Strain
Whale_EU111742
(Region: USA; Strain: Coronavirus SW1, complete genome.; Date: 2008)
Gene
ORF 1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
ORF 1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGTCTAAGTACCAAAAGTCAGTAGTTTCTACTAGAAATGCAAAGGTGGAGGTGGTTTACACCAGACCAGGCTTGCCGTTCCTGGATTACCTGCGCATCATGTATGGACCAACTAAGAAGTTGGATCAGATAAAGGACACCTCCATTGGAGAAGTTCATTGTGGGGATAAGGTCCTTAAATTTATCAAGAACCCCGTAGTGGGTATTGTTTGTAATGAAGGTGATGTACCCTTTTCAGAACTTGAAGAAAAGTATGGAGGGAATGAGCTTACTAAGCTCTATCAGCACCTTGCTGCTACTCAGTCTATTTGGAGCAAAAGCTCTGCCGATTTGGTGGCAAAGGCTGAGTCTGTGGCGCATGTTGAAGGAATTGATAGATTGGTTGGATGTTACAACCTTCGTATCAATATGTGTGCAACTCTTGCAGTGCTTAAGAACTTCCTTTTTAAGATTGAAGGTCTTGTTAAGAATGTAGCTGAGAGCTATATTGAACCTATGCAGGGTGAGTTTGATGCTTTGCTTGGTAATTACCTAGCGAGTGTTAAAATTACACCTACTGTTGTTAAGGAGTTGGCAAAATTGGCCAAGTCCATTCCTATGCTGAAAGTTGAGAACCATGTGCTGCGTTTGTTCGGAGCGGGTGGTGATTTTGTTGATTGTATCAACAAGTTCCTTTCAGATGTGTATTATAAACATCCTGGGCATGTGGAATATCATGGTGTGAAGGTTTCCGCCACGATTTTCTATCGCAACAACCGTGCAAAGATAAGCCGTGCGTATATCATGCCACCAAAAGTTGTTTGCAAGCCCGATGTGTATTTTGAAGCTACACCTGCTACTCAGTTTCAAACTGTGATTGTTGAAGGAAGTGGAGAGGAAGTGCATGAGCTCCGCCAAGTTATTGGTGAAGTACCAGAAGGACAGAAAGGCATTATTGTGCTTTCTGATGGTGCTGCCTATTTTAAGTACCTAGGTTCAGATGGAAAGGAATACCTTTCACTCTGGGTAGGTGTGGGATGCCTTAAATACCCTATTTATGTGTCAGAGCAACCTGCAGCAGTTAAATTTGCTGAGGCTGTGTCAGTGTTGGAATATGAACAAGAAGAAGAGCCGGACATTGCGATTAGATGCAAGTTCAGATGTTTTAATGGCAACCACATTGAAAAAGACCTTGATAAGGCAATTGATGAAATTGTATTTGAAACAGAGTGTACCATTGAGGAAGTTCATGCAGTGTTTTATACCAGAATGTGTGAATATTTTGAAGAGCAAGGTAGCTCTGAAGAAATTCCACTTTTTGAAGAAACTGCCCTTGTGGATCCTGATTACCGTCTTTTGGATGGTCTCAGAAAGGTTGTTAGATTAGTCATGTTGGGTGAAGTCGCCGATGCGGAGGACGAAGACAACTATGATTGGAATGATGAAGATGCAGAGTCCCAGCCACCTGATGTTGAATCTGAAGAGCAGGTTCAAGATGAGGATGACTCTGTTGAAGTAGATGAAGGTGATTATGAAGAAGACACCTTTAACCTAGCTATGGGTGTACCTATGATCCATAGCGATGATGAGCTTGACCTTGTATGTGATGTTGATGATGATGAGCTGGTTGACGAGGGCGAAGAGCCTGATGTGCGGAGTTCATCAGAAGAGACTGACCTTGAGGTTAATGTTCAGTGTAATGATGATGCAGGTTGGTCTGAGGATCCTCTGGTGGTTGATGAGGATTCAGCAGACACCTCTGCTCAAGAAGAAGATGAAAACGAAAGTGCTAGTGCGCCTGAAACCTCTCAAGAGGATATGGAAACTACACCTGAGACATCTCATAATAAAAACGAAGTTGCTAGTGCAATGGAAACCACATATATTACCAATGACATGGCGGTGTGTAATCCAGAAGCCTTTGTTGATGGAGATATAGTGGAAATTGAAAATCAATTTTCTAGTGTTATTGAGGAGGGCGAGAAAAACGCTACCTCAGCTAGTGCAGATATTGTAAAATCTGCGGTAGGTCTCGTTGACCCGCGGAGCGATTCCTTGACTGACCAGCAGTCGGGTGTTGGTGACCTTGTGTGTAAACAGGTTGTTAGTAGTGTGGCTACGGTGCAGAGCGAAGTGGTAGGCGAAGGCAGTCCCGTACATACGCCTGATGCTGACGCGCTCATTGCAAGCTCCACTGCTAACCAAGGAGTAGTGACCAAAGGATTCGAGAGTGCTTCAAATGATGAAGAGTCTGTTAGTGGGGCTGAGAGTGTTTTACCCCTTACTGATTGTGATACTAGTTCATCTAGTAATTCTGCCAAACCTCTGCAACAGCGGCAAAAGAGGCTGAAAAAGAGAAAGGCTAAAAAATCTGGTGCTGATGCTGATACTGATCCCTCGAACTATTCTGGTATAAAGGGGGTTAGGGATGATTGTAGAGATGAATCAGCTCAGGCTTCGTGTAAGAGTGTATCCTCTGAGGAAGTGACAGATGTTGTTAAAGAAGATGAAGATTGGGGAAAAGCTGTTGATGCTCAGGAATGTAAAAACCTGGCAGGGCAGACTAAACCCTTCATCTTTTATGGAGATTTACAGGAGTTGCTGAAGCAACTTGGCGGGTTTGGTTCCATAATCATTAATGCCGCTAATGAAAGATTGCAGCATGGAGGTGGTTTTGCTAAAGTTGTAGCGAGTTTGGCAGGCCAACTGTTTATTAAGAAGTGTGAAGGTATAATTCGCACAAAGGGACCTGTGCCAATGGATACACGTATGGTTCAAACTGGTCCTTATAATTGTAGTATGTATGGAGTAAAGGCTATTAGAAATGCTGTTGCACCCAGAGGGAATGAACAGGATATTGAATCCAAGCTTAATACAACTTATTACCATGCTATTCAGGATATTGTGAATAAGCCTGAGGTTATTATAACACCCTTGTTAGGGGCGGGGATATTTAATGTAGATCCTGAGTTGAGTCTTAAAGCACTCCTTAGGTATGCCACAAATAATGTGGTTATTATTACCAATGAGAAAAAGCAGTTTGAAATGCTTAAAGCTCATGGTTTAATTGAAGCCACTTTTTCAGGCGTGAAAGCTTCTGCTCCAGGTACTTCGGTGAAGAGCGAAAAGGAGTTGGATTGGTCTGATAAAAGAACTGAAGAGGAAGAAGCTAATGTCCCAGGTACTTCGGTGAAAGACATAAGCACACCTAGAAGTGAGGCTCAAGTTGTTACTCCTGAGGAGAAAATTAATGAAGAACCTAAGCCTGAAAAAGCTGAGGAGGTTAAGAATTATTGGAAAAGCGAGTGTACTCGTGAATTGAATCTTGGTGCCGTCAGAGGATTAAATGGCATCTATAAATGTAAAAAGAGTGTTTTTCATGGTAGTTGTAATAATCCAGAACATAAGGGTTATTGTTGTGTATGTAATGGACATGTGTCGGAGGTAGTGTATTACTCTACCTTTGATGGTGTTAATTACAAAACCCATAAATTTAGTAATTTGGGTAAATTAGTGAAAGACGTCATAGGTGATAAAGTCTATGTTGATGGAGTTTGTGTAGATAACAAACCATTGTTTGAGATCCAACCAGGATCAACATTTTTGCGCTTGTATCCAATTTCTGATGCTGATAAACAGCATATTAAAAATTATTATGAGCTAAGTTCAAAACAATATGGTGTGTTTGCTGCAGTTTATGCAAGAGAGCACCCCATTATTGAAAGTGGTGGTTTGAGATACTTAAAACAGAAAAATAATAACTGTTTTGTGTCTACTGCCTTAGTTATGTTACAGCACTTGAAGCTTGAATTCAAGGGGATAGTTAAAGAATTATGGAGCAACTTTTTGGCTGGAGATGCTCGTGGAATTGTAGCTTATACCTATGCATTACTCTATCCTACTGTAAAGTATGGAGATATGGGTGATGCAGAAGAGGTAGTACTTAAGTACCTTAATAAGGCAAAATTATGTGCACAATTGACATTAAATATTAAGTGCAAATGTGGTGAAAGAAATCACACTTTTAGTGGTGTAGATGCTGTTTACTGCATTGCTGATGTTTCTACTAGACATAAAGCGTTAACGAGCCGCATAGTGTGTGCTTGTGATAATGTTAAATCTAGTATTGTGTATGCAGATCTTCCTTTTGTTTTTGTTCATCGTAATGTTACGACTAAGATAAAGTTAGAGGAAGACTTTGTTTGTGCAAATATTTTTAAGCATGGTTCACATTATTGTGGTACTAATGCAATGTATAGTTATGATTCTATGAGTTCTAAAGCAGGAAAGCCGATTTTAGAATCCAGTTTTTCTGCCATTGTATTTGAAGGATTTTTTAAGGCCAATACCGAAGTCTCAGAGGCGATAGATGAGGCCATTGAGAACGGTGTGGATATTCACGGAAGTGAGGAAAACCAGGATGCTGATGCTGGAAAGCAACATGCGGGAAGTACCTTCACTCCCCCTCGAAAAGGCGACACCCGAGGTGCCATTGGGCGTACTGTGGTGGACGTCCCCAGTAAAGGTGATGTAGGGAGTGCGGTGAAAACTGTAGAGAGTGTGAGTAATGTTATCAGTGTTCGTCAGGACCCACATTCCCATGTGAATAATTTTGAAGTCCTTAGTGTGCAAAGTTTGCCCGCTGAGAGTGCTGATCCTGTTGTAAAGAAAGCTAGTGTAGTTACTATGACGGGTGATTTTAAACCCTTTAAAGTAGGAAACACTACTGTTAAACCTGGTAAAGGGCCTCAATTAGAGGAGTATTTAACGTTAGATGTGATTAAGCAAGCTTGGATAACTGGCGATTACAATGTTGTAATTCGCCGGACATCCACCCTAACAAAGATGTTGGGAGTTGTAGCAATGGATACAGGCAAAATAGTGTTTGATAGTATGCTTAAGGCAGCAAATGCTATTATTGATTATGTAAAGAGACATAACCTTCAGAAGAAGGCAATACAAGAAGCAAAGGAAGTTGCTACTATGTTGTCTCCTTATATGGATGTTAAGGTAGTAAAAGGCATGTTGTTTAATGTCTGGAGCTACTTGTTGACTGTATTGCCATTGTTGCAGAAACCTACAGAATTGTATGGTGAATGTCTAAAGAGGTCTTCTAAGGTTGTTGGAGGTGTTAAGGCTTCTACTTGGGCTGTCATGATTTTGGCATGCATGTGCTGGTGGAGACAGAGACAAATAGCCGCAGGTGCAGTAAGATTAGCTAACTGGTTTACACTAGGCTATCTCTGTTATGATTATAATACGTACAGTGATTATCATTTTAATGTTTTTGATTATTGTAATGGTACTCTCTGTGAATTGTGTCTGTCTGGTGTAGATTCATTACACCTGTATAAGCATGCTAAGACTACATATCAAAAGGTTGTGACAACTGATTTTGTAGGCTATGCACCCTTATATTTTATATTGCAAGCTGTCTTTTTTAAGAGCGCAGCTATGTTGAGTGGTTTGTTGTTTATGATTAAGTTCACCATAAATTTTGGTGTTTTTAATACCGGTATTTATATTGTGGATTATGTGGTATCCACAATTGCTAATACCATTGACCCTATTATGATCTCAACGATTGTGTGCGGTATGATTAAATTGTATCGTATTGCAAATCATTATTTTTATGGATGCAAGAACCCTGCTTGTGATAAGTGTCATGCAGCTACTGTATCAGAGCGAACGGAGCTCAGTTGTGTAGTTGGAAGTAAAAGGTTTCCCTATTATGTGTATGCTAATAGTGTGGCTAAGATGTGCGGTAAGCATATGTGGTGCTGCAAGAATTGTGATGTATTTGGTGAAGGTAATACTTTTATTTCCACAGCTATTGTGGGTGACCTCACCGATAAGATTAGAAGAAAAGTCAAGGCTACGTCAGAAGCATTGGCTATTGCTACATTGATAGAAGAGGGAGATAATTATGAACTCCATTATAAATTAAATGGTGCTGAAGGTAGCCGTGTGTATGATAAAAACCAATTTTGGAATTGTGCTATACCAGTGTCTGACGCGTCAAAGTGTGGTAAGTTTGAACCGGACAATTTTATTACCTATAATGCCAGTTCACAAAGTGAGTTGTCATTAGCAAAGCAATGTGCTGTGTATTACGCTCAAGTGTTGTCTAGACCAACCATTATTGTGCCTCTTTCTCAGGAGGAATATACTAGTGGTAAGGTTACTAGAACACAAGTGACGCGTCTTTTAGATCTTTGTGATGATTATTACGGCATCAGTGATGCTGAGGTAAAAATGTCTGTTATTAAGAGTAATACTGGAGCAACACTATCAGCAGCAGTGCAGCAATATGTTGCAAAGATAGTGCCTAGTCAAGTTATGAATCTTGATGTAGACTTTTTATTGTTTTGTGATCGTTATGGTCTAACCCCAAGTCAGGCTGCATATAATAATGCAGTGCCCAATAGCACCTGTAATTTGGATGCATATGAGGGCGAGCAGTTTTTGCGTGTCAAAGAGCAAGTTAAGAGTGCCTTTGTACAATTTGGTGTTAAGTATGTTGATTTTAAAATGGCTTTGAATGATAGCAAGATTGCTATTTTGCAATATGATTTTCTTAAGAGCTTGCCAGGTAATTATCTGCCAAGTCTTCTTATGAGGATCAGACAAGCTGGTGTTACTCTTAGAGTTACTACTAGTCAAATTATGCAGCAAGATACACTAGGGGGTGTGCGTGTTACAATGGTAGAAGATAGAGTTAGCAAGACCCAGAAGATGCCTAAGAAGAAGGGTGGTAATCCACCTTCTTGGACTCGGAGGTTCTTCAACTTTATGCAAGAGTCCTTTAAGATGAGTCTTATAGGTGTATTGCTTGGTGCCTTAATGATTAGCCTAATTGCCCCCACATTTACACCGAGTGTAGTGGAATTGGCAGCTAGTGGCTATAAGGTTATTGATAATGGAGTTATTAGGCCTATTGTAGAGACTGATAACTGCTTTGCTAATAAATATGCTGGCTTTAATGATTGGTATTATGGTTTTGTGGGTAAGTATCCCTACAATTCTGTAGACTGTCCAGTTGTTGTTGCGTTAACCACAATTATGGATGCCAATATGAAGGGTGCTATAGTTCCTGGTTATGCTGGTAATATGGCTTGGCTTAATGGTCAAATTGTTCACTATAGGCATGAATTTTCATGGTTTACAGGCAGCAGTGCTGAGGGCATTGTTGGCTATACACGTGATATCGTTGTCTATGGAGAAGACTTTATTAAGTCTCTTGCTTTGATTAGCGCTAGGTGTGTTAAATTGATGATGGTGTCTGAAAGACTTTATTGTTACGGTGGTAGTAATGATGCCATAGATGCATTGCCCTTTACTGCTATTCAACCTCATGTTGTTTATAATGATGCTATAGGCGTTGGTAAGCTTGTAGTACCTGAACAACTTTTATATAAGCCTTATATTGTGTATACACAAGCTCGTGAATATTGTCGCGCGGGTGTTTGTGAGCAAGCTAAGGAAGGTTATTGTATTAATTTTAATGGTGAGTGGGCATTGTTTAACCAGCATTACACATCTAAAGATGGTGTGTATTGTGGGGAAACACCAATGAGTGTTGTTATGAGCATTATTAATGCTTATATTTATCAGGGAACCACCACTAGTTTCTTTAATCGCTTTTGTGTTTTGAGTGTGATGATGCTCATAGCGCTAGTAGCGCTTGTTTATGTAGTTAAGTTCCAAGCATTTTTCAAAACCTATGCAGGTCTTGCGTGTGCTATTTTATTGAGTTGGGGATTTAATGCTATTATGCTTTTGTCTTATAGTGTGAACCCAATTGTTGTTATGCCTTTAATAGTAGTGTATATGTATGTGGCCTTAACGGTTACAACTCCTACTGCTATTATAATGCACGTTGCTTTTCTTGTAACAATTGTGCCTATGCTACCTTATAGCCTTATGGCTATCTATGGTGCTTATGTACTATTGATGTATACTAGTGTGGCTTGTTGGTTCGTTAAGACCAAAGTGTCCTCAGGAAAGTTATTTGAAAAGGGAGAATTTGTTGCAGATTTTGATACTGCAGCACGTTCAACCTTTTTGATTAATAATAGCGTGTACGTCAAGCTTGTAAATGAGGTAGGCGATAAATTCCAAAAGTATCTTTCTGGTTATGCTAGGCTGAAGTATTATTCAGGTTCTGGTGGTGACCAGGAGTGCTTAGATGCATGCAGAGCAACATTAGCTAATGCTCTTGAGAATTTTAAGAACACACAAGTAGAGGTGCTGTATACGCCACCTAGATTTGGTGTTAATTTGGTTACGAGGCTACAAGCAGGTATAAAGAAGATGGTCGCTCCTTCATCTGCTGTAGAACAGTGTGTAGTATCTGTTGTGCATGGTAACACACAGCTTAATGGTTTGTGGTTGAATGATTATGTGTTATGCCCTCGTCATATACTTGGTAAGTATACTGGTGAGCAATGGAGGGATGCACTTATTAATGCTAATAATTTTGATTTCCATATTTTGTATAAGGGTATGGAACTTCAAGTTGTGGGCCGTGAATTGGTAGGCGCACTTTTAAAATTGAAAGTTTCTATGGTAAATGCTAATACACCTAAGTATAAGTTTGCCAAAGCTAGAATTGGTGATAACTTTTCCATTGCTTGTGCTTATAATGGACATGTTTCTGGTTTGTACACTGTCACACTCCGAGAAAATGGAACACTTAAAGGTAGTTTCATGTCAGGATCGTGTGGTAGTGTTGGTTATAATGTGACTAATGAAGGTGTTGAATTTGTTTATATGCACCATTTGGAACTTCCAGGGTGCGTGCATGGTGGTAGTGACCTTCATGGCATATTTTATGGCGGTTATGTAGACGAAGAAGTACTTCAGAGGATACCTCCTGCACCAGCTAATTCACGTAATATTGTTGCGTGGTTGTATGCTGCAGTCTATAATAACTGTGATTGGTTTGTGAAATATGGACCTAAGCAAGTTATGTCTGTAGAAGATTTTAATGAGTGGGCATCTGGATATGGTTTTACCAAATTTGAGTACCACCTTGCTTTTGATGTGTTTTCAGCAGCAACTGGAGTTTCTGTGGAGCAGATGCTTGCAGCCATAAAGGAGTTGGCCGATGGGTGGAATTATGCCCCTGTTTTGGGTTCATTCCATCTTGATGATGAATATTCTCCTGAAATGATTATGCAACAAACTAGTGGCATTGTTCTACAGAGCAATGTAAAGAAGGCCACTAAAGGTTTTCTATCTAGGTTGGGTTATTGGCTTGTTATGGTAATATTGACAGTGTATGCATCTTGTAATGTAGTTCCACTTGATATGTTGCCACAGCTGATTATGAGTGTTGGTGTAGGTTTTGCTATAATGTTTGTTACTTTGAAGCATCAACATTTCTTTATGACAACTGCCATAATTCCCTATGTTGTTACTAGTATTTTGGGTATGGCACTTGAGAAGCCTGTGTTTTATAATGGATGGTACTTTAGCTTTTTCCATGACTTTTTGAAGTATGTTGGAATTGAGGCTACACATCAATATGCTTGGATGCTTTTACCATTTGCGCTCTATGTGGCATATAATGTAGCAAAGGGCGTTGGTTCAACATTGATTAATTTCAATGCTGGTGGTATTAGCTTATGGAATTCGCTTGTGTATGGTATGCGATGGGGTAGTACACTTCGCTTTTTGTACACAGCACTGATGTCAGATAATGTTTTTGAGACCTTTGGGTCATCTGGTGAGTTTTATATTAATATGCATATGGCATGTGTTGGTCTGTTTTCTTCGGACCCCGCATCAGGATATATTATAATGTGGATAGTAAAGCAGGTGAACTATGTAGGTTACCTAGCTTACTTTACTGAATTGAGCTATTACACTTTTGTATTTTACAGTTGTGTATTATGCTATATGTTTTCATGCTATTTTGGACTGTTCTGGTTTACTAATAAGGTGCTTGGCACGACTTTTGGTAAGTATCCTTATAAAGTAAGTGCTGGACAATTCAAATATATGATGCTTAACGGTATGAGAGGACCTAGGTCAACTGCCGATGTGCTTATTACTAACATGAGGTTAGCTGGTATTGGTGGTGAAAGAACCATTACCGTGTCTACTGTGCAATCTAAATTGACTGATGTGAAATGTGCTACTGTGGTTTTGATGCAGTTGCTCACAAAGCTAAATGTGGAAGCCAATTCTCGTTTACACAAGCATTTGGTACAAACACATAATGATATTTTAGCAGAGAGTGATCCCGCTATTTGCATTGAAAAATTAACTGGTATGCTCATGACTTTGTTGTCTATTGATTCAACATTGGACGTGAAGGCATTGTGTGATGAATTACTCGCCAAGGAAAGTGTCTTACAGGCTGTTACTGACGAGTTTTGTGCCTTGCCTTCTTATGTGGATTATGAGAAGGCACGTGCTGCTTATGAAGAAATTCAGAAGAATAGTACTAATCCCCAAGAAATCAAGGCATACAAGAAAGCTATGAATATAGCTAAGTCTGTTCTTGATAGGGATATTGCAGTTCAAAAGAAACTGGATGCCATGGCTGAGAGAGCTATGAGCACAATGTATAAAGAAGCGAAGAGCAGTGAGAAGAAGACTCGTTTAGTCTCATCTCTTCATGCTCTCTTATTTTCTATGATCAAGAGACTTGATTCAGATCAGGTTGCTGATGTTTTTGAAAAAGCAAGGAATGGTGTGGTGCCTTTGGCTAGTGTACCGATTACTTGTTCTAACAAATTAACAATAGTTATTCCAGATATGTCTCTTTGGGAGAAGGTTGTTGTACATGATTATGTTGTGTACGGTAACATCGTTTGGGATATCAATGAGGTTGTTGATATGGATGGTAATCAAATTTTGCCATGCCGTGTATCTGGTGAAGCCTCGTGGCCTTTGGAAGTTAGGCTTGTGAGGAATGGAAAGCTAGTGGGTGATCTAGCTTTGTTACAGAATAATGAGTTGTTGCCTACGGGCATAAAGAAGAGTCCTTGTGTGGCTGGTGCGAACCAGGAAAGGTGTGCTGTGCCCGCAAACGCATATTATACGAGTTTGAAAGGACAACATTTTGTAGCTGCCATAACATCAGAGGATCCAACTCTGAAGTATGCCTCTTTTACGGGAGCTTCAGGCAACTTAGTTGTAGTTGAACTTGAACCTCCATGTAAGTTTGGTGTAAAAACACCAGATGGTGCAGTTAAAGTTATGCATCTGTATTTTGTTAAAAATGTTAAGAATATTGTAAGAGGTATGGTGCTTGGTGCCCTTACTAATGTAGTTGCTTTGCAACATGGTGTAAGTACCGAATCAGTGGAAAACTGTGGTATATTAAGCCTATGTAGTTTTGCTCTTGATGCTAAGGAATGTTATCTTGAATATATTAAGGAAGGAGGTGCGCCCCTTTCTAATTGTGTTAAGATGCTTACCTTGCATACTGGTTCTGGTGCTGCTGTAACTGTAAAACCGGCGCCCACACCAGAACAAGATTCCTTTGGAGGTGCTTCTGTGTGCTTGTATTGTAGAGCACATATTTCGCATCCAGGTGTTTATGGAGTTTGCCAATTTAAAGGTAAATTTGTCCAGATACCCGTAGAGGAGAAAGATCCTGTAGGATTTTGCTTACGTAATAAAATTTGTACTGTTTGTCAAATGTGGATTGGATTTGGTTGCCAATGTGATTCTTTAAGAAAAGACCCCTTACCCATAGACCCGAAGCCTGCGGCAATGCCAATAAGACCAAAGGAACTGCTGGGAGTAAGGGCCGCGGGGGAAAACAGCCAGGACAGCGCTGGGTTTCACCATCCTGGACTTGACTTCACGCGCGTAGGGGCCAATTCTGAATCACTGGAACTGCAATCTGTTCCACAGAATTATTTAAACGGGTACGGGGTCTCAGTGAAGCTCGACTGAGGCCCTGTGCGTCGGGATTGTTACCTGATGTTGTTAAAAGAGCTTTTGATCTTTATAATAGCAATACAGCTGGAATGTATGCTTCTTTAAAACATAATTGTGCCCGCTTTCAAGAGCTGGACGAGAACGATGATGAAATAGATTCGTTCTTTGTTGTAAAGCAAACTACTCCTCATAATTTTGAACATGAGGAGAAGTGCTATTTGGATTTAAAAGCAGACTGTGTGGCTGTTCATGATTTCTTTCGCTTTGAAGGCATGTATAGTATATGCCGCCAAAGGCTTACTAAATATACTATGATGGATTTGTGTTATGCTTTTAGGCATTTCGATCCTAATGATTGTGATGTGCTCAAAGAGATCCTTGTTGTTAAGGGTTGCTGTGAGTGGGATTATTTTGATCAGCCCAACTGGTATGATCCAGTTGAAAATCCAGATTGGTTTAGCCTTATTTCTAGGTTGGGACCAATCTTTCAAAGGGCATTGATTAAGGTGGCTGAATTTTGTGATTTGATGGTTGAAAAGGGTTACATAGGTGTTGTAACGCTTGATAACCAAGATTTGAATGGTAATTTTTATGATTTTGGTGATTTTAAAAAAGTTTTGCCAGGATGTGGAGTACCAGTTACTACTTCATATTATAGTTATATGATGCCATGCCTTACAGCGTGTGATGCATTGGCGTCTGAGAGGTTTTTCGAATTTAAGGCCACTTCAGGTTATAAGCAATATGACCTTACGAAGTATGACTTTACTGAAGAAAAGCTTCAATTATTTATGAAATATTTTAAGTACTGGGACCGTACTTATCATCCTAATTGTGTAGAGTGCATTGATGATAGGTGTTTGATTCATTGCGCTAATTTTAATATTTTATTTGCTACACTGTTTCCTCAAACAGCTTTTGGATGTCTTTGTAAGCGTGTGTATATAGATGGTGTTCCATTTATTTCCACGACTGGTTATCATAGTAAGGAGTTAGGGGTTTTGCTTAATAAAGATAATTCCATGTCCTTTTCAAAGATGTCTATAGGTGAATTAATGCGTTTTGCTGCAGACCCTTCTCTTTTGGTTTCAGCTAGTGATGCATTTGTTGATCTTAGGACAAGTTGTTTTTCATTGAGTGCTTTGTCAACTGGTTTGACATACCAAACTGTGAAACCTGGTCATTTCAACGAAGATTTTTATAACTTTGCTGAAAAGAAAGGGTTTTTCAAGGAAGGTTCGTCTATTCCATTGAAGCATTTCTTTTATATACAGGATGGTAATGCTGCCATTGCTGATTTTGATTATTATAGGTTTAATAAGCCTACTATGGTTGATATACAGCAGTTTTTGTTTTGCTTTGAAGTTACTGATAAATACTTTGAGCAGTATGATGGTGGTTGTATCCCTGCTAATCAAGTTGTAGTAACTAATTTAGATAAGAGTGCAGGCTATCCATTCAATAAGTTTGGTAAAGCTAGGCTGTATTATGAATCACTTTCATACGCTGAGCAGGATCAATTGTTTGAACTGACCAAGCGTAATATTTTACCTACCATTACCCAGATTAATATGAAGTATGCCATTTCTGCTAAGTCACGTGCACGTACTGTTGCAGGTGTGTCAATTCTTAGCTCGATGACAAACCGCCAATTTCATCAGAAGTGCCTCAAATCTATTGTGAACACGCGGAATGCAACCGTTGTAATAGGCACTACTAAGTTTTATGGAGGATGGGATAATATGCTCCGCAACCTTATGCGCGGTGTGGAGGATCCTGTTCTGATGGGGTGGGACTATCCTAAGTGTGATAGAGCTGTGCCATCACTTTTAAGACTTAGTGCTAGTCTAATATTAGCACGCAGGCATAAAGGTTGTTGTGACTGGAATGAGCGCATTTATAGGCTCGCTAATGAGGCGGCGCAAGTATTGTCTGAAGTGGCCTTATCTAATGGTGGATTGTATGTAAAGCCAGGTGGTACTAGTAGTGGAGATGCAACCACTGCTTATGCCAATAGCGCTTTTAATTTGTTTCAAGCCACAGCTGCTAATGTAGCGCAATTACTGGCCACACCCACATCTAGAATTTATGCTGAGGAGGTCAGAGCTTTACAGCATGAATTGTATACACAGGTGTATAGACGTGATAAGCCCGATATGGATTTCGTTTATACCTTTTATGCATATCTTAATAAGCACTTTAGTCTCATGATATTGAGCGATGATGGTGTTGTGTGTTATAACAAAAGTTATGCTGAGGCAGGTATGGTTGCCAGCATTGCTTCATTTAGAGAAGTTTTGTTTTATCAGAATAATGTGTTTATGGCCGATTCCAAATGTTGGACAGAAGAAGATGTTAAGATTGGGCCACATGAGTTTTGTTCACAGCATTCAATGCTAGTTGAAATAGATGGAGAAATGAGATACTTACCGTATCCTGATCCATCACGTATATTAGGAGCTTGTGTCTTTGTCGACGATGTTGAGAAGACTGAACCTGTTGTAGTTATGGAGAGATATGTGGCATTAGCAATTGATGCTTACCCATTGATCTATCATGAAAACGAAGAGTATGGAAAAGTATTTTATTTACTTCTTTCATACATTCAAACATTGTATCAGAGGCTATCAAATGATATGCTTATGGATTATTCTTTTGTGATGAATATTGATACTAGTTCTAAGTTTTGGGAGGAAGATTTTTACCGCCAAATGTATGGGAGCTCACCCACTTTACAGGCTTCTGGTGTGTGTGTTGTGTGTAATTCTCAAACAGTTTTGCGATGCGGTAATTGTCTTCGTAAACCGTTTTTGTGCTGCAAATGTTGTTATGATCACGTTATGGAAACGGAGCATAAGAATGTTCTCAGCATTAATCCTTATGTTTGTAGTGTTGCTGGTTGTGGAGAATCCAATGTCTGCAAACTATTTTTAGGTGGCATGTCATATTTTTGCCTTGACCACAAACCTAGGTTAGCTATACCTCTTGTTTCTGGAGGTACAGTATTTGGTATTTATCGTGCTACATGTTCAGGAAGTCCTGATGTTGCAGTGTTTAATAAATTGGCTACTACAGATTGGAAGGGCATAGACTCTTATGTATTAGCAAATAATTGCTCAGATAGTCTGAGACGCTTTGCAGCTGAGACTGTAAAAGCCACTGAAGAACTTGAAAAGCAGCAGTATGCTTCTGCCGAAATTAAAGAGATAGTAGGTGAGAAGGAACTTGTGCTTAGTTGGGAACCAGGTAAAACCAGACCTCCTTTAAATAGGAATTATGTGTTTACTGGTTATCATTTTACTAGAACTGGTAAAACTCAATTAGGTGAATTCACCTTTGAGAAAAGTGACTCTCAGCAGTCGGTGTATTATAAGGCTACTTCAACGTCTAAATTGGCTGTGGGCGATTTGTTTGTGCTTACATCACATAACATAAGCCCGCTTACTGCTCCTACGATCTGTAATCAGCAGATCTACACTAAATTTCAGAATATTACACCAAACCTCTTTGTGAGTGATGCGTTTGCTGATAATATACCATTATATCATATAGTAGGAAAGCAGCGGCGTACCACAGTGCAAGGTCCCCCTGGCAGTGGTAAATCGCACTTTGCTATAGGTTTAGCAGCATATTTTTCAAATGCTAGAATAGTTTATACAGCATGTTCTCATGCTGCAGTTGATGCTTTGTGTGCTAAGGCTTTTAAGTTTCTTAAGCACGATGATTGTACCAGAGTAGTACCTATGCGTGTAGGCGTAGATTGCTTCTCTGATTTTAAGGTTAATGATATGACTCGTAAGTACATTTTTTCTACGATAAATGCACTTCCAGAAGTTAGCTGTGATATATTGCTTGTTGATGAGGTGAGCATGCTTACCAATTATGAGCTTTCTTATTTGAATCAGAAGATTTCTTATCAATATGTTGTTTATGTAGGAGACCCTGCGCAATTGCCAGCACCCAGGACTCTTCTTAATGGTTGTTTAGAACCAGCTCATTACAATTTGGTAACTAATATAATGGTTTCTACGAAGCCCGATATATTTTTAGCAAAATGTTATCGGTGTCCAAAAGAAATTGTTGACACTGTGTCAGAGCTTGTTTATGAAGGCAAATTTATAGCAAATAATCCAGTTAGTGGACAGTGCTTTAAATGTGTTGTTAATACTGGCAACTCTGATGTTAAGAGAGAGTTGGGCAGTGCCTATAATCAGGTGCAGCTAGATTTTGTTGCGGATTTCCTTAAGCACAACCCTTTGTGGCGTAAGGCATGTTTTATATCACCCTACAATTCAATGAATCAGAGGGCGAGGCGGCAATTGGGCTTAGAAGTCCAAACCGTGGATTCATCTCAGGGGAGTGAGTATGACTATGTCATTTTTGCTGTAACGGCAGATTCACCCCACGCTATGAATATTAATAGATTTAATGTTGCAGTTACGCGTGCCAAGGTAGGTATCCTTGTGTTAATGAGACACAATGATAGCTTTTACCAGGGGTTGAAGTTTGTGGAAATTGAAGGTCCTAGAGGTAAGCTTCAATCACAAACTACAGGTTTGTTTAAGATCTGTTCACGTAATTTTAAAGGGTTACCCCCCGCGTATGCACCAACCTATATAGCGTTGGATGAGAAATATAAAGTGGGAGATAGTGTTTTGGCTACACTTCTTAAGGTTGATACTGGTAGTTGTGTTTCCTACTCCCATTTAGTTTCATTGTTAGGATTTAAGTTTGATAAAGGCACAGGCTCTTCTCAAATTGTGTCTAAGTATAGTCCTTTCATAACACGAGATATGGCTATACGTAATGTACGTGGTTGGGTGGGCTTTGATGTGGAAGCATCTCACGCGGCCAATGAACATATAGGTACTAATCTGCCATTGATGGTAGGATTTAGTATTGGTACTGATTATCTTGTAGCTAATGAGGGTCTTGTTATGACCGAGTATAATGATGAGTTTAGAAAGATACCAGCAAGATGTCCACCTGGAGATCAATTTGCTTATCTTAAACCATTATTGCACAAGGGGAAACCATGGAATGTTGTACGTCCTCAAATAGTGCGCATGATGGCGGATCACTTACAGGACATTTCTGATTGTGTGGTTTTGGTGACATGGAGCCATAGTCTTGAACTCACCACTATGAGATATTTTTGTAAAATGGGTAAAGAACAGAAATGTAAGCAGTGCGAAGGGCGCGGGTGTGCTTACAATTCTGCTGCTGAAACATTCCATTGCTGGAAACACAGCTTTGGATGTGATTTTCTTTATAATCCATATTTGGTAGATGTCCAACAATGGGGCTATTCTGGTAATTTAAGTAGCAATCATGACCGGTATTGTAATATGCATGGTAATGCTCATGTTGCATCAGCAGATGCTAAGATGACTCGTTGTTTGGCAGTTTATGATTGCTTTGTTAAGAATATAAATTGGGATGTTGAATACCCTATTATTGCTAATGAAGAGGACGTCAATAGGTGTTGTCGTCATCTGCAGAAGCTGTTTGTGAAATCAGTTTGCATAGGTATGAACTATGACAAAGTGCATGATATTGGAAACCCTAAGGGTATAAAGAGTGCTAATGGTATCAGCTTTAATTTCTATGATAGAGATCCCGTTGCTGATAATGTCATAAGGCTTGATTACGATTACGATAGTATGTGTGAGAGATTCAAAGATGGCCTAGCCCTCTTCTGGAATTGCAATGTAAATTGTTATCCAGATAATGCGCTAGTATGTCGCTTTGATACGCGTACTTTGAATGCATTAAATTTGCCAGGTTGTAATGGAGGTAGTTTGTATGTTAATAAACATGCATTCCACACCGAAAAGTACGACCGTAGTGCTTTTAGAAATCTGAAGAGTATGCCATTCTTCTTTTTTGATGATTCACCATGCGATGTCAAGTTAGTAAATGATGTTGCTCAAGATTTAGTTGCTTTGTCAGCTCGTGATTGTATTACAAGGTGTAATATAGGAGGAGCTGTATGTTGGAAACATGCTAAAGCTTATGCAGAGTTTGTTCATGCATATAATACATGCACTCTTGCTGGCTTTACTTTCTGGGTCAGTGAAAAATTTGATCCTTATGTGTTATGGAAGAAATTTTATAAGTTACAGTCACTAGACCAGCCGGTGGCTAATGTTGTTAAGCGTGATCATTTTGATGATGTTAAGGATGATGTCCCTTATGTCATAACTGGAGACAAAGTGTTTTATAGAAAGGGGCTTCAAGATGTTTTGATTTTTGAGAACAAGACTAGTATGGCTACTAGTATTGCTTTTGAGTATTATGCACGCCGCAACATTGATGTCATTCCTAAGAGTGCCATATTGTATGGTTTAGGTGTTGACGTTACGGCAGGATTTACATTGTGGGACAGAGAGCTTAGTCAGCCTGTCTTTAATGGTGTTGTAGACACTAGTAAGGTTATTGATATAGAACCCAATGAAAAGTTGTGTGTTCTCTACGATGATAGAGTGAAGGGTTCTAGACAGAGATTTTTACAGACTAAAAATGCTGTGCTTATCTCAACTATTAGGGTTAAGGTAGATGGTATTGAACTAGAAAGTGTTCGTATCCCTGCCTCTTCTTGTCAAATAGATTCAACACCAGTTTCCACTGTAAGGGATGGAAATGGTCAAATGTTTGTGTATGTACGCAAGGATGGAAAGCACGTTGTGCCCACCTCGCAACTTTTTACTGAGCAGAGAAGTTTTGAAGACTTTTTGCCACTTAGTGTTATGGAACGAGATTTCCTGAATATGGAAGCTCCCCAATTTATTGCTAAGTACGATTGTAAGGGCTTAGGTCTTGAACACGTACTATATGGTGATTTCAGCAAGAAAGTGATAGGAGGTGCACACCTAACTATTGGTCTTGCCCGTTTATATATTCAGGAAAAATTTGATGTGCATGAAATTTCGCCTTCAAGTTTTGATGTGTTTAAGAGTTATTTTGTGGTGACACATGCTGGTGCAATGAAACAGGTTTGCACAGTTTTGGATGTGTTGCTAGATGATTTTATTAGCATTCTTAAGGAAATTAAAGTCAGCCATAAGGGTGTTGTTTCAGAGGTGTTACACTATATTGTTGATTATCAAACCGTAGATTTTATGCTATGGATGGGTGATAATGCCATTAATACGTTTTATCCTAAGCTTCAAGCTGATTATTGGGATTCAATTAAAGGAAAGCACCCTAGTGTGTGGAGTCCTGGTTTTAATATGCCTGAGCTGTATAAAGTCCAAAATTGCCAACTCGAAAAGTGCGAATTGGCAAATTACGGTAAAACAGTTTTATTGCCACCTGGAATTTTAATGAATGTAGCAAAATACACTCAGTTGTGCCAGTATCTTAGTAAAACCACTATGTGTGTACCCCATAATATGAGGGTTATGCATTTTGGAGCTGGGTCAGATAAAGGAGTAGCACCTGGTACGTCTGTACTTCGCCAGTGGTTACCTGAAGGGGCCTTGCTTATTGATAATGATATTAATCGGTATGTTTCAGATGCCGATGCTTGTGTGATTAGTGATTGTAATGTGTTTAAGAGTCAAGGGAAGTTTGACTTGATTATTAGTGATATGTATACGTCTCCAAAGGGGGTAGATATACATGAAGGTATTATTAAGAATAATGGTATTTCCGACTGTTTTGGCTATTTATGCCACTTTATTAAGAATAATCTCTCACTTGGCGGTACTTTTGCTGTCAAGATTACAGAGACCAGTTGGTTGCCTGAATTGTATGAGCTAGCACAGAAATGTGCATATTGGACTTGTTTTTGCACCGCCGTGAATACTAGTTCCTCTGAGGCTTTTCTGGTAGGTGTTAATTATTTAGGAGATGTAGAAAAACCGATTATTGATGGGTCGGTGATGCATGCAAATTATTTATTTTGGAGAAATGTGACAGATTTACCGCTTAGTGCGCGTAGTCTGTTTGACATAGCGAAGTTTGGCTTAAAAGTTAAAGCAACCCCTGTAGTGAATTTAAAAAAGGAAAACATTACAGAGCTTGTTATAAACCTGCTTAAGAATGGTAAGATTATCATTCGTGATAGTGTTTCTGTGCACTATGTTGATGAATCCTTTATTAATTAG
Protein
MSKYQKSVVSTRNAKVEVVYTRPGLPFLDYLRIMYGPTKKLDQIKDTSIGEVHCGDKVLKFIKNPVVGIVCNEGDVPFSELEEKYGGNELTKLYQHLAATQSIWSKSSADLVAKAESVAHVEGIDRLVGCYNLRINMCATLAVLKNFLFKIEGLVKNVAESYIEPMQGEFDALLGNYLASVKITPTVVKELAKLAKSIPMLKVENHVLRLFGAGGDFVDCINKFLSDVYYKHPGHVEYHGVKVSATIFYRNNRAKISRAYIMPPKVVCKPDVYFEATPATQFQTVIVEGSGEEVHELRQVIGEVPEGQKGIIVLSDGAAYFKYLGSDGKEYLSLWVGVGCLKYPIYVSEQPAAVKFAEAVSVLEYEQEEEPDIAIRCKFRCFNGNHIEKDLDKAIDEIVFETECTIEEVHAVFYTRMCEYFEEQGSSEEIPLFEETALVDPDYRLLDGLRKVVRLVMLGEVADAEDEDNYDWNDEDAESQPPDVESEEQVQDEDDSVEVDEGDYEEDTFNLAMGVPMIHSDDELDLVCDVDDDELVDEGEEPDVRSSSEETDLEVNVQCNDDAGWSEDPLVVDEDSADTSAQEEDENESASAPETSQEDMETTPETSHNKNEVASAMETTYITNDMAVCNPEAFVDGDIVEIENQFSSVIEEGEKNATSASADIVKSAVGLVDPRSDSLTDQQSGVGDLVCKQVVSSVATVQSEVVGEGSPVHTPDADALIASSTANQGVVTKGFESASNDEESVSGAESVLPLTDCDTSSSSNSAKPLQQRQKRLKKRKAKKSGADADTDPSNYSGIKGVRDDCRDESAQASCKSVSSEEVTDVVKEDEDWGKAVDAQECKNLAGQTKPFIFYGDLQELLKQLGGFGSIIINAANERLQHGGGFAKVVASLAGQLFIKKCEGIIRTKGPVPMDTRMVQTGPYNCSMYGVKAIRNAVAPRGNEQDIESKLNTTYYHAIQDIVNKPEVIITPLLGAGIFNVDPELSLKALLRYATNNVVIITNEKKQFEMLKAHGLIEATFSGVKASAPGTSVKSEKELDWSDKRTEEEEANVPGTSVKDISTPRSEAQVVTPEEKINEEPKPEKAEEVKNYWKSECTRELNLGAVRGLNGIYKCKKSVFHGSCNNPEHKGYCCVCNGHVSEVVYYSTFDGVNYKTHKFSNLGKLVKDVIGDKVYVDGVCVDNKPLFEIQPGSTFLRLYPISDADKQHIKNYYELSSKQYGVFAAVYAREHPIIESGGLRYLKQKNNNCFVSTALVMLQHLKLEFKGIVKELWSNFLAGDARGIVAYTYALLYPTVKYGDMGDAEEVVLKYLNKAKLCAQLTLNIKCKCGERNHTFSGVDAVYCIADVSTRHKALTSRIVCACDNVKSSIVYADLPFVFVHRNVTTKIKLEEDFVCANIFKHGSHYCGTNAMYSYDSMSSKAGKPILESSFSAIVFEGFFKANTEVSEAIDEAIENGVDIHGSEENQDADAGKQHAGSTFTPPRKGDTRGAIGRTVVDVPSKGDVGSAVKTVESVSNVISVRQDPHSHVNNFEVLSVQSLPAESADPVVKKASVVTMTGDFKPFKVGNTTVKPGKGPQLEEYLTLDVIKQAWITGDYNVVIRRTSTLTKMLGVVAMDTGKIVFDSMLKAANAIIDYVKRHNLQKKAIQEAKEVATMLSPYMDVKVVKGMLFNVWSYLLTVLPLLQKPTELYGECLKRSSKVVGGVKASTWAVMILACMCWWRQRQIAAGAVRLANWFTLGYLCYDYNTYSDYHFNVFDYCNGTLCELCLSGVDSLHLYKHAKTTYQKVVTTDFVGYAPLYFILQAVFFKSAAMLSGLLFMIKFTINFGVFNTGIYIVDYVVSTIANTIDPIMISTIVCGMIKLYRIANHYFYGCKNPACDKCHAATVSERTELSCVVGSKRFPYYVYANSVAKMCGKHMWCCKNCDVFGEGNTFISTAIVGDLTDKIRRKVKATSEALAIATLIEEGDNYELHYKLNGAEGSRVYDKNQFWNCAIPVSDASKCGKFEPDNFITYNASSQSELSLAKQCAVYYAQVLSRPTIIVPLSQEEYTSGKVTRTQVTRLLDLCDDYYGISDAEVKMSVIKSNTGATLSAAVQQYVAKIVPSQVMNLDVDFLLFCDRYGLTPSQAAYNNAVPNSTCNLDAYEGEQFLRVKEQVKSAFVQFGVKYVDFKMALNDSKIAILQYDFLKSLPGNYLPSLLMRIRQAGVTLRVTTSQIMQQDTLGGVRVTMVEDRVSKTQKMPKKKGGNPPSWTRRFFNFMQESFKMSLIGVLLGALMISLIAPTFTPSVVELAASGYKVIDNGVIRPIVETDNCFANKYAGFNDWYYGFVGKYPYNSVDCPVVVALTTIMDANMKGAIVPGYAGNMAWLNGQIVHYRHEFSWFTGSSAEGIVGYTRDIVVYGEDFIKSLALISARCVKLMMVSERLYCYGGSNDAIDALPFTAIQPHVVYNDAIGVGKLVVPEQLLYKPYIVYTQAREYCRAGVCEQAKEGYCINFNGEWALFNQHYTSKDGVYCGETPMSVVMSIINAYIYQGTTTSFFNRFCVLSVMMLIALVALVYVVKFQAFFKTYAGLACAILLSWGFNAIMLLSYSVNPIVVMPLIVVYMYVALTVTTPTAIIMHVAFLVTIVPMLPYSLMAIYGAYVLLMYTSVACWFVKTKVSSGKLFEKGEFVADFDTAARSTFLINNSVYVKLVNEVGDKFQKYLSGYARLKYYSGSGGDQECLDACRATLANALENFKNTQVEVLYTPPRFGVNLVTRLQAGIKKMVAPSSAVEQCVVSVVHGNTQLNGLWLNDYVLCPRHILGKYTGEQWRDALINANNFDFHILYKGMELQVVGRELVGALLKLKVSMVNANTPKYKFAKARIGDNFSIACAYNGHVSGLYTVTLRENGTLKGSFMSGSCGSVGYNVTNEGVEFVYMHHLELPGCVHGGSDLHGIFYGGYVDEEVLQRIPPAPANSRNIVAWLYAAVYNNCDWFVKYGPKQVMSVEDFNEWASGYGFTKFEYHLAFDVFSAATGVSVEQMLAAIKELADGWNYAPVLGSFHLDDEYSPEMIMQQTSGIVLQSNVKKATKGFLSRLGYWLVMVILTVYASCNVVPLDMLPQLIMSVGVGFAIMFVTLKHQHFFMTTAIIPYVVTSILGMALEKPVFYNGWYFSFFHDFLKYVGIEATHQYAWMLLPFALYVAYNVAKGVGSTLINFNAGGISLWNSLVYGMRWGSTLRFLYTALMSDNVFETFGSSGEFYINMHMACVGLFSSDPASGYIIMWIVKQVNYVGYLAYFTELSYYTFVFYSCVLCYMFSCYFGLFWFTNKVLGTTFGKYPYKVSAGQFKYMMLNGMRGPRSTADVLITNMRLAGIGGERTITVSTVQSKLTDVKCATVVLMQLLTKLNVEANSRLHKHLVQTHNDILAESDPAICIEKLTGMLMTLLSIDSTLDVKALCDELLAKESVLQAVTDEFCALPSYVDYEKARAAYEEIQKNSTNPQEIKAYKKAMNIAKSVLDRDIAVQKKLDAMAERAMSTMYKEAKSSEKKTRLVSSLHALLFSMIKRLDSDQVADVFEKARNGVVPLASVPITCSNKLTIVIPDMSLWEKVVVHDYVVYGNIVWDINEVVDMDGNQILPCRVSGEASWPLEVRLVRNGKLVGDLALLQNNELLPTGIKKSPCVAGANQERCAVPANAYYTSLKGQHFVAAITSEDPTLKYASFTGASGNLVVVELEPPCKFGVKTPDGAVKVMHLYFVKNVKNIVRGMVLGALTNVVALQHGVSTESVENCGILSLCSFALDAKECYLEYIKEGGAPLSNCVKMLTLHTGSGAAVTVKPAPTPEQDSFGGASVCLYCRAHISHPGVYGVCQFKGKFVQIPVEEKDPVGFCLRNKICTVCQMWIGFGCQCDSLRKDPLPIDPKPAAMPIRPKELLGVRAAGENSQDSAGFHHPGLDFTRVGANSESLELQSVPQNYLNRVRGLSEARLRPCASGLLPDVVKRAFDLYNSNTAGMYASLKHNCARFQELDENDDEIDSFFVVKQTTPHNFEHEEKCYLDLKADCVAVHDFFRFEGMYSICRQRLTKYTMMDLCYAFRHFDPNDCDVLKEILVVKGCCEWDYFDQPNWYDPVENPDWFSLISRLGPIFQRALIKVAEFCDLMVEKGYIGVVTLDNQDLNGNFYDFGDFKKVLPGCGVPVTTSYYSYMMPCLTACDALASERFFEFKATSGYKQYDLTKYDFTEEKLQLFMKYFKYWDRTYHPNCVECIDDRCLIHCANFNILFATLFPQTAFGCLCKRVYIDGVPFISTTGYHSKELGVLLNKDNSMSFSKMSIGELMRFAADPSLLVSASDAFVDLRTSCFSLSALSTGLTYQTVKPGHFNEDFYNFAEKKGFFKEGSSIPLKHFFYIQDGNAAIADFDYYRFNKPTMVDIQQFLFCFEVTDKYFEQYDGGCIPANQVVVTNLDKSAGYPFNKFGKARLYYESLSYAEQDQLFELTKRNILPTITQINMKYAISAKSRARTVAGVSILSSMTNRQFHQKCLKSIVNTRNATVVIGTTKFYGGWDNMLRNLMRGVEDPVLMGWDYPKCDRAVPSLLRLSASLILARRHKGCCDWNERIYRLANEAAQVLSEVALSNGGLYVKPGGTSSGDATTAYANSAFNLFQATAANVAQLLATPTSRIYAEEVRALQHELYTQVYRRDKPDMDFVYTFYAYLNKHFSLMILSDDGVVCYNKSYAEAGMVASIASFREVLFYQNNVFMADSKCWTEEDVKIGPHEFCSQHSMLVEIDGEMRYLPYPDPSRILGACVFVDDVEKTEPVVVMERYVALAIDAYPLIYHENEEYGKVFYLLLSYIQTLYQRLSNDMLMDYSFVMNIDTSSKFWEEDFYRQMYGSSPTLQASGVCVVCNSQTVLRCGNCLRKPFLCCKCCYDHVMETEHKNVLSINPYVCSVAGCGESNVCKLFLGGMSYFCLDHKPRLAIPLVSGGTVFGIYRATCSGSPDVAVFNKLATTDWKGIDSYVLANNCSDSLRRFAAETVKATEELEKQQYASAEIKEIVGEKELVLSWEPGKTRPPLNRNYVFTGYHFTRTGKTQLGEFTFEKSDSQQSVYYKATSTSKLAVGDLFVLTSHNISPLTAPTICNQQIYTKFQNITPNLFVSDAFADNIPLYHIVGKQRRTTVQGPPGSGKSHFAIGLAAYFSNARIVYTACSHAAVDALCAKAFKFLKHDDCTRVVPMRVGVDCFSDFKVNDMTRKYIFSTINALPEVSCDILLVDEVSMLTNYELSYLNQKISYQYVVYVGDPAQLPAPRTLLNGCLEPAHYNLVTNIMVSTKPDIFLAKCYRCPKEIVDTVSELVYEGKFIANNPVSGQCFKCVVNTGNSDVKRELGSAYNQVQLDFVADFLKHNPLWRKACFISPYNSMNQRARRQLGLEVQTVDSSQGSEYDYVIFAVTADSPHAMNINRFNVAVTRAKVGILVLMRHNDSFYQGLKFVEIEGPRGKLQSQTTGLFKICSRNFKGLPPAYAPTYIALDEKYKVGDSVLATLLKVDTGSCVSYSHLVSLLGFKFDKGTGSSQIVSKYSPFITRDMAIRNVRGWVGFDVEASHAANEHIGTNLPLMVGFSIGTDYLVANEGLVMTEYNDEFRKIPARCPPGDQFAYLKPLLHKGKPWNVVRPQIVRMMADHLQDISDCVVLVTWSHSLELTTMRYFCKMGKEQKCKQCEGRGCAYNSAAETFHCWKHSFGCDFLYNPYLVDVQQWGYSGNLSSNHDRYCNMHGNAHVASADAKMTRCLAVYDCFVKNINWDVEYPIIANEEDVNRCCRHLQKLFVKSVCIGMNYDKVHDIGNPKGIKSANGISFNFYDRDPVADNVIRLDYDYDSMCERFKDGLALFWNCNVNCYPDNALVCRFDTRTLNALNLPGCNGGSLYVNKHAFHTEKYDRSAFRNLKSMPFFFFDDSPCDVKLVNDVAQDLVALSARDCITRCNIGGAVCWKHAKAYAEFVHAYNTCTLAGFTFWVSEKFDPYVLWKKFYKLQSLDQPVANVVKRDHFDDVKDDVPYVITGDKVFYRKGLQDVLIFENKTSMATSIAFEYYARRNIDVIPKSAILYGLGVDVTAGFTLWDRELSQPVFNGVVDTSKVIDIEPNEKLCVLYDDRVKGSRQRFLQTKNAVLISTIRVKVDGIELESVRIPASSCQIDSTPVSTVRDGNGQMFVYVRKDGKHVVPTSQLFTEQRSFEDFLPLSVMERDFLNMEAPQFIAKYDCKGLGLEHVLYGDFSKKVIGGAHLTIGLARLYIQEKFDVHEISPSSFDVFKSYFVVTHAGAMKQVCTVLDVLLDDFISILKEIKVSHKGVVSEVLHYIVDYQTVDFMLWMGDNAINTFYPKLQADYWDSIKGKHPSVWSPGFNMPELYKVQNCQLEKCELANYGKTVLLPPGILMNVAKYTQLCQYLSKTTMCVPHNMRVMHFGAGSDKGVAPGTSVLRQWLPEGALLIDNDINRYVSDADACVISDCNVFKSQGKFDLIISDMYTSPKGVDIHEGIIKNNGISDCFGYLCHFIKNNLSLGGTFAVKITETSWLPELYELAQKCAYWTCFCTAVNTSSSEAFLVGVNYLGDVEKPIIDGSVMHANYLFWRNVTDLPLSARSLFDIAKFGLKVKATPVVNLKKENITELVINLLKNGKIIIRDSVSVHYVDESFIN
Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR037204
NSP7_sf
IPR008740 Peptidase_C30
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR036333 NSP10_sf
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR014828 NSP7
IPR027352 CV_ZBD
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR037227 EndoU-like
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR009466 NSP11
IPR002589 Macro_dom
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR042515 Nsp15_N
IPR014827 Viral_protease
IPR014829 NSP8
IPR036499 NSP9_sf
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR008740 Peptidase_C30
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR036333 NSP10_sf
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR014828 NSP7
IPR027352 CV_ZBD
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR037227 EndoU-like
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR009466 NSP11
IPR002589 Macro_dom
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR042515 Nsp15_N
IPR014827 Viral_protease
IPR014829 NSP8
IPR036499 NSP9_sf
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1165 Identity=60.37%
Cov(Q)=13.90% Cov(P)=96.96%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6663
Number of predicted TMHs:
12
Exp number of AAs in TMHs:
331.199699999995
Exp number, first 60 AAs:
0.01735
Total prob of N-in:
0.00225
outside
1 - 2265
TMhelix
2266 - 2288
inside
2289 - 2535
TMhelix
2536 - 2558
outside
2559 - 2567
TMhelix
2568 - 2590
inside
2591 - 2594
TMhelix
2595 - 2617
outside
2618 - 2631
TMhelix
2632 - 2654
inside
2655 - 3071
TMhelix
3072 - 3094
outside
3095 - 3097
TMhelix
3098 - 3117
inside
3118 - 3121
TMhelix
3122 - 3141
outside
3142 - 3160
TMhelix
3161 - 3183
inside
3184 - 3187
TMhelix
3188 - 3210
outside
3211 - 3254
TMhelix
3255 - 3277
inside
3278 - 3283
TMhelix
3284 - 3306
outside
3307 - 6663
