Strain
Avian_FJ376620
(Region: Hong Kong; Strain: Bulbul coronavirus HKU11-796, complete genome.; Date: 7-Jan)
Gene
orf1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
orf1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGTTAAGAACGTGTCAAAACGCAGCCCTATTGTGCTGCCACAAATACAACCACCTCCTCTCCAGCTGTTTATAGCAGTTGCTGCAGCTGAAGAAGGTCATCCAAAAGACCTTAAGTATTTGGGTAATTATAATCTGGTCACCTCGAAAGTAATTCCTGGTGTCCAGGTTTTAAACCCCAAAATATCACTTACTGAGTTTGAGCAGCTGTTTGGAGCACAACCTGTGTTACGTGCATTGCGTAACCTTGTTGTTGAAACCCGCAATGCTGCGTGGAATGGCTCCAAGCAGGATTTTGCTGCCAAAGCTCAAAGTCTTACCTTTACTGATCACGTTTTGAGGGCAATGATCAAATATTGCCCTCCGCGTGTTTCTGCACTTGCATCTTTGGCTCTGTTTTACAGAATTGTGAAAATAGATGCCAAAGATCTTTGTGATGTTGCCATTGATTGTGCCATTGAGGTTGCATACAGTGGTAAGACTGAACAACATTTTGCTGATGCTAAAAGTGTTGTTCTTACCCACAAGGATGGTTATCTCACTTTGTCGGCTGACTGTGTTGGGATTCCATTTACTTCCACACTTCTGGCCCAAGCTAAACCTAGCAATGGAGCCATGATCTATTCTGACTATTTGCTTTATCCAGGTGCCACCATACGTATTGTAGATGGAAAGCCAGTAGCACTAGTCACGAAGCCCATTGTTGCTATCATACAATCAACTCCATCCGTTGAAGAAGATGTTAGCCTTCTACCTGACTACAACCAGACACCAGCTATTCAGGTAGCTGGTGTTGATTGTGTTGTTAATGGTGTTTCTTACCTCAAGACACATGACAATCCACCACTCTACTATCCAAGAGTAAAGGGCGGTGTTGTCAATGTACCTCTAAAGCAACAGGGAACTGCAGCTAAAAAGCTGTCCGTTGTTTTCCATGCTAAGCCTGATGATGTTTTGATGGCTTTTATCCAACTTCAGGAGTTTCTTAACAGAACTACTGGTTCTGTTGTTGACATTGCTGATCAAACAACTTACGATGTTGCACCGAATGTGACCGTTACTATAGGCACTTCTAAACCGGGCGACATAGTAGTTTCAAATGAAGATGAGTACCTTAAGTGTTTTGAAACACCTGAAGTTTCAGCACTTTACAAGGTCTTCCAAACTGAATCATGGGCCGTAGTTGAGCAGAAGTTTCGTAGACTTCATGTGCGAGCGGCTGATGCTTTGTATGACTTTATTAGTTTTCTGCAGTCCTTAGCAGACAACTTTAAACCACTTTTTGTAGCTGTTGAAGCTGTTATAGCTCAGCTGCAGAACATTACTCTTGATCTTGCTGTTCGCATTAAGAAAATGCGTATTACATATACAGCAGGACATCTTGTAGTTGATGCTTCCAACTTTGTTGTGAAGCTTATCCAACCACTCTGTGACTTTATTACGCCTTTTTTGCGTAAAATTGCAGGGTTTGCTACTTATGCGTATGGAAAGAGTATGTTACTCTTTACATCCGCTGGTACATTTTTGTTGAAGCAAACTACAGGTGTTGTCAATAAGGCATGTTATGTCTTTGATGTGTCTCCTGACTACCCTGTTGACCTTACAACAGACAAAATATACCATGAAGATAGCTTACATCCAACTGATGACAAACCTACTAGGGCTCTAGAGGTTGTTAGTGTTGTTGTTGGTAATGCTATTCTTCAAATGGCTACTGATGGTGTTGCATACTACCCTACTGATGGTAAGTATGCATCTACACCAGCATTTAAAGCAGGGTCGGATGAATTAAACATAGTGTTTACATGCGACCTCTTTGATGATGACACAAATGCCATGATCAACGAAACATTGGTTGGTTATGAGCTTAATAATCTTGTGGCACCCAGAAATTCAACACCCAGAGACATTGCTACTCTGGTTGTGAATACACTTGTTGATGCCATTACTGATCATTACCCTGAAAAATGCCTTGATTTGCCTGAAAATTATCAGGTATTTTCAACGCATGATGACATGCCTCTTACTAATGAACATATACCTGGTCATCTTACCCTTTATGTACAAGCCATGGAGGGTAGTGATGATGGTGATGACATCATTATAGAAGAGGATGAATATTCTTGTGAGGATGATGGTGCCGATGAAGGAGTCATACCACAGTGTTGGGATGTTCCCAATTTAGACACTATTCTTACAAAAATTAAAAAGAATGAACCCTGCGTTGAAGTACAACAAGGTGTTCAAAATGTAGAGTCTACTAATGTAGATGCTTCTTCATTAGTGGATGATACCCAACAAACTAACGCTCAGGAGACTGAATTGTCTACTGAGAATAGTGAGCATTTGTTGGTTATTAATGATGACGAGTTTTTGGCTATTCCAGAACTCGACCGTCCACTTAAAGATTACATTCAAGAAAAACAACTTGATGTAATTATAGAAGAGTCAGAATCATCATCTGTTACTAGTAACAGTCCAGAACCGGTTGGTGATGATGTGCCTAGTGCACTTGATGATTCCAACATTCACACAGCATCTGAGACACCTTCGGATGAAGAGTTTCAGGACGCAGAGTGTGGTAATGATGATGTTTCAACTATTATTACTGATAGTACGGAAAATGGTGAAGAAGACCCATTGCTGGAAACTATTGTTAACCAACCATTTATAGTAGACAATAATCTACCAGCATGTGCAATCAAGGAACCTAGTTCTACTAAGGTTGAGTTGGTTGTTGGTGATTTGTCTACTATTAAGTTTGACAACTCTGTTTTGGTTAACCCAGCTAACCCACAGCTTACTAATGGTGGAGGGGCTGCTAAAGCCATTGCAGATCTTGCAGGACCTGAATACCAGGCACATTGTAACAAAATAGCACCTATAACTGGTGTTGTTGTTACAGAGCCTTACAATGCAAGAACTGTTGGTGTTGCATGCATTTTGCATGTAGTACCACCGAAGGGTACAGATGCTGATGTTCAGGAAAAGCTTTATGAAGCTTACCGCAGCATCTTAACAGAACCAGCACACTATGTAATTCCGTTACTTGGTGCTGGAATTTATGGTTGCAATCCGGTACATTCTCTGGATGCCTTTAAAAAGGCATGTCCACCTGATATAGGACGTGTGACCATTGTTACTAAAGACGTCAATCATGTACAATTGTGGGATGCCCTCAATCGTACTGTTGTACGTACTACGAAAGACTTTGACCAAATAACCACCCAGGCATTGACGCCTCAAGGTATCCTTGATGCCAATTTGTTTGATGGTGATACATTTGTTCAAGAACCTGTGCCAGACGTAGTTTATTTAGCTGTTGATGATTCGGTTCAGGAGCAGGCTAAAGAACTAGGTCTAACATTGTCTCAATATTGCAAGTACCTAAAGGCATGTCACCATAAATGGGTTACCGTGCGTACAAATGGTATATTGCATTTAAAACAAAAGGATAATAACTGTTTTGTTAGTGCAGCTATTAACCTCTTCCAAGCCACTCACTATAAACTCCGACCGGCTATTGATCAGCTGTACCAGGAGTATTTGAATGGCAATCCCTGTCGGTTTGTTGCATGGATTTATGCTTCAATCGATCAAACTATTGGAGATATGGGTTGTCCTCAACAGGTTACTTCCCTGCTGGTCAACAACTCAAATTCTAAATTTTCAGGCACCGTTCATTGTTGTAAGACTTATTTTACACATGATGGTGTTGTATCTAATGTTAGAGAATTTGATCTCTTACAACCCAAAGTGTTTTGTATGCGTTGTGATACCTGGACTACATTTTCGGCTGAAAATGTTGAAGGTGTTATCGTTTTAGGTAACACCCCTGGTAAGGCACCAACTCATGCAATTCAATTTGGTAATTCCCATTGTTGGTATACAAATGGGAAGAAATCTGTTAATGGCTATGACATCGATTCAGATGTAGTGGCCATTTACCATAAATTTCAAACCACACCTGTTCGAAATATTGTGGTTACACAACCAATTTCCACTAGTAATACATTTAGTGTGTTGCCAGTGCAGGATATTCCCAAGGAATCAATTCTTAATGATGACCCTAGTGTTGTAGTGGTTAGCAGTAAGAAAACACAGAACCATGAAGTCTTAGAGAATCCAAATTGTTTGGATTTGCTAGATGTGTGGATTCGTAAACCCAAATATGTCATGGTTAAATCATGGGATGTTGTGGGTAAACCGCTTTTTAAGACTGGTAAAGTTGTCTTACTTAGTGGTAAACATCTTACACGCATTTATGACTACCTGTGTAGCATAGGTGCTATTGATACTACAGCTAAACTTTCTATAAGTTTGGCATATAAATGTGTTAAGCGTGTTTTACCATCGTCTAACACATTAATTCGCACCATCAAAGGTTTGTTCTATTCGTTTAGAACTATACTTTTTGCATGCGCCCCATTTTTGCTATTGCCAGCAGTTGCTAGTATATTAGCATCTGGTTATCAGCTTGGTGTGTATGTTTATGCAAAGACAGGCATTCCTTGCTATGGCAATAGTACAGATCATTATGACTATCAATCATTTTGTGCAGGAGATTTAACTTGCCTCGCATGTTTTGATGGTCAAGATTCTTTACATTTGTACAAGCATTTACGTGTAGATCAGAGAACCTATGGTTCTAATGATTACACAACACATGCTTTAGCAATTGTATTACTTTTAGCAAACACCACTTTAGTCCTTCTGACTTTAGTAGCTTGCTTCTTGTTTAACTTTTATAAATTTACAATTCCATTTTATGGTGTTGTATTTGTAGACTACCAGACAACCCTTGTAGTTGTCTTTTCAGTCTACTACTTATTGAGGGTCGTTAAGTTTTTAAGACATATAGCTAAGGGGTGTAAAACACCCACTTGTACTATATGTTCCAAACTTAGAATACCACCCACTATTACTGTAGATACTATAGTTCAGGGTAGAAAATACCCTTCTGTAGTACAAACAAATGCTGGGTTTAAAATATGTAAGGA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Protein
MVKNVSKRSPIVLPQIQPPPLQLFIAVAAAEEGHPKDLKYLGNYNLVTSKVIPGVQVLNPKISLTEFEQLFGAQPVLRALRNLVVETRNAAWNGSKQDFAAKAQSLTFTDHVLRAMIKYCPPRVSALASLALFYRIVKIDAKDLCDVAIDCAIEVAYSGKTEQHFADAKSVVLTHKDGYLTLSADCVGIPFTSTLLAQAKPSNGAMIYSDYLLYPGATIRIVDGKPVALVTKPIVAIIQSTPSVEEDVSLLPDYNQTPAIQVAGVDCVVNGVSYLKTHDNPPLYYPRVKGGVVNVPLKQQGTAAKKLSVVFHAKPDDVLMAFIQLQEFLNRTTGSVVDIADQTTYDVAPNVTVTIGTSKPGDIVVSNEDEYLKCFETPEVSALYKVFQTESWAVVEQKFRRLHVRAADALYDFISFLQSLADNFKPLFVAVEAVIAQLQNITLDLAVRIKKMRITYTAGHLVVDASNFVVKLIQPLCDFITPFLRKIAGFATYAYGKSMLLFTSAGTFLLKQTTGVVNKACYVFDVSPDYPVDLTTDKIYHEDSLHPTDDKPTRALEVVSVVVGNAILQMATDGVAYYPTDGKYASTPAFKAGSDELNIVFTCDLFDDDTNAMINETLVGYELNNLVAPRNSTPRDIATLVVNTLVDAITDHYPEKCLDLPENYQVFSTHDDMPLTNEHIPGHLTLYVQAMEGSDDGDDIIIEEDEYSCEDDGADEGVIPQCWDVPNLDTILTKIKKNEPCVEVQQGVQNVESTNVDASSLVDDTQQTNAQETELSTENSEHLLVINDDEFLAIPELDRPLKDYIQEKQLDVIIEESESSSVTSNSPEPVGDDVPSALDDSNIHTASETPSDEEFQDAECGNDDVSTIITDSTENGEEDPLLETIVNQPFIVDNNLPACAIKEPSSTKVELVVGDLSTIKFDNSVLVNPANPQLTNGGGAAKAIADLAGPEYQAHCNKIAPITGVVVTEPYNARTVGVACILHVVPPKGTDADVQEKLYEAYRSILTEPAHYVIPLLGAGIYGCNPVHSLDAFKKACPPDIGRVTIVTKDVNHVQLWDALNRTVVRTTKDFDQITTQALTPQGILDANLFDGDTFVQEPVPDVVYLAVDDSVQEQAKELGLTLSQYCKYLKACHHKWVTVRTNGILHLKQKDNNCFVSAAINLFQATHYKLRPAIDQLYQEYLNGNPCRFVAWIYASIDQTIGDMGCPQQVTSLLVNNSNSKFSGTVHCCKTYFTHDGVVSNVREFDLLQPKVFCMRCDTWTTFSAENVEGVIVLGNTPGKAPTHAIQFGNSHCWYTNGKKSVNGYDIDSDVVAIYHKFQTTPVRNIVVTQPISTSNTFSVLPVQDIPKESILNDDPSVVVVSSKKTQNHEVLENPNCLDLLDVWIRKPKYVMVKSWDVVGKPLFKTGKVVLLSGKHLTRIYDYLCSIGAIDTTAKLSISLAYKCVKRVLPSSNTLIRTIKGLFYSFRTILFACAPFLLLPAVASILASGYQLGVYVYAKTGIPCYGNSTDHYDYQSFCAGDLTCLACFDGQDSLHLYKHLRVDQRTYGSNDYTTHALAIVLLLANTTLVLLTLVACFLFNFYKFTIPFYGVVFVDYQTTLVVVFSVYYLLRVVKFLRHIAKGCKTPTCTICSKLRIPPTITVDTIVQGRKYPSVVQTNAGFKICKEHNFYCKNCSQQNPDTFIPTEAIESLSRATRLNVKSTAPAYVLARDVECQTDAILARASHDGQPMVCISKYSDVRTVEALLKPTPLFSYTPDVIIAADFDNAGSLKTAKELAVVLSMDLKRTIFIIDQSYSRPVDNYTEVVSRMEKYFTFQKITPTGDIFTDVKTATNGQASDTAINAAILAVQKGLDFTIDNPNHILPHYAFDFNTLSAEDQSVLLEAGCAKGNLKGTNVGVVLAANLVMRLSQSAIRIIANAASRNGVTCAVTPSNITLRGNIATQPFQRVKAGSDNKHSVVKFLVVFLVLYATAFGLSTIASYAYNPSHPAVMSDIHTTGFYVIRDGVLDTIRSTDTCFSNKFVSFDGYIQAEYTNDPACPVVVGVADVTTKSIPGIPAGVLHRDGGILHIYEQALYDRLQRQSMVQEALNLKVRPLFNLGQQTIVGYTRTEVVVGTSYLRSPALFNAKCTYLEHHGERNLYCYDVVNKDHKLYTDVVPHVEYKAVDFNGNLVPFKIPEQLMFYPHIVRYTGNSYCRMGQCFKTNPGICISFTDQFPYSENVQPGVYCADTGLQLATNFLVGTISGVHVFTSTAALIGSTCVILLCVVGILIFQRLFKEYTTFVLYTLAIAIVNVCGIVLIYKYTAISFVYYTIYLYFVLTFVPVKRNIALFYFAVVVIPHISNMQLLTIAVVCVLYLCYSYIRVVSKTTGKFSSFLEASKSTFVIDNDKYVILKDLAGSDYDSYLASYNKYKYFSGTASDKDYDKVCMAFLAKALSAFREGGGSQLYTPPKLAVVQSLKAKLQAGIKILLHPSGVVERCMVAVTYNGSALNGVWLNNVVYCPRHVLGKYRGEQWQHMVSIADCRDFAITCPAQGIQLTVQSIKMVGAILQLTVHTSNSGTPDYEFVRITPGSSMTIACAYDGVVRNVYHVVLQTNNLIYASFLNGACGSVGYTLRGKTLLLHYMHHLEFNNQTHGGTDLHGQFYGPYVDEEVAQQQTAFQYYTDNVVAQLYAHLLTIDASPRWLASAEISESDFNAWASSNSFANFPCEQSNMAYILGLSQTAKVSVGRILNTIIQLTLNRSGALIMGKPDFECDWTPEMVYNQAPITLQSGVVKRASMWFFHFLFNTFLFVLATLHVLPVDLYPIGLPVVVSLAFLITLSVKHSVVFTTTYLLPAFLMFVVKAPTLWIPNTYLRSAYEWVFGLSMSERLTTYTVGCYIAVYAFIAINYTLRCLRYRSTSVISFCMQMLQYGYIAHITYRLMTQVWTERLLFTAFSLLTSHPLLAGFSWYVAGKFTVPLILPDLAIRITIYVCIGYVMCMRFGLLWILNKFTTVPMGTYNYMVSIEQLKYMMAIKMSPPRNVFEVIIANIRLIGLGGVRNIAVSTVQNKLLDAKAAAVVVANLLDKAGVTNKHAVCKKIVKLHNDTLKASTYEEAEMSLVKLLTHIIEFLPTDQVDAYLADTVKVQALNTYFDHLLENKLVLQAVVDANINLDSYRVYKEADATYRKSVEMDEPLQIQKKKLKAVNIAKAEWEREAASQRKLEKLADAAMKSMYLAERAEDRRIKLTSGLTAMLYHMLRRLDSDRVKALFECAKQQILPIHAVVGVSNDNLKVIFNDKDSYLQYVDGNTLIFKGQRYNIVKKLSLDNTPIEGIPEEYPVAVETIKEGVPQIQNNELCLRNVFTAQAPVLDGNGKETTAKSFYVSRAGKKILVAVTSTKDDLKTVTCSTDQGKVVLNLDPPMRFSHVVGGKQNLVYLYFIQNISSLNRGMVIGHISGTTILQANGTQIEYQENASLLTYLAFAVNPKEAYLKHLADGGKPIQGCIQMIASLGPGFAVTTKPQPNEHQFSYGGASICLYCRAHIPHPGVDGRCVYKGRFVHIDKDKEPVSFALTHEPCNSCQRWSNYDCTCGTTLQNSPYLNRVTGSSGARLEPQQPGVTPDAVKRAFHVHNNITSGIFLSTKTNCSRFRTTKQNLPLPNKGSVELYFVSKQCSQQVFEIEETCYNMFDDSLKSTPEKFGVLARTEFFKFDKIPNVNRQFLTKYTLLDLAYALRHLSTSRDVIKEILITICGTDEEWFGDSWFDPIENPTFYREFHKLGSVLNRCVLNANAFAKACSELGLVGILTPDNQDLLGQIYDFGDFIVTQPGNGCVDLSSYYSYLMPIMSMTHMLKCECYDNDGNEIDYDGFQYDFTDFKLSLFFKYFTYWDRPYHPNTVDCPDDRCVLHCANFNVLFAMCIPNTAFGNLCSQATVDGHKIIQTVGVHLKELGIVLNQDVNTHMSNINLNTLLRLVGDPTTIASVSDKCLDFRTPCQTLATMSSGITKQSVKPGHFNQHFYKHLLDSDILNQLGIDLKHFYYMQDGEAAITDYSYYRYNTPTMVDIKMFLFVLEVADKYLQPYEGGCLNAQSVVVNNLDKSAGYPFNKLGKARNYYDMTYAEQNQLFEYTKRNVLPTLTQMNLKYAISAKDRARTVAGVSIISTMTNRQYHQKMLKSISLARNQTIVIGTTKFYGGWDNMLRRLMNGINNPILVGWDYPKCDRSMPNMLRIAASCLLARKHTCCNQSQRFYRLANECCQVLSEVVVSGNNLYVKPGGTSSGDATTAYANSVFNILQVVSANVATFLSTSTSSHNSREIADLHRNLYEDIYRGDSNNTTIIDQFYQHLQKYFGLMILSDDGVACIDTEAAASGVVSNLDGFRDILFYQNNVYMADSKCWTETDMTVGPHEFCSQHTVLAEHEGKPYYLPYPDVSRILGACIFVDDVNKADPIQNLERYISLAIDAYPLTKVDPIKGKVFYLLLDYIRILAQELQDGILDTFQSMTDMSYVNNFVQEAFYAQMYEQSPTLQASGVCVVCASPTILRCGDCIRRPLLCCVCAYQHVTQTTHKRIIAINNYICSVDNCNEDNVEKLYISGTAIYCENHKPTLCIPIVANGTVFGIYRHTARGSDDIDLFNELATSNFDTIEPYQKANRAPLSLMLFAAETIKALEESIKKSYATATVKDVYDQRYIKLVWEHGKKPPPITKNHIFTGYHFNKNGKTQVGDYILTKTDGSDSYTYRGTSTYKLQTGDVLVLMAHVVTPLSAPPVLAQTTYVRKSLIPDTVNASFYVQHFKSYNEIALQKVTTVLGPPGTGKSTFAIGLAKYYPNARICYTASSHAAIDALCEKAFKTLPVGQCSRIVPTRTTVECFQDFVVNNTTAQYIFSTINALPDIKCDIVVVDEVSMLTNYELSSVNARLVYNHIVYVGDPYQLPSPRTMLTTGQLAPADYNVVTDIMVHTGADVMLDMCYRCPREIVDTVSKLVYDNKLKAAKPNSRQCYKTIINFGSSDIAHEGQSAYNEPQLRF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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR001205
RNA-dir_pol_C
IPR027352 CV_ZBD
IPR036333 NSP10_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR008740 Peptidase_C30
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR037227 EndoU-like
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR009466 NSP11
IPR017896 4Fe4S_Fe-S-bd
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR036499 NSP9_sf
IPR014829 NSP8
IPR002589 Macro_dom
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR042515 Nsp15_N
IPR014827 Viral_protease
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SUPFAM
Gene 3D
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score= 946 Identity=51.61%
Cov(Q)=14.92% Cov(P)=97.80%
3D Structure
Ontologies
GO
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6262
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
345.224669999996
Exp number, first 60 AAs:
0.01095
Total prob of N-in:
0.00504
outside
1 - 1468
TMhelix
1469 - 1491
inside
1492 - 1556
TMhelix
1557 - 1579
outside
1580 - 1588
TMhelix
1589 - 1611
inside
1612 - 1961
TMhelix
1962 - 1984
outside
1985 - 2249
TMhelix
2250 - 2272
inside
2273 - 2278
TMhelix
2279 - 2301
outside
2302 - 2305
TMhelix
2306 - 2323
inside
2324 - 2327
TMhelix
2328 - 2342
outside
2343 - 2345
TMhelix
2346 - 2365
inside
2366 - 2779
TMhelix
2780 - 2799
outside
2800 - 2802
TMhelix
2803 - 2822
inside
2823 - 2826
TMhelix
2827 - 2849
outside
2850 - 2868
TMhelix
2869 - 2891
inside
2892 - 2929
TMhelix
2930 - 2952
outside
2953 - 2966
TMhelix
2967 - 2989
inside
2990 - 3020
TMhelix
3021 - 3043
outside
3044 - 6262
