Strain
Avian_JQ065049
(Region: China: Hong Kong; Strain: Common-moorhen coronavirus HKU21 strain HKU21-8295, complete genome.; Date: 2007)
Gene
replicase polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
replicase polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGACGAAAAACTCATTTGATGTTGGCAAGGTTATAACTTTGCCTAAAGTGATCCCACCACCATTGCAGCTTTTTATAGCGGTGGCTGCAGCGGATGAAGGTCATCCTAATAAGCTAAACCGTTTAGCCGGTTATACACTTAGAACTGGCAATGTAGTGCCTGGTGTACAGGTATTGGATCCTAAGACAACCCTTACCGGGTTTGAAACTATCTTTGGTGTTCAACCAACTCTTCGTGCTATTGGAAATCTTCTTGAGAGTGCACGTACTGATGGTTGGGTTAATTCAAAGGACTTTATGGCTGTTAAAGCCAAAGAGCTAACATTTACTGATGATGTTTTGCGTGTTATGATTCGTCATGGTGCAGCAAGAATTCCATTTCTTGCATCCTTGGCTTTGTTTTACCGGCTGATAAATATTAATGTTAAGGATTTGTATTTTATTGCTGAGGATGTGGCAAGGGAGCTTGCCTATTCAGCTGACTTTTCAACTGTTTTGGCGGATGTTAAAACAATTGAATGTATTCACACAGATGGTTATTTAACCATAAACATTAATAAGCTAGGTAATAAATTTACTTCTAGCTTAGTAGCTCAGGCAGAACCTACTAATGGTTCCCTTACTTTTGGAAACTTTGTGTTGTGGCCTCGTGCTACAGCAATTAAGGTGAATGATGAGTTTTTGCCTTTTGCTGGTAAGGCAATTACTGCAACACAGGTTGGTAATCCTTATGATGAGGATGTTAACCTTTTGCCTGATTACCAACAATTACCTGTTGATGTGGTAGAGGGCACTGTTGTCACTGTGCGTGGCTATAAGTACATTAAAACAACTGCTGCACCTCCTCTTTACTATCCTATAGTGAAGGGTGGTGTATTGCCAGTTGCTCTAAAACAGCAGGGCTCTGCAAGTAAGAAACTTAATGTTGTTTTTCATGCATCTCCCAATGATGTATTGTTGGCTTTTATACAGCTACAGGAATTTTTAAATCGTTCTACTTCATCAACATTGGATGTTGTTTCTAAAGATGTTTATGAAGTGGCACCTGATGTAACTGTTACCATAGGTCCATCAAAACCTGGTGACATTGTCGTTCATGATGATGAGGAATATTTGAAGTGTTTTTTAACACCTGATGTTCCTCTTCTTTACAAGGTGTTTCAAACTGAGTCTTGGGCAAAGGTAGCTGTCATGTGTTCTAACATTCGTGTTAGAGTTTCAGACACTTTGACAGGATTTTTGACATTTTTACAATGTTTGTGTGATAAATTACCCACACTTGTTGGTGTGGTAAATTGTATTATACAAGCTCTTGAAGAACTTTCACTTTTTGCTGCTGCAAAAATTTCTAATATTAGACTTACCTATAAGGCAGGGAGTCTAGTTGTTGATGCTGTGTCTAGTGTGGCAACTCTTTGCCAGCCCCTTCTAGACTTTTTGACACCATTTTTGAGCAAGGTTGCTAATTTTGCTACTTATGCAGTTGGCAACTATATGCTTATGTTTACTTCAGTTGGCACATTTTTGTTGAATCGTACCAAAATTTGTGCTAACAAGATACGGTATGCAATTGACTATGCGGGTGTTTATCCCGTTGTTGAAGCAAAGCCTAAAATTCAGTATTGTGATGGCTTGACACCCGTTCATGCCAAACCAAAAGCTGAGTTGTTTCCTACTGATGTTGTGTTGGATAACACAATTATTCAGATGGCTTCTGATGGTCAACATCTTTACATGTTTGACGGTACACAAGCACATGAACAGGCATTCTTAGCTGGTGTTTCTGATGACATAACAGTTAGTTATGTTTGTGATGTGTTTTCTGATGAAGTCAATGAAGCTATTAATAGCACATTGTCGTCTTATGAATTAAACTCTTTTGTTGTGCCTTCGGATGCAACTGCAGAGTTTATAACACAACAGTGTATTGCATCGCTTGTTGATGCAATAAATGATTATCATCCTGAATATGTTTTGTCACTTATGGATGATTTACAAGTGTGTTCATCTTTTGATGATTTACCTTTGGCTTCACATCATATTCCTGATAAGCTTGAATTGTATGTTCAAGCTTTGGATAATGATGATAGTGATGATATTAATGTTGATGAAGATGATTGTCATTTTCAGGACACTGCAGAAGATGATGGTGGTGTTATCCCTACTTGTTGGGTGATACCTGAAATACCATCTTTTACTAAGGCTGATGTAACGTCTGTTGACGTTAAGCCTGATGAAAAAGCCCAGGAATTGGATTCAACTTTAGTACAGAAAACTGTTATAGTAGAACGTTTTACTGTGCATGACCTTAAAGCATTTGATTTGAAGTTGGATGTTATACCAGAAGAATCAGATGTTGATGTTAATTCTATGGAGACTTCAGATGTTTGTTCAGAATGTTCCGTTGAATATTATCAGGACGCATTGGATGATGACACTACAATTATAACAGATGAGTCTGATGTTGTTTTTCAAGATGAGCTTTTGGCCACTGTTGTAAACCAGTGTTCTCAGGTTGATAATAATATTCCTGAGATCGCAAAGAAACCTAATTCTCCTACTGTTGTAGAGCTAGTTGTTGCTGACTTGAAAACTTTAAAGTATGACAATAGTGTGTTGGTTAACCCAGCTAATGAATATTTGAGACATGGTGGTGGAGCTGCAGCAGCTATAGCAAAAATGGCAGGTCCTGACTATGTTAAATATTGTGATGAACATGCACCCTTTACTGGTGTGTTAAACACACCTGCTTTTGATGCAGAGAAGTTAGGTGTTGCATGTATTTTACACGTAGTACCCCCTCGTGGTACTGATTCTAATGTGCAGGAAAAACTCTATCTGGCTTATAAAAGCTTGTTAGTAGAACCTGCACATTATGTAATTCCAATATTGGGTGCTGGTATTTTTGGTTGTAATCCAGTACATTCACTTGATGCCTTTCGTAAGGCTTGTCCTCCCAATATTGGTAAAGTAACACTTGTTACTCAGGATGATAGACATCTTCAGGCTTGGGATGCCATTAATAGAGTAGTTGTACAGACAACTAAAGATTTTGATCAGGTCACTACTCAGCATCTCACCCCACAGGGTGTTTTAGATGCTAATTTGTATGATGGTCATGATTTTGTTTTGGAACCAAAGCCAAATCATGTTTATTTAGCTGTTGATGATGTTATACAAACTGCAGCTAATGATTTAGACTTGACATTGTCTCAGTATTGTATGTATTTGAAGAATTGTCAGGTTCGCTGGACCACTAAACGTGTTAAAGGTCTTGTTCACCTTCAACAGCAGAGTAACAATTGTTTTGTTAGTAGTGCTTTGAATTTTTATCAAAACACTCACTATAAGTTTAGACCTGTTATAGATGCTTTATATCAGGAGTATTTGAATGGCAATCCTAGCCGTTTAGTAGCATGGATATATGCATCTATATCACAGAGTATTGGAGAATTAGGATGTCCCCAGCAAGTTTTGAATTTGTTGGTTTTAAATTCTAATTCAAAATTTTCAGGAGTCACACATTGTTGTAAGAGATATTTTACACATGATGGTGTCGTCGCCAATGTTGAAGAATTTGACTTATTACAGTCAAAAGTATATTGTGTTCAGTGTGAATGTTGGACAACATTCGATGCTGAACAAACAGAAGGAGTTATTACTGTTGGGCGTACTTCAGGTCCAGCACCTACTCATGCCATTATGTTTGGCAATGCTCATTGTTGGTATACTGATGGCCGTAAATCTGTGAATGGCTATGACATTCAAGCTGATGTTGTTGCTATTTATCATAAATTTAACAAGGTTCCCGAGCAGACTGCAATGCTTGCTCAGGTTTTTGAAACTTCAAATAAATATGAAGTTTTAAAAGTAGATCCTGTTATTAATGATGATCAACTTCAGGATGTGGTTGTTACAATTCAACAACCTGCAGTACCTAAATGTGAGGTTTTGCAAAATCCTAATACAATAGATTTGTTGGATGTTTGGATCAGAAAACCGACATTTTTGTTGGTTAAATCTTGGTCCGTTATAGGTAAAACCTTGTTCAAAGCAGGTAAGGTTGTGTTTTTAAGCACAAGGATTCTTAATCGTATTTATGAATATTTGTGCCAGATAGGTGCAGTTGATCGCACTGCTAAGTTGTCATTTAACTTGGCTTATAAGTGTGTGAAATCTGTTTGTCCGAAACCACAAACTGTTGGTAGAGTTGTTAAGGGTATGTTTTATTCTTTTAGAACTATACTTTTAGCAATGGCTCCATTGTTGCTGTTACCTGCAGTTACAATATTGTTGCGTGCAGGTGTACAAGTTTTTACTTATTATTATGCTAAAACAGGTTGGCCTTGTAATTATAATGGTACTATACCATATGATTACCAGTCTTTCTGTGTTGGGCAGCCATTAACATGTATGGCATGTTTTGATGGTTATGACTCATTGCATTTATATCAGCATTTGCATATAAATCAAGTTCCTGTTAAAGATATTGATTATACTACAATTGCTGCTTTTATTGTTTTATTAGTGGCTAATGCTACATTAGCACTAGTTACAACTATTATAATATTTTGTGTTAATTTTTATAAATTTACCTTACCGTTTTATGGTGTGGTAATTTTGGATTATTATAATACATTAACTTTTGTCTTTGGTGTTTCATACACTATTAGACTTATAAGATTTTTTAGGCATGTTAGTAAGGGATGTAAATCTCCTACATGTACTATTTGTTCTAGGATACGTACTTCACCTACTATAACTGTTGAAACAATAGTTCAGGGACGTAAGTATCCATCTACTATTATAACTAATGAAGGTTCTGTTGTTTGTAAACAACATAACTTTTATTGTAAGAACTGTGATGCTATAAATCCAGATACTTTTATACCTGTTGAAGCAGTAGAGTCTTTAGCTAAAGTAACTAAGCTTGATGTTAAATCTACTGCACCAGCTTATGTTTTAGCTCGTGACGTGGAGTGTCAATCTGATGCTATAGT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Protein
MTKNSFDVGKVITLPKVIPPPLQLFIAVAAADEGHPNKLNRLAGYTLRTGNVVPGVQVLDPKTTLTGFETIFGVQPTLRAIGNLLESARTDGWVNSKDFMAVKAKELTFTDDVLRVMIRHGAARIPFLASLALFYRLININVKDLYFIAEDVARELAYSADFSTVLADVKTIECIHTDGYLTININKLGNKFTSSLVAQAEPTNGSLTFGNFVLWPRATAIKVNDEFLPFAGKAITATQVGNPYDEDVNLLPDYQQLPVDVVEGTVVTVRGYKYIKTTAAPPLYYPIVKGGVLPVALKQQGSASKKLNVVFHASPNDVLLAFIQLQEFLNRSTSSTLDVVSKDVYEVAPDVTVTIGPSKPGDIVVHDDEEYLKCFLTPDVPLLYKVFQTESWAKVAVMCSNIRVRVSDTLTGFLTFLQCLCDKLPTLVGVVNCIIQALEELSLFAAAKISNIRLTYKAGSLVVDAVSSVATLCQPLLDFLTPFLSKVANFATYAVGNYMLMFTSVGTFLLNRTKICANKIRYAIDYAGVYPVVEAKPKIQYCDGLTPVHAKPKAELFPTDVVLDNTIIQMASDGQHLYMFDGTQAHEQAFLAGVSDDITVSYVCDVFSDEVNEAINSTLSSYELNSFVVPSDATAEFITQQCIASLVDAINDYHPEYVLSLMDDLQVCSSFDDLPLASHHIPDKLELYVQALDNDDSDDINVDEDDCHFQDTAEDDGGVIPTCWVIPEIPSFTKADVTSVDVKPDEKAQELDSTLVQKTVIVERFTVHDLKAFDLKLDVIPEESDVDVNSMETSDVCSECSVEYYQDALDDDTTIITDESDVVFQDELLATVVNQCSQVDNNIPEIAKKPNSPTVVELVVADLKTLKYDNSVLVNPANEYLRHGGGAAAAIAKMAGPDYVKYCDEHAPFTGVLNTPAFDAEKLGVACILHVVPPRGTDSNVQEKLYLAYKSLLVEPAHYVIPILGAGIFGCNPVHSLDAFRKACPPNIGKVTLVTQDDRHLQAWDAINRVVVQTTKDFDQVTTQHLTPQGVLDANLYDGHDFVLEPKPNHVYLAVDDVIQTAANDLDLTLSQYCMYLKNCQVRWTTKRVKGLVHLQQQSNNCFVSSALNFYQNTHYKFRPVIDALYQEYLNGNPSRLVAWIYASISQSIGELGCPQQVLNLLVLNSNSKFSGVTHCCKRYFTHDGVVANVEEFDLLQSKVYCVQCECWTTFDAEQTEGVITVGRTSGPAPTHAIMFGNAHCWYTDGRKSVNGYDIQADVVAIYHKFNKVPEQTAMLAQVFETSNKYEVLKVDPVINDDQLQDVVVTIQQPAVPKCEVLQNPNTIDLLDVWIRKPTFLLVKSWSVIGKTLFKAGKVVFLSTRILNRIYEYLCQIGAVDRTAKLSFNLAYKCVKSVCPKPQTVGRVVKGMFYSFRTILLAMAPLLLLPAVTILLRAGVQVFTYYYAKTGWPCNYNGTIPYDYQSFCVGQPLTCMACFDGYDSLHLYQHLHINQVPVKDIDYTTIAAFIVLLVANATLALVTTIIIFCVNFYKFTLPFYGVVILDYYNTLTFVFGVSYTIRLIRFFRHVSKGCKSPTCTICSRIRTSPTITVETIVQGRKYPSTIITNEGSVVCKQHNFYCKNCDAINPDTFIPVEAVESLAKVTKLDVKSTAPAYVLARDVECQSDAIVARAIIGGTHKVCVSKYSDVRTVEALLKPVPLYSYTSDVIIAVDFDNSGSLRTAKELAVVLSMDLKRTIFIIDQHYSRPIDNYTEVCSRIEKYFTINKITPTGDIFVDVRNATNGQVTDSAINAAIIAVERGLDFTIDEPNHVLPHYAFDFSSLSVEDQSVLLDMGCVKGNLKGTNVGVVLTANLVTRLTQQALRVISNAASRNGVTCSVTPSTRVLRGNIVTQPFARIKAGKFSNQNVKLIKLFAVIAFVYVVAFATFYVANGLTYNTVPTVKSDIKVSGFYLIRDGVLDTIRAEDDCFMNKFLAFDSYIQKPYVNSPQCPIVVGIADVTGLSLPGIPAGVIQRDGLILHIYEQSLYDKLLRKSLVDGVLNIQTRNLFNIGNKMVVGYTQHEVVTGDSYLYSPALFNAKCTFLLYNNNRTLYCYDKVDVPHKLYSDVIPHVEYKAVDLNGDYVPFKIPEQLFYYPHVVRYVSNNYCRMGHCFRTDPGVCVSFVDAFPYTQNDVYGVYCASNGYKLVTNLVLGTITGIHVFTSTAALLASTGVIIFCVIFALSFQRLFKEYTVFVVTTLVVAVFNIIGIFLFYKITLLAIVYYVVYVYIALLAAPVKRNIALFYLCVVFIPHITNMQLLCLVICGFLYVVYNYVYIVTKTKGKFSSFLDAAKSTFVIDNDKYVLLKDLAGPDYDQYLASYVKYKYFTGTASDKDYDKVCMAFLAKAMSLFREGGGTQLYTPPKLAVVQSIKIKLQAGIKILLHPSGMVERCMTSVTYNGSTLNGVWLHNIVYCPRHVIGKYTGDQWQLMVSILDCNDFIIKCPTQGIQLTVQSVKMVGAVLQLTVHSSNAHTPKYEFTRLTPGASMTIACAYDGIVRNVYHVVLHLNNLIYASFLNGACGSVGYTVKGATLHLHYMHHLEFNNQTHGGTDFHGVFYGPYIDEEIAQQQMPTQYFTDNVVAQIYAHLLTIDRSPKWLARQAISDEEFNRWAVNNAFANYPCDSANLPYLTGLAETSKVSIGRVLNTIIQLTLNRDGALIMGHPDFECDWTPQMVFNQAPINLQASVVSTCFNWCLVVLFNMVLFALALIHILPVNMYVMIPMIAGCTAFIVTITIKHTVVFLTTFLLPTLVLFVVLAPTIWVPNTYLRYIYEWIIGYTTYDNFTSYTFCLYMLVYIIVAINFTLRNVRYKATSLVDFCLKSLQYGYTLRIMYRLFTETWDEHLLFPAVALLSSHPMYAAICWKLAGKFILPLVIPDLAVRICVYFLLGYISCMRFGIFWFINKFLALPIGTYKYMVSMDQLKYMMATKMSPPHNVFEVMTTNIRLFGIGGHRNIAISTVQNRVLDAKATAVIVANLLEKAGVTNKHVVCKKIVKLHNDTLKAATYEEAETALVKLLAHIIEFLPSEQVDEYLSMVNKPRVLDEYMDVLVQNKFVLQAVVDANIHMDSYRIFKEAEQAYKKSVELNEPIQEQKKKLKAVNIAKSEWERDAASQKKLEKLADAAMKSMYLAERAEDRRIKLTSGLTAMLYHMLRRIDSDKVKALFECAKQSILPIHAVVGVSSDALKVIFNDKESYMQYITGNILIYKGVSYNILKVTSLDNSPIEGIPEEYPVVVETIKVGIPNIQNNELCLRNVFTAQNVAYDINGKEETTKSFYVSRTGKKILVAITSTKDNLQTVVCHTDTGKTVLDLDPPMRFSHVVGGKQSVVYLYFIRNISSLNRGMVIGHISGTTILQATGTHVEYQENASLLTYLAFAVNPKEAYLKHVADGGKPIQGVIQMIAPIGSGFAVTTKPQPNEMQYSYGGASVCLYCRAHITHPGVDGRCVYKGRFVHIDKDKEPVSFALTHEPCNSCQRWLNYDCTCGSVLQNTAYLNRVKGSSDARLEPQQSGTQPDIVKRAFHVHNNITSGIFLSTKTNCARFKTQRINLPIPNSGVVDLYFVTKQCSTSSFELEEKCYNLFSSEFKSTDDTFGVLAKTEFFKFDKIPNVNRHNLTKYTLLDLAYAIRHLSTSKDVIQDILITMCGTPQTWFDDQWFDPIENPTFYNEIHKLGVILNRCILNANKFASICRDVGLVGILTPDNQDLLGQIYDFGDFIVTQPGNGCVDLESYYSYLMPLMSMTHMLKCEMFDIDGNYKEYDGYQYDYTDYKKYLFDKYFQHWRMPYHPNTIDCVDDRFLLHCANFNVLFAMCIPNTAFGNLCSKATVDGHTIIQTVGVHLKELGIVLNQDVDAHMSNINLNTLLRLVGDPTTHAVVADKCVDLRTPCQTLATMSGGITKQSVKPGHFNHHFYKHLIDSDILSQLDIDIRHFYYMQDGEAAIKDYSYYRYNTPTMVDIKMFLFCLEVANRYLDPYEGGCLNAQSVVVNNLDKSAGFPFNKLGKARNYYDMSYAEQNQLFEYTKRNVLPTLTQMNLKYAISAKDRARTVAGVSIVSTMTNRQYHQKILKSISLARNQTIVIGTTKFYGGWDNMLRKLMNGIKNPTLAGWDYPKCDRSMPNILRIAASCLLARKHTCCNQSQRFYRLANECCQVLSEVVVSGNNLYVKPGGTSSGDATTAYANSVFNILQVVTANVAAFLSTSTTSHSLKEVADLHRNLYEDIYRGDSNNKTVIDNFYDHLATYFGLMILSDDGVACIDTEAAANGVVADLNGFRDVLFYQNNVFMSDSKCWTETDMTKGPHEFCSQHTVLTEHEGKSYYLPYPDVSRILGACIFVDDINKADPVQNLERYISLAIDAYPLTKVSPVKGKVFYLLLDYIRILAQELQSGILDTFQTMTDMSYVNNFVQEAFYAQMYEQSPTLQASGTCVVCSSPTILRCGDCIRRPLLCCVCAYQHVTCTDHKRVIAINNYICSVDNCNEDNVEKLYISGTSIYCENHKPTLCIPIVANGTVFGIYRHTAKGSDDIDLFNMLATSDYSTVEPYKKANRAPISLMLFAAETIKAREESIKKSYASATVKDVYDQRFIKLVWEHGKKPPPITKNHIFTGYHFNKNGKTQVGDYILAKCDGGDSYTYRGTSTYKLQTGDVLVLMAHVVTPLSAPPVLAQSNYTRKTLIPDSVNASFYVQHFKSYNDIAMQKVTTVLGPPGTGKSTFAIGLAKYFPNARICYTASSHAAIDALCEKAFKTLPVEHCSRIVPTRTTVDCFQDFVVNNTTSQYIFSTINALPDIKCDIVVVDEISMLTNYELSSVNARLVYNHIVYVGDPYQLPSPRTMLTTGHLSPADYNVVTDIMVHTGADVMLDTCYRCPKEIVDTVSKLVYDNKLKAAKPYSRQCYKTIINYGNSDIGHEGQSAFNEPQLQFALAFRKFKKWDNVTFISPYNAMNVKAAMAGFSTQTVDSSQGSEYDYVIFCVTTDSGHALNMSRLNVALTRAKIGILVVFRQANELYQELQFESIEPSLVGQEGVLLRTDRRSTALAKSGSTPVKVQCSENETQGVLPGGETSTRSLTSLFKRCGFDYKGVHPAHALTWHDCGPDYRCNEPLAKLVGVADGTPISYKTLVSALGFLPSLNIDEYHNMFITKDACRVYAQSWVGIDVEAAHAVKPNVGTNLPLQVGFSTGVNFSVVPEGIWIDEHGTCSDVVPAKIPPGEQFRHLRKDMRIARPWKVVRYEIVAHLAELAPQTDHICFITWAHQLELATMRYFVKIGKEEFCFCGRRACFTNNKAFYCKSHYNVDIPCDYVYNPFVVDVATWGYTGNLSSNHDAFCTYHANAHVASADAAMTVCLAIQNLFSSVDWSLEYPVTPEQSYLNKACRLVQANYLNILLTTTKANVVHDIGNPKGIPAVRKAGVKYHFYDMNPLVKHVTKLKYKPDMEPRFDGLTMFWNCNVDSYPANALVCRYDTHKQKHLIGPNGSALYINKHAFLTDAMQSYATHKLMLAPLVYYSTTDCSKDQPIVVTYRDCVTRCNTGTTVCSTHALEYQNFIQAYNVMSKNGFNVYIPRNINVYNCWLTFANLQTIENLAYNCYYKNYNAHNDGQLDVVVNNNAVYVKVNDNLVKLFDNKTNLPVSVAFEHYINRHMRTLPTTQLLSGLGVTATRNFTIWVNDDSAFPNTINISVYTDCDPQNHVVLCDDRYGTDWSQFNQFKNAVFLTASQVKKYPAFVCTALTINNVPVEGEKLYIYCRVNGEFVTIDTICTQGRLLDKFTPRSKMESDFLTMDQSTFIDTYKLQDLGIDHIIYGDDTKPIIGGTHTFISLVRNKFNCQMVSHIYNPVQNCVVTSTSASTKEVCTVLDILLDDYVDIIRNAHNNYTTKSKVFSVTIDNQKVSFMLWHDANVQTCYPIVQSLTNGYQMPSVYKSLVTELEPCDIPNYHAYIPKVPGVIKNVIKYRQLFNYIVKKDRLAVPHNMTVLHLGAASFDGVAPGSAVIKQMFPEGTVLIDLDIRDFVSDANQVIVTDYRTYMPPHYVDAIFSDLYCNDDIHFFDNLIRIVHERLALGGSIFVKVTEHSYSAALYELAGYFDEYQLFCTAVNASSSEAFLCCFNYLGYAKYNIDGYNAHAAYIKWRNEIVLTPTYSPLADITTTIVKLKATPVVSKKELDKKPILNYLVASGRLLVRPPECSDLY
Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR009003
Peptidase_S1_PA
IPR009466 NSP11
IPR014822 NSP9
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR037227 EndoU-like
IPR027352 CV_ZBD
IPR014829 NSP8
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR036499 NSP9_sf
IPR036333 NSP10_sf
IPR002589 Macro_dom
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR042515 Nsp15_N
IPR008740 Peptidase_C30
IPR014827 Viral_protease
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score= 926 Identity=50.96%
Cov(Q)=15.05% Cov(P)=97.80%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0019079 P:viral genome replication
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0016021 C:integral component of membrane
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host membrane
Host perinuclear region
Host membrane
Topology
Length:
6208
Number of predicted TMHs:
12
Exp number of AAs in TMHs:
331.384719999996
Exp number, first 60 AAs:
0.0798299999999999
Total prob of N-in:
0.08618
outside
1 - 1413
TMhelix
1414 - 1436
inside
1437 - 1500
TMhelix
1501 - 1523
outside
1524 - 1532
TMhelix
1533 - 1555
inside
1556 - 1906
TMhelix
1907 - 1929
outside
1930 - 2197
TMhelix
2198 - 2220
inside
2221 - 2226
TMhelix
2227 - 2249
outside
2250 - 2252
TMhelix
2253 - 2272
inside
2273 - 2291
TMhelix
2292 - 2314
outside
2315 - 2745
TMhelix
2746 - 2768
inside
2769 - 2774
TMhelix
2775 - 2797
outside
2798 - 2816
TMhelix
2817 - 2839
inside
2840 - 2911
TMhelix
2912 - 2934
outside
2935 - 6208
