Strain
Bat_KJ473795
(Region: China; Strain: Bat coronavirus 1A; Date: 2011)
Gene
ORF1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
ORF1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGTCGTCCAACCTTGTGACATTGGCTTTTGCCAGTGATTCGGAGATTTCTGCAGAGGGTTTCTGTGATGTTAGTTCTGCCGTCTACGCTTTTAGCGTGTCCGCAGCTAACGGTTTCACAGATTGCCGTTTTGTGGCCCAAGGCTTAGAACATTGCCTTGTTGGTATTGAAGCTGATGACTACGTCCTGTGTGTAACAGGCGATGTTCAGCTTAAGGCATATATTGCCAAATTCTCGGACCGTCCTCTAAACCTTCGTGGTTGGATCGTCCGTTCTAATTCAAACTACTTTCTTGAAACCATGGATCTGGTTTTTGGCTGTGGTGGTGGCACTTCAATTCCAGTAGATAACTACATGTGTGGTGCCAACGGTAAGCCAGTTTTACCAGAAGATATGTGGTGCTTCTGCGACTATTTTGGTGATGAGGGAGATAACATCACTGTAAATGGTCAAGCCTATCATAAGGCATGGAATGTCACTCGTAGTGATGTCCCATACCAGTTTCAGAATGCTAGCACCATTCTTAGCATTGAGTACCTTGCAGACGAAAAACATGTGCTGCCTGATGGTGCTGTTGCTAAGACTGCTAAACCACCTAAGTTCTCTAAGAACATTGTTCTTTCAGAGAAATACAAAGCACTTTATGATGCTTGTGGCAGTCCATTTGTCACTAATGGCACCAATGTCCTTGAGGTTGTAACCAACCCCATTTTTGCGCATGGTTTTGTGCAATGTAAATGTGGGTCTAAACATTGGACTACTGGTGACTGGGCTGGTTTTAAATCAGTGTGCTGTGGCATACCAGGACGTGTCTTGTGCACTGTCTTTGGTGGTGTTGCACCTGGTTCAGTTTTACTGACATCAACTCGTGTTGATGCCAGCCCTGGTGCTGCACGCTATTATCATGGTTTGACACTTAAACACATTTGCAATGTGGATGGTGTTGCATGCTGGCGTGTCACTAAAGTGCAGGGTGTCGAAGGTTTTGTAGCTAGTGGTTCTATTGAGGACTGTGTTGGCTCCACTTTCGACACTTGCACATATGACAATTACACTTCAGTTGCGAAGGCCTTTAAGTGTGGCATGTTAACTGGCAACTTTGCTGACGATGTTGTTGCCAGTGTCATTAATGGCACACTTGATGTTGGTCTTGCAGTGCTGGATGTAACCACAGCTGTAACCAAGCCTTGGTTTGTGCTGAAGTGTGGTTCACTTCTTGAATCTGCTTGGGATGCACTCATAATGGCCGTTAAACAGTTACCTGTTATGGCTAGTGATGTGCTGAAGTTCTTTAACAACCTCAGTCAAGTGCTGATTGTTGTTAGAGATGGTGTCATTGACATCATTCATTCTGTGCCAGAGGCTTTTAAGAGCGCCTTTGAGATCTTTAAAGACCTTATTACAGGTGTGTTTGATCTTGTTGTTGATCATTTTAAGATCGCCAACAAGAAATTCAAGCGTGCTGGTGACTACATCCTTTTCGAAAACGCACTTGCCTGTCTTGTCAGTGCAAAAGTTAAGGGTGTTAAGCAGGCTGGTCTTAAAAAGCTTCTCTATGCTAAAGCTGTTGTTGGTGCTACGGTTAAAGTTACTGTTAGCCGTATTGAAAGTGCAACTGTCAAACTCGTTGAGTGTAAACCATCTAAATTTGTGAAGAAGGGCAATGTTGTTGTTATTAACGACATAGCATTTTTCCACAGTGATGGTGTTTACAGACTGATGAGTGACAGTGACGAGGTCTATGAAGACATTGCTTTCACTGCTGAAGGTGTTTCCACAGTTAAGAAGCCAGTTTTTGATTGTAACAAACCAGTTGACTTTCCTGACATCAGTAGTACTGATGTTGAAGTATTGGTTCGCGAGGTCAGAGCTGCTCTTGGCAAGTTCTCCAGAATCTATGACAAATACAGTTGTGTTGTCAAGGACGGAGAATGTGTTGTCACACATAAGTATGTCTTCAATGCACCTAGCTTTGTTGAAGACAAGGCTATGTTTGTTGACCTCTGTAAGGATTATGTCACAGATGTTGGCTTTGAGGCATTTTATGCTAATGCCATTGTTGCTAACAATTCTGATGATTTTAATCCAGTTTACTCAGCTTTTGAGGTTTTTAAAACCAAAGTTGAGTGCCCTGAAGAACTTATGAATATTGATGGCGGTTCTATTTTTGGAACTTTCATCAATACAGTTAATGATGCTGTGAACTTTGTCAAATCGTTGAAGATAACGGTAACAGCTACTGAAGTCATGATTAACACTGTTAAGCGATTCAAACGCTTTGCCAGTGCTCTTGCTAAGCTATATAGTGAGTTTATGAATACTGTTAAGAATATTATTTCTATCGGCAGTATCAAATGTTATCACTATGGCTTTGTGAAACCTGTTCTAGTGATCAAAGACGTCTTTTACCGCATCCAGGATGCTGTTGTAGACACATTCAATGTCGCTGTTGAAGCAGGTCTAAATACAGTTAAGACTTTCAGTGGTGGTGAAAATCCTATCACTTTCTCACGTGTTGAAGTTGCTAGTGTCGAGCTTGAACATGCTGAATACGTCAAGCCCGAAGATAATGGTCATGTCAGTGTTATTAATGGACACACATTCTACACATGTGGTGACTATTACTATCCTTGTGACCAGAACAATTGCTTCTCACAGTGCTTTAAGAAGGTTGGTGGATCTGCTGTTACATTTTCTGAAAAAGTTGCTGTCAAACAAATTGACCCTGTTTACAAAGTAAAACTCGTTTTCGAGTTTGAAGATGACACTATCAGTAGTGTATGTAAGCAGGCAATTGGTAAGTACATCTCTTTTGAAGGCAATGACTGGTCCAGCTTTGAGGAAACTATCCATAACGCTATGAGTGTTGTTGGTGAATTCGTGAACTTACCTGATTACTTCATCTATGATGAGGAAGGTGGTCACGACTTAACTAACACTGTTATGGTTTCTCAATGGCCAGTGTTTGATCCATCAGCACTACAGCTTTTAGTTGCTGACTTGGGTGTCAATTGTGACTTCAATGGTAAGTCTTCCATTGAAGAATGTCTGACTTCTGTTTCTGACACTGTTCTTTGTGTGTCATTGGAGAAGTCATGTGACTGTGGCACCTTCAATGCTATAATGGAAGGGTTTGCACTTGATTTCAAACCATGCACTGGTAGTGATGTCTGTGACAACTGTGGTGGTCTTTGCACTACTACTGTTTTGAGCATGACTGGTACTGGTTTTGTGCGTTCTTGTGATGAACCATTAGTGCCTTTCAATGTTACATTTGAAGGTTATGGTGTCTACAAGGACGTTTGTTTTGTCAATGACACAGTGTTACCTCCTCCACTTGATGAAGAGATCACACCTGTTAAGGAAGAACTAGTAGTAGATAATGTCATCGCAGCTGATGAAGTTGTTGATGTTGAAACTACTACACAAGTAGAAGAAGTGACTGTTGTTGAAGCTGTTGAAGAGGACATTATCAAACCTGAAGAGGTTATTGATGTTTCTTCTGATATTGAGGCTGTTAATCAGGCACTTTCATTTATGAAACCTACAGAAACAAAGTTTGTAGACCCATTCAAGTTTGATTATTATGATCATGAGGGTATTCGTGTACTCAGACAGAATAATAATAATTGTTGGGTCGCTTCTACTTTGGTACAATTGCAACTGTCAGGCTTTTTGGATGATGATGACACTATGGCTCTTTTTAAAGCTGGTAGTGTGTCACCATTGGTTCGCAAGTGTTATGATGCAGTTGGAGCTATTGTAGGTAGTCTAGGTGATGCATCTCACTGTTTAGAAGTTCTTCTAAAAGATCTGCATACCATGTTCATCACTTGTGACGCCACTTGTGGTTGTGGTAGCAGTAATTATGAACTTAGTGGTTCTGTTTTTAGATTTATGCCTACCAGAGATAGTTTTAGTTATGGTGCTTGTGGTGTTTGTGGTAAAACACTCAAGCTTAAGATTAAGACTATGACTGGTACTGGCTTCTTTTGTCAGGATCCAAAACCTTTTAATACTGCACGTGCTATTGTAAAGCCAGTTTGTGCTAGTATTTACCAGGGTTCTACTACTAGTGGACACTATAAAACCAATGTCTTTGGCAAAAGATTTTGCGTTGATGGTTCTGGTATTAGCAGCATTTCTAATGGTCATATTAATACGATTCTTTTGAAGGATTGTAACTATGGCATTTCTGCTATTGCTGAACCTAAGCAAGAAAAAGTTGAACAATTTGTCACACCTGAAGATGTTGGACAAGTTGTTAAACAAAAACCTAAGCCTTTCACTACTTATCGCAATATTGAATTCTACCAAGGCGATGTTTCTGAATTAGTTGGTCTTGACTTTGACTTCATTGTCAATGCAGCCAATGAAAATCTTAAACATGCTGGTGGAGTTGCAGCTGCGATCGACAAGCTTACTGGCAATGAGTTGCAGAGTTTGTCAAATAAGTATGTAAAGGCAAATGGTAAAGTCAAAGTTGGTTCTGGTGTCATGATACGTTGTAAGAAATACAGCGTACTCAATGTTGTAGGACCTAGAAAAGGTAAACATGCACCTGAGCTTTTGGAAAAGTGTTACAGAACTATTCTTAAAGAGCAAGGTGTTCCTCTCACACCTCTTATTAGTGTTGGTATATTTGGTATACCTCTTGCAACATCTTTCAACGCTCTATTGAACACGTCCAGTGGTAGAACGGTTAGATGTTTTTGCTACACTGATAAAGAGTGTAATGAGATTAAAATACTTGTTGCTTCTCTTAATGAAGAACAAGTTGCAGCTACTGTTGAAGAAACAGTTGTAGCTGAAGAAAAGCTTATTGCTGACTTAACAGCTGTTGAAAGAACTGCTGAAGAAAAGTCAGTTGAAGCTGAGAAAATATCTACCGAGGAGGTTAAAGAACCTTTGGTAGCTGAGAAAGTCATTGTTGAGGTAAAAGAACCTGTTTTAAAGGTTGCTGGTGTGTCTTATTATAATATTGAAGACAGTTTTGCTGT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Protein
MSSNLVTLAFASDSEISAEGFCDVSSAVYAFSVSAANGFTDCRFVAQGLEHCLVGIEADDYVLCVTGDVQLKAYIAKFSDRPLNLRGWIVRSNSNYFLETMDLVFGCGGGTSIPVDNYMCGANGKPVLPEDMWCFCDYFGDEGDNITVNGQAYHKAWNVTRSDVPYQFQNASTILSIEYLADEKHVLPDGAVAKTAKPPKFSKNIVLSEKYKALYDACGSPFVTNGTNVLEVVTNPIFAHGFVQCKCGSKHWTTGDWAGFKSVCCGIPGRVLCTVFGGVAPGSVLLTSTRVDASPGAARYYHGLTLKHICNVDGVACWRVTKVQGVEGFVASGSIEDCVGSTFDTCTYDNYTSVAKAFKCGMLTGNFADDVVASVINGTLDVGLAVLDVTTAVTKPWFVLKCGSLLESAWDALIMAVKQLPVMASDVLKFFNNLSQVLIVVRDGVIDIIHSVPEAFKSAFEIFKDLITGVFDLVVDHFKIANKKFKRAGDYILFENALACLVSAKVKGVKQAGLKKLLYAKAVVGATVKVTVSRIESATVKLVECKPSKFVKKGNVVVINDIAFFHSDGVYRLMSDSDEVYEDIAFTAEGVSTVKKPVFDCNKPVDFPDISSTDVEVLVREVRAALGKFSRIYDKYSCVVKDGECVVTHKYVFNAPSFVEDKAMFVDLCKDYVTDVGFEAFYANAIVANNSDDFNPVYSAFEVFKTKVECPEELMNIDGGSIFGTFINTVNDAVNFVKSLKITVTATEVMINTVKRFKRFASALAKLYSEFMNTVKNIISIGSIKCYHYGFVKPVLVIKDVFYRIQDAVVDTFNVAVEAGLNTVKTFSGGENPITFSRVEVASVELEHAEYVKPEDNGHVSVINGHTFYTCGDYYYPCDQNNCFSQCFKKVGGSAVTFSEKVAVKQIDPVYKVKLVFEFEDDTISSVCKQAIGKYISFEGNDWSSFEETIHNAMSVVGEFVNLPDYFIYDEEGGHDLTNTVMVSQWPVFDPSALQLLVADLGVNCDFNGKSSIEECLTSVSDTVLCVSLEKSCDCGTFNAIMEGFALDFKPCTGSDVCDNCGGLCTTTVLSMTGTGFVRSCDEPLVPFNVTFEGYGVYKDVCFVNDTVLPPPLDEEITPVKEELVVDNVIAADEVVDVETTTQVEEVTVVEAVEEDIIKPEEVIDVSSDIEAVNQALSFMKPTETKFVDPFKFDYYDHEGIRVLRQNNNNCWVASTLVQLQLSGFLDDDDTMALFKAGSVSPLVRKCYDAVGAIVGSLGDASHCLEVLLKDLHTMFITCDATCGCGSSNYELSGSVFRFMPTRDSFSYGACGVCGKTLKLKIKTMTGTGFFCQDPKPFNTARAIVKPVCASIYQGSTTSGHYKTNVFGKRFCVDGSGISSISNGHINTILLKDCNYGISAIAEPKQEKVEQFVTPEDVGQVVKQKPKPFTTYRNIEFYQGDVSELVGLDFDFIVNAANENLKHAGGVAAAIDKLTGNELQSLSNKYVKANGKVKVGSGVMIRCKKYSVLNVVGPRKGKHAPELLEKCYRTILKEQGVPLTPLISVGIFGIPLATSFNALLNTSSGRTVRCFCYTDKECNEIKILVASLNEEQVAATVEETVVAEEKLIADLTAVERTAEEKSVEAEKISTEEVKEPLVAEKVIVEVKEPVLKVAGVSYYNIEDSFAVGADNIVILTNSKLELGKIGECIDKHSDGALRLAVSEYLSQTPNVPPGNVISMRCSGLATVVFAVVPSDGDVQYVKNVKRTISKLSKLKGSSVCSFSTLDMHKRLLNLFNKFCVDNIDDIKDIHDTKTTIKVSLDGRNVVDVDVAADQTIGEQLNACTTDNVIISDSVVTDVIDTIVNVAPEVDWDSFYGFPHAAEFHMLDHSAYAFDSDVVDGKRALVGTDNNCWVNAVCLQLQFAEVDFTSEGLKDMWNEFLVGNVAKFCHWIYWLVRANKGDAGDAENALNMLNKYVKAHGTVTLTRETAEGCCVNEHRINSFVVNASVLRSGCNDGYCKHGNAYIARVSKVDGVSVIVNVDRPSVMSDNLLLSGTSYTAFSGPMDSGHYRVFNPATSKMFDGANCVGGDLCNLAVTAVVIKNKVFKIQTADNNTPVKIIKKLDDASEKFFSFGDIVSKNVCNSIIWFFTMLSIIFKAFKTRDFKVFVLAPERTGVILSRSLKYNLKATQHVLRRKQMYVKRFFKFSVIAYTLYALGFMFVRFSPANDYFCKEHVEGYSNSTFVKDEYCASTMCKVCLFGFQELADLPHTKVVWKYVGFPIFVNWLPFLYLAFLFTFGGIFVKGLVCYFIAQYVNTLGVYFGMQEKFWPLQIIPFDIFGDEIVVTFIVYKALMFIKHVCFGCEKPSCVACSKSARLNRVPMQTIVNGANKSFYVVANGGSSYCHKHKFFCLNCDSYGPGNTFINETVARELSNVVKTNVQPTGESFIEVDKVSFENGFYYLYSGETFWRYNFDVTEAKYGCKEVLKNCNVLSDFIVYNNTGTNVSQIRNACVYFSQMLCKPIKLVDATLLSTLNVDFNGALHSAFVQVLNDSFSKDLSSCASMTECKQVLGFDVSDEEFVDAVSNAHRFNVLLSDNSFNNLLTSYAKPEEQLSTHDVATCMRFNAKVVNHNVLIKENVPIVWLSRDFQQLSEEGRKYLVKTTKAKGVTFLLTFNTNAMNVKLPAISIVNKKGAGVSSSFLWWLCAAIITFFFCVGISEGLIATSLEGFGFKYIKDGVMHDFDKPLSCVHNVFDNFNSWHEARFGSIPSNSLKCPIVVGTLDDVRNVPGVPSGILLVGKTLVFAIKAVFTDAGNCYGLNGLTNAGACLFNSACTKLEGLGGTHVYCYKDGLFEGSKRYSDLVPHSNYKMEDGNFVKLPETLVNGFGINIIRTMETTYCRVGECLKSKAGVCFGANRFFVYNDDFGSDYICGNGLFSFVKNLFNTFTMXLSVMALSGQVIFNCAVAALAIFICFLVVKFKRMFGDLSYGVCSVIAAVTINNLSYVFTQNMLFMFVYATFYFLAVRNLNYAWIWHASYVVAYFNMAPWFIIVWYVVAMLTGLLPSVLKLKISTNLFEGDKFVGTFENAAFGTFVIDMHSYEKLVNSITPDKLKQHAAMFNKYKYYSGSASEADYRCACFAHLAKAMTDYASSHQDMLYSPPSISYNSTLQAGLRKFAQPSGVIEHCIVRVSYGNMVLNGLWLGDEVICPRHVIASSINSAIDYDHEYTMMRLHNFSVSSGNLFIGVVSAKMRGASLVIKVNQNNPHTPKHVFKTLRAGDAFNILACYDGVPSGVYGTILKHNKTIRGSFINGACGSPGFNINGDIVEFVYLHQLELGSGCHVGSNMEGVMYGGFDDQPSLQIEGADCLVTVNVIAFLYGAILNGCTWFLSNERVSAEVFNGWAHDNNFTDVGSLDCFNILAAKTGVDVQRILASIQKLAKGFGGRNIIGYASLTDEFTVSEVVKQMYGVSLQSKRVPSIFNNVTLVSVFWSMFLSELLYYTSSYWIKPDLITAVFVLLFGIAVMLTLTIKHKVLFLYTFLIPSVVISACYNLAWDLYIRELLAKYFDYHMSIFSMDIQGCFNIVACILVNAIHTWRFVKTGTATRLTYVLSLVVSVYNYWCCGDFLSLSMMVLLNINNNWYIGAIAYRFSVVVVNYMDPSVIRMLGGVKVILFMYVTCGYLCCMYYGICYWFNRFFKCTMGLYEFKVSPAEFKYMVANDLCAPTGVFDSMSLSLKLMGLGGERTIKISTVQSKLTDIKCTNVVLMGCLSSMNIEANSKKWSYCVDLHNKINLCDDAEKAMEYLLALVTFFISEHADFNVSELVDSYFGDNSILQSVASTFVNMPSFIAYESARQSYEEAINNGSSPQLVKQLKRAMNIAKAELDHESSVQRKLNRMAEQAAAQMYKEARAVNKKSKVISSLHTLLFGMLRKLDMSSVDNILSLARDGVVPLSIIPAACATKLTIVVSDFESFKRIFQLGNVQYAGVVWSLTEVKDNDGKPVHIKEITANNTALTWPLVLNCERIVKLQNNEVIPGKLKVRPLKGEGEGGFTADGKALFNNEGGKTFMYAFIADKPDLKVVKWEFDGGCNVIELEPPCRFAVVDAGGNNVVKYLYFVKNLNTLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTELVVNSSLLTLCSFAVDPAKCYLDAVKSGVKPVNNCVKMLSNGSGTGQAVTVGVEANTNQDSYGGASVCLYCRAHVDHPSIDGFCQFKGRYVQIPVGTVDPIRFCLENQVCKVCHCWLNNGCSCDRTSVIQSVDQAYLNRARGSSAARLEPCNGTEPEHVVRAFDIYNKEVASIGKFVKVNCVRFKNLDKHDAFFIVKRCTKSVMEHEQSIYDILKYSGALAIHDFFLWKDGRAIYGNICRQDLTKYTMMDLVNALRNFDEKNCEVLKEILILTGACDSSYFDNKSWYDPVENEDIHRVYAKLGDVIANAMLKCVALCDAMTEKGIVGVITLDNQDLNGNFYDFGDFVTSIPGVGVPVCTSYYSYMMPAMGMTNCLARECFIKSDIFGSDFKTFDLLEYDFTEHKLKLFDKYFKYWGQDYHPDCADCYDEMCIVHCANFNTLFATTIPNTAFGPLCRKVFIDGVPVVTTAGYHFKQLGLVWNKDINTHSTKLSINELLRFVSDPALLVASSPALVDQRTVCFSVAALGTGVTKQTLKPGHFNKEFYDFLREHGFFDEGSELTLKHFFFAQKGDAAIRDFDFYRYNRPTVLDICQARVAYHVVKKYFEIYEGGCIAARDVVVTNLNKSAGYPLNKFGKAGLYYEALSYEEQDALYAVTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQFHQKHLKSIVNTRNATVVIGTTKFYGGWDNMLRNLIDGVDNACLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHENCCTNSDRYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYLKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSANINRILGVNSNTCNNLTVKELQRSLYDNCYRTSTVDPAFVDTFYGYLRKHFSM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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR036333
NSP10_sf
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR009466 NSP11
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
IPR036499 NSP9_sf
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014827 Viral_protease
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR042515 Nsp15_N
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829 NSP8
IPR037227 EndoU-like
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6M71
E-value=0.0 Score=1159 Identity=59.31%
Cov(Q)=13.40% Cov(P)=98.62%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008168 F:methyltransferase activity
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GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
Subcellular Location
From MSLVP
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6931
Number of predicted TMHs:
18
Exp number of AAs in TMHs:
391.189289999996
Exp number, first 60 AAs:
0.00251
Total prob of N-in:
0.00053
outside
1 - 2112
TMhelix
2113 - 2135
inside
2136 - 2181
TMhelix
2182 - 2204
outside
2205 - 2254
TMhelix
2255 - 2277
inside
2278 - 2283
TMhelix
2284 - 2301
outside
2302 - 2310
TMhelix
2311 - 2333
inside
2334 - 2677
TMhelix
2678 - 2700
outside
2701 - 2931
TMhelix
2932 - 2954
inside
2955 - 2960
TMhelix
2961 - 2983
outside
2984 - 2986
TMhelix
2987 - 3009
inside
3010 - 3015
TMhelix
3016 - 3038
outside
3039 - 3343
TMhelix
3344 - 3366
inside
3367 - 3453
TMhelix
3454 - 3476
outside
3477 - 3485
TMhelix
3486 - 3505
inside
3506 - 3511
TMhelix
3512 - 3534
outside
3535 - 3548
TMhelix
3549 - 3571
inside
3572 - 3583
TMhelix
3584 - 3606
outside
3607 - 3615
TMhelix
3616 - 3633
inside
3634 - 3645
TMhelix
3646 - 3668
outside
3669 - 6931
