CoVDB Coronavirus Database (v3)   
Strain
Bat_KJ473800 (Region: China;  Strain: Miniopterus bat coronavirus HKU8;  Date: 2013)
Gene
ORF1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,  ORF1ab polyprotein
GenBank Accession
 

Sequence

CDS
ATGGGTTCTAACCATTTGACATTGGCATTTGCCAATGATCCTGAAATTTCTGCAGAAGGCTGCTCTACTCGTGGTGAAGCCGTCTCACGGTATAGTGAGGCCGCACTCTATGGATTTGAGAGTTGCCGATTTGTTGCGTCCGGTCTCCAGGAGATCGTTGACGGTGTCAGCGCAGATGATTATGTGCTGTGTTTCTCAGGTGTCACAACACTGAGGGCTTTTATTGGTAGATTTGGCGATCGTCCACGTAATTTGCGTGGTTGGTTGTTGTTCTCCAATTGTAATTATTTTCTTGAGGAAGTTGACGTCATTTTTGGTCATGGCGGTGGCAATGTTGAGCCTGTATATGTAGATAATTACATGTGCGGTGCCAATGGTAAACCCGTCTTGCCAGCTGACGTCTGGTGCTTCCAGGATTACTTTGGTGATGAGACAGAGTTGGTTGTTAACGGTGTTCGTCATGTTAAAGCATGGGACGTCGTTAGAACCAACCTGCCCTACCAGTTTCAGTCTACTGGTGCCATTGAATCCATTATTTGGCTTTCTGATGTTCCTCACGTTCTAAGAAATGGTAGCAAACTTAGTGTTTGCAAGGCACCAAAATTTTCTAAGAACGTTAAACTTAGTGAGCCACTCAACACATTATACCAGGCCTGTGGCAGTCCATTTGTTTCAAATGGTACTGATTTGGCTGGTGCTGTTGGAAAACCTGTTTTTGCACACTCCTATGTTGCTTGTAAATGTGGTAGCAAGTGTTGGAGTGTTGGTGACTGGTCAGGTTACAAATCTACGTGTTGTGGCACTTTTGGTAAAGTGCTTTGCACTGTTTTTGGTGATGTGGTCCCTGGTGATGTGCTCATGACATCTGCAGCTGTTGGTTCTGGTACGCGTTATTACAATGGTTTGACAATTAAACATGTTGTTACTGTTCAAAACATTGCATGTTGGCGCGTCCTTAAAACCCAGGCCGTTGATGGCTTTGTTGCCACCCCAACCTTTGACCAATATTCTGATGTCACATTGGATTCTTGCACTTACGACAATGTTACCGTTGCAGCTACAGCTCTGAAGTTTGGTCTTCTTAGCGGTAAGTTTGAGGACATTGTGGTTGAAGGCGTCCTTACTGGTGTTTTGGACGTTGGTTGTGCAGTTCTTGATGTGATTGACAGGGTTTGTGAGCAAAAGCCATCGTTTATTGTTAAATTTGGTGGCTTGCTGGAGTCTGCGTGGTCAGCTTTTGTTGCTGCAATTAAACAGATTCCTGCATTTGCTTCAGAAGTTGTTGCACTTTGTAAAACACTTAGTAAGGCTGTCCTAGTTGTGCGTAATCGTTGTTTAGACTTTTACGTTGAGGATGTTGCACCTAAGTTTAGACAGGCTCTAGAGTTGCTTAAGACATTAGTTACTGGTCTTTTTGACCTTGCAGTTGAGACCTTTAAAGTTGCTGGTGAGACATTTAGCCGTGTTGGCGACTGCGTCCTCCTTGAGAACGCTGTTGTTAGGCTTGTGTCCACCAAGGTTAAGGGCCTTAAGCAATCAGGCGTCAAGAAGGCCACTGTGGCAACTCCCATTGTCGGTGCTACTAAGAAAGTTCAGTCTAGTCGCACTGAAGTTGGTGACCTAACCCTCGTCAAAACTGCTAGTGTACCTCTTGTTAATCAGGGTGTTACAGTCCTGATTGGCGGTGTTGCATTCTTTAAGAGTGGTGGTGTCTATAGACTTATGGCTGATGCCGATGCTGTTTATGAAGAACCTGTCTATTGTCAACAGGCTTCTTGTAAACCTGTTTTTAAGTGCAACAAACCCGATGGGTTTCCTGATGTAACTAGTACCAACCCCGACACTTTGGCCCATGAGGTCAAGAAACTTTTGGAAGGCATAGCAAAACCATTTGACAAGTACGTTTGTAGTGTCGTGAATGGTGAGTGCCAGGTTGATCATAGTTATAATTTTAAGGCTCCTGCTTATATAGCTGACAAGCAACAGTATGTCATGCTCTGTAAGGATTTTGTCACTGATGACAAGTTTGAAGAGTTTTATGTTAAGGCTCTTAAAGCTAGTTCTCTTGATGGTTTTGAACCTTATTATGAGGCCTTTACCATCTTTAAAGGAGAATTGAAGTGTCCGGCAGAGCTCCTTGAACTTGATGATGGTGGTTTGTTTAACACTTTCATTAAGACCGTTAACAGTGCCTATGATTTTGTTAAAAACCTTAAGGTGTCTGTTACTGTTAAAGGTGTTATTTGTACTGCTGCTAAGCGCTTTAAGCGTTGGGCCAATGCACTTGCCAAGTTGTATTCCGAGTTTATTGTTAGCACATGTAAGACAGTCGTTATTGGCGGTCTTGATTTTGCATACTATTGTTTTGCAAAACCAGCTATTGCACTCGGTGACACTTTTGTGCGTGTTTCTAGGAACGCTCTTAGTGCCTTTAACCGTCCTGTTGAAGATGGTTCTAGTGAGGCGTATACCTTTGATGGTGGTGCTATAGAGACTGTTTGCTCACGTGTCCAGTTTGACACTGTTGTGCTTGAGTCTGTGCAAGACATACCCGTTCCTAGTGATGGTTATGTCGCTGTTGTAGATGGTTATACCTTCTTTACAGATGGCACTCATTATTTCCCAACTGGACTGTCTCGCTGCCACACTACGTGTTTTAAGCGTGGTGGTGGTAGTGTTGAGTTTTCCGAAGTTGTGGAAGTTAAAGAAATTGACCCCGTCTATAAAGTTCGTATTGAGTACGAATTTGAGGACGAGACTATTGTTGCCGTTTGTAAGAAGGCAATTGGTAAGACCATGACATTTGAAGGTAGTGACTGGGCCGACTTTGAACAGACTTTGACCAATGCTGTCTCTGTGGTTGGTGAGTTTGTCGACCTCCCTGACTTTTTTGTCTATGATGAGGAGGGTGGCACTGATCTTACTAAAGTTGTCATGGTCTCACAATGGCCTTTGAAAACAACACCAGAACCACCTGTATTTGACCCCTCACCATTAGCTGCTTTTGTAGTTAGTTGTGGTTTGGAGTGTGACTTTAGTGGTTGTGAAGACCCTATTAGTTGCTTCAAAACCATAGAGGGTGTGTCTCTTTGTGTTTCTATGGAGCGTTCTTGTAAGTGTGGCATTGATCAGGCCGTTTGTGAAGGTTTCTATGTGCCAGTTAAACCCTGTGCTGTCACTGACGTTTGCAGTGAGTGTGGTGGTGACCGTGTCGCTACCATCACTAGTATGGTTGGTACTGGTTTTGTTGACCTTTGTGATGATCCTGTTGTGCCATTTGATTGTGCAGAGTGCGGTTTTGGTGGTTACAATAATGTGTGTTTCGTCAATGTTGATGTTGCACCACCACCACCTCCTTTTGAGGAAACACCAACTCCGTTAGCTGACACTCCTGTTGATGATGTCCAGGAGGTCACTGAGGCATTGTCTTTTATTGTAGATGAACCTCGTGCATTTGTTGATCCTTTTAAGTTTGAGTATTATGACCACGCTGGTGTTCGTGTGCTTAAACAGGATGCTAACAATTGCTGGGTTGCTTCCACGATTGTGCAATTACAGCTTTATGGTTTTGAGAGTGATGCTATGTCACTTTTTAAGGCTGGCAGTGTTTCACCTATGGTGCGTAACTGCTATGAGGCTGTTAGTGCTATTCGTGGTAGTCTTGGTGATGTGTCTCAGTGTTTGGAGCGACTTCTTTGTGATAGTCATACTATGTTTATGACTTTCGATGTGAAGTGCAAGTGTGGTGTCTCTATGGCTGAGATGAGTGGTGCTGTGTTTCGTTTTATGCCTACTCGTGATGCTTTTAATTATGGTGCTTGTCCTACGTGTAGGAGCGTCATGGTTTATAAGATCAAGAGTATGCAGGGGTCTGGATTCTTTTGTCAAGATCCGAAACCTTTTAACACTGCTCGCTCTCTTGTTAAGCCTGTGAGCGCCAGTGTTTATAGTGGCAGCACGGATGGTGGCCATTACAAAACCAATATTTACAATGCACGTGTTTGCGTTGATGGTTTTGGCGTTACTAGTATTGTTACTGGTAACGTTAATGTGGTTTTTCTCCGTGACGTCAGTTATGGTCTTGATGACATTTCCACTGATGTTACTGCCACTATTGCTGAGAGTGTTGGTGATGTTGTCACACCCACTGTTGAACCCTTTGCCACTTTTGGCAGTATTGAGTTCTATCAGGGTGATATTAAGACATTGTCTGCACTGCCTTGCGACTTTGTGGTTAATGCTGCTAATGAGAATTTGCAGCATGCTGGTGGTGTCGCTAAGGCTATTAATGAACTTACAGATGGTGTGTTGCAGCGTCTCTCAGACGATTACATACGTGCCAATGGTAAGGTTAAAGTGGGCTGTGGTGTCATGCTTGAGTGTCCATTGCGTGTGTTTAACGTTGTTGGACCACGTAAGGGTAAGCATGCCAGGTCTTTGCTTGTCAAGTGTTATAAGAGTGTTCTCTCCAACCCAGGTGTGCCACTGACGCCATTAGTCAGTGTGGGTATATTTGGCGTTCCTTTGTCAGACTCTTTTATTGCACTTACTAGTGCTGTTGATGGTAGGCGTGTTTTGTGTTTCTGTTATTCTGATACAGAACGCAAAGCTATATTAAAGTTGATTGCTCAACGCGCTGAGAGTTCTGCTGTTGAGCAAACAACTGCTGAGCCCCCCTCGACAAATGATGTGACACCAGAACCGGCTTTGGTTGAACCTGTTGTTCAAGATGTTGTTGGTTCTGTAACTCAGTCCACTGATGTTGTTGTTGCACAGCAAGAATTTGTTGTGCCAGACGCACTTGAGACTGTTGGTTCTGTTACTTACTATCCTGTTGATGTTGGTGTTGTTGGTGTTAGACCAGACAACATTATTTTGCACACTACGCAGGATTTAGATCTTTGTGATTTTGGTAAGTTACTTGACAAGCAGTCATGTGGCGCTCTTACAGCTTCAATTGCTGCATATAAGCAAAACACAGCTGTTGTGCCACCTGGTAA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CCTGGTACTACTGTACTCCGTCGTTGGTTACCTGACGACGCAGTAATTGTTGACAATGATGTTAATGACTACGTTAGTGATGCTGATATGAGTGTAGTTGGTGACTGTACGACATTGTATCTGCAAGACAAGTTTGATCTTGTCATTTCAGATATGTATGATGGCAGAATTAAGCACATTGATGGTGAAAATGTTTCCAAGGACGGTTTCTTTGTGTACCTTAATGGTGTCATAACAGAGAAACTCGCGCTTGGAGGGTCTGTTGCTATTAAGATTACCGAGCATAGTTGGAACAAGCGTACTTATGAGCTTATTCAGAAATTTGCGTATTGGACCTTGTTCTGTACCAGTGTGAATACTTCTTCGTCAGAAGCTTTTCTCGTTGGTATTAACTATTTAGGTGATTTGAATACCACACCGATTGTTGATGGTAATGTTATGCATGCCAATTATATCTTTTGGCGTAATTCCACTATAATGGCGATGTCTTACAATAGTGTCTTAGATCTTTCTAAGTTTGAGTGTAGACATAAAGCCACTGTGGTTATAGCCCTGAAGGATACTGATTTAAGTGAAGTTATAGTTGGTCTTATCAGGAATGGTAAGTTGCTTATTAGGAAGAATGGTAGTGTTTGTGGCTATGGCACTAATTTAGTTTCAACTAAATAA
Protein
MGSNHLTLAFANDPEISAEGCSTRGEAVSRYSEAALYGFESCRFVASGLQEIVDGVSADDYVLCFSGVTTLRAFIGRFGDRPRNLRGWLLFSNCNYFLEEVDVIFGHGGGNVEPVYVDNYMCGANGKPVLPADVWCFQDYFGDETELVVNGVRHVKAWDVVRTNLPYQFQSTGAIESIIWLSDVPHVLRNGSKLSVCKAPKFSKNVKLSEPLNTLYQACGSPFVSNGTDLAGAVGKPVFAHSYVACKCGSKCWSVGDWSGYKSTCCGTFGKVLCTVFGDVVPGDVLMTSAAVGSGTRYYNGLTIKHVVTVQNIACWRVLKTQAVDGFVATPTFDQYSDVTLDSCTYDNVTVAATALKFGLLSGKFEDIVVEGVLTGVLDVGCAVLDVIDRVCEQKPSFIVKFGGLLESAWSAFVAAIKQIPAFASEVVALCKTLSKAVLVVRNRCLDFYVEDVAPKFRQALELLKTLVTGLFDLAVETFKVAGETFSRVGDCVLLENAVVRLVSTKVKGLKQSGVKKATVATPIVGATKKVQSSRTEVGDLTLVKTASVPLVNQGVTVLIGGVAFFKSGGVYRLMADADAVYEEPVYCQQASCKPVFKCNKPDGFPDVTSTNPDTLAHEVKKLLEGIAKPFDKYVCSVVNGECQVDHSYNFKAPAYIADKQQYVMLCKDFVTDDKFEEFYVKALKASSLDGFEPYYEAFTIFKGELKCPAELLELDDGGLFNTFIKTVNSAYDFVKNLKVSVTVKGVICTAAKRFKRWANALAKLYSEFIVSTCKTVVIGGLDFAYYCFAKPAIALGDTFVRVSRNALSAFNRPVEDGSSEAYTFDGGAIETVCSRVQFDTVVLESVQDIPVPSDGYVAVVDGYTFFTDGTHYFPTGLSRCHTTCFKRGGGSVEFSEVVEVKEIDPVYKVRIEYEFEDETIVAVCKKAIGKTMTFEGSDWADFEQTLTNAVSVVGEFVDLPDFFVYDEEGGTDLTKVVMVSQWPLKTTPEPPVFDPSPLAAFVVSCGLECDFSGCEDPISCFKTIEGVSLCVSMERSCKCGIDQAVCEGFYVPVKPCAVTDVCSECGGDRVATITSMVGTGFVDLCDDPVVPFDCAECGFGGYNNVCFVNVDVAPPPPPFEETPTPLADTPVDDVQEVTEALSFIVDEPRAFVDPFKFEYYDHAGVRVLKQDANNCWVASTIVQLQLYGFESDAMSLFKAGSVSPMVRNCYEAVSAIRGSLGDVSQCLERLLCDSHTMFMTFDVKCKCGVSMAEMSGAVFRFMPTRDAFNYGACPTCRSVMVYKIKSMQGSGFFCQDPKPFNTARSLVKPVSASVYSGSTDGGHYKTNIYNARVCVDGFGVTSIVTGNVNVVFLRDVSYGLDDISTDVTATIAESVGDVVTPTVEPFATFGSIEFYQGDIKTLSALPCDFVVNAANENLQHAGGVAKAINELTDGVLQRLSDDYIRANGKVKVGCGVMLECPLRVFNVVGPRKGKHARSLLVKCYKSVLSNPGVPLTPLVSVGIFGVPLSDSFIALTSAVDGRRVLCFCYSDTERKAILKLIAQRAESSAVEQTTAEPPSTNDVTPEPALVEPVVQDVVGSVTQSTDVVVAQQEFVVPDALETVGSVTYYPVDVGVVGVRPDNIILHTTQDLDLCDFGKLLDKQSCGALTASIAAYKQNTAVVPPGNIVTFKCDGQPNVILAVFPPVDDGAYLKNVKRTISKLAKLKGVSVSTFSTVDVHKRLLAFVKLFCVASMDVIGDVHTTSSIVKVSEDGRTVKDVVVSTTSDAGVQLGPCAVDGTSLTASVVTDVVSSVVAVAPNVDWDSHYGFKDAGTFHVLDHNAYAYDSDFVDGKRALASSDNNCWVNATCLQLQFAGVEFLSKGVTAMWNEFLTGDVARFVHWLYWLNGANKGDLGDVETTLNLVAKYAKPKGCVTIEKTTTDGCCSSEKRVNSLVVNASVLRQGVGDGYCQHGSEYIIRVARVEGTAIVVNVGDPSVKAPNLLISGTAYTAFSGPVDAGHYRVYCAATSKVFDGKNVVGGDLCNLAVTSVVVVNKSFKADLGVAKSTEPTAVKIMNKLDDASDKFFTAGDVVSHNIANSVVWFFTMLSILFKAFKTRDFKVFALAPERTGIIFTRSLKYNVKAAREMLKRKQKWVFWFLKFCLLLYTGYALLFMFVRFGPPNETLCKDYVEGYANSTFVKDDYCSSALCRVCLFGYQELADLPHTNVVWRHVGMPLFVNWMPLFYLAFLFIFGGFVTKGFVLYFVAQYVNTFGVHFGMQDLFWPLHLVPFSTFGDEFVVLFLVGKFLMFVKHVCFGCDKASCVACSKSARLTRVPMQTIVCGANKSFYVAANGGKNFCSRHNFFCVNCDSHGPGNTFINDVVARELSNVIKSSVKPTDVAYLEVDKVEFNDGFYYLYSGETFWRYNFDITDSKYSCKEALKSCNVLSDFIVYNDAGSNITQVRNACVYFSQLLCKPIKLVNASLLSTLNVDFNGALHAAFVNVLSDSFSKDLSTCTTMNECKQALGFEVSDDEFLNGVSDAHRYNVLLSDTSCNNLVTSYAKPEEKLSVHDLGTCMRFGAKVVNHNVLIKENVPVVWLASEFHLLSEEGRKYIIKTTKAKGVTFLLTFNSNPMQLNIPATSIVNKRAAGVGSKFIWWVCLAIVAFFLLLNASEFGYVATSFEDFGFKFIENGVLKDFEGPLQCVHNVFDNFNVWHEARYGVTPINRRSCPIVVGTMDNIRFVPNVPSGILLVGKTLVFAVKAVFTETGNCFDLSGLTTMGSCIFNSACTNMDGLGGPATYCYKEGLVENSKLYADLVPHSHYKLEDGNYVKLPETLARGLGFVTIKTMETTYCRIGECLDSKAGVCFGMDRFFVYNTEFGGDYICGSGFLSFFRNVLGIFTSSFSVMALSGQVMFNCIVAAVAVVVCFLVIKFKRMFGDLSMGVCTVVAAVFVNNVSYIVTQNMLFMFLYAIFYFLAVKGLKYAWIWHLGYVVAYFTLAPWFLVAWYLGATALDVLPALLKLKISTQLFEGDKFVGSFEAAAYGTFVLDMRSYERIVNSISMDKIKQYAATYNKYKYYSGSASEADYRCACFAHLAKALLTYADNHQDLLYTPPSISYNSTLQSGLKKMAQPSGIIERCVVRVCYGNMTLNGIWLGDVVICPRHVIASSTNSTINYEHEYTMMRLHNFSVSVGNVFLGINGVTMKGVNLHIKVNQSNPHTPAHSFRTLKPGDSFNILACYDGTPAGVYGITLRPNYTIRGSFINGACGSVGYNVVNGQVEFCYLHQLELGSGCHVGSNFDGVMYGAFQDQPSLQIEGADQLVTPNVVAFLYGALLNGCNWFLVNERLTVEAYNEWAHGNGFTDMVGVECFTMLAAKTGVDVQRLLAAIQKLTKGFGGKNILGFTSLTDEFTAAEVIKQMYGVNLQSRRLPSVFNNIMLVGVFWFMFISEMLYYTSSYWIKPDLITPIFLVFFAIALFLTAFIKHKVLFLYTFLVPGIVITATTNLAWDCYVRDLLAKYLDYHMSLFNMDIQGFFNIAACFIVNALHTWRYMRSGCTTRITYVVSLVVSIYNYWYVGDVLSLAMMLLLNINSNWYIGAFAYRFVLIVARYMNPTVVAIIGPFKLVMALYVAVGYLCCVYYGILYWLNRFFKFTLGIYDFKVSAAEFKYMVANDLRAPGGVFDSLLLSFRLMGIGGEKTIKISTVQSKLTEIKCTNVVLMGVLTSMNIEANSKDWAFCVELHNKINLADDAEKAMEYLLTLLTFFLSRQKDFNCTELLDSYFADSSVLQSVASTFVNMPSFIAYETARQNYEDATNNGSSPQLVKQLKRAMNIAKAEFDHEAAVQRKIQRMAEQAASQMYKEARAVNRKSKVISSMHALLFGMLRKLDMSAIDTILNLARGGVVPLNIIPAACATKLVVVASDFESFKRIYQYGAVHYAGAVWTLAEVKDNDGKPVHVKEITNDNTALTWPLVLNCERVVKLQNNEIIPGKLKQRPVKGEGDGGVVADGKALYNTEGGNTFMYAFISDKPDLKVVKWEFEGGCKTIELEPPCRFAVSNSNGTTSIKYLYFVRNLNTLRRGAVLGYIGATVRLQAGTQTELVANSSLLTMCSFAVDPKKCYLDAVKNGIKPVTNCVKMLSNGSGTGQAVTVGVEANTNQDSYGGASVCLYCRAHIDHPNMDGFCQFKGRYVQVPVGTVDPIRYCLENDICKVCHCWLNNGCTCDRTTVVQSLDGNYLNRVRGSSAARLEPCNGTEPEHVIRAFDIYNKDVACIGKFVKVNCVRFKNLDKHDAFFVVKRCTKSVMEHEQSVYNVLKDCGAVAAHDFFVWKDGRSVYGNIARQDLTKYTMMDLAHALRNFDEKNCETLKEILVILGACDATYFDNKNWYDPVENEDIHRVYAKVGGFVANAMLKCVALCDAMVEKGVVGVVTLDNQDLNGDFYDFGDFTVGIPGVGVPLCTSYYSYLMPVMGLTNCLARECFIKSEIFGSDFKTYDLLEYDFTEHKLCLFNKYFKHWDLDYHPNCSDCYDEMCVIHCANFNTLFATTIPDTAFGPLCRKVFIDGVPVVTTAGYHFKQLGLVWNKDLNTHSTRLTINELLRFVTDPALLVASSPALFDQRTVCFSVAALGTGLTKQTVKPGHFNKEFYDFLCAQGFFDEGSELTLKHFFFAQKGDAAIRDFDFYRYNRPTVLDICQARVAYHVVKRYFDIYEGGCIAARDVVVTNLNKSAGYPLNKFGKASLYYESLSYEEQDALYALTKRNVLPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQFHQKHLKSIVNTRNATVVIGTTKFYGGWDNMLRNLMDGVDNACLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHVNCCTNSDRYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYMKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSANINRILGINSNTCNNLTVKSLQRMLYDNFYRSSAVDPGFVDTFYGYLRKHFSMMILSDDGVVCYNKEYASLGYVADINAFKATLYYQNNVFMSTSKCWVEEDLTKGPHEFCSQHTMQIVDGDGTYYLPYPDPSRILSAGVFVDDVIKTDAVVLLERYVSLAIDAYPLSKHPNPEYRKVFYVLLDWVKHLNNTLNQGVLESFSVTLLEDASSKFWDESFYANLYEKSAVLQAAGLCVVCNSQTVLRCGDCLRRPMLCTKCAYDHVIGTNHKFILAITPYVCNAAGCAVNDVTKLYLGGLSYYCVEHKPQLSFPLCSGGNVFGLYKNSATGSPDVEVFNTLATSDWTDAKDYRLANEVKDSLRLFAAETVKAKEECVKSSYAAATLKEIIGPKELLLSWEPGKIKPPLNRNSVFTCFQVTKDSKFQVGEFTFEKLDYGSDTVCYKSTATCKLQPGMIFVLTSHNIQPLRAPTIANQERYAAICKLKPTFNISDAYSTLVPYYQMIGRQKITTIQGPPGSGKSHCVIGLGLYYPGARIVFAACSHAAVDSLCVKASTTYVVEHCTRIIPARARVECFSGFKANNNSAQYIFSTVNALPECTADIVVIDEVSMCTNYDLSIVNQRVAYKHIVYVGDPQQLPAPRTMITRGVLEPKDYNVVTQRMCAVGPDVFLHKCYRCPAEIVKTVSELVYENKFVPVHSESKQCFKIFCKGAVQVDNGSSINRRQLEVVKMFLAKNPSWSKAVFISPYNSQNYVASRSLGLQIQTVDSSQGSEYDYVIFAQTSDTAHACNINRFNVAITRAKKGIFCIMCDKLLYEALKFFEVKLTDLQAGDTCGLFKDCSKFDDPPLPPSHAPTYVALSDRFKTEGDLAVQIGSKTPCTYERVISFMGFRFDLNIPGYHTLFCTRDFAMRHVRGWLGMDVEGAHVCGSNVGTNVPLQIGFSNGVDFVVNPEGCVMTNVNDVIAPVKARAPPGEQFAHLIPLMRKGQPWTVIRKRIVQMCCDYVSPSSDILIFVLWAGGLELTTMRYFVKIGPRCDCHCGKVATCYNSVEHAFYCFRHALGCDYLYNPYVIDIQQWGYTGSLSSNHHEHCNVHRNEHVASGDAIMTRCLAIYDCFVKNVDWSITYPFIGNEAAINRSGRIVQSHVVKAALKVYNPKAIHDIGNPKGIRCAVTDASWYCYDKNPISSNVKTLEYDYLVHGQFDGLCLFWNCNVDMYPEFSVVCRFDTRCKSAFNLEGVNGGSLYVNNHAFHTPAFDKRAFAKLKAIPFFFYDDGECDSCQGSINYVPLHASNCVTRCNIGGAVCSKHANMYYAYVNAYNTFTQAGFTIWVPNSFDVYNLWQTLVTPKLQSLENVAFNVVKHGSFIGVDGELPVAIVSDKVFVREGTVDNVLFVNKTTLPTNVAFELYAKRKTGNTPSLTILRNLGVTRTYKFVLWDYEAERPFTSYTKDVCGYTDFDVDVCTCYDNSIAGSFERFSMCRDGVLISTSAVKKLSAIKLNYGYLNGEPVTTTDGKPITWYFYVRKDGQFLDQCDGIFTQGRSANNFVPRTQMESDFLELDMGLFISKYGLENFAFEHIVYGDVSKTTLGGLHLLISQVRLSKMGILKVEEFVHTGDSSLRCASVTYVDNPSSKMVCSYMDILLDDFVTLLKTLDLSVVSKVHEVIVDCKVYRWMLWCKDHKVQTFYPQLQSAEWKCGYSMPSLYKIQRMCLEPCNLYNYGASIRLPDGIMFNVVKYTQLCQYLNSTTMCVPHNMRVLHLGAGSDKGVAPGTTVLRRWLPDDAVIVDNDVNDYVSDADMSVVGDCTTLYLQDKFDLVISDMYDGRIKHIDGENVSKDGFFVYLNGVITEKLALGGSVAIKITEHSWNKRTYELIQKFAYWTLFCTSVNTSSSEAFLVGINYLGDLNTTPIVDGNVMHANYIFWRNSTIMAMSYNSVLDLSKFECRHKATVVIALKDTDLSEVIVGLIRNGKLLIRKNGSVCGYGTNLVSTK

Summary

Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pfam
PF09401   NSP10
PF06460   NSP16
PF08715   Viral_protease
PF06478   Corona_RPol_N
PF08716   nsp7
PF08717   nsp8
PF13087   AAA_12
PF08710   nsp9
PF05409   Peptidase_C30
PF16348   Corona_NSP4_C
PF06471   NSP11
PF01661   Macro
Interpro
IPR037204   NSP7_sf
IPR008740   Peptidase_C30
IPR032505   Corona_NSP4_C
IPR009469   RNA_pol_N_coronovir
IPR036333   NSP10_sf
IPR014828   NSP7
IPR027352   CV_ZBD
IPR013016   Peptidase_C30/C16
IPR027417   P-loop_NTPase
IPR038123   NSP4_C_sf
IPR037230   NSP8_sf
IPR037227   EndoU-like
IPR009003   Peptidase_S1_PA
IPR014822   NSP9
IPR041679   DNA2/NAM7-like_AAA
IPR029063   SAM-dependent_MTases
IPR018995   RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR009466   NSP11
IPR014827   Viral_protease
IPR009461   Coronavirus_NSP16
IPR002589   Macro_dom
IPR042515   Nsp15_N
IPR011050   Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829   NSP8
IPR036499   NSP9_sf
IPR007094   RNA-dir_pol_PSvirus
IPR027351   (+)RNA_virus_helicase_core_dom
SUPFAM
SSF142877   SSF142877
SSF50494   SSF50494
SSF53335   SSF53335
SSF144246   SSF144246
SSF52540   SSF52540
SSF140367   SSF140367
SSF143076   SSF143076
SSF51126   SSF51126
SSF101816   SSF101816
ProteinModelPortal
PDB
6NUS     E-value=0.0     Score=1159     Identity=59.72%     Cov(Q)=13.44%     Cov(P)=96.96%

Ontologies

KEGG

Subcellular Location

From MSLVP
From Uniprot
Host cytoplasm  
Host perinuclear region  
Host endoplasmic reticulum  
Host membrane  

Topology

Length:
6889
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
406.037169999996
Exp number, first 60 AAs:
0.00021
Total prob of N-in:
0.00027
outside
1  -  2071
TMhelix
2072  -  2094
inside
2095  -  2133
TMhelix
2134  -  2156
outside
2157  -  2222
TMhelix
2223  -  2245
inside
2246  -  2633
TMhelix
2634  -  2656
outside
2657  -  2887
TMhelix
2888  -  2910
inside
2911  -  2916
TMhelix
2917  -  2939
outside
2940  -  2943
TMhelix
2944  -  2966
inside
2967  -  2970
TMhelix
2971  -  2993
outside
2994  -  3300
TMhelix
3301  -  3323
inside
3324  -  3410
TMhelix
3411  -  3433
outside
3434  -  3442
TMhelix
3443  -  3462
inside
3463  -  3466
TMhelix
3467  -  3489
outside
3490  -  3503
TMhelix
3504  -  3526
inside
3527  -  3538
TMhelix
3539  -  3556
outside
3557  -  3560
TMhelix
3561  -  3583
inside
3584  -  3602
TMhelix
3603  -  3625
outside
3626  -  6889
 
 
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