Strain
Bat_KJ473806
(Region: China; Strain: Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011; Date: 2011)
Gene
ORF1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
ORF1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGCTTGCAGTCAGTACACACTTGCAGTGGCAAGTGATGTGGAAATAAATGGTTATGGCTACCAGTCTATTGGAGATGCCGTCACAGCTTATAGCGTGGCCGCAGCTGATGGGTTTTCTGGTTGTCGTTTTGTTCCATTTGGTCTTCAGGATTGTGTTGTTGGTGTGAACGATGACGATTATGTTATGGTTCTCACTGGTGATCACACTCTTTATGCCTTTTTGGACCTGTTTTCAGCTACTCCTAGTAACATCCGTGGTTGGCTGATTTTCTCTAACTGTAACTACGTGCTTGAGTCATTCGACGTTGTTCTCGGTCGTAGAGGTGGTGCTCCGCCAATCTACGTCGATAACTACCTTTGTGGCGCTGATGGCACACCAGTAGTACAGGAGAGTATGTGGTCTTACACTGATCACTTCGGTGAGGATTGTGATGAGATCACTCTTTGTGGCATTACTTATGTTCATGCTTGGAACGTTCAGCGTGCTGATGTTCCATATGAGCAGCAGAATGTCACTTCTATCTTTTCAATCGAGTATCTGCTCGATGTTGATCATGCACTTCAGAATGGCGCCGTTTTAAACGTCGCTTCTGGTGTTAAATACAAGAAGAGTGTAGTGCTTTCCGAGGGCTTTAAAAAGCTCTACGATGCATGTGGTGTTCCAGCAGTTCAGAATGGTAATACTCTTGTTGACATTCTGACTAAACCAGCATTTTTCCATGCCATTGTGTCTTGCAGCTGTGGTCTCAGCTCTTACACTGTCGGTGACTGGAAAATTGGTTTTCGCTCTCTGTGCTGTGGTAAGCGACTTGAACCCATAACTGTAGTTGTTGGAGATGTCAAGCCAGGTGACATCGTTGTCACTAGCGCTAATGCTGGTGATGGTGTGCGTTATTTTAATGGTCTGACTTTGCAATATGTTGGTGACTGGGAAGGTGTTAGCTGCTGGCGTGCTGTTGGTGTTCAAGCCTTTAATGGTTTTGTGGCATCACCTACGTTTGATGAACAGCTTCACACCTATAGTCTTGATGCATGTGCTTACACATCCAATACCCGGCTTTTTAAAGCTCTTAAACTGTCTGTCCTCAGTGGTTTTACCAATGACGATGTGACTAATGCTGTCATTGCTGGTGTTGTTGATGTCAACAGCTGTGTTTATAATTTTGTGGATGCTGTGCTTGAACAGAAGCCTTGGTTTGTTAGAAAACTGGGAAAACTCTGTGAGACTGCATGGTCTTTGCTGTGCGATGCTCTTAAGGAGAGTTCTCTTTTGTCATCAGACCTTGTGGCTTTTGTTAAGAGTTTGACAACAGCAGTTCTTACAGTTGTTGATGGTAAGCTTAAACTTATTGCAGACATTCCATCAGTTTTTGAGAGCGTTTTTGACGTTTTCAAGTCTGCTTTGGAAGGAATCTTTGATGCCTGTGCTAACACTGTCACTATTGCAGGTAAGGCTGTTAGGGCTGCTTTTGATTACTTGCTGTTTGACAATGCCATTGTTAAGCTGCAGAGTGTAAAGGTGAGTGGTCTTAAACAAGCTGGTGTTAAGAACGCATTATATGCAAGTGTAGTGATTGGTCCTACACAAAATGTCAAGACGACACGTGTTGAGGTTGTTAATGTAAAACTTACGCCTATTACTGACAAAGTGCCATTTAACCGTGAAGGTTATGTTGCACTTGTTGATGGTGTGGCGTTCTTCGTTAATGACGGTTACTATAGGCTTATGGCTGACAGTGATTGTGTCTTAGAAGAACCTGTTTTTAAAGCTGCCTCTGGTGAAACTCTTGCTGGTGCTGTTGAGTGTCCTTCATTGTTTGTGCAGGTTGATGGCGGTGCAATTTGGCGTAAAGTTGTGTCCGTCTTCGATGGTGTTACAGACTTTCTGAAGAACCTCAAGATTCAGTTTGGACTTAATGGTTTTGTTGGCACATGTGCAAAACGCTACAGGAAAATTTTAAACACTCTTCTGACAATGTACAATGACTTTGCTGCTAGTGTTAGGCAAGTTGTAGTGTTAGCTGGTGTTAAGCTGTCTTACTATGCCTTTGAAACACCGGCAGTTGCATTGAATGGTGTTTTGCATGCTGTTAAGCGTTGCAGTGCAAAATCTTTAGATGTTCCATGTGAAGAGGGTGCAGCTGAGTTTAATGTTTTTGAGGGTGGTGTCCATCTTCTAAAGCCCACAGCGGTTGAACTTGCTAGTGATATGGAACTTCTAGAAACAGACTATGTGGAACCTTGTGCTGGTGGTGTCTTGCGTATTTGCGATGACTATGCATGGTACATGGATGGTGACAGATTTTATCCGTATGGTGACAATGGTGTCATACCACTTTGTTATAAGCTTGGTGGTGGTGACAGAGTAACCTTTGGTGAGGATGAAATCAAAGAAATTCCAGCACGCAATAACGTCAAACTTATTTTTGAGTTTGAGAATGATGTTATTGCTGAGGCCTGCAAACAAGCTATTGGTAAGCGCATTAGCTTTGAGGGCGACTGGAGTGATCTGTGTGAAATGATAGACATTGCTATGAAAGCACTCTCTGATCATATTGAGGTACCAGAGTACTATATTTATGATGAAGAGGGTGGTAATGATTTGGACCTGCCAGTTATGATTTCACAATGGCCCTGCAACGCAGAAGATGCAGTCGCCAGTGTTTGTGAAGCTGTGGATGTCTGTTTTGGTGATGATTGTACTATGGATATGCAATTTTGTGAGACTACAGATATTAGTATTACAACATGTAATGCTGTTGATACTGGTGTTGCAGTTCACAAGGCGCTTTCTCGTACAGTTGTTGTTCAGACAGCTAGTGATCCACAGAAGGAAGTTGAAGAAGCACTGGCATATATGAAACCTGAGGTTGTTAAGCCAGTTGTTGAAAAGTCTATGTTTGACTACCCATCTACAGTCTTTAATGGAATTCGTGTGCTAAAACAGGTTGCTAATAACTGTTGGTTGACATGTGCTACATATCAATTACAACTTGCTGATTGCTATGAAGCAGACGACTACTCGCTTTTTAAAGTGGGTAGTGTTAAGCACTTTGTCAAACGTTGTTATGAATCTGTGGGAGCTGTTAAGGGCAGTTTGGGTGATACAACACAGCTTTTGGAACGTTTGTGTAAGGATGTCAAAACACTTAAGGTGACATGTAATGTTGCATGTGATTGTGGCACCTCTGTTAAAGTTCTTGAAGGTTGTGTGTTTCATTTTATGCCTGTGGCTGACGCATTTCCCTATGGTGTTTGTAGCAACTGTAAGCAAGTTGCTATGCACACTATAATGGGCATCAATGGTACTGGTTTCTTTTGTCAAGAACCAGCACATTTTGATGTTAAGAAGGCGTTGTGTTCTATTGCAGCCACTGCTACATATGTAGGCAAACAGAATGGCGGCCATTATAGAACCAATGACTTTGTTCATGGTAAGGCTGTTGATGGTTCTGGTATAACACCTTTGAATTATAAAGCACCTGTTACCAACTGTCTTGTAGTTAATGCTAATTATGTAGCCCCCACACCGCCAGTTAAAGTGGAACTCAACCCCTTTAGAGTGCATGGCAGTGTATCATTTTACAGAGCAGAGTTTTCTGAACTCGTTAATCTGGATTATGATTTTGTTGTCAATGCGGCAAATGAGAACTTGAGTCATGGTGGTGGTGTTGCAAAAGCAATTGATGATTACACAAAAGGACAGTTGCAACTTTTGTCTAAGGCATATGTCAAAAGTCATGGTCGTGTTCGTACAGGCAATGGTGCTATGATCAAGTGTGACTCTTTTGATGTGCTTAATGTGGTTGGTCCTAAAAAGGGTGGTAAGAGCTGGCAAAAGCTACTTCGCTTTGCTTATGAGACTATTTATAAGCAAGGTGGCACACCTTTGACACCATTATTGAGTTGTGGCATTTTCGGTGTTCCTTTAGAGGAGTCGCTAAAGATGTTGCTAGATACTTGTAATGATGTTAGGACTTGCTGTTTTGTTTACACTCCTGATGAAGAAGCCAAGGTTGTGGCTTATTTAGATAGTTTAAAGGTTCAAGATGAAGTGCCTGCTAAAATTGAAGTGCAGCCATATAGAGTTGAAGGTAAATTCAATTTTTATGACTGTTCTGTTGCAGACATTCTTGCCACTGATGTTAGTTCAGTTGTTGTATTTACCGATGGTAAGTTGTCTTTGACAGACGTCGGTGTTGAAATAGATGAACATCTGAGTGGTAAACTTTTAACATCTATTAAGGAGTGTTTGGCCGAAAATATAGCTATACCTTCTGGTAATGCTATGAAGTTTGATTGCAACCCGACCATATATATGGCTGTGGTTCCTGCAATTAACACACCTGGTTTTGAGAAGAACGTTACGAGGACCTTACGCAAAGTTTCGAAGTTGGAGGGTAGGGTCATTTGTACAACACCTATTAAACAGGTCTTGCAAATGGCATTAAAAACCTTTCCTTCAAATTACGCATTTTTGGTTCATGATAGTGCTAAAAGCACTGTTGATGATTGTTTTTCTCTAGCGCAGTATAAGGTTCAAACCACAGAGGATGGTGTTAATGTTAACACTGTCATTGTTTCAAATGCTAAGACTTATGGTGAGCAGTTGGGTTCAGTTACTGTAGCAGACAGTGACATCTCAGCTACGAAGCCCGCAGTCTTAGATGAAACTAAGATGTTGGTTGTTGCACCTGCTGTTGATTGGGTTTCACATTATGGTTTTTCTGATGCTGCTGCTTTTGCTACTTTTGACCATACACCTTTTGCTTTCGATAGCGATATGGTGATGGGCAAGAGAGCATTGGCACAGACAGATAACAATTGTTGGATCAATGCTGCTTGTCTAGCACTACAGCAATTGAAACCCAAGTTTAAATTTCCAGGTTTGGAGGCCGCATGGAATAAGTATGTTACAGGTGATTGTGGTGAGTTTGTTCACTTTCTTTACCATATTACGCGTTCGCGTAAGGGTGATTTAGGTGATACTGAAAACTT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Protein
MACSQYTLAVASDVEINGYGYQSIGDAVTAYSVAAADGFSGCRFVPFGLQDCVVGVNDDDYVMVLTGDHTLYAFLDLFSATPSNIRGWLIFSNCNYVLESFDVVLGRRGGAPPIYVDNYLCGADGTPVVQESMWSYTDHFGEDCDEITLCGITYVHAWNVQRADVPYEQQNVTSIFSIEYLLDVDHALQNGAVLNVASGVKYKKSVVLSEGFKKLYDACGVPAVQNGNTLVDILTKPAFFHAIVSCSCGLSSYTVGDWKIGFRSLCCGKRLEPITVVVGDVKPGDIVVTSANAGDGVRYFNGLTLQYVGDWEGVSCWRAVGVQAFNGFVASPTFDEQLHTYSLDACAYTSNTRLFKALKLSVLSGFTNDDVTNAVIAGVVDVNSCVYNFVDAVLEQKPWFVRKLGKLCETAWSLLCDALKESSLLSSDLVAFVKSLTTAVLTVVDGKLKLIADIPSVFESVFDVFKSALEGIFDACANTVTIAGKAVRAAFDYLLFDNAIVKLQSVKVSGLKQAGVKNALYASVVIGPTQNVKTTRVEVVNVKLTPITDKVPFNREGYVALVDGVAFFVNDGYYRLMADSDCVLEEPVFKAASGETLAGAVECPSLFVQVDGGAIWRKVVSVFDGVTDFLKNLKIQFGLNGFVGTCAKRYRKILNTLLTMYNDFAASVRQVVVLAGVKLSYYAFETPAVALNGVLHAVKRCSAKSLDVPCEEGAAEFNVFEGGVHLLKPTAVELASDMELLETDYVEPCAGGVLRICDDYAWYMDGDRFYPYGDNGVIPLCYKLGGGDRVTFGEDEIKEIPARNNVKLIFEFENDVIAEACKQAIGKRISFEGDWSDLCEMIDIAMKALSDHIEVPEYYIYDEEGGNDLDLPVMISQWPCNAEDAVASVCEAVDVCFGDDCTMDMQFCETTDISITTCNAVDTGVAVHKALSRTVVVQTASDPQKEVEEALAYMKPEVVKPVVEKSMFDYPSTVFNGIRVLKQVANNCWLTCATYQLQLADCYEADDYSLFKVGSVKHFVKRCYESVGAVKGSLGDTTQLLERLCKDVKTLKVTCNVACDCGTSVKVLEGCVFHFMPVADAFPYGVCSNCKQVAMHTIMGINGTGFFCQEPAHFDVKKALCSIAATATYVGKQNGGHYRTNDFVHGKAVDGSGITPLNYKAPVTNCLVVNANYVAPTPPVKVELNPFRVHGSVSFYRAEFSELVNLDYDFVVNAANENLSHGGGVAKAIDDYTKGQLQLLSKAYVKSHGRVRTGNGAMIKCDSFDVLNVVGPKKGGKSWQKLLRFAYETIYKQGGTPLTPLLSCGIFGVPLEESLKMLLDTCNDVRTCCFVYTPDEEAKVVAYLDSLKVQDEVPAKIEVQPYRVEGKFNFYDCSVADILATDVSSVVVFTDGKLSLTDVGVEIDEHLSGKLLTSIKECLAENIAIPSGNAMKFDCNPTIYMAVVPAINTPGFEKNVTRTLRKVSKLEGRVICTTPIKQVLQMALKTFPSNYAFLVHDSAKSTVDDCFSLAQYKVQTTEDGVNVNTVIVSNAKTYGEQLGSVTVADSDISATKPAVLDETKMLVVAPAVDWVSHYGFSDAAAFATFDHTPFAFDSDMVMGKRALAQTDNNCWINAACLALQQLKPKFKFPGLEAAWNKYVTGDCGEFVHFLYHITRSRKGDLGDTENLLNLLDKYIVASGTVVLERHVDCPTCNSTERTINASVVSASLSRDGSDDGVCCAHGVDYVLRVKHVKGDVIITTCEQPKCYKSSEILMGEAYVAFTGPISGGHYLVYDRATGQVFDGNKCLPYDFDTLTISAVVVKGGYVCSMPKKIKLDRVMTDLDNGAKKFFDFGDFILRNLASFFSIFFSLLFVGYKALKKRDVKVLAQAPQRTGIILTRSLKYNCKAAFKFWQTRSWCIIMLFKILLLLFALFAACFMLIRFSFLNKYFCDGYVAGYANSTFVKKDFCNGGLVCDACLHGFDQLSDFSHLNVKWDYITVPFALKVYPSVVAFLLFLFGGVYVKFMMLYVLAQYVNTFGVYFGFQDYFWVVHIIPFDVFCDEILAIFCAVKGLLFLKHVIMGCDSPSCIACSKSARLRRVPMTTVVNGANKSFYVTANGGTKFCTKHNFFCVDCGSYGNNSTFINDHVARELSNVVKTSVRPTGPAYIEIDRVDFSNGFYRLYSGDTFWRYNYDITESKFSCKEVLKNCNTVDDFIVYNNTGTNVTQVRNACVYLSQLMCRPIKLVDAQLLSSLNVDFNGALHKAFVEVLQNSFSVDLADCNTMSECKERIGLDVSDDEFLAAVTNAHRYDVLLSEVSFNNFITSYAKPEEKLSAFDCAQCVRAGAKIVNHNVIVKEKLSIVWLAKDFQALSAEGRKYIVKTSKVKGLNFILTLNDNAAQCSVPVVSMMSKKGAGPKKSLWFLWGLCAFILALYYATSYITFGTMVGSFPGYDFKYIEHGQLQEFSHGLTCVHNVFDNFMEWHFQKFGNTPSTGKACPVIVGVGDNGRTLPGVPADVHLVGQTLVFTVKSVFGNTNLCYDTSGVVSAASCIFISACTVLEGLGGISTYCYKDGIVEGAKLYSDLQPNAHYKFDNDNFVKLPEVLARGFGMRTVRTLDTTYCRVGECTESKAGICIGADRWLVYNAESGSDFVCGASLLQLLYNVFRVFNTDFSTAALSGQMMFNVIVAGLAIMACFIITKFKRVFGDMSFGVFTVIITALVCNLSYFVTQNYLGLYTFSLLYYLTTRSFRYEWIWHIGYVVSYYFLAPWWLMLMYVGALVLELVPNLLKLKVSTQLFEDGNFIGNFESAAAGTFVLDMRTYEKLVNSIPAERLRQYAASYMKYKYYSGSPGEVDYRLACYAHLAHAMMSFGKDQRDVLYTPPTVSFNSTLQSGLKKMAQPSGIVEPCVVRVSYNSTVLNGLWLGDTVYCPRHIIASNTNAVIDYDHAYTVMRLHNFSISAGNIYLGVVSATMHGANLHIKVNQSNVHTPVHSFRTVKPGEMFNILACYDGTPAGVYSVNLRTNHTIKGSFINGACGSPGYNIVNGTVEFVYMHQIELGSGCHVGSSFDGKIYGNYEDQPTLQIEGSANLVTDNVVAFLYGALLNGITWWLSPSRITVEAFNEWASVSGYTPLQSADGYSILAAKTGVEVERILSSIQKHANGFGGRNVLGYSALTDDFTLSEVVKQMFGVNLQSSKKVSCCKSLLLVGGFFAMFWGEFLMYSSVMWVHPAVVTPILLCLGLVSLMLSGLIKHKMMFLQTFLLPSIVVIAANNFFWDYFVTQLLVQYFDYTASLFSLDIQGLLNIAMCLFVMFLHTYRFVSTGNNAIAYLSSLVVSAYTYLLGGDPMYCAIMVLCSLSSEWYVGAVCYKLAIRIAPYTSPIIATVFGTPKVIVFVYLALGYFTCVYWGFLYWFNRFFKFTLGEYDFKVSPAEFKYMVANNLSAPRGPFDSLALSLRLVGVGGQRTIRISTVQSKLTDLKCANVVLLGCLSSMNIASNSKDWEYCVTLHNKINLCDDPEKAHEMLLALLAFFLSKQQAFGIDGLVDSYFDSNSMLQSVANTYVNLPSFVAYESARQNYEEAVNNGSSPQIIKQMRRAMHLAKAEYDREVSVQRKIERMAENAAAQMYKEARAENRKSKIISSMHALLFGMLRKLDMSSVDTILNLAKNGVVPLSIIPATSATRLCVVCPDHEAYAKIIFGQCLHYAGVVWNIVEVKDNDGKTVHQKEIVKANEETLSWPLSINCERVVKLQNNEIIPSGKLKQQAVKADGDGFSSEGIALYNNEGGKTFMYAFLADKPDLKVVRWEFDGGCNVIELEEPRRFAVETGSGTQIKYLYFVKNLNTLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTEQAANSSLLTMCAFAVDPAKCYLDAVKGGVKPVGNCIKMLSNGSGNGQAITNGVESNTSQDTYGGASVCLYCRAHVDHPSMDGFCRLKGKYVQVPLGTLDPIRYCLENTVCKVCACWLNNGCQCERTSMQSFDNGYLNRVRGSSDARLEPLNGTDIDRCVRAFDVYNKDVACIGKFLKVNCVRFRNADKHDAFFVVKRCTKSVMEHEQSIYDELKHCNALAPHDFFTWKEGRAVYGNISRQNLTKYTMMDLCYALRNFDERNCDTLKEILVLTGCCSEAYFDNKCWYDPVENEHIHKVYAQLGVIVANAMLKCVRLCDAMVEKGIVGILTLDNQDLNGDFYDFGDFCKTAPGMGVPCCTSYYSYMMPVMGVTNCLASECFMKSSIFGEDFKTYDLLEYDFTEHKERLFKKYFKYWDQDYHPNCCDCYDDMCVVHCANFNTLFATTIPGTAFGPLCRKVYIDGVPLVATAGYHFKQLGIVWNKDVNTHSSRLNINDLLMFVTDPSLIVASSPALVDQRTVCFSVAALSTGMTQQVVKPGHFNKDFYDFLLKQGFFSEGSELTLKHFFFAQKDDAAVKDFDFYRYNRPTMLDICQARVTYKIVSRYFDCYEGGCITAKEVVVTNLNKSAGWPLNKFGKAGLYYDSLSYEEQDQLYAVTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRNAAVVIGTTKFYGGWDNMLNNLISGVENPHLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHTTCCSSTDRYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYMKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQATSANINRLLSVDSNNCNNLGVKALQRRLYDCCYRSSHVDDDFVTEYYNYLRKHFSLMILSDDGVVCYNSEYAALGYVADISAFKATLYYQNNVFMSTSKCWVEPDINKGPHEFCSQHTMQIVDENGKYYLPYPDPSRILSAGVFVDDIVKTDPVILMERYVSLAIDAYPLSKHENPEYRKVFYALLDWVKHLNKTLHAGILDAFSITMLEDSAAKFWDESFYAGLYEKSTILQAAGLCVVCGSQTVLRCGDCIRRPMLCTKCAYDHVVGTTHKFILSVTPYVCNNSGCTVNDVTKLWLGGLSYWCTEHRPQLAFPLCSGGNVFGLYKSAATGSP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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR014828
NSP7
IPR027352 CV_ZBD
IPR036333 NSP10_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR009466 NSP11
IPR037204 NSP7_sf
IPR008740 Peptidase_C30
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR036499 NSP9_sf
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR037227 EndoU-like
IPR014829 NSP8
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014827 Viral_protease
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR038634 A-CoV_nsp1_sf
IPR042515 Nsp15_N
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
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IPR038123 NSP4_C_sf
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6M71
E-value=0.0 Score=1172 Identity=59.48%
Cov(Q)=13.93% Cov(P)=98.51%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008168 F:methyltransferase activity
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GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
Subcellular Location
From MSLVP
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6662
Number of predicted TMHs:
14
Exp number of AAs in TMHs:
393.302479999996
Exp number, first 60 AAs:
0.02226
Total prob of N-in:
0.00365
outside
1 - 1834
TMhelix
1835 - 1854
inside
1855 - 1899
TMhelix
1900 - 1922
outside
1923 - 1988
TMhelix
1989 - 2011
inside
2012 - 2398
TMhelix
2399 - 2421
outside
2422 - 2654
TMhelix
2655 - 2677
inside
2678 - 2689
TMhelix
2690 - 2712
outside
2713 - 2737
TMhelix
2738 - 2760
inside
2761 - 3182
TMhelix
3183 - 3205
outside
3206 - 3208
TMhelix
3209 - 3228
inside
3229 - 3234
TMhelix
3235 - 3257
outside
3258 - 3276
TMhelix
3277 - 3299
inside
3300 - 3303
TMhelix
3304 - 3321
outside
3322 - 3325
TMhelix
3326 - 3348
inside
3349 - 3368
TMhelix
3369 - 3391
outside
3392 - 6662
