Strain
Bat_KJ473807
(Region: China; Strain: Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013; Date: 2013)
Gene
ORF1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
ORF1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGATTCAGAGATTTCAGCTCTTGGCTTTGGTTCCGTCGAGAGCCGTCTCATTCTATAGTGAGGCCGCTGTCGGTGGTTTTGCCAATTGCCGATTTGTCTCTACGGGTCTTCAAGACATAATTGAAGGCGTCCTTGATGATGACTACGTGTTAGTTATTACAGGGGTGCATCAACTAGTCGCCCGTATAGGCCAATTCGGTGACCAACCTTCAAATCTTAGGGGTTGGTTGCTGTTCTCTAATTCAAACTACTTTTTGGGAGAATTAGATCTTGTCTTTGGTGGACGTGGTGGAAACACAGTCTACGTAGACAATTACATGTGTGGTTCTAATGGTGTTCCCGTACTTCCTGAAGATCAATGGGAGTTTGTGGACTATTTTGGTGAACTCACTGAAGTGTCAATTGGTGACACTACCTACATTAAGGCCTGGAACGTTGACAGAGTCGAGGGGCCTTACAAAAGTCAAACTTTGTTGTCCATCAATGCCATTTCTTACTGCGGTGAAGTAATTCATGCATTGGCTGATGGTTCAACCATGTCTTATGCAACAGCTGTGAAAAAGAACAGCAAAACTGTTGTTAATAAGACCTTTCAAAAACTTTACGATAACATCGGTGTGCCCTTTGTTACCAATGGTAAAGTTTTAACTGAAATTATACCCAAACCTGTGTTCAATCATGGACTGGTGAAATGCCATTGTGGAAAAGTTTCCTGGACTGTTGGAGATTGGAGTTGTTATAAGTCCACTTGTTGTGGAATAGTTTGCAAACCAATCGCTATTGTCAATGGAGACGTTAATCCAGGAGATGTTGTGATCACTAGTAAACAGGTGGCGACGAATGGCGTTAAGTACTATAATGGTATGGTACTTAAGTATGTAGATACCATCGAGGATGTGCACCTGTGGAGAGTTGTAAAACTGCAGAGCGTGAAAGGCTTTGTAGCTTCTCCAAACTATGATCCAGCTGAATATGTCTTCCTTGCTGATGACGCTTGCTCACCAACCAGTCGGTTGGTTATTTCTGCAAGTTACAAACTTGGGTTATTAAATGGAAATTTCACGGACGATGTTCGTGTTGCAGCCAGAGATGGTACAATTGTCGTTGGCAATAATGTGCTTAGTCTGATTGACGTTGTTCTAACTAAACCGTGGTTCGTTCGAAAACTCGAGGAACTTCTCGGAGAAGCGTGGGACACGTTTGTGGCTAGTCTGAAAAATCTTGTGTTTACAAGTACTCAGTTGGTCGAACTTACGAAAGCACTCTCAAAAGCCGTGTTAAATGTTACTAAAGAAGGTATTGAGTTCGCGGCTGAAGTACCATCATGTTTTGAAAGTTGTTTTTCAGTTTTTAAAGAATTTGTTACTGGAATCTTTGATTTTACAGTAAACAGTGTAAAAATTGCAGGCCGTAGCTTTAAAAGTGTTGGTTCTTACGTTCTGTTTGATAATGCTATAATTAAATTTGTAGCAGTTAAGGTCAAAGGCCTTCATCAAGCAGGAATCAAACAGACTGAATACGCTACGTCTATAATTGGCAAAACTACTAAAGTTAACTCCAAAAGAACAGAAAGTGCAGATGTTAACCTTGTGTTAGTCAATGACAAACAACCACTATTGAAGGACGGTGTCACTAAGATAATTGGTGGTAAGTCGTTCTTTTATAGCGGAGGTGTCTACAGACTTATGAGTGATAACAATTTTGTACTTGATGAACCTGTGTTTCAAGAAAAAATGAGTGTACAATTTGAGTGTGAAAAACCGAAAGGTTTTGTTGAACCAAATTGTGACAATCTCCCAAGTGCCATCAAAACTACTGTAGAACAACTTGTTAAATTTAACACACCTTATCGTAATTACGATGTTAGTGTGGTGAATAATAAGTGTGTTGTCAAGTGTACTTACACTTTCCGTGCACCAGCTTACATTGCAGACACAGAGAATTTTGTGAAAGCATGTGAGGTGTGTGTTGACAAAGAAGGTTTTGATGAATTCTATGTTCAAACACATGCAGTTGACTCTCTTGTAGCTTTCAAACCAGCTTTTGCTGAATTTGAACAGTTTTTAGAGCCTGTCAGTTGCCCTGAACTATTTCTTGAAATAGATGGTGGTAACATTTGGAATAAGTTTATTAAAACTGTCACAGATGCTGTTGAATTTGTAAAATCAATTAAAGTTTCTTTTGACCTCAATGGTGTTGTTGTTAAAGCCACAAAACGTTTCAAGAGATTCGCAGCTACTCTAGTTAATCTTTACAGAGAGTTTGTTGCTACTGTTACTAAGACTATCAAAATTGGAAGCCAGGCTTTTACATATTATGCATTTGAAGTACCAAAAGTTTTACTTTCTGGTGCTTTGCATAGTGTGAGAACAGTCAAAGCTAAAGAGCTTAACTTGTCTGTACAAGACGTTGTTGTTGAGTTCAATGTTTTTGATGGTGCAACAGTAGAAGTCACACCTAAACGTGTTGAAAAAGAAGAAGTCTCTCTTGAGGAAGTAGAGTTTATCCCACCTGTAAGCAATGGCTCTATTGCAGTAGTTGATGGTTATTCATTTTACTCTTGTGGTGATTTGTATTACCCGTCAAATGAAAATGCAGTTGTCCCACTTTGCTTTAAACGTAGTGGTGGTGGTAAATTGCAATTCTCTGATGTTGTTGAAGTCAAAGAAATTGATCCAGTTTACAAAGTAAAATTAGATTATGAATTTGAAGATGAAAATATTGCTGCAGTCTGTAAGAAAGCCATAGGTTCTAAAATTAAGTACAATGGTTCAGACTGGGAAGGTTTCTGTGAACAAATTCACTCTGTTATGACTGTCGTTGGTGAACACATGGAACTGCCTAAATACTACATCTATGATGAAGAAGGTGGTAACGATCTGAATAAGGTCGTCATGATTTCACAATGGTCATGTGACGGAGAGTCTAATGAACAAAAAGAAGAAGAACAACAGATTCAAAACGGTTCTACAGATGTTTCTGAAGTTGAAAGTGAGCCCGCACCACCTGAAGTGGAGGTGCCACAGAAACCTCAGTATCAACAAGAACAAAAACCTGCTGTAGATCAACAGGCTGAAGTTGAAGCTGCTTTGTCATATATGACTCCTACAGCCCCTAAACCTACAGAAAACCCGTTTGCATTTGAGTATTATGACCTTAATGGTATTAAGGTACTAAGACAATGTGATAACAATTGTTGGGTTGCATCAGCTTTAGTCCAATTGCAGCTTTTGAATGTTAATGAGGATTATACGTACTTCTTTAAAAGTGGTCGTTTGTCTCCATTGGTTAAACGCTGTTATGAACGTACAGGTAACATTAGAGGATCTGCTGGTGACACGTCTCATTGCTTAGAAGTAATGTTACGTGATTTACACACTATGCAACTTAGATTCTCTGTTAAGTGTAAATGTGGTACTTTTACTGAAGAAATGAGTGGTTGTGTTTTTAGATTTATGCCAACAGCAAAAGCATTCCCATATGGTGGTTGTGCTTCTTGTGGTAAAACCAAGATGTACACTATTACTACCATGAAAGGAACTGGTGTGTTTTGTCAAGAACCTAACCCACTTAACATCAGTGATCTTCTGGTTGAACCACTCTGTGCATCTGTGTTTAAAAGTGGCCATTATAAAACCAACATTTACAAATATAATGTTTGTGTTGATGGTAATGGCCGTGGTCAAATTAAATGGAATACAGTTAACACAGTGTGTTTTAAGGATGTTGAGTACAATAAAGTAGAGGAAGTCCAGTCTTTTGCTACTTACCGAAACATTTCCTTTTATCAAGGTGACATTAAAGAGGTAAAATCTGTAAATCATGATTTTATAGTTAATGCAGCTAATGAGGATTTGAATCATGGTGGTGGTATTGCTGGTGCTTTAAATAAATATACAAAGGGTGTGCTACAGAAAGTATCGAATGCACACATCACTGCAAATGGTAAGCTTAAAGTGGGAAGTGGTGTTATGCTTGAATGCGATGGAACTAATATCTTTAATGTTGTTGGTCCACGTAAAGGTAAGCATGCACCTGAATTGCTCATAAAAGCTTACGATGCAATTTTTAGTAATCCTGGTGTCCCACTAACACCTCTCATTAGTGTCGGTATTTTTAAAGTGCCAATTGAAGATTCGCTGTCTGCTCTTTTTGCATCTGCGGGCGAACGAGTAGTAAAGTGTTTTTGCTACACTTCAGCCGAAAAAAGCGCGATCATTAAATACATAGATAGTGTTACTAATGTAGTGGTAGATGTTAAAGAACCAGGGCCTGCACCTCCAGAGGTTAAACAAATCCTACCTTTTAGAAAGGAGGGTAAATTTGACTTCTACGAAATAGAGGCAGCAGACTTGGCACTTTTAAATCCAGATAGGTTAGTTATTTTCACTGATACAGACTTTAAATTATGCGATTTTGCTATCGCCTTCAATAGTGTTGTTGAGGGAGGTTTGACTTCGTGTATTGAGGCTTATCGTAAAGAAAATAATGTTGTGCCTGCTGGTAACATTGTTACCTTTAAATGTGAGGGAATGGTGGCAGTCAGTTTTGCTGTACTTCCAATTGCTGGTGCTGCTTCTTATGATAAGAACGTCACACGCACAATTAATAAAATTACTAAGTTGAAGGGTAATGTCTTCTCAACTGTACCACCTACAAGTGTCTTGAAAAATATGCTTAAATGTTGTAATTGTTCCTTTGTTGTTTCGCAAGATACAAAAGCGTCAGTGACAGAGTGTTTTGACGTTCAAGAAGTGCGAATCAAGGTTTCTTACAATGATAGAGATGTTCAAGACGTAGTGGTTAAAGGAGACAAAGTTATTGATCAACAAATTGGTCCTTGTAGTACAAATAACTTTGACCTGACAGGTGTAAAACCAGACGATGCAATTAATAGTGTCGTCAATGTTGCACCTGAAGTTGATTGGATTTCTCATTATGGTTTTCCACGAGCAGATGTGTGGCATACTCTTGATCATTCTGCTTATGATTATGAAAG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Protein
MIQRFQLLALVPSRAVSFYSEAAVGGFANCRFVSTGLQDIIEGVLDDDYVLVITGVHQLVARIGQFGDQPSNLRGWLLFSNSNYFLGELDLVFGGRGGNTVYVDNYMCGSNGVPVLPEDQWEFVDYFGELTEVSIGDTTYIKAWNVDRVEGPYKSQTLLSINAISYCGEVIHALADGSTMSYATAVKKNSKTVVNKTFQKLYDNIGVPFVTNGKVLTEIIPKPVFNHGLVKCHCGKVSWTVGDWSCYKSTCCGIVCKPIAIVNGDVNPGDVVITSKQVATNGVKYYNGMVLKYVDTIEDVHLWRVVKLQSVKGFVASPNYDPAEYVFLADDACSPTSRLVISASYKLGLLNGNFTDDVRVAARDGTIVVGNNVLSLIDVVLTKPWFVRKLEELLGEAWDTFVASLKNLVFTSTQLVELTKALSKAVLNVTKEGIEFAAEVPSCFESCFSVFKEFVTGIFDFTVNSVKIAGRSFKSVGSYVLFDNAIIKFVAVKVKGLHQAGIKQTEYATSIIGKTTKVNSKRTESADVNLVLVNDKQPLLKDGVTKIIGGKSFFYSGGVYRLMSDNNFVLDEPVFQEKMSVQFECEKPKGFVEPNCDNLPSAIKTTVEQLVKFNTPYRNYDVSVVNNKCVVKCTYTFRAPAYIADTENFVKACEVCVDKEGFDEFYVQTHAVDSLVAFKPAFAEFEQFLEPVSCPELFLEIDGGNIWNKFIKTVTDAVEFVKSIKVSFDLNGVVVKATKRFKRFAATLVNLYREFVATVTKTIKIGSQAFTYYAFEVPKVLLSGALHSVRTVKAKELNLSVQDVVVEFNVFDGATVEVTPKRVEKEEVSLEEVEFIPPVSNGSIAVVDGYSFYSCGDLYYPSNENAVVPLCFKRSGGGKLQFSDVVEVKEIDPVYKVKLDYEFEDENIAAVCKKAIGSKIKYNGSDWEGFCEQIHSVMTVVGEHMELPKYYIYDEEGGNDLNKVVMISQWSCDGESNEQKEEEQQIQNGSTDVSEVESEPAPPEVEVPQKPQYQQEQKPAVDQQAEVEAALSYMTPTAPKPTENPFAFEYYDLNGIKVLRQCDNNCWVASALVQLQLLNVNEDYTYFFKSGRLSPLVKRCYERTGNIRGSAGDTSHCLEVMLRDLHTMQLRFSVKCKCGTFTEEMSGCVFRFMPTAKAFPYGGCASCGKTKMYTITTMKGTGVFCQEPNPLNISDLLVEPLCASVFKSGHYKTNIYKYNVCVDGNGRGQIKWNTVNTVCFKDVEYNKVEEVQSFATYRNISFYQGDIKEVKSVNHDFIVNAANEDLNHGGGIAGALNKYTKGVLQKVSNAHITANGKLKVGSGVMLECDGTNIFNVVGPRKGKHAPELLIKAYDAIFSNPGVPLTPLISVGIFKVPIEDSLSALFASAGERVVKCFCYTSAEKSAIIKYIDSVTNVVVDVKEPGPAPPEVKQILPFRKEGKFDFYEIEAADLALLNPDRLVIFTDTDFKLCDFAIAFNSVVEGGLTSCIEAYRKENNVVPAGNIVTFKCEGMVAVSFAVLPIAGAASYDKNVTRTINKITKLKGNVFSTVPPTSVLKNMLKCCNCSFVVSQDTKASVTECFDVQEVRIKVSYNDRDVQDVVVKGDKVIDQQIGPCSTNNFDLTGVKPDDAINSVVNVAPEVDWISHYGFPRADVWHTLDHSAYDYESKEQDGVRVLKFSDNNCWVNATCIQLQIAKITFRTEGIQAMWDEFLVGKVAKFVHWLYWYQNSSKGDPGDVEYTLNAISRYMANKSTVVISRVATTECCNDTKTIHTPVVNVSLLRSGVEDGVCQHGNKYYSRLVSVKGTVIVTSTGKPNVYPRNALITGDSYTLYSGDVKDGHYTVFSVKGDKIFDGENVSSNNDLSLYPVTSVVVSNKVIEFEKPAKPKIAEVMNKLDNASEKFFSFGDVVSRNFAAVFVWLFSMIGLVFKAFKTKDVKVFALAPERTGIILGRSIKYNFKATKQLLVSKIKWVKLFGKILLAMFAIYATSFMLVRFGPLNESLCTDYVKNYSESNFNKAAYCDGITCKTCLYGYQELSDFPHTSTVWEHVKDPLFKKVMPMFYMAFLLIFGGTITRSCMLYFLAQYVNNIGVFLGVQDNVWALQFVPFDVFGDEIVVIFLVVKILLFAKHIVFGCDKPSCVACTKSARLTRVPMQTIVNGSNKSFYVAANGGKKFCKKHNFFCVNCDSYGPGNTFINDVVAAEISNVVKTSVAPTAPATIDVTKVEFQNGFYYLYGPDNVFWRYNFDITESKYGCKDVLKSCNILSDFIVYNNAGSNVAQVRNACVYFSQLLCKPIKLVDSTLLSTLNVDFNGALHSAFVDVLNESFSKDLSSCTTMSDCKTALDIEADDEDFVNCVSNAHKFNVLLTDLSFNNFVTSYAKPEEKLSTHDIAACMRGGSKVVNHNVLVKENVPIVWLAKDFNMLSEEGRKYVVKTAKIKGINFMLTFNENRMQTTIPTVSIAGKKGSGLKQCYNFIWWSCAFILFMFFAIGLLDFSTTVTSASEYDFKYIIGGKLQSFEKPLDCVHNVFDNFNTWFQAKFGFVPRNSRSCPIVVGVNDEARVIPGVASGVSLVDKTLVFATKSVFANSATCYDITGPAPAERCVFNSACTTLNGLGGLATYCYKNGLVEGAKLYTDLQPNSHYSMADGGYVKLPDVLASGFGFRTVKTQETTYCRVGQCVNSKAGVCFGANRFLVYNEDSGTDFVCGTGLMSLMYNLLSVFSSSFSVMAMSGQIVLNCAVALFAIFACMLVTKFKRMFGDLSLGVCSVICVAIVNNLSYIVTQNAVTMVAYAVLYFLCTRTFRYSWIYHTGYCIAYFTLAPWWLIFMYACSALIGVIPNLLKLKVTTQLFDGDKFVGNFENAAFGTFVMDMHSYQRLVNSIAPEKLKQYAASYNKYKYYSGSASEADYRLACYAHLAKAMLDYSSNHNDILYTPPTISYNSTLQSGLRKMAQPSGVVERCVVRVCYGNMVLNGLWLGDTVICPRHIIASSTSSIIDYEHQYSVMRLHNFSVSVGNVFLGVVGVTMKGTNLHIKVNQTNVHTPEHTFKTLKQGDSFNILACYDGVPSGVYGVTLRTNNTIRGSFINGACGSPGYNINNGKVEFCYLHQLELGSGCHVGSNLDGVMYGGFEDQPTLQVEGANNLVTINVIAFLYGALLNGITWFLSNDRVTVESFNEWASVNGYTDCGSIDCFAMLAAKTNVDVQRILAAVQRLHKGFGGKNILGFTTLTDEFTVTEVIKQMYGVSLQSGKVSSMFYNVCVIGAFLTMFWSELLHYTAFFWISPGFITPMFFMLLMVSVFFMCALKHKIMFLYTFLIPAVIVTSCYNFAWDWYITSVLATTFDYHVSLLSLDIQGVINVSACVFVTLLHTFRFCKSSVNYSSVITYCCSLLFVAYGFYMGSDALSLVMMVLFNFTSNWYVGAIVYKIAFYTRDMTVLPLLVGNVKAVMLCYIVLGYFCCVYYGILYWINRFFKLTLGVYDFKVSANEFKYMVANGLHAPRGVFDAVALSVKLIGIGGEKTIKVSTVQSKLTDIKCTNVVLLGCLSSMNIASHTKEWSYCVELHNKINLCDDPEKAQEMLLALLAFFLSKQKDFGVDDLLESYFSSGSILQSVASTFVNMPSFIAYENARQAYEDAINSGAAQQLVKQLKRAMNIAKSEFDHEASVQKKISRMAEQAAAQMYKEARAVNRKSKVISAMHSLLFGMLRRLDMSSVDTILNLAKDGVVPLSIIPAASATKLNVVSADLESYLKICKEGCVHYAGVIWNVIDIRDNDGKLVHMKEVTQENVENLAWPLFLNCERIVKLQNNEIMPGKLKQRAVKAEGDGFSADGKALYNNESGKTFMYAFVADKPDLKYVKWEFDGGCNTIELEPPCKFAVESTNGTVIKYLYFVRNLNTLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTELATNSPLLTMCAFSVDPAKTYLDAVKRGVKPVGNCIKMLSNGAGTGQAITVGVESNTNQDSYGGASVCLYCRAHVEHPSMDGRCRLKGKYVQVPLGTIDPIRFCLENDTCKVCMCWLNNGCTCDRVSSVQAFDAGYLNRARGSSAAQLEPCNGTDTDHCVRAFDIYNKEVACMGKFLKVNCVRFKNPEYNDAFFVIKKCPKSVMEHEQSIYDILKDSGAVASHDFFTWKDGRAIYGNISRQNLTKYTMMDLVYALRNFDEKNCETLKEILVLTGACEESYFESKVWFDPVENEDIHRVYAILGKIVANSMIKCVRLCDAMVENGIVGVITLDNQDLNGNFYDFGDFARTLPGMGVPLCTSYYSYMMPVMGMTNCLAGECFMKSDIFGDDFKTYDLLHYDFSEHKQALFEKYFKHWGQDYHPNCVDCHDEMCLIHCANFNTLFSTTIPATAFGPLCRKVFVDGVPLVATAGYHFKQLGIVWNKDLNTHSSRLSINELLQFVTDPSLLVASSPALVDQRTICFSVAALSTGMTKQTVEPGHFNKEFYDFLRGQGFFEEGSELTLKHFFFAQKGDAAIKDFDYYRYNRPTVLDICQARVTYKLVSRYFEIYEGGCITAKEVVVTNLNKSAGYPLNKFGKAGLYYDSLSYEEQDALYAVTKRNVLPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRNASVVIGTTKFYGGWDNMLKTLIEGVEHPCLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHTTCCNTEERYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYLKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSANINRLLSIDSNVCNNVGVKALQRELYDNCYRSSTVDDSFVDKYYGYLRKHFSMMILSDDGVVCYNKDYADLGYVADIGAFKATLYYQNNVFMSTSKCWVENDISKGPHEFCSQHTMQIVDEAGKYYLPYPDPSRILSAGVFVDDVVKTDAVILLERYVSLAIDAYPLTKHSNPEYRKVFYALLDWVKHLHNTLNQGVLESFSVTLLEDASSKFWDESFYASMYEKSTILQAAGLCVVCGSQTVLRCGDCLRRPMLCT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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR009466
NSP11
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829 NSP8
IPR042515 Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR014827 Viral_protease
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR036499 NSP9_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR036333 NSP10_sf
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR037227 EndoU-like
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1168 Identity=60.26%
Cov(Q)=13.77% Cov(P)=96.96%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0008242 F:omega peptidase activity
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Subcellular Location
From MSLVP
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6727
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
385.072339999994
Exp number, first 60 AAs:
0.05974
Total prob of N-in:
0.00290
outside
1 - 1911
TMhelix
1912 - 1931
inside
1932 - 1970
TMhelix
1971 - 1993
outside
1994 - 2060
TMhelix
2061 - 2083
inside
2084 - 2473
TMhelix
2474 - 2496
outside
2497 - 2727
TMhelix
2728 - 2750
inside
2751 - 2756
TMhelix
2757 - 2779
outside
2780 - 2783
TMhelix
2784 - 2806
inside
2807 - 2812
TMhelix
2813 - 2835
outside
2836 - 3140
TMhelix
3141 - 3163
inside
3164 - 3248
TMhelix
3249 - 3267
outside
3268 - 3276
TMhelix
3277 - 3299
inside
3300 - 3305
TMhelix
3306 - 3328
outside
3329 - 3342
TMhelix
3343 - 3365
inside
3366 - 3373
TMhelix
3374 - 3396
outside
3397 - 3399
TMhelix
3400 - 3422
inside
3423 - 3442
TMhelix
3443 - 3465
outside
3466 - 6727
