Strain
Bat_KJ473810
(Region: China; Strain: Alphacoronavirus BtMs-AlphaCoV/GS2013; Date: 2013)
Gene
ORF1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
ORF1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGCTAGCAACCGTATTTCGTTGGCTTTTGCCAATGATTCAGAGATTTCAGCTCTTGGCTTTGGTTCCGTCGAGGAAGCCGTCTCATTTTATAGTGAGGCCGCTGTCGGTGGTTTTGCCAATTGCCGATTTGTCTCTACGGGTCTTCAAGACATAATTGAAGGCGTCCTTGAAGATGACTACGTGTTAGTTATTACAGGGGTGCATCAACTAGTCGCCCGTATAGGCCAATTCGGTGACCAACCTTCAAATCTTAGGGGTTGGTTGCTGTTCTCTAATTCAAACTACTTTTTGGGAGAATTAGATCTTGTCTTTGGTGGACGTGGTGGAAACACAGTCTACGTAGACAATTACATGTGTGGTTCCAACGGTGTTCCCGTACTTCCTGAAGATCAATGGGAGTTTGTGGACTATTTTGGTGAACTCACTGAAGTGTCAATTGGTGACACTACTTACATTAAGGCCTGGAATGTTGACAGAGTCGAGGGGCCTTACAAAAGTCAAACTTTGTTGTCCATCAATGCTATTTCTTACTGCGGTGAAGTAATTCACGCATTGGCTGATGGTTCAACCATGTCTTATGCAACAGCTGTGAAAAAGAACAGCAAAACTGTTGTCAATAAGACTTATCAAAAACTTTACGATAACATCGGCGTGCCCTTTGTTACCAATGGTAAAGTATTAACTGAAATTATACCCAAACCTGTGTTCAATCATGGACTGGTGAAATGCCATTGTGGAAAAGTTTCCTGGACTGTTGGAGATTGGAGTTGTTATAAGTCCACTTGTTGTGGAACTGTTTGCAAACCAATTGCCATTGTCAATGGAGACGTTAATCCAGGAGATGTTGTGATCACTAGTAAACAGGTGGCGACGAATGGCGTTAAGTACTATAATGGTATGGTACTTAAGTATGTAGATACCATCGAGGATGTGCACCTGTGGAGAGTTATAAAACTGCAGAGCGTGAAAGGCTTTGTAGCTTCTCCAAACTATGATCCAGCTGAATATGTCTTCCTTGCTGATGACGCTTGCTCACCAACTAGTCGGTTGGTTATTTCTGCAAGTTACAAACTTGGGTTACTAAATGGAAATTTCACGGACGATGTTCGTGTTGCAGCCAGAGATGGTACAATTGTCGTTGGCAATAATGTGCTTAGTCTGATTGACGTTGTTCTAACTAAACCGTGGTTCGTTCGAAAGCTCGAGGAACTTCTCGGAGAAGCGTGGGACACGTTTGTGACTAGTCTGAAAAGCCTTGTATTTACAAGTGCTCAGTTGGTCGAACTTACTAAAGCACTCTCAAAAGCCGTGTTAAATGTTACCAAAGAAGGTATTGAGTTCGCGGCTGAAGTACCATCATGTTTTGAAAGTTGTTTTTCAGTTTTCAAAGAATTTGTTACTGGAATCTTTGATTTTACAGTAAACAGTGTCAAAATTGCAGGCCGTAGCTTCAAAAGCATTGGTTCTTATGTTCTGTTTGACAATGCTATAATTAAATTTGTGGCAGTCAAGGTTAAAGGCCTTCATCAAGCAGGAATTAAATCTACTGAATATGCTACGTCCATCATTGGCAAAACTACTAAAGTTAATTCCAAAAGAACAGAAAGTGCAGATGTGAATCTCGTACTTGTCAATGACAAACAACCACTACTGAAGGATGGTGTTACTAAGATAATTGGTGGAAAATCATTCTTTTACAGTGGAGGTGTCTATAGACTTATGAGTGATAATAACTCTGTGCTTGATGAACCTGTATTTCAAGAAAAAGTGAGTGTACAATTTGAGTGTGAACAACCGAAAGGTTTCACTGAACCAGATTGTGACAATCTCCCAAGTGTCGTTAAAACTACTGTTGAACAACTTGTTAAATTTAACACACCTTATCGTAATTACGATGTTAGTGTGGTGAATAACAAGTGTGTTGTCAAGTGTACTTACACTTTCCGTGCACCAGCTTACATTGCAGACACAGAGAATTTTGTGAAAGCTTGTGAGGTGTGTGTTGACAAAGAAGGTTTTGACGAATTTTATGTTCAAACACATGCAGTTGACTCTCTTGTAGCTTTCAAACCAGCTTTTGCTGAATTTGAACAGTTTTTAGAGCCTGTTAGTTGCCCTGAACTATTTCTTGAAATAGATGGTGGTAACATTTGGAATAAGTTTATTAAAACTGTCACAGATGCTGTTGAATTTGTAAAATCAATTAAAGTTTCTTTTGACCTCAATGGTGTTGTGGTTAAAGCCACAAAACGTTTCAAGAAATTTGCAGCTACTCTAGTCAATCTTTACAGAGAGTTCGTTGCTACTGTTACTAAGACTATCAAAATTGGAAGCCAAGCTTTTACATATTATGCATTTGAAGTACCAAAAGTTTTACTTTCTGGTGCTTTGCATAGTGTGAGAACAGTCAAGGCTAAAGAGCTCAACTTGTCTGTACAAGACGTTATTGTTGAATTTAATGTTTTTGATGGTGCTACAGTAGAGGTCACGCCTAATCGTGTTGAAAAAGAAGAAATCTCTCTTGAAGAAGTAGAGTTTATCCCACCTGAGGGCAATGGTTCTATTGCAGTAGTTGATGGTTATTCATTTTACTCTTGTGGTGATTTGTATTATCCATCAAATGAAAATGCAGTCGTCCCACTTTGCTTCAAACGTAGTGGTGGAGGTAAATTGCAATTCTCTGATGTTGTTGAAGTCAAAGAAATTGACCCAGTTTATAAAGTAAAATTAGATTATGAATTTGAAGATGAAAACATTGCAGCGGTCTGCAAGAAAGTCATTGGTACTAAAATTAAGTACAATGGTGCAGACTGGGAAGGTTTCTGTGAACAAATTCACTCTGTTATGACTGTTGTTGGTGAACACATGGAACTGCCTAAATACTATATCTATGATGAAGAAGGCGGTAATGATCTGAATAAGGTCGTCATGATTTCACAATGGTCATGTGACGGAGAGTCTAATGAACAAAAAGAAGAAGAACAACAGATTCAAAACGGTTCTACAGATGTTTCTGAAGTTGAAAGTGAGCCCGCACCACCTGAAGTGGAGGTGCCACAGAAACCTCAGTATCAACAAGAACAAAAACCTGCTGTAGATCAACAGGCGGAAGTTGAAGCTGCTTTGTCATATATGACTCCTACAGCTCCTAAACCTACAGAAAACCCATTTGCATTTGAGTTTTATGACCTTAATGGTGTTAAGGTACTAAGACAATGTGACAATAATTGCTGGGTTGCATCAGCTCTTGTCCAATTGCAGCTTTTAGACATCTACAATGACTACGCATACGATTTCTTTAAAATCGGTCGCGTGGCACCAATGGTCAAACGCTGTTATGAATGTACAGGAAACATTAGAGGATCTGCTGGTGATACATCTCATTGTCTTGAAAAGATTTTGAGTGGGTTACACACCATGCAACTTAGGTTCTCTGTTAAATGTAAATGTGGTACATACGCTGAAGAAATGAGTGGATGTGTCTTTAGATTCATGCCAACTGCGAAAGCATTTCCATATGGTGGCTGTGCGTCTTGTGGTAAAACCAGGATGTACACTATTACTACCATGAAGGGAACTGGTGTGTTCTGTCAAGAACCTACTCCACTTAATATCAGTGAACTTTTGGTTGAACCACTCTGTGCTTCTGTGTTCAAAAGTGGCCATTATAAAACCAACATTTACAAACATAATGTTTGTGTTGATGGTAATGGCCGTGGTCAAATTAAATGGAACACAGTAAACACAGTGTGTTTTAAGGATGTTGAATACAACAAAGTGGAAGAAATCCAGCCTTTTGCTACTTACCGGAACATATCCTTTTATCAAGGTGACATTAAAGAAGTAAAATCTGTGAATCATGATTTTATTGTTAATGCAGCTAATGAGGATTTGAATCACGGTGGTGGTATTGCTGGTGCTTTAAATAAATTTACAAAAGGTGTGCTACAGAAAGTATCAAATGCACACATCACTGCAAATGGTAAGCTCAAAGTGGGAAGTGGTGTCATGCTTGAATGCGACGGAACAAACATCTTTAATGTTGTTGGTCCTCGTAAAGGAAAGCATGCACCTGAATTGCTCACAAGAGCTTACGATGCAATTTTTAGCAATCCTGGTGTCCCACTAACACCTCTCATTAGTGTTGGTATTTTTAAAGTGCCAATTGAAGATTCGCTGTCTGCTCTTTTTGCGTCTGCGGGCGAACGAGTAGTAAAGTGTTTTTGCTATACTTCAGCCGAAAAAAGCGCGATCATTAAATACATAGATGGTGTTACTAATGTAGTGGTAGATGTTAAAGAACCAGAGCCTGCACCTCCAGAGGTTAAACAAATCCTACCTTTTAGAAAGGAGGGTAAATTCGACTTCTATGAAATCGAGGCAGCAGACTTGGCACTTTTAAATCCAGATAGGCTAGTTATTTTCACTGATACAGACTTTAAATTATGCGATTTCGCTATCGCCTTCAATGGTGTTGTTGAGGGAGGTTTGACTTCGTGTATTGAGGCTTATCGCAAAGAAAATAATGTTGTGCCTGCTGGTAACATTGTTACCTTTAAATGTGAGGGAATGGTGGCAGTCAGTTTTGCTGTACTTCCAATTGCTGGTGCCGCTTCTTATGATAAGAACGTCACACGCACAATTAATAAAATTACTAAATTAAAGGGTAATGTCTTCTCCACTGTACCACCTACAAGTGTCTTGAAAAACATGCTTAAATGTTGTAATTGTTCCTTCGTTGTTTCGCAAGATACAAAAGCGTCAGTGACAGAGTGTTTTGATGTTCAAGAAGTGCGAATCAAGGTTTCTTACAACGATAGAGATGTTCAAGACGTTGTGGTAAAAGGAGACAAAGTTATCGATCAACAAATTGGTCCTTGTAGTACAAATAACTTTGACCTAACAGGTGTGAAACCAGATGATGCTATTAATAGTGTCGTCAATGTTGCACCTGAAGTTGATTGGATTTCTCATTATGGTTTTCCACGAGCAGATGT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Protein
MASNRISLAFANDSEISALGFGSVEEAVSFYSEAAVGGFANCRFVSTGLQDIIEGVLEDDYVLVITGVHQLVARIGQFGDQPSNLRGWLLFSNSNYFLGELDLVFGGRGGNTVYVDNYMCGSNGVPVLPEDQWEFVDYFGELTEVSIGDTTYIKAWNVDRVEGPYKSQTLLSINAISYCGEVIHALADGSTMSYATAVKKNSKTVVNKTYQKLYDNIGVPFVTNGKVLTEIIPKPVFNHGLVKCHCGKVSWTVGDWSCYKSTCCGTVCKPIAIVNGDVNPGDVVITSKQVATNGVKYYNGMVLKYVDTIEDVHLWRVIKLQSVKGFVASPNYDPAEYVFLADDACSPTSRLVISASYKLGLLNGNFTDDVRVAARDGTIVVGNNVLSLIDVVLTKPWFVRKLEELLGEAWDTFVTSLKSLVFTSAQLVELTKALSKAVLNVTKEGIEFAAEVPSCFESCFSVFKEFVTGIFDFTVNSVKIAGRSFKSIGSYVLFDNAIIKFVAVKVKGLHQAGIKSTEYATSIIGKTTKVNSKRTESADVNLVLVNDKQPLLKDGVTKIIGGKSFFYSGGVYRLMSDNNSVLDEPVFQEKVSVQFECEQPKGFTEPDCDNLPSVVKTTVEQLVKFNTPYRNYDVSVVNNKCVVKCTYTFRAPAYIADTENFVKACEVCVDKEGFDEFYVQTHAVDSLVAFKPAFAEFEQFLEPVSCPELFLEIDGGNIWNKFIKTVTDAVEFVKSIKVSFDLNGVVVKATKRFKKFAATLVNLYREFVATVTKTIKIGSQAFTYYAFEVPKVLLSGALHSVRTVKAKELNLSVQDVIVEFNVFDGATVEVTPNRVEKEEISLEEVEFIPPEGNGSIAVVDGYSFYSCGDLYYPSNENAVVPLCFKRSGGGKLQFSDVVEVKEIDPVYKVKLDYEFEDENIAAVCKKVIGTKIKYNGADWEGFCEQIHSVMTVVGEHMELPKYYIYDEEGGNDLNKVVMISQWSCDGESNEQKEEEQQIQNGSTDVSEVESEPAPPEVEVPQKPQYQQEQKPAVDQQAEVEAALSYMTPTAPKPTENPFAFEFYDLNGVKVLRQCDNNCWVASALVQLQLLDIYNDYAYDFFKIGRVAPMVKRCYECTGNIRGSAGDTSHCLEKILSGLHTMQLRFSVKCKCGTYAEEMSGCVFRFMPTAKAFPYGGCASCGKTRMYTITTMKGTGVFCQEPTPLNISELLVEPLCASVFKSGHYKTNIYKHNVCVDGNGRGQIKWNTVNTVCFKDVEYNKVEEIQPFATYRNISFYQGDIKEVKSVNHDFIVNAANEDLNHGGGIAGALNKFTKGVLQKVSNAHITANGKLKVGSGVMLECDGTNIFNVVGPRKGKHAPELLTRAYDAIFSNPGVPLTPLISVGIFKVPIEDSLSALFASAGERVVKCFCYTSAEKSAIIKYIDGVTNVVVDVKEPEPAPPEVKQILPFRKEGKFDFYEIEAADLALLNPDRLVIFTDTDFKLCDFAIAFNGVVEGGLTSCIEAYRKENNVVPAGNIVTFKCEGMVAVSFAVLPIAGAASYDKNVTRTINKITKLKGNVFSTVPPTSVLKNMLKCCNCSFVVSQDTKASVTECFDVQEVRIKVSYNDRDVQDVVVKGDKVIDQQIGPCSTNNFDLTGVKPDDAINSVVNVAPEVDWISHYGFPRADVWHTLDHSAYDYESKEQDGIRVLKFSDNNCWVNATCIQLQIAKTTFKNEGIQAMWDEFLVGKVAKFVHWLYWYQNSSKGDPGDVEYTLNAISRYMANKSTVVISRVATTECCNDTKTIHTPVVNVSLLRSGVEDGVCQHGNKYYSRLVSVKGTVIVTSTGKPNVYPRNALITGDSYTLYSGDVKDGHYTVFSVKGDKIFDGENVSSNNDLSLYPVTSVVVSNKVIEFEKPAKPKIAEVMNKLDNASEKFFSFGDVVSRNFAVVFVWLFSMIGLVFKAFKTKDIKVFALAPERTGIILGRSIKYNFKATKQLLVSKIKWVKLFGKILLAMFAIYATSFMLVRFGPLNESLCTDYVKNYSESSFNKAAYCDGITCKTCLYGYQELSDFPHTSTVWEHVKDPLFKKVMPMFYMAFLLIFGGTITRSCMLYFLAQYVNNIGVFLGVQDNVWALQFVPFDVFGDEIVVIFLVVKILLFAKHIVFGCDKPSCVACTKSARLTRVPMQTIVNGSNKSFYVAANGGKKFCKKHNFFCVNCDSYGPGNTFINDVVAAEISNVVKTSVAPTAPATIDVTKVEFQNGFYYLYGPDKVFWRYNFDITESKYSCKDVLKSCNILSDFIVYNNVGSNVAQVRNACVYFSQLLCKPIKLVDSTLLSTLNVDFNGALHSAFVDVLNESFSKDLSSCTTMSDCKTALDIEADDEDFVNCVSNAHKFNVLLTDLSFNNFVTSYAKPEEKLSTHDIAACMRGGSKVVNHNVLVKENVPIVWLAKDFNMLSEEGRKYVVKTAKIKGINFMLTFNENRMQTTIPTVSIASKKGSGLKQCYNFIWWSCAFILFMFFAIGLLDFSTTVTSASEYDFKYIIGGKLQSFEKPLDCVHNVFDNFNTWFQAKFGFVPRNSRSCPIVVGVNDEARVIPGVASGVSLVDKTLVFATKSVFANSATCYDITGPAPAERCVFNSACTTLNGLGGLATYCYKNGLVDGAKLYTDLQPNSHYSMADGGYVKLPDVLASGFGFRTVKTQETTYCRVGQCVNSKAGVCFGANRFLVYNEDSGTDFVCGTGLMSLMYNLLSVFSSSFSVMAMSGQIVLNCAVALFAIFACMLVTKFKRMFGDLSLGVCSVICVAIVNNLSYIVTQNAVTMVAYAVLYFLCTRTFRYSWIYHTGYCIAYFTLAPWWLIFMYACSALIGVIPNLLKLKVTTQLFDGDKFVGNFENAAFGTFVMDMHSYQRLVNSIAPEKLKQYAASYNKYKYYSGSASEADYRLACYAHLAKAMLDYSSNHNDILYTPPTISYNSTLQSGLRKMAQPSGVVERCVVRVCYGNMVLNGLWLGDTVICPRHIIASSTSSIIDYEHQYSVMRLHNFSVSVGNVFLGVVGVTMKGTNLHIKVNQTNVHTPEHTFKTLKQGDSFNILACYDGVPSGVYGVTLRTNNTIRGSFINGACGSPGYNINNGKVEFCYLHQLELGSGCHVGSNLDGVMYGGFEDQPTLQVEGANNLVTINVIAFLYGALLNGITWFLSSDRVTVESFNEWASVNGYTACGSTDCFAMLAAKTNVDVQRILAAVQRLHKGFGGKNILGFTTLTDEFTVTEVIKQMYGVSLQSGKVSSMFYNVFVIGAFLTMFWSELLHYTAFFWISPGFITPMFFMLLMVSVFFMCALKHKIMFLYTFLIPAVIVTSCYNFAWDWYITSVLATTFDYHVSLLSLDIQGVINVSACVFVTLLHTFRFCKSSVNYSSVITYCCSLLFVAYGFYMGSDALSLVMMVLFNFTSNWYVGAIVYKIAFYTRDMTLLPMLVGNVKAVMLCYIVLGYFCCVYYGILYWINRFFKLTLGVYDFKVSANEFKYMVANGLHAPRGVFDAVALSVKLIGIGGEKTIKVSTVQSKLTDIKCTNVVLLGCLSSMNIASHTKEWSYCVELHNKINLCDDPEKAQEMLLALLAFFLSKQKDFGVDDLLESYFSSGSILQSVASTFVNMPSFIAYENARQAYEDAINSGAAQQLVKQLKRAMNIAKSEFDHEASVQKKISRMAEQAAAQMYKEARAVNRKSKVISAMHSLLFGMLRRLDMSSVDTILNLAKDGVVPLSIIPAASATKLNVVSADLESYLKICKEGCVHYAGVIWNVIDIRDNDGKLVHMKEVTQENVENLAWPLFLNCERIVKLQNNEIMPGKLKQRAVKAEGDGFSADGKALYNNESGKTFMYAFVADKPDLKYVKWEFDGGCNTIELEPPCKFAVESTNGTVIKYLYFVRNLNTLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTELATNSPLLTMCAFSVDPAKTYLDAVKRGVKPVGNCIKMLSNGAGTGQAITVGVESNTNQDSYGGASVCLYCRAHVEHPSMDGRCRLKGKYVQVPLGTIDPIRFCLENDTCKVCMCWLNNGCTCDRVSSVQAFDAGYLNRARGSSAAQLEPCNGTDTDHCVRAFDIYNKEVACMGKFLKVNCVRFKNPEYSDAFFVIKKCPKSVMEHEQSIYDILKDSGAVASHDFFTWKDGRAIYGNISRQNLTKYTMMDLVYALRNFDEKNCETLKEILVLTGACEESYFESKVWFDPVENEDIHRVYAILGKIVANSMIKCVRLCDAMVENGIVGVITLDNQDLNGNFYDFGDFARTLPGMGVPLCTSYYSYMMPVMGMTNCLAGECFMKSDIFGDDFKTYDLLHYDFSEHKQALFEKYFKHWGQDYHPNCVDCHDEMCLIHCANFNTLFSTTIPATAFGPLCRKVFVDGVPLVATAGYHFKQLGIVWNKDLNTHSSRLSINELLQFVTDPSLLVASSPALVDQRTICFSVAALSTGMTKQTVEPGHFNKEFYDFLRGQGFFEEGSELTLKHFFFAQKGDAAIKDFDYYRYNRPTVLDICQARVTYKLVSRYFEIYEGGCITAKEVVVTNLNKSAGYPLNKFGKAGLYYDSLSYEEQDALYAVTKRNVLPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRNASVVIGTTKFYGGWDNMLKTLIEGVEHPCLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHTTCCNTEERYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYLKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSANINRLLSIDSNVCNNVGVKALQRELYDNCYRSSTVDDSFVDKYYGYLRKHFSMMILSDDGVVCYNKDYADLGYVADIGAFKATLYYQNNVFMSTSKCWVENDISKGPHEFCSQHTMQIVDEAGKYYLPYPDPSRILSAGVFVDDVVKTDAVILLERYVSLAIDAYPLTKHSNPEYRKVFYALLDWVKHLHNTLNQGVLESFSVTLLEDASSKFWDESFYASMYEKSTILQAAGLCVVCGSQTVL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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR009466
NSP11
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829 NSP8
IPR042515 Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR014827 Viral_protease
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR036499 NSP9_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR036333 NSP10_sf
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR037227 EndoU-like
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
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IPR029063 SAM-dependent_MTases
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1168 Identity=59.94%
Cov(Q)=13.74% Cov(P)=96.96%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0008242 F:omega peptidase activity
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Subcellular Location
From MSLVP
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6740
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
386.658019999996
Exp number, first 60 AAs:
0.00173
Total prob of N-in:
0.00041
outside
1 - 1921
TMhelix
1922 - 1944
inside
1945 - 1983
TMhelix
1984 - 2006
outside
2007 - 2073
TMhelix
2074 - 2096
inside
2097 - 2486
TMhelix
2487 - 2509
outside
2510 - 2740
TMhelix
2741 - 2763
inside
2764 - 2769
TMhelix
2770 - 2792
outside
2793 - 2796
TMhelix
2797 - 2819
inside
2820 - 2825
TMhelix
2826 - 2848
outside
2849 - 3153
TMhelix
3154 - 3176
inside
3177 - 3261
TMhelix
3262 - 3280
outside
3281 - 3289
TMhelix
3290 - 3312
inside
3313 - 3318
TMhelix
3319 - 3341
outside
3342 - 3355
TMhelix
3356 - 3378
inside
3379 - 3386
TMhelix
3387 - 3409
outside
3410 - 3412
TMhelix
3413 - 3435
inside
3436 - 3455
TMhelix
3456 - 3478
outside
3479 - 6740
