Strain
Bat_KU762338
(Region: China; Strain: Rousettus bat coronavirus GCCDC1; Date: 2014/5/28)
Gene
ORF1ab protein
Description
Annotated in NCBI,
ORF1ab protein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGAGGGTGCTTTAGGCACTAACAAGCTTAGATCTATGGTGTCGATCACCCTTGATTGGATCGACCCCCGTAATGTACCCAGACTCACTAACTGGGAAATGCCTTTGCAGGAGGCTGCTGAGTATGTGAAGCGAGAGCTCAGTAAGCCAAATCCTGATGTGGTTTTTGTGCCCAACTACTTGCTAGATTCCGCACAAATTCCGCAAAATCGCGTCGTCATCACTAATAGTGTATGGCGCTGCTACGAGATGGGTTGGAAACCCGTCCGTGAGATTGCCTTCGACCTCGATGGAGTACGCTTCGGTCGTGGCGGTACTCATGGTGTTTTGCTCCCGAGGCAACCACCGCAATACATTTGTGGTACCGTGAGCATCGAGCTCCGTAAATACGGAGTGGGTGGAGGTGCCGAGATTTTTATTCCTAAGCTGTGGGATGGGTTCGTGGACCCGCCTGCCGCCGCGGAAGAGTATTTAGATTTTCCTGACAAGTGCTTTCCCACGAAGCCCAAGGCTAAGCGTGGAGGAAACACCTTTCTAACAGATCAATATGGATTTGACGCTGATGGCGTCCTTGCTGCTCCGATAAAGGAGGTGCTTGGAGGTAAAGGAGCTGGTATGTCCCTGGTTGAGCTGACAAAGTTCCTAGGCAAGTACCGGACTGCTGATGGTTACGAATTACCTTCCGGCATAGTGAAAGTGGCCGTGAAGGTGGTTCGCAAAAACCTACCTGTTTCTAAACAGTCTATCTTTACAGTTCTGGGGGTTACTGAACGTGTGGTAGACGGGTTTTATTATCCGTACTCCACCAACAGTGTGGTTAGCTACACAAAACCGCGCGCTGGCGCAACTGTAGGCAACACTGTACAGTCAGTGATGCTAAGCATGTATGGTACAGAGGCCTACAACCCAGTGACACCTGTTGTGCGCTTGCGCTGTAGCTCCTGTGACTTTTACGGGTGGGTTCCTGTTAAAGACCTTGGCTGTGTTACCTGCTCCTGTGCAGCTGTGCATCAGATTACATCTTCTTGCATTGATGCTGAGTCTGCCGGTCTGATTAAGCAGGGTGCCGTTATGCTTGTTGACAGAAGTCCGAGCATGCGTGTGGTACCTGGTAACAGACTCTATGTGGCTTTTGGTGGGGCCATCTGGTCCCCAATTGGAAAAGTGAATGGTGTCCAAGTTTGGGTACCACGTGCTTACTCCTGTGTTGCTGGTGATCACTCTGGAGCCGTAGGTTCGGGTGATGTTAACACCATAAACAAGGAGATCATGAGTCTCATCATAGACGGTGTCCGCATTGATGATGAAGTTTTGGAGCAACCATCTTGTGGTGTGCTTATTGCCAACCTGGAGGATCCTTCTGCAGCACCTCGCGTGCACACTGTGGATTCCCTACGCCAGTTGTGTGTTGACAACAATGTGATGCTTGGCGACACACCTTTGCCCAAGGATGAGTTTCATCCTGGAATTGTGGGCTTGTCCTATCATTTCTACCGTGCGTGCTGGTACGGAGTGCTAACCGCAAAATCATTTGGTGCTTTCAAAGAACTCTTACAGAGTGAAGAGGTTCGTCTGTCGCACTTCTGTGCTAATATCAGGCGTTGCCTTGACCGTGCTCTTAACTGGGCGCGTACCACTGGCAATGTCTCGCTTTTGAGCTCAAGCCTTGTGCTGAAGGCTCTTGCAGAGAATCTGTTAGATTCTGTTAAAAACACTCCTTTCCTTGTGGGGGACCTTGTGAAACCCGTATTGGATTGGATTGTTGAAAAGATGGTCCTTGCACGTGACAGTGTTGTTAACTGTGCTGAGGCCGTCTTGTCTCTGTTTAACATGCAGTTTACCTTTGCAAAAGGTAAATTTACTTTTTTAAAGGAGAAACTCAACAAGTCCTGTGTGGCCTTGCGTGAGTTGCTCACTGTTATTGTAAATAAGTTTGCTACTACTGTTAAGTGGGCCGGCTGTAAGATAGATGGTTTTTACAATGGTGATTACCACTTCTTCTCAGCAAAGGGCGTACTAACAGAAGTACAAGTTTGTGCTAAGACACTTGGTGCCATGCTTACACCTCGCCAACAGCGTATGGAGGTTGAGGTACTTGATGGTAAGTATGATGCACCAGTTGCTATTACTGTTCCTGAGTTGGAAGAGCTCAATGGGACACTTGAAGAAGTTTTTGGATTCGACGACCTTACGCTCGTAAGAGGTTCACTGGTTGCACTTGCTAGTAAGGTATTTGTCCGCACCGATGATGGATTGCTGTTCCGCTACGTAAAGTCCGGCGGTGTCTTTTTGAAGGCATTCCGACTACGTGGAGGTGGCAAACCTAAGGTTTCCTTTGGTGAGGAAGAGGTGCGTACAGTACCGCGTGTTTTGACTGTAAACTTCACCTATGATGTTTGTGAGGGTCTCGATGGGGTTCTCAACAAGCTCATGGCTCCCTTTGAAGTGGAGGAAGGTACTAAGCTTGAAGACCTTGCACTTGTTGTTCAAGAAGCGGTTGCTGAAAAACTGCGCGAACTGTTTGAGGATTGTCCAGCTGATGTGCGGCCTATTGATATAGACGCATTCGCTGATGACGAGTGTTACATTTACAACATGGACTATGAAAAAGTGCTGTCCACTGAAATGTACTTTTCACTAGAGGATGTCACACCTGTTGAGGATGAAGACGAGTGTGCTAGTGAGGTACAGTCCTCTGACGACTGCGAAGAACAGACTGAGCAGTTTGATGAGAGCGATGATGACACATGGTTAGGTGCCGATGACACTGAAGCTGAGGCTGATGTTAGCTTCCCTGTGGTGGAAGGCATCCCCGAGGCCAGTGGACATGTACCACCAGAGAACATAGATGATGACCATGTTGGCTTCAAACAGTTGACTGCCAATGTGTTTATTAAATGCGCTGACATAGTACAGGAAGCTACGTCACGCTCTTACAAAGTGTTAGTGAACGCAGCTAACGTTAACCTACATCATGGCGGCGGTGTGGCGGGAGTTCTAAACCGCGCCTCTGACAACGCAATGCAGGCTGAATCAACTGCCTACATTCGCGAGCATGGTCCACTACAACCTGGTAATGGCGTTCTATTGAGCGGACATGGTCTTGCTCAGGATGGCATTCTACACGTGGTTGGACCTGATAAACGTCTCGGTCAAAGCTTAGATACACTAGGCCAAGTTTACCAGCTCTATAATGCTCATGATGACATACTTACACCGTTAGTGTCTGCAGGCATATTTGGCTTCACAGTGGAGGAGTCACTTGTGTGCCTGTGCCGCAACGTAACGGCTAATACCTTCATAGTTGTTTATGACAAACAGCTCTATTCAAGAGCCTGTGCTGTTAGCAGGCAAGATTTAGAACCCGCCCCATTGGCAAGGAAAGAGGCCTGTGTGGTAGCGGTTAGCAATGATGCGCAGCAAGAAAGTCAAGAGAACGATTGGGCTGCTGCTGTAGAGTTTCAAGAGAAGAACCACAACGTGGAAGAAGTAGTTGGAGGTCCGTACCCCTCAGGGGATGCACCGGTTCCGTTCGCTGCATTAGTGGACGCAAAGACTACGACTGAAGCGCCTTGTGAGGATGCTAGCATAACTACTCCCTCTCCTAACCTCAAGGAGAATGTAGAAGAGGAAGTAGCAGCTTGTATGCGCTTTCTGCTAAGGAGAGTAACGAAGTCGCTGAAAAGCGAACGGCGTGAGACTACCAACGCAGCTAAAGTGACTGAGGTTGTGCAAGAAGCACCACCTGCGGAGCCAGTTGTTGCCTCTAGCCAATCTCATCTTAAGGATGTGCTTTGCATGTCTTTCTCTCAAATGATACAGTATGCCAAATCACACGGCCTGTTGACGCCAGTTGTGCTTGACTATACTGCATTCAGCAAGGTTTTACGTAAGTATGAACCAAAGTCTGGGCTTTATGAGTTTGGTGGCCAAAAATTTTATGGTTACAGTCGAGAAACGCCTCTTGAAGACGTTAGCAAAGCATTGAATGAGTTGGGTCTACCTTTGATTATGATACCATTTGGTTACATAGTCAATGGTGCTCAGCTATCTCTTTCTGCTATTAACATGAGAATGTTGCAAGTAGAGCATACGGTTGTTTTGCCGTCTGAATCCTGTGTACCATTGTACCGCAACTACTATGTTAGTGGTATCACTCAGGAAACCACAGCCTTACAGGACTTTGTAGTTGACATAATTGTCAACGGTGCTAAAGGCTGGGATGTAGTGCAGACTGTTTGTAAGGTAGACGGGGTCACCTACAAAACTATTTGCAAGTACAGGGACACTTATATGTGTCATGATGAAAGTAACCTGTATGCTATTACAGGGTCTACTGTTTTAAAGTTTGCTACGCTTCAGAAAGCGCGTGGCTATATGGAATCCTCTGTCAAGGAGAAGAAAACCTTGACCAAGGTGCTTACAACTGTAGACGGTGTTAACTATAGCACTGTTCTTGTTGATGATGAACGCACCTTCCAAGACCAGATTGGTGTGGTGTTCCATAATGGTGTTGATATTTCATCTAGAGTTCCAAACTCCGATGATGCCAACATACAATTGTTTAAGCAAGACAACTTTTCTCCAGAAGAAGTACAGGCCATAAGCGACTACTACGGTGTAAATGACTGCACCGTGGTAGCACGCGCTCTCAGTGTACGGAGGTATGTGCGAACCTGGCCATATTCCGTTGTGGACGGTAGAGTGCTTTTGGCTCAGCGTGATTCCAATTGCTACTTGAATGCGGCAATCTCTGTGTTGCAAGACATTGAGGTTGAATTTTCTACACCTTGGATCAGCACCGCATTTGACGCGCTCAAAGGTGGTAATCCATTGCCGATAGTGGAAGTTTTAATCACGTTAGGTAAAACTACAATTGGTGAGCCCGATGACGCTCACATGATCCTGTCTTCTTTGCTCTCTTACGCGTCCGTGAAAGCGGCCCGTAGAGCTATAACCACTGTTTGTGAAAACTGTGGTTCGTCTCAGGAGATCATTGA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Protein
MEGALGTNKLRSMVSITLDWIDPRNVPRLTNWEMPLQEAAEYVKRELSKPNPDVVFVPNYLLDSAQIPQNRVVITNSVWRCYEMGWKPVREIAFDLDGVRFGRGGTHGVLLPRQPPQYICGTVSIELRKYGVGGGAEIFIPKLWDGFVDPPAAAEEYLDFPDKCFPTKPKAKRGGNTFLTDQYGFDADGVLAAPIKEVLGGKGAGMSLVELTKFLGKYRTADGYELPSGIVKVAVKVVRKNLPVSKQSIFTVLGVTERVVDGFYYPYSTNSVVSYTKPRAGATVGNTVQSVMLSMYGTEAYNPVTPVVRLRCSSCDFYGWVPVKDLGCVTCSCAAVHQITSSCIDAESAGLIKQGAVMLVDRSPSMRVVPGNRLYVAFGGAIWSPIGKVNGVQVWVPRAYSCVAGDHSGAVGSGDVNTINKEIMSLIIDGVRIDDEVLEQPSCGVLIANLEDPSAAPRVHTVDSLRQLCVDNNVMLGDTPLPKDEFHPGIVGLSYHFYRACWYGVLTAKSFGAFKELLQSEEVRLSHFCANIRRCLDRALNWARTTGNVSLLSSSLVLKALAENLLDSVKNTPFLVGDLVKPVLDWIVEKMVLARDSVVNCAEAVLSLFNMQFTFAKGKFTFLKEKLNKSCVALRELLTVIVNKFATTVKWAGCKIDGFYNGDYHFFSAKGVLTEVQVCAKTLGAMLTPRQQRMEVEVLDGKYDAPVAITVPELEELNGTLEEVFGFDDLTLVRGSLVALASKVFVRTDDGLLFRYVKSGGVFLKAFRLRGGGKPKVSFGEEEVRTVPRVLTVNFTYDVCEGLDGVLNKLMAPFEVEEGTKLEDLALVVQEAVAEKLRELFEDCPADVRPIDIDAFADDECYIYNMDYEKVLSTEMYFSLEDVTPVEDEDECASEVQSSDDCEEQTEQFDESDDDTWLGADDTEAEADVSFPVVEGIPEASGHVPPENIDDDHVGFKQLTANVFIKCADIVQEATSRSYKVLVNAANVNLHHGGGVAGVLNRASDNAMQAESTAYIREHGPLQPGNGVLLSGHGLAQDGILHVVGPDKRLGQSLDTLGQVYQLYNAHDDILTPLVSAGIFGFTVEESLVCLCRNVTANTFIVVYDKQLYSRACAVSRQDLEPAPLARKEACVVAVSNDAQQESQENDWAAAVEFQEKNHNVEEVVGGPYPSGDAPVPFAALVDAKTTTEAPCEDASITTPSPNLKENVEEEVAACMRFLLRRVTKSLKSERRETTNAAKVTEVVQEAPPAEPVVASSQSHLKDVLCMSFSQMIQYAKSHGLLTPVVLDYTAFSKVLRKYEPKSGLYEFGGQKFYGYSRETPLEDVSKALNELGLPLIMIPFGYIVNGAQLSLSAINMRMLQVEHTVVLPSESCVPLYRNYYVSGITQETTALQDFVVDIIVNGAKGWDVVQTVCKVDGVTYKTICKYRDTYMCHDESNLYAITGSTVLKFATLQKARGYMESSVKEKKTLTKVLTTVDGVNYSTVLVDDERTFQDQIGVVFHNGVDISSRVPNSDDANIQLFKQDNFSPEEVQAISDYYGVNDCTVVARALSVRRYVRTWPYSVVDGRVLLAQRDSNCYLNAAISVLQDIEVEFSTPWISTAFDALKGGNPLPIVEVLITLGKTTIGEPDDAHMILSSLLSYASVKAARRAITTVCENCGSSQEIIEGVPACLHYGTVQLDDLYKPESIVCPCGKAAIRFVSLQQTPWVLMSHVPTNVPLDTTGNWFSAVVFKGPVTCGHYMYAVNGSLISVYDANTRKRTSDLLVPATDILYKDVNFTTSSKVVTFYLDGVKLTQIDPDLTQYVKRGDYYFTKAPIDVVAAPKVVTPYDGFRLVSDQASELAEAFNKAINASSDGPKRSLTVYPDCSGDAVVVNEEIPSYAHGALIQGKPVLYPKKPKTWKKLVPLLSVLEVKTKNRFEALPVDQLPEQTVEVVKKHKVATEPLYGLTAPIVLDGVNYVPGKKGDLLCLKEFTIIDLKTFYVEGNQPFVLLKENHLSKLLGLKISSNKLVVNKISSALILSYGLSLKSACAVKCATKKTLRYGAQATANCIRETKPGAKIVGILCMFYRVLLHLWFAIKKPPLVKVSGIVAYNTGCSVTACVFNYLKARFSNTSWTGISRVLRLLLYMWFTWTCLAIVGVWVSEPYAPSLLTKVKQYFGFVFPCDYLTVNETSEGWFHHMCMSGMDGLDYPALKMQQRRYGSPYDWTYMVMFLEAFVAYLLYTPVLPLVGIIGCLHALVLYLPISLGNSWLVVFFYYFVKLIPLSSLLRMYIVSAFLWLCYKGFVHVRYGCTNVSCLMCYKRNIATRVECSTVVNGVKRVFYVNANGGTYYCTKHNWNCVNCDTYTVDSTFISRPVALDLSAQFKRPINHTDEAYYEVTSVQVRNGYVYCYFDSEGEQSYERFPVDSFTNVSKLYYSELKGNPPAFNVLIFDATNRIEENAVKTAAIYYSQLACKPILLVDKRMVGVVGDDTAIAKTMFEAYAQSYLLKYNIAMDKVKSLYATALHQIASGTSVEAVLKVFVGSTREEARDLESDVDTNELVSCIRMCHQDGWEWTTASWNNLVPTYLKQETLSTLEVGQLITSNARYINANMAKSAAVQIVWRYADFARLSESVRRQLKIAARKTGLSLQLTTSNLKADVACVVTPFKVVGGNKRVIPWRSILVHVLMLLVVLNPQWFTPWYTMTAVPYDVIDFKVIDNAILRDIVPTDTCFANKFETFDNWYHNRFGTYENNWRCPMVVGVVKELVGVLKPDLPVRFVRVGTTLLPVVNFGMSGADSVCYTPYSAISYSDFETSACVLAATCTLFTGVGGQPAPYCADPTLIPNATHYGMLKPHVLYPFYETAGYIRFPEVIDAGVHIVKLMAMEYCKVGRCDVSEAGVCVTLTPMWVVNNPTFRQLPGVYCGASFMDMILQVFTPMFTPVGAVDITGSIIMGACLAVAISMVLYYLLKFRRAFGDYSSVVLVNILAFVVNVLVLCLEGAYPMLPSIYALLFLYVTCYFSSDVAAIMHVSFLVMFTSVIPLWVTMVYVVVLCSRHALWFAGLCTKRTVQVGDLSFHSFHDAALQTFMLDKEKFLRLKRELSPDAYAKYLALFPKYKYYNGPMDTAAYREAACAHLVMALEKFSTGGGDSIYQPPRCSVAAATLQAGLAKMAHPSGLVEPCIVKVSYGTMTLNGVWLNNYVLCPRHVLCTRDDLVNPDYQRLSMRAANYDFHVSQNGLNLRVTGHVMEGALLRLTVDATNPKTPAHSFVRVSTGQAISILACYDGIPAGVYTCTLRANGTLRAAFLCGSCGSPGFVMNGKEVQFCYLHQLELPNGTHTGTDMHGAFYGPFEDKQVPQLASPDVTITVNVLAWLYAAVLSGESWFVTKLGITAAEFNTSAVKYMCQSVTEESLQVLQPLAAKTGVSVQRMLSSLKVLLSTGFCGKTIMGSCSLEDEHTPYDIGRQMLGVTLQSRTQKFVKWAMQWFLIVFALSCLTLLHLSQWTVLGALPLQLLLPLLGFISCCVGFMAMFIKHKHTFLTVYLLPVVMVAAYYNFQYQPEGIQGYLLYVYNYVNPGRFDMGFDLTTMLVISGITTLLSVRIAKSDTYSRVWYVCTAIGWVYNCCTGTAETIALSYLTFVVSVFTNYTGVACISVYVSQVIVWAMAWVEPGILMYGHFRCVLVCYVIIGYCCTCYFGVFNLLNRLFRCTLGTYDYVVSSQELRYMNSNGLSPPTNSWQAMVLNLKLAGIGGVPMYKVATIQSNMTDLKCTSVVLLSVLQQLHVESSSKLWSLCVKLHNEILAATSTTDAFEAFVSLLSVLLSLPGAINLDELCNSILENNTVLQAVASEFSNLSSYVDYENAQKAYDTAVTTGAPVSTIKALKKAMNVAKSVLDKDVATARKLERMSEMAMTAMYKQARAEDKRSKVTSAMQTMLFNMIRRLDSDALNSILTNARNGIVPLGVIPRTAANKLLLVVPDYSVFSSTVVLPTLTYAGSAWDVTQVSDADGKNVNVTDITRENSANLAWPLVITAVRQVATSPVKLQNNELMPQAVKRMAVTAGISQTSCTTDTVAYYNASKEGRHVMAILADVDGLLYAKVEKSTGDGFVILELEPPCKFMIETPKGPALKYLYFTKGLKNLCRGTVLGALACTVRLHAGSATEVASNSAILSLCAFSVDPEATYKDYLDNGGTPIGNCVKMLTTHTGTGLALTAKPDASIDQESFGGASCCIYCRCHIEHPGASGVCKFKGKFVQIPLCGVPDPVGFCIRNVICSVCNMWQGYGCPCASLREVSLHANDDCFLNRVRGASGVARLVPQGIGVQPDVVLRAFDICNSKVAGFGLHLKNNCCRYQELDSEGNKLDSYFVVKRHTEENYALEQRCYDKLKDCDVVARHDFFKFKVEGVMTPHISRQRLTKYTMADLVYSLRHFDNNNCEILKEILVMRGCCDEEFFTKKDWFDPVETPELISVYHKLGETVRNAVLSANKMADAMVKAGLVGVLTLDNQDLNGKWYDFGDFIEAPPGTGVAVMDTYYSLAMPVYTMTNMLAAECHVDGDLTKPKRVWDLCVYDYTQFKYSLFQKYFKYWDMQYHPNCVACPDDRCILHCANFNILFSMVIPNTSFGPLVQKVYVDGVPFVVSTGYHYRELGVVINQDIKVHSQRLSLKDLLVYAADPAMHIAASHALADKRTVCMSVAAMTTGVTFQTVKPGQFNEDFYKFAVKCGFFKEGSSISFKHFFYAQDGNAAISDYDYYRYNLPTMCDIKQLLFSLEVVDRYFDCYEGGCLQASQVVVANYDKSAGFPFNKFGKARLYYESLSYEDQDELFAYTKRNVLPTVTQMNLKYAISAKNRARTVAGVSIASTMTNRQFHQKILKSIAAARGASVVIGTTKFYGGWNRMLRTLCDGVEKPHLMGWDYPKCDRAMPNLLRIFASLILARKHSTCCNTSERFYRLANECAQVLSEIVLCGGGFYVKPGGTSSGDSTTAYANSVFNICQAVSANLNTFLSRDGNKIYNSYVQGLQR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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR032505
Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR036333 NSP10_sf
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR037227 EndoU-like
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR038083 R1a/1ab
IPR009466 NSP11
IPR038400 Nsp3_coronavir_sf
IPR042570 NAR_sf
IPR024375 Nsp3_coronavir
IPR014829 NSP8
IPR042515 Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR014827 Viral_protease
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR036499 NSP9_sf
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IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
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SUPFAM
Gene 3D
ProteinModelPortal
PDB
6M71
E-value=0.0 Score=1441 Identity=72.21%
Cov(Q)=13.37% Cov(P)=98.94%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0016021 C:integral component of membrane
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GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
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Subcellular Location
From MSLVP
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6973
Number of predicted TMHs:
14
Exp number of AAs in TMHs:
396.73554
Exp number, first 60 AAs:
0
Total prob of N-in:
0.00017
outside
1 - 2086
TMhelix
2087 - 2109
inside
2110 - 2121
TMhelix
2122 - 2144
outside
2145 - 2210
TMhelix
2211 - 2233
inside
2234 - 2237
TMhelix
2238 - 2260
outside
2261 - 2928
TMhelix
2929 - 2951
inside
2952 - 2962
TMhelix
2963 - 2985
outside
2986 - 3011
TMhelix
3012 - 3034
inside
3035 - 3463
TMhelix
3464 - 3486
outside
3487 - 3489
TMhelix
3490 - 3512
inside
3513 - 3518
TMhelix
3519 - 3538
outside
3539 - 3560
TMhelix
3561 - 3583
inside
3584 - 3589
TMhelix
3590 - 3612
outside
3613 - 3626
TMhelix
3627 - 3649
inside
3650 - 3660
TMhelix
3661 - 3683
outside
3684 - 6973
