Strain
Avian_KY073748
(Region: Kenya; Strain: 229E-related bat coronavirus strain BtKY229E-8, complete genome.; Date: 10-Jun)
Gene
ORF1ab protein
Description
Annotated in NCBI,
ORF1ab protein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGCCTGCAACCGTGTGACACTTGCTGTGGCAAGTGATACTGAAATTTCTGCATCTGGTTGTTCTACCATTGCGCAAGCCGTCCGCCGCTATAGCGAGGCCGCTAGCAATGGGTTTAGAGCATGCCGATTTGTTTCATTTGGCTTGCACGATTGTGTTGTTGGCATTGCAGACGATGATTATGTTATGGGTCTGCATGGTAACCAAACATTGTTCTGCAACATAATGAAATTCTCTGACCGTCCCTTTATGCTTAGAGGGTGGTTGGTGTTTTCCAACTCAAATTACCTTTTGGAGGAATTTGATGTTGTCTTCGGCAAGCGTGGTGGCGGTAATGTGACTTACACTGACCAATACCTCTGCGGAGCCGATGGCAAACCTGTCATAAATGAGGATTTGTGGCAGTTTGTCGACTACTTCGGTGAAAATGAAGAAATTGTCATCAATGGTCATACTTATGTTTGTGCCTGGCTTACCAAGCGTAAACCATTAGAGTATAAACGTCAGAACAACCTTGCCATTGAAGAGATTGAGTATGTGCGTGGTGATGCTTTGCATACGTTGCGCAATGGTTCTGTTCTTGAAACGGCTAAGGAAGTGAAGACATCTAGTAAAGTTGTGTTAAGTGATGAACTTGACAAACTTTACAAAGTTTTTGGTTCTCCTGTTATGACCAATGGTTCTAACATCTTAGAGGCTATTACCAAACCTGTGTTCATTAGTGCATTGGTTCAATGTACTTGTGGCAAGAAATCATGGTCTGTTGGTGATTGGACCGGCTTTAAATCCTCTTGTTGCAACGTTCTTAGCAAGAAGCTTTGTGTTGTACCTGGTAATGTGAAACCTGGTGATGCTGTGATTACAACTCAGCAAGCTGGTGCTGGTATTAAGTACTTTTGTGGTATGACTCTCAAGTTTGTTGCAAACATTGAAGGTGTCTCTGTTTGGCGAGCAATTGCTGTTCAGAGTGTTGATTGCTTCGTTGCTTCTGCCACTTTTGTGGAAGAAGACCATGCTAACAGAATGGATACATTCTGCTTCAATGTGCGCAATAGTATAACTGATGAGTGCCGATTGGCCATGTTAGGTGCTGAATTGACTAGTAATGCCAGAAAACAAGTTGCTGCAGGTGTCATTGACATTAGTACCGGTTGGTTTGATGTTTATGATGACATCTTCTCTGAAAACAAACCCTGGTTTGTGCGCAAGGCTGAAGATATCTTCGGTACTTGTTGGTCTGCTCTTGTTTCTGTGCTTAAACAGCTTAAAGTTACTACAGGTGAACTCATGAAATTTGTTAAGACCATTTGTAGTTCAGCTGTTGCTGTTGTGAATGGTACTATTCAAATTGTTGCTAGTGTACCTGAGAAGTTTTTGAATGCATTTGATGTGTTCATCAAAGCTGTTCAGACTGTCTTTGCTTGTGCTGTTGAAACCAGTACTATTGCTGGTAAAGCTTTTGACAAAGTCTCTGACTATCTCTTGCTTGATAATGCCCTTGTCAAATTTGTCACCACTAAGCTTAAAGGCGTTCGTGAAAGTGGTCTTAACAAAGTTAAGTATGCAACTGCTGTTGTTGGTTCTACCGAAGATGTTAAATCATCTAGAGTGGAACGCAGCACGGCAGTTCTGGCAATTGCAAACAATTACCCTAAACTTTCTGATGAAGGGTATACTGCTGTGGTTGACGGGATAGCGTATTTTGTTAGTGATGGCTACTTTCGTCTTATGGCCAGTCCAACTAGTGTGTTGACTACTGCTGTCTACAAACCATTATTCACTTTTAATGTGAATGTTATGGGCACTAGACCTGAAAAGGTCCCAACTACTGTGACTTGTGAAGATTTAGAGTCTGCTGTCTTAGTTGTTAATGACAAAATTACTGAGTTCCAATTGGATTACAGTGTTGATGTCTTTGACAATGAAATAGTCGTCAAGCCCAATATCAGCCTATGTGCTCCACTTTATGTGAGAGACTATGTTGATAAATGGGATGACTTCTGCAGTCGATATAGTAATGAGTCTTGGTTTGATGAAGATTACAGAGCTTTTATTAGCGTCTCGGATATTACTGATGCTGATGTTAAGGCTGCAGAGTCTAAAGCCTTTGTAGACTCAATTATTCCACCTTGTCCTTCTATTTTGAAAATAATAGATGGAGGCAAGATATGGAATGGAATTATTAAGGCTATTAGCTCTGTTTTAGACTGGCTTAAATCTTTGAAATTAACTCTTACACCAGAGGGTCTTTTTGGTACTTGCGCTAAGCGTTTTAAGCGGTTTCTTGCTGCTTTGTTGGATGCTTACAACGCATTTTTGGACACTGTGGTTTCCACTGTTAAGATCGGTGGCAAAGCTTTTAAAAAGTATGCATTTGATAAACCTTATATCGTGATACGTGATATCGTGTGTAAGGTTGAGCATAAAACAGATGCTGAATGGATTGAGCTTATGCCACGCAATGACAGAATTAAGTCTTTTAGTACTTTTGAAAATGCATACCTACCTATTTCTGACCCAACACATTTTGATATTGAAGAAGTTGAACTTCTTGATACAGAATTTGTTGAACCAGGTTGTGGCGGTATCTTGGTATTGGTAGATGAGCATGTCTTTTATAAAAAGGATGACATCTATTACCCATCAAATGGTACTAAAATACTACCGGTCGCGTTTACTAAAGCTGCCGGTGGTAAAGTTTCTTTTTCAGATGCTGTTGAAGTTAAAGACATTGCACCTGTTTATAGGGTTAAACTTTGCTTCGAGTTTGAGGATGCGAAACTTGTAGATGTTTGTGAGAAGGCAATTGGCAAGAAAATTAAACATGAGGGTGACTGGGATAGTTTTTGTAAAACTATTCAATCAGCACTTTCTGTTGTTTCAGGCTATGTAAACCTACCTACATATTACATCTATGATGAGGAAGGCGGTAATGATTTGAGTTTGCCTGTTATGATTTCTGAATGGCCTCTCTCCGAATCAGATAAGGAAGGTGAGGTTCAACAAGCTCAACAAGAAGACACTGTAGTGCCTGATGTCATTGAGACTATTGTTGAGCAAGTTGAAGAAGTCAATGGTAGTTTTAATATTGAGGCAGTGGATGTTAAACACGAAGTGAGTCCCTTTGAAATGCCATTTGAAGAGTTAAATGGTTTAAAGGTACTCAACCAATTGGATAACAACTGCTGGGTTAATTCGGTTATGTTACAATTACAGTTAACTGGCATACTTGATGAAGATTATGCTATGCAGTTCTTTAGACTGGGCCGTGTTGCCAAGATGGTGGAGCGTTGTTACAATGCTGAGCAATGTATACGCGGTGCCATGGGTGATGTTGGCCTTTGTTTGTATAGGCTGCTTAAAGAGATGCACACTGGTTTTATGGTTATGGATTATAAATGTAGTTGTACCAGTGGTAGACTTGAAGAATCAGGATCTGTTTTGTTTTGTACGCCTACTAAAAAGGCGTTTCCATATGGTACTTGTCTAAATTGTAATGCACCTCGTATGTGTACAATTAGGCAGTTGCAAGGTACAATAATTTTTGTGCAACAAAGACCAGAACCTGTTAACCCTAGTGCTTTTGTTGTTAAACCAATCTGTGCATCGGTGTTTCGTGGAGCTGTGTCTTGTGGTCACTATCAAACAAACATTTACGCACAAAAACTGTGTGTTGATGGTTTTGGTGTTAACAAGATTCAACCATGGACTAATGATGCACTTAATACTATTTGTATTAAGGATGCAGATTACAGTGCAAAAGTTGAAAAACCTGTTGCTCCGCCAAAAGCTACAGTTGAGACGCCACCTAAGGAAGAACCTGTTGTCAAAGTGAAGTTGAACTCTTTCCTTGTGTACAACAATGTTACTTTCTATCAGGGTGATGTTGACGCTGTTGTTAATGGTGTTGACTTTGATTTCATTGTTAATGCTGCTAACGAAAACCTCGCTCATGGTGGTGGACTTGCCAAAGCTTTGGATGTGTATACTAAAGGTAAACTTCAACGTTTGTCTAAAGAATACATCGGGTCAAATGGCAAAGTGAAAGTTGGCACTGGAGCTATGATTGAGTGTGATGACTTGAAAGTTTTTAATGTTGTTGGCCCACGTAAAGGTAAGCACGAGCGTGACTTACTCGTAAAAGCGTACAACACCATTAACAACGAACAAGGCATACCTTTAACACCAATTTTGAGCTGCGGTATTTTCGGTGTCAAGCTTGAAACTTCGTTAGAAGTTTTGCTTGATGTCTGTAATACAAAAGAAGTCAAAGTCTTTGTTTATACAGATACAGAGGTTTGCAAGGTTAAGGAGTTTGTTTCTAGTTTGAGTACTCAAAAAGTTGAGCAACCCAAAGTGGAACCAACACAATTGCCTGTAGCTAAAGTTGTGCCTAAACCTTACAAGGTAGATGGTAATTTTAGCTATTTTACAGAGGACTTATTGTGCGTCGCTGATGACAAACCTATTGTTCTGTTTACTGACTCTGTGCTTACTTTGGATGACCATGGTTTAACCTTAAACAATGCACTTAATGGAGCGCTTAGTGCTGCTATTAAGGATTGTATTGATACAAACAAGGCTATACCATCTGGTAATCTTATTAAGTTTGATATAGGTTCTGTTGTTGTTTACATGTGTGTCGTGCCATCAGAACAAGACAAACACTTAGATAAGAATGTCCAACGGTGCACACGTAAGTTGAATAGACTTATGTGTGATATAGTTTGTACTATACCTGCCGAGCATGTCTTACCATTAGTGTTGTCTAGTTTGACATGTAATGTTTCTTTTGTAGGTGAACTTAAAGCTGTTGAAGCTAAAGTTATAACTATAAAGGTGACAGAGGATGGCGTTAATGTTCACGATGTGACTGTAACAACAGACAAGTCATTTGAACAACAAGTTGGTGTTATCGCTGATAAAGATAAAGATCTTTCTGGTGCAGTACCAAGTGATCTTAACACATCTGAATTGCTTACTATAGCAATAGATGTTGA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Protein
MACNRVTLAVASDTEISASGCSTIAQAVRRYSEAASNGFRACRFVSFGLHDCVVGIADDDYVMGLHGNQTLFCNIMKFSDRPFMLRGWLVFSNSNYLLEEFDVVFGKRGGGNVTYTDQYLCGADGKPVINEDLWQFVDYFGENEEIVINGHTYVCAWLTKRKPLEYKRQNNLAIEEIEYVRGDALHTLRNGSVLETAKEVKTSSKVVLSDELDKLYKVFGSPVMTNGSNILEAITKPVFISALVQCTCGKKSWSVGDWTGFKSSCCNVLSKKLCVVPGNVKPGDAVITTQQAGAGIKYFCGMTLKFVANIEGVSVWRAIAVQSVDCFVASATFVEEDHANRMDTFCFNVRNSITDECRLAMLGAELTSNARKQVAAGVIDISTGWFDVYDDIFSENKPWFVRKAEDIFGTCWSALVSVLKQLKVTTGELMKFVKTICSSAVAVVNGTIQIVASVPEKFLNAFDVFIKAVQTVFACAVETSTIAGKAFDKVSDYLLLDNALVKFVTTKLKGVRESGLNKVKYATAVVGSTEDVKSSRVERSTAVLAIANNYPKLSDEGYTAVVDGIAYFVSDGYFRLMASPTSVLTTAVYKPLFTFNVNVMGTRPEKVPTTVTCEDLESAVLVVNDKITEFQLDYSVDVFDNEIVVKPNISLCAPLYVRDYVDKWDDFCSRYSNESWFDEDYRAFISVSDITDADVKAAESKAFVDSIIPPCPSILKIIDGGKIWNGIIKAISSVLDWLKSLKLTLTPEGLFGTCAKRFKRFLAALLDAYNAFLDTVVSTVKIGGKAFKKYAFDKPYIVIRDIVCKVEHKTDAEWIELMPRNDRIKSFSTFENAYLPISDPTHFDIEEVELLDTEFVEPGCGGILVLVDEHVFYKKDDIYYPSNGTKILPVAFTKAAGGKVSFSDAVEVKDIAPVYRVKLCFEFEDAKLVDVCEKAIGKKIKHEGDWDSFCKTIQSALSVVSGYVNLPTYYIYDEEGGNDLSLPVMISEWPLSESDKEGEVQQAQQEDTVVPDVIETIVEQVEEVNGSFNIEAVDVKHEVSPFEMPFEELNGLKVLNQLDNNCWVNSVMLQLQLTGILDEDYAMQFFRLGRVAKMVERCYNAEQCIRGAMGDVGLCLYRLLKEMHTGFMVMDYKCSCTSGRLEESGSVLFCTPTKKAFPYGTCLNCNAPRMCTIRQLQGTIIFVQQRPEPVNPSAFVVKPICASVFRGAVSCGHYQTNIYAQKLCVDGFGVNKIQPWTNDALNTICIKDADYSAKVEKPVAPPKATVETPPKEEPVVKVKLNSFLVYNNVTFYQGDVDAVVNGVDFDFIVNAANENLAHGGGLAKALDVYTKGKLQRLSKEYIGSNGKVKVGTGAMIECDDLKVFNVVGPRKGKHERDLLVKAYNTINNEQGIPLTPILSCGIFGVKLETSLEVLLDVCNTKEVKVFVYTDTEVCKVKEFVSSLSTQKVEQPKVEPTQLPVAKVVPKPYKVDGNFSYFTEDLLCVADDKPIVLFTDSVLTLDDHGLTLNNALNGALSAAIKDCIDTNKAIPSGNLIKFDIGSVVVYMCVVPSEQDKHLDKNVQRCTRKLNRLMCDIVCTIPAEHVLPLVLSSLTCNVSFVGELKAVEAKVITIKVTEDGVNVHDVTVTTDKSFEQQVGVIADKDKDLSGAVPSDLNTSELLTIAIDVDWVAFYGFKDAVTFATVDHSAFAYESAVVNGIRVLKTSDNNCWVNAVCISLQYLKPHFISQGLDAAWNKFVLGDVEIFVAFVYYVAGLVKGAKGDAEDTLNKLSKYLANEAQVQLEHYSSCVECEATFKNSVASINSAIVCASVKRDGVQVGYCAHGIKYYSRVRSVSGRAIIVSVEQLEPCAQSRLLSGVAYTAFSGPADNGHYTVYDTAKKSMYDGDRFVKHDLSLLSVTSVVMVGGYVASVVETVKPKPVINQLDEKAQKFFDFGDFLVHNFVTFFTWLLSMFTLCKTAVTTGNVKIMAKAPQRTGVVIKRSLKYNLKASAAVLKSKWWLLAKFMKLMLLIYTLYSIVLLGVCFGPFNDYLCSETVNGYAKSNFVKDDYCDGSLGCKMCLFGYQELSQFSHLDVVWKHITDPLFSNMQPFIVMVLLLIFGDNYLRCFLLYFVAQMISTVGVFLGYKETNWFLHFVPFDVICDELLVTVIVIKVISFVRHVLFGCENPDCIACSKSARLKRFPVNTIVNGVQRSFYVNANGGSKFCKKHRFFCVDCDSYGYGNTFITPEVSRELGNITKTNVQPTGPAYVMIDKVEFENGFYRLYFGETFWRYNFDITESKYSCKEVLKNCNVLDDFVVFNNNGTNVTQVKNASVYFSQLLCRPIKLVDSELLSTLSVDFNGVLHKAYIDVLRNSFGKDLNANMSLAECKSALGLSISDHDFTSAISNAHRCDVLLSDLSFNNFVSSYAKPEEKLSAYDLACCMRAGAKVVNANVLTKDQTPIVWHAKDFNSLSAEGRKYIVKTSKAKGLTFLLTINENQAVTQIPATSIVAKQGAGESGRLSTWFWLFCGLVCLIQFYLCFFMPYFMYDTVRSFEGYDFKYIENGQLKNFEAPLKCVRNVFDNFDEWHYAKFGSTPLNKQSCPIVVGVSEIVNTVAGIPSNVYLVGKTLVFTLQAAFGNAGVCYDIFGVTMPEKCIFTSACTRLEGLGGNNVYCYNTDLMEGSLPYSSIQANAYYKYDNGNFIKLPEVIAQGFGFRTVRTIATKYCRVGECVDSNAGVCFGFDKWFVNDGRVDNGYVCGTGLWNLVFNILSMFSSSFSVAAMSGQILFNCALGAFVIFCCFLVTKFRRMFGDLSVGVCTVVMAVLLNNVSYIVTQNLVTMIAYAVLYFFATRSLRYAWIWCAAYLIAYISFAPWWLCVWYFLAMLTGLLPSLLKLKVSTNLFEGDKFVGTFESAAAGTFVIDMRSYEKLANSISPEKLKSYAASYNRYKYYSGNANEADYRCACYAYLAKAMLDFSRDHSDILYTPPTVSYGSTLQAGLRKMAQPSGIVEKCVVRVCYGNTVLNGLWLGDIVYCPRHVIASNTTSAIDYDHEYSIMRLHNFSITSGTAFLGVVGATMHGATLKIKVSQTNMHTPRHSFRTLKSGEGFNILACYDGCAQGVFGVNMRTNWTIRGSFINGACGSPGYNLKNGEVEFVYMHQIELGSGSHVGSSFDGVMYGGFEDQPNLQVESANQMLTVNVVAFLYAAILNGCTWWLKGDKLSVEHYNEWAQTNGFTAMNGEDAFSILAAKTGVCVERLLHAIQVLNNGFGGKQILGYSSLNDEFSINEVVKQMFGVNLQSGKTTSMFKSLSLFAGFFIMFWAELFVYTTTVWVNPGFLTPFMILLVALSLCLTSVVKHKVLFLQVFLLPSIIVAAIQNCAWDYHVTKVLAEKFDYNVSVMQMDIQGFVNIFICLFVALLHTWRFAKERCTHWCTYLFSLLAVLYTALYSYDYVSLLVMLLCAISNEWYIGAIIFRICRFGVAFLPVEHVSYFGGVKTVLLFYMLLGFVSCMYYGLLYWINRFCKCTLGVYDFCVSPAEFKYMVANGLNAPNGPFDALFLSFKLMGIGGPRTIKVSTVQSKLTDLKCTNVVLMGILSNMNIASNTKEWAYCVEMHNKINLCDDPETAQELLLALLAFFLSKHSDFGLGDLVDSYFENDAILQSVASSFVGMPSFVAYETARQEYENAVANGSSPQIIKQLKKAMNVAKAEFDRESSVQKKINRMAEQAAAAMYKEARAVNRKSKVVSAMHSLLFGMLRRLDMSSVDTILNMARNGVVPLSVIPATSASKLVVVVPDHESFAKMMVDGFVHYAGVVWTLQEVKDNDGKNVHLKDVTKENQETLVWPLILTCERVVKLQNNEIMPGKMKVKATKAEGDGGITSEGNALYNNEGGRAFMYAYVTTKPDMKYVKWEHDSGVVTVELEPPCKFVVDTPTGPQIKYLYFVKNLNNLRRGAVLGYIGATVRLQAGKQTEFVSNSHLLTHCSFAVDPAAAYLDAVKQGAKPVGNCVKMLTNGSGSGQAITSTIDSNTIQDTYGGASVCIYCRAHVAHPTMDGFCQYKGKWVQVPIGTNDPIRFCLENTVCKVCGCWLNHGCTCDRTAIQSFDNSYLNRVRGSSAARLEPCNGTDIDYCVRAFDVYNKDASFIGKNLKSNCVRFKNADKDDAFYIVKRCIKSVMDHEQSMYNLLKGCNAVAKHDFFTWHEGRTIYGNVSRQDLTKYTMMDLCFALRNFDEKDCEVLKEILVLTGCCGTDYFEMKNWFDPVENEDIHRVYAALGKVVANAMLKCVAFCDEMVLKGVVGVLTLDNQDLNGNFYDFGDFVLCPPGMGIPYCTSYYSYMMPVMGMTNCLASECFMKSDIFGQDFKTYDLLKYDFTEHKEVLFNKYFKYWGQDYHPDCVDCYDEMCILHCSNFNTLFATTIPNTAFGPLCRKVFIDGVPVVATAGYHFKQLGLVWNKDVNTHSTRLTITELLQFVTDPALIVASSPALVDKRTVCFSVAALSTGLTSQTVKPGHFNKEFYDFLRSQGFFDEGSELTLKHFFFTQKGDAAIKDFDYYRYNRPTMLDIGQARVAYQVASRYFDCYEGGCITSREVVVTNLNKSAGWPLNKFGKAGLYYESISYEEQDAMFALTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLATMTTRQFHQKCLKSIVATRNATVVIGTTKFYGGWDNMLKNLMADVDDPKLMGWDYPKCDRAMPSMIRMLSAMILGSKHVTCCTASDKFYRLSNELAQVLTEVVYSNGGFYFKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSSNINRILSVNSSNCNNLNVRKLQKQLYDNCYRNSNVDESFVDDFYGYLQKHFSMMILSDDGVVCYNKTYAELGYIADISAFKATLYYQNSVFMSTAKCWTEEDLSIGPHEFCSQHTMQIVDENGKYYLPYPDPSRIISAGVFVDDITKTDAVILLERYVSLAIDAYPLSKHPKPEYRKVFYALLDWVKHLNKTLNEGVLESFSVTLLDEQESKFWDESFYASMYEK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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR036499
NSP9_sf
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR042515 Nsp15_N
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014827 Viral_protease
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR014822 NSP9
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829 NSP8
IPR037227 EndoU-like
IPR036333 NSP10_sf
IPR014828 NSP7
IPR027352 CV_ZBD
IPR037204 NSP7_sf
IPR008740 Peptidase_C30
IPR009466 NSP11
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1160 Identity=59.16%
Cov(Q)=13.71% Cov(P)=97.17%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008168 F:methyltransferase activity
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6767
Number of predicted TMHs:
18
Exp number of AAs in TMHs:
434.067199999994
Exp number, first 60 AAs:
0.01112
Total prob of N-in:
0.00223
outside
1 - 1936
TMhelix
1937 - 1959
inside
1960 - 1996
TMhelix
1997 - 2019
outside
2020 - 2076
TMhelix
2077 - 2099
inside
2100 - 2105
TMhelix
2106 - 2124
outside
2125 - 2502
TMhelix
2503 - 2525
inside
2526 - 2733
TMhelix
2734 - 2756
outside
2757 - 2759
TMhelix
2760 - 2782
inside
2783 - 2802
TMhelix
2803 - 2825
outside
2826 - 2834
TMhelix
2835 - 2857
inside
2858 - 3036
TMhelix
3037 - 3059
outside
3060 - 3171
TMhelix
3172 - 3194
inside
3195 - 3287
TMhelix
3288 - 3310
outside
3311 - 3313
TMhelix
3314 - 3333
inside
3334 - 3337
TMhelix
3338 - 3355
outside
3356 - 3374
TMhelix
3375 - 3397
inside
3398 - 3409
TMhelix
3410 - 3428
outside
3429 - 3432
TMhelix
3433 - 3455
inside
3456 - 3475
TMhelix
3476 - 3498
outside
3499 - 6767
