Strain
Bat_KY770850
(Region: China; Strain: Bat coronavirus isolate Anlong-43, complete genome.; Date: 2013)
Gene
orf1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
orf1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
GGGCTTACAGTCAGCTACATTGGAGACTTTGATGGTGTTAGCTGTTGGCGTGTTGTTGGTGTGCAAGCCTTTAATGGGTTTGTCGCATCATCAACATTTAGTGAGCAGCTTCACAACTATAGTCTCGATGCCTGCTCCTACACTGCAAATACTCGGCTTTTCAAATTGTTGAAGCTTGCTGTCCTCAGTGGTAACACTGTTGATGAGGTTACAAGCGCCGTTGTTGCAGGTGTTGTTGACATTAGCAGCAATGTCTACAATTTTGTGGATGCTGTTCTTGAACAGAAACCGTGGTTTGTTCGCAAGTTGGACAAGCTTTGTGAGACTGCATGGAGTTTGCTCTGTGATGCGCTTAAGAGTTTGTCTATTCGGGCTTCAGACCTTTTGGATTTTGTCAAGGCAATGTCAGTTGCTGTTGTTACAGTGGTGGAAGGCAAGCTGACGCTTATTGCTGAGGTGCCACAAGCTTTTTCAAATGTCTATGAGACATTTAAGCTTGCACTTGAGGGCATCTTTGATGCGTGTGCTAACACTATTACACTTGCTGGTAAGGCTTTTAGATCTGTCTTTGACTACATTTTGTTTGACAATTGTATTGTTAAGCTTTCTACTGTCAAGGCTGTTGGTCTTAAGCAAATGGGTATTAAGAATATTACCTATGCTAGTGTAGTGTTGGGTCCTACACAGTCCGTTAAAACTGACCGTATAGAGATCTCTAGTGCCAAACTTACGCCTGTGCTGGAAAAAGTACCATTGAAGAGAGATGGCGTTGCTGTTCTCCTTGATGGTGTCGCTTTCTTTTGCAGTGATGGTTATTACAGGCTTATGTCTGATAACGATTGCGTGCTTGAAGAACCAGTTTTTAAGCTTGCCCCTGTGACTGAAGTCAAGCCAGTTGTTGAGTGCCCATCTCTGTTTGTAGGTGTTGATGGTGGTGCGATATGGCGTACAGTCATTGCCACTATTGATAGTGTTGCAGACTTTGTGAGGGGTCTCAAGATACAGTTTGGTATTGATGGCTTTGTTGGCACTTGTGCTAAGCGCTTCAGAAAGTTTTTAAAAACTCTTCTTACATTGTATAATGATTTGGCCAATAGCATTAGGCGTACTGTTGTGTTGGCTGGTGTTACACTGCAATACTACGCCTTTGAGAAACCTGCATTGGCTATTAATGGTGTCCTGCATTTTGTTAAGCGTACTAAGGCTAAGGACCTTGGTGTTCCATGCGAGGCGGGTGTGGAGGATTTTAACCTACTGGAAGGTGGTGATTATCCTTTTAAGCCTACAGCCGTGGAGTTGGCTTATGAAATGGAGTTAATGGAATCAGATTTTGAGGAGCCCTGTGAAGGCGGTGTTCTCCGTATCTGCGATGATTACGCATGGTATATGGATGACGACCGCTTTTACCCATATGGTGACAGTGGTGTTCTACCCATCTGCTACAAACTTGGTGGTGGCAGAGTAGATAATCAAGTCACCTTTGGTCAGGATGAAGTCAAGGAAATACCACCTCTCAACAATGTCAAGCTCGTTTTTGAGTTTGAAAATGACATTATCAGTGAGGCCTGTAAGAAGGCCATTGGTAAGCGTATTAGTTTTGAGGGTGATTGGAGTGACCTTTGTGCTATGATAGACATAGCTATGAAGGCTTTGTCTGAGCACATAGAGGTGCCTCAATATTACATCTATGATGAAGAAGGTGGTAATGACTTGGACCTCCCAGTTATGATTTCAGAATGGCCATGTAATGTCGATAGCCAGGAGCTTCATGCGCAAGAGTGCATTGTTCCAGATATTGATTTAGAAACCTCTACAACATTTGAAGGCGTTGATGTTTGCAACGCCAAAGTCTCAAGTGTTAAGCTTTTGAAAGCCGTTTGTGTTGAATCTAAGACTGTGCACCCTAGTGGTGTTGTTAGTCTTGAGGTTCCTGTTACTACAACCACTGACATAAAGCCTATGACAGTATGTAATGCTGTTGTTAAGGATGTTAGTGTTTGTAGAGCTGTTGCACATCAGCCTGTTGTTAAGGTTGTGGCAGATCAAGCTAAAGAGGTTGAGGATGCCTTGGCATACATGAAACCAAAGGACACTAAGGTTAAGGTGGACAAGTCAATTTTTGACTATCCTAGTACAGTCTTTAAGGGTGTACGTGTTCTTAAGCAGGTTGCCAACAACTGTTGGTTGACAAGTGCCGCTTACCAGCTGCAGTTGGCCAACTGTTATGATTCAGATGACTTTAATCTTTTCAAGGTTGGTCGTGTGAGTCACTTTGTGCAACGCTGTTATGAGGCTGTTGGTGCTGTTAAGGGTAGTTTGGGTGATGTTACTCAGCTGCTCGAGCGCCTCTGTAAGGACATCAAATCACTTAAAGTGACATGTAATGTTGCTTGTGATTGTGGTGCCACAGTAAAGGTGCTTGAAGGTTGTGTTTTTCACTTCATGCCCGTTGCTGATGCATTTCCATATGGTGTGTGTGGTTCCTGTAAGCAGGTTGCTATGCATACCATTAAGAGCATTGAAGGCACCGGCTTCTTTTGTCAGGAACCAGCACCTTTTGACATTACGAAGTCATTGTGTTCTATTGCTGCCACTGCCACCTATGTTGGCAAACAAAATGGTGGCCATTATAGGACAAATGACTTTGTGCATGGTAACGCCGTCGATGGTTCTGGTGTTACCCCTCTAAATTGCACTGCACCTGTTACTAACTGTCTTGTTGTGAATGTTAACTATGAAGCCCCCACAGCACCTGTTGTGAAACTCAGCCCCTTTAAGGTTGTTGACAATGTTGAATTCTATAAGGGCGAGTTTTCTGAGCTCGCACAATTGGAATTTGATTTTGTTGTTAATGCAGCTAATGAGAACCTGAGTCACGGTGGTGGTGTTGCTAAAGCTATAGATGATTACACTAAAGGACAGTTACAGTTGCTTTCAAAGACATATGTTAAGAGCAATGGTCGTGTGCGCACTGGTTCTGGTGCCATGATCAAGTGTAAAGCATTTGATGTCTTGAACGTAGTTGGGCCAAAGAAAGGTGGCAAAAGTTGGCAGAAACTCTTGAAGTTTGCCTACGAAACCATCTTTAAAAATGATGGTGTGCCACTTACCCCACTTCTTAGTTGTGGTATCTTTGGTGTCTCACTTGAAGACTCATTAAAAACACTTCTTGAAACATGTGGTGATAGGCAAGTAAAGTGCTTTGTCTACACTAGTGAGGAACAGCAGAAAGTTGAAGCATTCTTCAACAGCAGTGTTGCTGTGGTTGAAGAAGTGGCAACACCATATAGGAAGGAGGGTAAATACGCCTTCTATGATTGTGGTGCTGCCGCTGTGCTGAAGCTCAAACCCGACAACATTGTCATATTCACAGACAGCAAACTAGCATTGGCTGGTGCAGGTTTGGATTTTGACGCTTGTTTAAACAAAGGTTTGTCTGCTGCTATAAAAGAGTGTATTGATGTTAATAAGGCAATACCTACTGGTAATGCCATTAAGTTTGAGTGTGACCCAACTATTTATATGGCAGTTGTTCCTCCAAAGGACACACCGGGGTTTGCAAAGAATGTTGCCAGAACATTGCGTAAGGTTTCAAAGCTTGAAGGTAAGACGTTCTGCACTGTCCCCATTAAGGAGATAATGCAGAGTGCTCTTAAAGTTTTTGACAGCTGTTCGTTTGTTGTTCAGGCTGAAGAGAAGAAACTTGTGGAAGAATGTTTTATGCCACAGAGTGTTAAGTTGACAACAACAGAGGATGGTGTTAACGTTAATACTGTAGTTGTTTCTAGCACTGCTACGTATAGTGAGCAGTTGGGTACTGTTACTAATGGTAGTACAAACCTTACTGACACTAAGCCGTCTAGTGGTGATGAAACTAAAATTTTGAATGTGGCACCAGCAGTTGATTGGGTTGCTCATTATGGGTTCCATGATGCAGCAGCTTTTGTTACGTACGACCACAAGCCTTTTGCTTACGAAAGTGATATGCTTATGGGTAAGCGTACTTTAAAACAGACTGATAATAACTGCTGGATTAATGCTGCCTGTCTAGCACTGCAGTATTTGAAACCCAAGTTTCGATATCCTGGTTGGGAAGCTGCCTGGAATAAATTTGTTACAGGTGCTTGTGAAGAATTTGTGCATCTCTTATACCATATTGCGCAAGCTCGCAAGGGTGATTTAGGGGATGCAGAAGAATTGCTTGGCAGGTTGGATAAGTTCATCGTGCCAGGTGGTACAGTAGTTTTGGAGCGCCACGTTGACTGTTCTGTTTGTAAGACAACGGAGCGTGTCGTTAAGTCTAGCGTTGTATCTGCTAGTCTTAAGCGTGAAGGCGTTGATGACGGCGCTTGTTGCAACCACGGTAGTGCTTATTCACTGCGTGTTAAGAGTGTAAAGGGCGACGTTATCGTAACTACTTGTGAAAAACCACAATGCTACAGGAATTCAGAAGTTCTCTGCGGTGAAGCATATGTTGCATTTACTGGTCCTGTGGATGGTGGTCATTATCTGGTGTATGATAGGTCTACTGGTCAAGTTTTTGATGGTGACAGAATTGTGCCATATGAATTTGACACTTTGACGGTTTCTGCACTAGTTGTGAAAGGGGGCTATGTTTGTTCGGTGCCAAAAGCTGTTAAACTTGAGCGCGTTATGACAGATTTGGATAACGGTGCTCAAAAGTTCTTTGATTTTGGCGATTTTGTGTTACGCAATCTCGTCAGTTTCTTCTCTGTGTTATTTAGTCTATTGTTTATAGGCTATAGAGCATTGAGAAAAAGAGATCTTAAAGTTTTAGCACAGGCACCGCAGCGTACTGGTATTATACTAACGCGTAGTCTTAAGTATAATTGTAAAGCTGCCTTGAAGTTTTGGAAAACTCGAAGCTGGTATATAATGCTAATGCTGAAGCTATTGCTTTTGGCATATACATTATATGCAGCTGGCTTTATGATAGTACGCTATAGTTTCTTTAATAACTATATATGCAAAGGTTATGT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Protein
GLTVSYIGDFDGVSCWRVVGVQAFNGFVASSTFSEQLHNYSLDACSYTANTRLFKLLKLAVLSGNTVDEVTSAVVAGVVDISSNVYNFVDAVLEQKPWFVRKLDKLCETAWSLLCDALKSLSIRASDLLDFVKAMSVAVVTVVEGKLTLIAEVPQAFSNVYETFKLALEGIFDACANTITLAGKAFRSVFDYILFDNCIVKLSTVKAVGLKQMGIKNITYASVVLGPTQSVKTDRIEISSAKLTPVLEKVPLKRDGVAVLLDGVAFFCSDGYYRLMSDNDCVLEEPVFKLAPVTEVKPVVECPSLFVGVDGGAIWRTVIATIDSVADFVRGLKIQFGIDGFVGTCAKRFRKFLKTLLTLYNDLANSIRRTVVLAGVTLQYYAFEKPALAINGVLHFVKRTKAKDLGVPCEAGVEDFNLLEGGDYPFKPTAVELAYEMELMESDFEEPCEGGVLRICDDYAWYMDDDRFYPYGDSGVLPICYKLGGGRVDNQVTFGQDEVKEIPPLNNVKLVFEFENDIISEACKKAIGKRISFEGDWSDLCAMIDIAMKALSEHIEVPQYYIYDEEGGNDLDLPVMISEWPCNVDSQELHAQECIVPDIDLETSTTFEGVDVCNAKVSSVKLLKAVCVESKTVHPSGVVSLEVPVTTTTDIKPMTVCNAVVKDVSVCRAVAHQPVVKVVADQAKEVEDALAYMKPKDTKVKVDKSIFDYPSTVFKGVRVLKQVANNCWLTSAAYQLQLANCYDSDDFNLFKVGRVSHFVQRCYEAVGAVKGSLGDVTQLLERLCKDIKSLKVTCNVACDCGATVKVLEGCVFHFMPVADAFPYGVCGSCKQVAMHTIKSIEGTGFFCQEPAPFDITKSLCSIAATATYVGKQNGGHYRTNDFVHGNAVDGSGVTPLNCTAPVTNCLVVNVNYEAPTAPVVKLSPFKVVDNVEFYKGEFSELAQLEFDFVVNAANENLSHGGGVAKAIDDYTKGQLQLLSKTYVKSNGRVRTGSGAMIKCKAFDVLNVVGPKKGGKSWQKLLKFAYETIFKNDGVPLTPLLSCGIFGVSLEDSLKTLLETCGDRQVKCFVYTSEEQQKVEAFFNSSVAVVEEVATPYRKEGKYAFYDCGAAAVLKLKPDNIVIFTDSKLALAGAGLDFDACLNKGLSAAIKECIDVNKAIPTGNAIKFECDPTIYMAVVPPKDTPGFAKNVARTLRKVSKLEGKTFCTVPIKEIMQSALKVFDSCSFVVQAEEKKLVEECFMPQSVKLTTTEDGVNVNTVVVSSTATYSEQLGTVTNGSTNLTDTKPSSGDETKILNVAPAVDWVAHYGFHDAAAFVTYDHKPFAYESDMLMGKRTLKQTDNNCWINAACLALQYLKPKFRYPGWEAAWNKFVTGACEEFVHLLYHIAQARKGDLGDAEELLGRLDKFIVPGGTVVLERHVDCSVCKTTERVVKSSVVSASLKREGVDDGACCNHGSAYSLRVKSVKGDVIVTTCEKPQCYRNSEVLCGEAYVAFTGPVDGGHYLVYDRSTGQVFDGDRIVPYEFDTLTVSALVVKGGYVCSVPKAVKLERVMTDLDNGAQKFFDFGDFVLRNLVSFFSVLFSLLFIGYRALRKRDLKVLAQAPQRTGIILTRSLKYNCKAALKFWKTRSWYIMLMLKLLLLAYTLYAAGFMIVRYSFFNNYICKGYVDGYANSTFVKKDFCDGGLVCDACLHGFDQLPDFNHLNVKWDYITVPFAIKVYPSVVAILLFLLGGNYVKFMMLYVLAQYVNSCGVYFGLQAHFWPVHIIPFDVFCDEIFAIFVAVKSLLFIKHVFMGCDSPNCIACSKSARLKRVPMTTVVNGANKSFYVTANGGTKFCTKHNFFCVDCDSFGNNSTFINEHIARELGNVTKTAVKPTGPAYIEIDRVDFSNGFYRLYSGDTFWRYNFDITEGKYSCKEVLKNCNAIDDFIVYNNSGTNVTQVRNACVYLSQLMCKPIKLVDSELLASLNVDFNGALHKAFVEVLQNSFSVELDGCTTMAECKEKIGLDVADDEFVNAVTNAHRYDVLLSEVSFNNFIVSYAKPEEKLSAFDCAQCVRAGAKIVNHNVLVKEKLSVVWLAKDFQNLSAEGRKYLVKTAKVKGLNFILTLNDNAAQCSVPVVSMMSKKGAGPKRRSFFWFMWVLCALVLGTYYATSYITFGTQVSSFAGYDFKYIEHGQLREFEAGLPCVHNTFDNFMDWHFQKFGVRPRTSPSCPVVVGVGDYGRTIPGVPADVQLVGHTLVFTVKTVFGNTNLCYDTSGVVNAASCIFTSACTVLEGLGGAITYCYKNGIVEGSKLYSDLQPNAHYKFDADNYVKIPEVLARGFGMRTIRTIETTYCRVGECIASKAGICIGADRWLVYSAESGSDFVCGSSLIQLLCNAFKVFNYDFSTAALSGQMMFNAIVAGLAIMICFLVTKFKRVFGDLSYGVFTVIVTALVCNLSYFVTQNYLGLYIFSGLYYLTTRQLRYEWIWHIGYVVSYFFLAPWWLMLAYVGVLILELVPNLLKLKVSTHLFEDGHFIGSFESAASGTFVLDMRAYEKLVNSIPAERLRQYASSYNKYKYYSGSPTEVDYRLACYAHLAHAMMTFGKEQRDMLYAPPTCSFNSSLQSGLKKMAQPSGIVEPCIVRVSYNSTVLNGLWLGDTVYCPRHVLASNTTVTIDYEHAYAVMRLHNFSISAGSMYLGVISATMHGANLHIKVNQSNVQTPPHSFRTVKPGEMFNILACYDGTPAGVYSVNLRTNHTIKGSFINGACGSPGYNVVNGTVEFVYMHQIELGSGCHVGSDYSGKIYGGYEDQPSMQIEGAANLVTENVIAFLFGALLNGITWWLTPNRVSVEAFNDWASVSGYTPLQSADGFSMLAAKTGVEVERLLASIQKYASGFGGRNILGYSTLTDDFTLSEVVKQMFGVNLQSSKKATCFKSLMLVGGFFAMFWGEFLMYSSVMWVHPAIVTPILLGLGCVSMFLSCFIKHKMMFLQTFLLPSIIVVAASNFFWDYFVTQLLIQYFDYTASLFSLDIQGLLNITMCLFVMFLHTYRFVGSGTNAIAYVASLWGSAYTYLMGGDPMYCAIMVLCSLSSEWYVGAVCYKLALRLAPFVNPLVVTIFGQSKVIVFVYLALGYCTCVYWGFLYWFNRFFKLTLGEYDFKVSPAEFKYMVANNLSAPRGPFESLALSLRLVGVGGQRTIRVSTVQSKLTDLKCANVVLLGCLSSMNIASNSKDWEYCVTLHNKINLCDDTEKAHEMLLALLAFFLSKQQAFGVDGLVDSYFDNNSMLQSVANTYVNLPSFVAYETARQNYEDAVNNGSSAQIIKQMRRAMHLAKAEYEREVSVQKKIERMAENAAAQMYKEARAENRKSKIIGSMHALLFGMLRKLDMSSVDNILSLAKNGVVPLSIIPATSATKLCIVCPDHEAYTKIIYSQCVHYAGVVWNIVDVKDNDGKPVHQKEIVKANEETLSWPLSINCERVVKLQNNEIIPNGKLKQCAVKAEGDGFSCEGKALYNNEGGKTFMYAFLADKPDLKVVKWEFDGGCNVIELEEPRRFAVETGSGTQIKYLYFVKNLNTLRRGAVLGFIGATVRVQAGKQTEQASNSPLLTMCAFAVDPAKCYLDAVKSGVKPVGNCIKMLSNGSGTGQAITNGVESNTNQDTYGGASVCLYCRAHVEHPSMDGFCRLKGKYVQVPIGTLDPIRYCLENTVCKVCACWLNNGCQCDRTSVQSLDTGYLNRVRGSSDARLEPLNGTDTDKCVRAFDVYNKDVACIGKFLKVNCVRFKNADRNDAFFVVKRCTKSVMEHEQSIYDELKHSNALAPHDFFTWKEGRSVYGNISRQNLTKYTMMDLCYALRNFDERNCETLKEILVLTGCCTEAYFDNKCWYDPVENEHIHKVYAQLGVIVANAMIKCVRLCDAMVEKGIVGILTLDNQDLNGDFYDFGDFCKTAPGMGVPCCTSYYSYMMPVMGMTNCLASECFMKSSIFGEDFKTYDLLEYDFTEHKEKLFKKYFKYWDQDYHPNCSECFDEMCVVHCANFNTLFATTIPNTAFGPLCRKVYIDGVPLVATAGYHFKQLGIVWNKDVNTHASRLSINDLLMFVTDPSLIVASSPALVDQRTVCFSVAALSTGMTQQIVKPGHFNKEFYDFLLKQGFFSEGSELTLKHFFFAQKDDAAVKDFDFYRYNRPTMLDICQARVTYKIVSRYFDCYEGGCITAKEVVVTNLNKSAGWPLNKFGKAGLYYESLSYEEQDQLYAVTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRNAAVVIGTTKFYGGWDNMLNNLISGVENPHLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHTTCCTGTDRYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYMKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQATSANINRLLSVDSNNCNNLGVKSLQRRLYDCCYRSAHVDDEFVTDYYNYLRKHFSLMILSDDGVVCYNSEYASLGYVADISAFKATLYYQNNVFMSTAKCWVEPDISKGPHEFCSQHTMQIVDQDGKYYLPYPDPSRILSAGVFVDDIVKTDPVILMERYVSLAIDAYPLSKHDNPEYRKVFYALLDWVKHLNKTLNAGILDAFSITMLEDSTAKFWDEGFYASLYEKSTVLQAAGLCVVCGSQTVLRCGDCIRRPMLCTKCAYDHVVGTTHKFILSVTPYVCNASGCTVNDVTKLWLGGLSYWCTEHKPQLAFPLCSGGNVFGLYKSAATGSPDVETFNQLAMSDWTDVKDYKVANSAKDSLRLFAAETVKAREESVKSQYASATLKEVVGPKELLLSWEAGKVKPPLNRNSVFTCFQISKDSKYQIGEFTFEKADYDSDTVIYKSTATTRLCPGMIFVLTSHNVAPLRAPTIANQERYSSIFKLHPAFNVAEAYAQLVPYYQLIGKQRITTIQGPPGSGKSHCVIGLGLYYPGARIAFTACSHAAVDSLCVKAFSAYARDRCSRIVPARARVECFSGFKSNNNNAQYIFSTVNALPECNVDIVVVDEVSMCTNYDLSIINSRLSYKHIVYVGDPQQLPAPRTMITKGVLEPADYNVVTQRMCSVGPDIFLHRCFRCPAEIVNTVSELVYENKFKPVNAESKQCFKLFAKGNVQVDNGSSINRRQLDIVKMFLAKNPSWSKAVFISPYNSQNYVAARVLGLQIQTVDSSQGSEYDYVIFTQTSDTLHACNVNRFNVAITRAKKGIFCVMCDKSLYDALKFFEVNISDLQAENGCGLFKNCIRNEVVLSPTHAPTYMALSDCFKTSQDLAVAIGTARESVRYEHVISFMGFRFDVNVPNYHTLFCTRDFAMRHVRGWIGMDVEGAHVCGDNVGTNVPLQVGFSNGIDFVVQPEGCVSTEVGDFIKPVRARAPPGEQFTHLVPLLRKGQPWTVVRRRIVQMVCDSLRGLSDVVVFVLWAGGLELTTMRYFVKIGPVQHCYCGKEGRCYSSATHTYYCFNHATNCDYLYNPFVIDIQQWGYTGSLSLNHHEHCNIHRNEHVASGDATMTRCLAVYDCFVKNVDWSITYPFICNEGVVNKSGRIVQSHIMRAALVVYDPVSIHDIGNPKGIRCAVTSKPWYCYDKQPLNTNVRCLEYDYITHGQMNGLCLFWNCNVDMYPEFSIVCRFDTRCKSALNLEGCNGGSLYVNNHAFHTPAFDKRAFAKLKVMPFFYYDASECDKVQDHVNYVPLRANSCITRCNIGGAVCSKHAEAYKKYVEAYNTFTQAGFTLWCPTSFDVYNLWQSFSSNLQGLENIAFNVVKKGGFVGADGELPVAIINDRVMVRDGLTDTLVFTNKTTLPTNVAFELYAKRKLGLTPPLTILRNLGVMATYKHVLWDYDAERPLTPYTKSVCSYTDFDQDVCVCYDNSIPGSFERFTMAKDAVLYSTTCIKKLTCIKVNFGCLNGNAVCSTKEVVGGETKEKNITWYIYTRKNGAFVDHYDGYYTQGRNSTDFIPRSQMEKDFLALDTGVFIAKYGLEDYNFEHVVYGDVSKTTLGGLHLLISQVRLSQIGILKVDEFNSADDSTLKCCTVTYLNDPSSKIVCTYMDLLLDDFVTILKNLDLSVVSKVHEVMVDCKAWRWMLWCKDAHIETFYPQLQSAEWKCGYSMPSLYKIQRMCLDACNLYNYGAGLKLPDGIMFNTLKYTQLCQYLNSTTMCVPHNMRVLHLGAGSDKGVAPGTCVLKRWLPLDAIVVDNDINDYVSDADFSYTGDCNTLFLEDKFDLVISDMYDGRTKSCDGENVSKEGFFPYINGVITGKLSLGGSVAIKITEYSWNKRLYELIQKFEFWTLFCTSVNTSSSEAFLIGINYLGDFCDRPITDGNTMHANYIFWRNSTIMTMSYNSVLDLSKFACKHKATVVVSLKDSDVNEMVLGLVKSGRLLVRNNNKLCGFSNHLVSTK
Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR014828
NSP7
IPR027352 CV_ZBD
IPR036333 NSP10_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR009466 NSP11
IPR037204 NSP7_sf
IPR008740 Peptidase_C30
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR036499 NSP9_sf
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR037227 EndoU-like
IPR014829 NSP8
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014827 Viral_protease
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR038634 A-CoV_nsp1_sf
IPR042515 Nsp15_N
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1161 Identity=59.05%
Cov(Q)=14.51% Cov(P)=97.17%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008168 F:methyltransferase activity
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6396
Number of predicted TMHs:
18
Exp number of AAs in TMHs:
391.196889999993
Exp number, first 60 AAs:
0.04946
Total prob of N-in:
0.00271
outside
1 - 1568
TMhelix
1569 - 1591
inside
1592 - 1629
TMhelix
1630 - 1652
outside
1653 - 1709
TMhelix
1710 - 1732
inside
1733 - 1738
TMhelix
1739 - 1761
outside
1762 - 1764
TMhelix
1765 - 1787
inside
1788 - 2132
TMhelix
2133 - 2155
outside
2156 - 2389
TMhelix
2390 - 2412
inside
2413 - 2418
TMhelix
2419 - 2441
outside
2442 - 2445
TMhelix
2446 - 2460
inside
2461 - 2472
TMhelix
2473 - 2495
outside
2496 - 2802
TMhelix
2803 - 2825
inside
2826 - 2917
TMhelix
2918 - 2940
outside
2941 - 2943
TMhelix
2944 - 2963
inside
2964 - 2969
TMhelix
2970 - 2989
outside
2990 - 3003
TMhelix
3004 - 3026
inside
3027 - 3032
TMhelix
3033 - 3055
outside
3056 - 3074
TMhelix
3075 - 3097
inside
3098 - 3103
TMhelix
3104 - 3126
outside
3127 - 6396
