Strain
Bat_KY770851
(Region: China; Strain: Bat coronavirus isolate Anlong-57, complete genome.; Date: 2013)
Gene
orf1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
orf1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGCTTGCAGTCAGTACACACTTGCTGTGGCAAGTGATGTGGAAATAGATGGTTTTGGCTTTGCAACCATGGGTGAGGCCGTCACAGCTTTTAGCGTGGCCGCTGCTGATGTGTTTGCACAATGCCGCTTTGTTCCATTTGGCCTTCAAGACTGTATTGTTGGTGTTAGTGACGATGACTATGTCATGTTGCTTACTGGCGATTACACTCTTTATGCCTATTTGGACCAATTTTCAGCTAGACCCACTAATCTTAGGGGCTGGCTGATTTTCTCCAACTGTAATTATGTCCTAGAGACCTTTGATATGGTTCTCGGTCGTAGGGGTGGTAATCCACCTGTCTACGTCGACAACTATCTCTGTGGGTCCGACGGCACACCTGCAGTTCAGGAGTCTCTGTGGTCTTTTACTGATCATTTTGGTGAGGATTGCGATGAGCTTACCATTTGTGGCATTACATATGTTCATGCATGGAATGTTCAGCGCGCTGAACTGCCATATGACCAGCAGAATGCCACTACAATTTTGTCCATCGAATACCTTATCGATGTTGATCACGTGCTGCAGAATGGCGCCACTTTGAGTGTCGCTTCTGCTGCAAAATTTAAGAAGAGTGTTGTGCCTTCTGACAGTTATAAGAAACTGTATGAGGCATGTGGGGTTCCCTTTGTCCAAAATGGCACTAAGCTTGTCGATGTTTTGGCAAAACCAGTCTTTTTACATGCTATAGTGGAGTGTAATTGCGGACGCAGTTCATACACTGTGGGTGATTGGAAGATTGGATTCCGCTCTCTGTGCTGTGGTAAGCGGTGTGAACCCATTGTTATAGTTTCTGGAGATGTTAAGCCTGGTGACGTTGTTGTTACTAGCACTAGTGCTGGTAGTGGCGTCCGTTATTTTAATGGGCTAACAGTCAGCTATGTTGGAGACTTTGATGGTGTTAGTTGCTGGCGTGTTGTTGGTGTGCAGGCCTTTAATGGTTTTGTTGCATCTTCGACCTTTAGTGAGCAGCTTCACAATTATAGTCTAGATGCCTGCTCTTACACTGCGAACACACGGTTGTTCAAATTGTTGAAACTTGCTGTCCTCAGTGGAAACACTACAGATGAGGTTACAAGTGCCGTAGTTGCAGGTGTTGTTGACATTAGCAGCAATGTCTACAATTTTGTGGATGCTGTTCTTGACCAAAAACCATGGTTTGTGCGTAAGTTAGACAAGCTTTGTGAAACAGCATGGAGTTTGCTCTGTGATGCTCTTAAGAGTTTGGCTGTTCGTGCATCGGACCTTTTGGAGTTTGTCAAGTCTATGTCAGTGGCTGTTGTAACAGTTGTTGAAGGCAAGCTGACTCTTATTGCAGATGTGCCACAAGCATTCTTGAACGTTTACGAAACGTTTAAGCTTGCACTTGAGGGTATTTTTGACGCGTGTGCTAACACTATTACAATTGCTGGTAAAGCTTTTAGGTCTGCATTTGACTATTTACTGCTTGACAATTGTATTGTCAGGTTGTCAACTGTTAAAGCTGTTGGCCTTAAGCAAGCGGGTGTTAAGAACATTACCTATGCCAGTGTTGTTTTAGGCCCTACGCAGTCTGTTAAGACGGATCGCATAGAGGTCTCTAGTGTTAAGCTTACTCCTGTGCTGGAGAAGGTGCCATTGAAGAGAGAGGGCGTTGCCGTTCTCATTGATGGTGTCGCTTTCTTTTGTAGTGATGGTCATTACAGGCTTATGTCTGACAATGACTGCGTGCTTGAAGAACCAGTTTTTAAAACTGCCCCTGTGCCTGTTGTTAAACCTACTGTAGAGTGTCCTTCGTTGTTTGTGAGCGTCGATGGTGGCGCTATATGGCGTACAGTTATTGCCACCATTGATAGCGTTGCAGACTTTGTGAAGGGCCTTAAGGTTCAGTTTGGTATTGATGGTTTTGTTGGCACATGTGCTAAGCGCTTCAGGAAGCTATTGAAAACTCTTCTTACACTGTATAATGATTTAGTCAATAGCATTAAGCGTACTGTTGTGTTAGCTGGTGTTACACTACAATACTACGCTTTTGAGAGACCTGCATTGGCTATTAATGGTGTCCTACATTTCATTAAGCGCACTAAGGCCAAGGATCTTGGCGTGCCATGTGAAGCAGGTGTAGAGGATTTTAACCTACTGGAAGGTGGTGACTATCCTTTCAAACCTACAGCCGTTGAATTGGCTTATGAAATGGAATTAATGGAATCTGATTATGAGGAACCTTGTGAAGGCGGTGTACTCCGTATCTGTGATGATTATGCATGGTATATGGATGATGACCGGTTTTACCCATATGGTGATAATGGTGTTATACCTGTCTGCTACAAGTTAGGTGGTGGTAAGGTTGATAACCAGGTCACATTTGGTGAAGATGAAGTCAAAGAAATACCGCCCTTCAATAATGTTAAGCTCATATTTGAGTTTGATAACGATATTATCAGTGAAGCCTGTAAAAAGGCCATTGGTAAGCGTATTAGTTTTGAGGGTGACTGGGACGACCTGTGTGCTATGATAGACATTGCCATGAAGGCTTTGTCTGAGCATATAGATGTGCCTCAGTATTACATCTATGATGAAGAAGGTGGTAATGACTTAGACCTCCCAGTTATGATTTCAGAATGGCCATGTAATGCTGATAATCAGGAATTTCATGCACAAGAGTGTGTGATGCCTGATGTTGGATTTGAAACTCCTACGACATTTGATGGTGTTGTTAGTTGCAATGCTAAAAGTTCAAGTGTTGAATTGCTAAATGCCACTTGCGTTGAGTCTAAGACTGTGCACCCTGGTAGTGCTGTTATGCTTGAGACTCAAGTCTTTTCAACTACTGACATAAAACCTGCTGCAGTGTGTAATGCTGTTGTTAAGGATGTTAGTGTTTGTAAGGCTGTTGCGCGTAAACCTGTAATTAAGGTTGCAGTGGACCAAGCTAAGGAGGTTGAGGATGCGTTGGCTTACATGAAACCAAAGGACACTAAGGTCAAGGTGGAGAAGTCAATTTTTGACTATCCCAGTACAGTCTTTAAGGGTGTACGTGTTCTTAAACAAGTTGCTAATAACTGTTGGTTGACAAGTGCGGCTTATCAGCTGCAGTTGGCTAATTGTTATGACGCAGATGATTTCAGCCTTTTTAAGGTTGGTAGTGTGCGTCATTTTGTGCAACGTTGTTATGAATCCGTCGGTGCTGTTAAGGGTAGTTTGGGTGATGTTACTCAACTTCTTGAGCGTCTTTGCAAGGATGTTAAATCACTTAAGGTTACATGTAATGTGGCCTGTGATTGTGGCTCTTCCTTGAAAGTACTTGAGGGGTGCGTTTTTCACTTTATGCCTACCGCAGATTTATTCCCTTATGGTGTGTGTGGTACCTGTAAGCAGGTAGCTATTCATACCATTAAGAGTATTGAAGGCACTGGTTTCTTTTGTCAAGAACCTGCACCTTTTGATATTACAAAGTCTTTGTGTTCTATTGCAGCCACTGCCACTTATGTTGGTAAACAGAATGGCGGCCATTATAGAACGAACGACTTTGTTCATGGTAATGCCATTGATGGTTCTGGTATTACACCACTTAATTACACTGCACCTGTTACTAACTGTCTTGTTGTAGATGTAAACTATGAAGCCCCCAAACCGGCCGTTAAGATGCTCAGCCCCTTTAAAATTGTTGACAATGTGGAGTTCTATAAGGGTGAGTTCTCTGAACTTGCACAATTGGAATTTGACTTTGTCGTTAATGCAGCTAATGAGAACCTGAGCCATGGCGGTGGTGTCGCAAAAGCTATAGATGATTACACTAAAGGACAGTTACAGCTTCTTTCAAAGACATATGTTAAGAACAATGGTCGTGTGCGTACTGGTTCAGGCGCCATGATTAAGTGTAAAGCTTTTGATGTCTTGAATGTGGTTGGACCAAAGAAAGGTGGTAAAAGTTGGCAAAAACTTTTGCGTTTTGCTTATGAGACAATCTTCAAGACTGAAGGTGTGCCACTTACACCACTCCTTAGTTGTGGTATCTTTGGTGTTGCACTCGAAGACTCATTAAGAACTCTTATTGAAACGCACGGTGATAGACGAGTTAAATGCTTTGTCTACACTAGTGATGAAGAGCAGAAGGTTTTGGCATTTTTCGACAACGCTGAGACAGTTGTTGATGAACCAGTAGTACCGTATAAGTCAGAGGGTAAGTGTGCCTTCTATGATTGCGATGCTGCTGCGGTGTTAAAGCTTAAGCCTGATAACATTGTCATTTTTACAGACAGTAAACTGACACTTGTTGGTGCTGGTTTGGATTTTGACAAATGCTTAAATAACAGGTTGTCTGCCGCTATAAAAGAGTGTATTGAGGTCAATACTGCAATACCAACTGGTAATGCTGTTAAATTCGAGTGTTCTCCAACTGTGTACATGGCAGTTGTCCCTCCGAAGGACACACCAGGGTTTGATAAAAATTTCGCTAGAACACTTCGTAAGGTGTCAAATTTGGAAGGTAAGACATTCTGCACTGTTCCTATTAAAGAGATAATGCAGAGTGCACTTAAAATCTTTGACGGTTACGCATTTGTTGTTTTAGCTGATGAGAAGAAACTTGTGGAAGATTGTTTTAAGCCACAGAGTGTTAAGTTGACAACAACAGAGGATGGTGTCAATGTTAATACAAAAATTGTTTCTAGTGCTGCTACGTATGGTGAGCAGTTGGGTACTGTTACCAGTGGTAATACAGACCTTACTGCTACTAGACCATCTAGTAGTGATGAAACAAAGATTTTGAGTGTGGCACCAGCAGTTGATTGGGTTGCTCATTATGGTTTCCATGATGCAGCAGCTTTTGTTACGTACGACCACAAGCCTTTTGCTTATGAAAGTGATATGCTTATGGGTAAGCGTACTTTAAAACAGACTGATAATAACTGCTGGATTAATGCTGCCTGTCTAGCACTGCAGTATTTGAAACCCAAGTTTCGATATCCTGGTTGGGAAGC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Protein
MACSQYTLAVASDVEIDGFGFATMGEAVTAFSVAAADVFAQCRFVPFGLQDCIVGVSDDDYVMLLTGDYTLYAYLDQFSARPTNLRGWLIFSNCNYVLETFDMVLGRRGGNPPVYVDNYLCGSDGTPAVQESLWSFTDHFGEDCDELTICGITYVHAWNVQRAELPYDQQNATTILSIEYLIDVDHVLQNGATLSVASAAKFKKSVVPSDSYKKLYEACGVPFVQNGTKLVDVLAKPVFLHAIVECNCGRSSYTVGDWKIGFRSLCCGKRCEPIVIVSGDVKPGDVVVTSTSAGSGVRYFNGLTVSYVGDFDGVSCWRVVGVQAFNGFVASSTFSEQLHNYSLDACSYTANTRLFKLLKLAVLSGNTTDEVTSAVVAGVVDISSNVYNFVDAVLDQKPWFVRKLDKLCETAWSLLCDALKSLAVRASDLLEFVKSMSVAVVTVVEGKLTLIADVPQAFLNVYETFKLALEGIFDACANTITIAGKAFRSAFDYLLLDNCIVRLSTVKAVGLKQAGVKNITYASVVLGPTQSVKTDRIEVSSVKLTPVLEKVPLKREGVAVLIDGVAFFCSDGHYRLMSDNDCVLEEPVFKTAPVPVVKPTVECPSLFVSVDGGAIWRTVIATIDSVADFVKGLKVQFGIDGFVGTCAKRFRKLLKTLLTLYNDLVNSIKRTVVLAGVTLQYYAFERPALAINGVLHFIKRTKAKDLGVPCEAGVEDFNLLEGGDYPFKPTAVELAYEMELMESDYEEPCEGGVLRICDDYAWYMDDDRFYPYGDNGVIPVCYKLGGGKVDNQVTFGEDEVKEIPPFNNVKLIFEFDNDIISEACKKAIGKRISFEGDWDDLCAMIDIAMKALSEHIDVPQYYIYDEEGGNDLDLPVMISEWPCNADNQEFHAQECVMPDVGFETPTTFDGVVSCNAKSSSVELLNATCVESKTVHPGSAVMLETQVFSTTDIKPAAVCNAVVKDVSVCKAVARKPVIKVAVDQAKEVEDALAYMKPKDTKVKVEKSIFDYPSTVFKGVRVLKQVANNCWLTSAAYQLQLANCYDADDFSLFKVGSVRHFVQRCYESVGAVKGSLGDVTQLLERLCKDVKSLKVTCNVACDCGSSLKVLEGCVFHFMPTADLFPYGVCGTCKQVAIHTIKSIEGTGFFCQEPAPFDITKSLCSIAATATYVGKQNGGHYRTNDFVHGNAIDGSGITPLNYTAPVTNCLVVDVNYEAPKPAVKMLSPFKIVDNVEFYKGEFSELAQLEFDFVVNAANENLSHGGGVAKAIDDYTKGQLQLLSKTYVKNNGRVRTGSGAMIKCKAFDVLNVVGPKKGGKSWQKLLRFAYETIFKTEGVPLTPLLSCGIFGVALEDSLRTLIETHGDRRVKCFVYTSDEEQKVLAFFDNAETVVDEPVVPYKSEGKCAFYDCDAAAVLKLKPDNIVIFTDSKLTLVGAGLDFDKCLNNRLSAAIKECIEVNTAIPTGNAVKFECSPTVYMAVVPPKDTPGFDKNFARTLRKVSNLEGKTFCTVPIKEIMQSALKIFDGYAFVVLADEKKLVEDCFKPQSVKLTTTEDGVNVNTKIVSSAATYGEQLGTVTSGNTDLTATRPSSSDETKILSVAPAVDWVAHYGFHDAAAFVTYDHKPFAYESDMLMGKRTLKQTDNNCWINAACLALQYLKPKFRYPGWEAAWNKFVTGACEEFVHLLYHIAQARKGDLGDAEELLGRLDKFIVPGGTVVLERHVDCSVCKTTERVVKSSVVSASLKREGVDDGACCNHGSAYSLRVKSVKGDVIVTTCEKPQCYRNSEVLCGEAYVAFTGPVDGGHYLVYDRSTGQVFDGDRIVPYEFDTLTVSALVVKGGYVCSVPKAIKLERVMTDLDNGAQKFFDFGDFVLRNFVSFFSVLFSLLFIGYKALRKRDLKVLAQAPQRTGIILTRSLKYNCKAALKFWKTRSWYIMLMLKLLLLAYTLYAAGFMIVRYSFFNNYICKGYVDGYANSTFVKKDFCDGGLVCDACLHGFDQLPDFNHLNVKWDYITVPFAIKVYPSVVAILLFLLGGNYVKFMMLYVLAQYVNSCGVYFGLQAHFWPVHIIPFDVFCDEIFAIFVAVKSLLFVKHVFMGCDSPNCIACSKSARLKRVPMTTVVNGANKAFYVIANGGTKFCTKHNFFCVDCDSYGNNSTFINEPIARELSNVTKTAVKPTGPAYIEIDRVDFSNGFYRLYSGDTFWRYNFDITEGKYSCKEVLKSCNAIDDFIVYNNSGTNVTQVRNACVYLSQLMCKPIKLVDSELLASLNVDFNGALHKAFVEVLQNSFSVELDGCTTMAECKEKIGLDVADDEFVNAVTNAHRYDVLLSEVSFNNFIVSYAKPEEKLSAFDCAQCVRAGAKIVNHNVLVKEKLSVVWLAKDFQNLSAEGRKYLVKTAKVKGLNFILTLNDNAAQCSVPVVSMMSKKGAGPKRRSYFWFAWTLCALILGMYYATSYITFGTQVSSFAGYDFKYIEHGQLREFEAGLQCVHNTFDNFMDWHFQKFGLRPSTSANCPVVVGVGDHGRTLPGVPADVQLVGHTLVFTVKTVFGNTNLCYDTSGVVNAASCIFTSACTVLEGLGGAITYCYKNGIVEGAKLYSDLQPNAHYKFDADNYVKIPEVLARGFGMRTIRTIETTYCRVGECVDSKAGICIGADRWLVYSAESGSDFVCGSSLIQLLCNAFKVFNYDFSTAALSGQMMFNAIVAGLAIMICFLVTKFKRVFGDLSYGVFTVIVTALVCNLSYFVTQNYLGLYIFSGLYYLTTRQLRYEWIWHIGYVVSYFFLAPWWLMLAYVGVLILELVPNLLKLKVSTHLFEDGHFIGSFESAASGTFVLDMRAYEKLVNSIPAERLRQYASSYNKYKYYSGSPTEVDYRLACYAHLAHAMMTFGKEQRDMLYAPPTCSFNSSLQSGLKKMAQPSGIVEPCIVRVSYNSTVLNGLWLGDTVYCPRHVLASNTTVTIDYEHAYAVMRLHNFSISAGNMYLGVISATMHGANLHIKVNQSNVQTPPHSFRTVKPGEMFNILACYDGTPAGVYSVNLRTNHTIKGSFINGACGSPGYNVVNGTVEFVYMHQIELGSGCHVGSDYSGKIYGGYEDQPTLQIEGSANLVTENVLAFLYGALLNGITWWLAPTRVSVEAFNDWASVSGYTPLQSADGFSMLAAKTGVEVERLLASIQKYASGFGGRNILGYSTLTDDFTLSEVIKQMFGVNLQSSKKATCFKSLMLVGGFFAMFWGEFLMYSSVMWVHPAIVTPILLGLGCVSMFLSCFIKHKMMFLQTFLLPSIIVVAATNFFWDYFVTQLLIQYFDYTASLFSLDIQGLLNITMCLFVMFLHTYRFVGSGTNAVAYVSSLCVSAYTYLMGGDPMYCAIMVLCSLSSEWYVGAVCYKLALRLAPFVNPIVITIFGQSKVVVFVYLALGYCTCVYWGFLYWFNRFFKLTLGEYDFKVSPAEFKYMVANNLSAPRGPFDSLALSLRLVGVGGQRTIRVSTVQSKLTDLKCANVVLLGCLSSMNIASNSKDWEYCVTLHNKINLCDDPEKAHEMLLALLAFFLSKQQAFGVDGLVDSYFDNNSMLQSVANTYVNLPSFVAYETARQNYEDAVNNGSSTQIIKQMRRAMHLAKADYDREVSVQKKIERMAENAAAQMYKEARAENRKSKIIGSMHALLFGMLRKLDMSSVDNILSLAKNGVVPLSIIPATSATKLCIVCPDHEAYTKIIYGQCVHYAGVVWNVVDVKDNDGKPVHQKEIVKANEETLSWPLSINCERVVKLQNNEIIPNGKLKQCAVKAEGDGFSCEGKALYNNEGGKTFMYAFLADKPDLKVVKWEFDGGCNVIELEEPRRFAVETGSGTQIKYLYFVKNLNTLRRGAVLGFIGATVRVQAGKQTEQASNSPLLTMCAFAVDPAKCYLDAVKSGVKPVGNCIKMLSNGSGTGQAITNGVESNTNQDTYGGASVCLYCRAHVEHPSMDGFCRLKGKYVQVPIGTLDPIRYCLENTVCKVCACWLNNGCQCDRTSVQSLDTGYLNRVRGSSDARLEPLNGTDTDKCVRAFDVYNKDVACIGKFLKVNCVRFKNADRNDAFFVVKRCTKSVMEHEQSIYDELKHSNALAPHDFFTWKEGRSVYGNISRQNLTKYTMMDLCYALRNFDERNCETLKEILVLTGCCTEAYFDNKCWYDPVENEHIHKVYAQLGVIVANAMIKCVRLCDAMVEKGIVGILTLDNQDLNGDFYDFGDFCKTAPGMGVPCCTSYYSYMMPVMGMTNCLASECFMKSSIFGEDFKTYDLLEYDFTEHKERLFKKYFKYWDQDYHPNCSECFDEMCVVHCANFNTLFATTIPNTAFGPLCRKVYIDGVPLVATAGYHFKQLGIVWNKDVNTHASRLSINDLLMFVTDPSLIVASSPALVDQRTVCFSVAALSTGMTQQIVKPGHFNKEFYDFLLKQGFFSEGSELTLKHFFFAQKDDAAVKDFDFYRYNRPTMLDICQARVTYKIVSRYFDCYEGGCITAKEVVVTNLNKSAGWPLNKFGKAGLYYESLSYEEQDQLYAVTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRNAAVVIGTTKFYGGWDNMLNNLISGVENPHLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHTTCCTGTDRYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYMKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQATSANINRLLSVDSNNCNNLGVKSLQRRLYDCCYRSAHVDDEFVTDYYNYLRKHFSLMILSDDGVVCYNSEYASLGYVADISAFKATLYYQNNVFMSTAKCWVEPDISKGPHEFCSQHTMQIVDQDGKYYLPYPDPSRILSAGVFVDDIVKTDPVILMERYVSLAIDAYPLSKHDNPEYRKVFYALLDWVKHLNKTLNAGILDAFSITMLEDSTAKFWDEGFYASLYEKSTVLQAAGLCVVCGSQTVLRCGDCIRRPMLCTKCAYDHVVGTTHKFILSVTPYVCNASGCTVNDVTKLWLGGLSYWCTEHKPQLAFPLCSGGNVFGLYKSAATGSPDVETFNQLAMSDWTDVKDYKVANSAKDSLRLFAAETVKAREESVKSQYASATLKEVVGPKELLLSWEAGKVKPPLNRNSVFTCFQISKDSKYQIGEFTFEKADYDSDTVIYKSTATTRLCPGMIFVLTSHNVAPLRAPTIANQERYSSIFKLHPAFNVAEAYAQLVPYYQLIGKQRITTIQGPPGSGKSHCVIGLGLYYPGARIAFTACSHAAVDSLCVKAFSAYARDRCSRIVPARARVECFSGFKSNNNNAQYIFSTVNALPECNVDIVVVDEVSMCTNYDLSIINSRLSYKHIVYVGDPQQLPAPRTMITKGVLEPADYNVVTQRMCSVGPDIFLHRCFRCPAEIVNTVSELVYENKFKPVNAESKQCFKLFAKGNVQVDNGSSINRRQLDIVKMFLAKNPSWSKAVFISPYNSQNYVAARVLGLQIQTVDSSQGSEYDYVIFTQTSDTLHACNVNRFNVAITRAKKGIFCVMCDKSLYDALKFFEVNISDLQAENGCGLFKNCIRNEVVLSPTHAPTYMALSDCFKTSQDLAVAIGTARESVRYEHVISFMGFRFDVNVPNYHTLFCTRDFAMRHVRGWIGMDVEGAHVCGDNVGTNVPLQVGFSNGIDFVVQPEGCVSTEVGDFIKPVRARAPPGEQFTHLVPLLRKGQPWTVVRRRIVQMVCDSLKGLSDVVVFVLWAGGLELTTMRYFVKIGPVQHCYCGKEGRCYSSATHTYYCFNHATNCDYLYNPFVIDIQQWGYTGSLSLNHHEHCNIHRNEHVASGDATMTRCLAVYDCFVKNVDWSITYPFICNEGVVNKSGRIVQSHIMRAALVVYDPVAIHDIGNPKGIRCAVTSKPWYCYDKQPLNTNVRCLEYDYITHGQMNGLCLFWNCNVDMYPEFSIVCRFDTRCKSALNLEGCNGGSLYVNNHAFHTPAFDKRAFAKLKVMPFFYYDASECDKVQDHVNYVPLRANSCITRCNIGGAVCSKHAEAYKKYVEAYNTFTQAGFTLWCPTSFDVYNLWQSFSSNLQGLENIAFNVVKKGGFVGADGELPVAIINDRVMVRDGLTDTLVFTNKTTLPTNVAFELYAKRKLGLTPPLTILRNLGVMATYKHVLWDYDAERPLTPYTKSVCSYTDFDQDVCVCYDNSIPGSFERFTMAKDAVLYSTTCIKKLTCIKVNFGCLNGNAVCSTKEVVGGETKEKNITWYIYTRKNGAFVDHYDGYYTQGRNSTDFIPRSQMEKDFLALDTGVFIAKYGLEDYNFEHVVYGDVSKTTLGGLHLLISQVRLSQIGILKVDEFNSADDSTLKCCTVTYLNDPSSKIVCTYMDLLLDDFVTILKNLDLSVVSKVHEVMVDCKAWRWMLWCKDAHIETFYPQLQSAEWKCGYSMPSLYKIQRMCLDACNLYNYGAGLKLPDGIMFNTLKYTQLCQYLNSTTMCVPHNMRVLHLGAGSDKGVAPGTCVLKRWLPLDAIVVDNDINDYVSDADFSYTGDCNTLFLEDKFDLVISDMYDGRTKSCDGENVSKEGFFPYINGVITGKLSLGGSVAIKITEYSWNKRLYELIQKFEFWTLFCTSVNTSSSEAFLIGINYLGDFCDRPITDGNTMHANYIFWRNSTIMTMSYNSVLDLSKFACKHKATVVVSLKDSDVNEMVLGLVKSGRLLVRNNNKLCGFSNHLVSTK
Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR014828
NSP7
IPR027352 CV_ZBD
IPR036333 NSP10_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR009466 NSP11
IPR037204 NSP7_sf
IPR008740 Peptidase_C30
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR036499 NSP9_sf
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR037227 EndoU-like
IPR014829 NSP8
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014827 Viral_protease
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR038634 A-CoV_nsp1_sf
IPR042515 Nsp15_N
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
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IPR038123 NSP4_C_sf
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1160 Identity=59.05%
Cov(Q)=13.86% Cov(P)=97.17%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008168 F:methyltransferase activity
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GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6697
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
383.255689999995
Exp number, first 60 AAs:
0.49364
Total prob of N-in:
0.02417
outside
1 - 1869
TMhelix
1870 - 1892
inside
1893 - 1930
TMhelix
1931 - 1953
outside
1954 - 2010
TMhelix
2011 - 2033
inside
2034 - 2039
TMhelix
2040 - 2062
outside
2063 - 2065
TMhelix
2066 - 2088
inside
2089 - 2434
TMhelix
2435 - 2457
outside
2458 - 2690
TMhelix
2691 - 2713
inside
2714 - 2725
TMhelix
2726 - 2748
outside
2749 - 2773
TMhelix
2774 - 2796
inside
2797 - 3218
TMhelix
3219 - 3241
outside
3242 - 3244
TMhelix
3245 - 3264
inside
3265 - 3270
TMhelix
3271 - 3290
outside
3291 - 3304
TMhelix
3305 - 3327
inside
3328 - 3333
TMhelix
3334 - 3356
outside
3357 - 3375
TMhelix
3376 - 3398
inside
3399 - 3404
TMhelix
3405 - 3427
outside
3428 - 6697
