CoVDB Coronavirus Database (v3)   
Strain
Porcine_LT905450 (Region: Belgium;  Strain: Porcine epidemic diarrhea virus isolate CV777 genome assembly, complete genome: monopartite.;  Date: 1977)
Gene
replicase polyprotein
Description
Annotated in NCBI,  replicase polyprotein
GenBank Accession
 

Sequence

CDS
ATGGCTAGCAACCATGTCACATTGGCGTTTGCCAATGATGCAGAAATTTCGGCTTTTGGCTTTTGCACTGCTAGTGAAGCCGTCTCATACTATTCTGAGGCCGCCGCTAGTGGATTTATGCAATGCCGTTTTGTGTCCCTCGATCTCGCTGACACTGTTGAGGGATTGCTTCCTGAAGACTATGTCATGGTGGTGATCGGCACTACCAAGCTTAGTGCGTATGTGGACACTTTTGGTAGCCGCCCCAGAAACATTTGTGGTTGGCTGTTATTTTCTAACTGTAATTACTTCCTCGAAGAGTTAGAGCTCACTTTTGGTCGTCGTGGTGGTAACATCGTGCCAGTTGACCAATACATGTGTGGCGCTGACGGGAAACCTGTTCTTCAGGAATCCGAGTGGGAGTATACAGATTTCTTCGCTGACTCCGAAGACGGTCAACTCAACATTGCTGGGATCACTTATGTGAAGGCCTGGATTGTAGAGCGATCGGACGTCTCTTATGCGAGTCAGAATTTAACATCTATTAAGTCTATTACTTACTGTTCAACCTATGAGCATACTTTTCTTGATGGTACTGCCATGAAGGTTGCACGTACTCCAAAGATCAAGAAGAATGTTGTTTTGTCTGAGCCACTTGCTACTATCTACAGGGAAATTGGTTCCCCTTTTGTGGATAATGGGAGCGATGCTCGTTCTATCATTAGGAGACCAGTGTTCCTCCACGCTTTTGTTAAGTGTAAGTGTGGTAGTTATCATTGGACTGTTGGTGATTGGACTTCCTATGTCTCCACTTGCTGTGGCTTTAAGTGCAAGCCAGTCCTTGTGGCCTCATGCTCTGCTATGCCTGGTTCTGTTGTGGTCACACGCGCTGGTGCTGGCACTGGTGTTAAGTACTACAACAACATGTTCCTGCGCCATGTGGCTGACATTGATGGATTGGCATTCTGGCGAATTCTTAAGGTGCAGTCCAAAGACGACCTCGCTTGCTCTGGTAAGTTCCTTGAACACCATGAGGAAGGTTTCACAGACCCTTGCTACTTTTTGAATGATTCGAGCCTTGCTACTAAGCTTAAGTTCGACATCCTTAGTGGCAAGTTTTCTGATGAAGTCAAACAAGCTATCATTGCTGGTCATGTTGTTGTTGGCAGTGCACTCGTTGACATTGTTGACGATGCACTGGGACAACCTTGGTTCATACGTAAGCTTGGTGACCTTGCAAGTGCACCTTGGGAGCAGCTTAAGGCTGTCGTTAGAGGCCTTGGCCTCTTGTCTGATGAGGTTGTGCTCTTTGGCAAAAGACTTAGCTGTGCCACTCTTAGTATCGTTAACGGCGTTTTTGAGTTTCTCGCCGATGTGCCAGAGAAGTTGGCTGCGGCTGTTACAGTTTTTGTCAACTTCTTGAATGAGTTCTTTGAGTCTGCCTGTGACTGCTTAAAGGTCGGAGGTAAGACATTCAACAAGGTTGGTTCCTATGTTCTTTTTGACAATGCATTGGTTAAGCTTGTCAAGGCAAAAGCTCGCGGCCCACGACAGGCAGGTATTTGTGAAGTTCGCTACACAAGCCTGGTTGTTGGGAGTACTACCAAGGTGGTTTCCAAGCGCGTTGAAAATGCCAATGTGAATCTCGTCGTCGTTGACGAGGATGTAACCCTCAACACCACTGGTCGTACAGTTGTCGTTGATGGACTTGCATTCTTCGAGAGTGACGGGTTTTACAGACATCTTGCTGATGCTGACGTTGTCATCGAACATCCTGTTTATAAGTCTGCTTGTGAGCTCAAGCCAGTTTTTGAGTGTGACCCAATACCTGATTTTCCTTTGCCTGTGGCCGCTAGTGTTGCAGAGCTCTGTGTGCAAACCGATCTGTTGCTTAAAAATTACAACACTCCTTATAAAACTTACAGCTGCGTAGTGAGAGGTGATAAGTGTTGCATCACTTGCACCTTACAGTTCAAAGCACCAAGTTATGTGGAGGATGCTGTTAATTTTGTAGACCTATGTACCAAGAACATTGGTACTGCTGGTTTTCATGAGTTTTACATAACGGCCCATGAACAACAGGATCTGCAAGGGTTTTTAACCACTTGTTGCACGATGTCAGGTTTTGAGTGTTTTATGCCTACAATCCCACAGTGTCCAGCAGTGCTTGAAGAGATTGATGGTGGTAGCATATGGCGGTCTTTTATCACTGGTCTTAATACAATGTGGGATTTTTGCAAGCGTCTTAAAGTCAGCTTTGGACTGGATGGCATTGTTGTCACTGTAGCACGCAAATTTAAACGACTTGGTGCTCTTTTGGCAGAAATGTATAACACTTATCTTTCAACTGTGGTGGAAAACTTGGTACTGGCCGGTGTTAGCTTCAAGTATTATGCCACCAGTGTCCCAAAAATTGTTTTGGGCGGTTGTTTTCACAGTGTTAAAAGTGTTTTTGCAAGTGTCTTCCAGATTCCTGTCCAGGCAGGCATTGAGAAGTTTAAAGTTTTCCTTAACTGTGTTCACCCTGTTGTACCACGTGTCATTGAAACTTCTTTTGTGGAATTAGAAGAGACGACATTTAAACCACCAGCACTCAATGGTGGTATTGCTATTGTTGATGGCTTCGCTTTCTATTATGATGGAACACTATACTATCCCACCGATGGTAATAGTGTTGTGCCTATCTGTTTTAAGAAGAAAGGTGGTGGTGATGTTAAATTCTCTGATGAAGTCTCTGTTAAAACCATTGATCCAGTTTATAAGGTCTCCCTTGAATTTGAGTTCGAGTCTGAGACTATTATGGCTGTGCTTAATAAGGCTGTTGGTAATCGTATCAAGGTTACAGGTGGTTGGGATGATGTCGTTGAGTATATTAACGTTGCCATTGAGGTTCTTAAAGATCACGTTGAAGTGCCTAAGTACTACATCTATGATGAGGAAGGTGGCACTGATCCTAATCTGCCCGTAATGGTTTCTCAGTGGCCGTTGAATGATGACACGATCTCACAGGACCTGCTTGATGTGGAAGTTGTTACGGATGCACCAATTGATTCCGAGGGTGATGAAGTAGACTCCTCTGCACCTGAGAAGGTGGCAGATGTGGCTAACTCTGAACCTGGGGATGATGGTCTTCCTGTGGCACCTGAAACAAATGTAGAGTCTGAAGTTGAGGAAGTTGCCGCAACCTTGTCCTTTATTAAAGATACACCTTCCACAGTTACTAAGGACCCTTTTGCTTTTGACTTTGTAAGCTACGGAGGACTTAAAGTTTTAAGACAATCTCATAACAATTGTTGGGTTACTTCTACCTTGGTGCAGCTACAATTGCTTGGCATCGTTGATGACCCTGCAATGGAACTTTTTAGTGCTGGTAGAGTTGGTCCAATGGTTCGCAAATGTTATGAGTCACAAAAGGCTATTTTGGGATCTTTGGGTGATGTGTCGGCTTGCCTAGAGTCTCTGACTAAGGACCTACACACACTTAAGATTACCTGTTCTGTAGTCTGCGGTTGTGGTACTGGTGAACGTATCTATGAGGGTTGTGCTTTTCGTATGACGCCAACTTTGGAACCGTTTCCATATGGTGCTTGTGCTCAGTGTGCTCAAGTTTTGATGCACACTTTTAAAAGTATTGTTGGCACCGGCATCTTTTGCCGAGATACTACTGCTCTCTCCTTGGATTCTTTGGTTGTAAAACCTCTTTGTGCGGCTGCTTTTATAGGCAAGGATAGTGGTCATTATGTCACCAATTTTTATGATGCTGCTATGGCTATTGATGGTTATGGTCGTCATCAGATAAAGTATGACACACTGAACACCATTTGTGYTAAAGACGTGAATTGGACAGCACCTCTTGTCCCTGCCGTTGATTCTGTAGTGGAGCCTGTTGTCAAACCATTCTATTCTTATAAGAATGTTGATTTTTACCAAGGAGATTTTAGTGACCTTGTTAAACTTCCATGTGACTTTGTTGTTAATGCTGCAAATGAGAAGTTGTCTCATGGTGGCGGCATAGCAAAGGCCATTGATGTTTATACCAAGGGCATGTTGCAGAAGTGTTCAAATGATTACATTAAAGCACACGGTCCCATTAAAGTTGGACGTGGTGTCATGTTGGAGGCATTAGGTCTTAAGGTCTTTAATGTTGTTGGTCCACGTAAGGGTAAGCATGCACCTGAGCTTCTTGTTAAGGCTTATAAGTCCGTTTTTGCTAACTCAGGTGTTGCTCTTACACCTTTGATTAGTGTTGGAATTTTTAGTGTTCCTTTGGAAGAATCTTTATCTGCTTTTCTTGCATGTGTTGGTGATCGCCACTGTAAGTGCTTTTGTTATGGTGACAAAGAGCGCGAGGCGATCATTAAGTACATGGATGGCTTGGTAGATGCTATTTTCAAAGAGGCGCTTGTTGACACTACTCCTGTCCAGGAAGATGTTCAACAAGTTTCACAAAAACCAGTTTTGCCTAATTTTGAACCTTTCAGGATTGAAGGTTCTCATGCTTTCTATGAGTGCAACCCTGAAGGTTTGATGTCCTTAGGTGCTGACAAGCTGGTGTTGTTTACAAATTCCAATTTGGATTTTTGTAGTGTTGGTAAGTGTCTTAACGATGTGACCAGCGGTGCATTGCTTGAAGCCATAAATGTATTTAAAAAGAGTAACAAAACAGTGCCTGCTGGCAACTGTGTTACTTTAGATTGTGCAAATATGATTTCTATTACTATGGTAGTATTGCCATTTGATGGTGATGCTAATTATGACAAAAATTATGCACGCGCCGTTGTCAAGGTATCTAAGCTTAAAGGCAAGTTAGTGCTTGCTGTTGATGATGCCACGTTGTATTCCAAGTTGTCCCACCTCAGCGTGTTAGGTTTCGTGTCCACACCTGACGATGTGGAGCGTTTCTACGCAAATAAGAGTGTGGTTATTAAAGTCACTGAGGATACACGTAGTGTCAAGGCTGTTAAAGTAGAATCCACTGCTACTTATGGACAACAAATTGGACCTTGTCTTGTTAATGACAC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Protein
MASNHVTLAFANDAEISAFGFCTASEAVSYYSEAAASGFMQCRFVSLDLADTVEGLLPEDYVMVVIGTTKLSAYVDTFGSRPRNICGWLLFSNCNYFLEELELTFGRRGGNIVPVDQYMCGADGKPVLQESEWEYTDFFADSEDGQLNIAGITYVKAWIVERSDVSYASQNLTSIKSITYCSTYEHTFLDGTAMKVARTPKIKKNVVLSEPLATIYREIGSPFVDNGSDARSIIRRPVFLHAFVKCKCGSYHWTVGDWTSYVSTCCGFKCKPVLVASCSAMPGSVVVTRAGAGTGVKYYNNMFLRHVADIDGLAFWRILKVQSKDDLACSGKFLEHHEEGFTDPCYFLNDSSLATKLKFDILSGKFSDEVKQAIIAGHVVVGSALVDIVDDALGQPWFIRKLGDLASAPWEQLKAVVRGLGLLSDEVVLFGKRLSCATLSIVNGVFEFLADVPEKLAAAVTVFVNFLNEFFESACDCLKVGGKTFNKVGSYVLFDNALVKLVKAKARGPRQAGICEVRYTSLVVGSTTKVVSKRVENANVNLVVVDEDVTLNTTGRTVVVDGLAFFESDGFYRHLADADVVIEHPVYKSACELKPVFECDPIPDFPLPVAASVAELCVQTDLLLKNYNTPYKTYSCVVRGDKCCITCTLQFKAPSYVEDAVNFVDLCTKNIGTAGFHEFYITAHEQQDLQGFLTTCCTMSGFECFMPTIPQCPAVLEEIDGGSIWRSFITGLNTMWDFCKRLKVSFGLDGIVVTVARKFKRLGALLAEMYNTYLSTVVENLVLAGVSFKYYATSVPKIVLGGCFHSVKSVFASVFQIPVQAGIEKFKVFLNCVHPVVPRVIETSFVELEETTFKPPALNGGIAIVDGFAFYYDGTLYYPTDGNSVVPICFKKKGGGDVKFSDEVSVKTIDPVYKVSLEFEFESETIMAVLNKAVGNRIKVTGGWDDVVEYINVAIEVLKDHVEVPKYYIYDEEGGTDPNLPVMVSQWPLNDDTISQDLLDVEVVTDAPIDSEGDEVDSSAPEKVADVANSEPGDDGLPVAPETNVESEVEEVAATLSFIKDTPSTVTKDPFAFDFVSYGGLKVLRQSHNNCWVTSTLVQLQLLGIVDDPAMELFSAGRVGPMVRKCYESQKAILGSLGDVSACLESLTKDLHTLKITCSVVCGCGTGERIYEGCAFRMTPTLEPFPYGACAQCAQVLMHTFKSIVGTGIFCRDTTALSLDSLVVKPLCAAAFIGKDSGHYVTNFYDAAMAIDGYGRHQIKYDTLNTICXKDVNWTAPLVPAVDSVVEPVVKPFYSYKNVDFYQGDFSDLVKLPCDFVVNAANEKLSHGGGIAKAIDVYTKGMLQKCSNDYIKAHGPIKVGRGVMLEALGLKVFNVVGPRKGKHAPELLVKAYKSVFANSGVALTPLISVGIFSVPLEESLSAFLACVGDRHCKCFCYGDKEREAIIKYMDGLVDAIFKEALVDTTPVQEDVQQVSQKPVLPNFEPFRIEGSHAFYECNPEGLMSLGADKLVLFTNSNLDFCSVGKCLNDVTSGALLEAINVFKKSNKTVPAGNCVTLDCANMISITMVVLPFDGDANYDKNYARAVVKVSKLKGKLVLAVDDATLYSKLSHLSVLGFVSTPDDVERFYANKSVVIKVTEDTRSVKAVKVESTATYGQQIGPCLVNDTVVTDNKPVVADVVAKVVPNANWDSHYGFDKAGEFHMLDHTGFTFPSEVVNGRRVIKTTDNNCWVNVTCLQLQFARFRFKSAGLQAMWESYCTGDVAMFVHWLYWLTGVDKGQPSDSENALNMLSKYIVPAGSVTIERVTHDGCCCSKRVVTAPVVNASVLKLGVEDGLCPHGLNYIGKVVVVKGTTIVVNVGKPVVAPSHLFLKGVSYTTFLDNGNGVVGHYTVFDHGTGMVHDGDAFVPGDLNVSPVTNVVVSEQTAVVIKDPVKKAELDATKLLDTMNYASERFFSFGDFMSRNLITVFLYILSILGLCFRAFRKRDVKVLAGVPQRTGIILRKSMRYNAKALGVFFKLKLYWFKVLGKFSLGIYALYALLFMTIRFTPIGSPVCDDVVAGYANSSFDKNEYCNSVICKVCLYGYQELSDFSHTQVVWQHLRDPLIGNVMPFFYLAFLAIFGGVYVKAITLYFIFQYLNSLGVFLGLQQSIWFLQLVPFDVFGDEIVVFFIVTRVLMFIKHVCLGCDKASCVACSKSARLKRVPVQTIFQGTSKSFYVHANGGSKFCKKHNFFCLNCDSYGPGCTFINDVIATEVGNVVKLNVQPTGPATILIDKVEFSNGFYYLYSGDTFWKYNFDITDSKYTCKEALKNCSIITDFIVFNNNGSNVNQVKNACVYFSQMLCKPVKLVDSALLASLSVDFGASLHSAFVSVLSNSFGKDLSSCNDMQDCKSTLGFDDVPLDTFNAAVAEAHRYDVLLTDMSFNNFTTSYAKPEEKFPVHDIATCMRVGAKIVNHNVLVKDSIPVVWLVRDFIALSEETRKYIIRTTKVKGITFMLTFNDCRMHTTIPTVCIANKKGAGLPSFSKVKKFFWFLCLFIVAAFFALSFLDFGTQVSSDSDYDFKYIESGQLKTFDNPLSCVHNVFINFDQWHDAKFGFTPVNNPSCPIVVGVSDEARTVPGIPAGVYLAGKTLVFAINTIFGTSGLCFDASGVADKGACIFNSACTTLSGLGGTAVYCYKNGLVEGAKLYSELAPHSYYKMVDGNAVSLPEIISRGFGIRTIRTKAMTYCRVGQCVQSAEGVCFGADRFFVYNAESGSDFVCGTGLFTLLMNVISVFSKTVPVTVLSGQILFNCIIAFVAVAVCFLFTKFKRMFGDMSVGVFTVGACTLLNNVSYIVTQNTLGMLGYATLYFLCTKGVRYMWIWHLGFLISYILIAPWWVLMVYAFSAIFEFMPNLFKLKVSTQLFEGDKFVGSFENAAAGTFVLDMHAYERLANSISTEKLRQYASTYNKYKYYSGSASEADYRLACFAHLAKAMMDYASNHNDTLYTPPTVSYNSTLQAGLRKMAQPSGVVEKCIVRVCYGNMALNGLWLGDIVMCPRHVIASSTTSTIDYDYALSVLRLHNFSISSGNVFLGVVSATMRGALLQIKVNQNNVHTPKYTYRTVRPGESFNILACYDGAAAGVYGVNMRSNYTIRGSFINGACGSPGYNINNGTVEFCYLHQLELGSGCHVGSDLDGVMYGGYEDQPTLQVEGASSLFTENVLAFLYAALINGSTWWLSSSRIAVDRFNEWAVHNGMTTVGNTDCFSILAAKTGVDVQRLLASIQSLHKNFGGKQILGHTSLTDEFTTGEVVRQMYGVNLQGGYVSRACRNVLLVGSFLTFFWSELVSYTKFFWVNPGYVTPMFACLSLLSSLLMFTLKHKTLFFQVFLIPALIVTSCINLAFDVEVYNYLAEHFDYHVSLMGFNAQGLVNIFVCFVVTILHGTYTWRFFNTPASSVTYVVALLTAAYNYFYASDILSCAMTLFASVTGNWFVGAVCYKVAVYMALRFPTFVAIFGDIKSVMFCYLVLGYFTCCFYGILYWFNRFFKVSVGVYDYTVSAAEFKYMVANGLRAPTGTLDSLLLSAKLIGIGGERNIKISSVQSKLTDIKCSNVVLLGCLSSMNVSXNSTEWAYCVDLHNKINLCNDPEKAQEMLLALLAFFLSKNSAFGLDDLLESYFNDNSMLQSVASTYVGLPSYVIYENARQQYEDAVNNGSPPQLVKQLRHAMNVAKSEFDREASTQRKLDRMAEQAAAQMYKEARAVNRKSKVVSAMHSLLFGMLRRLDMSSVDTILNLAKDGVVPLSVIPAVSATKLNIVTSDIDSYNRIQREGCVHYAGTIWNIIDIKDNDGKVVHVKEVTAQNAESLSWPLVLGCERIVKLQNNEIIPGKLKQRSIKAEGDGIVGEGKALYNNEGGRTFMYAFISDKPDLRVVKWEFDGGCNTIELEPPRKFLVDSPNGAQIKYLYFVRNLNTLRRGAVLGYIGATVRLQAGKQTEQAINSSLLTLCAFAVDPAKTYIDAVKSGHKPVGNCVKMLANGSGNGQAVTNGVEASTNQDSYGGASVCLYCRAHVEHPSMDGFCRLKGKYVQVPLGTVDPIRFVLENDVCKVCGCWLSNGCTCDRSIMQSTDYGLFKRVRGSSAARLEPCNGTDTQHVYRAFDIYNKDVACLGKFLKVNCVRLKNLDKHDAFYVVKRCTKSAMEHEQSIYSRLEKCGAIAEHDFFTWKDGRAIYGNVCRKDLTEYTMMDLCYALRNFDENNCDVLKSILIKVGACEESYFNNKVWFDPVENEDIHRVYALLGTIVARAMLKCVKFCDAMVEQGIVGVVTLDNQDLNGDFYDFGDFTCSIKGMGVPICTSYYSYMMPVMGMTNCLASECFVKSDIFGEDFKSYDLLEYDFTEHKTALFNKYFKYWGLQYHPNCVDCSDEQCIVHCANFNTLFSTTIPITAFGPLCRKCWIDGVPLVTTAGYHFKQLGIVWNNDLNLHSSRLSINELLQFCSDPALLIASSPALVDQRTVCFSVAALGTGMTNQTVKPGHFNKEFYDFLLEQGFFSEGSELTLKHFFFAQKGDAAVKDFDYYRYNRPTVLDICQARVVYQIVQRYFDIYEGGCITAKEVVVTNLNKSAGYPLNKFGKAGLYYESLSYEEQDELYAYTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRGASVVIGTTKFYGGWDNMLKNLIDGVENPCLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHTTCCSSTDRFFRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYLKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSANVNKLLSVDSNVCHNLEVKQLQRKLYECCYRSTIVDDQFVVEYYGYLRKHFSMMILSDDGVVCYNNDYASLGYVADLNAFKAVLYYQNNVFMSASKCWIEPDINKGPHEFCSQHTMQIVDKEGTYYLPYPDPSRILSAGVFVDDVVKTDAVVLLERYVSLAIDAYPLSKHENPEYKKVFYVLLDWVKHLYKTLNAGVLESFSVTLLEDSTAKFWDESFYANMYEKSAVLQSAGLCVVCGSQTVLRCGDCLRRPMLCTKCAYDHVIGTTHKFILAITPYVCCASDCGVNDVTKLYLGGLSYWCHEHKPRLAFPLCSAGNVFGLYKNSATGSPDVEDFNRIATSDWTDVSDYRLANDVKDSLRLFAAETIKAKEESVKSSYACATLHEVVGPKELLLKWEVGRPKPPLNRNSVFTCYHITKNTKFQIGEFVFEKAEYDNDAVTYKTTATTKLVPGMVFVLTSHNVQPLRAPTIANQERYSTIHKLHPAFNIPEAYSSLVPYYQLIGKQKITTIQGPPGSGKSHCVIGLGLYYPGARIVFTACSHAAVDSLCVKASTAYSNDKCSRIIPQRARVECYDGFKSNNTSAQYLFSTVNALPECNADIVVVDEVSMCTNYDLSVINQRISYRHVVYVGDPQQLPAPRVMISRGTLEPKDYNVVTQRMCALKPDVFLHKCYRCPAEIVRTVSEMVYENQFIPVHPDSKQCFKIFCKGNVQVDNGSSINRRQLDVVRMFLAKNPRWSKAVFISPYNSQNYVASRLLGLQIQTVDSSQGSEYDYVIYAQTSDTAHASNVNRFNVAITRAKKGILCIMCDRSLFDLLKFFELKLSDLQANEGCGLFKDCSRGDDLLPPSHANTFMSLADNFKTDQYLAVQIGVNGPIKYEHVISFMGFRFDINIPNHHTLFCTRDFAMRNVRGWLGFDVEGAHVVGSNVGTNVPLQLGFSNGVDFVVRPEGCVVTESGDYIKPVRARAPPGEQFAHLLPLLKRGQPWDVVRKRIVQMCSDYLANLSDILIFVLWAGGLELTTMRYFVKIGPSKSCDCGKVATCYNSALHTYCCFKHALGCDYLYNPYCIDIQQWGYKGSLSLNHHEHCNVHRNEHVASGDAIMTRCLAIHDCFVKNVDWSITYPFIGNEAVINKSGRIVQSHTVRSVLKLYNPKAIYDIGNPKGIRCAVTDAKWFCFDKNPTNSNVKTLEYDYITHGQFDGLCLFWNCNVDMYPEFSVVCRFDTRCRSPLNLEGCNGGSLYVNNHAFHTPAFDKRAFAKLKPMPFFFYDDTECDKLQDSINYVPLRASNCITKCNVGGAVCSKHCAMYHSYVNAYNTFTSAGFTIWVPTSFDTYNLWQTFSNNLQGLENIAFNVLKKGSFVGDEGELPVAVVNDKVLVRDGTVDTLVFTNKTSLPTNVAFELYAKRKVGLTPPITILRNLGVVCTSKCVIWDYEAERPLTTFTKDVCKYTDFEGDVCTLFDNSIVGSLERFSMTQNAVLMSLTAVKKLTGIKLTYGYLNGVPVNTHEDKPFTWYIYTRKNGKFEDYPDGYFTQGRTTADFSPRSDMEKDFLSMDMGLFINKYGLEDYGFEHVVYGDVSKTTLGGLHLLISQVRLACMGVLKIDEFVSSNDSTLKSCTVTYADNPSSKMVCTYMDLLLDDFVSILKSLDLSVVSKVHEVMVDCKMWRWMLWCKDHKLQTFYPQLQASEWKCGYSMPSIYKIQRMCLEPCNLYNYGAGVKLPDGIMFNVVKYTQLCQYLNSTTMCVPHHMRVLHLGAGSDKGVAPGTAVLRRWLPLDAIVVDNDSVDYVSDADYSVTGDCSTLYLSDKFDLVISDMYDGKIKSCDGENVSKEGFFPYINGVITEKLALGGTVAIKVTEFSWNKKLYELIQKFEYWTMFCTSVNTSSSEAFLIGVHYLGDFASGAVIDGNTMHANYIFWRNSTIMTMSYNSVLDLSKFNCKHKATVVVNLKDSSISDVVLGLLKNGKLLVRNNDAICGFSNHLVNVNK

Summary

ProteinModelPortal
PDB
6NUS     E-value=0.0     Score=1165     Identity=59.31%     Cov(Q)=13.77%     Cov(P)=97.80%

Ontologies

Subcellular Location

From MSLVP
Capsid

Topology

Length:
6781
Number of predicted TMHs:
18
Exp number of AAs in TMHs:
415.250909999995
Exp number, first 60 AAs:
0.01219
Total prob of N-in:
0.00104
outside
1  -  1962
TMhelix
1963  -  1982
inside
1983  -  2019
TMhelix
2020  -  2042
outside
2043  -  2102
TMhelix
2103  -  2125
inside
2126  -  2131
TMhelix
2132  -  2151
outside
2152  -  2154
TMhelix
2155  -  2177
inside
2178  -  2527
TMhelix
2528  -  2550
outside
2551  -  2622
TMhelix
2623  -  2645
inside
2646  -  2656
TMhelix
2657  -  2676
outside
2677  -  2752
TMhelix
2753  -  2775
inside
2776  -  2781
TMhelix
2782  -  2804
outside
2805  -  2829
TMhelix
2830  -  2852
inside
2853  -  2864
TMhelix
2865  -  2887
outside
2888  -  3331
TMhelix
3332  -  3354
inside
3355  -  3360
TMhelix
3361  -  3383
outside
3384  -  3397
TMhelix
3398  -  3420
inside
3421  -  3426
TMhelix
3427  -  3449
outside
3450  -  3458
TMhelix
3459  -  3481
inside
3482  -  3500
TMhelix
3501  -  3520
outside
3521  -  6781
 
 
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