Strain
Bat_MG916904
(Region: China; Strain: Bat coronavirus BtCoV/Rh/YN2012 isolate BtCoV/Rh/YN2012_Ra13591, complete genome.; Date: 1-Jun-13)
Gene
ORF1a
Description
Annotated in NCBI,
ORF1a
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGATTGCAACCAAATAACGTTGGCTTTTGCCAATGACTCAGAGATTTCAGCTTTTGGATTTGGCACCGTCGAAGAGGCCGTCTCACATTATAGTGAGGCCGCTGCTGATGGTTTTACCAAATGCCGATTTGTCACTGCGAGTCTTCTGGATATAGTCACGGGAGTGTTGGATGATGAGTATGTCCTCTGTATTAGTGGTCTTCATCAACTAACAGCTCGCATTGGTAAATTCGGTGACCGCCCGAGTAACTTTAGGGGCTGGTTGCTGTTCTCCAACTCTAACTATTTTCTTTCGGAGTTGGATCTTGTCTTCGGAGGACGTGGTGGTAACACTGTCTACGTAGACAACTATATGTGTGGTGCCAATGGTCTTCCCGTATTGTCTGAGGACATATGGGAGTTTAAAGACTATTTTGGTGAACTAACAGAGATGTGTGTGAATGGCACCACATATACTAAGGCTTGGAATGTTGACCGTGTTGATGTTCCTTTTAAAAGCCAGAACTTGTTGGCTATTAATGCCATTACCTGGTGTCTCGATGTCCCTCATACTTTGCCTGATGGTGCCACCACTACCACTGCACCCCCTGTACGTAAAAATAAGGCTGTTGTGCTTGATAAGTACTATGCCAAACTTTACGATGCTGTTGGAGTGCCTTTTGTGCGTAATGGTAATGTATTGAAGGATGTTGTGGCCAAACCAGTGTTTTTACATGCACTTATCAAGTGTCATTGTGGTGTCACTAGCTGGACAGTGGGAGACTGGGGTTGTTACAAGTCCACCTGTTGCGGTGTGTCTTGTAAACCAATTTGCGTCTCTAGTGGTGATGTCCGTGCTGGTGATGTTGTTTTTACAACTAACAAGGTTTCACCTACTGGCTCTAAGTACTATAATGGTATGGTGCTTAAATTTGTTGACACTGTTGATGGTGTGCACTTGTGGCGTGTCATTAAATTACAGAGTGTCAACGGGTTAGTTGCGTCAGCCAACTATGATGCAGCTGAGTACGTCTACTTGAATGAACACATTTGCAGTCCAGCTAACATGCTTGAGCTAGCCTTTTGCTTTAAGTTTGGAATGCTTAGTGGTGTGTTCGATGATGATGTGAGAAATGCTGTGGTTAATGGTACTATTGTAGTCAGCAATGTTATCCTTGATGTTACAGACACTGTACTTGTCAAACCTTGGTTTGTTCGTAACTTGTCTGAGTTGATTGGCAGTGCTTGGAACACTTTTGTGACTGGTGTAAAGCAGTTGTGTTACACTAGTGCACAATTGATAGAACTTGTTAAGGCTTTTGCTAAGGCAACTTTAGTTGCAACTAGTGAAGGCTTAAAATTCACAGCTGTGGTGCCAGAGTGTTTCAAAACCTGCTTTGAAATTTTCAAAGAATTTGTTAATGGTGTGTTTGATCTCACTGTTAAAACTTTTAAAGTTGCTGGTGTCTCTTTTAAAAGCGTAGGATCTTATATTTTGTTGAACAATGCTTTGGTGAAGCTTGTTTCAGTTAAAGTTAAAGGTCTACGTGAAGCTGGTTTGACTAGTGCCCAGTATGCCGAAGTGGTCTTGGGTAAGACTACTAAGGTGAGAGCAAAGAGACTAGAAGCATCTAATGTTAACCTTAAACTTGTTGAGAATCAGCCAGTTGTAAAAGAGGGCATTGCTAAGATCATTGGTGGTATTACCTTCTTTGAAAGTGGTGGTTACTACAGATTCATGAGTGATCATGATGTTGTTCTCAACACACCCGTTTTTCAGGCTGTAGTATCTTACACACCAGTCTTTGAGTGTGTTAAGCCAAAAGACTTTGTCACACCTACTTGTGACACATTACCTGAACTTGTTACTGCAACAGTCACTGAGTTGTTAAAGTTGAACACACCTTATAGAGTTTACGATGTTAAAGTTGTGAACAATAAGTGTGTTGTCACTTGCCGTTATACATTCAGAGCTCCGTCTTATATCACAAATGTTGATGCTTTTATAAAGGCATGTGAGTGTTGTGTGGACAAAGAAGGCTTTGAAGATTTCTATGTCAATGCACATGCTAATACTATGTTGGCATCTTTTGAGCCTGTCTTTGACGAATTTAAACAATTCACTATGCCTGCTGTTTGTGCTCCACCTTTGCTTGAAGAAATTGATGGTGGTTCTATCTGGAGTTCGTTCATTAAGACTGTTGCTAATGCTGTTGATTTTGCTAAAAACTTAACTGTTAGTTTTGATCTGAGTGGTATAGTTTTCAAGACTGTAAAGCGCTTTAAGCGATTTGCATCTGTTTTGACTAACCTCTACAGAGAGTTCATTGCTACAGTTACACAGGCGATTAGTATTGGTGGTGTCACATTTACTTACTATGCCTTCAATGTTCCCAAAGTCTTCATTTCAGGAGTTTTACACACTGTTAGACGTGTTTCATTAAGTTCCTTCAACATACCTGTAGAGGATGTTGGAACTGATGTGCATGTCTTTGATGGTACCTCTATACCAATAACAGCGGTTAGAGTTGAGCAAGTTGTTGTTAAATTTGAGGAATCAGACTTTGTACAACCTGCTTCTAATGGTGTGTTGGCAGTCATTGATAATCATACATTTTATAACACTGGCAATTATTACTACCCTGCTAATGAAACTGCAATTTTGCCTATTTGTTTCAAACGTAGTGGTGGTGGTGTTGTCCAGTTTGCTGAGACAGTGGCTGTTAAAGAAATTGAACCTGTTTATAAAGTTAAGCTTGACTTTGAATTTGAAGACGAGAATATAATGGCTGTCTGTAAGAAAGTTATTGGTCGTGTTCTAACCTGTGATGGTGATGACTGGGATGCAATGTGTACTCAAATAGACACAGTCATGACAGTCATCAATGAACACTTACCAGTACCCAAGTACTTCATATATGATGAAGAAGGTGGTAAAGACCTTACTAAAACAGTTATGATATCACAATGGGCCATTGAAGAGCCAGTAAATGAAGGAATTGTTGTCTCACCTGTATCTGATGATATACAACAGGTTGAAAAGGCTTTATCTTTCATAGAGGATGTTAAAATGGAAACAACACCAAAAAGTGTTTTTGCATTTGAGTTCTATGAAATTAATGGATTAAAAGTCTTGCAACAGTCTGCTAACAATTGCTGGGTTGCATCTACATTAGTGCAGCTGCAATTGATAGATTGTTATGAAAGTACTGCTTTTGATTTGTTTAAGGCTGGTCGTGTTGCACCTATGGTACAGAAGTGTTATGAAGCCACAAATAACATCTGGGGTAGCCTTGGTGACGTTTCTCATTGTCTAGAAGTCCTACTTAAAGATCTACACACAATGTTTATACATTGTTCTGTGGAATGTAAGTGTGGACAGACATTTGATGATTTGAGTGGTTGCTTGTTTCGCTTTATACCTACTAACAAACCATTCCCTTATGGTGGTTGTTATAATTGTGGTGCCACACGCATGTACACAATACTTTCGATGAAGGGTACAGGTGTTTTCTGTCAAGAGCCAGTTCCTCTTGATGTTAGTACGCTATTATTAGAACCTCTTTGTGCCTCAGTTTTTATGGGTAGTCATTATAAGACTAACATCTACAAGTACAATGTCTGTGTAGATGGTAGTGGTCGTCAGCAGATAGGTTGGAATACCATTAACACTGTCTGCTTTAAAGATGTTGACTACTGCAAGGTTGCTGAACCCAAACCATTTTTAGTTCACAAGAATGTCTCATTCTTTCAAGGTGAGATTAAAGACTTACTTAGTATTCCGCATGATTTTATAGTTAACGCTGCCAACGAAAACCTTAGCCATGGAGGTGGTGTAGCTGCAGCAATTGATAATTTGACCAAGGGTCAATTACAAAAATTGTCTACAGCACATGTTAAAGCCAATGGCAAAGTGAAGGTTGGTGGTGGTGTCATGCTCAAGTGTGAGAAACACTCAGTACTGAATGTTGTGGGTCCTCGCAATGGTAAACATGCACCTACATTGCTAGAAAAAGCTTATGGTACCGTTTTTAATGAATCCGGTATACCATTAACACCCTTGTTGAGTGTTGGTATATTTAAAGTACCACTTGAGACATCTTTAGACGCTCTTTTCAATGTTGTGGGTGATAAAGTTGTTAAATGCTTTTGTTACACTGATGTGGAGCGTGAAAAGATTGTTAAATATGTGAGTACAAAGGTACCGGCTGTTATTAGCACATATGATGTGTGTACTACTGCTGTTGTACAAACTGCACCATTGATGGTTGCAGAGGTTGTTCAGCCTGAAGTGGTTGCAGAATTGCCACAACCATATAGAAGTGAAGGAAAATTTGATTTTTACGATGTGAGTGTCAATTCTTTACTTTCACTTAAACCTGATAGGTTTGTCTTTTACACAGATTCTACATTTATCTTAGACACTATTGCCAAAGAGTTTGATGCTTTGGTTGAAGGTGGTCTTAGTGCATGTTTAGAGGCTTATAAGAAGGACAATAATTTAACTCCGCCAGGTAACCTTGTGTCTTTTAAATGTGACAATGCTGTTACTGTTAGTTTTGCTATCTTACCTAAAAGTGATGATGTCACTTATGACAAGAATGTCATGCGCACAGTCACTAAGATTTCAAAACTTAAAGGTCGTGTTTTGTCAACTGTGCCAACACTAGATGTCTTACGTAAAGTCTTAAAGTGTTGTACTTTAGCTTTTGTCACAGATGCTGTTACTAAAGATGTTGTGTCAGAGTGTTTTGACATTCAGGATGTTACAGTTAAGGTTACAGAAAATGGTAGAGATGTTAAGAATGTTACTGTCACTAGTGCTGTGGTTATTGATGCGCAAGTTGGTGCTTGTAGCATGAATAACTTCGATCTCACTGGTGTTAAACCTGACAACGCAATTACAGATGTTGTTAGTACAGCACCAGATGTCGATTGGATTGCTTATTACGGTTTTCCACGAGCAGATGTGTGGCACACCCTAAATCATGATGCTTACAATTTTGATAATAAGGAATT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AAATTTTTGACCACCATGTTTCTTTAATCAGTTTGGATATACAGGGTGTGCTTAATATTCTTACTTGTGTGTTTGTCACTCTGTTACACACATATAGATTCTTTAGAAGCAACTCCTCTGTAACCACTTATGTGTTATCTTTGTGTTTTATGGCTTATGGATTTTATATTGGTTCTGATGCTCTTAGTATGGTTATGATGATTCTTTTCAATTTTACCACTAATTGGTATATTGGTGCTATAGCTTATAAAATAGCTTTTTATTTAGTGCAGTATACTATGTGGCCTAACCTTCTAGGTAGTGTTAAAGCTATCATGTTGTGTTATGTTTTGATTGGTTATATCTGTTGTGTCTATTATGGTCTGTTGTATTGGATCAATAGATTTTTCAAACTTACACTGGGTGTTTATGATTTTAAGGTTAGTGCCAATGAGTTTAAATACATGGTTGCTAATGGTTTGCAAGCCCCTAAGGGTGTTTTTGATGCCGTTGCACTATCAATTAAACTTATAGGTATTGGTGGTGATAAGACTATTAAAGTTTCATCAGTGCAGTCTAAATTAACAGATATTAAGTGTACAAATGTTGTTCTTCTTGGTTGTTTGTCTAGCATGAATATTGCTGCAAACACTAAGGAATGGGCATATTGTGTTGAGTTGCATAACAAAATAAACCTTTGTGATGACCCTGAAGTTGCACAAGAATTGCTCTTAGCTCTCTTGGCATTTTTTCTTAGTAAACAAAAAGATTTTGGTGTTGATGATCTGCTTGATTCGTACTTTTCAACTGGTAGTATTCTTCAGAGTGTGGCGTCGACATTTGTTAATATGCCTTCTTTTATTGCATATGAGAATGCGCGTCAGGCTTATGAAGATGCTCTTAATACAGATGCTTCACCTCAGTTGATCAAACAGCTTAAGAGGGCTATGAATATAGCTAAGGCTGAATTTGATCATGAAGCTTCTGTACAAAAGAAAATCTCACGTATGGCTGAGCAAGCAGCTGCACAAATGTACAAAGAGGCTAGAGCTGTTAATAGAAAATCTAAGGTCATTAGTGCTATGCACTCTCTTTTGTTTGGTATGCTTAGGCGTCTGGATATGTCAAGTGTTGATACAATTCTAAACTTGGCTAGGGATGGTGTTGTGCCATTATCCATTATCCCAGCCGCTTGTGCTACTAAATTGAATGTTGTCAGTGCAGATTTGGATTCTTATCTCAAGATATGCAAAGATAGCTGTGTGCATTATGCTGGTGTTGTCTGGAATGTAATAGACATTCGTGACAACGACGGTAAAATAGTGCACATGAAAGAAGTTACACAAGAGAATAGTGATTCTTTAGCATGGCCTTTGTTCCTTAATTGTGAACGTGTTGTTAAATTACAAAACAATGAAATCATGCCAGGCAAATTGAAACAGCGTGCTGTTAAAGCTGAAGGTGATGGTTTTTCTGCTGATGGTAAAGCTTTGTACAATAATGAGTCTGGTAAGACCTTTATGTATGCTTTTGTAGCTGATAAACCTGATCTTAAATATGTAAAATGGGAGTTTGATGGTGGTTGTAATACCATCGAATTAGAACCCCCTTGTAAATTTGCAGTTGAAACCACAAATGGCACTGTTATTAAGTATTTATACTTTGTACGCAATCTTAATACATTGCGTAGAGGTGCTGTATTAGGCTTCATTGGTGCTACAGTTCGTTTACAAGCTGGTAAACAAACGGAGTTAGCAGTTAACTCATCGTTGTTGACTATGTGCGCATTCGCTGTAGACCCTGCAAAAACATACTTAGACGCTGTTAAACGTGGTGTCAAGCCAGTTGGTAATTGTATCAAAATGTTATCTAATGGTGCGGGCACTGGCCAGGCTATAACTACAGGTGTTGAAGCTAATACTAATCAAGATAGTTATGGTGGCGCATCTGTTTGTCTCTATTGTCGTGCTCATGTTGAACACCCGTCAATGGATGGCAGATGCAAGTTTAAAGGCCGCTACGTACAAGTACCATTGGGTACTATAGATCCAATACGTTTCTGTTTAGAAAATGACACATGTAAAGTTTGTATGTGCTGGTTGAATAATGGGTGTGCTTGTGATAGATTTTCGTCTGTGCAATCATTAGACACTGGTTATTTAAACGAGCAGGTGGCTCTAGTGGTGCTCAACTAG
Protein
MDCNQITLAFANDSEISAFGFGTVEEAVSHYSEAAADGFTKCRFVTASLLDIVTGVLDDEYVLCISGLHQLTARIGKFGDRPSNFRGWLLFSNSNYFLSELDLVFGGRGGNTVYVDNYMCGANGLPVLSEDIWEFKDYFGELTEMCVNGTTYTKAWNVDRVDVPFKSQNLLAINAITWCLDVPHTLPDGATTTTAPPVRKNKAVVLDKYYAKLYDAVGVPFVRNGNVLKDVVAKPVFLHALIKCHCGVTSWTVGDWGCYKSTCCGVSCKPICVSSGDVRAGDVVFTTNKVSPTGSKYYNGMVLKFVDTVDGVHLWRVIKLQSVNGLVASANYDAAEYVYLNEHICSPANMLELAFCFKFGMLSGVFDDDVRNAVVNGTIVVSNVILDVTDTVLVKPWFVRNLSELIGSAWNTFVTGVKQLCYTSAQLIELVKAFAKATLVATSEGLKFTAVVPECFKTCFEIFKEFVNGVFDLTVKTFKVAGVSFKSVGSYILLNNALVKLVSVKVKGLREAGLTSAQYAEVVLGKTTKVRAKRLEASNVNLKLVENQPVVKEGIAKIIGGITFFESGGYYRFMSDHDVVLNTPVFQAVVSYTPVFECVKPKDFVTPTCDTLPELVTATVTELLKLNTPYRVYDVKVVNNKCVVTCRYTFRAPSYITNVDAFIKACECCVDKEGFEDFYVNAHANTMLASFEPVFDEFKQFTMPAVCAPPLLEEIDGGSIWSSFIKTVANAVDFAKNLTVSFDLSGIVFKTVKRFKRFASVLTNLYREFIATVTQAISIGGVTFTYYAFNVPKVFISGVLHTVRRVSLSSFNIPVEDVGTDVHVFDGTSIPITAVRVEQVVVKFEESDFVQPASNGVLAVIDNHTFYNTGNYYYPANETAILPICFKRSGGGVVQFAETVAVKEIEPVYKVKLDFEFEDENIMAVCKKVIGRVLTCDGDDWDAMCTQIDTVMTVINEHLPVPKYFIYDEEGGKDLTKTVMISQWAIEEPVNEGIVVSPVSDDIQQVEKALSFIEDVKMETTPKSVFAFEFYEINGLKVLQQSANNCWVASTLVQLQLIDCYESTAFDLFKAGRVAPMVQKCYEATNNIWGSLGDVSHCLEVLLKDLHTMFIHCSVECKCGQTFDDLSGCLFRFIPTNKPFPYGGCYNCGATRMYTILSMKGTGVFCQEPVPLDVSTLLLEPLCASVFMGSHYKTNIYKYNVCVDGSGRQQIGWNTINTVCFKDVDYCKVAEPKPFLVHKNVSFFQGEIKDLLSIPHDFIVNAANENLSHGGGVAAAIDNLTKGQLQKLSTAHVKANGKVKVGGGVMLKCEKHSVLNVVGPRNGKHAPTLLEKAYGTVFNESGIPLTPLLSVGIFKVPLETSLDALFNVVGDKVVKCFCYTDVEREKIVKYVSTKVPAVISTYDVCTTAVVQTAPLMVAEVVQPEVVAELPQPYRSEGKFDFYDVSVNSLLSLKPDRFVFYTDSTFILDTIAKEFDALVEGGLSACLEAYKKDNNLTPPGNLVSFKCDNAVTVSFAILPKSDDVTYDKNVMRTVTKISKLKGRVLSTVPTLDVLRKVLKCCTLAFVTDAVTKDVVSECFDIQDVTVKVTENGRDVKNVTVTSAVVIDAQVGACSMNNFDLTGVKPDNAITDVVSTAPDVDWIAYYGFPRADVWHTLNHDAYNFDNKELDGMRVLKFSDNNCWVNAVCIQLQKAKTLFKTEGIQNMWNDFLVGNVAKFVHWLYWYQDAGKGDSGDVEYTLNTLTRYMVNSGKITVVRSTSSKCCNKSRTYTTPVFSASVLRAGYEDGVCAHGETIHCSVTEVSGTVVIVSPSRPTVHNANLLLRGDSYTVYSGDVKDGHYSVFVHGGRIYDGDTVSGGNDLSLCAVTSVVVTNFLNTVKPVAVRSAPTVIETLDSASEKFFTFGDVVTRNMATAFVWLFSMFSLCVKAFKNKDFKVLAKAPERTGVILGRSFKYNFKASKQFLLSRVLWVKLFGKFLLALFAVYAVWFLMVRFGPLNDVMCTSYVEGYAKSNFDKNSYCDSVTCRTCLYGYQQLSDFPHTSIVWEHVRDPLFRRVVPMFYMAFLLIFGGVIMRACMLYFVAQYVNGIGVLFGLQDNVALLQLIPFDVFGDEIVVMFVVFKCLLFVKHIFLGCDKPSCVACTKSARLTRIPLQTIVNGSSKSFYVFANGGKKFCSKHNFFCVNCDSYGSGNTFINDVVASEVSNVTKTSVLPTGPATIDISRVEFSNGFYYLYGADGSKFWRYNFDITESKYSCKEVIKNGNVLSDFIVYNNTGSNVTQVRNACVYFSQLLCKPIKLVDSALLATLNVDFNGALHSAFVDVLKESFNKDLSSCTTMSDCKVALDIDAEDEDFVNCVSNAHRFNVLLTDLSFNNFVTSYAKPDEKLSTHDIAACMRGGAKVVNHNVLVKEQVPVVWLARDFNMLSEEGRKYVVKTAKLKGVNFMLTFNTNRMQTSIPAISVAGKNGSGIKRCYNYVWWLCACAVFLFFAVGLLDFTSTVASATDYDFKYIKGGKLHTFDSGLDCVHNVFSNFNEWFHAKFGYVPRNSKSCPIIVGVSDEARTVPNIPSGVYLFDKTLVFATKTVFSPSTNCYDIRGPSDAAECVFNSACTTLSGLGGLVTYCFKHGLVENSKLYTDLLPHNHYSTADGGFIKLPEVITSGFGFRTVRTKETTYCRMGQCIDSKAGVCFGADRFLVYSAESGSDFVCGTGLWSLLLNVLGIFSSSFSVMAMSGQIMFNCFVAFLVVVSCLMITKFKRMFGELSFGVCTVVCVALVNNISYIVTQNILVMVCYAVLYFLCTRTFRYAWIWHIGYCIAYATMAPWWLIFWYLCSALTGLIPSLLKLKVTTQLFDGDKFIGTFETAAAGTFVLDMHSYQRLVNSIAPEKLKQYAASYNRYKYYSGSASEADYRCACYAHLAKAMLDYGTNHQDILYSPPTISYNSTLQSGLRKMAQPSGVVEKCVVRVCYGNMVLNGLWLGDTVLCPRHVIASSTTNVIDYDHEYNIMRLHNFSVSVGNVFLGVIGVTMKGTLLHIKVNQTNVNTPNYVFKTLKQGDTFNILACYDGVPSGVYGVTLRTNHTIRGSFINGACGSPGYNLNNGKVEFCYLHQLELGSGCHVGSTMDGTMYGNFDDQPTLQIEGANHLVTVNVLAFLYGALLNGVNWWLTGDRVTVESFNEWCLNNGFTTLTCVDSFAMLAAKTGVDVQRLLAAVQRLHKGFGGKNILGFTTLTDEFTIGEVIKQMYGVTLQSNKISGSFSNLAIVGVFLTMFWSELLHYTAFFWVSPGFVTPVFFVLLFVSILFMCLLKHKMLYLYTFLIPAVVVISCCNFAWDWYVTSILAEIFDHHVSLISLDIQGVLNILTCVFVTLLHTYRFFRSNSSVTTYVLSLCFMAYGFYIGSDALSMVMMILFNFTTNWYIGAIAYKIAFYLVQYTMWPNLLGSVKAIMLCYVLIGYICCVYYGLLYWINRFFKLTLGVYDFKVSANEFKYMVANGLQAPKGVFDAVALSIKLIGIGGDKTIKVSSVQSKLTDIKCTNVVLLGCLSSMNIAANTKEWAYCVELHNKINLCDDPEVAQELLLALLAFFLSKQKDFGVDDLLDSYFSTGSILQSVASTFVNMPSFIAYENARQAYEDALNTDASPQLIKQLKRAMNIAKAEFDHEASVQKKISRMAEQAAAQMYKEARAVNRKSKVISAMHSLLFGMLRRLDMSSVDTILNLARDGVVPLSIIPAACATKLNVVSADLDSYLKICKDSCVHYAGVVWNVIDIRDNDGKIVHMKEVTQENSDSLAWPLFLNCERVVKLQNNEIMPGKLKQRAVKAEGDGFSADGKALYNNESGKTFMYAFVADKPDLKYVKWEFDGGCNTIELEPPCKFAVETTNGTVIKYLYFVRNLNTLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTELAVNSSLLTMCAFAVDPAKTYLDAVKRGVKPVGNCIKMLSNGAGTGQAITTGVEANTNQDSYGGASVCLYCRAHVEHPSMDGRCKFKGRYVQVPLGTIDPIRFCLENDTCKVCMCWLNNGCACDRFSSVQSLDTGYLNEQVALVVLN
Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR009466
NSP11
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IPR014829 NSP8
IPR042515 Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR014827 Viral_protease
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR036499 NSP9_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
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IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR037227 EndoU-like
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037230 NSP8_sf
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IPR013016 Peptidase_C30/C16
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IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
5HYO
E-value=4e-157 Score= 488 Identity=73.09%
Cov(Q)=7.42% Cov(P)=100.00%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
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GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
4057
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
397.301569999999
Exp number, first 60 AAs:
0.00271
Total prob of N-in:
0.00072
outside
1 - 1904
TMhelix
1905 - 1927
inside
1928 - 1964
TMhelix
1965 - 1987
outside
1988 - 2056
TMhelix
2057 - 2079
inside
2080 - 2470
TMhelix
2471 - 2493
outside
2494 - 2724
TMhelix
2725 - 2747
inside
2748 - 2753
TMhelix
2754 - 2771
outside
2772 - 2774
TMhelix
2775 - 2794
inside
2795 - 2800
TMhelix
2801 - 2823
outside
2824 - 3137
TMhelix
3138 - 3160
inside
3161 - 3245
TMhelix
3246 - 3265
outside
3266 - 3279
TMhelix
3280 - 3299
inside
3300 - 3305
TMhelix
3306 - 3328
outside
3329 - 3342
TMhelix
3343 - 3365
inside
3366 - 3376
TMhelix
3377 - 3399
outside
3400 - 3408
TMhelix
3409 - 3431
inside
3432 - 3437
TMhelix
3438 - 3460
outside
3461 - 4057
