Strain
Avian_MH532440
(Region: Poland; Strain: Quail deltacoronavirus strain G032/2015, complete genome.; Date: 3-Mar-15)
Gene
replicase polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
replicase polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGCCAAGAACAAATCCAAGCGCGACGCTATAGCGTTGCCTGAAAAAATACCACCACCGCTGCAGCTGTTTATTCATGTGGCTGCTGCTGAGGAGGGTCATCCTAAGGTTACCTCTTATCTTGGGAACTATAATTTGTACACCGCAAAGGCTCCGCCTGGTATGCAGGTTATTGATACCAAAGCCTCACTTACTGACTTTGAGAATATCTTTGGGGCTCAACCCACCTTGCGATCCATTCGCAATTTGGTTTGTGAGGCACGCTCGGCTGAGTGGTCCACCTCCAAGGATGCATTCGCACTCAAAGCAAAACAACTTAACTACTCTGATGCTGTCTTGAGGGCAATGATTCGTTTTTGTCCTGCCAAGATTTCTGCACTTGCTGCATTGTCACTTTTCTACCGGCTGGTTAAAATTGATGACGATGAACTCTCAGCATTAGCCGCTGCTACTGCCCTTGAATTGGCGTATATGGCTAAGATTGGTACAACTCTCGCGGACGCGAGAGTTGTTTCACTTACTCATAAGGACTCCTACCTCACTCTTAGCAATGAGGTACTAGGTGTTCCTTTTACTGCAACACTTATGGCAAAGGCTACCACTATTAATGGGGCCATGCAATATCTAAACTTCTACTTTTACCCTCGTGGCACCATTAAAGTCATTGATGGTAAAGCTGAAGCCATTTCCACCAAACTCTTGGCGGCTACTGTTATAGGTAAGCCAATCACAGAGGATGTTAACTTGCTCCCTGACTATCATCAGTTACTTGTTGACCAAGTTAATGGAACTGAAGTTAAGGTTGGAGCTATTACCTACGTTAAAACCACTGATTCCCCACCTCTCTACTTTCCTAAAGTGAGAGGTGGCGTCATTGGTATTGCACTTAAACAGCAGGGCACTGCGACTAAGAGACTCAATGTAGTCTTTCACGCCCAGCCTAATGATGTTCTGCTGGCTTTTATTCAACTTCAGCAGTTCTTGAACCGTACCACGGATTCAAGTGTTGAAATTATTGATAGCCAGAGACATATGATCTACGAGGTGTCACCAACTGTGACGGTCAGGATTGGACCGTCTAAACCTGGTGATGTAGTCGTAGCTACTGATGAGGAGTACCTTAAATGCTTTGACACCCCTGAGGTTGGTAAGCTTTATAGAATCTTTCAAACACAATCCTGGGCCATAATTGAGCGCAAATTTTCCTCTTTGAGAGTGCGCGTGTCGAATGCCCTCTATCAATTTATAAGTTTCCTGCAAACTCTTGTTGAAAACTTTTCTCCACTTGCTGGTGTTGTCACTGGACTCATTCATGAGTTACAGAATCTTACTCTGGATGTGGCGGCACGTATTACTAATATCCAACTTGTTTACCGCGCTGGTAAACTCATTGTTGATACCACCAATGCCATTGCTAAACTCCTCCAGCCACTGTGTGACTTTTTGTCACCCTTTCTTCGTAAGGTCGCTGGTTTTGCAGTTTACACTGTTGGTAACCGTATGCTTATGTTTACCAGCTGTGGCACTTTTCTCTTGACTAAAGCAACCACTAAGATACTTAACAAGGCCAAGTACATTTTTGATGTTGACCCAGAGTATCCTGTGGATGTAACTACTTCAAAAGTTGTAGTACATGAAACCTTACAGCAAGTCAGCACTAAGCCTACTAGGGCTCTAGAGGCTGTTGATGTCGTTGTGGGTAACACTGTGCTGCAAATGGCTACAGATGGCAACACTTTCTATCCTTCAGATGGAAGTCATGCCTCACTACCAGGATTCAAAGCAGGTTCTGACGAGCTAGTAATTAGCTTTAGCTGTGACCTCTTTGATGATGATACAAATGCTCAAATCAACGAAACTCTCGCTGCATATGAGCTTAACCAACTAGTTGCTCCATGTGATTCTACTCCACGTCAAATTGCGACGCTGGTTGTGGATACACTTGTTGATGCACTAACAGATCATTTTCCAGAGAAAACCATTGACTTGCCAGGAAATTATCAAGTCTTCTCTGCTCATGATGATCTCCCTCTTGCACAACATCACATACCATCACACCTCAGCTTGTACATTCAAGCTATGGAAGGTGAAGATGATAGTGGTGATGAAATTGTTGAGGATGATGATTATGATTGTCCTCAATTAGGAGACGACACTGATGGAGCAATTCCTCAGCAATGGGACCTACCAGATGTCGACACATTCTTACTCAAACTCAAGGAACGGAATACCAGAAGCGACGAAGTACTAAGCGTTGACATACACCCAAAGCCTAGTAGGGCAGAAGTGGCCGTCTCCGCGTCGGAAAAGAAGCCTGATGGTGACCAAGTACAGAGTTTTGAAGACCCTTCTTCGGCTTCGGTCGAGACTGTGGTGTTTTCTGAATCAGCCTCTGAGGCTGTAAATTTATCTCCGCCGTCTAGCCCACAGGCAGACCTGGCAGAAAGTTCCCAACTTGAATCCGAGTTGCGTTCCTATGATGGAGACTGTAACTCTGATGATGAAATCATAATACCTATAGTACCAGACACACCTGAGGATTATAAACCTCAGTCTGTAACTATACGGGAATATTTTACCGCCCAAAAATTGGACACAATAGTTGAAGGTTCTACTGAGTCTGTTGCTACGGAAGAATCGTCTGTTTATGATTCTTGCGCTGATGCGGACCCCGAAGAACTGCAACAGGATGCTGTCTATGATGATGAAACCATCATAACGGACAGTACTGAACCAGACGATGAACCTGAAGCTACTTTGGCTACCATCGTCAATACACCACTTACTATTGATAATAACTTGCCACCTGAAGCCATCAAACAACCTAGCCCTACGAAAGTTGAGCTTGTTGTTGGCGAGCTGTCAAGTATTAAATTTGACAATTCTGTCTTAGTAAATCCAGCCAATGAGCAATTAACCAATGGCGGCGGCGCTGCCCTTGCGATTGCTAAGCTAGCTGGACCTAAATATCAAGAGTATTGTAATAGTGTGGCTCCTATTAATGGAACCCTCACTACAGACTCTTTTGATGCTAAGAAACTTGGTGTGGCTTGCATTTTGCATGTTGTGCCACCCAAAGGTTCTGACCCTAATGTCCGGGAGCTACTGTATCAAGCATACAAGAGCATCCTCACTGAGCCAGCTCACTATGTAATACCCATATTAGGAGCTGGTATTTATGGTTGCAATGCAGTACACTCACTTGATGCATTTAGAAAAGCTTGTCCTAATGACATTGGTCGTGTCACCCTTGTCACTATGAACAAGAACCACTTGGAGGTGTGGGATGCCCTTAACAGGACAGTAGTCCGCACCACTCAAGATTTTGACCAAGTTACCACCAAGGCACTAACACCCCAAGGAGTGTTGGAAGCCAATCTTTTTGACGGTGAAGACTTTGTGCAAGAACCAACACCCGGTCAACTCTACTTAGAGGTTACTGAGGAGGTTCAGAAACAAGCTAAGGAATTAGACCTTAACTTACAACAATATTGTGCCTACCTTAAAATGTGCCACCACACTTGGAGTGTTGGTCGCATAAATGGGTTGATGCATCTTAAACAAAAAGCTAACAACTGTTTTGTTAGTGCTGGTTTAAACCTGTTCCAAAACACTGGTTATCAACTTAGGCCTGTCATTGATACTCTCTACCGAGAATATCTTAATGGCAACCCAAACAGACTTGTTGCTTGGATTTACGCATCCATCGAGCGTAAGATAGGTGAGATGGGTTGTCCACAGCAAGTCGTATCTCTGCTTGTCAATAACACTGACGCAAAGTTTTCTGCTACGACTGCCTGCTGTAACACCTACTTTAATCACCAGGGTGTTATTTCGGTTGCTCGAGAGTATGATCCCTTGGTACCTAAAGTCTACTGTATGAAGTGTGACATCTGGACCCCATTCAATCCTCAGAGTGGTAAGGGTGCAGTTGCAATTGGCACTTCTTCAGAAGAACCTACTGGACCAGCCATTAAGTTTGCTGCAGCTCACTGCTGGTATACTAATGGCAAGAAAACTGTTAATGGTTATGACATTAAAGCGGATGTTGTAGCCACCTACCACAGATTTGACGTACCGAAAACCCAACCGGTTGAGGAAATTGTCACCCTTCCTGTGAAGAATGACTTTGAAGTTCTTAAAGTTGAGGAGCTACCACGGGATAGTGTCCTTAATTTGGATCCACCCACAGTGCAACCACAACTTGAAGAACAACAACAGCGTGCTGAAGTTCTTGATAATCCGGATTGTCTGGATATTCTTGATCTTTGGATTCGTAAACCCAAATTTATCCTAGTTAAATCTTGGAGTGTTTTGGGTAGAGTTTTATGTAAGACCGGTAAAGTGGTCTTCTTAAGCTCTAAACTTTTACTCCGCTTCTACAATTATCTTGCGGAAATTGGAGTTATTGACACTACTGCTAGACTTTCTATAAATCTAGCATGTAAATTTGTTCGCAAGGTTCTACCTTCTTCGAGCACAATTCGCAAAACTTGTATTGGTCTGTATTATTCAGCCCAAACACTTTTTGTATCCTTAACACCTTTTCTTATGTTACCGGCAATAGCTAGTCTGCTTAGTTCAGGTTATACTATCGGTACATACTTATTTGCAAAAACTGGGTTGCCTTGTGACTACAATGCTACTCAACACTTTGACTATAATTCCTATTGTGCTGGAGATTTGACATGTCAAACTTGTTTTAACGGTCAAGACTCCCTACATTTATACTCGCATCTACGAGTGAATCAGCAGCCACTTCGGGCTAATGATTACACTGTTTATGCGTTGTCACTAATACTACTACTAGCTAACACGACACTTGTCATGGGCACGCTATTAGTTACCTTATTTGTTAACCTTTATGGAATACAAATACCATTTTACGGCACACTGATAATAGATTACCAGTCTGCACTAGTTTTAACATTTTCAGTGTACTATTTCTACAAAGTTATGAAGTTCTTTCAACACCTCAAGCATGGGTGTAAAACACCTAC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Protein
MAKNKSKRDAIALPEKIPPPLQLFIHVAAAEEGHPKVTSYLGNYNLYTAKAPPGMQVIDTKASLTDFENIFGAQPTLRSIRNLVCEARSAEWSTSKDAFALKAKQLNYSDAVLRAMIRFCPAKISALAALSLFYRLVKIDDDELSALAAATALELAYMAKIGTTLADARVVSLTHKDSYLTLSNEVLGVPFTATLMAKATTINGAMQYLNFYFYPRGTIKVIDGKAEAISTKLLAATVIGKPITEDVNLLPDYHQLLVDQVNGTEVKVGAITYVKTTDSPPLYFPKVRGGVIGIALKQQGTATKRLNVVFHAQPNDVLLAFIQLQQFLNRTTDSSVEIIDSQRHMIYEVSPTVTVRIGPSKPGDVVVATDEEYLKCFDTPEVGKLYRIFQTQSWAIIERKFSSLRVRVSNALYQFISFLQTLVENFSPLAGVVTGLIHELQNLTLDVAARITNIQLVYRAGKLIVDTTNAIAKLLQPLCDFLSPFLRKVAGFAVYTVGNRMLMFTSCGTFLLTKATTKILNKAKYIFDVDPEYPVDVTTSKVVVHETLQQVSTKPTRALEAVDVVVGNTVLQMATDGNTFYPSDGSHASLPGFKAGSDELVISFSCDLFDDDTNAQINETLAAYELNQLVAPCDSTPRQIATLVVDTLVDALTDHFPEKTIDLPGNYQVFSAHDDLPLAQHHIPSHLSLYIQAMEGEDDSGDEIVEDDDYDCPQLGDDTDGAIPQQWDLPDVDTFLLKLKERNTRSDEVLSVDIHPKPSRAEVAVSASEKKPDGDQVQSFEDPSSASVETVVFSESASEAVNLSPPSSPQADLAESSQLESELRSYDGDCNSDDEIIIPIVPDTPEDYKPQSVTIREYFTAQKLDTIVEGSTESVATEESSVYDSCADADPEELQQDAVYDDETIITDSTEPDDEPEATLATIVNTPLTIDNNLPPEAIKQPSPTKVELVVGELSSIKFDNSVLVNPANEQLTNGGGAALAIAKLAGPKYQEYCNSVAPINGTLTTDSFDAKKLGVACILHVVPPKGSDPNVRELLYQAYKSILTEPAHYVIPILGAGIYGCNAVHSLDAFRKACPNDIGRVTLVTMNKNHLEVWDALNRTVVRTTQDFDQVTTKALTPQGVLEANLFDGEDFVQEPTPGQLYLEVTEEVQKQAKELDLNLQQYCAYLKMCHHTWSVGRINGLMHLKQKANNCFVSAGLNLFQNTGYQLRPVIDTLYREYLNGNPNRLVAWIYASIERKIGEMGCPQQVVSLLVNNTDAKFSATTACCNTYFNHQGVISVAREYDPLVPKVYCMKCDIWTPFNPQSGKGAVAIGTSSEEPTGPAIKFAAAHCWYTNGKKTVNGYDIKADVVATYHRFDVPKTQPVEEIVTLPVKNDFEVLKVEELPRDSVLNLDPPTVQPQLEEQQQRAEVLDNPDCLDILDLWIRKPKFILVKSWSVLGRVLCKTGKVVFLSSKLLLRFYNYLAEIGVIDTTARLSINLACKFVRKVLPSSSTIRKTCIGLYYSAQTLFVSLTPFLMLPAIASLLSSGYTIGTYLFAKTGLPCDYNATQHFDYNSYCAGDLTCQTCFNGQDSLHLYSHLRVNQQPLRANDYTVYALSLILLLANTTLVMGTLLVTLFVNLYGIQIPFYGTLIIDYQSALVLTFSVYYFYKVMKFFQHLKHGCKTPTCAVCAKLRTPPTITVETVVQGRKYPSVIETNGGFAICKEHNFYCKDCTSQTPGTFIPTEAIESLSRATKLSVKPTAPAFLLARDVECQPDVVVARATHNQNAHVCISKYSDIRTVDQLLKPTPLFSYTPDVIIAADFDNRGSIKTAKELAVVLSMDLKRTIIIIDQAYSRPIDNYQEVASRIEKYYPVTKITPTGDIFADIKQATNGSATDSAINAAVLAVQRGLDFTVDNPNHILPHYAFDFTALNAEDQSTILESGCAKGNLKGTNVGVVLSASLVTRLSQQAVRVIANAASRNGVTCAVTPSTLVMRGNIATQPLTRIKAGVPPMRYKIFRLILALVIVYLAAMALGFLASQITLNTVPTAKSDIQVSTFYVIRDGVLDTIRSDDKCFANKFLAFDSFYQAPYTNSPDCPVVVGVVNVTTHSIPGIPAGVIHSDGLILNIYEQAIYETHQRLSMVRDALSLKTADLFNLGKRVIVGYTQYEVVVGTSYINSQALFNAKCTFLQYESMRNLYCYDAVPKEHKLYSDVIPHVEYQAIDINGDLVPFKIPEQIMFYPHIVRYTSNTYCRMGHCFNTNPGICISFTDAFPYSDNVGPGVYCADTTVQLFSNLVLGTVSGIHVFTSTAALLGSTIVIILCVVAVLAVQRFFKEYTTFVMYTCGVAAVNIIGIALMYKSLVFALFYYAIYLYFVLTFPSFKRNVALFYFAVVVVPHVSNMQLLAIIVCSTIYFLYSYVHTVTKTAGKFSSFLDAAKSTFVIDNDKYVLLKDLAGAEFDQYLASYNKYKYFSGTASDKDYDKVCMAFLAKALSSFREGGGAQLYTPPKFAVVQSLKTKLQAGIKILLHPSGVVEQCVVSVVYNGSALNGIWLNNIVYCPRHVIGKYRGEQWSHMVSIADCREFIVNCPTQGIQLNVQSVKMVGALLQLTVHTNNTATPNYKFEKLAPGSSMTIACAYDGVVRHVYHVVLQTNYLIYASFLNGACGSVGYTLKGKTLCLHYMHHIEFNNKTHSGTDLEGNFYGPYVDEEVIQHQTAFQYYTDNVVAQLYAHLLTVDARPKWLAHAQISVDDFNAWAANNSFASFPCEQTNMSYIMGLAQTARIPVERILNTIVQLTLNRDGALIMGSPDFECDWTPEMVYNQAPISLQSGVVTKTCMWFFHFLFMAFAILLAAIHVFPVHLYPIVLPAFTVVAFLLTLTIKHTVVFTTTYLLPSAIMMVVNANTFWIPNTFLRTCYENIFGSPIAVRLSGYSVAFYILIYFGLAINYTLNTFRYRSTSTITFCMQWLQFGYIGNIVYQLLTKPWTESLLFTAFSMLTSHPLLAALSWWAAARIPLPIVMPDLAIRVLVYNIIGYVMCVRFGLIWLVNRFTTIPMGTYKYMVSVEQLKYMMAVKMSPPRNALEVLVANIRLLGLGGNRNIAVSTVQNKILDAKATAVVVANLLEKAGVTNKHAICKKIVKFHNDTLKAVNYEEAEMSLVKLLAHIIEFLPTDQVDTFLADSSKAQHVNNYLDKLLEHKTVVQAVADININLDSYRTYKEADATYKRSVEMNESPQEQKKKLKAVNIAKAEWEREAASQRKLEKLADAAMKSMYLAERAEDRRIKLTSGLTAMLYHMLRRLDSDRVKALFECAKQQILPIHAVVGISNDNLKVIFNDKESYAQYVEGNTLIHKGVRYTIVKKLSLDNAPIEGIPEEFPVVVETIREGVPQLQNNELCLRNVFTAQNTAQDINGNESTAKSFYVSKTGKKILVAITSTKDNLKTVTCLTETGKAILNLDPPMRFAHTVGGKQSIVYLYFIQNISSLNRGMVIGHISGTTILQANGTHVEYQQNASLLTYLAFAVDPKAAYLKHLADGGSPIQGCIQMIATMGPGFAVTTKPQPSEHQYSYGGASICLYCRAHIPHPGNDGRCPYKGRFVHIDKDKEPVSFALTHEPCSSCQRWVNYDCTCGTSLQNAAYLNELTGSSTARLEPLQPGTQPDTVKRAFHVHNETTSGIFLSTKTNCARFKTKRKALPLPNKGEVDLYFVTKQCSAKVFEVEEKCYNALSTDLYTTDESFGVLAKTEFFKFDKIPNVNRQYLTKYTLLDLAYALRHLSTSRDVIREILMTMCGTPEEWFGENWFDPIENPSFYKEFHKLGDILNHCVLNANKFASACIDAGLVGILTPDNQDLLGQIYDFGDFITTQPGNGCVDLSSYYSYLMPIMSMTHMLKCECMDSEGKPLEYDGCQYDFTDLKLTLFEKYFKYWDRPYHPNTVECPDDRCVLHCANFNVLFAMCIPNTAFGNLCSRATVDGHLVVQTVGVHLKELGIVLNQDVTTHMANINLNTLLRLVGDPTTIASVSDKCLDLRTPCQTLATMSSGIAKQSVKPGHFNQHFYKHLLDSNLLDQLGIDIRHFYYMQDGEAAITDYSYYRYNTPTMLDIKMFLFCLEVADKYLEPYEGGCINAQSVVVSNLDKSAGYPFNKLGKARNYYDMTHREQNQLFEYTKRNVLPTLTQMNLKYAISAKDRARTVAGVSIISTMTNRQYHQKMLKSISLARNQTIVIGTTKFYGGWDNMLRRLMCNINNPILVGWDYPKCDRSMPNMLRIAASCLLARKHTCCNQSQRFYRLANECCQVLSEVVVSGNNLYVKPGGTSSGDATTAYANSVFNILQVVSANVATFLSTSTTSHINKEIADLHRSLYEDIYRGNSDDSTVINRFYQHLQSYFGLMILSDDGVACIDSDMAKSGAVADLNGFRDILFYQNNVYMADSKCWTETDMTVGPHEFCSQHTVLAEYDGKPYYLPYPDVSRILGACIFVDDVNKADPVQNLERYISLAIDAYPLTKVDPIKGKVFYLLLDYIRILAQELQDGILDAFQSLTDMSYINNFLNEAFYAQMYEQSPTLQASGVCVVCNSPTILRCGDCIRRPLLCCVCAYQHVTQTSHKRVIAINNYICSVENCNEDNVEKLFISGTAIYCENHKPTLCIPIVANGSVFGIYRHTARGSDDIDLFNELSTSNYDTIEPYQKANRAPLSLMLFAAETIKALEESIKKSYATATVKDVYDQRFIKLLWEQGKKPPPITKNHIFTGYHFNKNGKTQVGDYILAKTDGNDTYTYRGTSTYKLQTGDVLVLMAHVVTPLSAPPVLAQTTYVRKALLPDSVGASYYVQHFKSYNEIAMQRVTTVLGPPGTGKSTFAIGLAKYYPSARICYTASSHAAIDALCDKAFKTLPVGQCSRIVPTRTTVECFQEFVVNNTTAQYIFSTINALPDIKCDIVVVDEVSMLTNYELSSVNARLVYNHIVYVGDPYQLPSPRTMLTSGQLLPADYNVVTDIMVHAGADVMLDMCYRCPREIVETVSKLVYDNKLKAAKPNSRQCYKTIVNFGPGDIAHEGQSAYNEAQLRFALAFRQQKRWDNVTFISPYNAMNVKAALAGFSTQTVDSSQGSEYDYVIFCVTTDSAHALNMARLNVALTRAKIGILVVFRQANELYNSLQFESIDSQLQSGEALTPLFKRCGYDYNGVHPAHALTWHDCGIEYRCEEPLAKLVGVADGTLISYKTLVSALGFLPSLKIDAYHNMFLTRDACRAYVQSWIGIDVEAAHAIKPNTGTNLPLQIGFSTGINFSVVPEGIWVNEHGSCTEPVPAKIPPGEQFRHLKKDMRQARPWKVVRREIAAHIAEVASHTDYICFVTWAHQLELATMRYFVKLGMEEKCFCGRRACFTNGTEFACKAHHSLTTPQCDYVYNPFLIDVATWGFSGRLSTNHDAVCTYHANAHVASADAIMTVCLAIHELFSTVDWTLEFPVTAEQSQLNKACRLVQANYLNILLTTTKATVVHDIGNPKGIPIVRKPGVKYHFYDQSPIVKHVQKLKYKPEMEARFTDGLTMFWNCNVDTYPANALVCRYDTHRQKHLIGPNGSALYVNKHAFLTPEMHTYATHKLSLAPLIYYSTTDCSSEQPIVVTYRDCVTRCNTGTTLCPVHALEYQEFINAYNLMARHGFNVYIPRNVSVYNCWLTFTNLQNLENLAFNCYYKNCNAHAEGQLDVVINSNAVYAKVDTNLVKLFDNRTNLPVSVAFEHYTNRHTKSLPTTQLLSGLGVTATRNFTVWVDDDTIFQYTINVSTYTDVDPNTHVVLCDDRYGTDWSQFNQLPNAVFLTKTKVKKAEPFVCRALTLNGLAIDGDELYIYVRQNNQLTTFNTMCTQGRNVEQFISKTPMEKDFLELSKESFIEQYQLQDLGVEHIIYGEDFTPIIGGTHTLISLVKNKFEYQLVNHVYNPVQNCVVTSPNASSKNVCTVLDLLLDDYIDIIRQAHANYTTKSKVFTVSIDNQQIRFMLWHDEQVRTCYPMLQSLTNGYQMPSVYKTLVTDLQPADIPNYHSYTPKVPGIVKNVIKYRQLFNYIVKKDRLAVPHNMTVLHLGAASALGTAPGSSVIKQMLPEGTVLIDLDIREFTSDANQIIVTDYRTYVPPHHVDAIFSDLYSCDDIHFFDNLIRIVKERLALGGSIFVKITEHSYSPELYSLAGWFDDYQLFCTAVNASSSEAFLCCFNYLGYAKENINGFNLHASYIQWRNEIALTPTYSSLADNPAIACKLKATPIISARELEKKPILRYLVASGRLLVRPPECRELY
Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR008740
Peptidase_C30
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR036333 NSP10_sf
IPR027352 CV_ZBD
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037227 EndoU-like
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR009466 NSP11
IPR014827 Viral_protease
IPR042515 Nsp15_N
IPR002589 Macro_dom
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR014829 NSP8
IPR036499 NSP9_sf
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR017896 4Fe4S_Fe-S-bd
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SUPFAM
Gene 3D
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score= 944 Identity=51.07%
Cov(Q)=14.98% Cov(P)=98.22%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6260
Number of predicted TMHs:
14
Exp number of AAs in TMHs:
337.976399999995
Exp number, first 60 AAs:
0.00177
Total prob of N-in:
0.15173
outside
1 - 1515
TMhelix
1516 - 1538
inside
1539 - 1595
TMhelix
1596 - 1618
outside
1619 - 1627
TMhelix
1628 - 1650
inside
1651 - 1998
TMhelix
1999 - 2021
outside
2022 - 2289
TMhelix
2290 - 2312
inside
2313 - 2318
TMhelix
2319 - 2341
outside
2342 - 2344
TMhelix
2345 - 2364
inside
2365 - 2368
TMhelix
2369 - 2391
outside
2392 - 2818
TMhelix
2819 - 2841
inside
2842 - 2842
TMhelix
2843 - 2862
outside
2863 - 2866
TMhelix
2867 - 2889
inside
2890 - 2909
TMhelix
2910 - 2932
outside
2933 - 2969
TMhelix
2970 - 2992
inside
2993 - 3003
TMhelix
3004 - 3026
outside
3027 - 6260
