Strain
Avian_MN611525
(Region: China; Strain: Hipposideros pomona bat coronavirus CHB25 isolate CHB0025, complete genome.; Date: 18-Mar)
Gene
orf1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
orf1ab polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGCTCGCAACCAGTTAACGTTGGCTATTGCCAACGATCCAGAGATTTCAGCTTTTGGTTTTGAATCCATCGGTGATGCCGTAGAACAATATAGTTTTGCCGCTGCCGATGGTTTTGTTCAATGCCGTTTTGTTAGTATGGGTTTGCAGAGTATCGTTGATGGTGTTCGTGATAGTGACTATGTTTTAGTTGTCACGGGGATCAACCAACTTTGTGCCCGTATTGGCAAGTTTGGTGACCGCCCACAAAATTTGCGCGGTTGGTTGCTGTTCTCTAATTCAAATTACTTTTTAAGTGAGATGGATTTAACTTTTGGTGGTCGTGGCGGGAATACCGTTTACGTTGACCAATATCTTTGTGGTGCTAATGGTTACCCTGCTCTTGATGAAACCCTTTGGGAATTCAAAGATTACTTTGGAGAACTCGATGAGATAGTGATCAATGGCACCACTTTTGTTAAGGCCTGGCTTGTTGTTAGATCACCAGGTCCTTACAATACTCAAAACCTTTTGTCTATACAAGCTATCACCTGGTGTGGTGAGTGTCCTCACACTCTTGCTGATGGTACCACACTGAAAAATGCTGGTCCCATTAAAAAGAATAAGAGTGTTGTTATTGGTGGCAAGTTTTCGCAACTCTATGATAGAGTTGGTTCACCTTTTGTCACTAATGGAAAGGTATTGAGTGAAGTTTTGACCAACCCTACCTTTTGTCATGCTCTTGTGAAGTGTCATTGTGGCACAACATCATGGACTGTTGGAGACTGGAGTGGTTACAAATCAATGTGTTGCGGCAAGGTTTGCAAACCATCCACTATAGTAGTGGGTGAAGTGAAACCAGGTGATGTGCTTGTCACATCATCTAAAGTTGCAACAAATGGAGTTAAGTACTATAGTGGTATGGTACTTGATTTCGTTACAAAAGTTGATGATGTCTGTTTGTGGCGTATTGTAAAAGTGCAGAGTGTTGATGACTTTGTTGCCTCTGGTAATTTTGATATCGAAGACCACACTTACAGACTTGAAGAAATTTGCAGTCCTTTTACAAGTTCTGAGCTTGCCAAGGAATTTAAGTTGTGCTACTACACTGGTGTCTACACAGATGCTGTGCGTGTTGCCATTATTAATGGTGACATAGATGTTAACACCACAGTGTGCAGTGTAGCAGATGATGTTCTTCACAAGCCTTGGTTTGTTAGAGAACTTCAAGACTTACTTGGATCTGCTTGGGACATCTTTGTCAGTGCTGTTAAAGCTTTAGCTGTTAAGAACAGTGACCTGGTTTTGCTTATGAAGTCATTGACCAAGGCAACTATTAAAGTTGCTAAAGGTGTCATTGATTTCTGTGCAGATGTGCCATCTGTCTTTGTCAGCTGTTTTGAAGTGCTCAAAAGTTTTGTCGTAACAATGTTTGACCTAACTGTTAACACCTTCACTATTGCTGGTGTCAAAGTCAAGGCGGTTGGTGACTATGTTTTGCTTGACAACGCAATTGTCAAGTTCGTCTCCGCAAAGGTTAAGGGTGTCAAACAGGATGGTTTGAAAACTATCTCTTTTGCACATACAATTGTTGGTGACACTTTAAAAGTGAAATCAAAACGATTTGAGTACAGCACTGCTAACTTGGTTGTAGTCCCTGATGAACTTGTTGTTACAGAAGGTGTCACCAAATCCATTGGTGGTAGAGCATTCTTTTATAGTGGTGGTTGTTATCGTCTCATGAAAGATAATGGGACTGTCTTAACCACACCCACATTCAAGGCTCAAGCACCAGCAAGTGTCATTTTTGATTGTGCAAAACCTAAAAGTTTTGTTGATCCCAATTGTTCAGACATTATTGAATTGGTGGGTGAAGTCACTAAACAACTCATGCGGCTGAATAAGCCTTACCGTTTCTACGACGTTAAGGTACAAGCTGACAAGTGTATTGTGACGGAAACTCTAAACTTTAGAGCACCTTCTTACATTTGTGATGCAGAAAAGTTTGTTAAACTGTGTGTTGAATTTGTTAGTGATGATAGGTTTGACACGTTTTATGTTAATGCACACGCTGCAGTTAATCTTGTCCAATTTGAACCAGTTTTTGAAGCGTTTGGGTGTTTCAAACAAGTTGTTGAATGTCCAGATTTGTTGAAAGATATTGACAATGGTGGCATTTGGTATTCTTTTATTGAAACAGTTAGTGATGCTTTGTCATTCGCTAAGTCCATTAAGGTGGATTTCGGTTTGAGTGGTATAGTTATCACAGCAACTAAACGTTTCAAGCGCTTTGCTGGTGTTCTTATGAACTTGTATAGAGAGTTCATAGCCAGTGTTACAACTGTTCTTATGATTGGTGCCAAGAAATTTACTTATTATACTTTTGAAAAACCAAAAATATTGATTGCTGGTGTTTTGCATCCTGTGTTTGTAAAGCAGGCTTCTGACTGTAGTTGTGCGGTTGAAGATGGTGTTGGGCTTGTTTCTATGTTTGCTTGTGGTGACATTGAGATACAGCCCACACGTGTTGAGTCGCATACTGTTGAGCTAGAGGAATGTGATTTTACAAAACCACAGAAAGGAGGCGTGTTGGCTGTTGTAAATGGTTACACGTTTTACAACACTGGTGATTATTACTATCCTTCTAATGACAAATTTGCCATCTCAACATGTTACAAACGTGGTAGTGGTAAAAGTGTTCAATTTTCTGCTGATGTTTCTGTTAAAGAGATCGAGCCTGTTTATAAGGTTTATCTTGACTTTGAATTTGACGATGATACTATTACAAATGTTTGTAAGCGTGTCATAGGCAGGAAAATAAATTTTACGGGTTCAGATTGGGGTGAATTTTGTCAGGTTGTTCATACTTACATGGACGCTGTTAACACACAGTTGGATGTGCCACCTTACTTCATTTATGATGAAGAGGGTGGTAATGATTTAACTAAACCTATTATGGTGTCTCAGTGGCCTATAGTAGAACAACAGGATGTAGAATCCACACCTGCACCAGAAATTGTGTCAGATCAAATTGCTGTAGAAGAAGCACTTAGCTTTATAGTGGATGACGGTGTTGCACCTGTTGTTAGTCCATTTGCTTTTGAGTTCTATGACATTAATGGTCTTAGAGTTTTGAAGCAGTGTAATAACAATTGTTGGGTTGCAACTACCCTCGTGCAATTACAAATGCTGGAAGTCTATGACGATCCAGCTTTTGACTTGTTCAAGGTGGGGCGTGTATCTTCTATGGTTAAGAAGTGTTATGAAGCCACAAACAATATTGTGGGCGCTGCAGGTGACACTGTTCATTGCATGGAAGTGTTGTTGAAAGATTTGCACACCATGTTTATTACTTTCGATGTTGAATGTAAATGTGGTAAAGAACAGTCTCAACTTAGTGGTTGCGTTTTTACTTTTATGCCAACACCAAAACCTTTTGTTTATGGTAATTGTCAGTGGTGTAAAACACCCGCTATGCATACCATAACATCGATGAAGGGTACTGGTGTATTTTGTCAACAACCGAAGTCAATTGACATTAACTCACTGTTGCTAAAGCCCATGTGTGCATCTGTGTTTTTGGGTAATGACAGTGTTTGTGGTCATTATAAGACAAACATTTATGAGAAAAATGTTTGTGTCGATGGTCATGGACAAGGTCCTATACTCTTGGACACCCTTAACACTGTATGTTATAAAGATGTCACTTATGTTAAACAAGATCTTAAGCCCGAAATTACACCATTTTTGGTTTACAAGAATGTTGAATTCTATGTTGGTGAGATTGCAAAACTTGTTGCTATTAAACATGATTTTGTTGTTAATGCAGCCAATGAGAACCTTAGTCATGGTGGTGGCATAGCTGGTGCGCTTAATAAGCTTACTGGCGGCATTCTTCAGGATGTTTCTAGTAGTTATATTAGAGACAATGGTAAGTTGAAGGTCGCCACTGGTGTTATGTTAGATTGCGGTTTGGAGCGCATCTACAATGTTGTAGGCCCCAGAGCTGGTAAACACGCACCAGAACTTTTGCGTAAAGCATACAATGCTATCTTGTCACAGCCAGGTGTGCCCTTAACACCTCTTTTGAGTGTTGGCATCTTTAAAGTGCCCATAGTGGAGTCTGTTATGGCACTACTAGATGTGGTGGGTGATAACACTGTTAAGTGTTTTTGTCTTAATGTTAAAGAGTGTGACCAGATTAAGCAGTGTGTGTCCACACTTGGTGTAATGACTCCGTTGGAAGTGCCTGAGCAGATAGTTGAAGTTAGTGCCAAAGTTGAGTCTGAAACCGTTGTTGCTGTACCTAAGCCTTTTAGGTGTGAAGGTAAGTTTGAGTTTTATGACTCTTCTATTGCAGAACTGCTAGCTCTTCAATTAGATCGTTTTGTGTTCTTTACTGATAGCACATTTACATTTTGTTCTGTTGCTAAGTCTTTGGACGCACACTATGACGGTGCACTCACCACTTGTGTGCAAGGTTATCTTGCTACTACACCTACTGTGCCTGCTGGTAATGTTATTACATTTAAATGTGATAATGCAGTAGCTGTTAGTTTTGCTGTGGTCCCCAATGTTTGTGAAGCTAATTATGACAAAAATGTTAAACGTTTGTTTGTTAAGTTAGCTAAAATAAAGGGTTGCATAATGGCCACAATCCCTTCTACTCCTTTGCTTAAGTCTTTACTTAAGTGTTGTGCATTTCGTTTTGCCGTGTGTACCGAGACTAAGCCTTTTGTGTCGGAGTGTTTTGAGGCTAAGGTTATGGAATTGAAAGTTACACATGATGGACGTGATGTTCACACTGTTAAAGTTGATACAAATGTTGTTATTGACAAGCAATTGGGCACTTGTAGTGTAGATAATTTTGATCTTACTGGTGTTAAACCTAATGATTCTATTGACACTATTGTTAGTGTTGCCCCAGATGCTGATTGGAGAACTTTCTACGGTTTTCCACGGGCTGATGTGTTTCACACACTTGATCACGGTGCTTATGCCTTTGAAAACAGTGAAGTCGA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Protein
MARNQLTLAIANDPEISAFGFESIGDAVEQYSFAAADGFVQCRFVSMGLQSIVDGVRDSDYVLVVTGINQLCARIGKFGDRPQNLRGWLLFSNSNYFLSEMDLTFGGRGGNTVYVDQYLCGANGYPALDETLWEFKDYFGELDEIVINGTTFVKAWLVVRSPGPYNTQNLLSIQAITWCGECPHTLADGTTLKNAGPIKKNKSVVIGGKFSQLYDRVGSPFVTNGKVLSEVLTNPTFCHALVKCHCGTTSWTVGDWSGYKSMCCGKVCKPSTIVVGEVKPGDVLVTSSKVATNGVKYYSGMVLDFVTKVDDVCLWRIVKVQSVDDFVASGNFDIEDHTYRLEEICSPFTSSELAKEFKLCYYTGVYTDAVRVAIINGDIDVNTTVCSVADDVLHKPWFVRELQDLLGSAWDIFVSAVKALAVKNSDLVLLMKSLTKATIKVAKGVIDFCADVPSVFVSCFEVLKSFVVTMFDLTVNTFTIAGVKVKAVGDYVLLDNAIVKFVSAKVKGVKQDGLKTISFAHTIVGDTLKVKSKRFEYSTANLVVVPDELVVTEGVTKSIGGRAFFYSGGCYRLMKDNGTVLTTPTFKAQAPASVIFDCAKPKSFVDPNCSDIIELVGEVTKQLMRLNKPYRFYDVKVQADKCIVTETLNFRAPSYICDAEKFVKLCVEFVSDDRFDTFYVNAHAAVNLVQFEPVFEAFGCFKQVVECPDLLKDIDNGGIWYSFIETVSDALSFAKSIKVDFGLSGIVITATKRFKRFAGVLMNLYREFIASVTTVLMIGAKKFTYYTFEKPKILIAGVLHPVFVKQASDCSCAVEDGVGLVSMFACGDIEIQPTRVESHTVELEECDFTKPQKGGVLAVVNGYTFYNTGDYYYPSNDKFAISTCYKRGSGKSVQFSADVSVKEIEPVYKVYLDFEFDDDTITNVCKRVIGRKINFTGSDWGEFCQVVHTYMDAVNTQLDVPPYFIYDEEGGNDLTKPIMVSQWPIVEQQDVESTPAPEIVSDQIAVEEALSFIVDDGVAPVVSPFAFEFYDINGLRVLKQCNNNCWVATTLVQLQMLEVYDDPAFDLFKVGRVSSMVKKCYEATNNIVGAAGDTVHCMEVLLKDLHTMFITFDVECKCGKEQSQLSGCVFTFMPTPKPFVYGNCQWCKTPAMHTITSMKGTGVFCQQPKSIDINSLLLKPMCASVFLGNDSVCGHYKTNIYEKNVCVDGHGQGPILLDTLNTVCYKDVTYVKQDLKPEITPFLVYKNVEFYVGEIAKLVAIKHDFVVNAANENLSHGGGIAGALNKLTGGILQDVSSSYIRDNGKLKVATGVMLDCGLERIYNVVGPRAGKHAPELLRKAYNAILSQPGVPLTPLLSVGIFKVPIVESVMALLDVVGDNTVKCFCLNVKECDQIKQCVSTLGVMTPLEVPEQIVEVSAKVESETVVAVPKPFRCEGKFEFYDSSIAELLALQLDRFVFFTDSTFTFCSVAKSLDAHYDGALTTCVQGYLATTPTVPAGNVITFKCDNAVAVSFAVVPNVCEANYDKNVKRLFVKLAKIKGCIMATIPSTPLLKSLLKCCAFRFAVCTETKPFVSECFEAKVMELKVTHDGRDVHTVKVDTNVVIDKQLGTCSVDNFDLTGVKPNDSIDTIVSVAPDADWRTFYGFPRADVFHTLDHGAYAFENSEVEGKRVLKLSDNNCWVNAVCLQLQFAKVIFKSEGLQAMWDDFLLGKVSKFIHWLYWYQNLDKGQPSDVEHLLNAISRYFVCGGSLTITKASSCCVVKKVFNSPVVEASILRAGAPDGFCKHGDTFVSRVTAVKGTVIVTQAGEPKVHLKHELLGGGSYTAYTGSVSDGHYTVFESKDCRVYDGDKVSTGNDLSTMPVSSLVITNKVFDGESFSTKQKPIEVLNETADKFFSFGDLLMRNGAAVFVWFVSICTLLFKAFKQKDVKVIAQAPHRTGLILSRSLKYNVKELRKLLHVKSKWVIVLFKVLLILATVYATVFMFIRFSPAHDSVCSGYVEGYGKSNFDKSTYCNNVACRICLYGYQELSDFPHTTVVWTHLKDPLLKTILPLMYMAFLLIFGGVVVRSLMLYFVAQYVNQLGVMLGLQDNVWVLQMVPFSVFGDEIVVLFLVTKLLLFFKHVLLGCDKPSCVACSKSARLTRVPMQTIVNGSNRSFYVVANGGKSFCSKHKFFCVNCDSYGPGCTFINDFVAIELSNVVKTNVIPTSTATIDVSRVEFSDGFYYLYGPDGSTFWRYNFDITESKYGCKEVLKNCNVLTDFIVYNNSGSNVTQVRNACVYFSQLLCKPIKLVDSSLLSTLNVDFNGALHSAFVDVLTESFGKDLSNCTTMADCKTVLDLDVDDEDFVNGVSNAHKFNVLITDLSYNNFLTTYAKPEEKLATHDLASCMRSGAKVVNHNILVKENTPIVWFAKDFNMLSDEGRKYVVKTAKLKGVNFMLSFNDNRMQTSIPIVSVTTKCGSGIKHCYNCLWWLCVFVLTGFVLLGCLDYTTTIQSDSDFGFKYIEGGKLFNFETPLKCVHNTFSNFDDWHNSKFGFVPIKDRSCPIIVGVSNLARTIPGVPAGVFLYGRTLIFAIQAVFGGSNTCYDFTGPAPSERCLFNSACTVLNGLGGLRTYCYKDGLIEGASLYRDLQPNSYYSLPHGGYIRLPEVLASGFGFRTVRTLQTTYCRMGECIDSKEGVCFGYNRFLVYNTDSGPDFVCGTGFLSLLYNVLTMFSSTFSVMAVSGQILFNTILTGLIIAACLLFTKLKRMFGDLSYGVCTVIAVALLNNLSYIITQNAITMVAYAVLYFLCTRSYKYAWIWHLGYVVAYAMMAPWWLLFWYVTAALVGLIPSLLKLKVTTQLFDGDKFVGNFESAASGTFVLDMHSYQRLVNSVTPEKLKQHASSYNKYKYYSGAASEADYKLACYSHLAKAMLDYASDHQDKLYTPPTISYNSTLQAGLRKMAQPSGIVERCVVRVCYGSMSLNGLWLGDTVICPRHVIASNTNAVIDYDYENSVMRLHNFSVSVGNVFLGVVSVSMKGANLHIKVNQSNVNTPEHSFKTLKAGDSFNILACYDGVPSGVYGVTMRTNGVIRGSFITGACGSPGYNVNKGKVEFCYLHQLELGSGCHVGSNLEGVMYGGFEDQPTFQIEGANQLVTINVLAFLYGALLNGINWWLTSDKVSVDTFNSWATANGFTQCGSLDCFNMLAAKTGVDVQRLLAAVQRLHVSFGGKNILGFTTLTDEFTIGEVIKQMYGVTLQSTKVVGTFCNLAIVGAFVVMFWSELLQYTPLFWVSPGFLTPIFFILLLLSFFLMCMLKHKILFLYTFLIPAVIIMSCFNFAVDWYVIHKVQQSFDFNIAIFSLDIQSFLNVCVCVYVALLHTLRFYKANNSAMTYVFSICFTLYGLIAGTDPLSMIMTLLFNFTNTWYVGAIVYKCAIYLYVYTALPIIVGEIKAIMLCYIALGYLCCVYYGFLYWINRFFTLSVGVYDFKVSANEFKYMVANGLQAPRGVFDSLVLSIKLIGIGGEKTIKVSSVQSKLTDIKCTNVVLLGCLSSMNIASHTKEWAYCVDLHNKINLCDDTDTAQELLLALLAFFLSKQKDFGCDDLIESYFDNNTILQSVASTFVNMPSFISYENARQVYEEAVNNGSSPQLVKQLRRAMNIAKAEFDHEASVQKKISRMAEQAAAAMYKEARAVNRKSKVIGAMHALLFSMLRKLDMSSVDTVLNLAKDGVVPLSIIPAACSTKLNVVSADLDSYKKIFADGCVHYAGVVWNVIDIRDNDGKIVHAKEITQENVETLAWPLFLNCERIVKLQNNEIMPGKLKQKAVRAEGNGVSVDGKALYNSESGKTFMYAFIADKPDLKFVKWEFDGGCNVIELEPPCRFAVETPNGPAIKYLYFVKNLNTLRRGAVLGFVGATVRLQAGKQTEMAVNSPLLTMCAFSVDPAKTYVDAVKRGAKPVGNCIKMLSNGSGSGQAITNGVEANTNQDSYGGSSVCLYCRAHVEHPSMDGHCRLKGKYVQVPSGTIDPIRFCIENETCKVCMCWLNNGCACDRVSTVQAFDNGYLNRARGSSAAQLEPCNGTDTDHCVRAFDIYNKDVACLGKFLKVNCVRFKNKLKSDSYFVIKRCPKSVMEHEQSIYDVLKNCGAVAIHDFFTWKDSRAIYGNVSRQDLTKYTMMDLVFALRNFDEKNCDTLKEILVITGACEESYFDNKVWFDPVENEDIHRVYAVLGKIVANAMLKCVCLGDAMVKHGIVGVLTLDNQDLNGNFYDFGDFAKTLPGMGVPLCTSYYSYMMPVMGMTNCMASECFMKSDIFGNDFKTYDLLYYDFSDHKQALFEKYFKYWDQEYHPNCVDCHDEMCIIHCANFNTLFSTTIPITAFGPLCRKVFVDGVPLVATAGYHFKQLGIVWNKDLNTHSTRLNINELLQFVTDPSLLIASSPALVDQRTVCFSIAALSTGMTKQTVQPGHFNREFYDFLRMQGFFEEGSELTLKHFFFAQKGDAAIKDFDYYRYNRPTVLDICQARVTYKLVSRYFDIYEGGCITSREVVVTNLNKSAGYPLNKFGKASLYYESLSYEEQDALYAVTKRNVLPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQYHQKHLKSIVNTRNASVVIGTTKFYGGWDNMLKTLIDGVDNPCLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHVTCCKSDERYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYFKPGGTTSGDASTAYANSVFNIFQAVSANINRLLSIDSNVCNNASIKSLQRDLYDNCYRSSSVDESFIDRYYGYLRKHFSMMILSDDGVVCYNKDYADLGYVADISAFKATLYYQNNVFMSTSKCWVESDVSKGPHEFCSQHTMQIVDGDGSYYLPYPDPSRILSAGVFVDDVVKTDAVILLERYVSLAIDAYPLSKHSNPEYRKVFYALLDWVKHLHNTLNQGVLESFSVTLLEDASSKFWDESFYAGMYEKSAILQAAGLCVVCNSQTVLRCGDCLRRPMLCTKCAYDHVIST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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR027352
CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR036333 NSP10_sf
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR014822 NSP9
IPR037227 EndoU-like
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR009466 NSP11
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR036499 NSP9_sf
IPR011050 Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829 NSP8
IPR042515 Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR014827 Viral_protease
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1164 Identity=59.18%
Cov(Q)=13.78% Cov(P)=96.96%
3D Structure
Ontologies
GO
GO:0032259 P:methylation
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
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GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0033644 C:host cell membrane
Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6719
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
389.218169999996
Exp number, first 60 AAs:
0.0005
Total prob of N-in:
0.00049
outside
1 - 1900
TMhelix
1901 - 1923
inside
1924 - 1962
TMhelix
1963 - 1985
outside
1986 - 2048
TMhelix
2049 - 2071
inside
2072 - 2090
TMhelix
2091 - 2113
outside
2114 - 2720
TMhelix
2721 - 2743
inside
2744 - 2749
TMhelix
2750 - 2767
outside
2768 - 2770
TMhelix
2771 - 2790
inside
2791 - 2796
TMhelix
2797 - 2819
outside
2820 - 3133
TMhelix
3134 - 3156
inside
3157 - 3241
TMhelix
3242 - 3260
outside
3261 - 3269
TMhelix
3270 - 3292
inside
3293 - 3298
TMhelix
3299 - 3321
outside
3322 - 3335
TMhelix
3336 - 3358
inside
3359 - 3370
TMhelix
3371 - 3390
outside
3391 - 3404
TMhelix
3405 - 3427
inside
3428 - 3433
TMhelix
3434 - 3456
outside
3457 - 6719
