CoVDB Coronavirus Database (v3)   
Strain
Cow_NC_007447 (Region: ;  Strain: Breda virus, complete genome.;  Date: )
Gene
replicase
Description
Annotated in NCBI,  replicase
Location
NC_007447(+):859-14196
GenBank Accession
YP_337906.1
 

Sequence

CDS
ATGTCCAAGACCTCAAGAGAGCTCACCAACGAAACCGAGCTGCATTTGTGCTCAAGTACCTTGGACCTAATTTCCAAGTCCCAGCTTTTGGCCCAGTGTTTAGGTACACCACAAAATCTGGTATCTCTTTCAAAGATGGTTCCATCTATCTTGGAGTCACCGACTTTGGAACCCAGATACACATCAACCCACTCCAGCTCTTTACAAAGTTTGCAATTACTTGCCCTGAACACCTCATCCACCCTGTACAAATGGACTACAGGGTCTATCTCGAAACTGAGGGGTCATTTGGAGAGAGAATTGTGCAGGGGGTTAGTTCCTTTGAACGATTTTATCCCAAAAGGCAACTATGTGGAGTTATCATTGATGATCCCTTCAGTTTTGACTGGGCAGGGAACATCCACAACTACTACTTTACAAGAAATGTGCTCAGATATGGTACAAAGTTGTATCAAGTCAATGGAAACAGACTTATTGAAAGGAGTTCTGGCATTGAAAGATCAGACGTCTTGCCAAGAATACTTTCTGAGTGCCAACTACCAATCCTTGATACCACCCCAACCCCTAGTGAATGCGATGAGGATGTCATCTGTTGTGGATTTGAGTCCCTTGATATTAGAGAATACCCGGCTCTTGCTGAAACTCAGCCCTTTCCATGGCGGCACTTCAGTCAGTTACACCTCAATGATTAGGGAGTTTGTGGATTGTTCTAGACGGGATGAAAAATGTCTTAAGCGCCGTCTAACAAAGAAGCAAAAGAGGCAGGAAGAAGGTAGTTTTGATGCTAACAAGGTTATAACACTTGGTGGTAAAATGTATCGTTACCGGGTGGTTATATTGAAATGTAGTGATGAGGTTGATGATTTAATTGGCTTTGATGGTAAAGTTGGAGAATTTGATTATAATTTTGAGAATGTACCACATTGTTGGAGGGACCTTGTTAAAAGAAGGTGTCTTATTCGGGCAAAGGCCACTTGGAATCTTGCTGGGGGTGTTGATGAGAATTTGGACCATGTCTACATAGATGAAAGCCAGCRGGATTTTCGGTGTGCTGATGGAAGCTCGGATTCACCTAGTGCATGTGTTGAGGACCCTCATTTGGAAGAAAGAATTTTTTCTCGTGTGTGGTTAAAACAGACATCTAGGTTTTTTGGTACAAAGATACAACAGGTGTCCGAGTTGTTCAAGAGCATTGGGTTGCCTGAACTTGAAACTACATATTGTGGTGTTAATCCAGTAAAAGTAGGTAATAAGTGGCTTAGTTTTAGAGATCAAGGTAGATCAAGAGTATTTTTTGTTTATACTGATAGTAATGTATATTTAGCCACAACACGTCAAAAAGTTTGTTGTGACTACATTTTAACTAAATTTAAGAGTGTTAAATGGATTGGCAATAAGCCTGATCAGTGTAGAGTTGTAAAAGTGTTAGCATGGTTGATTTCTGTAAATAAGGTTAAAAATTGTACAAGAGTTATTACACCAATGTTGACTGTTCAGGGTAAGATTAGTCATAGAAGAGTTGATTATTTGGATATAAGTGTTTTAGATAGTTATGTAAGTGATACCGCTGGTTTAAATTGTGTACAGAAGGTTAAAAAGTTTTTATCAATGTATTATAATTGTGGTGCTGATTTGGGTTTGCTAGATAAYTTTTTAACACCTATAGAGTGTGGCACTAAGCAGCTGGTTTTTGAAAGATGTAATTGTCCAAACCATCAGTTCTATGTAGCTCAATTTGACAATCATGTGGTTTTAGGTTTGGGTAGGCCTACAGGAGTTGTATATCCGGAAGAAATACCAAGTTGTGCAAACATTTATGCTGTGGGTTTTGCAACTCAGAAAAGGGTTGTTGAAGTTCATTATTATTCTGAAATGGATCGTCATCAGCTGCCTCAGGACTACTACTATTTTGCTTATGATCAAGAATTTCAGCATGTTGGTGGTGATGATTATGTTAATCACCACCTAGATGATGTTGAAGATCAACCATTCCCACCTGTATTGTTTGATGATGTCTATGATAGTGGTGACTCTTTAGATGATGGTGGAAGTGATTTAGATTGTTTTGATGTTGGTTATGATTTTTTYTGGCCTGAGGCACCCATACCTGTACCATCACCTTATGGTTATTATCAGGGTCAACGATTGAGGGATTTGTGTGTTGCAGGAGGTGATTTTGGCTGTGATTGCCCTCGTTGTGATGGCACATTTATTTATCATCCATTCAGACCACGACACTACCATTCCTTTGATGAGGTTGGTCCATTTATTCAGATGTGTGAATTTACACTAACATATTCAGGACAAAATTACAACTTATTTTATGGTTTAGAACCCAAAGTTTGTCTTCAAGATTTGGTGGAAGCAAGTGATAAACTCTTACAGTTATTGGTGAGGGGACAGTTGGAAAATATATCACTGCCAAATGATATTTTAGCATGTTTATCAAGTTTGAAGTTGGGGGCTAATATCCACCCCTTCTTGTGGCCAGCACCGTTTTTTAATGCTAATGGTGAGTGGGTTGACATTTTTGGTGGTGGTGACTTTACAGTGTTTGGTGAGGATTTCTGCTTAAAGGCCAAGTCTATGGTTGAAAGTGTGTATTTTTTAGTTGAAAATTTCTTTTCTGTGGATTGTCCTATTGGGAATTTATATTGTAATTTGCATCTTGATGGTGATGTTAAGAAGATGCTTTGGTCAACAATTCATATGAAGTATATTTATTTAGCTTTAATACATAGTGAAAAAGTTTTTAATATTATCTTAAATAGTAGACAATTAAGCCATCAAGAGTTAGTTAAGCTGGTTATAATAGGTACCTTTGATGTTTCTATAGTTGCACCCTGTGCTTGTAGTGGTGATTGTAATCATGGTAAGGTATATAATTGGACAAATCTTCTTAGTAGTGTTTATAGATTTGTAACATTAGACCAGTTGGTGGGGCTGTCATATTGTGAGAAAAGGTCACTAGTCCTTAGAAAGGTTCAGCAGTACCTTGAGGTTGAAGAGGGGTACCAACGGCCAGTACAGCTGTTGATGGCACCATTTTATGGTTTTAATGATAATGCCGAACCTGATGAACAGCCCTTGACTGGTGTTTTTCACCAACAGGTAATGCAAATGTTTGATACATGTGTGATGTTAGATGTTATTTGTGGCCTAAAGCGGCCAAGAGCATCAGTGTATAACCTCTTTGGTGTGTTGGCAGATTATTTTAGGAGACCATTTACCTTCCGGTATTATCAAGTGGCTGAGTTTTCGGGCTCAGAATCCACTCAGGTTTTTACAGATGTAACTTCTGCATTGACATCTAAAGACCCCTGCTCTAATCGCCCCTACATTTATCACGATTACGCAGTTTGTAGGGTTGTGGAGCCTAGGACAGCCGCTGTAACAACTAGGGGGGCCATATACCCACCAGAGGTCATAGAGATGATCCGTAGTTATTTACCAATTGAGTTTGATGTAGGTGTTATGAATTATGTTGATGGTAATTGTGATTTTAAATATTGCAATTTAGAGTTTTGCCTTAGTGGTAGAGGTTTGGTTAAGTTGGATACTGGTGAGTTGTTAGATTATAAGACTAATTTGTTTGTTGTTAGGTACAAAACATTACCCTTGCTATATGTTACTAGTAATCCTATTTATTTGAGTGATTTTAGTTTAGATAATGCTGTTTGTCTTACAGGTGATTTTAAGTTAAGTTTTGATGTTGAGCCTGGTAGTACACTCTTTGGCCTCTATTTTACTAATGGTAGGTGTTATAGAGATGTTTGGGAAACTTTACCACGCTTTGGACTTGGTACCCTATCCCCTCCTAAGTGTCATTCTAAGTGTGAACCTTTTGAGAATTTGGCAGAGGTGTTTTTTTTCAAGCGTAGGGTCCAGCTTGTTCCATTGGTAAATAATTATACTCCAGTTTTTAGGCATAGGCCAGACATCCCTAAAGTTTTGACAGTTGAATTGATGCCCTACTACTCATCTATAGGGTACCAAGGCTTTGTAGCCCCCAAATGTGTTTTGCCTGGATGTGTGGCCACTCAGTATTGTAAGTTGAGACATCAATTGGATAGATGTGTTCAGGTTACCAAGTTAGCAGTTGCATATGCATTTTATTTTAAACCACTTAACATAGGCTCACTTTACCATTTAGATCCTATGAGAGGTACTAGTTATGGTAAGCCAGCTGTGGTACAGTTTGAACCCGTTGGGTTGATAAAGGAAGTTAATATACTTGTCTATCAGTTTGGTAAACATGTTGCCATACATTATTTCCCAGAATGTCCCACATATGTAGCCTATGGACACTACCCAAGTCATTCTGTGGGTGTGTGGTTGGGTTACCTACCCTCGGTTGAAGAGTGTGTTATTGCACAACGCAATTATAGGGTATATGTTCCCACATGCTTTAGGCTCTCACGTACTGGTTGCTATCATATTCAACAGGATGAAGATTTTGAAAGAACACATATTACAGTGAGTTACCATTATGCTAGAGATTTTGACACAAAGTCTTTAACACCTATGTTTCAGATGTTTAGTAAAATTTTTGGTAAGTCAAAACAAGATCTTATTTGTGCATTAAATTCTTTAAGTGAAGAGTCACAGAGTGTTTTAACATTATTTTGTGAGGAGTTTGATTCAGCCTACACCTTGCAAACAATATCTGATGAGGTTTCATTTGAAACATCCACTAGTCCAGAATTGGTAGCGTGTGTGTTGGCTTATGCAATTGGTTATGAGCTTTGCTTAACTGTTAAGACTGATGGTGAGTGTGAAAGTTTAGATGTTGGTTCAAGTTTGGAACAGGTTTATGTTGATTATGATGTAAGCAAAAATGTTTGGGACCTGTCAACTCACCTGCAAGATGATAGTTCTGATGATTTGGAGTTACCATTTAATCAATATTATGAGTTTAAGGTAGGTAGGGCTTCAGTTGTTTTAGTTCAAGATGATTTTAAGAGTGTTTATGATTTTTTGAAGAGTGAGCAAGGTGTTGATTATGTTGTTAACCCTGCCAATAATCAATTAAAGCATGGTGGAGGTATTGCTAAGGTTATCTCATGTATGTGTGGCCCGAAGTTGACAAGTTGGTCAAATAATTATATAAAACAATATAAAAAGTTGGGTGTAACTTGTGCTATTAGGTCTCCAGGTTTTCAGTTGGGGAAGGGTGTCCAAATTATACATGTTGTAGGTCCCAAGAGTGCAGATTCTGATGTTGTAAATAAACTTGAAGCATCTTGGCGTAGTGTTTTTCAAAATGTTAAGCCTGACACCACTGTCCTTACTTCAATGTTGTCTACTGGTATATTTGGTTGTTCTGTTACAGACTCAGCTACTACATTGCTTAGTAATTTGGTAGATTTAGATAAAGATGTTGTAGTTTTTGTGGTTACTAATGTTTCTGATCAGTACATTGAGGCTTTGGGTGTTGTGGAGAGTTTTCAAAGTGCACATGGTTTACCAAACTTTGGTAATACTTGTTGGTTTAATGCCTTGTATCAGCTTTTAAAGAGTTTTGCTGTAAAAGAGCAGATTGTACAGGATTTGGTTAATTGTTTTGATGATTTTTATGAGTGTCCAACTAGGCAATGTGTTGAGTGGGTGTGTGATCAATTGGGTGTAGTGTTTGGTGAACAGTATGATGCAGTTGAGATGTTAGTTAAAATTTTTGATGTTTTTAAGTGTAATGTTAGAGTGGGCTATGATTGCTTAGCACGTCTACAACAGGTTGCTTTGGGGTCTTGTAGGGAGGTTCCAGCTGATGCTGTTCTTATGTTTTTTGGTCAGGATAAGAGTGGACACTGGGTGGCAGCGCGTAAGGTATGTGGTGTTTGGTACACTTTTGATGATAAAGTGGTTGTTAAGAAGGATCCTGACTGGTCTAAGGTTGTTTTGGTTTTGAGAGAGCGTGGTCTTTTCAAAGCAACTGATTTTGAAACACCCAGACCAAGGCGCCGTCGTGTTGCATATAGGGTGCCGCGGGATACTATTTCACAGGATGCAATCATGTTTCTTGAGGAGAGGCAATTTTCGTCTGGTACGATGCTTGCCCATAGTTGTGTTGAGAGTGTTGAAAGTTTTCATGTTGAGGGTGTTCAGCCCAGCCCACTTCAGAGTGTTGATGGTTTAGATGATGTTGCTGACCTGAGTTGTGATAATCATGTTTGTGACAATAGTGATTTGCAAGAACCTCAGGTTGTAGTTAGCCAGCCCAGTGAGGTGTTGACCACGAGCATGTCTATAGAGTGTCCAGTTTTAGAAAATTCTGAGTGTAGTGTAGAGACTGATTTAAATCCTGTGTGTGAGGAGAATGAACAGGTTGGTGAGAGTGGCATTAAGGAACAAGATGGTGTAACCACATCTGACTCTCAACAGGTTTTTTCAAAAAGTTTAGACCCAATTATTAAACAACATGAGGTAGAGAGTGTGGAGCCTCAGGATTTGCCAGTGTTTAGTCAACAGCCACAAGTTATGTTGTCTATGACATGGAGAGATGTACTCTTCCAACAGTATTTGGGTTTTAAATCTGATTTATTGAGTTTAACTCATGTAAATAAATTTAAGATTGTAGTTTACCTTATGGTATTATGGTTTGTTTTGTTATATTGTTTTTCAGATTTTTCATTGTTGAGTAGGTTTTGCTTATATGTCTTTTTGTTATGGTTAAGTCATGTTGTTTTAGTGGTCAAAAAGTTAGATTTAGGTTTAGTTAATTCAGGTGGTGAGAGTTATGTACTTAGGATTTTAAGTAGTGTTAAGGTGCCCAATTGTATTGCTTTTAATTGTGATGGTGTTCATTGGTTAATTTTGAAGTTGTTATTTTATAGTTTTCATTTCTATGACTTTTTTGTTAAGACTCTGGTTGTTGTTTTTCAAATGCCACAGTTAAGGTGCTTTACGTGGCCTCTACTTAAGCTTGGCTTTGCCGATACATTTTTGAGTCACCATATCCTTGCATTTCCAACAAAGCAAGTTAGTCAATCCTGTTTGCCTGTTTTTGGTGATGAGCGTAAGTACATTTACGTTCCATACTGGTGTAAGGAGTCATTTAGAACACTTGTTGCGCGGGCAAAACAGTTGACAGCAACAGGACGCACCAAAACTCTTGATAACTGGCATTATCAGTGTTGCTCTAAAACTGTTAAACCAAGTTCATGCTTTAATGTTCGAGATTTTGTTTTTGATGATGCTTGTAATAACCATAAACATTATGGTTTCTTTTCTGCCCTTTGGTTTTATGTTGTTTTTTATAGTGGTTTTGTTAGTTTTTGGTTACCTTTAATGTTTTGTTATTGTGCTTTGTTTATGTGTACTTTTAAAAATTTGCCTGTAAATATCACAAGACCAATAAGGTGGACTGTGTTACAACAAGTTGTAGATGATTTATTGTCTATAATTACTAAACCACTTTTTGGGCGTCCTGCATGTCCCCCTCTTAGTGCCTATCTGACAGCAACGACAGCTGATGAGGCTGTGCGTGCATCAAGGTCCTTGCTAGGACGGTTTTGTACACCTGTGGGTTTTCAACAACCAATTATGAATGTTGAGAATGGTGTAGCTGTCTCAAGTTTAGGGTTTATTAACCCTCTTATGTGGCCCCTGTTTATTGTTGTTTTGCTTGATAATAGGTTTGTTTGGTTTTTTAATGTGTTAAGTTATATCATGTTACCAGTTTTTGTGATTATACTTTTTTATTTTTATTTGAGGAAGATATGTGGTTGTGTTAATGTAAAGGGTGTTGTTAAGAATTGTACAAGACATTTCCAGAATTTTTCTAAACCATTAGTCGCAGCGGGTGTGCATGGTAATAGGACAAACTTTACCTACCAGCCTATGCAGGAGAATTGGTGTGACCGTCACTCTTGGTATTGCCCTAAAGAGGAGCATTACATGACACCAGAGATGGCAATGTTTATTAAGAACTATTACAATTTGGCAACTTCACCAATGGCTGACACAATTTGGTGTGATTATGTTAAATCTGTACCCAACATGACGTGGGCTAATTTTAAATTCTCATTGTTTAAATCTAATGAGACAGTTATGTGTGGTCCGTCATCACATGCAGATTCAATGTTGTTGTCATGGTATGCTTTCTTACATGGTATACGGTTTGCTGTGAATCCATCTGTTATAGATATACCATCCCAAACACAGCCTATATATGTGTCATCGGATAGTGATGATTCATTGGATAAAGGTTGTGATGTTAGTTTGAGGCCAACAAAGAACAAGGGTAAGTTTAAGAAGCAGTCTGTTGCATACTTTTCAGCTGGACCTGTGGACTTGTGGTACTATGTTATGCTCATTATAGCGTTGGGAGCAATTTTTGTGTTTATGTATAGTTGTTTTATGGTAGGACAGTATGTTGTTATGCCAAGAGATAAGTTTTTTGGTGTTAATCCTACTGGATACTCATATGTTAATGCACAGCCATATTTACATGCTAGTCCACCTGTTTTGAGAAATAGTGATGGAATGGTTTTGGCAACACCATTGAAAGTTCCATCTATTTCTTATTCTGTTTATCGTCTACTGAGTGGTCACCTTTATTTTACTAAACTTATCGTAGCTGAAAATGAGTGCACACCACCTTTTGGTGCAGMTAGACTGTCACATGAGTTTACTTGTAATGATTTTACCTACATCTTACCAGCCCACTTAAGAATTTTTGGTCGTTATATTATGTTAATACACCCAGACCAGCTACATATGTTGCCCTTTGAGGTTGAGCATTCAACGCATACACGACTCTGTTATGTTACTGGGACTAATATTGTTGAGTGCTTACCAACATTTGAAATAATTTCACCATATGTTTTTGTAGTTTTAGTTGCTATATTTACTATAGTGTTTTTATTTTTACTTAGAATGTATATAGTGATGTATAGTTACTTTAAAGTTTTTACATATGTAGTTTTTAAGTTGTTATTTGTGAATACTGTTATGGTCCTGTTTGTTGTTTGTTTACCACCCCTAGTTCCTGGTGTTGTTTTTGTTTTGGCGCTTTGGTTGTGTGATAGTGTAGTGTTTTTGCTGTATTTGGCAGTTTTGAGTTTGTTTATTTTACCTTGGTTCTATGTGATGCTTTTTGTGTTGATAGTTGGTGGATTTGTTTTTTGGTGGATGATGAAGTCCTCTGATGTAGTGCATTTGACACCGGATGGGTTGACTTTTAATGGTACCTTTGAACAAGTTTCTAAGTGTGTATTTCCTTTAAACCCTTTGATTGTTAATCGTCTCTTGCTAGATTGTCGGATGTCACATTCAGACTTGGTAGAAAAGTCCAAGCTTAAAACAACTGAAGGAAAGCTTGCTACTGAGATGATGAAAGTTTTTATGACAGGTGAAACAGCATACTACCAGCCTTCAAACTTCAGTTTTCAGAGTGTTTTCTCAAAGGTTGTGTCACCCTTTACCCTACATGCTAGACCACCTATGCCCATGTTCAGATTGTATGTCTATTTTAATGGGCAGTGTGTTGGAACAACGTGCACAGGTACTGGCTTTGCTATAGATGATAGCACGATTGTAACTGCTAAACATCTTTTTGAGTGTGATGACCTTAAACCAACACATTTGTCTGTTGAGTTATCATGTAGATCTTATTGGTGCACGTGGAAGGAACCTAATGTTTTATCATGGAAGTTTGAGGGTGAGAATGCCTATATTTCTGTTGAAAATTTGAGAGATTTCTATGGTATAGATTTTAAGTATTTACCATTTCAGCAAATTGAATGTGAATTTTACAAACGTATGGAGGCAGTGACTATATATTCAATTAAGTATGGTAGTGAGTTTGCAACTCAAGCTTGGCAAACTGTTAATGGTCATTTTGTTTGTTGTAATACAGAAGGTGGTGATTCCGGTGCTCCCTTGGTTTGGCGCGATTCTGTAATTGGTGTGCATCAGGGTCTTTGTGATAGTTTTAAAACCACCTTGGCATCTGATAGTAAGGGTGTTATGATGACAGAGGTAAAGGGTTACCATGTTGACCCACCCGTCTATTATAAGCCTATTATTATGTCGGCGGCTTATAATAAGTTTGTTGCTGATAGTGATGTTAGTGTGGGTGAGTGTACTAATTATCATAATTTTGTTAATGAGGATTTTTTTTCGATGCATGATGAGTTAGAAAAGGTTTCATTTGGTGATAAGATGTTTAGGTATTGTCAAAGTTTACCCAGATATTTAGAACCCCTTCATTACTTTCATGTACCCTCATTTTGGCAGCCGTTTAAGAAGCAGTCTGTTTCGTCTAATGTTTCCTGGGTGGTGGAGAATTTACATTTTATTTTTAGTGTTTATTTTCTTGTTTGTGATTTTGTGGCATATTGGTGGCTTGATGATCCCTTTAGTGTTGTATTGCCTTTATTTTTTGTTGTACAGCTTTTGAGTACGGTTGTTTTGAAGAATGTTTTGTTTTGGAATACAAGTTATTTGGTTACTTTGGCAGTGACATTTTATGTGCATTCTGAGGTGGCTGAATCCATGTATCTTCTTGGTTTGTTTTCTGATCAAATAGTTAATCGTGTTGGTTTAATTTTGGTAGTATCTGTTATGTGTCTTTTTGTTGTTGTTCGTGTGGTTGTTAATGTCAAGCGTGCAATTTTTGTTGTGGTTGTTAGTGTTTTGTTGATTGTGGTAAATGTTGTGCTGGGTGTTGTGCAGTTTAATAGTCTTGTGGCAGTTTGTATGTTTGATATTTATGCTGTCTTTGCAGCATTGTTAACACCTCAGCCTGTGGTAGCAATAATGATGCTTATTTTGTTTGATACAAAGTGTTTAATGTCATTTGCCTTTGTTGTTATTGTATTGAGTTTTAGGGTTTTTAAGAATTATAAGTTTGTTAGGGTTTTGCATAATCTTTGTAATTTTGATTTTGTTTTGACTCAGCTTTCATTGTTTCGTTACCGCCACCATAACCAAGGTAATAACCCATCACATTATGAAGCATTGTGGTTGTTTTTGAAGGAATTGTATTATGGTGTACAGGATGTAAAGTATGAAGTCTTTTCACCACAGGCTGGTACATATAATGTTAGATTTTTGACTGACATGACTGAACAGGACCAATTGGAAGCTGTTGAGCAAGTGCAGCGCCGTTTACAGCGCTTTAGTATTGTACAGGATAAAAATTCCCAGAGGCTTGTGCTTTATTCTAAGAATGTTGATTTTCTTAGATCACAAATACAACACCAGCGTGTATTGGGTGCTAATCCATTTATTATAACAACTTTGACACCTAAAGATATTGCAATAGATAATGTTGAGGTCCATAACCCATCACAATTTAAACCTGAAGATTTGCAGGCTCATATGTGGTTTTATTCAAAGTCTCCTATATTTGTTGGCCAAGTTCCCATACCTACTAATGTGCAGACTGCAGCTGTGTTAGATACAACATATAATTGTCAAGACCTAACTGCGGATGAAAAGAATAATGTTGCTGCTAATTTACAAATACAGAATGCAGCATTGACTTTGTCACTATTTGAAGAGTGTAACAGGTTTCTTGAGAGTGAGTTGGGTGATGTTCCTACTCTAATGTGGCAGTCTGAGGATGTTGTTGATGTTAAACAACTTGAGGTGCAGATAGAAAAGCTTCGTGTTGTCTTGGATGGCATGCAGTTGGGTACTAGTGAGTACAAAGCAACGCGTAAACAAATTAATATATTACAGAGTCAGTTGGATAAAGCTCTTGCATTTGAGAGGAAGCTTGCTAAATTTTTAGAAAAAGTTGATCAGCAACAGGCTATTACAAATGAAACAGCAAAACAACTATCTGCATTTAAAAACTTAGTTAAACAAGTTTATGAAAGTTATATGTCATCTCTGAAGGTAAGAGTTGTTGAGTCAAATGATGCATCATGCCTATTGACATCCACTGATTTACCACGGAAACTTGTACTTATGAGACCTATAACAGGATTGGATAATATTAAGATTGTTGAGAAAGCAAATGGTTGTGAAATTACAGCTTTTGGTGACACGTTTACTACTGGATTAGGTAGTAACCTTGCCGGTTTGGCGTATTCATCAACTCAACCATTATCAGCTTACCCTTTTATATTTAATCTTGAGGGCATATTTAAACAGCAAGCTAATATTGGCTATAAGACCGTTGAGTGTAATATGTCATCTGACAACGGTAGTGTGCTCTATAAGGGTAAGATTGTTGCTGTACCATCAGAAGATAATCCTGATTTTGTTGTGTGTGGTAAGGGTTATAAGCTTGATTGTGGTATTAATGTACTTATGATACCATCAATAGTTCGTTATATAACCTTAAATTTGACTGACCATTTACAGAGACAGAGTTTGAAACCAAGACGACGGTTGCAGTATAAACAACAAGGAGTTAGACTTGGTGGTGTTAATCTTGGAGAACATCAAGCATTTTCAAATGAGTTAATTTCATCTGTCGGTTATACAACATGGGTTTCATCTACTGTTTGTACCGACAAATCCCACAAGCATCCCTGGTTTGTGCAGATACCAAGTAGTGAAAAAGATCCAGAGTGGTTTATGCATAATACTCAAGTTAAGAATAATCAGTGGGTAGTTGATGCTAAACCTACACATTGGCTTGTTGATGCAGATACAAATGAACAGCTATTTGCTTTGGCACTCACAGATGAGGAATATTTGAAAGCTGAATCTATTCTTGCTAAGTGGTCACCAATAACCCAGGATGTTGAGTGTTGGTTTAAGGATTTGAGGGGGTATTATACTGTGAGTGGCCTTCAACCATTATGGCCTGTTTGTCCAAAAAAAATTTGTAGTTTAAAGATTGTGCCAATTTTTCAGTCTCAGTCAGTGGCTTATGCTGATGAACCTACACATTTTCTTTCTTTACCTGTTGTAAATAAAAATTTTCTTGAGGCTTTTTATGAGTTACAAGAGGGCTTTCCTGGGGAGAAACAGGTGGCCCCCCATATTAGTTTGACCATGCTTAAATTGACTGAAGAGGATGTGGCGAAGGTTGAAGATATTCTTGATGAGATGGTATTGCCCAACACTTACGCCACTATTACCAACCCACATATGATGGGACAATATTATGTGTTTGAAGTAGAAGGTCTTCAGGCTCTTCATGATGAAGTAGTTTCTGTTTTGAGACAGCATGGCATAGCCTGTGATCAGACAAGAATGTGGAAGCCTCATTTAACTATAGGTGAAATTAAAGATGGTAGTGTGTTTAATAAATTTAAAGATTTTGGAATTACTTGTAAGTTAGAAGATTGTGATTTTGTTAAGTTAGGGGCACCAAAAGCAAATGCTCGTTATGAGTTCATTGCTACACTTCCTGTTGGTGATTTAAACTGCTGA
Protein
MSKTSRELTNETELHLCSSTLDLISKSQLLAQCLGTPQNLVSLSKMVPSILESPTLEPRYTSTHSSSLQSLQLLALNTSSTLYKWTTGSISKLRGHLERELCRGLVPLNDFIPKGNYVELSLMIPSVLTGQGTSTTTTLQEMCSDMVQSCIKSMETDLLKGVLALKDQTSCQEYFLSANYQSLIPPQPLVNAMRMSSVVDLSPLILENTRLLLKLSPFHGGTSVSYTSMIREFVDCSRRDEKCLKRRLTKKQKRQEEGSFDANKVITLGGKMYRYRVVILKCSDEVDDLIGFDGKVGEFDYNFENVPHCWRDLVKRRCLIRAKATWNLAGGVDENLDHVYIDESQXDFRCADGSSDSPSACVEDPHLEERIFSRVWLKQTSRFFGTKIQQVSELFKSIGLPELETTYCGVNPVKVGNKWLSFRDQGRSRVFFVYTDSNVYLATTRQKVCCDYILTKFKSVKWIGNKPDQCRVVKVLAWLISVNKVKNCTRVITPMLTVQGKISHRRVDYLDISVLDSYVSDTAGLNCVQKVKKFLSMYYNCGADLGLLDNFLTPIECGTKQLVFERCNCPNHQFYVAQFDNHVVLGLGRPTGVVYPEEIPSCANIYAVGFATQKRVVEVHYYSEMDRHQLPQDYYYFAYDQEFQHVGGDDYVNHHLDDVEDQPFPPVLFDDVYDSGDSLDDGGSDLDCFDVGYDFFWPEAPIPVPSPYGYYQGQRLRDLCVAGGDFGCDCPRCDGTFIYHPFRPRHYHSFDEVGPFIQMCEFTLTYSGQNYNLFYGLEPKVCLQDLVEASDKLLQLLVRGQLENISLPNDILACLSSLKLGANIHPFLWPAPFFNANGEWVDIFGGGDFTVFGEDFCLKAKSMVESVYFLVENFFSVDCPIGNLYCNLHLDGDVKKMLWSTIHMKYIYLALIHSEKVFNIILNSRQLSHQELVKLVIIGTFDVSIVAPCACSGDCNHGKVYNWTNLLSSVYRFVTLDQLVGLSYCEKRSLVLRKVQQYLEVEEGYQRPVQLLMAPFYGFNDNAEPDEQPLTGVFHQQVMQMFDTCVMLDVICGLKRPRASVYNLFGVLADYFRRPFTFRYYQVAEFSGSESTQVFTDVTSALTSKDPCSNRPYIYHDYAVCRVVEPRTAAVTTRGAIYPPEVIEMIRSYLPIEFDVGVMNYVDGNCDFKYCNLEFCLSGRGLVKLDTGELLDYKTNLFVVRYKTLPLLYVTSNPIYLSDFSLDNAVCLTGDFKLSFDVEPGSTLFGLYFTNGRCYRDVWETLPRFGLGTLSPPKCHSKCEPFENLAEVFFFKRRVQLVPLVNNYTPVFRHRPDIPKVLTVELMPYYSSIGYQGFVAPKCVLPGCVATQYCKLRHQLDRCVQVTKLAVAYAFYFKPLNIGSLYHLDPMRGTSYGKPAVVQFEPVGLIKEVNILVYQFGKHVAIHYFPECPTYVAYGHYPSHSVGVWLGYLPSVEECVIAQRNYRVYVPTCFRLSRTGCYHIQQDEDFERTHITVSYHYARDFDTKSLTPMFQMFSKIFGKSKQDLICALNSLSEESQSVLTLFCEEFDSAYTLQTISDEVSFETSTSPELVACVLAYAIGYELCLTVKTDGECESLDVGSSLEQVYVDYDVSKNVWDLSTHLQDDSSDDLELPFNQYYEFKVGRASVVLVQDDFKSVYDFLKSEQGVDYVVNPANNQLKHGGGIAKVISCMCGPKLTSWSNNYIKQYKKLGVTCAIRSPGFQLGKGVQIIHVVGPKSADSDVVNKLEASWRSVFQNVKPDTTVLTSMLSTGIFGCSVTDSATTLLSNLVDLDKDVVVFVVTNVSDQYIEALGVVESFQSAHGLPNFGNTCWFNALYQLLKSFAVKEQIVQDLVNCFDDFYECPTRQCVEWVCDQLGVVFGEQYDAVEMLVKIFDVFKCNVRVGYDCLARLQQVALGSCREVPADAVLMFFGQDKSGHWVAARKVCGVWYTFDDKVVVKKDPDWSKVVLVLRERGLFKATDFETPRPRRRRVAYRVPRDTISQDAIMFLEERQFSSGTMLAHSCVESVESFHVEGVQPSPLQSVDGLDDVADLSCDNHVCDNSDLQEPQVVVSQPSEVLTTSMSIECPVLENSECSVETDLNPVCEENEQVGESGIKEQDGVTTSDSQQVFSKSLDPIIKQHEVESVEPQDLPVFSQQPQVMLSMTWRDVLFQQYLGFKSDLLSLTHVNKFKIVVYLMVLWFVLLYCFSDFSLLSRFCLYVFLLWLSHVVLVVKKLDLGLVNSGGESYVLRILSSVKVPNCIAFNCDGVHWLILKLLFYSFHFYDFFVKTLVVVFQMPQLRCFTWPLLKLGFADTFLSHHILAFPTKQVSQSCLPVFGDERKYIYVPYWCKESFRTLVARAKQLTATGRTKTLDNWHYQCCSKTVKPSSCFNVRDFVFDDACNNHKHYGFFSALWFYVVFYSGFVSFWLPLMFCYCALFMCTFKNLPVNITRPIRWTVLQQVVDDLLSIITKPLFGRPACPPLSAYLTATTADEAVRASRSLLGRFCTPVGFQQPIMNVENGVAVSSLGFINPLMWPLFIVVLLDNRFVWFFNVLSYIMLPVFVIILFYFYLRKICGCVNVKGVVKNCTRHFQNFSKPLVAAGVHGNRTNFTYQPMQENWCDRHSWYCPKEEHYMTPEMAMFIKNYYNLATSPMADTIWCDYVKSVPNMTWANFKFSLFKSNETVMCGPSSHADSMLLSWYAFLHGIRFAVNPSVIDIPSQTQPIYVSSDSDDSLDKGCDVSLRPTKNKGKFKKQSVAYFSAGPVDLWYYVMLIIALGAIFVFMYSCFMVGQYVVMPRDKFFGVNPTGYSYVNAQPYLHASPPVLRNSDGMVLATPLKVPSISYSVYRLLSGHLYFTKLIVAENECTPPFGAXRLSHEFTCNDFTYILPAHLRIFGRYIMLIHPDQLHMLPFEVEHSTHTRLCYVTGTNIVECLPTFEIISPYVFVVLVAIFTIVFLFLLRMYIVMYSYFKVFTYVVFKLLFVNTVMVLFVVCLPPLVPGVVFVLALWLCDSVVFLLYLAVLSLFILPWFYVMLFVLIVGGFVFWWMMKSSDVVHLTPDGLTFNGTFEQVSKCVFPLNPLIVNRLLLDCRMSHSDLVEKSKLKTTEGKLATEMMKVFMTGETAYYQPSNFSFQSVFSKVVSPFTLHARPPMPMFRLYVYFNGQCVGTTCTGTGFAIDDSTIVTAKHLFECDDLKPTHLSVELSCRSYWCTWKEPNVLSWKFEGENAYISVENLRDFYGIDFKYLPFQQIECEFYKRMEAVTIYSIKYGSEFATQAWQTVNGHFVCCNTEGGDSGAPLVWRDSVIGVHQGLCDSFKTTLASDSKGVMMTEVKGYHVDPPVYYKPIIMSAAYNKFVADSDVSVGECTNYHNFVNEDFFSMHDELEKVSFGDKMFRYCQSLPRYLEPLHYFHVPSFWQPFKKQSVSSNVSWVVENLHFIFSVYFLVCDFVAYWWLDDPFSVVLPLFFVVQLLSTVVLKNVLFWNTSYLVTLAVTFYVHSEVAESMYLLGLFSDQIVNRVGLILVVSVMCLFVVVRVVVNVKRAIFVVVVSVLLIVVNVVLGVVQFNSLVAVCMFDIYAVFAALLTPQPVVAIMMLILFDTKCLMSFAFVVIVLSFRVFKNYKFVRVLHNLCNFDFVLTQLSLFRYRHHNQGNNPSHYEALWLFLKELYYGVQDVKYEVFSPQAGTYNVRFLTDMTEQDQLEAVEQVQRRLQRFSIVQDKNSQRLVLYSKNVDFLRSQIQHQRVLGANPFIITTLTPKDIAIDNVEVHNPSQFKPEDLQAHMWFYSKSPIFVGQVPIPTNVQTAAVLDTTYNCQDLTADEKNNVAANLQIQNAALTLSLFEECNRFLESELGDVPTLMWQSEDVVDVKQLEVQIEKLRVVLDGMQLGTSEYKATRKQINILQSQLDKALAFERKLAKFLEKVDQQQAITNETAKQLSAFKNLVKQVYESYMSSLKVRVVESNDASCLLTSTDLPRKLVLMRPITGLDNIKIVEKANGCEITAFGDTFTTGLGSNLAGLAYSSTQPLSAYPFIFNLEGIFKQQANIGYKTVECNMSSDNGSVLYKGKIVAVPSEDNPDFVVCGKGYKLDCGINVLMIPSIVRYITLNLTDHLQRQSLKPRRRLQYKQQGVRLGGVNLGEHQAFSNELISSVGYTTWVSSTVCTDKSHKHPWFVQIPSSEKDPEWFMHNTQVKNNQWVVDAKPTHWLVDADTNEQLFALALTDEEYLKAESILAKWSPITQDVECWFKDLRGYYTVSGLQPLWPVCPKKICSLKIVPIFQSQSVAYADEPTHFLSLPVVNKNFLEAFYELQEGFPGEKQVAPHISLTMLKLTEEDVAKVEDILDEMVLPNTYATITNPHMMGQYYVFEVEGLQALHDEVVSVLRQHGIACDQTRMWKPHLTIGEIKDGSVFNKFKDFGITCKLEDCDFVKLGAPKANARYEFIATLPVGDLNC

Summary

Uniprot
A0A0A7UXD3  
Pubmed
25552712   
EMBL
KM349742    AJA91203.1   
Proteomes
UP000153628   
Pfam
PF05213   Corona_NS2A
Interpro
IPR039573   NS2A-like
ProteinModelPortal
A0A0A7UXD3  
PDB
4Z5V     E-value=1e-19     Score=90.1     Identity=32.33%     Cov(Q)=2.99%     Cov(P)=63.94%
3D Structure

Ontologies

KEGG
vg:22807879    

Subcellular Location

From MSLVP
Capsid

Topology

Length:
4445
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
395.283459999998
Exp number, first 60 AAs:
0.00032
Total prob of N-in:
0.00033
outside
1  -  2181
TMhelix
2182  -  2204
inside
2205  -  2210
TMhelix
2211  -  2230
outside
2231  -  2270
TMhelix
2271  -  2293
inside
2294  -  2405
TMhelix
2406  -  2428
outside
2429  -  2519
TMhelix
2520  -  2542
inside
2543  -  2546
TMhelix
2547  -  2569
outside
2570  -  2765
TMhelix
2766  -  2788
inside
2789  -  2940
TMhelix
2941  -  2963
outside
2964  -  2982
TMhelix
2983  -  3005
inside
3006  -  3011
TMhelix
3012  -  3044
outside
3045  -  3426
TMhelix
3427  -  3449
inside
3450  -  3455
TMhelix
3456  -  3478
outside
3479  -  3509
TMhelix
3510  -  3532
inside
3533  -  3538
TMhelix
3539  -  3561
outside
3562  -  3570
TMhelix
3571  -  3593
inside
3594  -  3597
TMhelix
3598  -  3613
outside
3614  -  4445
 
 
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:  zhuzl@cqu.edu.cn, mg@cau.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号
In processing...
Login to ASFVdb
Email
Password
Please go to Regist if without an account.
If you have forgotten your password, you can once again Regist an account with a registed or new email.
Cancel Go
Change my password
Enter new password
Reenter new password
Cancel Go
Regist an account of ASFVdb
It is required that you provide your institutional e-mail address (with edu or org in the domain) as confirmation of your affiliation.
Enter email
Reenter email
First Name
Last Name
Institution
You can directly go to if with an account.
Cancel Regist
Registraion Success
Your password has been sent to your email.
Please check it and login later.
Welcome to use ASFVdb.
OK