CoVDB Coronavirus Database (v3)   
Strain
Bat_NC_010437 (Region: Hong Kong;  Strain: Bat coronavirus 1A, complete genome.;  Date: 2005)
Gene
ORF1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,  ORF1ab polyprotein
GenBank Accession
 

Sequence

CDS
ATGTCGTCCAACCTTGTGACATTGGCCTTTGCCAGTGATTCGGAGATTTCTGCAGAGGGTTTCTGTGATGTTAGTTCTGCCGTCTACGCTTTTAGCGTGTCCGCAGCTAACGGTTTCACAGATTGCCGTTTTGTAGCCCAAGGCTTAGAACATTGCCTTGTTGGTATTGAAGCTGATGACTACGTCCTGTGTGTAACAGGCGATGTTCAGCTTAAGGCATATATTGCCAAATTCTCGGACCGTCCTCTAAACCTTCGTGGTTGGATCGTCCGTTCTAATTCAAATTACTTTCTTGAAACCATGGATCTGGTTTTTGGCTGTGGTGGTGGCACTTCAATTCCAGTAGATAACTACATGTGTGGTGCCAACGGTAAGCCAGTTTTACCAGAAGATATGTGGTGCTTTTGCGACTATTTTGGTGATGATGGAGATAACATCACTGTAAATGGTCAAGCCTATCATAAGGCATGGAATGTCACTCGTGGTGATGTCCCATACCAGTTTCAGAATGCTAGCACTATTCTTAGCATTGAGTACCTTGCAGACGAAAAACATGTGCTGCCTGATGGTGCTGTTGCTAAGTCTGCTAAACCACCTAAGTTCTCTAAGAACATTGTTCTTTCAGAGAAATACAAAGCACTTTATGATGCTTGTGGCAATCCATTTGTCACTAATGGCACCAATGTCCTTGAGGTTGTAACCAACCCCATTTTTGCGCATGGTTTTGTGCAGTGTAAATGTGGGTCTAAACATTGGACTACTGGTGACTGGGCTGGTTTCAAATCAGTGTGCTGTGGCATACCAGGACGTGTCTTATGCACAGTCTTTGGTGGTGTTGCACCTGGTTCAGTTCTTCTGACATCAACTCGTGTTGATGCCAGCCCTGGTGCTACACGCTACTATCATGGTCTTACACTCAAACACATTTGCAATGTGGATGGTGTTGCATGCTGGCGTGTCACTAAAGTGCAGGGTGTCGAATGTTTTGTAGCTAGTGGTTCTATTGAGGACTGTGTTGGCTCCACTTTCGATACTTGTACATATGACAATTACACTTCATTTGCGAAGGCCTTTAAGTGTGGCATGCTAACTGGCAGCTTTTCTGACAATGTTGTTGCCAGTGTCATTAATGGCACACTTGATGTTGGTCTTGCAGTGCTGGATGTAACTACAGCTGTTACCAAGCCATGGTTTGTGCTGAAGTGTGGTTCACTTCTTGAATCTGCTTGGGATGCACTCATAATGGCCATTAAACAGTTACCTGTTATGGCTAGTGATGTGCTGAAGTTCTTTAACAACCTCACTCAAGTGCTGATTGTTGTTAGAAATGGTGTCATTGACATCATTCATTCTGTGCCAGAGGCTTTTAAGAGCGCCTTTGAGATCTTTAAAGACCTTGTTACAGGTGTGTTTGATCTTGTTGTTGATCACTTTAAGATCGCCAACAAAAAATTCAAGCGTGCTGGTGATTACATCCTTTTTGAAAACGCACTCGCTTGTCTTGTCAGTGGTAAGATTAAGGGTGTTAAACAAGCAGGTCTTAAAAAGCTTCTGTATGCTAAGGCTATTGTTGGTGCTACGGTTAAAGTTACTGTTAATCGTATTGAAAGTGCAACTGTCAAACTCGTTGAGTGTAAGCCATCTAACTTTGTTAAGAAAGGCAGTGCTGTTGTTATTAACAACATTGCATTTTTCCACAGTGATGGTGTTTACAGACTGATGAGTGACAGTGATGAGGTCTATGAAGACATTGCTTTTACTGCTGAAAGTGTGTCCACAGTTAAGAAACCAGTCTTTGATTGTACCAAACCAGTTGACTTTCCTGACATCAGTAGTACTGATGTTGAAGTACTGGTTCGCGAGGTCAGAGCTACTCTTGGTAAATTCTCCAGAGTCTACGACAAGTATAACTGTGTTGTCAAAGATGGAAAATGTGTTGTCACACATAGGTATGTCTTCAATGCACCTAGCTTTGTTGAAGACAAGGCTATATTTGTTGACCTCTGTAAGGATTATGTCGCAGATGTTGGCTTTGAGGCATTTTATGCTAATGCCATTGTTGCCAATAACTCTGATGAGTTTAATCCAGTTTACTCAGCTTTTGAGGTTTTCAAAACCAAAGTTGAGTGCCCTGAAGAATTTATGAATATTGATGGCGGTTCTATTTTTGGAACTTTCATCAATACAGTTAATGATGCTGTGAACTTTGTCAAATCGTTGAAGATAACGGTAACAGCTACTGAAGTCATGATCAACACTGTTAAGCGTTTCAAACGCTTTGCCAGTGCCCTTGCTAAGCTATATAGTGAGTTCATGAACACTGTCAAGAATATCATTTCTATCGGCAGTATCAAATGTTACCACTATGGCTTTGTGAAACCTGTTCTAGTGATCAAAGATATCTTTTACCGCATCTATGATGCTGCTGTAGACACATTCAATGTCGCTGTTGAAGCAGGTCTAAACACAGTTAAGACTTTCAGTGGTGGTGAAAATCCTATCACTTTCTCACGTGTTGAAGTTGCTAGTGTCGAGCTTGAACATGCTGAATATGTCAAGCCCGAAGCTAATGGTCATGTCAGTGTTATCAATGGACACACATTCTATACATGTGGTGACTATTACTACCCTTGTGACCAGAATAATTGCTTCTCACAGTGCTTTAAGAAGGTTGGTGGATCTGCTGTTACATTTTCTGAAAAAGTTGCTGTCAAACAAATTGACCCTGTTTACAAAGTAAAGCTCGTCTTCGAGTTTGAAGATGACACTATCAGTAGTGTTTGTAAGCAGGCAATTGGTAAATACATCTCTTTTGAAGGCAATGACTGGTCCAGCTTTGAGGAAACTATTCATAACGCTATGAATGTTGTTGGTGAATTCGTAGACCTACCTGATTACTTCATCTATGATGAAGAAGGTGGTCATGACTTAACTAACACTGTTATGATTTCTCAATGGCCAGTGTTTGATCCATCAGCACTACAACTTTTAGTTGCTGACTTGGGTGTCAACTGTGATTTCAATGGTAAGTCTTCCATTGAAGAATGCTTGACTTCTGTCTCTGACACTGTTCTTTGCGTGTCATTGGAAAAGTCATGTGACTGTGGCACCTTCAATGCTATAATGGAAGGGTTTGCACTTGATTTCAAACCATGCACTGATAGTGATGTCTGTGATAACTGTGGTGGTTTTTGTACTACTACTGTTTTGAGCATGACTGGTACTGGTTTTGTGCGTTCTTGTGATGAACCATTAATGCCTTTCAATGTTACATTTGAAGGTTATGGTGTTTACAAGAACGTTTGTTTTGTTAATGACACAGTGTTACCTCCTCCTTTTGATGAAGAGATCACACCTATTGAGGAAGACCTAGTAGTAGAAGATGTCATCACAGCTGATGAAGTTGTTGATGTTGAAACTACTGCACAAGTAGAAGAAGTGACTGTTGTTTCAGCTATCGAAGAGGACATTATCAAACCTGAAGAGGTTATTGATGTCTCTTCTGACATTGAAGCTGTTAATCATGCACTTTCCTTCATGAAACCTACAGAAACGAAGTTTGTAGACCCATTCAAGTTTGATTATTATGATCATGAGGGCATTCGTGTACTCAGACAGAATAATAACAATTGTTGGGTCGCTTCTACTTTGGTACAATTGCAACTTTCATGCTTGTTGGATGATGATGACACTATGGCTCTTTTTAAGGCTGGTAGTGTGTCACCATTAGTTCGCAAGTGCTATGATGCAGTTGGAGCTATTGTGGGTAGTCTAGGTGATGCATCTCATTGTTTAGAAGTTCTTTTAAAAGACCTGCATACCATGTTTATCACTTGTGATGCCACTTGTGGTTGTGGTAGCAGTAATTATGAACTTACTGGTTCTGTTTTTAGATTTATGCCTACCAGAGATAGTTTTAGTTATGGTGCTTGTGGTGTTTGTGGTAAAACACTCAAGCTTAAGATTAGAACTATGACTGGTACTGGCTTCTTTTGTCAGGACCCAAAACCTTTTAATACTGCACGTGCTATTGTAAAGCCAGTTTGTGCTAGTATTTATCAGGGTTCTACTACTAGTGGACACTATAAAACCAATGTCTTTGGCAAAAGATTTTGCGTTGATGGTTCTGGTGTTAGCAGCATTTCTAATGGCCATATTAACACGATTCTTTTGAAGGATTGTAACTATGGCATTTCTGCTATTGCTGAACCTAAGCAAGAAAAAGTTGAGCAATTTGTCACACCTGAAGATGTTGGACAAGTTGTCAAACAAAAACCTAAGCCTTTCACTATTTATCGCAATATTGAATTCTACCAAGGCGATGTTTCTGAATTAGTTGGTCTTGACTTTGACTTTATTGTCAATGCAGCCAATGAGAATCTTAAGCATGCTGGTGGAGTTGCAGCTGCGATCGACAAGCTTACTGGCAATGAATTGCAGAGTTTGTCAAATAAGTATGTAAAGACAAATGGTAAAGTCAAAGTTGGTTCTAGTGCCATGATACGTTGTAAGAAATACAGCGTACTTAATGTTGTAGGACCTAGAAAAGGTAAACATGCACCTGATCTTTTGGAAAAGTGTTATAGAACCATTCTTAAAGAGCAAGGTGTTCCTCTCACGCCTCTTATTAGTGTTGGTATATTTGGTATACCTCTTGCAACATCTTTCAATGCTCTATTGAACACGTCCAGTGGTAGAACGGTTAGATGCTTTTGCTACACTGATAAAGAGTGTAATGAGATTAAAACACTTGTTGCTTCGCTTAATGAAGAACAAGTTGCAGCTACTGTTGAAGAAACAGTTGTAGCTGAAGAAAAGCCTATTGCTGACTTAGAAACAGCTGTTGAAAGACCTGCTGAAGAAAAGTCAGTTGAAGCTGAGAAAATAGCTACCGAGGAGGTTAAAGAACCTTTGGTAGCCGAGAAAGTCATTGTTGAGGTAAATGAACCTGTTTTAAAGGTTGCTGGTGTGTCTTATTATAATATTGAAGACAGTTTTGC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Protein
MSSNLVTLAFASDSEISAEGFCDVSSAVYAFSVSAANGFTDCRFVAQGLEHCLVGIEADDYVLCVTGDVQLKAYIAKFSDRPLNLRGWIVRSNSNYFLETMDLVFGCGGGTSIPVDNYMCGANGKPVLPEDMWCFCDYFGDDGDNITVNGQAYHKAWNVTRGDVPYQFQNASTILSIEYLADEKHVLPDGAVAKSAKPPKFSKNIVLSEKYKALYDACGNPFVTNGTNVLEVVTNPIFAHGFVQCKCGSKHWTTGDWAGFKSVCCGIPGRVLCTVFGGVAPGSVLLTSTRVDASPGATRYYHGLTLKHICNVDGVACWRVTKVQGVECFVASGSIEDCVGSTFDTCTYDNYTSFAKAFKCGMLTGSFSDNVVASVINGTLDVGLAVLDVTTAVTKPWFVLKCGSLLESAWDALIMAIKQLPVMASDVLKFFNNLTQVLIVVRNGVIDIIHSVPEAFKSAFEIFKDLVTGVFDLVVDHFKIANKKFKRAGDYILFENALACLVSGKIKGVKQAGLKKLLYAKAIVGATVKVTVNRIESATVKLVECKPSNFVKKGSAVVINNIAFFHSDGVYRLMSDSDEVYEDIAFTAESVSTVKKPVFDCTKPVDFPDISSTDVEVLVREVRATLGKFSRVYDKYNCVVKDGKCVVTHRYVFNAPSFVEDKAIFVDLCKDYVADVGFEAFYANAIVANNSDEFNPVYSAFEVFKTKVECPEEFMNIDGGSIFGTFINTVNDAVNFVKSLKITVTATEVMINTVKRFKRFASALAKLYSEFMNTVKNIISIGSIKCYHYGFVKPVLVIKDIFYRIYDAAVDTFNVAVEAGLNTVKTFSGGENPITFSRVEVASVELEHAEYVKPEANGHVSVINGHTFYTCGDYYYPCDQNNCFSQCFKKVGGSAVTFSEKVAVKQIDPVYKVKLVFEFEDDTISSVCKQAIGKYISFEGNDWSSFEETIHNAMNVVGEFVDLPDYFIYDEEGGHDLTNTVMISQWPVFDPSALQLLVADLGVNCDFNGKSSIEECLTSVSDTVLCVSLEKSCDCGTFNAIMEGFALDFKPCTDSDVCDNCGGFCTTTVLSMTGTGFVRSCDEPLMPFNVTFEGYGVYKNVCFVNDTVLPPPFDEEITPIEEDLVVEDVITADEVVDVETTAQVEEVTVVSAIEEDIIKPEEVIDVSSDIEAVNHALSFMKPTETKFVDPFKFDYYDHEGIRVLRQNNNNCWVASTLVQLQLSCLLDDDDTMALFKAGSVSPLVRKCYDAVGAIVGSLGDASHCLEVLLKDLHTMFITCDATCGCGSSNYELTGSVFRFMPTRDSFSYGACGVCGKTLKLKIRTMTGTGFFCQDPKPFNTARAIVKPVCASIYQGSTTSGHYKTNVFGKRFCVDGSGVSSISNGHINTILLKDCNYGISAIAEPKQEKVEQFVTPEDVGQVVKQKPKPFTIYRNIEFYQGDVSELVGLDFDFIVNAANENLKHAGGVAAAIDKLTGNELQSLSNKYVKTNGKVKVGSSAMIRCKKYSVLNVVGPRKGKHAPDLLEKCYRTILKEQGVPLTPLISVGIFGIPLATSFNALLNTSSGRTVRCFCYTDKECNEIKTLVASLNEEQVAATVEETVVAEEKPIADLETAVERPAEEKSVEAEKIATEEVKEPLVAEKVIVEVNEPVLKVAGVSYYNIEDSFAVGADNIVILTNSKLELGKIGECIDKHSDGALKLAVSEYLSQTPNVPPGNVISMRCSGLATVVFAVVPSDGDVQYVRNVKRTISKLSKLKGSSVCSFSTLDMHKRLLNLFNKFCVDNIDDIKDIHDTKTTIKVSLDGRNVVDVDVAADQTIGEQLNACTTDNVIISDSVVTDVIDTIVNVAPEVDWDSFYGFPHAAEFHMLDHSAFAFDNDVVDGKRALVGTDNNCWINAVCLQLQFAEVDFTSEGLKDMWNEFLVGNVAKFCHWIYWLVRANKGDAGDAENALNMLNKYVKAHGTVTLTRETAEGCCVNEHRINSFVVNASVLRSGCNDGYCKHGNAYIARVSKVDGVSVIVNVDRPSVMSDNLLLSGTSYTAFSGPMDSGHYRVFNPATSKMFDGANCIGGDLCNLAVTAVVIKNKVFKIQTADNNTPVKIIKKLDDASEKFFSFGDIVSKNVCNSIIWFFTMLSIIFRAFKTRDFKVFALAPERTGVILSRSLKYNLKAAQHVLRRKQTYVERFFKFSVIAYTLYALSFMFVRFSPANDYFCKDHVEGYSNSTFVKDEYCASTMCKVCLLGFQELADLPHTKVVWKYVGFPIFVNWLPFLYLAFLFTFGGIFVKGLVCYFFAQYVNTLGVYFGMQEKFWPLQIIPFDIFGDEIVVTFIVYKALMFIKHVCFGCEKPSCVACSKSARLNRVPMQTIVNGANKLFYVVANGGSSYCHKHKFFCLNCDSYGPGNTFINETVARELSNVVKTNVQPTGESFIEVDKVSFENGSYYLYSGETFWRYNFDVTEAKYGCKEVLKNCNVLSDFIVYNNTGTNVSQIRNACVYFSQMLCKPIKLVDATLLSTLNVDFNGALHSAFVQVLNDSFSKDLSSCASMTECKQALGFDVSDEEFVDAVSNAHRFNVLLSDNSFNNLLTSYAKPEEQLSTHDVATCMRFNAKVVNHNVLIKENVPIVWLARDFQQLSEEGRKYLVKTTKAKGVTFLLTFNTNAMNVKLPAISIVNKKGAGVSSSFLWWLCAAIITFFFCVGISEGLIATSLEGFGFKYIKDGVMHDFDKPLSCVHNVFDNFNSWHEARFGSIPSNSLKCPIVVGTLDDVRNVPGVPSGILLVGKTLVFAIKAVFTDAGNCYGLNGLTNAGACLFNSACTKLEGLGGTHVYCYKDGLFEGSKRYSDLVPHSNYKMEDGNFVKLPETLVNGFGINIIRTMETTYCRVGECLKSKAGVCFGANRFFVYNDDFGSDYICGNGLFSFVKNLFNTFTMSVSVMALSGQVIFNCAVAALAIFICFLVVKFKRMFGDLSYGVCSVIAAVTINNLSYVFTQNMLFMFVYATFYFLAVRNLNYAWIWHASYVVAYFNLAPWFIIVWYVVAMLTGLLPSVLKLKISTNLFEGDKFVGTFENAAFGTFVIDMHSYEKLVNSITPDKLKQHAAMFNKYKYYSGSASEADYRCACFAHLAKAMTDYASSHQDMLYSPPSISYNSTLQAGLRKFAQPSGVIEHCIVRVSYGNMVLNGLWLGDEVICPRHVIASSINSAIDYDHEYTMMRLHNFSVSSGNLFIGVVSAKMRGASLVIKVNQNNPHTPKHVFKTLRAGDAFNILACYDGVPSGVYGTILRHNKTIRGSFINGACGSPGFNINGDTVEFVYLHQLELGSGCHVGSNMEGVMYGGFDDQPSLQIEGADCLVTVNVIAFLYGAILNGCTWFLSNERVSAEVFNGWAHDNNFTDVGSFDCFNILAAKTGVDVQRILASIQKLAKGFGGRNIIGYASLTDEFTVSEVVKQMYGVSLQSKRVPSIFNNVTLVSVFWSMFLSELLYYTSSYWIKPDLITAVFVLLFGIAVMLTLTIKHKVLFLYTFLIPSVVISACYNLAWDLYIRELLAKYFDYHMSIFSMDIQGCFNIVACILVNAIHTWRFVKTGTATRLTYVLSLVVSVYNYWCCGDFLSLSMMVLLNINNNWYIGAIAYRFSVVVVNYMDPSVIRMLGGVKVILFMYVTCGYLCCMYYGICYWFNRFFKCTMGLYEFKVSPAEFKYMVANDLRAPTGVFDSMSLSLKLMGLGGERTIKISTVQSKLTDIKCTNVVLMGCLSSMNIEANSKKWSYCVDLHNKINLCDDAEKAMEYLLALVTFFISEHADFNVSELVDSYFGDNSILQSVASTFVNMPSFIAYESARQSYEEAINNGSSPQLVKQLKRAMNIAKAELDHESSVQRKLNRMAEQAAAQMYKEARAVNKKSKVISSLHTLLFGMLRKLDMSSVDNILSLARDGVVPLSIIPAACATKLTIVVSDFESFKRIFQLGNVQYAGVVWSLTEVKDNDGKPVHIKEITANNTALTWPLILNCERIVKLQNNEVIPGKLKVRPLKGEGEGGFTADGKALFNNEGGKTFMYAFIADKPDLKVVKWEFDGGCNVIELEPPCRFAVVDAGGNNVVKYLYFVKNLNTLRRGAVLGFIGATVRLQAGKQTELVVNSSLLTLCSFAVDPAKCYLDAVKSGVKPVNNCVKMLSNGSGTGQAVTVGVEANTNQDSYGGASVCLYCRAHVDHPSIDGFCQFKGRYVQIPVGTVDPIRFCLENQVCKVCHCWLNNGCSCGRTSVIQSVDQAYLNRARGSSAARLEPCNGTEPEHVVRAFDIYNKEVASIGKFVKVNCVRFKNLDKHDAFFIVKRCTKSVMEHEQSIYDILKYSGALAIHDFFLWKDGRAIYGNICRQDLTKYTMMDLVNALRNFDEKNCEVLKEILILTGACDSSYFDNKSWYDPVENEDIHRVYAKLGDVIANAMLKCVALCDAMTEKGIVGVITLDNQDLNGNFYDFGDFVTSIPGVGVPVCTSYYSYMMPAMGMANCLARECFIKSDIFGSDFKTFDLLEYDFTEHKLKLFDKYFKYWGQDYHPDCADCYDEMCIVHCANFNTLFATTIPNTAFGPLCRKVFIDGVPVVTTAGYHFKQLGLVWNKDINTHSTKLSINELLRFVSDPALLVASSPALVDQRTVCFSVAALGTGVTKQTLKPGHFNKEFYDFLREHGFFDEGSELTLKHFFFAQKGDAAIRDFDFYRYNRPTVLDICQARVAYHVVKKYFEIYEGGCIAARDVVVTNLNKSAGYPLNKFGKAGLYYEALSYEEQDALYAVTKRNILPTMTQLNLKYAISGKERARTVGGVSLLSTMTTRQFHQKHLKSIVNTRNATVVIGTTKFYGGWDNMLRNLIDGVDNACLMGWDYPKCDRALPNMIRMISAMILGSKHENCCTNSDRYYRLCNELAQVLTEVVYSNGGFYLKPGGTTSGDATTAYANSVFNIFQAVSANINRILGVNSNTCNNLTVKELQRSLYDNCYRTSTVDPAFVDTFYGYLRKHFSMMILSDDGVVCYNKEYASLGYVADIGAFKATLYYQNNVFMSTAKCWVEEDLSKGPHEFCSQHTLQIVDGDGTYYLPYPDPSRILSAGVFVDDVVKTDAVILLERYVSLAIDAYPLSKHPNPEYRKVFYVLLDWVKHLNNTLNEGVLESFSVTLLEDSSSKFWDEGFYASLYEKSSVLQASGLCVVCGSQTVLRCGDCLRRPMLCTKCAYDHVVSTPHKFILSITPYMCNTSGCTVNDVTKLYLGGLSYYCIDHKPTLAFPLCSNGNIFGLYKNSATGSPDVEVFNTLATSEWNDAKDYRLANEVKDSLRLFAAETVKAREESVKSSYAAATLKEVIGPRESLLSWEVGKVKPPLNRNSVFTCYQITKDSKFQVGEYTFEKLDYDNDTVSYRSSTTYKLAPGMIFVLTSHNVPPLRAPTIANQERYASIYKLRPVFNISDDYANLIPYYQMIGKQMITTIQGPPGSGKSHCVIGLGLYYPNARIVFTACSHAAVDSLCVKASKNYVVDHCSRIIPARARVECYSGFKANNNSAQYIFSTVNALPECNADIVVVDEVSMCTNYDLSVINQRVSYRHIVYVGDPQQLPAPRTMITRGVLEPKDYNVVTQRMCAVGPDVFLHKCYRCPAEIVNTVSELVYENKFKPVHDDSKQCFKIYCKGSVQIDNGSSINRRQLEVVKMFLAKNPRWSKAVFITPYNSQNYVASRVLGLQIQTVDSSQGSEYDYVIYTQTSDTAHACNINRFNVAITRAKKGIFCVMCDKALYDSLKFFEIQLTDLQSGDLCGLFKDCSRVEEPLPPAYAPTYVSLSDRFKTSGELAVNVGAKGPCTYEHVISYMGFRFDLNVPGYHTLFCTRDFAMRNVRGWLGMDVEGAHVCGSNVGTNVPLQVGFSNGVDFVVQPEGCVMNNVNDTITSVKAKAPPGEQFAHLIQLMRKGQPWSVVRKRIVQMCCDYISTSSDVIIFVLWAGGLELTTMRYFVKVGPRIDCHCSKVATCYNSVEHQYYCFKHAMGCDYIYNPYVIDIQQWGYTGSLSSNHHQHCNVHRNEHVASGDAIMTRCLAIYDCFVKNVDWSITYPFIGNEAAINKGGRVVQSHIVKAAIKVYNPKVIHDIGNPKGIRCAVTNSTGYSYDKQPLNSNVKTLEYDYLIHGQMDGLCLFWNCNVDMYPEFSVVCRFDTRCKSTFNLEGVNGGSLYVNNHAFHTPAFDKRAFAKLKQAPFFFYDDGDCDSVQGSVNYVPLRASNCITRCNIGGAVCNKHANMYYSYVNAYNTYVQAGFTIWVPNSFDTYNLWQTLVTPQLQSLENVAFNVVKHGSFVGVKGDLPVAIVSDKVFVRDGVVDNVIFTNKTTLPTNIAFELYAKRKIGNSPSLTVLRNLGVTCTYKFVLWDYEADRPFTNYTKDVCAFTDFDADVCTCYDNSVEGSFERFSLCRNGVLISTTAVKKLSAIKLNYGYLNGFPITSHDNKPVTWYYYVRKDGVFVDQCDGIFTQGRNVSIFEPRSEMESDFLNLDMGLFISKYGLEDYAFEHIVFGDVSKNTLGGLHLLISQVRLSKMGVLKVEDFVSSADSTLKSCSVTYVNDPSSKMVCTYMDILLDDFVNVLKSLDLSVVSKVHEVIVDCKVYRWMLWCKDYKVQTFYPQLQSAEWKCGYSMPSLYKVQRMCLEPCNLYNYGASIKLPDGIMFNVVKYTQLCQYLNSTTMCIPHSMRVLHLGAGSDKGVAPGTSVLRRWLPTDAVIVDNDVNDYVSDADISVTGDCTTLYLQDKFDLVISDMYDGRIKQMDGENVSKDGFFVYINGVITEKLALGGTVAIKITEYSWNKRLYELIQKFSYWTMFCTSVNTSSSEASLIGVNYLGDFATDPIIDGNVLHANYIFWRNSTVMAMSYNSVLDLAKFQCRHKATVVIALKDNDISDVILGLIKNGKLFIRKNGVVCSYGNHLVSTK

Summary

Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pfam
PF08710   nsp9
PF09401   NSP10
PF06460   NSP16
PF05409   Peptidase_C30
PF08715   Viral_protease
PF06478   Corona_RPol_N
PF16348   Corona_NSP4_C
PF06471   NSP11
PF01661   Macro
PF08716   nsp7
PF08717   nsp8
PF13087   AAA_12
Interpro
IPR036333   NSP10_sf
IPR027352   CV_ZBD
IPR014828   NSP7
IPR008740   Peptidase_C30
IPR037204   NSP7_sf
IPR032505   Corona_NSP4_C
IPR009469   RNA_pol_N_coronovir
IPR009466   NSP11
IPR041679   DNA2/NAM7-like_AAA
IPR036499   NSP9_sf
IPR027351   (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094   RNA-dir_pol_PSvirus
IPR029063   SAM-dependent_MTases
IPR018995   RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR013016   Peptidase_C30/C16
IPR014827   Viral_protease
IPR027417   P-loop_NTPase
IPR042515   Nsp15_N
IPR038123   NSP4_C_sf
IPR037230   NSP8_sf
IPR009461   Coronavirus_NSP16
IPR002589   Macro_dom
IPR011050   Pectin_lyase_fold/virulence
IPR014829   NSP8
IPR037227   EndoU-like
IPR014822   NSP9
IPR009003   Peptidase_S1_PA
SUPFAM
SSF143076   SSF143076
SSF50494   SSF50494
SSF142877   SSF142877
SSF140367   SSF140367
SSF53335   SSF53335
SSF101816   SSF101816
SSF144246   SSF144246
SSF51126   SSF51126
SSF52540   SSF52540
ProteinModelPortal
PDB
6NUS     E-value=0.0     Score=1150     Identity=59.07%     Cov(Q)=13.36%     Cov(P)=96.96%

Ontologies

KEGG

Subcellular Location

From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm  
Host perinuclear region  
Host endoplasmic reticulum  
Host membrane  

Topology

Length:
6932
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
390.370159999995
Exp number, first 60 AAs:
0.00251
Total prob of N-in:
0.00054
outside
1  -  2119
TMhelix
2120  -  2139
inside
2140  -  2182
TMhelix
2183  -  2205
outside
2206  -  2267
TMhelix
2268  -  2290
inside
2291  -  2678
TMhelix
2679  -  2701
outside
2702  -  2932
TMhelix
2933  -  2955
inside
2956  -  2961
TMhelix
2962  -  2984
outside
2985  -  2987
TMhelix
2988  -  3010
inside
3011  -  3016
TMhelix
3017  -  3039
outside
3040  -  3344
TMhelix
3345  -  3367
inside
3368  -  3454
TMhelix
3455  -  3477
outside
3478  -  3486
TMhelix
3487  -  3506
inside
3507  -  3512
TMhelix
3513  -  3535
outside
3536  -  3549
TMhelix
3550  -  3572
inside
3573  -  3584
TMhelix
3585  -  3607
outside
3608  -  3616
TMhelix
3617  -  3634
inside
3635  -  3646
TMhelix
3647  -  3669
outside
3670  -  6932
 
 
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