CoVDB Coronavirus Database (v3)   
Strain
Bat_NC_014470 (Region: Bulgaria;  Strain: Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008, complete genome.;  Date: 2008)
Gene
ORF1ab polyprotein
Description
Annotated in NCBI,  ORF1ab polyprotein
GenBank Accession
 

Sequence

CDS
ATGGAGAGCCTTGTCCCTGGTTTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTACCTGTTTTGCAGGTTCGTGACGTGCTCGTACGTGGATTCGGTGACACCGTAGAAGAGGCTGTCGCTGAAGCACGCCAACATTTAATTGAAGGAACATGTGGCATTGTTGATCTCCAGAAGGGTGTTTTACCCCAACTGGAACAACCTTACATTTTCCTTAAACGCTGTGATGCCCGTACTGCTCCCCACGGCCATGTTATGGTCGAATTGGTGGCAGAGCTTGATGGCGTCCAGTATGGTAGGAGCGGAGAATCTCTTGGTGTGTTAGTCCCGCATGTGGGTGAAACACCAATTGGTTACCGCAAGGTTCTTGTCCGTAAGAACGGTAATAAGGGAGCCGGTGGTCACTTGTACGGCGCCGATCTAAGGTTTTACGATCTAGGTGACGAACTTGGCACTGACCCCCTTGATGACTTCCAACAAGATTGGAATACTAAGCATGGCAGTGGGCTTCGCCGCGATCTCTTTAGGGAGCTCAATGGTGGTGTCTACACACGCTATGTTGATAACAACTTCTGCGGACCAGATGGTTATCCTCTGGAATGCATAAAAGACTTGCTTGCGCGAGCTGGCAAGTCAAGCGCACCTCTTGCTGAACAGCTTGACTTTTTGGAGTCTAAGAGAGGTGTGTACTGTTGCCGTGAACATGAGCATGAGATTGCTTGGTACACGGAGCGCTCTGATAAGAGCTATGAGCTTCAGACACCTTTTGACATTACTAATGCCAAAAAGTTTGATTCTTTCAAAGGCGAATGTCCTAAATTCGTCTTCCCACTTAATTCCACAGTTAAAGTCTTGCAACCACGTGTTGAAAAGAAGAAGACTGAGGGATTTTTAGGCCGTATTCGTACGGTTTACCAAGTTGCATCACCTGGTGAGTGTAACTCTATGCACCTGTCTACCTACATGAATTGTAACCATTGTGGTGAAAAGTCATGGCAGACATGTGATTTCTTAACAGCCACTTGTGAAATGTGTGGCAACCAGAATACTGTTGAAGAGGGACCTACCACATGTGGGTATGTACCTAGTAATGCTGTAGTAAAGATGGTTTGCCCTGCCTGTCAGAACCCAGAGATTGGGCCCGACCATAGTGTGGCAGATTACCACAACAACTCAAAGATTGAAACTCGACTCCGCAAGGGAGGTAGGATTAAATCTTTTGGTGGCTGTGTTTTCTCTTATGTTGGCTGCTACAACAAGCGTGCCTTCTGGGTGCCGCGTGCCGCAGCCAATATTGGTTCCAACCATACTGGCGTTGTCGGTGAAGGAGTTGAAACCATGAATGAGGACTTGCTTCAGATCTTAAGTCGTGAACGTGTTGTTATCAACATTGTTGGCGAGTTTTGTCTGAACGAGGAGATTGCTATCTTACTTGCTTCTCTTTCAGCGTCTACTAGTGCTTTTGTAGAGACAGTTAAAAATCTTGATTTTAAAACTTTCAAGAAAATCATTGAGTCTTGTGGTAATTATAAAGTGACCAAGGGCAAGTTTAAACCTGGTGTCTGGAATATTGGCACTAGTAAATCATTGCTTACACCTCTGCATTGCTTTTCATCGCAGGCTGCAGGTGTAGTTCGCTCAATCTTCTCTCGCACACTTGCTACAGCTAATCATTCAATTGTAGACCTGCACAGAGCTGCTATGATTATTTTCTCTGATATATCAGATCAAGCCAATCGTGTGCTGGATGCCATGGTCAACACATCTGACTTAGTCACTGAAAGTGTTGTTGTCATGGCTTATCTCACAGGTGGATTGGTGCAACAGGTTAGTACCTGGTTGAGCCAATTACTTAATACTTCTGTAGACAAGTTTAGCGCAGTTTTGCGCTGGCTTGAGCAAAAGCTCCAAGGTGGCATTGATTTTCTTCGTCAAGCTTGGGGCATTCTTAAACTTCTAGTCACTGGCGCTTATGTGGTTATAAGAGGTAAAATTCAAGTTGTTAACACTAGTCTCATAGAGTGCGTTACATCATTTGTTGACGTCGTTAACAAGGTTTTTGAGCTCTGTACTGATTACATTACTGTTGCTGGTGCTAGAGTGCGTGCTATAAATTTTGGTGAGGTTTTGATTGCGCAAAGTCGAGGCCTCTACCGTCAGTGTGTACGTGCCAGAGATCAGCTTCAGTTGTTGATGCCTTTAAAATCGCCAAAGGACGTTGTTTTCCTTGACGGTGATGCTTATGACACACTTTTAACCTCTGAGGAGGTAACAGTTAAAAATGGAACTCTTGAAGCACTTGATCTTGAACTCAGTGACGTAGTTACTGGTGTTGCGGAGGGAGTCCCTGTTTGTGTTAATGGTCTAATGCTCTTAGAATTGAAGGAAAAGGAGCAATACTGTGCATTGTCTCCTTCTCTACTTGCAACTAATAACGTCTTTACATTAAAAGGAGGTGCCCCTACAAAGGGAGTCACATTTGGTGAAGACACAGTTGTGGAAATCCAGGGTTATAAAAGTGTTAAAATCACTTTTGAGTTGGATGAACGTGTTGATAAAGTTCTTAATGAGAAGTGTGCATCCTATACAGTAGAGACCGGCACTACAGCTGAAGAACTTGCTTGTGTTGTGGCTGAGTCTGTTGTAAAGACTTTACAACCAATCTCTGAATTACTAACACCCATGGGTATCGACCTTGATGAATGGAGTGTAGCTAAATTTTACCTGTTTGATGAGTCTGGTGAAGCAGTTCTTTCATCACACATGTATTGTTCCTTCTATCCTCCTGACGAAGAGGAAGAAGAAGATTTGGAAGAGTCTGAAGATGTCGAATACGGTACTGAAGACGATTACACAGGCGCCCCGCTCGAATTCGGTGCTAGTAGCACTGTTGAGCAGGACGAGGTCCATGATGAAGAGGAAGACTGGCTTGCACCACAGGAAGAGTCCGAAGTGTTATATGACCAGTTTACCGATTATCACAAACTCACAGACAATGTCTTCATAAAGTGTGCTGATATTGTTGAAGAGTCTCTGAAAGTCAACCCAACAGTTGTAGTGAATGCTGCTAACATACACTTGAAACATGGTGGTGGTGTTGCACGAGCACTAGATAAAGCAACTGGCGGTAGTATGCAAAAAGAATCTAATGATTACATTTCTACTAATGGTCCTCTTAGAGTAGGAGGTTCCTGTCTTCTCTCAGGCCATAACTTAGCTAAACATTGTTTGCATGTTGTTGGCCCAAATAAAAATGCAGGAGAGGATATTAAACTCCTTGATGCAGCCTATGAGAACTTCAATGCATATGAAGTAGTTTTATCACCACTACTGTCAGCAGGTATCTTTGGTGTAAGTCCTATTCAATCACTAGAGACTTGCAAGCGCGTGGTGCGTAACACAGTCTACATTGTTGTAAACGACAGTGTGGTATTTGATCAGCTTTTAGCCAAAACCCCTGGAAAGACTAACGAGAGGCCTGTTGTTGAATCTTCAGAAATTTGTGAGGAGGTCAACCAGAAGCCTGTTGTTGAGTTTTCAGAAACTAAGGAGTTGCATGAAGAGACCAATCAGAAGCTTAAGTCTTCGGAAGAGCCTGTTAAAACCCGCATTGAGGAGTTGAACACAACTGTTGATGAGGCTAAATTTCTAACCACTAAGTTGCTATTATATGCAGATGTCAATGGTAATCTTAGTGAAGATTCAAAGGTGTTAATTGGCAATGATGGCGCGTCCTTTAAAAAGGGTGCTCCTTACATTGTTGGTGACATCATTAGCGAAGGTGAATTGACCTGTGTTGTTTTACCAACTAAAGCTGTGGGTGGTACAACTCATATGCTTACTAGGGCTCTGAAGAATGTACCTTCAGACACCTATCTTACAACCTATCCTGGTCAGGGTGTTTCAGGCTACACTTTGGATGAAGCTAAAGCAGCTCTTAAAAAGTCCAGATCAGTCTTTTACATATTACCTTCAGCAAATGTTAATGCTAAGGAAGAGGTTTTAGGCACTGTTGCCTGGAACTTGCGTGAAATGTTAGCTCACGCTGAGGAAACTAGGAAAGTTATGCCAGTCTGTATGGATGTTAGGGCGATTATTTCCACAATTCAGCGTAAGTATAAAGGAATTGGAATACAGGAAGGTCTTGTAGATTATAAAGTAAGATTTTACTTTTACTCTAGCAAAACACCTATTGCTAGGGTAATCTCAAACCTTAATTCTCTTGGAGAGCCCCTGATTACTATGCCTTTGGGCTATGTCACACATGGACTCAATTTAGAAGAATCAGCGCGCTACATGCGTTCTGTTAAGGTTCCTGTTGTAGTTTCTGTGTCTTCACCTGATGCAGTCACTTCTTACAACGGTTATGTTACATCTGCTTCTAAGAGTGCTGAAGAACACTTTATTGAAACAGTTTCCTTAGCGGGTTCATACAAGGATTGGTCATATTCTGGCCAACGTACTGAACTTGGTGTTGAATTCCTCAAGAGAGGTGACAAAATTGTCTACCATACAGTAGGAAATGTTATAGAATTTCACATGGAAGGTGAAGTTCTTCCTCTTGAGAAGTTAAAAACTCTCTTAGCTTTAAGAGAGGTTAAAACTATTAAGGTGTTCACAACTGTAGATAACATCAACTTACACACACAAGTCATTGATATGTCTATGACTTATGGACAACAGCTAGGACCCACCTATATGGACGGTGCTGATCTTACTAAAGTCAAACCTCATGCTAGTCATGAGAACAAGACTTTCTTTGTCCTACCTAGTGATGATACGCTACGTATTGAAGCTTTTGAGTACTATCATACCGTAGACGAGAGTTTTTTTGGTAGATACATGTCAGCATTAAACCATACTAAAAGATGGAAGTATCCTCAAGTTGGTGGTTTAACATCTATAAAATGGGCAGATAACAATTGTTACTTGTCTAGTGTTCTTTTGTCACTACAACAAATTGACATTAAGTTTAATGCACCAGCACTTCAGGATGCTTATTA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Protein
MESLVPGFNEKTHVQLSLPVLQVRDVLVRGFGDTVEEAVAEARQHLIEGTCGIVDLQKGVLPQLEQPYIFLKRCDARTAPHGHVMVELVAELDGVQYGRSGESLGVLVPHVGETPIGYRKVLVRKNGNKGAGGHLYGADLRFYDLGDELGTDPLDDFQQDWNTKHGSGLRRDLFRELNGGVYTRYVDNNFCGPDGYPLECIKDLLARAGKSSAPLAEQLDFLESKRGVYCCREHEHEIAWYTERSDKSYELQTPFDITNAKKFDSFKGECPKFVFPLNSTVKVLQPRVEKKKTEGFLGRIRTVYQVASPGECNSMHLSTYMNCNHCGEKSWQTCDFLTATCEMCGNQNTVEEGPTTCGYVPSNAVVKMVCPACQNPEIGPDHSVADYHNNSKIETRLRKGGRIKSFGGCVFSYVGCYNKRAFWVPRAAANIGSNHTGVVGEGVETMNEDLLQILSRERVVINIVGEFCLNEEIAILLASLSASTSAFVETVKNLDFKTFKKIIESCGNYKVTKGKFKPGVWNIGTSKSLLTPLHCFSSQAAGVVRSIFSRTLATANHSIVDLHRAAMIIFSDISDQANRVLDAMVNTSDLVTESVVVMAYLTGGLVQQVSTWLSQLLNTSVDKFSAVLRWLEQKLQGGIDFLRQAWGILKLLVTGAYVVIRGKIQVVNTSLIECVTSFVDVVNKVFELCTDYITVAGARVRAINFGEVLIAQSRGLYRQCVRARDQLQLLMPLKSPKDVVFLDGDAYDTLLTSEEVTVKNGTLEALDLELSDVVTGVAEGVPVCVNGLMLLELKEKEQYCALSPSLLATNNVFTLKGGAPTKGVTFGEDTVVEIQGYKSVKITFELDERVDKVLNEKCASYTVETGTTAEELACVVAESVVKTLQPISELLTPMGIDLDEWSVAKFYLFDESGEAVLSSHMYCSFYPPDEEEEEDLEESEDVEYGTEDDYTGAPLEFGASSTVEQDEVHDEEEDWLAPQEESEVLYDQFTDYHKLTDNVFIKCADIVEESLKVNPTVVVNAANIHLKHGGGVARALDKATGGSMQKESNDYISTNGPLRVGGSCLLSGHNLAKHCLHVVGPNKNAGEDIKLLDAAYENFNAYEVVLSPLLSAGIFGVSPIQSLETCKRVVRNTVYIVVNDSVVFDQLLAKTPGKTNERPVVESSEICEEVNQKPVVEFSETKELHEETNQKLKSSEEPVKTRIEELNTTVDEAKFLTTKLLLYADVNGNLSEDSKVLIGNDGASFKKGAPYIVGDIISEGELTCVVLPTKAVGGTTHMLTRALKNVPSDTYLTTYPGQGVSGYTLDEAKAALKKSRSVFYILPSANVNAKEEVLGTVAWNLREMLAHAEETRKVMPVCMDVRAIISTIQRKYKGIGIQEGLVDYKVRFYFYSSKTPIARVISNLNSLGEPLITMPLGYVTHGLNLEESARYMRSVKVPVVVSVSSPDAVTSYNGYVTSASKSAEEHFIETVSLAGSYKDWSYSGQRTELGVEFLKRGDKIVYHTVGNVIEFHMEGEVLPLEKLKTLLALREVKTIKVFTTVDNINLHTQVIDMSMTYGQQLGPTYMDGADLTKVKPHASHENKTFFVLPSDDTLRIEAFEYYHTVDESFFGRYMSALNHTKRWKYPQVGGLTSIKWADNNCYLSSVLLSLQQIDIKFNAPALQDAYYRARAGDAANFCALVLAYSKKTVGELGDVRETMAHLLQHANLESAKRVLNVVCKHCGQKSTTLSGVEAVMYMGTLSYDHLKRGVKIPCVCGREATQYLVKQESTFVMMSAPPAEYTLQTGEFLCANEYTGNYQCGHYTHITNRETIYKIDGALLTKITEYKGPVADVFYKETSYSTDIKPVSYKLDGVTYTEINPDLNGYYKKDNAYYTEQPIDLVPTQPLPNASFDNFRFVCANTKFADDLNQMTGFKKPPSRDLTITFFPDLNGDVVAIDYRHYTPTFKKGAKLVHKPILWHVNQTTTKSTFKPNMWCLRCLYSTKPVPTSNSFEVLSSDDAQGMDNLACESQQTVAEEVVDNPTIQKDIIECDVKTTEVVGNVILKPSADGIKVTSELEHEDLMAAYVNETSITIKKPNELSIMLGLKTIATHGAAAINSVPWIKICAYVKPFLGYVAEQSKNCIKRCFRRVFNDYMPFLLTLLLQLCTFTKSTNFRIKAAMPIVIARNSVIGGVRFCLDALTMYVKSPKFSGILTVVMWLLLLSVCLGCLVYAVASFGAILSGFGLMSYCDGVRAGYVNSSNVTIPDYCAGSLPCGVCLGGLDSLDAYPALETIQVTISSYKLDLTFVGMMAEWFLAYMLFTKFFYLLGLFALMQLFFGLFATHFVNNSWLMWLIINVVQMAPISAMVRMYVFFASFYYVWKAYIHVINGCTSSTCIMCYKRNRATRVECTTIVNGMKKSFYVYANGGQGFCKLHNWNCLNCDTFCSGSTFISDEVARDLSLQFKRPINPTDQSSYNVDSVTVKDGTLYLYFQKAGKLTYERHPLSYFVNLDNLRANNVKGTLPINVIVFDGKSKCEEAAAKSASVYYSQLMCQPILLLDQALISDVGDSTEVAVKMFDAYVNAFSSTFNAPMEKLKTFIATAHAEIAKGVSLDSVLSTFLSAARQGFVDSDVDTKDVMECLKLSHHSDLEITSDSCNNFMLTYNKVENMTPRDLGACIDCSARHINAQVAKSHNVSLVWNVKDYMSLSEQLRKQIRSAAKKNNIPFKLTCATTRQVVNVITTKISLKGGKFVSNNWFRFLLKMTVLMVLVAFIFYFITPTHTLMGHDVFSSEIIGYKAIHNGVTRDVLTTDDCFANKHTGFDHWFSQRGGSYRNDKTCPVIAAVITREVGFIVPGLPGTVRRASNGDFLHFLPRVFSAVGNICYTPAKLIEYTDFATSACVLAAECTIFKDAQGKPVPYCYDTNLLEGSISYSELRPDTRYVLMDGSIIQFPSTYLEGSVRVVTTFDSEYCRHGTCERSDAGVCLSTNGRWVLNNDYYRSIPGVFCGADASDLLFNIFTPLVRPVGTLDISASVVAGGLIAILVTCVAYYFMKFRRAFGEYNHVVFANALLFLLSFTILCLTPAYTFLPGIYSLLYLYLTFYFTNDVSFLAHLQWLAMFSPIVPFWITVTYVVCISIKHCHWFFSNYLKKRVVFNGVTFSTFEEAALCTFLLNKEMYLKLRSETLLPLTQYNRYLALYNKYKYFSGALDTTSYREAACCHLAKALNDFSNSGADVLYQPPQTSITSAVLQSGFRKMAFPSGKVEGCMVQVTCGTTTLNGLWLDDVVYCPRHVICTLEDMLNPNYDDLLIRKSNHNFLVQASNVQLRVIGHTMQNCLLKLKVDIANPKTPKYKFVRIQPGQTFSVLACYNGAPSGVYQCAMRSNHTIKGSFLNGSCGSVGFNIDYDCVSFCYMHHMELPTGVHAGTDLEGNFYGPFVDRQTAQAAGTDTTITLNVLAWLYAAVINGERWFLNRFTTTLNDFNLVAMKYNYEPLTQDQVDILGPLSAQTGVAVMDMCAALKELLQNGLNGRTILGSTILEDEFTPFDVVRQCSGVTFQGKFKKVVKGTHHWLLLTLLTSLLILVQSTQWSLFFFVYEHAFLPFTMGVVCFAACAMVLVKHKHAFLCLFLLPSLITVAYFNMIYMPASWVMRVMTWLDLVDTSLSGYRLKDCVMYALAAFLLILMTARTVYDDAARRVWTVMNVITLVYKVYYGNSLDQALAMWALVISVTSNYSGVVTTIMFLARAIVFLCVEYYPILFITGNTLQCIMLVYCFLGYCCCCYFGLFCLLNRYFRLTLGVYDYFVSTQEFRYMNSQGLLPPKTSLDAFKLNVKLLGIGGKPCIKVATVQSKMSDIKCTSVVLLSVLQQLRIESSSKLWAQCVQLHNDILLAKDTTEAFEKMVSLLSVLLSMQGAVDINKLCDEMLNNRATLQAIASEFSSLPSYAAYATAQEAYEQAVANGDSEVVLKKLKKSLNVAKSEFDRDAAMQRKLEKMADQAMTQMYKQARSEDKRAKVTSAMQTMLFTMLRKLDNDALNNIINNARDGCVPLNIIPLTTAAKLMVVVPDYNTYKNTCDGNTFTYASALWEIQQVVDADSKVVQLSEINMDNSQNLAWPLIVTALRSNSAVKLQNNELSPVALRQMSCAAGTTQTACTDDNALAYYNTSKGGRFVLALLSDHQDLKWARFPKSDGTGTIYTELEPPCRFVTDTPKGPKVKYLYFIKGLNNLNRGMVLGSLAATVRLQAGNATEVPANSTVLSFCAFAVDPAKAYKDYLASGGQPITNCVKMLCTHTGTGQAITVIPEANMDQESFGGASCCLYCRCHIDHPNPKGFCDLKGKYVQIPTTCTNDPVGFILRNTVCTVCGMWKGYGCSCDQLREPVMQAADAPAFLNRVCGVSAARLTPCGTGTSTDVVYRAFDIYNEKVAGFAKFLKTNCCRFQEVDEEGNLLDSYFVVKRHTMSNYQHEETMYNLVKECPAVAVHDFFKFRVDGDMVPHISRQRLTKYTMADLVYALRHFDEGNCDTLKEILVTYNCCDDAYFNKKDWYDFVENPDILRVYACLGERVRQALLKTVQFCDAMRDAGIVGVLTLDNQDLNGNWYDFGDFVQVAPGAGIPIVDSYYSLLMPILTLTKALAAESHMDCDTTKPLIKWDLLKYDFTEERLCLFNRYFKYWDQTYHPNCINCLDDRCILHCANFNVLFSTVFPPTSFGPLVRKIFVDGVPFVVSTGYHFRELGVVHNQDVNLHSSRLSFKELLVYAADPAMHAASGNLLLDKRTTCFSVAALTNSVAFQTVKPGNFNKDFYDFAVSKGFFKEGSSVELKHFFFAQDGNAAISDYDYYRYNLPTMCDIRQLLFVVEVVDKYFDCYDGGCINANQVIVNNLDKSAGFPFNKWGKARLYYDSMSYEDQDALFAYTKRNVIPTITQMNLKYAISAKNRARTVAGVSICSTMTNRQFHQKLLKSIAATRGATVVIGTSKFYGGWHNMLKTVYSDVETPNLMGWDYPKCDRAMPNMLRIMASLVLARKHSTCCNLSHRFYGLANECAQVLSEMVMCGGSLYVKPGGTSSGDATTAYANSVFNICQAVTANVNALLSTDGNKIADKYVRNLQHRLYECLYRNRDVDHEFVEEFYAYLRKHFSMMILSDDAVVCYNSNYAAQGLVASIKNFKAVLYYQNNVFMSEAKCWTETDLTKGPHEFCSQHTMLVKQGDDYVYLPYPDPSRILGAGCFVDDIVKTDGTLMIERFVSLAIDAYPLTKHPNQEYADVFHLYLQYIRKLHDELTGHMLDMYSVMLTNDNTSRYWEPEFYEAMYTPHTVLQAVGACVLCNSQTSLRCGSCIRRPFLCCKCCYDHVISTSHKLVLSVNPYVCNAPGCDVTDVTQLYLGGMSYYCKSHKPPISFPLCANGQVFGLYKNTCVGSDNVTDFNAIATCDWTNAGDYILANTCTERLKLFAAETLKANEETFKLSYGIATVREVLSDRELHLSWEIGKPRPPLNRNYVFTGYRVTKNSKVQIGEYTFEKGDYGDAVVYRGTTTYKLNVGDYFVLTSHTVMPLTAPTLVPQEHYVRITGLYPTLNISDEFSSNVANYQKVGMQKYSTLQGPPGTGKSHFAIGLALYYPSARIVYTACSHAAVDALCEKALKYLPIDKCSRIIPARARVECFDKFKVNSTLEQYVFCTVNALPETTADIVVFDEVSMATNYDLSVVNARLRAKHYVYIGDPAQLPAPRTLLTKGTLEPEYFNSVCRLMKTIGPDMFLGTCRRCPAEIVDTVSALVYDNKLRAHKGKSSQCFKMFYKGVITHDVSSAINRPQIGVVREFLTRNPAWRKAVFISPYNSQNAVASKILGLPTQTVDSSQGSEYDYVIFAQTTETAHSCNVNRFNVAITRAKVGILCIMSDKDLYDKLQFTSLEVPRRSVAVLQSENVTGLFKDCSKLITGLHPTQAPTYLSVDTKFKTEGLCVDIPGIPKDMTYRRLISMMGFKMNYQVNGYPNMFITRDEAIKHVRAWIGFDVEGCHATRDAVGTNLPLQLGFSTGVNLVAVPTGYVDTSAATEFSRVNAKPPPGDQFKHLIPLMYKGLPWNIVRVKIVQMLSDTLKDLSDRVVFVLWAHGFELTSMKYFVKIGPERTCCLCDKRATCFSTSSDTYACWHHSVGFDYVYNPFMIDVQQWGFTGNLQSNHDQHCQVHGNAHVASCDAIMTRCLAIHECFVKRVDWSVEYPIIGDELRINVACRKVQHMVVKSALLADKFPVLHDIGNPKAIKCVPQADVEWKFYDVQPCSDKAYKIEELFYSYATHHDKFTDGVCLFWNCNVDRYPSNAIVCRFDTRVLSNLNLPGCDGGSLYVNKHAFHTPAFDKGAFANLKQLPFFYYSDSPCESHGKQVVSDIDYVPLKSATCITRCNLGGAVCRHHASEYRQYLDAYNMMISAGFSLWIYKQFDTYNLWNTFTRLQSLENVAYNVVNKGHFDGQAGEKPVSIINNTVYTKVDGVDVEIFENKTTLPVNVAFELWAKRNIKPVPEIKILNNLGVDIAANTVIWDYKRESPAYISTIGVCTMTDIAKKPTENACSSLTVFFDGRVDGQVDSFRNARNGVLITEGSVKGLNPSKGPPQASLNGVTLIGESVKTQFNYFKKVDGVVQQLPETYFTQSRSLDDFKPRSQMEVDFLQLAMDEFIERYKLEGYAFEHIVYGDFSHGQLGGLHLMIGLAKRSLESLLKLEDFIPIDSTVKNYFVTDAQTGSSKCVCSVIDLLLDDFVEIIKSQDLSVVSKVVTVTIDYAEISFMLWCKDGHVETFYPKLQANQTWQPGVAMPNLYKMQRMLLDKCDLHNYGENAVIPKGIMMNVAKYTQLCQYLNTLTIAVPYNMRVIHFGAGSDKGVAPGSAVLKQWLPVGTLLVDSDINDFVSDADSTLIGDCSTVYTANKWDLIISDMYDPKTKHILKENDSKEGFFTYLCGFIKQKLALGGSVAIKITEHSWNADLYKLMGYFSWWTAFVTNVNASSSEAFLIGVNYLGKQKESIDGYTMHANYIFWRNTNPIQLSSYSLFDMSKFPLKLRGTAVMSLKDNQINDMICSLLEKGRLIIRENNKVVFSSDVLVNN

Summary

Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Uniprot
Pfam
PF12379   DUF3655
PF16251   NAR
PF06471   NSP11
PF01661   Macro
PF11501   Nsp1
PF05409   Peptidase_C30
PF08710   nsp9
PF12124   Nsp3_PL2pro
PF16348   Corona_NSP4_C
PF08717   nsp8
PF08716   nsp7
PF11633   SUD-M
PF06460   NSP16
PF08715   Viral_protease
PF09401   NSP10
PF06478   Corona_RPol_N
Interpro
IPR008740   Peptidase_C30
IPR037204   NSP7_sf
IPR009469   RNA_pol_N_coronovir
IPR032505   Corona_NSP4_C
IPR036333   NSP10_sf
IPR032592   NAR_dom
IPR027352   CV_ZBD
IPR014828   NSP7
IPR013016   Peptidase_C30/C16
IPR037230   NSP8_sf
IPR038123   NSP4_C_sf
IPR027417   P-loop_NTPase
IPR037227   EndoU-like
IPR021590   NSP1
IPR014822   NSP9
IPR009003   Peptidase_S1_PA
IPR038083   R1a/1ab
IPR038030   NSP1_sf
IPR022733   Nsp3_PL2pro
IPR029063   SAM-dependent_MTases
IPR018995   RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR042570   NAR_sf
IPR038400   Nsp3_coronavir_sf
IPR009466   NSP11
IPR024375   Nsp3_coronavir
IPR014827   Viral_protease
IPR042515   Nsp15_N
IPR002589   Macro_dom
IPR009461   Coronavirus_NSP16
IPR038166   Nsp3_PL2pro_sf
IPR014829   NSP8
IPR024358   SARS-CoV_Nsp3_N
IPR036499   NSP9_sf
IPR027351   (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094   RNA-dir_pol_PSvirus
SUPFAM
SSF143076   SSF143076
SSF140367   SSF140367
SSF101816   SSF101816
SSF50494   SSF50494
SSF142877   SSF142877
SSF160099   SSF160099
SSF53335   SSF53335
SSF159936   SSF159936
SSF144246   SSF144246
SSF52540   SSF52540
ProteinModelPortal
PDB
6NUS     E-value=0.0     Score=1925     Identity=97.64%     Cov(Q)=13.21%     Cov(P)=97.70%

Ontologies

KEGG

Subcellular Location

From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host endoplasmic reticulum  
Host membrane  

Topology

Length:
7064
Number of predicted TMHs:
14
Exp number of AAs in TMHs:
363.314159999997
Exp number, first 60 AAs:
0
Total prob of N-in:
0.00001
outside
1  -  2198
TMhelix
2199  -  2221
inside
2222  -  2293
TMhelix
2294  -  2316
outside
2317  -  2330
TMhelix
2331  -  2353
inside
2354  -  2736
TMhelix
2737  -  2759
outside
2760  -  3010
TMhelix
3011  -  3033
inside
3034  -  3045
TMhelix
3046  -  3068
outside
3069  -  3095
TMhelix
3096  -  3118
inside
3119  -  3548
TMhelix
3549  -  3568
outside
3569  -  3577
TMhelix
3578  -  3597
inside
3598  -  3603
TMhelix
3604  -  3626
outside
3627  -  3649
TMhelix
3650  -  3669
inside
3670  -  3675
TMhelix
3676  -  3695
outside
3696  -  3714
TMhelix
3715  -  3737
inside
3738  -  3749
TMhelix
3750  -  3772
outside
3773  -  7064
 
 
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