Strain

GERMANY_PIG_2015_LT898412 (Region: Germany;  Strain: Porcine epidemic diarrhea virus isolate PEDV_GER_L01019-K01_15-09_2015 genome assembly, complete genome: monopartite.;  Date: 2015)

Gene

envelope protein

Description

Annotated in NCBI,  envelope protein

Location

LT898412(+):25440-25670

GenBank Accession

SNQ27957.1

Full name

Envelope small membrane protein      

CDS

ATGCTACAATTAGTGAATGATAATGGTCTAGTAGTTAATGTTATACTTTGGCTTTTTGTACTCTTTTTCCTGCTTATTATAAGCATTACTTTCGTCCAATTGGTTAATCTGTGCTTCACTTGTCACCGGTTGTGTAATAGCGCAGTTTACACACCTATAGGGCGTTTGTATAGAGTTTATAAGTCTTACATGCAAATAGACCCCCTCCCTAGTACTGTTATTGACGTATAA

Protein

MLQLVNDNGLVVNVILWLFVLFFLLIISITFVQLVNLCFTCHRLCNSAVYTPIGRLYRVYKSYMQIDPLPSTVIDV

Function

Plays a central role in virus morphogenesis and assembly. Acts as a viroporin and self-assembles in host membranes forming pentameric protein-lipid pores that allow ion transport. Also plays a role in the induction of apoptosis.

Subunit

Homopentamer. Interacts with membrane protein M in the budding compartment of the host cell, which is located between endoplasmic reticulum and the Golgi complex. Interacts with Nucleoprotein.

Miscellaneous

Bat coronavirus 512/2005 is highly similar to porcine epidemic diarrhea virus (PEDV).

Similarity

Belongs to the alphacoronaviruses E protein family.

Keywords

Apoptosis   Host Golgi apparatus   Host membrane   Membrane   Transmembrane   Transmembrane helix   Reference proteome  

Feature

chain  Envelope small membrane protein

Uniprot

A0A1X9Q889   A0A2U9EW62   X5C414   A0A482F7H5   A0A0U1YFC9   A0A286R3Q0   + More
A0A0U1YFA6   A0A0A8LFT5   K7WR34   A0A0U1VEI4   A0A2H4WQN5   H6WQB8   A0A0U2C267   A0A0S3MN88   A0A4P8DJN2   A0A1Y0DD47   A0A1P8A7E3   M4PK96   A0A3S8TLN4   A0A0U2C304   A0A0N7EJQ5   A0A0U2C499   A0A075ECK6   U6BPE0   A0A0B4UG64   A0A346RP87   A0A0U1YIT5   A0A2U8QMX6   A0A3S9JJ99   A0A097CK69   M4PKF6   A0A2H4WQM5   A0A5J6APD6   A0A1D8DGN6   Q000W7   A7LKV2   Q84706   G5D080   A0A2R4H2G8   A0A067YRR3   K7ZBV7   A0A5B8YSJ0   A0A075M712   A0A0U2C3N7   A0A068BBH7   A0A0K0YGJ7   A0A291FE87   A0A0H4KCZ9   A0A0U2C347   A0A0U1YFS9   A0A088NCB0   A0A0U1YHW2   A0A0C5KNT1   A0A0B4UFF7   A0A0U2C7N6   A0A0P0TDN2   L0HAG1   J9SUZ5   A0A2S0RQ73   A0A1X9RVE3   A0A2H4T8T9   A0A0U1YG58   A0A3Q8TMG7   A0A0K0WTM2   A0A482F7K4   A0A2N8Z208   A5Z1X5   A0A3S8Z5K9   A0A0U1YFN0   L7YFQ4   I1TLD2   A0A0U2C423   A0A2R4H2C1   A2IB77   F2VPY3   A0A0M4AHW2   A0A0D5BWC6   A0A1D8MIP6   A0A286L9P1   A0A0F7R811   A0A3G3NGZ5   A0A3G3NHG3   A0A3G3NGF7   A0A3G3NHH7   A0A5J6DDR7   A0A3G3NGT0   A0A4Y6GM80   A0A4Y6ACU9   S5YGS4   A0A220YLL5   A0A219TV00   A0A4Y6GLB2   A0A4Y6GM71   A0A4Y6GLC2   A0A3G3NH15   A0A3G3NGS8   Q0Q464   A0A3G3NHM3   A0A166ZM17   F1DAY5  

Pubmed

29789941    24818713    23166239    22354946    22532530    22879620    + More
22923806    22966198    23087112    23166262    23151819    23462888    23929470    23969052    24356830    23963154    24129257    24795932    24750580    24960370    25279722    25272273    24744324    24926047    24874682    24954514    24197882    25098383    25217400    26044419    25999551    26477934    25694517    25790462    26196056    26512689    26611909    26893409    27103712    27056240    26841768    27880757    27103490    27059242    28605965    28589511    29879479    29770590    29368629    29468451    31350613    31364317    30593385    28534849    26743534    30380612    8291230    9782358    11724265    21980030    23166259    25125639    26112783    26063495    23469356    28284624    23599287    28854955    26679593    31503522    28840816    16840328    26847648    19239771    22561208   

EMBL

KX532182    ARQ18620.1    MG837058    AWQ28490.1    KJ196348    AHW40032.1    + More
MK032690    QBO24659.1    KJ857353    AJD09476.1    MF577027    ASV51731.1    KJ857371    AJD09494.1    LM645057    CDW77207.1    JX647847    AFW99000.1    KJ857357    AJD09480.1    MG373536    AUD08943.1    JQ282909    JN825712    JQ023161    JX088695    JX112709    JX188454    JX512908    JX489155    JX524137    KC148524    KC210145    KC210147    KC189829    KC189830    KC189833    KC140102    KF272920    KF384500    KF267450    KF468752    KF468753    KF468754    KF650370    KF650371    KF650372    KF650373    KF650374    KF804028    KF452322    KF452323    KF760557    KF761675    KJ399978    KJ020932    KJ408801    KJ588062    KJ588063    KJ588064    KJ623926    KJ778615    KJ778616    KJ584361    KJ646626    KJ646627    KJ646628    KJ646631    KJ646634    KJ646635    KJ646637    KJ646638    KJ646639    KJ646640    KJ646641    KJ646642    KJ646643    KJ642644    KJ645635    KJ645636    KJ645637    KJ645638    KJ645639    KJ645640    KJ645641    KJ645642    KJ645643    KJ645644    KJ645645    KJ645646    KJ645647    KJ645648    KJ645649    KJ645650    KJ645652    KJ645653    KJ645654    KJ645655    KJ645656    KJ645657    KJ645658    KJ645659    KJ645660    KJ645661    KJ645662    KJ645663    KJ645664    KJ645665    KJ645666    KJ645667    KJ645668    KJ645669    KJ645670    KJ645671    KJ645672    KJ645673    KJ645674    KJ645675    KJ645676    KJ645677    KJ645678    KJ645679    KJ645680    KJ645681    KJ645682    KJ645684    KJ645685    KJ645686    KJ645687    KJ645688    KJ645689    KJ645690    KJ645691    KJ645692    KJ645693    KJ645694    KJ645695    KJ645696    KJ645697    KJ645698    KJ645699    KJ645700    KJ645701    KJ645702    KJ645703    KJ645704    KJ645705    KJ645706    KJ645707    KJ645708    KJ662670    KF840537    KF840538    KF840539    KF840540    KF840543    KF840544    KF840545    KF840546    KF840547    KF840548    KF840549    KF840550    KF840551    KF840552    KF840553    KF840554    KF840555    KF840556    KF840557    KF840558    KJ777677    KJ777678    KM077139    KM052365    KJ184549    KM392225    KM392226    KM392228    KM392229    KM392230    KM392231    KM392232    KM189367    KM403155    KJ526096    KJ526097    KJ526098    KJ526099    KJ526100    KJ526104    KJ857354    KJ857358    KJ857360    KJ857361    KJ857362    KJ857365    KJ857366    KJ857369    KJ857375    KJ857376    KJ857377    KM609203    KM609204    KM609205    KM609206    KM609207    KM609209    KM609210    KM609211    KM609212    KM609213    KP202365    KR003452    KR011756    KR265759    KR265760    KR265761    KR265762    KR265763    KR265764    KR265765    KR265766    KR265767    KR265768    KR265770    KR265771    KR265772    KR265773    KR265774    KR265775    KR265776    KR265777    KR265778    KR265779    KR265780    KR265781    KR265783    KR265784    KR265785    KR265786    KR265787    KR265788    KR265790    KR265791    KR265793    KR265794    KR265795    KR265796    KR265797    KR265799    KR265801    KR265802    KR265803    KR265804    KR265805    KR265806    KR265807    KR265808    KR265809    KR265810    KR265811    KR265813    KR265814    KR265815    KR265816    KR265819    KR265821    KR265822    KR265823    KR265825    KR265826    KR265827    KR265828    KR265829    KR265830    KR265831    KR265832    KR265833    KR265834    KR265843    KR265844    KR265846    KP688354    KM975735    KM975736    KM975738    KM975739    KM975740    KM975741    KR078299    KR078300    KR873431    KR873432    KR873433    KR873434    KR873435    KR809885    KP403954    KR818832    KR818833    KT021227    KT021228    KT021229    KP641662    KP641663    KT199103    KT941120    KT323980    KU297956    KU569509    KT591944    KT860508    KU380331    KR153325    KR153326    KU646831    KU252649    KX064280    KU982966    KU982967    KU982968    KU982969    KU982970    KU982971    KU982972    KU982973    KU982975    KU982976    KU982977    KU982978    KU982979    KU982980    KU982981    KU558702    KY019623    KY019624    KX883635    KX981440    KY070587    KX550281    KX812523    KX812524    KX791060    KY111278    KX016034    KY499261    KY499262    KY793536    KX532180    KX532181    KX532183    KY928065    KY963963    KX289955    MG373535    MG373537    MG373539    MF375374    KY649107    MF373643    MG334554    MG334555    MG837011    MG837012    MH004412    MH004415    MH004419    MH004420    MH006957    MH006958    MH006959    MH006960    MH006961    MH006962    MH006963    MH006964    MH006965    MH013462    MH013463    MH013464    MH013465    MH013466    MH052681    MH052682    MH052683    MH052684    MH052685    MH052687    MH052688    MH107321    MH107322    MF807951    MF807952    MH708895    MG778699    MG546687    MG546688    MG546689    MG546690    MH301099    MG983755    MH061336    MH061338    MH061339    MH061340    MH061342    MH061343    MH117940    MK250953    LC022792    LC063810    LC063811    LC063812    LC063813    LC063814    LC063815    LC063816    LC063817    LC063818    LC063820    LC063821    LC063822    LC063823    LC063824    LC063825    LC063826    LC063827    LC063828    LC063829    LC063830    LC063831    LC063832    LC063833    LC063834    LC063835    LC063836    LC063837    LC063838    LC063839    LC063840    LC063841    LC063842    LC063843    LC063844    LC063845    LC063846    LC063847    LM645058    MK288006    MH593900    MH243319    MK032689    MK032692    MK606369    MK140811    MK140812    MK140813    MK140814    MH891584    MH891585    MH891586    MH891587    MH891588    MH891589    MH891590    MH726362    MH726363    MH726364    MH726366    MH726369    MH726370    MH726371    MH726373    MH726375    MH726376    MH726383    MH726384    MH726385    MH726386    MH726387    MH726388    MH726391    MH726393    MH726394    MH726395    MH726398    MH726399    MH726400    MH726401    MH726402    MH726403    MH726404    MH726405    MH726406    MH726407    MK138353    MK559454    MK559455    MK482396    MK482397    MK409657    MK409658    MK558089    MK690502    MK628690    MK644601    MK644602    MK644603    MK644604    LT898408    LT898415    LT898413    LT898421    LT898414    LT898411    LT898416    LT898418    LT898423    LT898409    LT898420    LT898412    LT898410    LT898432    LT898425    LT898431    LT898427    LT898430    LT898433    LT898426    LT898436    LT898438    LT898440    LT898439    LT898435    LT898441    LT898443    LT898446    LT898445    LT898444    LT898417    LT898447    LT900498    LT900499    LT900500    LT900502    LT900501    AFB77236.1    AFC98505.1    AFE85964.1    AFP36391.1    AFP81691.1    AFQ37600.1    AFS63730.1    AFV09316.1    AFV46346.1    AFZ85186.1    AGG55739.1    AGG55752.1    AGH06454.1    AGH06455.1    AGH06458.1    AGK89916.1    AGO58926.1    AGR51644.1    AGS12451.1    AGY31024.1    AGY31030.1    AGY31036.1    AHA38120.1    AHA38127.1    AHA38134.1    AHA38141.1    AHA38148.1    AHA38162.1    AHC03504.1    AHC03510.1    AHF20047.1    AHG97487.1    AHL38186.1    AHM88219.1    AHN60054.1    AHX58672.1    AHX58678.1    AHX58684.1    AHY04231.1    AHZ94883.1    AHZ94889.1    AIA61016.1    AIC82433.1    AIC82434.1    AIC82435.1    AIC82438.1    AIC82441.1    AIC82442.1    AIC82444.1    AIC82445.1    AIC82446.1    AIC82447.1    AIC82448.1    AIC82449.1    AIC82450.1    AIC83853.1    AID56669.1    AID56675.1    AID56681.1    AID56687.1    AID56693.1    AID56699.1    AID56705.1    AID56711.1    AID56717.1    AID56723.1    AID56729.1    AID56735.1    AID56741.1    AID56747.1    AID56753.1    AID56759.1    AID56771.1    AID56777.1    AID56783.1    AID56789.1    AID56795.1    AID56801.1    AID56807.1    AID56813.1    AID56819.1    AID56825.1    AID56831.1    AID56837.1    AID56843.1    AID56849.1    AID56855.1    AID56861.1    AID56867.1    AID56873.1    AID56879.1    AID56885.1    AID56891.1    AID56897.1    AID56903.1    AID56909.1    AID56915.1    AID56921.1    AID56927.1    AID56933.1    AID56939.1    AID56945.1    AID56951.1    AID56963.1    AID56969.1    AID56975.1    AID56981.1    AID56987.1    AID56993.1    AID56999.1    AID57005.1    AID57011.1    AID57017.1    AID57023.1    AID57029.1    AID57035.1    AID57041.1    AID57047.1    AID57053.1    AID57059.1    AID57065.1    AID57071.1    AID57077.1    AID57083.1    AID57089.1    AID57095.1    AID57101.1    AID57107.1    AID66723.1    AIE15937.1    AIE15942.1    AIE15947.1    AIE15952.1    AIE15967.1    AIE15972.1    AIE15977.1    AIE15982.1    AIE15988.1    AIE15992.1    AIE15997.1    AIE16002.1    AIE16007.1    AIE16012.1    AIE16017.1    AIE16023.1    AIE16027.1    AIE16032.1    AIE16037.1    AIE16042.1    AIJ01337.1    AIK28710.1    AIK69677.1    AIM47750.1    AIN52096.1    AIN52102.1    AIN52114.1    AIN52120.1    AIN52126.1    AIN52132.1    AIN52138.1    AIP84469.1    AIR95867.1    AJD07368.1    AJD07371.1    AJD07372.1    AJD07373.1    AJD07374.1    AJD07378.1    AJD09477.1    AJD09481.1    AJD09483.1    AJD09484.1    AJD09485.1    AJD09488.1    AJD09489.1    AJD09492.1    AJD09498.1    AJD09499.1    AJD09500.1    AJP67398.1    AJP67404.1    AJP67410.1    AJP67416.1    AJP67422.1    AJP67434.1    AJP67440.1    AJP67446.1    AJP67452.1    AJP67458.1    AKA88561.1    AKC34874.1    AKE47380.1    AKJ21703.1    AKJ21709.1    AKJ21715.1    AKJ21721.1    AKJ21727.1    AKJ21733.1    AKJ21739.1    AKJ21745.1    AKJ21751.1    AKJ21757.1    AKJ21769.1    AKJ21775.1    AKJ21781.1    AKJ21787.1    AKJ21793.1    AKJ21799.1    AKJ21805.1    AKJ21811.1    AKJ21817.1    AKJ21823.1    AKJ21829.1    AKJ21835.1    AKJ21847.1    AKJ21853.1    AKJ21859.1    AKJ21865.1    AKJ21871.1    AKJ21877.1    AKJ21889.1    AKJ21895.1    AKJ21907.1    AKJ21913.1    AKJ21919.1    AKJ21925.1    AKJ21931.1    AKJ21943.1    AKJ21955.1    AKJ21961.1    AKJ21967.1    AKJ21973.1    AKJ21979.1    AKJ21985.1    AKJ21991.1    AKJ21997.1    AKJ22003.1    AKJ22009.1    AKJ22015.1    AKJ22027.1    AKJ22033.1    AKJ22039.1    AKJ22045.1    AKJ22063.1    AKJ22075.1    AKJ22081.1    AKJ22087.1    AKJ22099.1    AKJ22105.1    AKJ22111.1    AKJ22117.1    AKJ22123.1    AKJ22129.1    AKJ22135.1    AKJ22141.1    AKJ22147.1    AKJ22153.1    AKJ22195.1    AKJ22201.1    AKJ22213.1    AKO63239.1    AKP80591.1    AKP80598.1    AKP80612.1    AKP80619.1    AKP80626.1    AKP80633.1    AKR05180.1    AKR05186.1    AKS50224.1    AKS50229.1    AKS50234.1    AKS50240.1    AKS50246.1    AKV62621.1    ALJ52506.1    ALL27304.1    ALL27310.1    ALM09360.1    ALM09366.1    ALM09372.1    ALM31940.1    ALM31946.1    ALP06212.1    ALR74759.1    ALS35476.1    ALU34114.1    AMC39586.1    AMD11120.1    AMD11126.1    AMR59403.1    AMS37104.1    AMS37107.1    AMZ01560.1    ANC68209.1    AND76938.1    ANI85730.1    ANI85736.1    ANI85742.1    ANI85748.1    ANI85754.1    ANI85760.1    ANI85766.1    ANI85772.1    ANI85784.1    ANI85790.1    ANI85796.1    ANI85802.1    ANI85808.1    ANI85814.1    ANI85820.1    ANY27039.1    APG31000.1    APG31007.1    APG77341.1    APH81308.1    APR64497.1    AQT33896.1    AQW35009.1    AQW35015.1    AQX36344.1    AQY61721.1    ARJ54148.1    ARM65492.1    ARM65498.1    ARQ03271.1    ARQ18610.1    ARQ18615.1    ARQ18625.1    ART84252.1    ASA69726.1    ASB30083.1    AUD08942.1    AUD08944.1    AUD08946.1    AUJ79486.1    AUV64201.1    AUV64573.1    AVI57398.1    AVI57405.1    AVK78143.1    AVK78149.1    AVU05342.1    AVU05363.1    AVU05391.1    AVU05398.1    AVU05412.1    AVU05419.1    AVU05426.1    AVU05433.1    AVU05440.1    AVU05447.1    AVU05454.1    AVU05461.1    AVU05468.1    AVU05475.1    AVU05482.1    AVU05489.1    AVU05496.1    AVU05503.1    AWM11458.1    AWM11464.1    AWM11470.1    AWM11476.1    AWM11482.1    AWM11488.1    AWM11494.1    AWV57050.1    AWV57056.1    AXK47354.1    AXK47360.1    AYL64494.1    AYN79038.1    AYP73632.1    AYP73636.1    AYP73641.1    AYP73647.1    AYU70937.1    AYW03311.1    AZL47194.1    AZL47206.1    AZL47212.1    AZL47218.1    AZL47230.1    AZL47236.1    AZP03045.1    AZS27727.1    BAR92900.1    BAT33115.1    BAT33121.1    BAT33127.1    BAT33133.1    BAT33139.1    BAT33145.1    BAT33151.1    BAT33157.1    BAT33163.1    BAT33175.1    BAT33181.1    BAT33187.1    BAT33193.1    BAT33199.1    BAT33205.1    BAT33211.1    BAT33217.1    BAT33223.1    BAT33229.1    BAT33235.1    BAT33241.1    BAT33247.1    BAT33253.1    BAT33259.1    BAT33265.1    BAT33271.1    BAT33277.1    BAT33283.1    BAT33289.1    BAT33295.1    BAT33301.1    BAT33307.1    BAT33313.1    BAT33319.1    BAT33325.1    BAT33331.1    BAT33337.1    CDW77215.1    QAR17951.1    QAY31033.1    QBA57560.1    QBO24653.1    QBO24671.1    QCB65308.1    QCC26583.1    QCC26590.1    QCC26597.1    QCC26604.1    QCO95394.1    QCO95400.1    QCO95406.1    QCO95412.1    QCO95418.1    QCO95424.1    QCO95429.1    QCQ19800.1    QCQ19806.1    QCQ19812.1    QCQ19824.1    QCQ19842.1    QCQ19848.1    QCQ19854.1    QCQ19866.1    QCQ19878.1    QCQ19884.1    QCQ19926.1    QCQ19932.1    QCQ19938.1    QCQ19944.1    QCQ19950.1    QCQ19956.1    QCQ19974.1    QCQ19986.1    QCQ19992.1    QCQ19998.1    QCQ20016.1    QCQ20022.1    QCQ20028.1    QCQ20034.1    QCQ20040.1    QCQ20046.1    QCQ20052.1    QCQ20058.1    QCQ20064.1    QCQ20070.1    QCT24239.1    QDY92471.1    QDY92477.1    QDZ36664.1    QDZ36670.1    QEE80061.1    QEE80067.1    QEQ55822.1    QER78629.1    QFE32180.1    QFG01690.1    QFG01696.1    QFG01702.1    QFG01708.1    SNQ27889.1    SNQ27895.1    SNQ27901.1    SNQ27909.1    SNQ27914.1    SNQ27919.1    SNQ27925.1    SNQ27934.1    SNQ27935.1    SNQ27943.1    SNQ27951.1    SNQ27957.1    SNQ27963.1    SNQ27969.1    SNQ27976.1    SNQ27981.1    SNQ27987.1    SNQ27993.1    SNQ27999.1    SNQ28012.1    SNQ28018.1    SNQ28024.1    SNQ28034.1    SNQ28040.1    SNQ28047.1    SNQ28053.1    SNQ28059.1    SNQ28066.1    SNQ28072.1    SNQ28078.1    SNQ28084.1    SNQ28090.1    SNT95655.1    SNT95661.1    SNT95667.1    SNT95673.1    SNT95679.1    KR265769    KP641661    AKJ21763.1    ALM31934.1    LC063819    BAT33169.1    MH910099    QCL09022.1    KY929405    KY929406    ART85701.1    ART85708.1    KU975389    AMR60835.1    KC189831    KC189832    KC189834    KC189835    KJ857359    KJ857363    KJ857367    KJ857368    KJ857372    KJ857373    KJ857374    KR265782    KR265789    KR265820    AGH06456.1    AGH06457.1    AGH06459.1    AGH06460.1    AJD09482.1    AJD09486.1    AJD09490.1    AJD09491.1    AJD09495.1    AJD09496.1    AJD09497.1    AKJ21841.1    AKJ21883.1    AKJ22069.1    MH061341    MK644605    AZL47224.1    QFG01714.1    KR265798    KR265818    KU982974    AKJ21937.1    AKJ22057.1    ANI85778.1    KR095279    ALF39591.1    KR265845    AKJ22207.1    KJ645683    KM975737    KX066126    MF462814    MF782686    MH726372    MH726381    AID56957.1    AKP80605.1    APD70936.1    ASY04645.1    ATY72308.1    QCQ19860.1    QCQ19914.1    KF650375    KF840541    KF840542    MH726382    MH726396    MH726397    AHA38155.1    AIE15957.1    AIE15962.1    QCQ19920.1    QCQ20004.1    QCQ20010.1    KJ526102    AJD07376.1    MH708243    AXS67927.1    KJ857370    AJD09493.1    MH052689    AWM11500.1    MH581489    AZP53861.1    KM242131    AIS82614.1    KC189828    AGH06453.1    MG373538    AUD08945.1    MH726367    QCQ19830.1    KU847996    AOS89613.1    DQ985740    ABJ51940.1    EU031893    KJ646629    KJ646630    KJ646633    KJ646636    KJ646644    KJ526101    MF346935    MF737355    LT897799    LT905450    LT906582    LT906581    LT906620    ABS72125.1    AIC82436.1    AIC82437.1    AIC82440.1    AIC82443.1    AIC82451.1    AJD07375.1    ASO67379.1    ASW30996.1    SNC44847.1    SNU46338.1    SNW64186.1    Z24733    AF353511    JN547228    AEQ55006.1    MH004416    MH004417    MH004418    MH004421    MK606368    AVU05370.1    AVU05377.1    AVU05384.1    AVU05405.1    QCB65302.1    KJ158152    AHG97560.1    JX560761    KC189944    KP403802    KP728470    KT323979    KY420075    MG781192    MH726408    MK796238    AFX98015.1    AGN29322.1    AKJ85725.1    AKP99783.1    ALS35470.1    ASO96552.1    AUZ98438.1    QCQ20076.1    QCW07223.1    MH726377    MH726378    MH726379    MK841494    MK841495    QCQ19890.1    QCQ19896.1    QCQ19902.1    QED40657.1    QED40663.1    KJ645651    KJ960178    KJ960179    KJ960180    KR610993    KR610994    KR061458    MH243316    MH243318    MK392335    MH726374    AID56765.1    AIF73543.1    AKH45340.1    ALR84910.1    QBA57547.1    QBA57554.1    QBM00063.1    QCQ19872.1    KR265800    AKJ21949.1    KJ646632    AIC82439.1    KR873436    KR873437    KT021230    KU558701    KY825240    KY825241    KY825242    KY825243    MH056658    MN037494    AKS50251.1    AKS50256.1    ALM09378.1    ANY27033.1    ASA40093.1    ASA40099.1    ASA40105.1    ASA40111.1    AZN28595.1    QED58403.1    KY007140    MH726368    MK409659    ATG31102.1    QCQ19836.1    QEE80073.1    KM089829    KP765609    KY007139    MH748550    MH726390    MH726392    AKE53207.1    AKO90057.1    ATG31096.1    AZS18880.1    QCQ19968.1    QCQ19980.1    KR265792    KR265812    AKJ21901.1    AKJ22021.1    KJ857356    AJD09479.1    KM392227    AIN52108.1    KJ857364    AJD09487.1    KM609208    AJP67428.1    KJ526103    AJD07377.1    KR265817    KR265840    AKJ22051.1    AKJ22177.1    KT021231    KT021232    KT021233    ALM09384.1    ALM09390.1    ALM09396.1    KC196276    AGA94622.1    JX261936    KM392224    KR265841    KR265842    KU893861    KU893869    KU893870    KU893871    KU893872    KU893873    KX580958    MH726365    MH726380    MH726389    MK559456    AFR54328.1    AIN52090.1    AKJ22183.1    AKJ22189.1    APX42109.1    APX42115.1    APX42121.1    APX42127.1    APX42133.1    APX42139.1    APX42293.1    QCQ19818.1    QCQ19908.1    QCQ19962.1    QDY92483.1    MF281416    AWA45276.1    KY679908    ARQ84962.1    MF782687    ATY72314.1    KJ857352    AJD09475.1    MH061337    AZL47200.1    KP768390    AKS26491.1    MK032691    QBO24665.1    LT905451    SNU46344.1    EF612793    ABR08656.1    MH056657    AZN28589.1    KJ857355    AJD09478.1    KC109141    KC210146    AGD98687.1    AGG55747.1    JQ023162    KX534205    KX534206    AFE85971.1    AOM53010.1    AOM53017.1    KR265824    AKJ22093.1    MH004413    MH004414    AVU05349.1    AVU05356.1    EF185992    ABM64778.1    GU937797    KM887144    KR610991    KR610992    KU664503    KY486713    KX839246    KX839247    KX839248    KX839250    ADZ76335.1    AJH76958.1    AKH45328.1    AOC38023.1    AST13134.1    AST13217.1    AST13223.1    AST13229.1    AST13241.1    KP890336    ALB08473.1    KP162057    AJW67220.1    KU836638    AOV85636.1    KY486714    KX839249    KX839251    AST13138.1    AST13235.1    AST13247.1    LC053455    BAR73379.1    MH687942    MH687966    AYR18450.1    AYR18587.1    MH687944    MH687957    AYR18463.1    AYR18533.1    MH687934    AYR18402.1    MH687935    MH687936    MH687939    MH687940    MH687949    MH687950    MH687951    MH687952    MH687959    MH687962    AYR18408.1    AYR18414.1    AYR18432.1    AYR18438.1    AYR18489.1    AYR18495.1    AYR18501.1    AYR18507.1    AYR18545.1    AYR18563.1    MN065811    QER90706.1    MH687958    AYR18539.1    MK211371    QDF43801.1    MG923574    QDE55567.1    KF430219    AGT21335.1    KY799179    ASL24653.1    KT346372    ANV78632.1    MK211370    QDF43796.1    MK211369    QDF43791.1    MK211372    QDF43806.1    MH687941    MH687943    MH687945    MH687946    MH687948    MH687954    MH687956    MH687963    MH687964    AYR18444.1    AYR18457.1    AYR18469.1    AYR18475.1    AYR18483.1    AYR18515.1    AYR18527.1    AYR18569.1    AYR18575.1    MH687937    MH687938    MH687955    MH687960    MH687961    MH687965    AYR18420.1    AYR18426.1    AYR18521.1    AYR18551.1    AYR18557.1    AYR18581.1    DQ648858    MH687967    AYR18593.1    KU182966    ANA96050.1    HQ728481    ADX59460.1   

Proteomes

UP000129155    UP000138211    UP000128510    UP000096014    UP000096231    UP000096250    + More
UP000096695    UP000096781    UP000096896    UP000096940    UP000097091    UP000097201    UP000097739    UP000097949    UP000098101    UP000098326    UP000099262    UP000099939    UP000100204    UP000100263    UP000100611    UP000101279    UP000101663    UP000101715    UP000101883    UP000102422    UP000102715    UP000103144    UP000103187    UP000103230    UP000103525    UP000104212    UP000104329    UP000104528    UP000104629    UP000104743    UP000105228    UP000105572    UP000105717    UP000106279    UP000106554    UP000106837    UP000107011    UP000107079    UP000107726    UP000107825    UP000107890    UP000108853    UP000108901    UP000108998    UP000109171    UP000109281    UP000109462    UP000109784    UP000110005    UP000110085    UP000110170    UP000110553    UP000110779    UP000111596    UP000111801    UP000111853    UP000111997    UP000112445    UP000112678    UP000112725    UP000112744    UP000113629    UP000113720    UP000114176    UP000114423    UP000114426    UP000114579    UP000114584    UP000114886    UP000115696    UP000115820    UP000115913    UP000116623    UP000116900    UP000117024    UP000117314    UP000117357    UP000117463    UP000117465    UP000117616    UP000118055    UP000118902    UP000119410    UP000119498    UP000119763    UP000119870    UP000120045    UP000120106    UP000120197    UP000120281    UP000120524    UP000120529    UP000120737    UP000121150    UP000121532    UP000121581    UP000122106    UP000122204    UP000122310    UP000122353    UP000122774    UP000122785    UP000122852    UP000122996    UP000123046    UP000123112    UP000123161    UP000123657    UP000124209    UP000124555    UP000124684    UP000124742    UP000124784    UP000125425    UP000125691    UP000125786    UP000126216    UP000126602    UP000127334    UP000127765    UP000127975    UP000128202    UP000128363    UP000128879    UP000128894    UP000129574    UP000130338    UP000130438    UP000130673    UP000130717    UP000131126    UP000131296    UP000131950    UP000132054    UP000132225    UP000132713    UP000132791    UP000132921    UP000133030    UP000133157    UP000133192    UP000133398    UP000133657    UP000133882    UP000133992    UP000134050    UP000134226    UP000134395    UP000134741    UP000135153    UP000135367    UP000135609    UP000135702    UP000135713    UP000135804    UP000135840    UP000135878    UP000135912    UP000136286    UP000136506    UP000137076    UP000137135    UP000137505    UP000137642    UP000138117    UP000138881    UP000139036    UP000139218    UP000140002    UP000140886    UP000141497    UP000141524    UP000141838    UP000141930    UP000141975    UP000142054    UP000142467    UP000142735    UP000142872    UP000142994    UP000143145    UP000143266    UP000145028    UP000145713    UP000145872    UP000145986    UP000146202    UP000146214    UP000146856    UP000147164    UP000147626    UP000147669    UP000148016    UP000148048    UP000148065    UP000148263    UP000148798    UP000148839    UP000148893    UP000149058    UP000149986    UP000150256    UP000150601    UP000151163    UP000151206    UP000151262    UP000152961    UP000153081    UP000153092    UP000153127    UP000153418    UP000153562    UP000153741    UP000153753    UP000154143    UP000154382    UP000154578    UP000154704    UP000154723    UP000154811    UP000155002    UP000155212    UP000155241    UP000155578    UP000155842    UP000156035    UP000156412    UP000157500    UP000158257    UP000158262    UP000158401    UP000158498    UP000158624    UP000159218    UP000160024    UP000160123    UP000160238    UP000161341    UP000161506    UP000162314    UP000163006    UP000163267    UP000163624    UP000163819    UP000164459    UP000164654    UP000165932    UP000166734    UP000167803    UP000168320    UP000168469    UP000169024    UP000169265    UP000169341    UP000169811    UP000169922    UP000169926    UP000170794    UP000170945    UP000171222    UP000171736    UP000171879    UP000172207    UP000172504    UP000173775    UP000174684    UP000175330    UP000175484    UP000180355    UP000267271    UP000267306    UP000267609    UP000268721    UP000269355    UP000269867    UP000270191    UP000270497    UP000270545    UP000271078    UP000271135    UP000271448    UP000272790    UP000273819    UP000274124    UP000274353    UP000274834    UP000274992    UP000275549    UP000275656    UP000275831    UP000276052    UP000276298    UP000276964    UP000277020    UP000277354    UP000277927    UP000278039    UP000278495    UP000278554    UP000278990    UP000279022    UP000280517    UP000280596    UP000281047    UP000281631    UP000281935    UP000103873    UP000110780    UP000134981    UP000108525    UP000118621    UP000135502    UP000158343    UP000166175    UP000153801    UP000168169    UP000174062    UP000174771    UP000168944    UP000124268    UP000267509    UP000269222    UP000274194    UP000276154    UP000278337    UP000008159    UP000095955    UP000149796    UP000100223    UP000139136    UP000146251    UP000149315    UP000180353    UP000102013    UP000107040    UP000114638    UP000124407    UP000127953    UP000137179    UP000150912    UP000163543    UP000109960    UP000112802    UP000150836    UP000132509    UP000172961    UP000160819    UP000124473    UP000111048    UP000170995    UP000109730    UP000141943    UP000167996    UP000170972    UP000102377    UP000117333    UP000135037    UP000158853    UP000281783    UP000134644    UP000180354    UP000126260    UP000109831    UP000170862    UP000101744    UP000110433    UP000156820    UP000171486    UP000156201    UP000096075    UP000096210    UP000174423    UP000113079   

Pfam

PF02723   NS3_envE

Interpro

IPR003873   NS3/E

ProteinModelPortal

A0A1X9Q889   A0A2U9EW62   X5C414   A0A482F7H5   A0A0U1YFC9   A0A286R3Q0   + More
A0A0U1YFA6   A0A0A8LFT5   K7WR34   A0A0U1VEI4   A0A2H4WQN5   H6WQB8   A0A0U2C267   A0A0S3MN88   A0A4P8DJN2   A0A1Y0DD47   A0A1P8A7E3   M4PK96   A0A3S8TLN4   A0A0U2C304   A0A0N7EJQ5   A0A0U2C499   A0A075ECK6   U6BPE0   A0A0B4UG64   A0A346RP87   A0A0U1YIT5   A0A2U8QMX6   A0A3S9JJ99   A0A097CK69   M4PKF6   A0A2H4WQM5   A0A5J6APD6   A0A1D8DGN6   Q000W7   A7LKV2   Q84706   G5D080   A0A2R4H2G8   A0A067YRR3   K7ZBV7   A0A5B8YSJ0   A0A075M712   A0A0U2C3N7   A0A068BBH7   A0A0K0YGJ7   A0A291FE87   A0A0H4KCZ9   A0A0U2C347   A0A0U1YFS9   A0A088NCB0   A0A0U1YHW2   A0A0C5KNT1   A0A0B4UFF7   A0A0U2C7N6   A0A0P0TDN2   L0HAG1   J9SUZ5   A0A2S0RQ73   A0A1X9RVE3   A0A2H4T8T9   A0A0U1YG58   A0A3Q8TMG7   A0A0K0WTM2   A0A482F7K4   A0A2N8Z208   A5Z1X5   A0A3S8Z5K9   A0A0U1YFN0   L7YFQ4   I1TLD2   A0A0U2C423   A0A2R4H2C1   A2IB77   F2VPY3   A0A0M4AHW2   A0A0D5BWC6   A0A1D8MIP6   A0A286L9P1   A0A0F7R811   A0A3G3NGZ5   A0A3G3NHG3   A0A3G3NGF7   A0A3G3NHH7   A0A5J6DDR7   A0A3G3NGT0   A0A4Y6GM80   A0A4Y6ACU9   S5YGS4   A0A220YLL5   A0A219TV00   A0A4Y6GLB2   A0A4Y6GM71   A0A4Y6GLC2   A0A3G3NH15   A0A3G3NGS8   Q0Q464   A0A3G3NHM3   A0A166ZM17   F1DAY5  

KEGG

vg:935180     vg:16607891     vg:11266520    

GO

GO:0046760  P:viral budding from Golgi membrane
GO:0016021  C:integral component of membrane
GO:0019031  C:viral envelope
GO:0044178  C:host cell Golgi membrane
GO:0044662  P:disruption by virus of host cell membrane
GO:0044165  C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0033664  P:positive regulation by symbiont of host defense-related protein level
GO:0042025  C:host cell nucleus

From MSLVP

Host nucleus. Host cytoplasm.

From Uniprot

Host Golgi apparatus membrane   The cytoplasmic tail functions as a Golgi complex-targeting signal.   With evidence from 1 publications.

Length:

76

Number of predicted TMHs:

1

Exp number of AAs in TMHs:

22.99586

Exp number, first 60 AAs:

22.99304

Total prob of N-in:

0.17252

POSSIBLE N-term signal

sequence

outside

1  -  14

TMhelix

15  -  37

inside

38  -  76

 

 

Pi

0.2617989

Theta

0.3704072

Tajima's D

-0.789538

CLR

5.995092

Interpretation

No evidence of Selection