Strain

USA_AVIAN_2004_NC_001451 (Region: USA: Beaudette;  Strain: Avian infectious bronchitis virus, complete genome.;  Date: 2004)

Gene

membrane protein

Description

Annotated in NCBI,  membrane protein

Location

NC_001451(+):24505-25182

GenBank Accession

NP_040835.1

Full name

Membrane protein      

Alternative Name

E1 glycoprotein
Matrix glycoprotein
Membrane glycoprotein

CDS

ATGCCCAACGAGACAAATTGTACTCTTGACTTTGAACAGTCAGTTCAGCTTTTTAAAGAGTATAATTTATTTATAACTGCATTCTTGTTGTTCTTAACCATAATACTTCAGTATGGCTATGCAACAAGAAGTAAGGTTATTTATACACTGAAAATGATAGTGTTATGGTGCTTTTGGCCCCTTAACATTGCAGTAGGTGTAATTTCATGTACATACCCACCAAACACAGGAGGTCTTGTCGCAGCGATAATACTTACAGTGTTTGCGTGTCTGTCTTTTGTAGGTTATTGGATCCAGAGTATTAGACTCTTTAAGCGGTGTAGGTCATGGTGGTCATTTAATCCAGAATCTAATGCCGTAGGTTCAATACTCCTAACTAATGGTCAACAATGTAATTTTGCTATAGAGAGTGTGCCAATGGTGCTTTCTCCAATTATAAAGAATGGTGTTCTTTATTGTGAGGGTCAGTGGCTTGCTAAGTGTGAACCAGACCACTTGCCTAAAGATATATTTGTTTGTACACCGGATAGACGTAATATCTACCGTATGGTGCAGAAATATACTGGTGACCAAAGCGGAAATAAGAAAAGGTTTGCTACGTTTGTCTATGCAAAGCAGTCAGTAGATACTGGCGAGCTAGAAAGTGTAGCAACAGGAGGAAGTAGTCTTTACACATAA

Protein

MPNETNCTLDFEQSVQLFKEYNLFITAFLLFLTIILQYGYATRSKVIYTLKMIVLWCFWPLNIAVGVISCTYPPNTGGLVAAIILTVFACLSFVGYWIQSIRLFKRCRSWWSFNPESNAVGSILLTNGQQCNFAIESVPMVLSPIIKNGVLYCEGQWLAKCEPDHLPKDIFVCTPDRRNIYRMVQKYTGDQSGNKKRFATFVYAKQSVDTGELESVATGGSSLYT

Function

Component of the viral envelope that plays a central role in virus morphogenesis and assembly via its interactions with other viral proteins.

Subunit

Homomultimer. Interacts with envelope E protein in the budding compartment of the host cell, which is located between endoplasmic reticulum and the Golgi complex. Forms a complex with HE and S proteins. Interacts with nucleocapsid N protein. This interaction probably participates in RNA packaging into the virus.

Similarity

Belongs to the gammacoronaviruses M protein family.

Keywords

Glycoprotein   Host Golgi apparatus   Host membrane   Membrane   Transmembrane   Transmembrane helix   Viral envelope protein   Viral matrix protein   Virion   Reference proteome   Direct protein sequencing  

Feature

chain  Membrane protein

Uniprot

P69602   P69601   Q91QS9   F4MIZ0   P11222   Q5MNY8   + More
G4RJ75   G4RJA1   A0A1W6AWL0   Q6VUR2   P69606   P69607   A0A346M361   Q910H8   Q6VUR1   Q7TEH1   C6KCX6   A0A1V0G398   F4MIY0   A0A4Y5SXU6   C7S863   G3C785   A0A4V6MBA0   Q6W9D6   P69604   P69603   P69605   Q91SA0   Q91S98   G4RJ99   G0ZGK5   Q80RY9   A0A023PNU4   A0A0K1RMV7   A0A5J6RDL5   E9LUF4   Q9J3N8   Q58J42   Q91SA1   C9DSU1   G4RJ76   A0A1P8FCD5   A0A0A1G0F9   G4RJ78   Q7T9P8   A0A516UWB7   A0A286LPM1   E9LUF8   B3VN11   G4RJ77   A0A1P8VEW9   E9LUF7   A0A5J6RDM6   G4RJ88   A0A4Y5SYV1   A5Z1A5   A0A1L1XGY7   A0A1P8SSM9   E9LUG9   C5IZJ1   A0A1P8SML5   A0A1P8SSY9   G4RJ95   A0A1U9WSL5   A0A1V0G345   G3FLZ4   P12649   A0A1P8VF79   D7SCA1   Q6R4P1   A0A1L7H9C9   Q91S99   M4I7F2   J9WRY4   A0A1P8SSM7   A0A1P8SMP3   A0A1P8Z897   E9LUG3   A0A0D4CFG0   A0A1P8VFG6   A0A1P8SSV5   A0A023PND5   U5U9J5   A0A1P8VEW6   C4PE59   A0A1P8SMJ8   G4RJ79   A0A191TG90   A0A5J6RCR6   A0A1P8FCK5   J9WLU4   A0A1P8FCE7   A0A1P8VF98   W8E3T9   A0A5J6RBM4   A0A0U1UZF0   A0A1P8VF35   A0A1P8VF66   J9WMI7   A0A1P8SMV9  

Pubmed

11711626    6099661    3027249    16137658    21539870    2821010    + More
15661153    21909766    23203570    26482289    28495648    28646651    30526618    11087096    16934878    18295413    31561498    15722532    17629993    23178317    21994806    19100792    20652731    15019237    16927130    20022075    2841803    23166232    23182435    25636916    15183070    27108998   

EMBL

AJ311317    M95169    M22014    DQ001338    DQ001339    AJ311362    + More
FJ904722    ADA83561.1    AY692454    AAV98208.1    FJ849797    FJ849800    ACZ67619.1    ACZ67622.1    FJ849796    FJ849805    FJ849807    FJ849826    JQ801377    ACZ67618.1    ACZ67627.1    ACZ67629.1    ACZ67648.1    AFJ24941.1    KY626045    ARJ35795.1    AY325728    AY325729    GQ174486    FJ904720    FJ904723    GQ504724    GQ504725    JQ693036    KJ425504    KJ425508    KY805845    KY273667    MH539771    MH539772    MK728875    MK937830    MK937833    AAP86204.1    ACS45218.1    ADA83541.1    ADA83571.1    ADP06501.1    ADP06511.1    AFZ88831.1    AHX26068.1    AHX26104.1    ARS23143.1    ASF20084.1    AZP23934.1    AZP23944.1    QCE31537.1    QDA76313.1    QDA76340.1    AF363609    AF343343    AF286184    DQ834384    AY851295    AY044184    AF286185    MG913343    AXQ05205.1    AF363601    AF363604    AY325727    EF602457    GQ504723    KX236001    MK937828    MK887103    MK887109    AAK50028.1    AAK50031.1    AAP86202.1    ABQ84905.1    ADP06488.1    APY26749.1    QDA76295.1    QEY95708.1    QEY95714.1    AY325730    AY641576    AY702085    JF828980    KJ435286    AAP86205.1    AAT70077.1    AAU09494.1    AEP84740.1    AHX26176.1    AY302747    AAP68695.1    GQ174479    ACS45211.1    KX364296    ARB66166.1    FJ904721    ADA83551.1    MK937832    QDA76331.1    EU817497    ACJ12838.1    GU393332    ADV71743.1    MK071267    QCS40644.1    AY302742    AY302743    AY325732    AY846835    AY856347    EF602437    EF602438    EF602439    EF602443    EU714028    EU822341    FJ807652    FJ888351    FJ919614    FJ849808    GU393335    JF330899    JF828981    JX273198    KF188434    KJ425486    KJ425487    KJ425488    KJ425490    KJ425491    KJ425492    KJ425493    KJ425494    KJ425495    KJ425497    KJ425498    KJ425499    KJ425500    KJ425501    KJ425502    KJ425503    KJ425505    KJ425506    KJ425507    KJ425509    KJ425510    KJ425511    KJ425512    KJ435284    KT203557    MG763935    MK937829    MK887093    MK887097    MK887099    MK887106    AAP68690.1    AAP68691.1    AAP86207.1    AAW56626.1    AAW83033.1    ABQ84746.1    ABQ84754.1    ABQ84762.1    ABQ84794.1    ACH72797.1    ACJ50203.1    ACO37570.1    ACQ55234.1    ACQ91088.1    ACZ67630.1    ADV71781.1    ADY62556.1    AEP84750.1    AFS18118.1    AGW24531.1    AHX25906.1    AHX25915.1    AHX25924.1    AHX25942.1    AHX25951.1    AHX25960.1    AHX25969.1    AHX25978.1    AHX25987.1    AHX26005.1    AHX26014.1    AHX26023.1    AHX26032.1    AHX26041.1    AHX26050.1    AHX26059.1    AHX26077.1    AHX26086.1    AHX26095.1    AHX26113.1    AHX26122.1    AHX26131.1    AHX26140.1    AHX26158.1    ALE71335.1    AVX27616.1    QDA76304.1    QEY95698.1    QEY95702.1    QEY95704.1    QEY95711.1    AY028295    AF203004    AF322367    AF363602    AAK50029.1    AF363605    AAK50032.1    FJ849824    ACZ67646.1    JF274479    AEL12225.1    AF470628    AAO33466.1    KJ435285    KT736031    AHX26167.1    AMK51942.1    KR902510    AKV63209.1    MK887102    QEY95707.1    HQ141058    ADW77296.1    AF202999    AF206266    AF206267    AF206268    AF206269    AF206270    AF206271    AY942744    AAX39763.1    AF363600    GQ504722    AAK50027.1    ADP06477.1    GQ427174    ACV87250.1    FJ849801    ACZ67623.1    KX219795    APV46134.1    KM213963    AIY51832.1    FJ849803    FJ849816    FJ849817    FJ849818    FJ849819    ACZ67625.1    ACZ67638.1    ACZ67639.1    ACZ67640.1    ACZ67641.1    AY325731    AAP86206.1    MK581200    MK581201    QDQ69099.1    QDQ69112.1    MF462335    ASU92400.1    HQ141062    JX014370    JX273179    KP790145    KX236013    KX302874    KX425847    ADW77300.1    AFN88516.1    AFS18099.1    AKS25247.1    APY26856.1    APZ73782.1    AQY55861.1    EU780078    ACE88707.2    FJ849802    ACZ67624.1    KX302873    APZ73773.1    HQ141061    KF975406    KP790143    KR265086    ADW77299.1    AIB54163.1    AKS25229.1    ART35305.1    MK887112    QEY95717.1    FJ849813    ACZ67635.1    MK937831    QDA76322.1    EF602458    KX219797    ABQ84913.1    APV46152.1    KJ940497    KR265088    AJP08749.1    ART35321.1    KX236000    APY26740.1    HQ141073    KX259254    ADW77311.1    AQD20732.1    FJ976466    ACR16067.1    KX247128    KX252774    KX252775    KX302870    APW85780.1    APY23501.1    APY23510.1    APZ73746.1    KX236016    APY26883.1    FJ849820    ACZ67642.1    KX389094    AQY55843.1    KX364291    ARB66121.1    JF738089    KX275394    KX259252    MG233398    AEO45971.1    APZ73847.1    AQD20714.1    AXT92419.1    M21515    KX302867    APZ73719.1    FJ849799    HM245923    HQ141059    HQ141064    HQ141065    HQ141066    HQ141069    HQ141071    HQ141072    HQ141074    JX195176    JX840411    KC136209    KC478643    KF853202    KF558347    KF558350    KF558351    KF558352    KF558353    KF558355    KJ128295    KP036505    KM586818    KX348116    KX219792    KX219794    KX219799    KX721498    KX247130    KX252777    KX252784    KX252786    KX252787    KX252789    KX236002    KX236009    KX236015    KX302862    KX302863    KX302869    KX302875    KX259248    KX259250    KX259253    KX375806    KX364295    KY421672    KY421673    MF508703    MG197727    MK032181    MK887091    MK887094    MK887096    MK887098    ACZ67621.1    ADI54949.1    ADW77297.1    ADW77302.1    ADW77303.1    ADW77304.1    ADW77307.1    ADW77309.1    ADW77310.1    ADW77312.1    AFQ94226.1    AFX59331.1    AGE13895.1    AGV02010.1    AHI85764.1    AHJ77573.1    AHJ77576.1    AHJ77577.1    AHJ77578.1    AHJ77579.1    AHJ77581.1    AHN49814.1    AJP16743.1    AKN20496.1    APU51860.1    APV46107.1    APV46125.1    APV46170.1    APW81995.1    APW85798.1    APY23528.1    APY23591.1    APY23609.1    APY23618.1    APY26714.1    APY26758.1    APY26820.1    APY26874.1    APZ73674.1    APZ73683.1    APZ73737.1    APZ73791.1    AQD20678.1    AQD20696.1    AQD20723.1    AQY55816.1    ARB66157.1    ATJ01097.1    ATJ01107.1    AWR92749.1    AXX83287.1    AZA07864.1    QEY95696.1    QEY95699.1    QEY95701.1    QEY95703.1    AY514485    AAS00084.1    KX348117    APU51869.1    AF363603    AAK50030.1    JQ693040    AFZ88835.1    JX273197    AFS18117.1    KX236003    APY26767.1    KX252776    APY23519.1    KX259257    AQD20759.1    HQ141067    ADW77305.1    KP118889    KP118890    KX302860    AJT47927.1    AJT47936.1    APZ73656.1    KX275393    APZ73838.1    KX236012    APY26847.1    KJ435283    KX364299    KX364300    AHX26149.1    ARB66193.1    ARB66202.1    KF574761    KF558356    KX236008    KX275391    KX372250    AGZ20166.1    AHJ77582.1    APY26811.1    APZ73820.1    AQY03972.1    KX302871    APZ73755.1    FJ919615    FJ919616    KC008600    ACQ91089.1    ACQ91090.1    AGK85503.1    KX252773    APY23492.1    FJ849804    ACZ67626.1    KU317090    ANI87715.1    MK887100    QEY95705.1    KX219800    APV46179.1    JX273195    AFS18115.1    KX219793    APV46116.1    KX302872    APZ73764.1    KF558354    AHJ77580.1    MK887095    QEY95700.1    KF975407    KJ669722    KJ940498    KR265091    AIB54164.1    AJP08745.1    AJP08750.1    ART35345.1    KX302861    KX302865    APZ73665.1    APZ73701.1    KX302868    KX372249    APZ73728.1    AQY03963.1    JX273186    AFS18106.1    KX252785    APY23600.1   

Proteomes

UP000114388    UP000006717    UP000101586    UP000107149    UP000098752    UP000107291    + More
UP000114242    UP000117985    UP000155946    UP000165485    UP000007642    UP000096468    UP000132955    UP000104400    UP000149491    UP000161686    UP000169726    UP000107830    UP000160499    UP000097868    UP000102121    UP000102163    UP000103149    UP000106511    UP000108224    UP000113245    UP000113896    UP000113939    UP000118008    UP000120286    UP000120642    UP000132365    UP000136241    UP000136440    UP000138146    UP000146865    UP000149404    UP000155572    UP000158124    UP000158949    UP000159206    UP000163887    UP000165788    UP000166253    UP000167410    UP000170189    UP000170844    UP000173109    UP000173215    UP000180343    UP000159542    UP000107224    UP000174151    UP000151562    UP000101527    UP000098674    UP000174764    UP000162160    UP000148786    UP000098934    UP000126099    UP000126761    UP000134521    UP000145502    UP000149511    UP000154272    UP000167873    UP000160278    UP000133678    UP000152683    UP000102797    UP000102415    UP000151129   

Pfam

PF01635   Corona_M

Interpro

IPR042550   GAMMA_CORONA_M
IPR002574   Corona_M

ProteinModelPortal

P69602   P69601   Q91QS9   F4MIZ0   P11222   Q5MNY8   + More
G4RJ75   G4RJA1   A0A1W6AWL0   Q6VUR2   P69606   P69607   A0A346M361   Q910H8   Q6VUR1   Q7TEH1   C6KCX6   A0A1V0G398   F4MIY0   A0A4Y5SXU6   C7S863   G3C785   A0A4V6MBA0   Q6W9D6   P69604   P69603   P69605   Q91SA0   Q91S98   G4RJ99   G0ZGK5   Q80RY9   A0A023PNU4   A0A0K1RMV7   A0A5J6RDL5   E9LUF4   Q9J3N8   Q58J42   Q91SA1   C9DSU1   G4RJ76   A0A1P8FCD5   A0A0A1G0F9   G4RJ78   Q7T9P8   A0A516UWB7   A0A286LPM1   E9LUF8   B3VN11   G4RJ77   A0A1P8VEW9   E9LUF7   A0A5J6RDM6   G4RJ88   A0A4Y5SYV1   A5Z1A5   A0A1L1XGY7   A0A1P8SSM9   E9LUG9   C5IZJ1   A0A1P8SML5   A0A1P8SSY9   G4RJ95   A0A1U9WSL5   A0A1V0G345   G3FLZ4   P12649   A0A1P8VF79   D7SCA1   Q6R4P1   A0A1L7H9C9   Q91S99   M4I7F2   J9WRY4   A0A1P8SSM7   A0A1P8SMP3   A0A1P8Z897   E9LUG3   A0A0D4CFG0   A0A1P8VFG6   A0A1P8SSV5   A0A023PND5   U5U9J5   A0A1P8VEW6   C4PE59   A0A1P8SMJ8   G4RJ79   A0A191TG90   A0A5J6RCR6   A0A1P8FCK5   J9WLU4   A0A1P8FCE7   A0A1P8VF98   W8E3T9   A0A5J6RBM4   A0A0U1UZF0   A0A1P8VF35   A0A1P8VF66   J9WMI7   A0A1P8SMV9  

PDB

6EOR     E-value=3.49093,     Score=67