Strain

USA_FELINE_2005_NC_002306 (Region: USA;  Strain: Feline infectious peritonitis virus, complete genome.;  Date: 2005)

Gene

non-structural protein 7b

Description

Annotated in NCBI,  non-structural protein 7b

Location

NC_002306(+):28462-29082

GenBank Accession

YP_004070201.1

Full name

Non-structural protein 7b      

Alternative Name

Accessory protein 7b

CDS

ATGATTGTTGTAATCCTTGTGTGTATCTTTTTGGCTAATGGAATTAAAGCTACTGCTGTGCAAAATGACCTTCATGAACATCCCGTTCTTACCTGGGATTTATTACAGCATTTCATAGGACATACCCTCTACATTACAACACACCAGGTCTTAGCACTACCGCTTGGATCTCGTGTTGAGTGTGAGGGTATCGAAGGTTTCAATTGCACATGGCCTGGCTTTCAAGATCCTGCACATGATCATATTGATTTCTACTTTGATCTTTCTAATCCTTTCTATTCATTTGTAGATAATTTTTATATTGTAAGTGAGGGAAATCAAAGAATCAATCTCAGATTGGTTGGTGCTGTGCCAAAACAAAAGAGATTAAATGTTGGTTGTCATACATCATTTGCTGTTGATCTTCCATTTGGGATTCAGATATACCATGACAGGGATTTTCAACACCCTGTTGATGGCAGACATCTAGATTGTACTCACAGAGTGTACTTTGTGAAGTACTGTCCACATAACCTGCATGGTTATTGCTTTAATGAGAGGCTGAAAGTTTATGACTTGAAGCAATTCAGAAGCAAGAAGGTCTTCGACAAAATCAACCAACATCATAAAACTGAGTTATAA

Protein

MIVVILVCIFLANGIKATAVQNDLHEHPVLTWDLLQHFIGHTLYITTHQVLALPLGSRVECEGIEGFNCTWPGFQDPAHDHIDFYFDLSNPFYSFVDNFYIVSEGNQRINLRLVGAVPKQKRLNVGCHTSFAVDLPFGIQIYHDRDFQHPVDGRHLDCTHRVYFVKYCPHNLHGYCFNERLKVYDLKQFRSKKVFDKINQHHKTEL

Keywords

Reference proteome   Signal  

Feature

chain  Non-structural protein 7b

Uniprot

L7X9L9   L7X799   L7X7D6   L7X797   L7X7C6   L7X6G6   + More
L7X9L5   L7X2B5   L7X778   L7X2B9   L7X7E4   L7X7E8   L7X9M3   L7X785   L7X7E0   L7X6K0   L7X9M9   L7X9J4   L7X7B6   L7X7C1   L7X6I7   L7X794   L7X2B0   L7X790   L7X7D2   L7X295   L7X6H1   L7X773   L7X6J1   L7X7A1   L7X9K8   L7X2C8   L7X7A5   L7X6H7   L7X2A3   L7X288   L7X9N5   L7X7F2   L7X299   L7X6J5   L7X7F6   L7X9K3   L7X2D2   L7X9K0   L7X6G2   L7X6I2   L7X2C4   K7XKR3   A0A5K1VK71   I0B0S7   P19743   L7X768   Q66903   L7X6F8   I0B0R8   L7X7B2   L7X9I7   S6B8Y9   C6GHA3   C6GHH5   A0A077ER10   G1FEZ4   E0AGX3   A0A386YIM7   C6GH92   Q14V92   Q14VB3   Q14VA1   Q14V98   Q14VA2   S6BUM1   Q14V99   Q14V91   Q14VA9   C5IGE7   Q14V97   C5IJ71   A0A1Z2WUB9   E0AH05   D3KDM2   E3W5G5   E3W5I7   Q66953   A0A077EUY9   Q66900   A0A077EV00   Q14V93   Q14VC4   Q14V90   E0AGW3   C6GHI6   Q66902   Q14VC8   Q14VB2   A0A2U8Z7Y9   A0A077ERH9   D3KDL1   A0A125R5J0   C6GHJ7   Q14V95  

Pubmed

22438554    23996606    3201747    16033972    7571432    25180686    + More
25150756    26822958   

EMBL

JX239121    AGC94890.1    JX239127    AGC94896.1    JX239114    AGC94883.1    + More
JX239122    AGC94891.1    JX239104    AGC94873.1    JX239100    AGC94869.1    JX239116    AGC94885.1    JX239118    AGC94887.1    JX239102    AGC94871.1    JX239123    AGC94892.1    JX239124    AGC94893.1    JX239129    AGC94898.1    JX239126    AGC94895.1    JX239107    AGC94876.1    JX239119    AGC94888.1    JX239135    AGC94904.1    JX239131    AGC94900.1    JX239096    AGC94865.1    JX239094    AGC94863.1    JX239099    AGC94868.1    JX239120    AGC94889.1    JX239117    AGC94886.1    JX239113    AGC94882.1    JX239112    AGC94881.1    JX239109    AGC94878.1    JX239098    AGC94867.1    JX239105    AGC94874.1    JX239097    AGC94866.1    JX239125    AGC94894.1    JX239132    AGC94901.1    JX239111    AGC94880.1    JX239133    AGC94902.1    JX239137    AGC94906.1    JX239110    AGC94879.1    JX239108    AGC94877.1    JX239093    AGC94862.1    JX239136    AGC94905.1    JX239134    AGC94903.1    JX239103    AGC94872.1    JX239130    AGC94899.1    JX239139    AGC94908.1    JX239106    AGC94875.1    JX239138    AGC94907.1    JX239101    AGC94870.1    JX239095    AGC94864.1    JX239115    AGC94884.1    JX239128    AGC94897.1    KC175339    AFX81088.1    JX467668    JX467669    JX467670    AGC24775.1    AGC24776.1    AGC24777.1    JQ408981    KC461235    KC461236    AFH55128.1    AGZ84524.1    AGZ84534.1    M23694    DQ010921    AY994055    JX239092    AGC94861.1    X90573    CAA62197.1    JX239090    AGC94859.1    JQ408980    AFH55119.1    JX239089    AGC94858.1    JX239091    AGC94860.1    AB781788    BAN67908.1    FJ938052    ACT10873.1    FJ938059    ACT10945.1    KJ665801    AIL54108.1    JN183883    AEK25529.1    HQ012369    ADL71473.1    MH817484    AYF53101.1    FJ938051    ACT10862.1    DQ675450    ABG25961.1    DQ675429    ABG25940.1    DQ675441    ABG25952.1    DQ675444    ABG25955.1    DQ675440    ABG25951.1    AB781789    BAN67917.1    DQ675443    ABG25954.1    DQ675451    ABG25962.1    DQ675433    ABG25944.1    FJ917525    ACR10340.1    DQ675445    ABG25956.1    FJ943770    ACR46147.1    KY292377    ASB16895.1    HQ012372    ADL71505.1    GU553362    ADC35480.1    HQ392469    ADO39825.1    HQ392471    ADO39847.1    X90570    CAA62191.1    KJ665789    AIL54085.1    X90572    CAA62195.1    KJ665797    AIL54100.1    DQ675449    ABG25960.1    DQ675418    ABG25929.1    DQ675452    ABG25963.1    HQ012368    ADL71463.1    FJ938060    ACT10956.1    KU215419    KU215420    KU215422    KU215423    KU215424    KU215425    KU215426    X90574    AMD11138.1    AMD11150.1    AMD11172.1    AMD11183.1    AMD11194.1    AMD11205.1    AMD11216.1    CAA62199.1    DQ675414    ABG25925.1    DQ675430    ABG25941.1    MF457591    AWN93249.1    KJ665786    AIL54079.1    GU553361    ADC35469.1    KU215427    KU215428    AMD11227.1    AMD11238.1    FJ938061    ACT10967.1    DQ675447    ABG25958.1   

Proteomes

UP000119918    UP000131699    UP000169693    UP000180339    UP000000835    UP000140386    + More
UP000096172    UP000114363    UP000153160    UP000173564    UP000161789    UP000117062    UP000110620    UP000138585    UP000113038    UP000145457    UP000141579    UP000118118    UP000113596    UP000117806    UP000135072    UP000135717    UP000143834    UP000158395    UP000161862    UP000137357    UP000102801    UP000126919    UP000147290   

Pfam

PF03262   Corona_6B_7B

Interpro

IPR004945   Corona_6B_7B

ProteinModelPortal

L7X9L9   L7X799   L7X7D6   L7X797   L7X7C6   L7X6G6   + More
L7X9L5   L7X2B5   L7X778   L7X2B9   L7X7E4   L7X7E8   L7X9M3   L7X785   L7X7E0   L7X6K0   L7X9M9   L7X9J4   L7X7B6   L7X7C1   L7X6I7   L7X794   L7X2B0   L7X790   L7X7D2   L7X295   L7X6H1   L7X773   L7X6J1   L7X7A1   L7X9K8   L7X2C8   L7X7A5   L7X6H7   L7X2A3   L7X288   L7X9N5   L7X7F2   L7X299   L7X6J5   L7X7F6   L7X9K3   L7X2D2   L7X9K0   L7X6G2   L7X6I2   L7X2C4   K7XKR3   A0A5K1VK71   I0B0S7   P19743   L7X768   Q66903   L7X6F8   I0B0R8   L7X7B2   L7X9I7   S6B8Y9   C6GHA3   C6GHH5   A0A077ER10   G1FEZ4   E0AGX3   A0A386YIM7   C6GH92   Q14V92   Q14VB3   Q14VA1   Q14V98   Q14VA2   S6BUM1   Q14V99   Q14V91   Q14VA9   C5IGE7   Q14V97   C5IJ71   A0A1Z2WUB9   E0AH05   D3KDM2   E3W5G5   E3W5I7   Q66953   A0A077EUY9   Q66900   A0A077EV00   Q14V93   Q14VC4   Q14V90   E0AGW3   C6GHI6   Q66902   Q14VC8   Q14VB2   A0A2U8Z7Y9   A0A077ERH9   D3KDL1   A0A125R5J0   C6GHJ7   Q14V95  

PDB

1QAH     E-value=2.08671,     Score=68