Strain

CHINA_BAT_2006_NC_009019 (Region: China: Guangdong province;  Strain: Bat coronavirus HKU4-1, complete genome.;  Date: 2006)

Gene

hypothetical protein

Description

Annotated in NCBI,  hypothetical protein

Location

NC_009019(+):25948-26307

GenBank Accession

YP_001039955.1

Full name

Non-structural protein 3b       + More
DRBM domain-containing protein      
Non-structural protein ORF4a      

Alternative Name

Accessory protein 3b

CDS

ATGGACTACGTCTCTTTGCTTAACCAATTTTGGCAGAAGCAAATTAAGTCTTATAAAGAGACTCCTAGTCAGTATCATTACCTGTATCCACCCAGGTTTTTCTATAAACCTGTTTTGGGTAATTTACAGCACCCTACCAAGTGGTGTTGTACTATTAAATTTTATGAGTATAGTGCTCAGGCTACTGAGTGTACTAAAGCATCAGCAAAACAAGATGCAGCTAGACTTATCTGTGAACAGTTACAAGCTGCTGGACTACTCAATGGAATGGAGCTCCGATTCCGTAGTTCTGCCTCCGACATCTTCGGACAAAACCGTTATGATGCCAGCAAAAGCTACTTCTTCTCGAAAACGGCATAG

Protein

MDYVSLLNQFWQKQIKSYKETPSQYHYLYPPRFFYKPVLGNLQHPTKWCCTIKFYEYSAQATECTKASAKQDAARLICEQLQAAGLLNGMELRFRSSASDIFGQNRYDASKSYFFSKTA

Function

Induces host cell G0/G1 arrest and apoptosis.
DsRNA-binding protein that plays a role in the inhibition of host innate response. Suppresses host PACT-induced activation of DDX58 and MDA5 and thereby circumvents the production of type I inteferons. Prevents also the activation of host NF-kappaB.

Subunit

Interacts with host RUNX1 isoform b.
Interacts with host PRKRA/PACT.

Keywords

Apoptosis   Host mitochondrion   Host nucleus   Host-virus interaction   Modulation of host cell apoptosis by virus   Modulation of host cell cycle by virus   Reference proteome   RNA-binding   Host cytoplasm   Inhibition of host innate immune response by virus   Inhibition of host NF-kappa-B by virus   Viral immunoevasion  

Feature

chain  Non-structural protein 3b

Uniprot

A3EXB4   A3EXA5   A3EX96   P0C530   A3EXC3   A0A166ZLQ2   + More
A0A0U1WHL5   A0A0U1UZF7   A3EXF0   A3EXE1   A3EXF9   A3EXD2   A0A0G3KE65   A0A385AJY0   A0A291I5W5   A0A140AQ50   A0A2D0YCD5   A0A0R9USB1   A0A291I6J6   M1S185   T2BBG6   K9N4V0   A0A191KB16   A0A411PBJ9   A0A1W5LGT2   A0A2D0YLP2   A0A3B8DX19   A0A3S7R2I0   A0A411PBL5   A0A1B0V979   A0A384VYF7   A0A141LLC2  

Pubmed

17121802    16840328    26847648    26839489    26814649    29116217    + More
26584223    27999424    31022948    23693015    24055451    25075761    24549846    25323704    26484549    26632876    26272558    26272560    26933050    26678874    28634355    29239118    30294617    30753126    24027320    24318862    24522921    27486688    26981770   

EMBL

EF065507    ABN10859.1    EF065506    ABN10850.1    EF065505    DQ648794    + More
EF065508    ABN10868.1    KU182965    ANA96041.1    KJ473822    AIA62354.1    KJ473820    AIA62345.1    EF065511    ABN10895.1    EF065510    ABN10886.1    EF065512    ABN10904.1    EF065509    KT026453    KT026455    AKK52584.1    AKK52604.1    MH310912    AXN92262.1    MG011340    ATG84681.1    KT374056    KT374057    ALB08313.1    ALB08324.1    MF598722    ASU91327.1    KT275306    KT275307    KT275308    KT225476    KT806047    KX154684    KX108945    KX108946    MF598594    MF598595    MF598602    MF598603    MF598604    MF598606    MF598607    MF598608    MF598609    MF598611    MF598612    MF598613    MF598614    MF598615    MF598618    MF598619    MF598620    MF598621    MF598625    MF598627    MF598632    MF598633    MF598646    MF598652    MF598657    MF598661    MF598662    MF598664    MF598666    MF598668    MF598669    MF598670    MF598676    MF598677    MF598680    MF598682    MF598684    MF598685    MF598686    MF598688    MF598691    MF598692    MF598693    MF598694    MF598697    MF598712    MG011341    MG011343    MG011347    MG011352    MG011353    MG011355    MG011359    MG366880    MG912607    MG912608    MH454272    MH371127    MH395139    MH432120    MG757605    MK280984    MK462244    AKQ21057.1    AKQ21066.1    AKQ21075.1    ALD51906.1    ALW82671.1    ANF29164.1    ANI69913.1    ANI69924.1    ASU89923.1    ASU89935.1    ASU90012.1    ASU90023.1    ASU90034.1    ASU90056.1    ASU90067.1    ASU90078.1    ASU90089.1    ASU90111.1    ASU90122.1    ASU90133.1    ASU90144.1    ASU90155.1    ASU90188.1    ASU90199.1    ASU90210.1    ASU90221.1    ASU90265.1    ASU90287.1    ASU90342.1    ASU90353.1    ASU90496.1    ASU90562.1    ASU90617.1    ASU90661.1    ASU90672.1    ASU90694.1    ASU90716.1    ASU90738.1    ASU90749.1    ASU90760.1    ASU90826.1    ASU90837.1    ASU90870.1    ASU90892.1    ASU90914.1    ASU90925.1    ASU90936.1    ASU90958.1    ASU90990.1    ASU91001.1    ASU91012.1    ASU91023.1    ASU91056.1    ASU91221.1    ATG84692.1    ATG84714.1    ATG84758.1    ATG84813.1    ATG84824.1    ATG84846.1    ATG84890.1    ATY74383.1    AVK87452.1    AVK87463.1    AWU59323.1    AXG21645.1    AXG21656.1    AXG21667.1    AXN73527.1    AZU90733.1    QBF80468.1    MG011351    MG011356    MG011357    ATG84802.1    ATG84857.1    ATG84868.1    KC667074    AGG22544.1    KF600628    KF961221    KF961222    KJ156874    KJ156910    KJ156934    KJ156916    KJ156942    KJ156873    KJ156901    KJ156905    KJ156911    KJ156865    KJ156907    KJ156933    KJ650098    KJ829365    KM027255    KM027256    KM027257    KM027258    KM027259    KM027260    KM027261    KM027262    KP223131    KR011263    KR011264    KR011265    KR011266    KT006149    KT026454    KT026456    KT029139    KT036372    KT036373    KT036374    KT121574    KT326819    KT368824    KT368825    KT368826    KT368827    KT368828    KT368829    KT368830    KT368831    KT368832    KT368833    KT368834    KT368835    KT368836    KT368837    KT368838    KT368839    KT368840    KT368841    KT368842    KT368843    KT368844    KT368845    KT368846    KT368847    KT368848    KT368849    KT368850    KT368851    KT368852    KT368853    KT368854    KT368855    KT368856    KT368857    KT368858    KT368859    KT368860    KT368861    KT368862    KT368863    KT368864    KT368865    KT368866    KT368867    KT368868    KT368869    KT368870    KT368871    KT368872    KT368873    KT368874    KT368875    KT368876    KT368877    KT368878    KT368879    KT368880    KT368881    KT368882    KT368883    KT368884    KT368885    KT368886    KT368887    KT368888    KT368889    KT368890    KT374050    KT374051    KT374052    KT374053    KT374054    KT374055    KT868865    KT868866    KT868867    KT868868    KT868869    KT868870    KT868871    KT868872    KT868873    KT868874    KT868875    KT868876    KT868877    KT877350    KT877351    KT002191    KT751244    KT806044    KT806045    KT806046    KT806048    KT806049    KT806050    KT806051    KT806052    KT806053    KT806054    KT806055    KT861627    KT861628    KU308549    KU851860    KU851861    KU851862    KU851863    KU851864    KX034093    KX034094    KX034095    KX034096    KX034097    KX034098    KX034099    KX034100    KX154685    KX154686    KX154688    KX154689    KX154690    KX154692    KX154693    KX108944    KY688118    KY688119    KY688120    KY688121    KY688122    KY688123    KY688124    KY706245    KY706246    KY706247    KY581693    MF598596    MF598597    MF598598    MF598599    MF598600    MF598601    MF598605    MF598610    MF598616    MF598617    MF598622    MF598623    MF598628    MF598629    MF598630    MF598631    MF598634    MF598638    MF598640    MF598642    MF598643    MF598644    MF598645    MF598648    MF598649    MF598650    MF598651    MF598653    MF598654    MF598655    MF598656    MF598658    MF598659    MF598660    MF598665    MF598671    MF598673    MF598675    MF598678    MF598683    MF598687    MF598689    MF598690    MF598696    MF598698    MF598699    MF598700    MF598701    MF598702    MF598703    MF598704    MF598705    MF598706    MF598707    MF598708    MF598709    MF598710    MF598711    MF598713    MF598714    MF598715    MF598716    MF598717    MF598718    MF598719    MF598720    MF598721    MG011344    MG011345    MG011346    MG011348    MG011349    MG011350    MG011358    MG011360    MG011361    MG011362    MG366881    MG366882    MG366883    MG912595    MG912596    MG912597    MG912598    MG912599    MG912600    MG912601    MG912602    MG912603    MG912604    MG912605    MG912606    MH013216    MH306207    MG366483    MG520075    MG520076    MG757593    MG757594    MG757595    MG757596    MG757598    MG757599    MG757600    MG757601    MG757602    MG757603    MG757604    MH310909    MH310910    MH310911    MG546331    MH822886    MH029552    MK052676    MK039552    MK039553    MK129253    MK462243    MK462245    MK462246    MK462247    MK462248    MK462249    MK462250    MK462251    MK462252    MK462254    MK462256    MH259485    MH259486    MK796425    MN120513    MN120514    MN365232    MN365233    AGV08457.1    AHC74090.1    AHC74100.1    AHI48541.1    AHI48563.1    AHI48574.1    AHI48618.1    AHI48628.1    AHI48664.1    AHI48684.1    AHI48694.1    AHI48704.1    AHI48814.1    AHI48820.1    AHI48841.1    AHX71948.1    AHZ64059.1    AIL23914.1    AIL23925.1    AIL23936.1    AIL23947.1    AIL23958.1    AIL23969.1    AIL23980.1    AIL23991.1    AIZ48762.1    AKI29257.1    AKI29267.1    AKI29277.1    AKI29286.1    AKJ80139.1    AKK52594.1    AKK52614.1    AKL59403.1    AKL80595.1    AKL80606.1    AKL80617.1    AKN24769.1    AKS48064.1    ALA49343.1    ALA49354.1    ALA49365.1    ALA49376.1    ALA49387.1    ALA49398.1    ALA49409.1    ALA49420.1    ALA49431.1    ALA49442.1    ALA49453.1    ALA49464.1    ALA49475.1    ALA49486.1    ALA49497.1    ALA49508.1    ALA49519.1    ALA49530.1    ALA49541.1    ALA49552.1    ALA49563.1    ALA49574.1    ALA49585.1    ALA49596.1    ALA49607.1    ALA49618.1    ALA49629.1    ALA49640.1    ALA49651.1    ALA49662.1    ALA49673.1    ALA49684.1    ALA49695.1    ALA49706.1    ALA49717.1    ALA49728.1    ALA49739.1    ALA49750.1    ALA49761.1    ALA49772.1    ALA49783.1    ALA49794.1    ALA49805.1    ALA49816.1    ALA49827.1    ALA49838.1    ALA49849.1    ALA49860.1    ALA49871.1    ALA49882.1    ALA49893.1    ALA49904.1    ALA49915.1    ALA49926.1    ALA49937.1    ALA49948.1    ALA49959.1    ALA49970.1    ALA49981.1    ALA49992.1    ALA50003.1    ALA50014.1    ALA50025.1    ALA50036.1    ALA50047.1    ALA50058.1    ALA50069.1    ALB08248.1    ALB08259.1    ALB08269.1    ALB08280.1    ALB08291.1    ALB08302.1    ALK80194.1    ALK80204.1    ALK80214.1    ALK80224.1    ALK80234.1    ALK80244.1    ALK80253.1    ALK80263.1    ALK80273.1    ALK80283.1    ALK80293.1    ALK80303.1    ALK80313.1    ALL26398.1    ALL26411.1    ALM88292.1    ALR69643.1    ALW82638.1    ALW82649.1    ALW82660.1    ALW82682.1    ALW82693.1    ALW82704.1    ALW82711.1    ALW82722.1    ALW82733.1    ALW82744.1    ALW82755.1    ALX27234.1    ALX27245.1    AML60272.1    AMQ49028.1    AMQ49039.1    AMQ49050.1    AMQ49061.1    AMQ49072.1    ANC28636.1    ANC28647.1    ANC28658.1    ANC28669.1    ANC28680.1    ANC28691.1    ANC28702.1    ANC28713.1    ANF29175.1    ANF29186.1    ANF29208.1    ANF29219.1    ANF29230.1    ANF29252.1    ANF29263.1    ANI69902.1    AQZ41313.1    AQZ41323.1    AQZ41334.1    AQZ41345.1    AQZ41356.1    AQZ41367.1    AQZ41378.1    ASJ26612.1    ASJ26620.1    ASJ26628.1    ASU45798.1    ASU89946.1    ASU89957.1    ASU89968.1    ASU89979.1    ASU89990.1    ASU90001.1    ASU90045.1    ASU90100.1    ASU90166.1    ASU90177.1    ASU90232.1    ASU90243.1    ASU90297.1    ASU90309.1    ASU90320.1    ASU90331.1    ASU90364.1    ASU90408.1    ASU90430.1    ASU90452.1    ASU90463.1    ASU90474.1    ASU90485.1    ASU90518.1    ASU90529.1    ASU90540.1    ASU90551.1    ASU90573.1    ASU90584.1    ASU90595.1    ASU90606.1    ASU90628.1    ASU90639.1    ASU90650.1    ASU90705.1    ASU90771.1    ASU90793.1    ASU90815.1    ASU90848.1    ASU90903.1    ASU90947.1    ASU90968.1    ASU90980.1    ASU91045.1    ASU91067.1    ASU91078.1    ASU91089.1    ASU91100.1    ASU91111.1    ASU91122.1    ASU91133.1    ASU91144.1    ASU91155.1    ASU91166.1    ASU91177.1    ASU91188.1    ASU91199.1    ASU91210.1    ASU91232.1    ASU91243.1    ASU91254.1    ASU91264.1    ASU91275.1    ASU91286.1    ASU91297.1    ASU91307.1    ASU91317.1    ATG84725.1    ATG84736.1    ATG84747.1    ATG84769.1    ATG84780.1    ATG84791.1    ATG84879.1    ATG84901.1    ATG84912.1    ATG84923.1    ATY74394.1    ATY74405.1    ATY74416.1    AVK87320.1    AVK87331.1    AVK87342.1    AVK87353.1    AVK87364.1    AVK87375.1    AVK87386.1    AVK87397.1    AVK87408.1    AVK87419.1    AVK87430.1    AVK87441.1    AVV61902.1    AWM99584.1    AXN73361.1    AXN73372.1    AXN73383.1    AXN73395.1    AXN73406.1    AXN73417.1    AXN73428.1    AXN73450.1    AXN73461.1    AXN73472.1    AXN73483.1    AXN73494.1    AXN73505.1    AXN73516.1    AXN92230.1    AXN92240.1    AXN92251.1    AYM48033.1    AYO86701.1    AYP10300.1    AYV64551.1    AYV64562.1    AZK15902.1    QBF80457.1    QBF80479.1    QBF80490.1    QBF80501.1    QBF80512.1    QBF80523.1    QBF80534.1    QBF80545.1    QBF80556.1    QBF80578.1    QBF80600.1    QCI31471.1    QCI31482.1    QCQ29077.1    QDP16197.1    QDP16208.1    QEJ82217.1    QEJ82228.1    KC164505    KU851859    AMQ49017.1    MK462253    MK462255    QBF80567.1    QBF80589.1    KX154691    ANF29241.1    MF598626    ASU90276.1    MG546330    AYJ71472.1    MG757597    AXN73439.1    MK483839    QBF80613.1    KU710264    KU710265    AMQ48995.1    AMQ49006.1    MF741837    MF741834    MF741835    MF741836    ASY99780.1    ASY99886.1    ASY99897.1    ASY99908.1    KU233363    KU233364    MF741825    MF741826    MF741827    MF741828    MF741829    MF741830    MF741831    MF741832    ALT66815.1    ALT66826.1    ASY99791.1    ASY99802.1    ASY99813.1    ASY99822.1    ASY99833.1    ASY99844.1    ASY99855.1    ASY99866.1   

Proteomes

UP000110642    UP000163538    UP000006574    UP000007449    UP000123539    UP000107989    + More
UP000104899    UP000148908    UP000143769    UP000164987    UP000100668    UP000007451    UP000095864    UP000180347    UP000149108    UP000162302    UP000119183    UP000151795    UP000160415    UP000096875    UP000097149    UP000098431    UP000098933    UP000100765    UP000102098    UP000102966    UP000103178    UP000104003    UP000104075    UP000104540    UP000105311    UP000106595    UP000108564    UP000109122    UP000109494    UP000109666    UP000109767    UP000110604    UP000110836    UP000112022    UP000112306    UP000112550    UP000112676    UP000113143    UP000113235    UP000113724    UP000113762    UP000114746    UP000115322    UP000115754    UP000116785    UP000117213    UP000118563    UP000118772    UP000119223    UP000120083    UP000120697    UP000121965    UP000122049    UP000122810    UP000123963    UP000124216    UP000124793    UP000125198    UP000126763    UP000126955    UP000128076    UP000128184    UP000128186    UP000128651    UP000128896    UP000128936    UP000129301    UP000129370    UP000129433    UP000131256    UP000134703    UP000135646    UP000136645    UP000137287    UP000138672    UP000139687    UP000139800    UP000140611    UP000140819    UP000142239    UP000142730    UP000143877    UP000144056    UP000144472    UP000144709    UP000144909    UP000144938    UP000145271    UP000146591    UP000146604    UP000147342    UP000147538    UP000148100    UP000149043    UP000149341    UP000149520    UP000151455    UP000151733    UP000151999    UP000152659    UP000153346    UP000155291    UP000155319    UP000156579    UP000156767    UP000157238    UP000158935    UP000159190    UP000159306    UP000159414    UP000159793    UP000161712    UP000163035    UP000163895    UP000165587    UP000165701    UP000167218    UP000167295    UP000168352    UP000170921    UP000171389    UP000171892    UP000172503    UP000172734    UP000173175    UP000173448    UP000174054    UP000174558    UP000175153    UP000180346    UP000180348    UP000139997   

PRIDE

A3EXD2   

Pfam

PF00035   dsrm

Interpro

IPR014720   dsRBD_dom

ProteinModelPortal

A3EXB4   A3EXA5   A3EX96   P0C530   A3EXC3   A0A166ZLQ2   + More
A0A0U1WHL5   A0A0U1UZF7   A3EXF0   A3EXE1   A3EXF9   A3EXD2   A0A0G3KE65   A0A385AJY0   A0A291I5W5   A0A140AQ50   A0A2D0YCD5   A0A0R9USB1   A0A291I6J6   M1S185   T2BBG6   K9N4V0   A0A191KB16   A0A411PBJ9   A0A1W5LGT2   A0A2D0YLP2   A0A3B8DX19   A0A3S7R2I0   A0A411PBL5   A0A1B0V979   A0A384VYF7   A0A141LLC2  

PDB

6UZ7     E-value=2.00044,     Score=65