Strain

CHINA_BAT_2006_NC_009019 (Region: China: Guangdong province;  Strain: Bat coronavirus HKU4-1, complete genome.;  Date: 2006)

Gene

nucleocapsid phosphoprotein

Description

Annotated in NCBI,  nucleocapsid phosphoprotein

Location

NC_009019(+):28697-29968

GenBank Accession

YP_001039960.1

Full name

Nucleoprotein      

Alternative Name

Nucleocapsid protein

CDS

ATGGCAACTCCTGCTGCACCTCGCACCATTAGTTTTGCTGATAATAATGACAACCAGCCTAATCAGCAGCAGCGTGGACGCGGAAGAAACCCTAAGCCACGACCTGCTCCCAATAACACTGTCTCCTGGTACACAGGGCTCACCCAACACGGTAAAAACCCGCTTGCCTTCCCTCCTGGACAGGGTGTACCTCTTAATGCCAATTCTACAACAGCCCAGAATGCTGGATACTGGCGGAGACAAGACCGGAAAATCAACACCGGTAATGGTGTTAAACAATTGGCTCCCAGATGGTTCTTCTACTACACTGGGACTGGACCAGAGGCTAATCTACCTTTTAGATCAGTCAAGGATGGCATCGTCTGGGTTTATGAAGAAGGTGCCACTGATGCTCCTTCAGTCTTTGGGACTCGCAACCCAGCAAATGATGCTGCTATCGTTTGCCAGTTTGCGCCAGGTACTCTCATTCCTAAAAACTTCCACATTGAAGGGACTGGGGGTAATAGTCAGTCATCTTCAAGAGCATCCTCCAACAGTAGGAACTCTTCTAGATCCAGTTCCAGAGGAGGACGAAGCACTTCTAACTCCAGAGGGACTTCCCCAGTTTCACATGGAGTCGGAAGTGCAGAATCCTTAGCTGCTCTGCCATTGCTTCTAGACTTGCAGAAGCGTTTGGCTGATCTTGAGTCTGGAAAGTCAAAGCAGCCTAAAGTTGTCACCAAAAAGGACGCTGCCGCTGCAAAAAATAAAATGCGCCATAAGCGTGTTGCCACCAAAGGTTTCAATGTAACTCAGGCTTTTGGTCTTCGTGGACCAGGCCCATTGCAGGGAAATTTTGGTGACATGAACTACAACAAGTTTGGTACTGAGGACCCTCGTTGGCCTCAGATGGCTGAACTTGCTCCTTCAGCTTCAGCTTTCATGAGTATGTCTCAATTTAAGCTTACCCATCAAAGCAATGATGACAAAGGTGATCCTATTTACTTTTTGTCATATTCAGGAGCAATTAAACTAGACCCTAAGAATCCCAACTACAAAAAGTGGCTGGAGCTTCTTGAGTCAAATATTGATGCTTACAAAACTTTCCCTAAGAAAGAGCGTAAGCCTAAAACTACAGAAGATGGAGCTGTTGCTTCTTCTTCAGCTAGTCAAATGGAGGATGTTGATGCTAAACCTCAGCGAAAGCCTAAAAGCCGAGTAGCAGGTAGCATTACCATGCGTTCTGGAAGCTTACCAGCTCTTCAGGACGTTACCTTCGATTCAGAGGCTTGA

Protein

MATPAAPRTISFADNNDNQPNQQQRGRGRNPKPRPAPNNTVSWYTGLTQHGKNPLAFPPGQGVPLNANSTTAQNAGYWRRQDRKINTGNGVKQLAPRWFFYYTGTGPEANLPFRSVKDGIVWVYEEGATDAPSVFGTRNPANDAAIVCQFAPGTLIPKNFHIEGTGGNSQSSSRASSNSRNSSRSSSRGGRSTSNSRGTSPVSHGVGSAESLAALPLLLDLQKRLADLESGKSKQPKVVTKKDAAAAKNKMRHKRVATKGFNVTQAFGLRGPGPLQGNFGDMNYNKFGTEDPRWPQMAELAPSASAFMSMSQFKLTHQSNDDKGDPIYFLSYSGAIKLDPKNPNYKKWLELLESNIDAYKTFPKKERKPKTTEDGAVASSSASQMEDVDAKPQRKPKSRVAGSITMRSGSLPALQDVTFDSEA

Function

Packages the positive strand viral genome RNA into a helical ribonucleocapsid (RNP) and plays a fundamental role during virion assembly through its interactions with the viral genome and membrane protein M. Plays an important role in enhancing the efficiency of subgenomic viral RNA transcription as well as viral replication.

Subunit

Homooligomer. Both monomeric and oligomeric forms interact with RNA. Interacts with protein M. Interacts with NSP3; this interaction serves to tether the genome to the newly translated replicase-transcriptase complex at a very early stage of infection.

Similarity

Belongs to the betacoronavirus nucleocapsid protein family.

Keywords

ADP-ribosylation   Host Golgi apparatus   Phosphoprotein   Reference proteome   Ribonucleoprotein   RNA-binding   Transcription   Transcription regulation   Viral nucleoprotein   Virion  

Feature

chain  Nucleoprotein

Uniprot

A3EXB9   A3EXB0   A3EXA1   S4X257   S4WWP0   A3EXC8   + More
S4WYB6   A0A0U1WJZ8   Q0Q4E6   A0A166ZLV5   S4X263   S4WWP9   S4WYC1   S4X3Y6   S4WZN8   S4X261   A3EXF5   A3EXE6   A3EXG4   A0A0U1WHM3   S4WYC3   S4WZN4   S4WWP5   A3EXD7   S4X266   S4X3Y9   A0A5H2WWA6   A0A2I4R8R8   A0A2R4KP87   A0A023YAJ4   A0A023VZL1   A0A2I4R8R7   A0A023VZM0   W8NMH3   A0A2I6PIW9   A0A2I6PIX4   A0A0A7E7L7   A0A1W5LGI3   A0A4D6YRV1   A0A2U7NPB3   A0A0U4BQZ8   T2BBB8   A0A291I639   A0A411PBZ9   A0A3B8G589   A0A2I2MQH9   A0A2D0Y915   A0A0U2GQM3   A0A1W5LGQ6   A0A0U2GM98   A0A0U2GLA1   K0BVN3   R9UM87   A0A1W5LGD9   A0A0U2GPN9   A0A2P1ITA1   A0A2P1ITF9   A0A2D0YK04   A0A291I6B9   A0A3Q8H0X1   A0A384WU26   A0A3S7R2K5   M4SRY6   A0A2P1IT71   A0A023NFV4   A0A0U2GQX0   A0A1L2E1A8   A0A1L2E1A3   T2B9H8   A0A385AK00   T2BBK0   V9TXP8   W5ZZP8   A0A0D3MU51   A0A291I699   A0A0G2UKT0   A0A5C0PZ97   A0A2U9QWF8   A0A345F115   A0A141LLD8   A0A2D0YJ81   A0A2I2MQE7   A0A1W5LGR3   A0A2H4KGI5   A0A0U2GMX8   A0A2I2MQD0   A0A075Q125   A0A1W6ASV5   A0A2D0YJM1   A0A140HF81   A0A455M9P5   A0A384YDE9   A0A384YDN6   A0A1L2E001   A0A2I2MQF0   W5ZZV0   A0A384YDT9   A0A0A7KVQ1   A0A140AZ32   A0A0G3KE78  

Pubmed

17121802    23720729    16840328    26847648    24960574    24781747    + More
24856660    29258555    26981708    29239118    28634355    24055451    29116217    26678874    27486688    23170002    23782859    24857749    24549846    24896817    26584223    26632876    26272558    26272560    26814649    27999424    26839489    26933050    31022948    29507189    30570714    24874668    24964193    25148113    25989145    25075761    24786258    25323704    30644840    26981770    30294617    24050621    25031349    28377531    27125484    30482895    30753126   

EMBL

EF065507    ABN10864.1    EF065506    ABN10855.1    EF065505    KC522062    + More
KC522063    KC522064    KC522065    KC522066    KC522067    KC522068    KC522069    KC522072    KC522073    KC522074    AGP04888.1    AGP04889.1    AGP04890.1    AGP04891.1    AGP04892.1    AGP04893.1    AGP04894.1    AGP04895.1    AGP04898.1    AGP04899.1    AGP04900.1    KC522071    AGP04897.1    EF065508    ABN10873.1    KC522070    AGP04896.1    KJ473822    AIA62359.1    DQ648794    KU182965    ANA96046.1    KC522114    KC522115    AGP04910.1    AGP04911.1    KC522116    AGP04912.1    KC522105    KC522118    AGP04901.1    AGP04914.1    KC522112    AGP04908.1    KC522113    AGP04909.1    KC522106    KC522107    KC522109    AGP04902.1    AGP04903.1    AGP04905.1    EF065511    ABN10900.1    EF065510    ABN10891.1    EF065512    ABN10909.1    KJ473820    AIA62350.1    KC522110    AGP04906.1    KC522108    AGP04904.1    KC522111    AGP04907.1    EF065509    KC522119    AGP04915.1    KC522117    AGP04913.1    LC469308    BBJ36015.1    KX442565    ASL68960.1    MG021451    AVV62533.1    KJ473821    AHY61344.1    KJ713298    AHY22561.1    KX442564    ASL68949.1    KJ713299    AHY22571.1    KJ477102    AHL18098.1    MG596802    AUM60021.1    MG596803    AUM60031.1    KP209310    KY581696    AIY60565.1    ASU45836.1    KX154690    MG011345    ANF29235.1    ATG84741.1    MH259485    QCI31476.1    KY706245    KY706246    KY706247    ASJ26617.1    ASJ26625.1    ASJ26633.1    KT806047    ALW82676.1    KF600613    AGV08397.1    MG011342    ATG84708.1    MK462253    QBF80572.1    MH822886    MK462247    MK462248    MK462249    MK462250    MK462252    MK462254    MK462255    MK462256    MK483839    AYM48038.1    QBF80506.1    QBF80517.1    QBF80528.1    QBF80539.1    QBF80561.1    QBF80583.1    QBF80594.1    QBF80605.1    QBF80618.1    KY688121    AQZ41350.1    MF598642    ASU90457.1    KT368869    KT368879    ALA49843.1    ALA49953.1    KX154685    KX154686    KX154687    KX154689    KX154691    KX154692    KX154693    MG011344    MG011346    MG011358    MG757604    MH310909    ANF29180.1    ANF29191.1    ANF29202.1    ANF29224.1    ANF29246.1    ANF29257.1    ANF29268.1    ATG84730.1    ATG84752.1    ATG84884.1    AXN73521.1    AXN92234.1    KT368827    KT368829    KT368830    KT368831    KT368832    KT368852    KT368856    KT368857    KT368866    KT368867    KT368887    KT368890    KT806055    KU710264    KU710265    ALA49381.1    ALA49403.1    ALA49414.1    ALA49425.1    ALA49436.1    ALA49656.1    ALA49700.1    ALA49711.1    ALA49810.1    ALA49821.1    ALA50041.1    ALA50074.1    ALW82760.1    AMQ49000.1    AMQ49011.1    KT368828    KT368843    KT368844    KT368845    ALA49392.1    ALA49557.1    ALA49568.1    ALA49579.1    JX869059    AFS88943.1    KF186564    KF186566    KF186567    KF186565    KF192507    KF600612    KF600620    KF600621    KF600627    KF600628    KF600634    KF600635    KF600636    KF600639    KF600643    KF600644    KF600645    KF600647    KF600651    KF600652    KF961222    KF917527    KF958702    KJ156866    KJ156881    KJ156934    KJ156944    KJ156949    KJ156952    KJ156871    KJ156906    KJ156883    KJ156902    KJ156953    KJ156927    KJ556336    KJ713297    KM015348    KM210277    KM210278    KT006149    KT026453    KT026455    KT029139    KT036372    KT036373    KT036374    KT225476    KT275306    KT275307    KT275308    KT275309    KT275310    KT326819    KT368824    KT368825    KT368833    KT368834    KT368835    KT368836    KT368837    KT368838    KT368839    KT368840    KT368841    KT368842    KT368846    KT368848    KT368858    KT368859    KT368860    KT368861    KT368862    KT368863    KT368864    KT368865    KT368868    KT368870    KT368872    KT368873    KT368874    KT368876    KT368877    KT368878    KT368888    KT368889    KT374050    KT374051    KT374052    KT374053    KT374054    KT374055    KT374056    KT374057    KT868865    KT868866    KT868867    KT868868    KT868869    KT868870    KT868871    KT868872    KT868873    KT868874    KT868875    KT868876    KT003529    KT751244    KT806044    KT806045    KT806046    KT806048    KT806049    KT806051    KT806052    KT806053    KT806054    KU308549    KU851863    KX034093    KX034094    KX034095    KX034096    KX034097    KX034098    KX034099    KX034100    KX154694    KX108944    KX108945    KX108946    KY688118    KY688119    KY688120    KY688122    KY688123    KY688124    MF598594    MF598595    MF598596    MF598597    MF598598    MF598599    MF598600    MF598601    MF598602    MF598603    MF598604    MF598605    MF598606    MF598607    MF598608    MF598609    MF598610    MF598611    MF598612    MF598613    MF598614    MF598615    MF598616    MF598617    MF598618    MF598620    MF598622    MF598623    MF598624    MF598625    MF598626    MF598627    MF598629    MF598630    MF598631    MF598632    MF598633    MF598634    MF598640    MF598641    MF598644    MF598645    MF598646    MF598648    MF598649    MF598650    MF598651    MF598652    MF598653    MF598654    MF598655    MF598656    MF598658    MF598659    MF598660    MF598661    MF598662    MF598663    MF598664    MF598665    MF598666    MF598668    MF598670    MF598671    MF598673    MF598675    MF598676    MF598677    MF598678    MF598680    MF598682    MF598683    MF598684    MF598685    MF598686    MF598687    MF598688    MF598689    MF598690    MF598691    MF598692    MF598693    MF598694    MF598695    MF598696    MF598698    MF598699    MF598700    MF598701    MF598702    MF598703    MF598704    MF598705    MF598706    MF598707    MF598708    MF598709    MF598710    MF598711    MF598712    MF598713    MF598714    MF598715    MF598716    MF598717    MF598718    MF598719    MF598720    MF598721    MF598722    MG011340    MG011354    MG011356    MG757601    MK280984    MK796425    AGN70936.1    AGN70958.1    AGN70970.1    AGN70980.1    AGN72646.1    AGV08386.1    AGV08415.1    AGV08418.1    AGV08451.1    AGV08462.1    AGV08499.1    AGV08502.1    AGV08512.1    AGV08517.1    AGV08531.1    AGV08542.1    AGV08553.1    AGV08565.1    AGV08580.1    AGV08591.1    AHC74105.1    AHE78101.1    AHE78112.1    AHI48524.1    AHI48557.1    AHI48579.1    AHI48590.1    AHI48601.1    AHI48612.1    AHI48638.1    AHI48641.1    AHI48806.1    AHI48808.1    AHI48812.1    AHI48838.1    AHN10819.1    AHY22551.1    AID50425.1    AJD81447.1    AJD81458.1    AKJ80144.1    AKK52589.1    AKK52609.1    AKL59408.1    AKL80600.1    AKL80611.1    AKL80621.1    AKO73399.1    AKQ21062.1    AKQ21071.1    AKQ21080.1    AKQ21081.1    AKQ21082.1    AKS48069.1    ALA49348.1    ALA49359.1    ALA49447.1    ALA49458.1    ALA49469.1    ALA49480.1    ALA49491.1    ALA49502.1    ALA49513.1    ALA49524.1    ALA49535.1    ALA49546.1    ALA49590.1    ALA49612.1    ALA49722.1    ALA49733.1    ALA49744.1    ALA49755.1    ALA49766.1    ALA49777.1    ALA49788.1    ALA49799.1    ALA49832.1    ALA49854.1    ALA49876.1    ALA49887.1    ALA49898.1    ALA49920.1    ALA49931.1    ALA49942.1    ALA50052.1    ALA50063.1    ALB08253.1    ALB08264.1    ALB08274.1    ALB08285.1    ALB08296.1    ALB08307.1    ALB08318.1    ALB08329.1    ALK80199.1    ALK80209.1    ALK80219.1    ALK80229.1    ALK80239.1    ALK80248.1    ALK80258.1    ALK80268.1    ALK80278.1    ALK80288.1    ALK80298.1    ALK80308.1    ALM26399.1    ALR69648.1    ALW82643.1    ALW82654.1    ALW82665.1    ALW82687.1    ALW82698.1    ALW82716.1    ALW82727.1    ALW82738.1    ALW82749.1    AML60277.1    AMQ49066.1    ANC28641.1    ANC28652.1    ANC28663.1    ANC28674.1    ANC28685.1    ANC28696.1    ANC28707.1    ANC28718.1    ANF29279.1    ANI69907.1    ANI69918.1    ANI69929.1    AQZ41318.1    AQZ41328.1    AQZ41339.1    AQZ41361.1    AQZ41372.1    AQZ41383.1    ASU89928.1    ASU89940.1    ASU89951.1    ASU89962.1    ASU89973.1    ASU89984.1    ASU89995.1    ASU90006.1    ASU90017.1    ASU90028.1    ASU90039.1    ASU90050.1    ASU90061.1    ASU90072.1    ASU90083.1    ASU90094.1    ASU90105.1    ASU90116.1    ASU90127.1    ASU90138.1    ASU90149.1    ASU90160.1    ASU90171.1    ASU90182.1    ASU90193.1    ASU90215.1    ASU90237.1    ASU90248.1    ASU90259.1    ASU90270.1    ASU90281.1    ASU90292.1    ASU90314.1    ASU90325.1    ASU90336.1    ASU90347.1    ASU90358.1    ASU90369.1    ASU90435.1    ASU90446.1    ASU90479.1    ASU90490.1    ASU90501.1    ASU90523.1    ASU90534.1    ASU90545.1    ASU90556.1    ASU90567.1    ASU90578.1    ASU90589.1    ASU90600.1    ASU90611.1    ASU90633.1    ASU90644.1    ASU90655.1    ASU90666.1    ASU90677.1    ASU90688.1    ASU90699.1    ASU90710.1    ASU90721.1    ASU90743.1    ASU90765.1    ASU90776.1    ASU90798.1    ASU90820.1    ASU90831.1    ASU90842.1    ASU90853.1    ASU90875.1    ASU90897.1    ASU90908.1    ASU90919.1    ASU90930.1    ASU90941.1    ASU90952.1    ASU90963.1    ASU90973.1    ASU90984.1    ASU90995.1    ASU91006.1    ASU91017.1    ASU91028.1    ASU91039.1    ASU91050.1    ASU91072.1    ASU91083.1    ASU91094.1    ASU91105.1    ASU91116.1    ASU91127.1    ASU91138.1    ASU91149.1    ASU91160.1    ASU91171.1    ASU91182.1    ASU91193.1    ASU91204.1    ASU91215.1    ASU91226.1    ASU91237.1    ASU91248.1    ASU91258.1    ASU91269.1    ASU91280.1    ASU91291.1    ASU91301.1    ASU91311.1    ASU91321.1    ASU91331.1    ATG84686.1    ATG84840.1    ATG84862.1    AXN73488.1    AZU90738.1    QCQ29082.1    KX154684    MG011341    MG011343    MG011347    MG011352    MG011353    MG011355    MG011359    MG011360    MG011361    MG011362    MG366880    MG366881    MG366882    MG366883    MG912595    MG912596    MG912597    MG912598    MG912599    MG912602    MG912603    MG912604    MG912606    MG912607    MG912608    MG912609    MG366483    MG757605    MH310910    MH310911    MK462243    MK462244    MK462245    MK462246    MK462251    ANF29169.1    ATG84697.1    ATG84719.1    ATG84763.1    ATG84818.1    ATG84829.1    ATG84851.1    ATG84895.1    ATG84906.1    ATG84917.1    ATG84928.1    ATY74388.1    ATY74399.1    ATY74410.1    ATY74421.1    AVK87325.1    AVK87336.1    AVK87347.1    AVK87358.1    AVK87369.1    AVK87402.1    AVK87413.1    AVK87424.1    AVK87446.1    AVK87457.1    AVK87468.1    AVK87476.1    AXN73366.1    AXN73532.1    AXN92245.1    AXN92256.1    QBF80462.1    QBF80473.1    QBF80484.1    QBF80495.1    QBF80550.1    KT368847    ALA49601.1    MG923473    AVN89370.1    MG923474    MG923475    MG923476    MG923477    MG923478    MG923479    MG923480    MG923481    AVN89381.1    AVN89392.1    AVN89403.1    AVN89414.1    AVN89425.1    AVN89436.1    AVN89447.1    AVN89458.1    MF598657    ASU90622.1    MG011351    ATG84807.1    MH734114    MH734115    AXP07352.1    AXP07362.1    MF741826    MF741828    MF741831    ASY99807.1    ASY99827.1    ASY99860.1    MG757597    AXN73444.1    KC776174    KJ614529    AGH58724.1    AHY21476.1    MG923469    MG923470    MG923471    AVN89330.1    AVN89340.1    AVN89350.1    KJ650295    KJ650296    KJ650297    KT156561    AHX00718.1    AHX00728.1    AHX00738.1    AKM76246.1    KT368875    ALA49909.1    KX108941    ANI69874.1    KX108938    KX108939    KX108940    KX108942    ANI69842.1    ANI69853.1    ANI69864.1    ANI69885.1    KF600630    KF745068    KJ156874    KJ156910    KJ156861    KJ156913    KJ156932    KJ156876    KJ156901    KF811035    KP209306    KP209307    KP209308    KP209309    KP209311    KP209312    KP209313    KJ361500    KJ361502    KJ361503    KP719927    KP719928    KP719929    KP719930    KP719931    KP719932    KP719933    KT156560    KU242423    KU242424    KT861627    KX108937    KY673145    KY581686    KY581687    KY581688    KY581689    KY581690    KY581691    KY581692    KY581694    KY581695    KY581697    KY581698    KY581699    KY581700    MF598619    MF598621    MF598638    MF598669    MF598674    MF598679    AGV08474.1    AHB33333.1    AHI48546.1    AHI48568.1    AHI48635.1    AHI48644.1    AHI48649.1    AHI48679.1    AHI48689.1    AHZ90567.1    AIY60525.1    AIY60535.1    AIY60545.1    AIY60555.1    AIY60575.1    AIY60585.1    AIY60595.1    AIZ74424.1    AIZ74446.1    AIZ74457.1    AJG44065.1    AJG44076.1    AJG44087.1    AJG44098.1    AJG44109.1    AJG44120.1    AJG44131.1    AKM76236.1    ALT66877.1    ALT66887.1    ALX27239.1    ANI69831.1    AQZ41281.1    ASU45726.1    ASU45737.1    ASU45748.1    ASU45759.1    ASU45770.1    ASU45781.1    ASU45792.1    ASU45814.1    ASU45825.1    ASU45847.1    ASU45858.1    ASU45869.1    ASU45880.1    ASU90204.1    ASU90226.1    ASU90413.1    ASU90754.1    ASU90809.1    ASU90864.1    MH310912    AXN92267.1    KF600632    KJ156872    KJ156939    KJ156909    KJ650098    KJ713295    KJ713296    KJ782550    KJ829365    KM027255    KM027256    KM027258    KM027259    KM027260    KM027261    KP223131    KP769415    KT368826    KT368849    KT368850    KT368851    KT368853    KT368854    KT368855    KT877350    KT877351    KT861628    KY581693    MK052676    MK039552    MK039553    MH259486    AGV08487.1    AHI48659.1    AHI48718.1    AHI48810.1    AHX71953.1    AHY22531.1    AHY22541.1    AHZ20791.1    AHZ64064.1    AIL23919.1    AIL23930.1    AIL23952.1    AIL23963.1    AIL23974.1    AIL23985.1    AIZ48767.1    AKL80590.1    ALA49370.1    ALA49623.1    ALA49634.1    ALA49645.1    ALA49667.1    ALA49678.1    ALA49689.1    ALL26403.1    ALL26416.1    ALX27250.1    ASU45803.1    AYP10305.1    AYV64556.1    AYV64567.1    QCI31487.1    KF961221    AHC74095.1    KJ156916    KJ156942    KJ156917    KJ156865    AHI48623.1    AHI48633.1    AHI48647.1    AHI48819.1    KJ361501    AIZ74430.1    MG011348    MG011349    MG011350    ATG84774.1    ATG84785.1    ATG84796.1    KR011263    KR011264    KR011265    KR011266    AKI29262.1    AKI29272.1    AKI29282.1    AKI29291.1    MN365232    MN365233    QEJ82222.1    QEJ82233.1    MH454272    MH371127    MH395139    AWU59328.1    AXG21650.1    AXG21661.1    MH432120    AXG21672.1    KU233362    KU233363    KU233364    KU851860    KU851861    KU851862    KU851864    MF741837    MF741825    MF741827    MF741829    MF741830    MF741832    MF741833    MF741834    MF741835    MF741836    MG520075    MG520076    MG757593    MG757594    MG757595    MG757596    MG757598    MG757599    MG757600    MG757602    MG757603    MG546330    MG546331    MH029552    ALT66809.1    ALT66820.1    ALT66831.1    AMQ49033.1    AMQ49044.1    AMQ49055.1    AMQ49077.1    ASY99785.1    ASY99796.1    ASY99816.1    ASY99838.1    ASY99849.1    ASY99869.1    ASY99880.1    ASY99891.1    ASY99902.1    ASY99913.1    AXN73377.1    AXN73388.1    AXN73400.1    AXN73411.1    AXN73422.1    AXN73433.1    AXN73455.1    AXN73466.1    AXN73477.1    AXN73499.1    AXN73510.1    AYO86706.1    MF598637    MF598643    MF598697    ASU90402.1    ASU90468.1    ASU91061.1    KY673149    AQZ41303.1    KX154688    ANF29213.1    KY673143    KY581684    KY581685    AQZ41279.1    ASU45703.1    ASU45715.1    KT368871    KT368880    KT368881    KT368882    KT368883    KT368884    KT368885    KT368886    KU851859    ALA49865.1    ALA49964.1    ALA49975.1    ALA49986.1    ALA49997.1    ALA50008.1    ALA50019.1    ALA50030.1    AMQ49022.1    KY673144    AQZ41280.1    KC869678    AIG13103.1    KX574227    ARJ34233.1    MF598635    MF598636    MF598639    MF598647    MF598667    MF598672    MF598681    ASU90380.1    ASU90391.1    ASU90424.1    ASU90512.1    ASU90732.1    ASU90787.1    ASU90886.1    KU740200    MG923466    MG923467    MK357908    MK357909    AMO03408.1    AVN89298.1    AVN89309.1    QAT98899.1    QAT98910.1    MK129253    AZK15907.1    MG912601    AVK87391.1    MG912605    AVK87435.1    KX108943    ANI69896.1    KY673148    KY688115    KY688116    KY688117    AQZ41292.1    AQZ41307.1    AQZ41308.1    AQZ41309.1    KJ156862    AHI48804.1    MG912600    AVK87380.1    KP236093    AIZ48770.1    KT868877    ALK80318.1    KT026454    KT026456    MG011357    AKK52599.1    AKK52619.1    ATG84873.1   

Proteomes

UP000110642    UP000163538    UP000006574    UP000123539    UP000104899    UP000007449    + More
UP000107989    UP000143769    UP000164987    UP000100668    UP000148908    UP000007451    UP000124656    UP000127946    UP000105499    UP000166519    UP000130850    UP000151795    UP000134122    UP000110836    UP000120697    UP000112550    UP000117213    UP000124793    UP000129301    UP000134703    UP000139687    UP000142730    UP000155319    UP000157238    UP000159414    UP000159793    UP000161712    UP000172503    UP000098431    UP000126955    UP000128936    UP000151733    UP000112279    UP000095864    UP000096281    UP000096875    UP000097149    UP000098933    UP000101567    UP000103178    UP000104220    UP000105272    UP000105311    UP000106595    UP000108564    UP000108647    UP000109122    UP000109494    UP000109666    UP000112022    UP000112306    UP000113235    UP000113724    UP000114746    UP000114773    UP000115322    UP000115754    UP000117251    UP000118563    UP000118772    UP000119183    UP000119223    UP000119765    UP000120438    UP000122049    UP000122810    UP000123963    UP000125629    UP000126763    UP000127508    UP000128076    UP000128186    UP000128651    UP000129370    UP000129433    UP000130711    UP000131256    UP000135014    UP000135646    UP000138672    UP000139500    UP000140430    UP000140498    UP000140611    UP000142239    UP000143877    UP000144056    UP000144449    UP000144472    UP000144909    UP000145271    UP000145741    UP000146591    UP000146604    UP000147342    UP000147538    UP000148657    UP000148810    UP000149043    UP000149108    UP000149341    UP000149520    UP000151455    UP000151999    UP000154518    UP000155291    UP000156767    UP000157492    UP000158466    UP000158935    UP000159306    UP000159930    UP000160534    UP000162302    UP000163035    UP000167218    UP000168352    UP000170921    UP000171389    UP000171516    UP000171892    UP000172734    UP000173175    UP000174558    UP000180347    UP000128896    UP000108469    UP000180345    UP000110818    UP000117128    UP000124558    UP000157628    UP000140819    UP000096629    UP000099376    UP000101873    UP000102018    UP000110817    UP000112171    UP000115369    UP000118636    UP000120625    UP000131416    UP000136957    UP000142709    UP000143263    UP000144516    UP000152218    UP000159028    UP000161450    UP000165701    UP000166654    UP000167295    UP000167954    UP000170030    UP000174176    UP000174530    UP000100765    UP000104003    UP000104075    UP000112676    UP000116785    UP000124216    UP000136645    UP000137287    UP000144709    UP000148100    UP000153269    UP000153346    UP000156579    UP000159190    UP000161565    UP000171868    UP000173448    UP000175153    UP000180346    UP000109767    UP000169572    UP000102098    UP000110604    UP000120083    UP000165587    UP000102966    UP000104540    UP000113143    UP000121965    UP000125198    UP000152659    UP000163895    UP000174054    UP000145931    UP000202992    UP000128184    UP000180348   

PRIDE

A3EXD7   

Pfam

PF00937   Corona_nucleoca

Interpro

IPR037195   Nucleocapsid_N
IPR037179   Nucleocapsid_C
IPR001218   Corona_nucleocap

SUPFAM

SSF103068   SSF103068
SSF110304   SSF110304

ProteinModelPortal

A3EXB9   A3EXB0   A3EXA1   S4X257   S4WWP0   A3EXC8   + More
S4WYB6   A0A0U1WJZ8   Q0Q4E6   A0A166ZLV5   S4X263   S4WWP9   S4WYC1   S4X3Y6   S4WZN8   S4X261   A3EXF5   A3EXE6   A3EXG4   A0A0U1WHM3   S4WYC3   S4WZN4   S4WWP5   A3EXD7   S4X266   S4X3Y9   A0A5H2WWA6   A0A2I4R8R8   A0A2R4KP87   A0A023YAJ4   A0A023VZL1   A0A2I4R8R7   A0A023VZM0   W8NMH3   A0A2I6PIW9   A0A2I6PIX4   A0A0A7E7L7   A0A1W5LGI3   A0A4D6YRV1   A0A2U7NPB3   A0A0U4BQZ8   T2BBB8   A0A291I639   A0A411PBZ9   A0A3B8G589   A0A2I2MQH9   A0A2D0Y915   A0A0U2GQM3   A0A1W5LGQ6   A0A0U2GM98   A0A0U2GLA1   K0BVN3   R9UM87   A0A1W5LGD9   A0A0U2GPN9   A0A2P1ITA1   A0A2P1ITF9   A0A2D0YK04   A0A291I6B9   A0A3Q8H0X1   A0A384WU26   A0A3S7R2K5   M4SRY6   A0A2P1IT71   A0A023NFV4   A0A0U2GQX0   A0A1L2E1A8   A0A1L2E1A3   T2B9H8   A0A385AK00   T2BBK0   V9TXP8   W5ZZP8   A0A0D3MU51   A0A291I699   A0A0G2UKT0   A0A5C0PZ97   A0A2U9QWF8   A0A345F115   A0A141LLD8   A0A2D0YJ81   A0A2I2MQE7   A0A1W5LGR3   A0A2H4KGI5   A0A0U2GMX8   A0A2I2MQD0   A0A075Q125   A0A1W6ASV5   A0A2D0YJM1   A0A140HF81   A0A455M9P5   A0A384YDE9   A0A384YDN6   A0A1L2E001   A0A2I2MQF0   W5ZZV0   A0A384YDT9   A0A0A7KVQ1   A0A140AZ32   A0A0G3KE78  

PDB

4UD1     E-value=4.14722e-64,     Score=621