CoVDB Coronavirus Database Go to the lastest version >>
Strain
CHINA_BAT_2006_NC_009021 (Region: China: Guangdong province;  Strain: Bat coronavirus HKU9-1, complete genome.;  Date: 2006)
Gene
membrane glycoprotein
Description
Annotated in NCBI,  membrane glycoprotein
GenBank Accession
Full name
Membrane protein      
Alternative Name
E1 glycoprotein
Matrix glycoprotein
Membrane glycoprotein
 

Sequence

CDS
ATGTCTAATAATTGTACTAACACTGTGCCTCGTCCTGAGGTTATAGCTGCTTTAAAAGACTGGAACTTTGCAGTTTCAGTCATATTGTTGTTTATAACCGTGCTATTGCAGTGGGGTTATCCTTCTCGTTGTAAACCCATATGGGTTATCAAGATGTTTATACTTTGGTTACTATGGCCGTTGTCCATAGCGGCCGCTGTTTTTGCAGCTATACACCCAATCAATTCAGTTGCTTTTGGTTTTGCTATAGCTTTTGCCTGTATTTCAGGCATTATGTGGTTGAGCTATTTTATTAGCTCATTCCGCCTACTCTGTAGGACAGGCTCAGCCTGGTCTTTTATGCCAGAAACTGATATGCTTATTAACATACCCCTTTTAGGGCGTACTGTAACTAGGCCTATCATTTCAGACTCACCTGCTGTTCAATTTTTGATTATCAGAGGTGAGCTTAGGTTTGATGGTTTCACCCTAGGTCGTTGTGACCCGGGTGATATGCCTGACATTGTTACTATTGCTAGACCTAATGCATTGCACTGGTATAAGCGAGCACTTACTCGCAATATGTATACTCGTTCAGCTATCCTTGTTTATATTAAATACAAGGTTGGCAACCACCGTGTGCAGAATACCACAGAGGATGGTGATAGGTTAGCAATGTTTGTAGCTTAA
Protein
MSNNCTNTVPRPEVIAALKDWNFAVSVILLFITVLLQWGYPSRCKPIWVIKMFILWLLWPLSIAAAVFAAIHPINSVAFGFAIAFACISGIMWLSYFISSFRLLCRTGSAWSFMPETDMLINIPLLGRTVTRPIISDSPAVQFLIIRGELRFDGFTLGRCDPGDMPDIVTIARPNALHWYKRALTRNMYTRSAILVYIKYKVGNHRVQNTTEDGDRLAMFVA

Summary

Function
Component of the viral envelope that plays a central role in virus morphogenesis and assembly via its interactions with other viral proteins.
Subunit
Homomultimer. Interacts with envelope E protein in the budding compartment of the host cell, which is located between endoplasmic reticulum and the Golgi complex. Forms a complex with HE and S proteins. Interacts with nucleocapsid N protein. This interaction probably participates in RNA packaging into the virus.
Miscellaneous
Bat coronavirus HKU3 is highly similar to SARS-CoV (SARS-like).
Similarity
Belongs to the betacoronaviruses M protein family.
Keywords
Glycoprotein   Host Golgi apparatus   Host membrane   Host-virus interaction   Membrane   Reference proteome   Transmembrane   Transmembrane helix   Viral envelope protein   Viral immunoevasion   Viral matrix protein   Virion  
Feature
chain  Membrane protein
EMBL
EF065513    HQ728483    ADX59477.1    MG693170    AWV67058.1    HM211100    + More
ADM33577.1    HM211098    ADM33561.1    EF065515    ABN10930.1    EF065516    ABN10938.1    MG762674    AVP25409.1    HM211101    ADM33585.1    EF065514    ABN10922.1    HM211099    ADM33569.1    MK211379    QDF43842.1    MN187553    QEI22724.1    MK492263    QEH60466.1    KU762337    AOG30815.1    KU762338    AOG30825.1    AB543561    BAI67742.1    HQ728482    ADX59469.1    MG693168    MG693172    AWV67042.1    AWV67074.1    MG693171    AWV67066.1    MG693169    AWV67050.1    MG596803    AUM60030.1    MG596802    AUM60020.1    KC545383    AGX27806.1    KC545386    AGX27817.1    MK679660    QCC20720.1    MF741827    ASY99815.1    KU233362    KU233363    KU233364    MF741837    MF741825    MF741829    MF741830    MF741833    MF741834    MF741835    MF741836    ALT66808.1    ALT66819.1    ALT66830.1    ASY99784.1    ASY99795.1    ASY99837.1    ASY99848.1    ASY99879.1    ASY99890.1    ASY99901.1    ASY99912.1    KJ156944    AHI48589.1    MG923472    AVN89358.1    MN365233    QEJ82232.1    KT006149    KT026453    KT026454    KT026455    KT026456    KT029139    KT036372    KT036373    KT036374    KT275306    KT275307    KT275308    KT326819    KT368826    KT368833    KT368834    KT368835    KT368836    KT368837    KT368838    KT368839    KT368840    KT368841    KT368842    KT368846    KT368847    KT368848    KT368858    KT368859    KT368860    KT368861    KT368862    KT368863    KT368864    KT368865    KT368868    KT368869    KT368870    KT368871    KT368872    KT368873    KT368874    KT368876    KT368877    KT368878    KT368879    KT368888    KT368889    KT374050    KT374051    KT374052    KT374053    KT374054    KT374055    KT374056    KT374057    KT225476    KT868865    KT868866    KT868867    KT868868    KT868869    KT868870    KT868871    KT868872    KT868873    KT868874    KT868875    KT868876    KT868877    KT003528    KT806044    KT806045    KT806046    KT806047    KT806048    KT806049    KT806051    KT806053    KT806054    KU308549    KU851860    KU851861    KU851862    KU851863    KU851864    KX034093    KX034094    KX034095    KX034096    KX034097    KX034098    KX034099    KX034100    KX154684    KX154694    KX108945    KX108946    KY688118    KY688120    KY688121    KY688122    KY688123    KY688124    MF598594    MF598595    MF598597    MF598602    MF598603    MF598604    MF598606    MF598607    MF598608    MF598611    MF598612    MF598613    MF598616    MF598617    MF598618    MF598633    MF598637    MF598641    MF598644    MF598646    MF598649    MF598651    MF598652    MF598657    MF598658    MF598661    MF598662    MF598664    MF598666    MF598668    MF598670    MF598677    MF598680    MF598682    MF598684    MF598685    MF598686    MF598688    MF598691    MF598692    MF598693    MF598694    MF598696    MF598712    MF741826    MF741828    MF741831    MF741832    MG011340    MG011341    MG011343    MG011347    MG011352    MG011353    MG011354    MG011355    MG011359    MG011360    MG011361    MG011362    MG366881    MG366882    MG366883    MG912595    MG912596    MG912597    MG912598    MG912599    MG912600    MG912601    MG912602    MG912603    MG912604    MG912605    MG912606    MG912609    MH306207    MH454272    MH371127    MH395139    MG366483    MG520075    MG520076    MG757593    MG757594    MG757595    MG757596    MG757597    MG757598    MG757599    MG757600    MG757601    MG757602    MG757603    MG757604    MG757605    MH310910    MH310911    MH310912    MG470650    MG546330    MG546331    MH822886    MH029552    MK280984    MK462243    MK462244    MK462245    MK462246    MK462247    MK462248    MK462249    MK462250    MK462251    MK462252    MK462253    MK462254    MK462255    MK462256    MK483839    MK796425    MN120513    MN120514    MN365232    AKJ80143.1    AKK52588.1    AKK52598.1    AKK52608.1    AKK52618.1    AKL59407.1    AKL80599.1    AKL80610.1    AKL80620.1    AKQ21061.1    AKQ21070.1    AKQ21079.1    AKS48068.1    ALA49369.1    ALA49446.1    ALA49457.1    ALA49468.1    ALA49479.1    ALA49490.1    ALA49501.1    ALA49512.1    ALA49523.1    ALA49534.1    ALA49545.1    ALA49589.1    ALA49600.1    ALA49611.1    ALA49721.1    ALA49732.1    ALA49743.1    ALA49754.1    ALA49765.1    ALA49776.1    ALA49787.1    ALA49798.1    ALA49831.1    ALA49842.1    ALA49853.1    ALA49864.1    ALA49875.1    ALA49886.1    ALA49897.1    ALA49919.1    ALA49930.1    ALA49941.1    ALA49952.1    ALA50051.1    ALA50062.1    ALB08252.1    ALB08263.1    ALB08273.1    ALB08284.1    ALB08295.1    ALB08306.1    ALB08317.1    ALB08328.1    ALD51910.1    ALK80198.1    ALK80208.1    ALK80218.1    ALK80228.1    ALK80238.1    ALK80247.1    ALK80257.1    ALK80267.1    ALK80277.1    ALK80287.1    ALK80297.1    ALK80307.1    ALK80317.1    ALM26398.1    ALW82642.1    ALW82653.1    ALW82664.1    ALW82675.1    ALW82686.1    ALW82697.1    ALW82715.1    ALW82737.1    ALW82748.1    AML60276.1    AMQ49032.1    AMQ49043.1    AMQ49054.1    AMQ49065.1    AMQ49076.1    ANC28640.1    ANC28651.1    ANC28662.1    ANC28673.1    ANC28684.1    ANC28695.1    ANC28706.1    ANC28717.1    ANF29168.1    ANF29278.1    ANI69917.1    ANI69928.1    AQZ41317.1    AQZ41338.1    AQZ41349.1    AQZ41360.1    AQZ41371.1    AQZ41382.1    ASU89927.1    ASU89939.1    ASU89961.1    ASU90016.1    ASU90027.1    ASU90038.1    ASU90060.1    ASU90071.1    ASU90082.1    ASU90115.1    ASU90126.1    ASU90137.1    ASU90170.1    ASU90181.1    ASU90192.1    ASU90357.1    ASU90401.1    ASU90445.1    ASU90478.1    ASU90500.1    ASU90533.1    ASU90555.1    ASU90566.1    ASU90621.1    ASU90632.1    ASU90665.1    ASU90676.1    ASU90698.1    ASU90720.1    ASU90742.1    ASU90764.1    ASU90841.1    ASU90874.1    ASU90896.1    ASU90918.1    ASU90929.1    ASU90940.1    ASU90962.1    ASU90994.1    ASU91005.1    ASU91016.1    ASU91027.1    ASU91049.1    ASU91225.1    ASY99806.1    ASY99826.1    ASY99859.1    ASY99868.1    ATG84685.1    ATG84696.1    ATG84718.1    ATG84762.1    ATG84817.1    ATG84828.1    ATG84839.1    ATG84850.1    ATG84894.1    ATG84905.1    ATG84916.1    ATG84927.1    ATY74398.1    ATY74409.1    ATY74420.1    AVK87324.1    AVK87335.1    AVK87346.1    AVK87357.1    AVK87368.1    AVK87379.1    AVK87390.1    AVK87401.1    AVK87412.1    AVK87423.1    AVK87434.1    AVK87445.1    AVK87475.1    AWM99588.1    AWU59327.1    AXG21649.1    AXG21660.1    AXN73365.1    AXN73376.1    AXN73387.1    AXN73399.1    AXN73410.1    AXN73421.1    AXN73432.1    AXN73443.1    AXN73454.1    AXN73465.1    AXN73476.1    AXN73487.1    AXN73498.1    AXN73509.1    AXN73520.1    AXN73531.1    AXN92244.1    AXN92255.1    AXN92266.1    AYA73288.1    AYM48037.1    AYO86705.1    AZU90737.1    QBF80461.1    QBF80472.1    QBF80483.1    QBF80494.1    QBF80505.1    QBF80516.1    QBF80527.1    QBF80538.1    QBF80549.1    QBF80560.1    QBF80571.1    QBF80582.1    QBF80593.1    QBF80604.1    QBF80617.1    QCQ29081.1    QDP16201.1    QDP16212.1    QEJ82221.1    MG923475    MG923476    MG923477    MG923478    MG923479    MG923480    MG923481    AVN89391.1    AVN89402.1    AVN89413.1    AVN89424.1    AVN89435.1    AVN89446.1    AVN89457.1    MF598620    MF598628    MF598645    MF598676    ASU90214.1    ASU90301.1    ASU90489.1    ASU90830.1    KF600613    KF600628    KF961221    KF961222    KF917527    KF958702    KJ156869    KJ156881    KJ156934    KJ156949    KJ156952    KJ156916    KJ156942    KJ156873    KJ156905    KJ156911    KJ156865    KJ156907    KJ156927    KJ556336    KJ650098    KJ713295    KJ713296    KJ713297    KJ713298    KJ813439    KJ829365    KM027255    KM027256    KM027258    KM027259    KM027260    KM027261    KM027262    KP223131    KR011263    KR011264    KR011265    KR011266    KT121572    KT121573    KT121574    KT121575    KT121576    KT121577    KT121578    KT121579    KT121580    KT121581    KT368824    KT368825    KT368827    KT368828    KT368829    KT368830    KT368832    KT368843    KT368844    KT368845    KT368849    KT368850    KT368851    KT368852    KT368853    KT368854    KT368855    KT368856    KT368857    KT368866    KT368867    KT368887    KT368890    KT877350    KT877351    KT751244    KT806055    KT861628    KU710264    KU710265    KX108944    KY688119    KY706245    KY706246    KY706247    KY581693    MF598596    MF598598    MF598599    MF598600    MF598601    MF598605    MF598609    MF598610    MF598614    MF598615    MF598621    MF598622    MF598623    MF598624    MF598625    MF598626    MF598627    MF598629    MF598630    MF598632    MF598634    MF598638    MF598640    MF598643    MF598650    MF598653    MF598654    MF598655    MF598656    MF598659    MF598660    MF598665    MF598671    MF598673    MF598674    MF598675    MF598678    MF598683    MF598687    MF598689    MF598690    MF598699    MF598700    MF598701    MF598702    MF598703    MF598704    MF598705    MF598706    MF598707    MF598708    MF598709    MF598710    MF598711    MF598713    MF598714    MF598715    MF598716    MF598717    MF598718    MF598719    MF598720    MF598721    MF598722    MG923470    MG923471    MH013216    MK052676    MK039552    MK039553    MH259485    MH259486    AGV08396.1    AGV08461.1    AHC74094.1    AHC74104.1    AHE78100.1    AHE78111.1    AHI48534.1    AHI48556.1    AHI48578.1    AHI48600.1    AHI48611.1    AHI48622.1    AHI48632.1    AHI48668.1    AHI48698.1    AHI48708.1    AHI48818.1    AHI48824.1    AHI48837.1    AHN10818.1    AHX71952.1    AHY22530.1    AHY22540.1    AHY22550.1    AHY22560.1    AHZ58507.1    AHZ64063.1    AIL23918.1    AIL23929.1    AIL23951.1    AIL23962.1    AIL23973.1    AIL23984.1    AIL23995.1    AIZ48766.1    AKI29261.1    AKI29271.1    AKI29281.1    AKI29290.1    AKN24755.1    AKN24764.1    AKN24773.1    AKN24782.1    AKN24791.1    AKN24800.1    AKN24809.1    AKN24818.1    AKN24827.1    AKN24836.1    ALA49347.1    ALA49358.1    ALA49380.1    ALA49391.1    ALA49402.1    ALA49413.1    ALA49435.1    ALA49556.1    ALA49567.1    ALA49578.1    ALA49622.1    ALA49633.1    ALA49644.1    ALA49655.1    ALA49666.1    ALA49677.1    ALA49688.1    ALA49699.1    ALA49710.1    ALA49809.1    ALA49820.1    ALA50040.1    ALA50073.1    ALL26402.1    ALL26415.1    ALR69647.1    ALW82759.1    ALX27249.1    AMQ48999.1    AMQ49010.1    ANI69906.1    AQZ41327.1    ASJ26616.1    ASJ26624.1    ASJ26632.1    ASU45802.1    ASU89950.1    ASU89972.1    ASU89983.1    ASU89994.1    ASU90005.1    ASU90049.1    ASU90093.1    ASU90104.1    ASU90148.1    ASU90159.1    ASU90225.1    ASU90236.1    ASU90247.1    ASU90258.1    ASU90269.1    ASU90280.1    ASU90291.1    ASU90313.1    ASU90324.1    ASU90346.1    ASU90368.1    ASU90412.1    ASU90434.1    ASU90467.1    ASU90544.1    ASU90577.1    ASU90588.1    ASU90599.1    ASU90610.1    ASU90643.1    ASU90654.1    ASU90709.1    ASU90775.1    ASU90797.1    ASU90808.1    ASU90819.1    ASU90852.1    ASU90907.1    ASU90951.1    ASU90972.1    ASU90983.1    ASU91082.1    ASU91093.1    ASU91104.1    ASU91115.1    ASU91126.1    ASU91137.1    ASU91148.1    ASU91159.1    ASU91170.1    ASU91181.1    ASU91192.1    ASU91203.1    ASU91214.1    ASU91236.1    ASU91247.1    ASU91257.1    ASU91268.1    ASU91279.1    ASU91290.1    ASU91300.1    ASU91310.1    ASU91320.1    ASU91330.1    AVN89339.1    AVN89349.1    AVV61906.1    AYP10304.1    AYV64555.1    AYV64566.1    QCI31475.1    QCI31486.1    KJ361502    AIZ74445.1    KJ156874    KJ156910    KJ156901    AHI48545.1    AHI48567.1    AHI48688.1    KC667074    AGG22548.1    JX869059    AFS88942.1    KF186564    KF186566    KF186567    KF186565    KF192507    KF600612    KF600620    KF600623    KF600627    KF600630    KF600632    KF600634    KF600635    KF600636    KF600643    KF600644    KF600645    KF600647    KF600651    KF745068    KJ156866    KJ156872    KJ156876    KJ156939    KJ477102    KJ650295    KJ650296    KJ650297    KJ713299    KM015348    KP209306    KP209307    KP209308    KP209309    KP209310    KP209311    KP209312    KP209313    KJ361499    KJ361500    KJ361501    KJ361503    KM210277    KM210278    KP719927    KP719928    KP719929    KP719930    KP719933    KT156560    KU242423    KU242424    KU740200    KX108937    KY673148    KY673149    KY581684    KY581685    KY581686    KY581688    KY581689    KY581690    KY581691    KY581692    KY581694    KY581695    KY581696    KY581697    KY581698    KY581699    KY581700    MF598619    MF598635    MF598636    MF598639    MF598647    MF598648    MF598663    MF598667    MF598669    MF598672    MF598679    MF598681    MF598695    MF598697    MF598698    MG923465    MG923469    MG923473    MH734114    MH734115    MK357908    MK357909    MK564474    MK564475    AGN70935.1    AGN70957.1    AGN70968.1    AGN70979.1    AGN72645.1    AGV08385.1    AGV08414.1    AGV08432.1    AGV08450.1    AGV08473.1    AGV08486.1    AGV08498.1    AGV08501.1    AGV08511.1    AGV08530.1    AGV08541.1    AGV08552.1    AGV08564.1    AGV08579.1    AHB33332.1    AHI48523.1    AHI48658.1    AHI48678.1    AHI48717.1    AHL18097.1    AHX00717.1    AHX00727.1    AHX00737.1    AHY22570.1    AID50424.1    AIY60524.1    AIY60534.1    AIY60544.1    AIY60554.1    AIY60564.1    AIY60574.1    AIY60584.1    AIY60594.1    AIZ74409.1    AIZ74431.1    AIZ74455.1    AJD81446.1    AJD81457.1    AJG44064.1    AJG44075.1    AJG44086.1    AJG44097.1    AJG44130.1    AKM76235.1    ALT66875.1    ALT66886.1    AMO03407.1    ANI69830.1    AQZ41291.1    AQZ41302.1    ASU45702.1    ASU45714.1    ASU45725.1    ASU45747.1    ASU45758.1    ASU45769.1    ASU45780.1    ASU45791.1    ASU45813.1    ASU45824.1    ASU45835.1    ASU45846.1    ASU45857.1    ASU45868.1    ASU45879.1    ASU90203.1    ASU90379.1    ASU90390.1    ASU90423.1    ASU90511.1    ASU90522.1    ASU90687.1    ASU90731.1    ASU90753.1    ASU90786.1    ASU90863.1    ASU90885.1    ASU91038.1    ASU91060.1    ASU91071.1    AVN89286.1    AVN89329.1    AVN89369.1    AXP07351.1    AXP07361.1    QAT98902.1    QAT98913.1    QBM11742.1    QBM11754.1    KC164505    MF598631    ASU90335.1    KT156561    AKM76245.1    KX442565    ASL68959.1    MG923474    AVN89380.1    KX154686    KX154687    KX154689    KX154690    KX154691    KX154692    KX154693    MG011342    MG011345    MG011348    MG011349    MG011350    MG011351    MG011356    MG011357    MG011358    MH310909    ANF29190.1    ANF29201.1    ANF29223.1    ANF29234.1    ANF29245.1    ANF29256.1    ANF29267.1    ATG84707.1    ATG84740.1    ATG84773.1    ATG84784.1    ATG84795.1    ATG84806.1    ATG84861.1    ATG84872.1    ATG84883.1    AXN92233.1    KT368875    ALA49908.1    MG021451    AVV62532.1    KX574227    ARJ34232.1    KX154685    KX154688    MG011344    MG011346    ANF29179.1    ANF29212.1    ATG84729.1    ATG84751.1    KX108939    KX108940    KX108941    KX108942    ANI69852.1    ANI69863.1    ANI69873.1    ANI69884.1    KM027257    AIL23940.1    KX108938    ANI69841.1    KT806052    ALW82726.1    KP719931    KP719932    KY581687    AJG44108.1    AJG44119.1    ASU45736.1    KX108943    ANI69895.1    KC776174    KJ614529    AGH58718.1    AHY21475.1    MG923466    MG923467    MG923468    AVN89297.1    AVN89308.1    AVN89319.1    MG366880    MG912607    MG912608    MH432120    ATY74387.1    AVK87456.1    AVK87467.1    AXG21671.1    KT368880    KT368881    KT368882    KT368883    KT368884    KT368885    KT368886    ALA49963.1    ALA49974.1    ALA49985.1    ALA49996.1    ALA50007.1    ALA50018.1    ALA50029.1    KF600652    AGV08590.1    KT861627    ALX27238.1    LC469308    BBJ36014.1    KJ473816    AIA62333.1    MK129253    AZK15906.1    AY572038    AAU04668.1    AY686864    AAV49734.1    AY686863    AAV91635.1    AY572035    AAU04653.1    AY572034    AAU04638.1    KF636752    AIL94219.1    GQ153541    ADE34747.1    GQ153544    ADE34782.1    KJ473814    AIA62313.1    GQ153540    ADE34736.1    GQ153545    ADE34793.1    GQ153539    ADE34725.1    GQ153547    ADE34815.1    GQ153546    ADE34804.1    DQ084200    AAZ41343.1    GQ153548    ADE34826.1    DQ084199    AAZ41332.1    DQ022305    KY417142    ATO98112.1    KU851859    AMQ49021.1    AY502927    AAR87549.1    AY390556    AAS00007.1    AH013657    AAS01068.1    AY595412    AAT52332.1    FJ882963    ACQ82729.1    AY864805    AAY60784.1    AY502926    AAR87538.1    AY772062    AAX16197.1    AY864806    AAY60797.1    DQ182595    ABA02271.1    AY502925    AAR87527.1    AY508724    AAR91590.1    KY417147    ATO98173.1    AY714217    AAU81610.1    AY702026    AAU07933.1   
Proteomes
UP000006576    UP000152619    UP000098522    UP000115362    UP000123364    UP000147688    + More
UP000111929    UP000123432    UP000203393    UP000101546    UP000095937    UP000145741    UP000095864    UP000096875    UP000097149    UP000098933    UP000102966    UP000103178    UP000105311    UP000106595    UP000108564    UP000109122    UP000109494    UP000109666    UP000110836    UP000112022    UP000112306    UP000113235    UP000113724    UP000114746    UP000115322    UP000118563    UP000118772    UP000119183    UP000119223    UP000120697    UP000122049    UP000122810    UP000126763    UP000128076    UP000128184    UP000128186    UP000128651    UP000128896    UP000129370    UP000129433    UP000140611    UP000142239    UP000143877    UP000144056    UP000144472    UP000144909    UP000145271    UP000146591    UP000146604    UP000147342    UP000147538    UP000149043    UP000149108    UP000149341    UP000149520    UP000151455    UP000151795    UP000151999    UP000155291    UP000156767    UP000158935    UP000159306    UP000162302    UP000163035    UP000167218    UP000168352    UP000171389    UP000171892    UP000172734    UP000173175    UP000173448    UP000180347    UP000180348    UP000096442    UP000098431    UP000100765    UP000102098    UP000104003    UP000104075    UP000105272    UP000108030    UP000109767    UP000110604    UP000112550    UP000112676    UP000114620    UP000115754    UP000116785    UP000117213    UP000118244    UP000119765    UP000120083    UP000120438    UP000123861    UP000123963    UP000124216    UP000126955    UP000127946    UP000128936    UP000129301    UP000131256    UP000133615    UP000134122    UP000134703    UP000135014    UP000135429    UP000135646    UP000136645    UP000137287    UP000137346    UP000138672    UP000139500    UP000139687    UP000139800    UP000142730    UP000144709    UP000144938    UP000146144    UP000148100    UP000148657    UP000151733    UP000153269    UP000153346    UP000155319    UP000156579    UP000157238    UP000159190    UP000159414    UP000159793    UP000159930    UP000161565    UP000161712    UP000165587    UP000166310    UP000167575    UP000172503    UP000174558    UP000175153    UP000180346    UP000161450    UP000165701    UP000167295    UP000160415    UP000112279    UP000096281    UP000096629    UP000099376    UP000101567    UP000101873    UP000102018    UP000104220    UP000105499    UP000108647    UP000110817    UP000110818    UP000112171    UP000114773    UP000115369    UP000117128    UP000117251    UP000118636    UP000120625    UP000125629    UP000127508    UP000130711    UP000130850    UP000136957    UP000140430    UP000140498    UP000142709    UP000143263    UP000144449    UP000144516    UP000152218    UP000154518    UP000157492    UP000157628    UP000158466    UP000159028    UP000160534    UP000166519    UP000166654    UP000167954    UP000169572    UP000170030    UP000171516    UP000171868    UP000174530    UP000139997    UP000124558    UP000140819    UP000202992    UP000113762    UP000170921    UP000131416    UP000174176    UP000108469    UP000180345    UP000104540    UP000113143    UP000121965    UP000125198    UP000152659    UP000163895    UP000174054    UP000148810    UP000128606    UP000153024    UP000126514    UP000115496    UP000141980    UP000127950    UP000127207    UP000126363    UP000128919    UP000140614    UP000159980    UP000102617    UP000157996    UP000144982    UP000172322    UP000143770    UP000128853    UP000164299    UP000007450    UP000174857    UP000166164    UP000158790    UP000112237    UP000133349    UP000148329    UP000156013    UP000149347    UP000163176    UP000139901    UP000117876    UP000171372   
Pfam
PF01635   Corona_M
Interpro
IPR002574   Corona_M
PDB
6F44     E-value=1.40553,     Score=70

Ontologies

Subcellular Location

From MSLVP
Host nucleus. Host cytoplasm.
From Uniprot
Virion membrane   Largely embedded in the lipid bilayer.   With evidence from 1 publications.
Host Golgi apparatus membrane   Largely embedded in the lipid bilayer.   With evidence from 1 publications.

Topology

Length:
222
Number of predicted TMHs:
3
Exp number of AAs in TMHs:
63.40975
Exp number, first 60 AAs:
30.22364
Total prob of N-in:
0.72735
POSSIBLE N-term signal
sequence
inside
1  -  20
TMhelix
21  -  38
outside
39  -  47
TMhelix
48  -  70
inside
71  -  76
TMhelix
77  -  99
outside
100  -  222
 
 

Population Genetic Test Statistics

Genomic alignment in the CDS region

 
 

Multiple alignment of Orthologues

 
 

Gene Tree

 
 

Orthologous in Strains

Strain Availability Status Gene
CHINA_HS_2019_MN908947    
CHINA_AVIAN_2008_NC_016995    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016991    
CHINA_MURINE_2015_NC_035191    
CANADA_AVIAN_2007_NC_010800    
USA_PIG_2000_NC_038861    
CHINA_AVIAN_2007_NC_011549    
ITALY_PIG_2009_NC_028806    
GERMANY_PIG_2012_LT545990    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016992    
CHINA_BAT_2005_NC_009657    
CANADA_HS_2003_NC_004718    
CHINA_BAT_2014_NC_030886 Protein
YP_009273008.1
CHINA_BAT_2005_NC_018871    
USA_MURINE_2009_NC_012936    
CHINA_RABBIT_2006_NC_017083    
UK_PIG_2000_NC_003436    
ROMANIA_PIG_2015_LT898435    
ROMANIA_PIG_2015_LT898436    
GERMANY_PIG_2015_LT898444    
GERMANY_PIG_2015_LT898414    
GERMANY_PIG_2015_LT898439    
GERMANY_PIG_2015_LT898413    
GERMANY_PIG_2015_LT898412    
GERMANY_PIG_2015_LT898411    
GERMANY_PIG_2015_LT898416    
GERMANY_PIG_2015_LT898443    
GERMANY_PIG_2015_LT898420    
GERMANY_PIG_2015_LT898408    
GERMANY_PIG_2015_LT898423    
GERMANY_PIG_2015_LT898432    
GERMANY_PIG_2015_LT898409    
GERMANY_PIG_2015_LT898425    
GERMANY_PIG_2015_LT898446    
GERMANY_PIG_2014_LT898438    
GERMANY_PIG_2014_LT898440    
GERMANY_PIG_2014_LT900501    
GERMANY_PIG_2014_LT898427    
GERMANY_PIG_2014_LT898415    
GERMANY_PIG_2014_LT898421    
GERMANY_PIG_2014_LT898431    
GERMANY_PIG_2014_LT898410    
GERMANY_PIG_2014_LT900498    
GERMANY_PIG_2014_LT898430    
GERMANY_PIG_1978_LT897799    
GERMANY_PIG_2014_LT898447    
GERMANY_PIG_2014_LT898426    
GERMANY_PIG_2014_LT898417    
GERMANY_PIG_2014_LT900500    
GERMANY_PIG_2014_LT898445    
AUSTRIA_PIG_2015_LT898418    
AUSTRIA_PIG_2015_LT898441    
AUSTRIA_PIG_2015_LT898433    
AUSTRIA_PIG_2015_LT900502    
GERMANY_PIG_2015_LT900499    
BELGIUM_PIG_1980_LT906620    
BELGIUM_PIG_1977_LT905450    
SWITZERLAND_PIG_2003_LT905451    
BELGIUM_PIG_1978_LT906581    
UK_PIG_1987_LT906582    
CHINA_PIG_2009_NC_016990    
CHINA_PIG_2010_NC_039208    
KENYA_BAT_2010_KY073745    
KENYA_BAT_2010_NC_032107    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016994    
EUROPE_MURINE_2004_AY700211    
CHINA_AVIAN_2007_NC_011550    
USA_MURINE_1997_NC_001846    
USA_MURINE_1998_NC_023760    
MID_EAST_HS_2012_NC_019843    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016993    
CHINA_MURINE_2013_NC_032730    
USA_HS_2004_AY585228    
NETHERLAND_HS_2004_NC_005831    
CHINA_HS_2004_NC_006577    
EUROPE_HS_2000_NC_002645    
NETHERLAND_FERRET_2010_NC_030292    
JAPAN_FERRET_2013_LC119077    
USA_FELINE_2005_NC_002306    
CHINA_MURINE_2011_NC_034972    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016996    
ARABIA_CAMEL_2015_NC_028752    
CHINA_AVIAN_2007_NC_011547    
CHINA_BAT_2012_NC_028824    
CHINA_BAT_2013_NC_028814    
CHINA_BAT_2013_NC_028833    
CHINA_BAT_2011_NC_028811    
USA_BOVIN_2001_NC_003045    
CHINA_MURINE_2012_NC_026011    
GERMANY_ERINACEINAE_2012_NC_022643    
GERMANY_ERINACEINAE_2012_NC_039207    
UK_HS_2012_NC_038294    
AMERICA_WHALE_2007_NC_010646    
CHINA_BAT_2013_NC_025217    
UGANDA_BAT_2013_NC_034440    
CHINA_BAT_2006_NC_009021 Protein
YP_001039974.1
CHINA_BAT_2008_NC_010438    
CHINA_BAT_2006_NC_009020    
CHINA_BAT_2006_NC_009019    
CHINA_BAT_2006_NC_009988    
USA_BAT_2006_NC_022103    
BULGARIA_BAT_2008_NC_014470    
CHINA_BAT_2008_NC_010437    
USA_AVIAN_2004_NC_001451    
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:  zhuzl@cqu.edu.cn, mg@cau.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号

In processing...
Login to ASFVdb
Email
Password
Please go to Regist if without an account.
If you have forgotten your password, you can once again Regist an account with a registed or new email.
Change my password
Enter new password
Reenter new password
Regist an account of ASFVdb
It is required that you provide your institutional e-mail address (with edu or org in the domain) as confirmation of your affiliation.
Enter email
Reenter email
First Name
Last Name
Institution
You can directly go to if with an account.
Registraion Success
Your password has been sent to your email.
Please check it and login later.
Welcome to use ASFVdb.