Strain

CHINA_BAT_2008_NC_010438 (Region: China: Hong Kong;  Strain: Bat coronavirus HKU8, complete genome.;  Date: 2008)

Gene

ORF3 protein

Description

Annotated in NCBI,  ORF3 protein

Location

NC_010438(+):25083-25751

GenBank Accession

YP_001718613.1

CDS

ATGTTTGGTGGCCTTTTCACTTATTCTATTGAATCAGTTCGTACTGCAGTAAAGGAACTTGATTTGCCACCTGCTAAAGAGCATGATCTCCTTGAACATGTTGTGCCTGTGGCTCATGCAACTTCTTTTGCTGGTTACCTTCTTACTAGCCTCTTTGTATTGTATTTTGCCTTATTTAAGGCTGTTACAATTAGGGGCAATTATGCATGCTTTATTGCACGCATTTTGCTCATTTTGGTGTATTGTCCACTTATTGCTTATTGTGGCGCTTATTTGGATTCATGCATTATTTTTACTGCATTGCTTGTTAGGTTCTTTTGGACTGGTTATTATGCCTGTCGATATAGAACTTTTCTATTTGTCATCTTGAATGACACTACCTTGGCCTTTGTTAATGGAAAGGCTTGGTATTATTCATCTCAGCCCTATATGGTTTTGCCTGGTGGCGAACATTATGTTCAGCTTGGGCCTCATTTTATACCATTTGTAGGTGCCAAAGAGCTTTATGTTGCTGTTAGGGGCATGAATGATGAAAATCTTGAGCTTGTTCGCTGTGTCGAACTTATTAATGGCTCGTTTTTCTACATCTTCGCAAGAGAACCCGTTGTCGGTGTCGTGAATATGAAATTCACTGAGATACAACTCTACGAAGATGTTAACATTGATTGA

Protein

MFGGLFTYSIESVRTAVKELDLPPAKEHDLLEHVVPVAHATSFAGYLLTSLFVLYFALFKAVTIRGNYACFIARILLILVYCPLIAYCGAYLDSCIIFTALLVRFFWTGYYACRYRTFLFVILNDTTLAFVNGKAWYYSSQPYMVLPGGEHYVQLGPHFIPFVGAKELYVAVRGMNDENLELVRCVELINGSFFYIFAREPVVGVVNMKFTEIQLYEDVNID

Uniprot

B1PHK3   A0A0U1UZ22   A0A0U1WHC3   A0A0U1WHD4   A0A0U1UZB9   F1DB21   + More
F1DB15   A0A482JZU4   F1DAX7   A0A4Y5QL67   A0A0U1WHG6   A0A482K3B3   A0A0U1WHE2   A0A172PC13   L7Y6A8   S5MEE6   A0A1L2KGB1   L7Y697   A0A0U3HQW7   A0A410JAL3   G9JWF4   U3RC20   A0A481XW37   A0A0C5KQX3   A0A0U2UAH2   J7GVA2   A0A481XUS1   A0A1Y0D9J8   A0A0C5B4Z1   A0A0U1VEK2   A0A220T0U2   K4K2S1   A0A221ZTM6   A0A5K1KB86   A0A0U3HJ07   A0A075M1B8   L7WB48   A0A190LBD9   A0A2U9AUR6   D3XNW4   A7LKV1   A0A2Z4N643   A0A411NPI2   A0A411NPJ7   A0A411NPI4   A0A411NPJ6   A0A411NPI0   A0A411NPM5   A0A411NPK7   A0A411NPP2   A0A411NPJ2   A0A411NPK8   A0A411NPM4   A0A411NPI1   H9BHF0   K7WB43   A0A097I537   A0A097I545   M1HA71   A0A068JCX5   A0A2U8UA91   A0A2Z4N646   H9CH10   A0A2U8UA93   A0A5J6SVW6   K4JZ82   A0A2S0RPV0   A0A286R3Q8   G9I1Q7   A0A0K0MK97   A0A411NPJ9   A0A411NPE4   A0A0U3RFS3   A0A220YLL7   K4P7U2   A0A5K1KB61   H9BNP0   A0A160ED84   A0A172PC08   A0A0B5INN1   K4K225   X5CC42   A0A0C5B2S5   A0A0E3TJS0   A0A185QEM7   I3QK01   A0A2Z4N5X0   L0CLW6   A0A4D6P0A2   A0A411NPH4   A0A411NPJ0   A0A411NPC1   A0A411NPK3   A0A411NPC8   A0A411NPJ1   A0A411NPK4   A0A411NPG1   A0A411NPI9   A0A411NPL8   A0A411NPB7  

Pubmed

18420807    27125516    19239771    22561208    31067830    23969052    + More
24292967    25272273    26512689    27178127    29879479    22843324    25694517    22923806    22933277    25125639    26112783    20544234    22966198    23087112    30380612    23166239    23269482    28840816    24818713   

EMBL

EU420139    ACA52172.1    KJ473798    AIA62221.1    KJ473797    AIA62213.1    + More
KJ473799    AIA62228.1    KJ473800    AIA62235.1    HQ728486    ADX59496.1    HQ728485    ADX59489.1    MG916902    MG916903    QBP43269.1    QBP43280.1    HQ728480    ADX59452.1    MK720945    MK720946    QCX35168.1    QCX35179.1    KJ473810    AIA62272.1    MG916901    QBP43257.1    KJ473807    AIA62253.1    KX010467    AND65684.1    KC120789    AGD93111.1    KF384500    AGR51643.1    KY073744    APD51476.1    KC120779    KC120784    KC120787    KC120802    KF476049    KF476057    KF476059    KF761675    KF840540    KF840545    KF840555    KF840556    KP281632    KP281633    KP281634    KT021227    MH107322    MF611904    MF611907    MH726374    MH726375    MN037494    AGD93101.1    AGD93106.1    AGD93109.1    AGD93124.1    AGX01593.1    AGX01601.1    AGX01603.1    AHG97486.1    AIE15951.1    AIE15976.1    AIE16026.1    AIE16031.1    AKA64539.1    AKA64540.1    AKA64541.1    ALM09358.1    AWV57055.1    AWX65675.1    AWX65678.1    QCQ19871.1    QCQ19877.1    QED58402.1    KT388424    ALV66176.1    MK288006    QAR17950.1    JN980697    JQ027024    JQ027025    JQ027029    JQ723733    KM609204    MH708895    AEW22947.1    AFD23296.1    AFD23297.1    AFD23301.1    AFJ54355.1    AJP67403.1    AYL64493.1    KF476058    AGX01602.1    MH580585    QBK46452.1    KM609208    AJP67427.1    KT357514    KT357515    KT357516    KT357518    KT357519    KT357520    ALR34682.1    ALR34683.1    ALR34684.1    ALR34686.1    ALR34687.1    ALR34688.1    JX112709    AFP81690.1    MH580569    MH580583    MH580584    MH580586    MK690502    QBK46436.1    QBK46450.1    QBK46451.1    QBK46453.1    QER78628.1    KY928065    ART84251.1    KP455969    KP455973    AJL35182.1    AJL35186.1    KJ857447    AJD09570.1    KX852323    ASK39729.1    JQ989270    AFU92105.1    MF346935    ASO67378.1    MH726402    QCQ20039.1    KT388422    KT388423    KT388426    KT388427    MK392335    ALV66174.1    ALV66175.1    ALV66178.1    ALV66179.1    QBM00062.1    KJ960178    KJ960179    KR610993    KR610994    AIF73530.1    AKH45339.1    JX910242    JX910243    JX910244    JX910246    KF495661    AGC79131.1    AGC79132.1    AGC79133.1    AGC79134.1    AHA15403.1    KP281620    AKA64527.1    MF522838    AWO81894.1    GU372735    GU372741    MH006960    MH006962    MH006963    ADC67064.1    ADC67070.1    AVU05432.1    AVU05446.1    AVU05453.1    EU031893    ABS72124.1    MF611911    AWX65682.1    MH744226    QBF53895.1    MH744242    QBF53911.1    MH744233    QBF53902.1    MH744240    QBF53909.1    MH744234    QBF53903.1    MH744221    QBF53890.1    MH744227    QBF53896.1    MH744241    QBF53910.1    MH744243    QBF53912.1    MH744250    QBF53919.1    MH744239    QBF53908.1    MH744235    QBF53904.1    JQ027023    JX002697    JX002701    JX188454    JX261936    JX489155    JX878381    KM890289    KP455967    KP455968    KP455970    MH708243    MH061339    MH061341    MH581489    MH580574    MK140811    MK140812    MK140813    MK140814    MH909806    MH909821    MH726385    MH726393    MH726396    MH726397    MH726403    MH726404    MH726405    MH726406    MH726407    MK644605    MK656487    MK656488    MK656495    MK656496    MK656497    MK656498    MK656499    MK656500    MK656501    MK656502    MK656503    AFD23295.1    AFN66550.1    AFN66554.1    AFQ37599.1    AFR54327.1    AFV09315.1    AGA16703.1    AJF94322.1    AJL35180.1    AJL35181.1    AJL35183.1    AXS67926.1    AZL47211.1    AZL47223.1    AZP53859.1    QBK46441.1    QCC26582.1    QCC26589.1    QCC26596.1    QCC26603.1    QCE31484.1    QCF46622.1    QCQ19937.1    QCQ19985.1    QCQ20003.1    QCQ20009.1    QCQ20045.1    QCQ20051.1    QCQ20057.1    QCQ20063.1    QCQ20069.1    QFG01713.1    QFG71750.1    QFG71751.1    QFG71758.1    QFG71759.1    QFG71760.1    QFG71761.1    QFG71762.1    QFG71763.1    QFG71764.1    QFG71765.1    QFG71766.1    JX647847    KT388428    KT388429    KT388432    KT388433    MH726387    AFW98999.1    ALV66180.1    ALV66181.1    ALV66184.1    ALV66185.1    QCQ19949.1    KM048298    AIT56231.1    KM048308    AIT56241.1    KC161196    AGE46012.1    KF840558    AIE16041.1    MF488978    AWM99571.1    MF611912    AWX65683.1    JQ305099    AFE85869.1    MF489759    AWM99572.1    MK644601    QFG01689.1    JQ989266    JQ989267    JQ989269    AFU92071.1    AFU92079.1    AFU92096.1    MF281416    AWA45275.1    MF577027    ASV51732.1    JN547398    AEW24869.1    KM089829    MH748550    MH726386    MH726388    MH726389    MH726390    MH726391    AKE53206.1    AZS18879.1    QCQ19943.1    QCQ19955.1    QCQ19961.1    QCQ19967.1    QCQ19973.1    MH744191    QBF53860.1    MH744190    QBF53859.1    KT388425    ALV66177.1    KY799179    ASL24652.1    JX501330    AFV59252.1    MH726394    QCQ19991.1    JQ039903    AFD50643.1    KU641644    ANB44379.1    KX010470    KX010472    AND65687.1    AND65689.1    KM890281    AJF94315.1    JQ989272    JQ989273    AFU92123.1    AFU92132.1    KJ196348    KX580953    AHW40031.1    AQK38169.1    KP455972    AJL35185.1    KP222524    AKC35351.1    KP281643    KP281644    AKA64550.1    AKA64551.1    JQ664304    AFK09787.1    MF611899    MF611908    MF611909    AWX65670.1    AWX65679.1    AWX65680.1    JX880076    AGA16500.1    MH909815    MH909816    MH909817    MH909818    QCE31493.1    QCE31494.1    QCE31495.1    QCE31496.1    MH744218    QBF53887.1    MH744244    QBF53913.1    MH744162    QBF53831.1    MH744248    QBF53917.1    MH744184    QBF53853.1    MH744245    QBF53914.1    MH744246    QBF53915.1    MH744214    QBF53883.1    MH744181    QBF53850.1    MH744237    QBF53906.1    MH744163    QBF53832.1   

Proteomes

UP000143524    UP000110898    UP000106776    UP000135768    UP000126502    UP000144177    + More
UP000106394    UP000150256    UP000204102    UP000111801    UP000152961    UP000157500    UP000124473    UP000126602    UP000155419    UP000102013    UP000107040    UP000137179    UP000150912    UP000117333    UP000133882    UP000172504    UP000128510    UP000119818    UP000126615    UP000132096    UP000150836    UP000112496    UP000126962    UP000129155   

Pfam

PF03053   Corona_NS3b

Interpro

IPR004293   Coronavirus_Orf3b
IPR006141   Intein_N

ProteinModelPortal

B1PHK3   A0A0U1UZ22   A0A0U1WHC3   A0A0U1WHD4   A0A0U1UZB9   F1DB21   + More
F1DB15   A0A482JZU4   F1DAX7   A0A4Y5QL67   A0A0U1WHG6   A0A482K3B3   A0A0U1WHE2   A0A172PC13   L7Y6A8   S5MEE6   A0A1L2KGB1   L7Y697   A0A0U3HQW7   A0A410JAL3   G9JWF4   U3RC20   A0A481XW37   A0A0C5KQX3   A0A0U2UAH2   J7GVA2   A0A481XUS1   A0A1Y0D9J8   A0A0C5B4Z1   A0A0U1VEK2   A0A220T0U2   K4K2S1   A0A221ZTM6   A0A5K1KB86   A0A0U3HJ07   A0A075M1B8   L7WB48   A0A190LBD9   A0A2U9AUR6   D3XNW4   A7LKV1   A0A2Z4N643   A0A411NPI2   A0A411NPJ7   A0A411NPI4   A0A411NPJ6   A0A411NPI0   A0A411NPM5   A0A411NPK7   A0A411NPP2   A0A411NPJ2   A0A411NPK8   A0A411NPM4   A0A411NPI1   H9BHF0   K7WB43   A0A097I537   A0A097I545   M1HA71   A0A068JCX5   A0A2U8UA91   A0A2Z4N646   H9CH10   A0A2U8UA93   A0A5J6SVW6   K4JZ82   A0A2S0RPV0   A0A286R3Q8   G9I1Q7   A0A0K0MK97   A0A411NPJ9   A0A411NPE4   A0A0U3RFS3   A0A220YLL7   K4P7U2   A0A5K1KB61   H9BNP0   A0A160ED84   A0A172PC08   A0A0B5INN1   K4K225   X5CC42   A0A0C5B2S5   A0A0E3TJS0   A0A185QEM7   I3QK01   A0A2Z4N5X0   L0CLW6   A0A4D6P0A2   A0A411NPH4   A0A411NPJ0   A0A411NPC1   A0A411NPK3   A0A411NPC8   A0A411NPJ1   A0A411NPK4   A0A411NPG1   A0A411NPI9   A0A411NPL8   A0A411NPB7  

PDB

3KE7     E-value=3.18388,     Score=67