Strain

CANADA_AVIAN_2007_NC_010800 (Region: Canada;  Strain: Turkey coronavirus, complete genome.;  Date: 2007)

Gene

3a protein

Description

Annotated in NCBI,  3a protein

Location

NC_010800(+):23988-24161

GenBank Accession

YP_001941167.1

Full name

Non-structural protein 3a      

Alternative Name

Accessory protein 3a

CDS

ATGATTCAAACTCCAACATCTTTTCTAATAGTGTTAATTCTTCTTTGGTTTAAACTTGTGTTAAGTTGTTTTAAAGAGTGTGTTTTAGCGCTTCTTCAATTAATACAAGTTTTACTCCAAATTATTAATAGTAACTTACAGGCTAGACTTCTGCTTTGGCACAGTCTAGACTAA

Protein

MIQTPTSFLIVLILLWFKLVLSCFKECVLALLQLIQVLLQIINSNLQARLLLWHSLD

Keywords

Signal  

Feature

chain  Non-structural protein 3a

Uniprot

B3FHU6   A0A2H4I7L1   A5Z154   D0R6Q7   A0A291B648   C9DSU9   + More
A0A1L7H996   B3TD49   A0A2H4I7I5   Q6DTV1   Q64FZ3   I1YZH8   A0A0D3R3R8   A0A1B0Z546   Q7T832   A0A3G6ITW4   A5Z115   K9N232   A0A2H4I7I8   Q6R4P4   P30239   K9MY24   F4MIR7   A0A142IJR8   E5D068   Q998S4   U5QBA3   Q5XLA3   A0A2K8GJ42   P30240   P30238   A5Z139   A0A4Y5QBH4   A0A0A1FZU5   A0A0E3TI66   A0A1X9Y2Y0   A0A346T2V5   A0A286LPL0   A0A1L4BI82   C1IXZ6   K9LVG7   A0A2Z5D873   Q5I7K1   A0A516UWE7   F6M7B6   A0A516UWA6   A4ZCS1   F4MIQ7   A5Z1A2   Q9J3Q8   A0A1W6AWI5   A0A516UWG9   J7I6Z8   A0A0E4G3S5   G3C795   A0A0N9QTB6   Q9J3R1   A0A3G6IQ96   A0A346M353   A0A2K8GIZ8   A4ZCJ7   A4ZCI9   A0A346PYP4   A0A1B2CWH3   Q9J3P6   A0A140HEW6   A0A2K8GIX8   A0A1P8Z894   Q9J3Q5   Q9J3P9   K9LXC4   A0A0S2ZX27   A0A068LJW4   A0A068LKI2   A0A516UWH3   G3C769   A5Z162   A0A1U9WYF2   J7KFV7   Q9J3Q2   A0A1P8SSN7   A0A2K8GIW8   A0A1P8NTR5   K9LW89   A0A2K8GIT6   K9LVN9   D7SC98   A0A4Y5SXS7   Q0ZB61   U5U9I9   B3TD62   A5Z0Z1   B7SXP9   A4ZCQ5   A0A1B2RX99   A0A1L2FT89   K4FZD9   E5RCX3   A0A1U9WSK8   A0A068LK61  

Pubmed

18468711    20022075    18295413    19625463    28917538    18514348    + More
15722532    26482289    26616599    22421962    22966194    23182435    15183070    16927130    21539870    24613433    30197283    1653486    21909766    25843651    16990149    29337625    29141204    31439703    25843648    27793730    28495648    28923510    28116527    19102764    19219402    21994806    20574643    18045937    11087096    23202499    25712772    26262637    27938680    30126059    26585962    23166232    25636916    27108998    17364511    23171741    19100792   

EMBL

EU095850    GQ427173    GQ427176    ABW81428.1    ACV87242.1    ACV87275.1    + More
KR265090    ART35333.1    EF602452    EF602461    KX302866    ABQ84862.1    ABQ84934.1    APZ73707.1    FN430414    CAZ86700.1    KY933089    KY933090    ATE90968.1    ATE90981.1    GQ427175    ACV87264.1    KX348114    KX364298    APU51839.1    ARB66181.1    EU022525    ABW75126.1    KR265086    ART35302.1    AY646283    AAT70773.1    AY702975    KJ425496    KP343691    KT852992    KR608272    KT736032    KU356856    KX219801    KX236007    KX275391    AAU14249.1    AHX25993.1    AKJ66254.1    AMD40265.1    AMH39306.1    AMK51949.1    ANI21150.1    APV46185.1    APY26799.1    APZ73817.1    JQ088078    AFJ11177.1    KP118894    AJR29314.1    KU361187    ANO81444.1    AY319651    AAP92676.1    MH924835    AZA07515.1    EF602447    HQ848267    KC008600    KP790143    KX721498    KY407558    ABQ84823.1    AEB00707.1    AGK85500.1    AKS25226.1    APW82000.1    AQY61324.1    KC013541    KC119407    AFY11699.1    AFY11708.1    KR265087    ART35310.1    AY514485    AY942751    AY942752    FJ904713    FJ904716    FJ904717    FJ904718    FJ904719    GU386375    KC506155    KF411040    KF696629    KJ425485    KR265092    MF462335    MH779856    MH779857    MH779858    MH779859    MH779860    AAS00081.1    AAX39772.1    AAX39775.1    ADA83468.1    ADA83498.1    ADA83508.1    ADA83518.1    ADA83528.1    ADC79652.1    AGJ98438.1    AGZ89673.1    AHB79524.1    AHX25894.1    ART35350.1    ASU92397.1    AYA44692.1    X60712    JX853709    MH181793    AFY09696.1    QAT77249.1    FJ904715    ADA83487.1    KT946798    MG517474    AMR60481.1    AYD78150.1    GQ504720    ADP06458.1    AJ310640    CAC33180.1    KF377577    KP036502    KP036503    KP036504    KP118880    KP118881    KP118882    KP118883    KP118884    KP118885    KP118887    KP118888    KP118891    KP118892    KP118893    MK032177    MK032179    MK032180    AGY56141.1    AJP16713.1    AJP16722.1    AJP16731.1    AJT47843.1    AJT47852.1    AJT47861.1    AJT47870.1    AJT47879.1    AJT47888.1    AJT47906.1    AJT47915.1    AJT47942.1    AJT47951.1    AJT47960.1    AZA07825.1    AZA07843.1    AZA07851.1    AY761141    AAV28723.1    KU949747    ARI46301.1    X59820    X59819    EF602450    KY799582    ABQ84847.1    AVI69486.1    MK878536    QCX19620.1    KM213963    AIY51829.1    KP662631    KX272465    AKC34142.1    APY20695.1    KY805846    ARS23153.1    MG233398    AXT92416.1    MF462334    ASU92389.1    KY047602    MK581207    MK581208    API80971.1    QDQ69187.1    QDQ69200.1    FJ008695    ACM45230.1    JQ920405    KU900739    KU900740    KU900744    AFP50307.1    ARS22411.1    ARS22421.1    ARS22461.1    MH021175    AXB38895.1    AY846833    AY942750    EF602438    EF602440    EF602442    EF602456    EU418975    EU418976    GQ504721    GU393334    GU393338    KY776700    KY776701    AAW56622.1    AAX39769.1    ABQ84751.1    ABQ84767.1    ABQ84783.1    ABQ84894.1    ACB59363.1    ACB59373.1    ADP06464.2    ADV71771.1    AVI69445.1    AVI69454.1    MK581203    QDQ69135.1    JF732918    AEF98431.1    MK581202    QDQ69122.1    DQ490216    ABF61548.1    FJ904714    ADA83478.1    EF602458    KX219797    ABQ84910.1    APV46149.1    AF206261    GQ504722    GQ504723    AAF67541.1    ADP06480.1    ADP06491.1    KY626044    ARJ35782.1    MK581205    QDQ69161.1    JQ920379    JQ920382    JQ920384    JQ920385    JQ920386    JQ920388    JQ920390    JQ920394    JQ920399    JQ977697    KU900741    AFP50203.1    AFP50215.1    AFP50223.1    AFP50227.1    AFP50231.1    AFP50239.1    AFP50247.1    AFP50263.1    AFP50283.1    AFQ31001.1    ARS22431.1    LN610099    CEK09109.1    GU393333    ADV71759.1    KR231009    ALH21112.1    AF206260    AAF67538.1    MK032178    AZA07834.1    MG913342    AXQ05197.1    KU949741    KU949742    KU949743    KU949744    KU949745    MG738155    ARI46253.1    ARI46261.1    ARI46269.1    ARI46277.1    ARI46285.1    QAA92388.1    DQ490206    EF602441    ABF61474.1    ABQ84775.1    DQ490205    DQ490215    DQ490217    KU556805    ABF61466.1    ABF61540.1    ABF61556.1    APP92730.1    MG021194    AXR85433.1    KX258195    ANY59003.1    AF206265    AAF67553.1    KT886454    AMO03293.1    KU949740    ARI46245.1    KX219793    KX259252    APV46113.1    AQD20711.1    AF206262    AAF67544.1    AF206264    AAF67550.1    JQ920391    JQ920392    JQ920393    JQ920395    AFP50251.1    AFP50255.1    AFP50259.1    AFP50267.1    KR822424    ALQ43516.1    KJ690948    AIE47669.1    KJ690949    AIE47673.1    MK581206    QDQ69174.1    GU393331    ADV71733.1    EF602453    EF602455    KX185056    KX375808    ABQ84870.1    ABQ84886.1    APX44039.1    AQY55831.1    KY407557    AQY61315.1    JX195176    KX247129    KX252777    KX236011    KX302865    KX259251    KX434789    AFQ94223.1    APW85786.1    APY23525.1    APY26835.1    APZ73698.1    AQD20702.1    AQY55876.1    AF206263    AAF67547.1    KX236005    APY26782.1    KU949737    KU949739    MG738154    ARI46221.1    ARI46237.1    QAA92378.1    KX185059    APX44066.1    JQ920389    AFP50243.1    KU949738    ARI46229.1    JQ920398    AFP50279.1    HM245923    JQ920381    JQ920383    JQ920387    JQ920396    JQ920400    JQ920401    JQ920403    JX195175    JX840411    KC136209    KF411041    KF853202    KP036505    KP118889    KM586818    KP790144    KP790145    KP790146    KU317090    KX348115    KX348116    KX348117    KX219792    KX219795    KX219796    KX219798    KX219800    KX247127    KX247128    KX247130    KX185058    KX252773    KX252774    KX252776    KX252781    KX252782    KX252783    KX252784    KX252785    KX252786    KX252788    KX252789    KX252790    KX236000    KX236006    KX236012    KX236013    KX236014    KX236016    KX302860    KX302861    KX302868    KX302869    KX302870    KX302871    KX302872    KX302873    KX302874    KX302875    KX275390    KX275392    KX275393    KX275394    KX259248    KX259249    KX259250    KX259253    KX259254    KX259255    KX259257    KX372249    KX375805    KX375806    KX375807    KX400753    KX425847    KX434788    KX640829    KY620116    KX364290    KX364291    KX364292    KX364293    KX364294    KX364295    KX364297    KU900738    KU900742    KY421672    MF508703    MG197727    MH020185    ADI54946.1    AFP50211.1    AFP50219.1    AFP50235.1    AFP50271.1    AFP50287.1    AFP50291.1    AFP50299.1    AFQ94214.1    AFX59328.1    AGE13892.1    AGZ89682.1    AHI85761.1    AJP16740.1    AJT47924.1    AKN20491.1    AKS25235.1    AKS25244.1    AKS25253.1    ANI87712.1    APU51848.1    APU51857.1    APU51866.1    APV46103.1    APV46131.1    APV46140.1    APV46158.1    APV46176.1    APW85768.1    APW85777.1    APW85795.1    APX44057.1    APY23489.1    APY23498.1    APY23516.1    APY23561.1    APY23570.1    APY23579.1    APY23588.1    APY23597.1    APY23606.1    APY23624.1    APY26711.1    APY26719.1    APY26737.1    APY26790.1    APY26844.1    APY26853.1    APY26862.1    APY26880.1    APZ73653.1    APZ73662.1    APZ73725.1    APZ73734.1    APZ73743.1    APZ73752.1    APZ73761.1    APZ73770.1    APZ73779.1    APZ73788.1    APZ73808.1    APZ73826.1    APZ73835.1    APZ73844.1    AQD20675.1    AQD20684.1    AQD20693.1    AQD20720.1    AQD20729.1    AQD20738.1    AQD20756.1    AQY03960.1    AQY55804.1    AQY55813.1    AQY55822.1    AQY55849.1    AQY55858.1    AQY55867.1    AQY55894.1    AQY61370.1    ARB66109.1    ARB66118.1    ARB66127.1    ARB66136.1    ARB66145.1    ARB66154.1    ARB66172.1    ARS22401.1    ARS22441.1    ATJ01094.1    AWR92746.1    AXX83284.1    AYC44183.1    MK423876    MK423877    QDA76256.1    QDA76265.1    DQ646404    JF330898    MG448607    ABG36780.1    ADY62543.1    AVI69520.1    KF574761    KF663561    KJ128295    KX219794    KX252780    KX252787    KX236002    KX236003    KX236009    KX236010    KX302862    KX302863    KX372250    KX434790    KX364299    KX364300    KY421673    AGZ20161.1    AHB74009.1    AHN49811.1    APV46122.1    APY23552.1    APY23615.1    APY26755.1    APY26764.1    APY26817.1    APY26826.1    APZ73671.1    APZ73680.1    AQY03969.1    AQY55885.1    ARB66190.1    ARB66199.1    ATJ01104.1    EU022526    ABW75139.1    EF602444    FJ807653    HM245924    JF893452    KF663560    ABQ84799.1    ACO37575.1    ADI54956.1    AEJ80239.1    AHB74000.1    EU822338    ACJ50176.1    DQ490214    ABF61532.1    KX668222    AOC59732.1    KX266757    AOC59724.1    JN176213    KU556807    AFK30964.1    APP92756.1    HM371091    JF705860    ADQ57406.1    AEO86769.1    KX389094    AQY55840.1    KJ690950    AIE47677.1   

Proteomes

UP000106026    UP000123786    UP000167574    UP000159366    UP000112634    UP000117980    + More
UP000118234    UP000102195    UP000107304    UP000138732    UP000139325    UP000159001    UP000139891    UP000116981    UP000129860    UP000100089    UP000148786    UP000151129    UP000119449    UP000165290    UP000104663    UP000119721    UP000121579    UP000124016    UP000130162    UP000137477    UP000145806    UP000155805    UP000160278    UP000167075    UP000129334    UP000099500    UP000151624    UP000100522    UP000105210    UP000105510    UP000108163    UP000109170    UP000111271    UP000117109    UP000121165    UP000124537    UP000136129    UP000142905    UP000146859    UP000147307    UP000149934    UP000170218    UP000174764    UP000130326    UP000102335    UP000107038    UP000129978    UP000131863    UP000139706    UP000133571    UP000101527    UP000132955    UP000096390    UP000126934    UP000146844    UP000097758    UP000133437    UP000138261    UP000138275    UP000098934    UP000096908    UP000101166    UP000111823    UP000126099    UP000126761    UP000129345    UP000134521    UP000145502    UP000149511    UP000152683    UP000162160    UP000167873    UP000149090    UP000102415    UP000118698    UP000154272    UP000099410    UP000124698    UP000156427    UP000170434    UP000172963   

Pfam

PF03617   IBV_3A

Interpro

IPR005214   IBV_3A

ProteinModelPortal

B3FHU6   A0A2H4I7L1   A5Z154   D0R6Q7   A0A291B648   C9DSU9   + More
A0A1L7H996   B3TD49   A0A2H4I7I5   Q6DTV1   Q64FZ3   I1YZH8   A0A0D3R3R8   A0A1B0Z546   Q7T832   A0A3G6ITW4   A5Z115   K9N232   A0A2H4I7I8   Q6R4P4   P30239   K9MY24   F4MIR7   A0A142IJR8   E5D068   Q998S4   U5QBA3   Q5XLA3   A0A2K8GJ42   P30240   P30238   A5Z139   A0A4Y5QBH4   A0A0A1FZU5   A0A0E3TI66   A0A1X9Y2Y0   A0A346T2V5   A0A286LPL0   A0A1L4BI82   C1IXZ6   K9LVG7   A0A2Z5D873   Q5I7K1   A0A516UWE7   F6M7B6   A0A516UWA6   A4ZCS1   F4MIQ7   A5Z1A2   Q9J3Q8   A0A1W6AWI5   A0A516UWG9   J7I6Z8   A0A0E4G3S5   G3C795   A0A0N9QTB6   Q9J3R1   A0A3G6IQ96   A0A346M353   A0A2K8GIZ8   A4ZCJ7   A4ZCI9   A0A346PYP4   A0A1B2CWH3   Q9J3P6   A0A140HEW6   A0A2K8GIX8   A0A1P8Z894   Q9J3Q5   Q9J3P9   K9LXC4   A0A0S2ZX27   A0A068LJW4   A0A068LKI2   A0A516UWH3   G3C769   A5Z162   A0A1U9WYF2   J7KFV7   Q9J3Q2   A0A1P8SSN7   A0A2K8GIW8   A0A1P8NTR5   K9LW89   A0A2K8GIT6   K9LVN9   D7SC98   A0A4Y5SXS7   Q0ZB61   U5U9I9   B3TD62   A5Z0Z1   B7SXP9   A4ZCQ5   A0A1B2RX99   A0A1L2FT89   K4FZD9   E5RCX3   A0A1U9WSK8   A0A068LK61  

KEGG

vg:6353554    

From MSLVP

Single-Pass Membrane

Length:

57

Number of predicted TMHs:

1

Exp number of AAs in TMHs:

22.29008

Exp number, first 60 AAs:

22.29008

Total prob of N-in:

0.55073

POSSIBLE N-term signal

sequence

outside

1  -  9

TMhelix

10  -  32

inside

33  -  57