Strain

CANADA_AVIAN_2007_NC_010800 (Region: Canada;  Strain: Turkey coronavirus, complete genome.;  Date: 2007)

Gene

3b protein

Description

Annotated in NCBI,  3b protein

Location

NC_010800(+):24161-24355

GenBank Accession

YP_001941168.1

Full name

Non-structural protein 3b      

Alternative Name

Accessory protein 3b

CDS

ATGTTAGATTTTGAAGCAATTATTGAAACTGGTCAGCAAATAATTCAGCAAATCAGTTTCGATTTACAGCACATTTCAAGTGTGCTAAGCACTGAATTATTTGACCCCTTTGAAGTCTGTGTTTACAGAGGAGGTAATTATTGGGAGTTAGAGTCAGCTGACGAGTTTTCAGGTGATGACGAATTTATTGAGTAA

Protein

MLDFEAIIETGQQIIQQISFDLQHISSVLSTELFDPFEVCVYRGGNYWELESADEFSGDDEFIE

Keywords

Reference proteome  

Feature

chain  Non-structural protein 3b

Uniprot

B3FHU7   O12393   G3C7F9   B3TD50   Q6R4P3   Q9J3P5   + More
B3TD63   A0A2H4I7N3   K9LVI7   Q9J4B5   K9LVP3   G3C796   C1IXZ7   A0A221J5Q0   A5Z100   Q5XLA2   A0A4Y5SYY7   C9DSV0   C7DZG7   A0A0N9Q757   K9LVL2   X2J9I9   G3C770   K9LW64   Q9J3P8   K9LVE3   E5D0A2   A0A4Y5QA43   A0A516UWB5   K9LW93   A0A0M4G386   A0A0S2ZXP5   A0A2Z5D874   E5D091   Q66191   J7I3T2   F4MIQ8   A0A221J5S6   P30242   A0A1X9Y2N0   A0A3G4BBT1   G3C7D4   A0A516UWF8   A0A0E4C328   Q9J3R0   A0A1X9Y2X9   K9LWD8   Q9J3Q7   A4ZCS2   A0A286LPL9   P30244   Q998S3   A5Z0U4   A0A286LPL1   F4MIR8   A4ZCL9   A0A346T2V6   U5QB57   Q9J3Q4   A4ZCJ8   K4G0Z1   Q9J3Q1   A4ZCN5   A0A346PYP5   A4ZCM7   Q0ZB52   A0A2N9QPJ0   A0A516UWJ1   A4ZCJ0   A4ZCQ6   A0A068LK52   B7SXR6   Q0ZB44   A4ZCT0   P30243   A4ZCL1   A0A4Y5SY11   F6M7B7   A0A346M359   A0A516UWE5   A0A1L5YN83   A0A516UWD0   A0A172Q3R5   B7SXN4   C9DST9   Q6DV53   P05138   A0A172Q3S1   Q9J4A8   A0A1W6AWJ1   A0A286LPM7   B7SXQ0   A0A068LR32   Q5MNZ0   Q778S4   Q778R9   Q4ZJU0   P30241   B7SXQ8   A0A023PMQ1  

Pubmed

18468711    20022075    7710354    9168126    16927130    21994806    + More
30197283    18514348    15183070    21539870    24613433    26482289    11087096    28705717    18295413    26191621    16990149    19102764    19219402    21909766    20181858    26262637    28116527    31439703    26585962    2841803    23202499    1653486    30714035    25712772    28495648    18045937    25843651    27938680    30126059    21049275    22542436    25721384    17364511    29337625    19100792    20574643    15722532    17629993    23178317    30526618    3960740    16934878    20652731    28646651    15661153    11711626    16137658    2829563   

EMBL

EU095850    GQ427173    GQ427176    ABW81429.1    ACV87235.1    ACV87274.1    + More
U49858    U46036    AY942751    GU393334    MH779856    MH779857    MH779858    MH779859    MH779860    AAC57075.1    AAX39773.1    ADV71770.1    AYA44693.1    GU393338    ADV71820.1    EU022525    ABW75127.1    AY514485    AY942752    FJ904713    FJ904716    FJ904717    FJ904718    FJ904719    GU386375    GU393332    KC506155    KF411040    KF696629    KJ425485    AAS00082.1    AAX39776.1    ADA83469.1    ADA83499.1    ADA83509.1    ADA83519.1    ADA83529.1    ADC79653.1    ADV71745.1    AGJ98439.1    AGZ89674.1    AHB79525.1    AHX25895.1    AF206265    AAF67554.1    EU022526    ABW75140.1    KR265092    ART35351.1    JQ920379    JQ920382    JQ920384    JQ920385    JQ920386    JQ920394    AFP50204.1    AFP50216.1    AFP50224.1    AFP50228.1    AFP50232.1    AFP50264.1    AF202998    AAF69111.1    JQ920399    AFP50284.1    GU393333    ADV71758.1    FJ008695    ACM45231.1    MF421319    ASM61962.1    EF602445    EF602446    JX195177    JX195178    KP780179    ABQ84808.1    ABQ84816.1    AFQ94233.1    AKV60431.1    AY761141    AY846833    AY942750    EF602440    EF602441    EF602442    EF602456    EU418975    EU418976    GQ504720    GQ504721    KY776700    KY776701    AAV28724.1    AAW56623.1    AAX39770.1    ABQ84768.1    ABQ84776.1    ABQ84784.1    ABQ84895.1    ACB59364.1    ACB59374.1    ADP06457.1    ADP06469.1    AVI69446.1    AVI69455.1    MK423876    MK423877    QDA76257.1    QDA76266.1    GQ427175    ACV87263.1    GQ229232    ACT31315.1    KR231009    ALH21113.1    JQ920389    AFP50244.1    KJ135013    AHN54758.1    GU393331    ADV71732.1    JQ920380    KU900743    AFP50208.1    ARS22452.1    AF206264    AAF67551.1    JQ920391    JQ920392    JQ920393    JQ920395    AFP50252.1    AFP50256.1    AFP50260.1    AFP50268.1    GQ504723    ADP06490.1    MK878536    QCX19621.1    MK581203    QDQ69136.1    JQ920390    KU900741    AFP50248.1    ARS22432.1    KP868573    ALC78749.1    KR822424    ALQ43517.1    MH021175    AXB38896.1    GQ504722    ADP06479.1    M21515    AAA66579.1    JQ920388    JQ977697    AFP50240.1    AFQ31002.1    FJ904714    ADA83479.1    MF421320    ASM61975.1    X59819    KU900739    KU900740    KU900744    ARS22412.1    ARS22422.1    ARS22462.1    MH878976    AYS76107.1    GU393336    GU393337    ADV71795.1    MK581204    QDQ69149.1    LN610099    CEK09110.1    AF206260    AAF67539.1    KY805846    ARS23154.1    JQ920405    AFP50308.1    AF206261    AAF67542.1    DQ490216    ABF61549.1    MF462335    ASU92398.1    X59820    AJ310640    CAC33181.1    EF602438    ABQ84752.1    MF462334    ASU92390.1    FJ904715    ADA83488.1    DQ490209    ABF61496.1    MG233398    AXT92417.1    KF377577    KP036502    KP036503    KP036504    KP118880    KP118881    KP118882    KP118883    KP118884    KP118885    KP118887    KP118888    KP118891    KP118892    KP118893    MK032177    MK032179    MK032180    AGY56142.1    AJP16714.1    AJP16723.1    AJP16732.1    AJT47844.1    AJT47853.1    AJT47862.1    AJT47871.1    AJT47880.1    AJT47889.1    AJT47907.1    AJT47916.1    AJT47943.1    AJT47952.1    AJT47961.1    AZA07826.1    AZA07844.1    AZA07852.1    AF206262    AAF67545.1    DQ490206    ABF61475.1    JN176213    KU556807    AFK30963.1    APP92757.1    AF206263    AAF67548.1    DQ490211    DQ490213    ABF61512.1    ABF61525.1    MG021194    AXR85434.1    DQ490210    DQ490218    DQ490221    JN983807    KF460437    KF931628    ABF61504.1    ABF61565.1    ABF61581.1    AFK30955.1    AIG54285.1    AIG54297.1    DQ646405    ABG36789.1    KU949746    ARI46294.1    MK581206    QDQ69175.1    DQ490205    DQ490215    KU556805    ABF61467.1    ABF61541.1    APP92731.1    DQ490214    ABF61533.1    KJ690947    AIE47667.1    EU822340    ACJ50193.1    DQ646406    ABG36797.1    DQ490217    ABF61557.1    X60712    DQ490208    ABF61488.1    MK937828    MK937832    QDA76293.1    QDA76329.1    JF732918    AEF98432.1    MG913343    AXQ05203.1    MK581205    QDQ69162.1    KU556806    APP92744.1    MK581202    QDQ69123.1    KU253616    KU253617    KU253619    AND76820.1    AND76828.1    AND76844.1    EU822336    ACJ50161.1    GQ427174    ACV87252.1    AY641576    AY702085    EU817497    FJ904720    FJ904721    FJ904723    GQ504724    JF274479    JF828980    KJ425504    KJ435286    MH539771    MH539772    MK728875    MK937830    AAT70075.1    AAU09492.1    ACJ12836.1    ADA83539.1    ADA83549.1    ADA83569.1    ADP06502.1    AEL12223.1    AEP84738.1    AHX26066.1    AHX26174.1    AZP23932.1    AZP23942.1    QCE31535.1    QDA76311.1    X59542    X03723    DQ834384    AY851295    KU253618    AND76836.1    AF203003    EU714028    EU822341    FJ807652    FJ888351    GU393335    JF330899    JF828981    JQ920397    KJ425486    KJ425487    KJ425488    KJ425490    KJ425491    KJ425492    KJ425493    KJ425494    KJ425495    KJ425497    KJ425498    KJ425499    KJ425502    KJ425503    KJ425505    KJ425506    KJ425507    KJ425508    KJ425509    KJ425510    KJ425511    KJ425512    KJ435284    KJ435285    KT203557    KT736031    KY588134    KY588135    KY805845    KY273667    MG763935    MK937829    MK937831    MK937833    AAF69118.1    ACH72796.1    ACJ50201.1    ACO37568.1    ACQ55232.1    ADV71783.1    ADY62554.1    AEP84748.1    AFP50276.1    AHX25904.1    AHX25913.1    AHX25922.1    AHX25940.1    AHX25949.1    AHX25958.1    AHX25967.1    AHX25976.1    AHX25985.1    AHX26003.1    AHX26012.1    AHX26021.1    AHX26048.1    AHX26057.1    AHX26075.1    AHX26084.1    AHX26093.1    AHX26102.1    AHX26111.1    AHX26120.1    AHX26129.1    AHX26138.1    AHX26156.1    AHX26165.1    ALE71333.1    AMK51940.1    ARE67874.1    ARE67886.1    ARS23141.1    ASF20082.1    AVX27614.1    QDA76302.1    QDA76320.1    QDA76338.1    KY626045    MK071267    ARJ35793.1    QCS40642.1    MF673729    ASU92406.1    EU822338    ACJ50177.1    KJ690948    AIE47670.1    AY692454    AAV98210.1    AJ311317    CAC39116.1    AJ311362    CAC39302.1    DQ001338    FJ904722    AAY24425.1    ADA83559.1    M95169    M27435    EU822339    ACJ50185.1    KJ425500    AHX26030.1   

Proteomes

UP000106026    UP000123786    UP000167574    UP000131863    UP000129978    UP000117980    + More
UP000104663    UP000119721    UP000121579    UP000124016    UP000130162    UP000137477    UP000145806    UP000155805    UP000160278    UP000160499    UP000167075    UP000099410    UP000146844    UP000142745    UP000161583    UP000180340    UP000102335    UP000107038    UP000139706    UP000151624    UP000112634    UP000097758    UP000138100    UP000138275    UP000132955    UP000149006    UP000138261    UP000101527    UP000096390    UP000133571    UP000119508    UP000160333    UP000126934    UP000129334    UP000100522    UP000105210    UP000105510    UP000108163    UP000109170    UP000111271    UP000117109    UP000121165    UP000124537    UP000136129    UP000142905    UP000146859    UP000147307    UP000149934    UP000170218    UP000123393    UP000128029    UP000149405    UP000098674    UP000098752    UP000104400    UP000107291    UP000107830    UP000117985    UP000149491    UP000159542    UP000161686    UP000165485    UP000169726    UP000007642    UP000096468    UP000102121    UP000102163    UP000103149    UP000106511    UP000107224    UP000108224    UP000113245    UP000113896    UP000118008    UP000120286    UP000120642    UP000132365    UP000136241    UP000136440    UP000138146    UP000146865    UP000149404    UP000155572    UP000155946    UP000158124    UP000158949    UP000159206    UP000163887    UP000165788    UP000166253    UP000167410    UP000170189    UP000170844    UP000173109    UP000173215    UP000174151    UP000180343    UP000107149    UP000114388    UP000101586    UP000180341    UP000006717    UP000113939   

Pfam

PF03622   IBV_3B

Interpro

IPR005295   IBV_3B

ProteinModelPortal

B3FHU7   O12393   G3C7F9   B3TD50   Q6R4P3   Q9J3P5   + More
B3TD63   A0A2H4I7N3   K9LVI7   Q9J4B5   K9LVP3   G3C796   C1IXZ7   A0A221J5Q0   A5Z100   Q5XLA2   A0A4Y5SYY7   C9DSV0   C7DZG7   A0A0N9Q757   K9LVL2   X2J9I9   G3C770   K9LW64   Q9J3P8   K9LVE3   E5D0A2   A0A4Y5QA43   A0A516UWB5   K9LW93   A0A0M4G386   A0A0S2ZXP5   A0A2Z5D874   E5D091   Q66191   J7I3T2   F4MIQ8   A0A221J5S6   P30242   A0A1X9Y2N0   A0A3G4BBT1   G3C7D4   A0A516UWF8   A0A0E4C328   Q9J3R0   A0A1X9Y2X9   K9LWD8   Q9J3Q7   A4ZCS2   A0A286LPL9   P30244   Q998S3   A5Z0U4   A0A286LPL1   F4MIR8   A4ZCL9   A0A346T2V6   U5QB57   Q9J3Q4   A4ZCJ8   K4G0Z1   Q9J3Q1   A4ZCN5   A0A346PYP5   A4ZCM7   Q0ZB52   A0A2N9QPJ0   A0A516UWJ1   A4ZCJ0   A4ZCQ6   A0A068LK52   B7SXR6   Q0ZB44   A4ZCT0   P30243   A4ZCL1   A0A4Y5SY11   F6M7B7   A0A346M359   A0A516UWE5   A0A1L5YN83   A0A516UWD0   A0A172Q3R5   B7SXN4   C9DST9   Q6DV53   P05138   A0A172Q3S1   Q9J4A8   A0A1W6AWJ1   A0A286LPM7   B7SXQ0   A0A068LR32   Q5MNZ0   Q778S4   Q778R9   Q4ZJU0   P30241   B7SXQ8   A0A023PMQ1  

KEGG

vg:6353552    

From MSLVP

Single-Pass Membrane

Length:

64

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.00023

Exp number, first 60 AAs:

0.00023

Total prob of N-in:

0.13795

outside

1  -  64