Strain

CHINA_AVIAN_2007_NC_016992 (Region: China: Hong Kong;  Strain: Sparrow coronavirus HKU17, complete genome.;  Date: 2007)

Gene

NS7a protein

Description

Annotated in NCBI,  NS7a protein

Location

NC_016992(+):24244-24846

GenBank Accession

YP_009433743.1

CDS

ATGGAGTTCCGCTTAACTCTGCCATCAAGCCCGCTGAAAACCATGGCTATTGGCTGCGTTACACCAGACAAAAGCCAGGTGGTACTCAAATTCCTCCATCCTATGCCTTCTATTATACAGGCACAGGTCCGAGAGGAAATCTTAAGTATGGTGAACTCCCTCCTAATGATACCCAGGCAACCACTCGTGTTACTTGGGTTAAGGGTCCGGGAGCAGACACTTCTATTAAGCCTCATGTTGCCAAACGCAACCCCAACAATCCTAAACATCAGCTGCTACCTCTCCGATTTCCAACCGGAGATGGCCCAGCTCAAGGTTTCAGAGTTGACCCCTTCAACGCTAGAGGAAGACCTCAGGAGCGTGGAAGTGGCCCAAGATCTCAATCTGCTAACCCCAGAGGCACTAACAATCAGCCAAGGAAACGCGACCAGTCCGCACCTGCTGCGGTACGTCGTAAGACCCAACATCAAGCTCCCAAGCGGACTTTGCCCAAGGGCAAAACCATCTCTCAGGTATTTGGCAACCGGTCTCGTACTGGCGCCAATGTCGGCTCTGCAGACACTGAGAAGACGGGTATGGCTGATCCTCGCATCATGGCTCTAG

Protein

MEFRLTLPSSPLKTMAIGCVTPDKSQVVLKFLHPMPSIIQAQVREEILSMVNSLLMIPRQPLVLLGLRVREQTLLLSLMLPNATPTILNISCYLSDFQPEMAQLKVSELTPSTLEEDLRSVEVAQDLNLLTPEALTISQGNATSPHLLRYVVRPNIKLPSGLCPRAKPSLRYLATGLVLAPMSALQTLRRRVWLILASWL

Uniprot

A0A2Z4EVX7   A0A2Z4EVV7   A0A2Z4EVY2   A0A2Z4G623   H9BQY3   X2GCV6   + More
A0A140ESH7   A0A1Z4F689   H9BQZ0   A0A286NGM0   A0A0E3U233   A0A097EU77   A0A0E3Y616   A0A1L3HEF2   A0A075E3P0   A0A075E2S2   A0A140ESB4   A0A1S6KJP9   A6N257   A0A0M4KED6   A0A075E3P3   W8Q9Z3   A0A075E3D9   X2G841   A0A0E3KV22   A0A0K0PUN1   A0A140ES51   A0A166XBL7   A0A218PFD7   A0A0U2NYW8   A0A0E3Y5W4   A0A075X778   X2F2I8   A0A1S6L962   A0A2D0UZ92   A0A0K2D286   A0A2R3ZDM5   A0A291NLH7   A0A222YW18   A0A4P8FB90   A0A2Z5XXV8   A0A2H4NFT5   A0A1Z4F672   A0A2H5CUI4   A0A2H5A4I5   A0A222YV21   A0A346JFE6   A0A220W0L6   A0A2R4STQ4   A0A2Z4G612   A0A141ZUV1   A0A1C9C4J5   A0A1P8VJW2   A0A2H4NFU1   A0A223DMW8   A0A141ZUZ4   A0A145YPD7   A0A1S6K7T2   A0A2H5A4M5   A0A346IMW7   A0A2Z5XXV2   A0A2Z4G5Y5   A0A2Z4G620   H9BQZ7   A0A2Z5XXT4   A0A2Z5XXU7   A0A2Z5XXR0  

Pubmed

29872066    29363281    22278237    25153521    24744332    29621617    + More
28634353    26584185    17459938    26514769    24723704    24964136    25817405    29695146    26337879    25759498    24723718    26250097    29569144    26982324    27424024    28758347    27231358    30758768   

EMBL

MG812377    AWV67130.1    MG812375    MG812376    AWV67114.1    AWV67121.1    + More
MG812378    AWV67139.1    MF642325    AWV96583.1    JQ065042    AFD29192.1    KJ569769    KJ584360    KJ620016    KT381613    AHN16232.1    AIA61012.1    AIA99523.1    ALJ32190.1    KR265849    KR265850    KR265859    KR265864    KR265865    LC260038    LC260041    LC260043    AML40795.1    AML40802.1    AML40865.1    AML40900.1    AML40907.1    BBA66310.1    BBA66331.1    BBA66345.1    LC216915    BAY00735.1    JQ065043    AFD29199.1    MF095123    KY398014    MK211169    MK355396    MK572803    MK330604    ASY98692.1    ATU88978.1    QDF21516.1    QDH76193.1    QDH76199.1    QDP14516.1    KP757891    AKC54440.1    KM820765    AIT11905.1    KP757890    AKC54433.1    KY065120    MH715491    APG38203.1    AYU65239.1    KJ601777    AIB07790.1    KJ601778    AIB07798.1    KR150443    KR265854    KR265855    KR265856    KR265857    LC260044    AML40609.1    AML40830.1    AML40837.1    AML40844.1    AML40851.1    BBA66352.1    KY586147    KY586148    KY586149    AQT03442.1    AQT03444.1    AQT03446.1    EF584908    ABQ39963.1    KT021234    ALD83761.1    KJ601779    AIB07805.1    KJ481931    AHL45012.1    KJ601780    AIB07812.1    KJ462462    KJ584355    KJ584356    KJ584357    KJ584358    KJ584359    KM012168    AHN16225.1    AIA60978.1    AIA60985.1    AIA60992.1    AIA60999.1    AIA61006.1    AIP90491.1    KP981395    KR265851    KR265852    KR265853    KR265858    KR265860    KR265861    KR265862    KR265863    KX022602    KX022603    KX022604    KX022605    KY364365    MG837130    MG837131    MG837132    MG837133    LC260039    LC260040    LC260042    AKA97943.1    AML40809.1    AML40816.1    AML40823.1    AML40858.1    AML40872.1    AML40879.1    AML40886.1    AML40893.1    ANI85830.1    ANI85837.1    ANI85844.1    ANI85851.1    ARJ31779.1    AWG96870.1    AWG96877.1    AWG96883.1    AWG96889.1    BBA66317.1    BBA66324.1    BBA66338.1    KT266822    AKQ63088.1    KR265847    KR265848    AML40781.1    AML40788.1    KU981059    KU981060    KU981061    KU981062    ANA78469.1    LC260045    BAZ95614.1    KT336560    ALS54091.1    KP757892    AKC54447.1    KJ769231    AIH06862.1    KJ567050    AHM88405.1    KY354363    KY354364    AQT34134.1    AQT34140.1    KU665558    MG832584    AML83921.1    AYP31081.1    KR131621    ALA13750.1    MF280390    AVR48524.1    MF948005    ATJ00134.1    MF431742    ASR75144.1    MK005882    MK330605    QCO76968.1    QDP14523.1    LC364346    BBC54866.1    KY363868    ATV90804.1    LC216914    BAY00728.1    MF041982    AUH28255.1    KY513724    AUG59161.1    MF431743    ASR75151.1    MH708123    MH708124    MH708125    AXP32221.1    AXP32228.1    AXP32235.1    KY293677    KY293678    ASK86339.1    ASK86346.1    MG242062    AVZ61087.1    MF642324    AWV96576.1    KU051641    KU051642    KU051643    KU051644    KU051645    KU051646    KU051647    KU051648    KU051649    KU051650    KU051651    KU051653    KU051654    KU051655    KU051656    AMN91626.1    AMN91632.1    AMN91638.1    AMN91644.1    AMN91650.1    AMN91656.1    AMN91662.1    AMN91668.1    AMN91675.1    AMN91681.1    AMN91687.1    AMN91699.1    AMN91705.1    AMN91711.1    AMN91717.1    KX118627    AOM53032.1    KX834351    KX834352    APZ76695.1    APZ76703.1    KY363867    ATV90799.1    KY926512    ASS83091.1    KU051652    AMN91693.1    KU984334    AMW88202.1    KX443143    AQS99158.1    KY513725    AUG59169.1    MH532440    AXP20286.1    LC364345    BBC54857.1    MF642322    AWV96562.1    MF642323    AWV96569.1    JQ065044    AFD29206.1    LC364343    BBC54837.1    LC364344    BBC54847.1    LC364342    BBC54827.1   

Proteomes

UP000103266    UP000122701    UP000156755    UP000174689    UP000118503    UP000118624    + More
UP000136494    UP000154045    UP000162784    UP000103330    UP000169372    UP000114014    UP000172024    UP000160089    UP000129252    UP000116882    UP000120336    UP000130144    UP000131750    UP000150502    UP000120804    UP000104403    UP000102644    UP000172095    UP000118543    UP000124223    UP000147537    UP000149778    UP000152486    UP000152859    UP000161942    UP000115701    UP000117737    UP000132517    UP000137853    UP000144892    UP000147360    UP000158884    UP000161041    UP000171091    UP000100106    UP000097413    UP000148151    UP000170248    UP000180351    UP000180352    UP000163421    UP000156468    UP000139576    UP000126862    UP000151351    UP000108307    UP000141273    UP000112854    UP000135406   

ProteinModelPortal

A0A2Z4EVX7   A0A2Z4EVV7   A0A2Z4EVY2   A0A2Z4G623   H9BQY3   X2GCV6   + More
A0A140ESH7   A0A1Z4F689   H9BQZ0   A0A286NGM0   A0A0E3U233   A0A097EU77   A0A0E3Y616   A0A1L3HEF2   A0A075E3P0   A0A075E2S2   A0A140ESB4   A0A1S6KJP9   A6N257   A0A0M4KED6   A0A075E3P3   W8Q9Z3   A0A075E3D9   X2G841   A0A0E3KV22   A0A0K0PUN1   A0A140ES51   A0A166XBL7   A0A218PFD7   A0A0U2NYW8   A0A0E3Y5W4   A0A075X778   X2F2I8   A0A1S6L962   A0A2D0UZ92   A0A0K2D286   A0A2R3ZDM5   A0A291NLH7   A0A222YW18   A0A4P8FB90   A0A2Z5XXV8   A0A2H4NFT5   A0A1Z4F672   A0A2H5CUI4   A0A2H5A4I5   A0A222YV21   A0A346JFE6   A0A220W0L6   A0A2R4STQ4   A0A2Z4G612   A0A141ZUV1   A0A1C9C4J5   A0A1P8VJW2   A0A2H4NFU1   A0A223DMW8   A0A141ZUZ4   A0A145YPD7   A0A1S6K7T2   A0A2H5A4M5   A0A346IMW7   A0A2Z5XXV2   A0A2Z4G5Y5   A0A2Z4G620   H9BQZ7   A0A2Z5XXT4   A0A2Z5XXU7   A0A2Z5XXR0  

PDB

6J73     E-value=2.71929,     Score=67