Strain

CHINA_AVIAN_2007_NC_016994 (Region: China: Hong Kong;  Strain: Night-heron coronavirus HKU19, complete genome.;  Date: 2007)

Gene

membrane protein

Description

Annotated in NCBI,  membrane protein

Location

NC_016994(+):23310-23960

GenBank Accession

YP_005352865.1

Full name

Membrane protein      

Alternative Name

E1 glycoprotein
Matrix glycoprotein
Membrane glycoprotein

CDS

ATGTCTGACGCTGCAGAGTGGCAACTCATCGTATTTATCATCTTAATCTGGGCCTTAGGCTTCATACTCCAAGGAGGGTATGCAGCAAGACATAAGGTCATTTATGTAATAAAACTAATACTGCTTTGGCTGCTCCAGCCTTTCACACTAGTAGTCACTATCTGGACTGCAGTAGACAATGGAGCCCAACCAAGCAGTGCAGTGTTTATTATTGCTATTATCTTCGCCATACTAACTTTCGTTATATGGCTGAAGTACTGGTATGACTCCATCAGACTTGTAATCAAAACAAAGTCAGGTTGGAGTTTCTCTCCAGAAACTAGACTACTTGTGTGTGCAATTGATGGAATGGGTAATGTCAAATGTGCACCAGTAGATCATTTACCAACAGCTCTCACTCCTGTCCTTGTAATGGGAAGGTTTATGCTAAACGGGCAGCTCCTTATGGCACAACAAACTGTGCAGACAGCTCCTAGAGCTTTGTATGTCATGACACCGAGTCAGACATATCATTTTACTTTGAAGAAAACTTTTCAAGATCCAGACTTCAAAGACACAGCCACATTTTGTTACCTTGTCGACCGCATTTCCAAGGCAGATTTGCAGAGTGTGACAACAGGCAGCAATTACGCACTGTACAAACACCTTTAA

Protein

MSDAAEWQLIVFIILIWALGFILQGGYAARHKVIYVIKLILLWLLQPFTLVVTIWTAVDNGAQPSSAVFIIAIIFAILTFVIWLKYWYDSIRLVIKTKSGWSFSPETRLLVCAIDGMGNVKCAPVDHLPTALTPVLVMGRFMLNGQLLMAQQTVQTAPRALYVMTPSQTYHFTLKKTFQDPDFKDTATFCYLVDRISKADLQSVTTGSNYALYKHL

Function

Component of the viral envelope that plays a central role in virus morphogenesis and assembly via its interactions with other viral proteins.

Subunit

Homomultimer. Interacts with envelope E protein in the budding compartment of the host cell, which is located between endoplasmic reticulum and the Golgi complex. Forms a complex with HE and S proteins. Interacts with nucleocapsid N protein. This interaction probably participates in RNA packaging into the virus.

Similarity

Belongs to the gammacoronaviruses M protein family.
Belongs to the betacoronaviruses M protein family.

Keywords

Glycoprotein   Host Golgi apparatus   Host membrane   Host-virus interaction   Membrane   Transmembrane   Transmembrane helix   Viral envelope protein   Viral immunoevasion   Viral matrix protein   Virion  

Feature

chain  Membrane protein

Uniprot

H9BR19   A0A2U9I694   H9BR27   B6VDY9   A0A2Z5XXU6   A0A145YPB1   + More
A0A140ES76   A0A0U3BGC8   B6VDY0   A0A2Z4EVY0   A0A1C9C4I5   A0A1Z4F680   X2EZT4   A0A075X0D1   A6N254   A0A075E3D6   A0A075E3P1   A0A075E3D0   A0A097EU50   W8R479   A0A075E3L3   H9BQY0   A0A0E3U220   A0A2H4NFS0   A0A286NGL7   A0A1Z4F693   H9BQY7   A0A5J6NBG5   A0A140ESG7   A0A514C923   H9BQZ4   A0A2Z5XXS3   H9BR10   A0A5B8JML2   A0A2Z5XXR4   A0A2Z5XXT2   A0A2Z4G602   A0A2Z4G622   A0A2Z4G609   B6VDX1   A0A4Y6ER58   B6VDW2   A0A2Z4EVV0   A0A2Z4EVU8   A0A346IMW4   H9BR02   F4MIR0   A0A2R4KSQ9   A0A516UWD7   Q91SA2   A0A1Z3FR08   A0A3S7GYH1   Q6W359   A0A1X9Y2Y2   A0A0C5B155   A0A1V0JAZ7   A0A166MX93   A0A346M350   A0A2P1IQA5   C9DST0   C6GHN0   A4ZU79   C6GHP2   A4ZU13   A4ZU68   C6GHQ3   A4ZTY0   B7U2P8   A4ZU46   A4ZTZ1   A4ZU35   Q06BD5   A4ZU57   A4ZU02   Q4U3R5   Q8V433   B7U2S0   B7U2N8   B7U2M7   C6GHL8   B7U2L6   A3FEW1   Q0PL34   Q4U3R7   A3FEW0   Q4U3R0   A0A191URC8   B7U2Q9   P69600   P69599   A4ZU24   A0A346PYP7   Q91A23   G4RJ87   B3VZS6   Q9J3N8   G4RJ86   G4RJ85   A0A0N9QUP2  

Pubmed

22278237    29875375    18971277    27231358    27718337    29872066    + More
27424024    28634353    24723718    25759498    17459938    24723704    24964136    25153521    24744332    26584185    26337879    26514769    26250097    25817405    26982324    28758347    29621617    29695146    29569144    31239538    29363281    30758768    21539870    28495648    29508550    20022075    17344285    17434558    18842722    17459444    16604443    11714968    27274850    9778786    30126059    11087096    26262637   

EMBL

JQ065047    AFD29228.1    MH013338    AWR88317.1    JQ065048    AFD29236.1    + More
FJ376622    ACJ12064.1    LC364345    LC364346    BBC54854.1    BBC54863.1    KU984334    KU870479    KU870480    KU870481    KU870482    AMW88199.1    APC23093.1    APC23094.1    APC23095.1    APC23096.1    KR265851    AML40806.1    KT313678    KT313680    ALT00614.1    ALT00616.1    FJ376621    ACJ12055.1    MG812377    AWV67127.1    KX118627    AOM53029.1    LC216914    BAY00725.1    KJ567050    AHM88402.1    KJ769231    AIH06859.1    EF584908    ABQ39960.1    KJ601779    AIB07802.1    KJ601778    AIB07795.1    KJ601777    AIB07787.1    KM820765    AIT11902.1    KJ481931    AHL45009.1    KJ601780    AIB07809.1    JQ065042    KJ462462    KJ569769    KJ584355    KJ584356    KJ584357    KJ584358    KJ584359    KJ584360    KJ620016    KM012168    KT381613    AFD29189.1    AHN16222.1    AHN16229.1    AIA60975.1    AIA60982.1    AIA60989.1    AIA60996.1    AIA61003.1    AIA61009.1    AIA99520.1    AIP90488.1    ALJ32187.1    KP981395    KP757890    KP757891    KP757892    KT266822    KR131621    KT021234    KT336560    KT313675    KT313676    KT313677    KT313679    KT313681    KT313682    KT313683    KT313684    KT313685    KT313686    KR150443    KR265847    KR265848    KR265849    KR265850    KR265852    KR265853    KR265854    KR265855    KR265856    KR265857    KR265858    KR265859    KR265860    KR265861    KR265862    KR265863    KR265865    KU665558    KU051641    KU051642    KU051643    KU051644    KU051645    KU051646    KU051647    KU051648    KU051649    KU051650    KU051651    KU051652    KU051653    KU051654    KU051655    KU051656    KU517165    KU981059    KU981060    KU981061    KU981062    KX022602    KX022603    KX022604    KX022605    KU870483    KU870484    KY065120    KY129985    KX834351    KX834352    KX443143    KY354363    KY354364    KY364365    KY293677    KY293678    MF431742    MF431743    KY926512    MF948005    KY363868    KY513724    KY513725    MF041982    MF280390    MG242062    MG837130    MG837131    MG837132    MG837133    MH708123    MH708124    MH708125    MG832584    MH715491    LC260045    LC260038    LC260039    LC260040    LC260041    LC260042    LC260043    LC260044    MK005882    MK330605    AKA97940.1    AKC54430.1    AKC54437.1    AKC54444.1    AKQ63085.1    ALA13747.1    ALD83758.1    ALS54088.1    ALT00611.1    ALT00612.1    ALT00613.1    ALT00615.1    ALT00617.1    ALT00618.1    ALT00619.1    ALT00620.1    ALT00621.1    ALT00622.1    AML40606.1    AML40778.1    AML40785.1    AML40792.1    AML40799.1    AML40813.1    AML40820.1    AML40827.1    AML40834.1    AML40841.1    AML40848.1    AML40855.1    AML40862.1    AML40869.1    AML40876.1    AML40883.1    AML40890.1    AML40904.1    AML83918.1    AMN91623.1    AMN91629.1    AMN91635.1    AMN91641.1    AMN91647.1    AMN91653.1    AMN91659.1    AMN91665.1    AMN91672.1    AMN91678.1    AMN91684.1    AMN91690.1    AMN91696.1    AMN91702.1    AMN91708.1    AMN91714.1    ANA78298.1    ANA78445.1    ANI85827.1    ANI85834.1    ANI85841.1    ANI85848.1    APC23097.1    APC23098.1    APG38200.1    APW35736.1    APZ76692.1    APZ76700.1    AQS99155.1    AQT34132.1    AQT34138.1    ARJ31776.1    ASK86336.1    ASK86343.1    ASR75141.1    ASR75152.1    ASS83088.1    ATJ00131.1    ATV90800.1    AUG59158.1    AUG59166.1    AUH28252.1    AVR48521.1    AVZ61084.1    AWG96867.1    AWG96874.1    AWG96880.1    AWG96886.1    AXP32218.1    AXP32225.1    AXP32232.1    AYP31080.1    AYU65234.1    BAZ95611.1    BBA66307.1    BBA66314.1    BBA66321.1    BBA66328.1    BBA66335.1    BBA66342.1    BBA66349.1    QCO76965.1    QDP14520.1    KY363867    ATV90796.1    MF095123    KY398011    MK572803    MK330604    ASY98689.1    ATU88975.1    QDH76196.1    QDP14513.1    LC216915    BAY00732.1    JQ065043    AFD29196.1    MK673766    QEX51275.1    KR265864    AML40897.1    MK355396    QDH76190.1    JQ065044    AFD29203.1    LC364343    BBC54834.1    JQ065046    AFD29219.1    MK204388    QDY92323.1    LC364342    BBC54824.1    LC364344    BBC54844.1    MF642322    AWV96561.1    MF642325    AWV96582.1    MF642323    MF642324    AWV96568.1    AWV96575.1    FJ376620    ACJ12046.1    MK211169    QDF21513.1    FJ376619    ACJ12037.1    MG812375    MG812376    AWV67109.1    AWV67118.1    MG812378    AWV67136.1    MH532440    AXP20283.1    JQ065045    AFD29211.1    FJ904714    ADA83481.1    MF083115    AVV64338.1    MK581202    QDQ69125.1    AF363599    AAK50026.1    KY348417    KY994645    ASC42971.1    AUF40279.1    MG757138    MG757139    MG757140    MG757141    MG757142    AVI15005.1    AVI15016.1    AVI15027.1    AVI15038.1    AVI15049.1    AY316299    FJ415324    AAQ67201.1    ACJ35488.1    KY805846    ARS23156.1    KM985633    AJL33726.1    KX982264    ARD06004.1    KU127229    ANA52020.1    MG913342    AXQ05194.1    MG518518    AVN88327.1    GQ427173    ACV87238.1    FJ938064    ACT11000.1    EF424624    ABP38331.1    FJ938065    ACT11012.1    EF424618    ABP38270.1    EF424623    ABP38325.1    FJ938066    ACT11023.1    EF424615    ABP38238.1    FJ425187    ACJ66984.1    EF424621    ABP38305.1    EF424616    ABP38250.1    EF424620    ABP38285.1    DQ915164    ABI94002.1    EF424622    ABP38308.1    EF424617    ABP38255.1    DQ016129    DQ016130    DQ016131    DQ016132    DQ016134    AAY33933.1    AAY33936.1    AAY33939.1    AAY33942.1    AAY33948.1    AF391542    FJ425189    ACJ67005.1    FJ425186    ACJ66966.1    FJ425185    ACJ66958.1    FJ938063    ACT10988.1    FJ425184    ACJ66952.1    EF371516    ABN49621.1    DQ811784    ABG89282.1    AH014866    AAY33930.1    EF371515    ABN49620.1    AH014871    AH014873    KU886219    AAY33945.1    AAY33951.1    ANJ04979.1    KU558922    KU558923    ANJ04722.1    ANJ04733.1    FJ425188    FJ425190    ACJ66992.1    AF058944    AF058943    EF424619    ABP38278.1    MG021194    AXR85436.1    AF391541    FJ849812    ACZ67634.1    EU826086    ACE95722.1    AF202999    AF206266    AF206267    AF206268    AF206269    AF206270    AF206271    FJ849811    ACZ67633.1    FJ849810    ACZ67632.1    KR231009    ALH21115.1   

Proteomes

UP000132721    UP000167590    UP000103579    UP000112854    UP000171091    UP000011786    + More
UP000126862    UP000139576    UP000104403    UP000129252    UP000160089    UP000114014    UP000102644    UP000172095    UP000103266    UP000118543    UP000122701    UP000124223    UP000147537    UP000149778    UP000152486    UP000152859    UP000156755    UP000161942    UP000174689    UP000097413    UP000100106    UP000108307    UP000115701    UP000116882    UP000117737    UP000118503    UP000120336    UP000120804    UP000130144    UP000131750    UP000132517    UP000136494    UP000137853    UP000141273    UP000144892    UP000147360    UP000148151    UP000150502    UP000151351    UP000154045    UP000156468    UP000158884    UP000161041    UP000162784    UP000163421    UP000169372    UP000170248    UP000172024    UP000180351    UP000180352    UP000103330    UP000118624    UP000135406    UP000162232    UP000116644    UP000161619    UP000142997    UP000133571    UP000158296    UP000123786    UP000136745    UP000147178    UP000139966    UP000173415    UP000163913    UP000162935    UP000121953    UP000158327    UP000136116    UP000127099    UP000170940    UP000154814    UP000139235    UP000151273    UP000008571    UP000133443    UP000140344    UP000104294    UP000172225    UP000174569    UP000147981    UP000102696    UP000148210    UP000134650    UP000008570    UP000097758   

Pfam

PF01635   Corona_M

Interpro

IPR002574   Corona_M
IPR042550   GAMMA_CORONA_M

ProteinModelPortal

H9BR19   A0A2U9I694   H9BR27   B6VDY9   A0A2Z5XXU6   A0A145YPB1   + More
A0A140ES76   A0A0U3BGC8   B6VDY0   A0A2Z4EVY0   A0A1C9C4I5   A0A1Z4F680   X2EZT4   A0A075X0D1   A6N254   A0A075E3D6   A0A075E3P1   A0A075E3D0   A0A097EU50   W8R479   A0A075E3L3   H9BQY0   A0A0E3U220   A0A2H4NFS0   A0A286NGL7   A0A1Z4F693   H9BQY7   A0A5J6NBG5   A0A140ESG7   A0A514C923   H9BQZ4   A0A2Z5XXS3   H9BR10   A0A5B8JML2   A0A2Z5XXR4   A0A2Z5XXT2   A0A2Z4G602   A0A2Z4G622   A0A2Z4G609   B6VDX1   A0A4Y6ER58   B6VDW2   A0A2Z4EVV0   A0A2Z4EVU8   A0A346IMW4   H9BR02   F4MIR0   A0A2R4KSQ9   A0A516UWD7   Q91SA2   A0A1Z3FR08   A0A3S7GYH1   Q6W359   A0A1X9Y2Y2   A0A0C5B155   A0A1V0JAZ7   A0A166MX93   A0A346M350   A0A2P1IQA5   C9DST0   C6GHN0   A4ZU79   C6GHP2   A4ZU13   A4ZU68   C6GHQ3   A4ZTY0   B7U2P8   A4ZU46   A4ZTZ1   A4ZU35   Q06BD5   A4ZU57   A4ZU02   Q4U3R5   Q8V433   B7U2S0   B7U2N8   B7U2M7   C6GHL8   B7U2L6   A3FEW1   Q0PL34   Q4U3R7   A3FEW0   Q4U3R0   A0A191URC8   B7U2Q9   P69600   P69599   A4ZU24   A0A346PYP7   Q91A23   G4RJ87   B3VZS6   Q9J3N8   G4RJ86   G4RJ85   A0A0N9QUP2  

PDB

3CH8     E-value=3.91226,     Score=66