Strain

CHINA_RABBIT_2006_NC_017083 (Region: China;  Strain: Rabbit coronavirus HKU14, complete genome.;  Date: 2006)

Gene

NS2a1 protein

Description

Annotated in NCBI,  NS2a1 protein

Location

NC_017083(+):21673-21804

GenBank Accession

YP_005454240.1

Full name

Non-structural protein 2a      

Alternative Name

ns2
32 kDa accessory protein
32 kDa non-structural protein

CDS

ATGGCTGTCGCTTATGCTGATATGCCTAATCATTTTATCAATTTTTCACTTACCCATTTTGAGGGTTTTGTGTTAAATTATAAAGGTTTACAATTTCAAATTCTTGATGTAGGAGTGGATTGTAAAATATAA

Protein

MAVAYADMPNHFINFSLTHFEGFVLNYKGLQFQILDVGVDCKI

Similarity

Belongs to the coronaviruses ns2a protein family.

Keywords

Host cytoplasm   Reference proteome  

Feature

chain  Non-structural protein 2a

Uniprot

H9AA29   H9AA50   H9AA40   U3M7B9   A0A1S5VGE9   A0A0K0L8M8   + More
A0A0K0L8G9   A0A1V0PL34   G5CJB7   A0A386BYU4   Q80872   U3M791   A0A0K0L883   A0A0K0L8H6   A0A385H6I7   A0A0K0L987   A0A385H5P9   A0A1W6DZR0   A0A1C8Z4S4   A0A2Z4HFP1   A0A385H5Y8   U3M7X0   A0A1S6KXQ6   B8RIQ5   A0A411D566   A3E2F0   B7U2R3   B7U2N1   B7U2M0   B7U2K9   B7U2Q2   A0A1S5VGA7   U3M773   U3M781   U3M7A5   A0A140E063   U3M796   U3M7V8   U3M7Y1   A0A0B4Q809   A0A385H6R8   A0A2D1QW74   A0A0B4Q915   A0A1Y0EUZ2   P18517   A0A191URB9   B7TYG7   C6GHQ8   A0A191URA9   Q80B88   Q9QAS3   D0EY91   A0A3S7H195   P0C2R4   P0C2R3   A8HB14   A0A2R4STT5   A0A191URY2   A0A1V0JAY5   A4ZU17   C6GHL1   Q0PL41   A0A2R4STS7   C6GHM3   C6GHN5   A4ZU06   C6GHP7   B7U2P2   A4ZTY4   A4ZU28   Q06BD9   A4ZTZ5   Q91A27   A4ZTX3   A0A3S7GY36   A0A5J6NRP1   Q8V438   A0A5J6NUM2   A4ZU72   A4ZU61   A4ZU39   A4ZU50   A0A5J6NRX2   A0A2P1IQB3   X2JFA3   A0A0U2GR01   X2JJI7   A0A1W6DZX8   D0EY81   A7BKC0   D0EY71   A0A0K0L9B7   A0A0K0L8D2   U3M7H8   A0A1V0IGF4   A0A1E1ERK1   A0A2R4KSR0   A0A5J6NRJ7   A0A2R4STR3   Q2QKN5  

Pubmed

22398294    28050020    21849456    25530469    7844564    15650185    + More
15914223    15280490    29950583    19162098    17092595    18842722    2762160    11774548    27274850    9778786    17916374    17434558    17459444    11714968    31534035    17344285    29508550    24655427    26678874    23405345    17374765    16809333   

EMBL

JN874559    AFE48790.1    JN874561    AFE48812.1    JN874560    AFE48801.1    + More
KF530094    AGT51748.1    KX538968    AQN78686.1    KF923916    AIV41955.1    KF923905    AIV41889.1    KY674920    KY554974    KY554975    ARB07431.1    ARE30013.1    ARE30022.1    JN129834    JN129835    KF530063    KF530067    KF530068    KF530069    KF530071    KF530079    KF530081    KF530082    KF530084    KF530089    KF530091    KF530095    KF530096    KF530098    KF530099    KF923887    KF923888    KF923889    KF923890    KF923891    KF923893    KF923894    KF923895    KF923899    KF923900    KF923901    KF923903    KF923907    KF923908    KF923909    KF923910    KF923911    KF923912    KF923914    KF923917    KF923918    KF923919    KF923920    KF923921    KF923922    KF923923    KF923924    KF923925    KJ958218    KJ958219    KX538965    KX538967    KX538969    KX538971    KX538973    KX538975    KX538977    KY674917    KY674918    KY554972    KY554973    MG197709    MG197711    MG197719    MK303619    MK303621    MK303623    MK303624    MK303625    MN306043    MN310476    AEN19356.1    AEN19364.1    AGT51439.1    AGT51479.1    AGT51489.1    AGT51499.1    AGT51519.1    AGT51598.1    AGT51618.1    AGT51628.1    AGT51648.1    AGT51698.1    AGT51718.1    AGT51758.1    AGT51768.1    AGT51788.1    AGT51798.1    AIV41781.1    AIV41787.1    AIV41793.1    AIV41799.1    AIV41805.1    AIV41817.1    AIV41823.1    AIV41830.1    AIV41854.1    AIV41860.1    AIV41866.1    AIV41877.1    AIV41901.1    AIV41907.1    AIV41913.1    AIV41919.1    AIV41925.1    AIV41931.1    AIV41943.1    AIV41961.1    AIV41967.1    AIV41973.1    AIV41979.1    AIV41985.1    AIV41991.1    AIV41997.1    AIV42003.1    AIV42009.1    AIX09797.1    AIX09805.1    AQN78662.1    AQN78678.1    AQN78694.1    AQN78710.1    AQN78726.1    AQN78742.1    AQN78758.1    ARB07412.1    ARB07418.1    ARE29995.1    ARE30004.1    AXX83295.1    AXX83307.1    AXX83355.1    QBP84702.1    QBP84720.1    QBP84738.1    QBP84747.1    QBQ01837.1    QEG03774.1    QEG03801.1    MH685718    AYC76636.1    L37833    AY391777    AY903459    AY903460    AY585228    AY585229    KF530088    AGT51688.1    KF923886    AIV41775.1    KF923902    KF923904    KY369905    KY369906    KY369907    KX538964    KX538966    KX538970    KX538972    KX538976    KX538978    KX538979    KY684759    KY967358    KY967359    KY967361    KY983585    KY983588    MF374983    MF374984    MF374985    MG977444    MG977445    MG977446    MG977447    MG977448    MG977449    MG977450    MG977452    MG197710    MG197712    MG197715    MG197716    MG197717    MG197723    MH121121    MK303620    MK303622    MN026164    MN306036    MN306041    MN306042    MN306053    MN310478    AIV41871.1    AIV41883.1    APU51918.1    APU51928.1    APU51938.1    AQN78654.1    AQN78670.1    AQN78702.1    AQN78718.1    AQN78750.1    AQN78766.1    AQN78774.1    ARA15419.1    ARK08649.1    ARK08659.1    ARK08677.1    ARU07585.1    ARU07608.1    ATN39863.1    ATN39870.1    ATN39878.1    AWW13509.1    AWW13517.1    AWW13525.1    AWW13533.1    AWW13541.1    AWW13549.1    AWW13557.1    AWW13573.1    AXX83301.1    AXX83313.1    AXX83331.1    AXX83337.1    AXX83343.1    AXX83379.1    AZP73838.1    QBP84711.1    QBP84729.1    QDH43721.1    QEG03738.1    QEG03755.1    QEG03765.1    QEG03792.1    QEG03812.1    MG197718    MG197720    MG197721    AXX83349.1    AXX83361.1    AXX83367.1    KF923892    AIV41811.1    MG197713    AXX83319.1    KY967356    ARK08633.1    KX344031    AOL02451.1    MG977451    AWW13564.1    MG197714    AXX83325.1    KF530070    AGT51509.1    KX432213    AQT26496.1    EU999954    ACL12994.1    MH249786    QAY30018.1    DQ682406    ABG78746.1    FJ425189    ACJ66998.1    FJ425186    ACJ66972.1    FJ425185    ACJ66957.1    FJ425184    ACJ66947.1    FJ425188    FJ425190    ACJ66991.1    KX538974    AQN78734.1    KF530077    KF530083    KF530086    AGT51578.1    AGT51638.1    AGT51668.1    KF530085    KF530087    KF923913    KF923915    AGT51658.1    AGT51678.1    AIV41937.1    AIV41949.1    KF530092    AGT51728.1    KU131570    AMK59675.1    KF530061    KF530065    KF530066    KF530073    KF530074    KF530090    KF530097    AGT51420.1    AGT51459.1    AGT51469.1    AGT51539.1    AGT51549.1    AGT51708.1    AGT51778.1    KF530064    KF530072    KF530078    KF530080    KP198610    KP198611    KY014282    AGT51449.1    AGT51529.1    AGT51588.1    AGT51608.1    AJC98125.1    AJC98132.1    ATP16765.1    KF530075    AGT51559.1    KF923896    AIV41836.1    MG197722    AXX83373.1    KY014281    ATP16755.1    KF923906    AIV41895.1    KY983583    ARU07566.1    X15445    AF220295    KU558923    ANJ04726.1    FJ415324    ACJ35484.1    FJ938067    ACT11028.1    KU558922    ANJ04715.1    U00735    AF058942    GQ918143    ACX46858.1    MG757138    AVI14998.1    AF058944    AF058943    EU019216    ABV74052.1    MH043953    MH043955    AVZ61107.1    AVZ61127.1    KU886219    ANJ04972.1    KX982264    MG757139    MG757140    MG757141    ARD05997.1    AVI15009.1    AVI15020.1    AVI15031.1    EF424619    ABP38277.1    FJ938063    ACT10981.1    DQ811784    ABG89287.1    MH043954    AVZ61117.1    FJ938064    ACT10993.1    FJ938065    ACT11005.1    EF424618    ABP38269.1    FJ938066    ACT11017.1    FJ425187    ACJ66982.1    EF424616    ABP38245.1    EF424620    ABP38289.1    DQ915164    ABI94001.2    EF424617    ABP38254.1    AF391541    EF424615    ABP38231.1    MG757142    AVI15042.1    MN514963    QEY10631.1    AF391542    MN514966    QEY10655.1    EF424624    ABP38335.1    EF424623    ABP38318.1    EF424621    ABP38301.1    EF424622    ABP38315.1    MN514964    MN514965    MN514967    QEY10639.1    QEY10647.1    QEY10663.1    MG518518    AVN88334.1    KF906249    AHN64772.1    KT368891    MF593476    ALA50078.1    ATI09447.1    KF906250    KF906251    AHN64781.1    AHN64790.1    KY967360    MF314143    MK327281    MN026165    ARK08668.1    AVQ05262.1    QBP84757.1    QDH43724.1    GQ918142    JX860640    ACX46848.1    AFW97358.1    AB354579    BAF75629.1    GQ918141    ACX46838.1    KF923897    AIV41842.1    KF923898    AIV41848.1    KF530060    AGT51410.1    KY419103    ARC95201.1    KY994645    AB362589    AUF40273.1    BAV60913.1    MF083115    AVV64333.1    MN514962    QEY10623.1    MH043952    AVZ61097.1    DQ011855    AAY68295.1   

Proteomes

UP000107676    UP000125269    UP000124585    UP000104124    UP000128782    UP000128148    + More
UP000097333    UP000099221    UP000100004    UP000104994    UP000107048    UP000108500    UP000109321    UP000109543    UP000112072    UP000114034    UP000114169    UP000115343    UP000115819    UP000116223    UP000117554    UP000119058    UP000119762    UP000119882    UP000119993    UP000121854    UP000122365    UP000123825    UP000126267    UP000130067    UP000130586    UP000132146    UP000136483    UP000137532    UP000137844    UP000140040    UP000140401    UP000142623    UP000143152    UP000143194    UP000143341    UP000149793    UP000150164    UP000152870    UP000154332    UP000155676    UP000158566    UP000160021    UP000161839    UP000168290    UP000172586    UP000173555    UP000173822    UP000007552    UP000100580    UP000159995    UP000161137    UP000180344    UP000150595    UP000114688    UP000101116    UP000165756    UP000130040    UP000117387    UP000133443    UP000140344    UP000104294    UP000174569    UP000102696    UP000148210    UP000096360    UP000136788    UP000159503    UP000105266    UP000136628    UP000165173    UP000166197    UP000126877    UP000147591    UP000106834    UP000143333    UP000147052    UP000147585    UP000149594    UP000168172    UP000170317    UP000100971    UP000115705    UP000133796    UP000134871    UP000154668    UP000165185    UP000149702    UP000174077    UP000173306    UP000008572    UP000158296    UP000164707    UP000007554    UP000134650    UP000172225    UP000147981    UP000136745    UP000139966    UP000173415    UP000162935    UP000158327    UP000127099    UP000170940    UP000154814    UP000151273    UP000008570    UP000121953    UP000008571    UP000147178    UP000163913    UP000136116    UP000139235    UP000121258    UP000158231    UP000145507    UP000149260    UP000137675    UP000168103    UP000162080    UP000142982    UP000167348    UP000125924   

PRIDE

Q80872    Q8V438   

Pfam

PF05213   Corona_NS2A

Interpro

IPR039573   NS2A-like
IPR007878   Coronavirus_NS2A
IPR009097   Cyclic_Pdiesterase

SUPFAM

SSF55144   SSF55144

ProteinModelPortal

H9AA29   H9AA50   H9AA40   U3M7B9   A0A1S5VGE9   A0A0K0L8M8   + More
A0A0K0L8G9   A0A1V0PL34   G5CJB7   A0A386BYU4   Q80872   U3M791   A0A0K0L883   A0A0K0L8H6   A0A385H6I7   A0A0K0L987   A0A385H5P9   A0A1W6DZR0   A0A1C8Z4S4   A0A2Z4HFP1   A0A385H5Y8   U3M7X0   A0A1S6KXQ6   B8RIQ5   A0A411D566   A3E2F0   B7U2R3   B7U2N1   B7U2M0   B7U2K9   B7U2Q2   A0A1S5VGA7   U3M773   U3M781   U3M7A5   A0A140E063   U3M796   U3M7V8   U3M7Y1   A0A0B4Q809   A0A385H6R8   A0A2D1QW74   A0A0B4Q915   A0A1Y0EUZ2   P18517   A0A191URB9   B7TYG7   C6GHQ8   A0A191URA9   Q80B88   Q9QAS3   D0EY91   A0A3S7H195   P0C2R4   P0C2R3   A8HB14   A0A2R4STT5   A0A191URY2   A0A1V0JAY5   A4ZU17   C6GHL1   Q0PL41   A0A2R4STS7   C6GHM3   C6GHN5   A4ZU06   C6GHP7   B7U2P2   A4ZTY4   A4ZU28   Q06BD9   A4ZTZ5   Q91A27   A4ZTX3   A0A3S7GY36   A0A5J6NRP1   Q8V438   A0A5J6NUM2   A4ZU72   A4ZU61   A4ZU39   A4ZU50   A0A5J6NRX2   A0A2P1IQB3   X2JFA3   A0A0U2GR01   X2JJI7   A0A1W6DZX8   D0EY81   A7BKC0   D0EY71   A0A0K0L9B7   A0A0K0L8D2   U3M7H8   A0A1V0IGF4   A0A1E1ERK1   A0A2R4KSR0   A0A5J6NRJ7   A0A2R4STR3   Q2QKN5  

PDB

4Z5V     E-value=8.45223e-53,     Score=522