Strain

CHINA_BAT_2005_NC_018871 (Region: China;  Strain: Rousettus bat coronavirus HKU10, complete genome.;  Date: 2005)

Gene

non-structural protein NS3

Description

Annotated in NCBI,  non-structural protein NS3

Location

NC_018871(+):24690-25346

GenBank Accession

YP_006908643.1

Full name

Non-structural protein 3      

Alternative Name

Accessory protein 3a

CDS

ATGACTGGCCTATTTCAAACCTCTTTTGGTGACTCAGTTCAGGCTGGTGTGCAGCATTTAGTTGAAAAATTACCATTACCTGATGTACATTTTCAACATGCATTGCCATTAGCCAATTTTCTCATGACTAGTGTGTTTGTAATTTACTTTGCTATGTACAAAGCCAGCTCAGTTAGAAATAACTGTATTATGTTTGGCTTTAGGCTTTTTGCAATGTTTGTATACGCACCATTGTTATGTTATTTTGAGCTGTATGTTGATGCCGCTATTATTTTCGGTGCTCTTTACACTAGGCTTATGTATGTTACGTATTATGCCTGTAGGTACAGATCACCTGCATTTGTTGTGCTTAACACTGACAAACTTGCTTTTGTTCAAGGCTATTATTGGTACTATCAGGACAACTCATACCTGACTTTGTTAGGTGGTGAAAACTTTGTCACCTTTGGTCCTAATTTTGTGCCAATTGCTGCCACTAATGACCTTTACATTGCTCTCAGAGGTAAGAAAGATGATGATGTACCACTGGTGAGGCGCGTAGAACTCATCAATGGACAATTCTTTTACATCTTTGCACAAGAGCCTGTTGTAGGTGTGGTGAACATGTGCTTTTCTGAACTTAGACTCTGTGAAGAAGTTGAAGTTCAATCTGATTAA

Protein

MTGLFQTSFGDSVQAGVQHLVEKLPLPDVHFQHALPLANFLMTSVFVIYFAMYKASSVRNNCIMFGFRLFAMFVYAPLLCYFELYVDAAIIFGALYTRLMYVTYYACRYRSPAFVVLNTDKLAFVQGYYWYYQDNSYLTLLGGENFVTFGPNFVPIAATNDLYIALRGKKDDDVPLVRRVELINGQFFYIFAQEPVVGVVNMCFSELRLCEEVEVQSD

Keywords

Host membrane   Membrane   Transmembrane   Transmembrane helix  

Feature

chain  Non-structural protein 3

Uniprot

K4K2S1   K4JZ82   K4K1W1   K4KCQ8   K4K225   A0A4Y5QL67   + More
F1DAX7   A0A482JZU4   A0A482K3B3   A0A482JX61   A0A0U1WHC3   A0A0U1UZ22   B1PHK3   A0A0U1WHD4   A0A0U1WHG6   A0A0U1UZB9   A0A0U1WHE2   F1DB21   F1DB15   A0A0U1WJW8   A0A3G8EWH8   A0A068BFX9   E5LPC0   A0A411NPD3   A0A160EDC3   U6A623   A0A482F7H2   A0A5J6SVW6   A0A220YLL7   U3RJK5   A0A411NPG6   A0A0F7L1H1   L7Y6A8   U3RGM6   A0A411E5Y0   A0A2Z4N643   A0A0N9E989   A0A219TU70   A0A097I545   A0A220T0U2   A0A411NPI8   A0A411NPG4   A0A411NPH7   A0A411NPF6   A0A075ECG0   A0A3G3NGZ1   A0A411NPJ9   A0A411NPE4   A0A2L1IPZ6   A0A0C5KQX3   A0A068BDE6   A0A411NPC9   L7Y697   A0A411NPF9   A0A411NPF1   U3RC20   A0A3G3NGZ8   A0A411NPH4   A0A411NPJ0   A0A411NPC1   A0A411NPK3   A0A411NPC8   A0A411NPJ1   A0A411NPK4   A0A411NPG1   A0A411NPI9   A0A411NPL8   A0A411NPB7   A0A411NPJ4   A0A411NPF5   A0A411NPH6   A0A411NPK5   A0A411NPM8   A0A411NPA8   H9CH10   A0A0K1RL86   A0A0U2URV9   A0A0N9E8P5   Q91AV0   U3RC15   A0A3G3NGF5   A0A160EED3   H9BHF4   S5ZIX9   A0A0U1YIX8   M1HA71   K4P7U2   I3QJZ9   A0A4P8GK27   A0A0U3HQW7   A0A3G3NH43   I3V636   A0A221ZTM6   G9JWF4   A0A1P7ZRN0   J7GVA2   A0A5J6VBZ7   A0A410JAL3   K4P5B0  

Pubmed

22933277    31067830    19239771    22561208    27125516    18420807    + More
30447246    21210162    31350613    28840816    24292967    26112783    25279722    25694517    25272273    26512689    27178127    29879479    8291230    9782358    11724265    22843324    28095455    22923806   

EMBL

JQ989270    AFU92105.1    JQ989266    JQ989267    JQ989269    AFU92071.1    + More
AFU92079.1    AFU92096.1    JQ989268    AFU92087.1    JQ989271    AFU92114.1    JQ989272    JQ989273    AFU92123.1    AFU92132.1    MK720945    MK720946    QCX35168.1    QCX35179.1    HQ728480    ADX59452.1    MG916902    MG916903    QBP43269.1    QBP43280.1    MG916901    QBP43257.1    MG916904    QBP43291.1    KJ473797    AIA62213.1    KJ473798    AIA62221.1    EU420139    ACA52172.1    KJ473799    AIA62228.1    KJ473810    AIA62272.1    KJ473800    AIA62235.1    KJ473807    AIA62253.1    HQ728486    ADX59496.1    HQ728485    ADX59489.1    KJ473809    AIA62266.1    MH938448    AZF86119.1    KJ646563    AIC82370.1    HQ537442    HQ537444    ADQ27458.1    ADQ27460.1    MH744180    QBF53849.1    KU641649    ANB44384.1    KF495659    KF495663    AHA15401.1    AHA15405.1    MK032689    MK482396    MK482397    QBO24652.1    QDZ36663.1    QDZ36669.1    MK644601    QFG01689.1    KY799179    ASL24652.1    KF476056    AGX01600.1    MH744179    QBF53848.1    KR610991    KR610992    AKH45327.1    KC120789    AGD93111.1    KF476060    KF476061    AGX01604.1    AGX01605.1    MH243318    QBA57553.1    MF611911    AWX65682.1    KR138439    ALF41045.1    KT346372    ANV78631.1    KM048308    AIT56241.1    KX852323    ASK39729.1    MH744207    QBF53876.1    MH744208    QBF53877.1    MH744197    QBF53866.1    MH744198    QBF53867.1    KJ645659    AID56812.1    MH687938    MH687944    MH687955    MH687958    MH687960    MH687965    AYR18425.1    AYR18462.1    AYR18520.1    AYR18538.1    AYR18550.1    AYR18580.1    MH744191    QBF53860.1    MH744190    QBF53859.1    MF418656    MF418657    AVD96850.1    AVD96851.1    KM609208    AJP67427.1    KJ646569    AIC82376.1    MH744183    QBF53852.1    KC120779    KC120784    KC120787    KC120802    KF476049    KF476057    KF476059    KF761675    KF840540    KF840545    KF840555    KF840556    KP281632    KP281633    KP281634    KT021227    MH107322    MF611904    MF611907    MH726374    MH726375    MN037494    AGD93101.1    AGD93106.1    AGD93109.1    AGD93124.1    AGX01593.1    AGX01601.1    AGX01603.1    AHG97486.1    AIE15951.1    AIE15976.1    AIE16026.1    AIE16031.1    AKA64539.1    AKA64540.1    AKA64541.1    ALM09358.1    AWV57055.1    AWX65675.1    AWX65678.1    QCQ19871.1    QCQ19877.1    QED58402.1    MH744202    QBF53871.1    MH744203    QBF53872.1    KF476058    AGX01602.1    MH687967    AYR18592.1    MH744218    QBF53887.1    MH744244    QBF53913.1    MH744162    QBF53831.1    MH744248    QBF53917.1    MH744184    QBF53853.1    MH744245    QBF53914.1    MH744246    QBF53915.1    MH744214    QBF53883.1    MH744181    QBF53850.1    MH744237    QBF53906.1    MH744163    QBF53832.1    MH744236    QBF53905.1    MH744205    QBF53874.1    MH744220    QBF53889.1    MH744219    QBF53888.1    MH744247    QBF53916.1    MH744158    QBF53827.1    JQ305099    AFE85869.1    KR809885    AKV62620.1    KR061458    ALR84909.1    KR138442    LT906582    LT906581    LT906620    ALF41048.1    SNW64185.1    SNW64191.1    Z24733    AF353511    KF476053    AGX01597.1    MH687937    MH687961    MH687966    AYR18419.1    AYR18556.1    AYR18586.1    KU641637    ANB44372.1    JQ027027    KR138438    KR138440    AFD23299.1    ALF41044.1    ALF41046.1    KF430219    AGT21334.1    KJ857430    AJD09553.1    KC161196    AGE46012.1    JX501330    AFV59252.1    JQ664302    KX852322    KX852331    KX852332    KX852333    KX852334    KX852335    AFK09785.1    ASK39728.1    ASK39737.1    ASK39738.1    ASK39739.1    ASK39740.1    ASK39741.1    MH891589    QCO95423.1    KT388424    ALV66176.1    MH687943    MH687956    AYR18456.1    AYR18526.1    JQ710434    AFK73389.1    MF346935    ASO67378.1    JN980697    JQ027024    JQ027025    JQ027029    JQ723733    KM609204    MH708895    AEW22947.1    AFD23296.1    AFD23297.1    AFD23301.1    AFJ54355.1    AJP67403.1    AYL64493.1    KU363125    KU363126    KU363127    KU363128    KU363129    KU363130    KU363132    AMK69972.1    AMK69973.1    AMK69974.1    AMK69975.1    AMK69976.1    AMK69977.1    AMK69979.1    JX112709    AFP81690.1    MK656493    QFG71756.1    MK288006    QAR17950.1    JX501329    AFV59251.1   

Proteomes

UP000155419    UP000119818    UP000126615    UP000132096    UP000123997    UP000162430    + More
UP000112496    UP000126962    UP000106776    UP000110898    UP000143524    UP000135768    UP000144177    UP000126502    UP000106394    UP000103794    UP000156820    UP000171486    UP000151206    UP000124473    UP000111801    UP000152961    UP000117357    UP000124407    UP000269222    UP000274194    UP000276154    UP000008159    UP000174423    UP000157500    UP000126602   

PRIDE

Q91AV0   

Pfam

PF03053   Corona_NS3b

Interpro

IPR004293   Coronavirus_Orf3b

ProteinModelPortal

K4K2S1   K4JZ82   K4K1W1   K4KCQ8   K4K225   A0A4Y5QL67   + More
F1DAX7   A0A482JZU4   A0A482K3B3   A0A482JX61   A0A0U1WHC3   A0A0U1UZ22   B1PHK3   A0A0U1WHD4   A0A0U1WHG6   A0A0U1UZB9   A0A0U1WHE2   F1DB21   F1DB15   A0A0U1WJW8   A0A3G8EWH8   A0A068BFX9   E5LPC0   A0A411NPD3   A0A160EDC3   U6A623   A0A482F7H2   A0A5J6SVW6   A0A220YLL7   U3RJK5   A0A411NPG6   A0A0F7L1H1   L7Y6A8   U3RGM6   A0A411E5Y0   A0A2Z4N643   A0A0N9E989   A0A219TU70   A0A097I545   A0A220T0U2   A0A411NPI8   A0A411NPG4   A0A411NPH7   A0A411NPF6   A0A075ECG0   A0A3G3NGZ1   A0A411NPJ9   A0A411NPE4   A0A2L1IPZ6   A0A0C5KQX3   A0A068BDE6   A0A411NPC9   L7Y697   A0A411NPF9   A0A411NPF1   U3RC20   A0A3G3NGZ8   A0A411NPH4   A0A411NPJ0   A0A411NPC1   A0A411NPK3   A0A411NPC8   A0A411NPJ1   A0A411NPK4   A0A411NPG1   A0A411NPI9   A0A411NPL8   A0A411NPB7   A0A411NPJ4   A0A411NPF5   A0A411NPH6   A0A411NPK5   A0A411NPM8   A0A411NPA8   H9CH10   A0A0K1RL86   A0A0U2URV9   A0A0N9E8P5   Q91AV0   U3RC15   A0A3G3NGF5   A0A160EED3   H9BHF4   S5ZIX9   A0A0U1YIX8   M1HA71   K4P7U2   I3QJZ9   A0A4P8GK27   A0A0U3HQW7   A0A3G3NH43   I3V636   A0A221ZTM6   G9JWF4   A0A1P7ZRN0   J7GVA2   A0A5J6VBZ7   A0A410JAL3   K4P5B0  

PDB

2QY0     E-value=1.57746,     Score=69