Strain

MID_EAST_HS_2012_NC_019843 (Region: Arabia;  Strain: Middle East respiratory syndrome coronavirus, complete genome.;  Date: 2012)

Gene

ORF8b protein

Description

Annotated in NCBI,  ORF8b protein

Location

NC_019843(+):28762-29100

GenBank Accession

YP_009047212.1

CDS

ATGCCAATTCTACCCCTGCGCAAAATGCTGGGTATTGGCGGAGACAGGACAGAAAAATTAATACCGGGAATGGAATTAAGCAACTGGCTCCCAGGTGGTACTTCTACTACACTGGAACTGGACCCGAAGCAGCACTCCCATTCCGGGCTGTTAAGGATGGCATCGTTTGGGTCCATGAAGATGGCGCCACTGATGCTCCTTCAACTTTTGGGACGCGGAACCCTAACAATGATTCAGCTATTGTTACACAATTCGCGCCCGGTACTAAGCTTCCTAAAAACTTCCACATTGAGGGGACTGGAGGCAATAGTCAATCATCTTCAAGAGCCTCTAGCTTAA

Protein

MPILPLRKMLGIGGDRTEKLIPGMELSNWLPGGTSTTLELDPKQHSHSGLLRMASFGSMKMAPLMLLQLLGRGTLTMIQLLLHNSRPVLSFLKTSTLRGLEAIVNHLQEPLA

Uniprot

K4L9K1   M4T791   A0A291I601   A0A140HF82   A0A2P1IT70   M1S904   + More
R9UNW8   A0A1W5LGP6   A0A411PBI5   A0A2P1IT59   A0A2P1IT57   W6A8Z4   A0A0U2GLJ8   A0A411PBF8   A0A2I2MQI0   A0A2P1ITB9   A0A2D0Y518   A0A385AJW8   T2B9U9   A0A2D0Y8J4   A0A385AJY3   A0A291I605   A0A1L2E0K4   A0A068EQ54   A0A411PBL4   A0A411PBJ8   A0A0U2GPC1   A0A0U2GMC7   A0A0S3IV87   W6A0C3   A0A0U2GM99   A0A291I6I5   A0A0U2GMT4   A0A0U2GKV1   A0A023W0Q3   A0A1B0V2R3   A0A0U2GL69   A0A1L2E0T6   A0A0U2GQ91   A0A0U2GLY8   A0A0A0QJF3   A0A075Q6H0   A0A2R2YRH9   A0A5H2WYZ6   A0A023YAC5   A0A2I6PIX0   A0A2I6PIX7   A0A2R4KP81   A0A2I4R8R2   U5LR23   U5LNP4   A0A2I4R8Z1   A0A2R4KP95   A0A4D6G1H4  

Pubmed

23170002    24874668    29507189    27125484    30482895    23693015    + More
24055451    23782859    24549846    24781747    25989145    26272560    26814649    26981770    27999424    26839489    26678874    29116217    29239118    30294617    30753126    31022948    26632876    24857749    24896817    25075761    27486688    25323704    24050621    25031349    29579103    24960574    29258555    24131722   

EMBL

JX869059    AFV09328.1    KC776174    KJ614529    AGH58725.1    AHY21477.1    + More
MG011340    MG923470    MG923471    MG923472    MG923474    MG923475    MG923476    MG923477    MG923478    MG923479    MG923480    MG923481    ATG84687.1    AVN89341.1    AVN89351.1    AVN89360.1    AVN89382.1    AVN89393.1    AVN89404.1    AVN89415.1    AVN89426.1    AVN89437.1    AVN89448.1    AVN89459.1    KU740200    MG923465    MG923466    MK357908    MK357909    MK564474    MK564475    AMO03409.1    AVN89288.1    AVN89299.1    QAT98903.1    QAT98914.1    QBM11744.1    QBM11756.1    MG923469    AVN89331.1    KC667074    AGG22550.1    KF186564    KF186566    KF186567    KF186565    KF192507    KF600612    KF600613    KF600620    KF600621    KF600623    KF600627    KF600628    KF600630    KF600634    KF600635    KF600636    KF600639    KF600643    KF600644    KF600645    KF600647    KF600651    KF600652    KF745068    KF961222    KJ156866    KJ156869    KJ156874    KJ156881    KJ156910    KJ156934    KJ156949    KJ156952    KJ156861    KJ156871    KJ156906    KJ156913    KJ156932    KJ156873    KJ156876    KJ156901    KJ156862    KJ156902    KJ156953    KJ156927    KJ713297    KJ713298    KJ713299    KJ361499    KJ361500    KJ361501    KJ361502    KJ361503    KP719927    KP719928    KP719929    KP719930    KP719931    KP719932    KP719933    KT006149    KT036372    KT036373    KT036374    KT225476    KT326819    KT368824    KT368825    KT368833    KT368835    KT368836    KT368837    KT368838    KT368839    KT368840    KT368841    KT368842    KT368846    KT368847    KT368848    KT368868    KT368869    KT368870    KT368871    KT368872    KT368874    KT368876    KT368877    KT368879    KT368880    KT368881    KT368882    KT368883    KT368884    KT368885    KT368886    KT368888    KT368889    KT374050    KT374051    KT374052    KT374053    KT374054    KT374055    KT374056    KT374057    KT002194    KU233362    KU233363    KU233364    KU242423    KU242424    KT806046    KT806047    KT806048    KT806049    KT806051    KT806052    KT806053    KT861627    KU308549    KU851859    KU851860    KU851861    KU851862    KU851863    KU851864    KX034093    KX034094    KX034095    KX034096    KX034097    KX034098    KX034099    KX034100    KX154685    KX154686    KX154687    KX154688    KX154689    KX154690    KX154691    KX154692    KX154693    KX154694    KX108937    KX108938    KX108939    KX108940    KX108942    KX108944    KX108945    KX108946    KY673148    KY673149    KY688118    KY688119    KY688120    KY688122    KY688123    KY688124    KY581684    KY581685    KY581686    KY581687    KY581688    KY581689    KY581690    KY581691    KY581692    KY581694    KY581695    KY581696    KY581697    KY581698    KY581699    KY581700    MF598594    MF598595    MF598602    MF598603    MF598604    MF598606    MF598608    MF598611    MF598612    MF598615    MF598617    MF598618    MF598619    MF598620    MF598621    MF598624    MF598632    MF598633    MF598635    MF598636    MF598637    MF598638    MF598639    MF598641    MF598642    MF598643    MF598644    MF598645    MF598646    MF598647    MF598648    MF598649    MF598652    MF598654    MF598656    MF598657    MF598658    MF598661    MF598662    MF598663    MF598664    MF598665    MF598666    MF598667    MF598669    MF598670    MF598672    MF598673    MF598674    MF598675    MF598676    MF598677    MF598678    MF598680    MF598681    MF598682    MF598684    MF598685    MF598686    MF598687    MF598688    MF598691    MF598692    MF598693    MF598694    MF598695    MF598696    MF598697    MF598698    MF598712    MF741837    MF741825    MF741826    MF741827    MF741828    MF741829    MF741830    MF741831    MF741832    MF741833    MF741834    MF741835    MF741836    MG011342    MG011344    MG011346    MG011348    MG011349    MG011350    MG011351    MG011358    MH013216    MH306207    MG520075    MG520076    MG757593    MG757594    MG757595    MG757596    MG757597    MG757598    MG757599    MG757600    MG757602    MG757603    MG757604    MG546330    MG546331    MH029552    MK129253    MK280984    MH259485    AGN70937.1    AGN70959.1    AGN70969.1    AGN70981.1    AGN72647.1    AGV08387.1    AGV08398.1    AGV08416.1    AGV08419.1    AGV08434.1    AGV08452.1    AGV08463.1    AGV08475.1    AGV08500.1    AGV08503.1    AGV08513.1    AGV08518.1    AGV08532.1    AGV08543.1    AGV08554.1    AGV08566.1    AGV08581.1    AGV08592.1    AHB33334.1    AHC74106.1    AHI48525.1    AHI48536.1    AHI48547.1    AHI48558.1    AHI48569.1    AHI48580.1    AHI48602.1    AHI48613.1    AHI48636.1    AHI48639.1    AHI48642.1    AHI48645.1    AHI48650.1    AHI48670.1    AHI48680.1    AHI48690.1    AHI48805.1    AHI48809.1    AHI48813.1    AHI48839.1    AHY22552.1    AHY22562.1    AHY22572.1    AIZ74408.1    AIZ74436.1    AIZ74447.1    AIZ74458.1    AJG44066.1    AJG44077.1    AJG44088.1    AJG44099.1    AJG44110.1    AJG44121.1    AJG44132.1    AKJ80145.1    AKL80601.1    AKL80612.1    AKL80622.1    AKO73400.1    AKS48070.1    ALA49349.1    ALA49360.1    ALA49448.1    ALA49470.1    ALA49481.1    ALA49492.1    ALA49503.1    ALA49514.1    ALA49525.1    ALA49536.1    ALA49547.1    ALA49591.1    ALA49602.1    ALA49613.1    ALA49833.1    ALA49844.1    ALA49855.1    ALA49866.1    ALA49877.1    ALA49899.1    ALA49921.1    ALA49932.1    ALA49954.1    ALA49965.1    ALA49976.1    ALA49987.1    ALA49998.1    ALA50009.1    ALA50020.1    ALA50031.1    ALA50053.1    ALA50064.1    ALB08254.1    ALB08265.1    ALB08275.1    ALB08286.1    ALB08297.1    ALB08308.1    ALB08319.1    ALB08330.1    ALM88295.1    ALT66810.1    ALT66821.1    ALT66832.1    ALT66878.1    ALT66888.1    ALW82666.1    ALW82677.1    ALW82688.1    ALW82699.1    ALW82717.1    ALW82728.1    ALW82739.1    ALX27240.1    AML60278.1    AMQ49023.1    AMQ49034.1    AMQ49045.1    AMQ49056.1    AMQ49067.1    AMQ49078.1    ANC28642.1    ANC28653.1    ANC28664.1    ANC28675.1    ANC28686.1    ANC28697.1    ANC28708.1    ANC28719.1    ANF29181.1    ANF29192.1    ANF29203.1    ANF29214.1    ANF29225.1    ANF29236.1    ANF29247.1    ANF29258.1    ANF29269.1    ANF29280.1    ANI69832.1    ANI69843.1    ANI69854.1    ANI69865.1    ANI69886.1    ANI69908.1    ANI69919.1    ANI69930.1    AQZ41293.1    AQZ41304.1    AQZ41319.1    AQZ41329.1    AQZ41340.1    AQZ41362.1    AQZ41373.1    AQZ41384.1    ASU45705.1    ASU45716.1    ASU45727.1    ASU45738.1    ASU45749.1    ASU45760.1    ASU45771.1    ASU45782.1    ASU45793.1    ASU45815.1    ASU45826.1    ASU45837.1    ASU45848.1    ASU45859.1    ASU45870.1    ASU45881.1    ASU89929.1    ASU89941.1    ASU90018.1    ASU90029.1    ASU90040.1    ASU90062.1    ASU90084.1    ASU90117.1    ASU90128.1    ASU90161.1    ASU90183.1    ASU90194.1    ASU90205.1    ASU90216.1    ASU90227.1    ASU90260.1    ASU90348.1    ASU90359.1    ASU90381.1    ASU90392.1    ASU90403.1    ASU90414.1    ASU90425.1    ASU90447.1    ASU90458.1    ASU90469.1    ASU90480.1    ASU90491.1    ASU90502.1    ASU90513.1    ASU90524.1    ASU90535.1    ASU90568.1    ASU90590.1    ASU90612.1    ASU90623.1    ASU90634.1    ASU90667.1    ASU90678.1    ASU90689.1    ASU90700.1    ASU90711.1    ASU90722.1    ASU90733.1    ASU90755.1    ASU90766.1    ASU90788.1    ASU90799.1    ASU90810.1    ASU90821.1    ASU90832.1    ASU90843.1    ASU90854.1    ASU90876.1    ASU90887.1    ASU90898.1    ASU90920.1    ASU90931.1    ASU90942.1    ASU90953.1    ASU90964.1    ASU90996.1    ASU91007.1    ASU91018.1    ASU91029.1    ASU91040.1    ASU91051.1    ASU91062.1    ASU91073.1    ASU91227.1    ASY99786.1    ASY99797.1    ASY99808.1    ASY99817.1    ASY99828.1    ASY99839.1    ASY99850.1    ASY99861.1    ASY99870.1    ASY99881.1    ASY99892.1    ASY99903.1    ASY99914.1    ATG84709.1    ATG84731.1    ATG84753.1    ATG84775.1    ATG84786.1    ATG84797.1    ATG84808.1    ATG84885.1    AVV61908.1    AWM99590.1    AXN73378.1    AXN73389.1    AXN73401.1    AXN73412.1    AXN73423.1    AXN73434.1    AXN73445.1    AXN73456.1    AXN73467.1    AXN73478.1    AXN73500.1    AXN73511.1    AXN73522.1    AYO86707.1    AZK15908.1    AZU90739.1    QCI31477.1    KX154684    MG011341    MG011343    MG011347    MG011352    MG011353    MG011355    MG011359    MG011360    MG011361    MG011362    MG366880    MG366881    MG366882    MG366883    MG912595    MG912596    MG912597    MG912598    MG912599    MG912600    MG912601    MG912602    MG912603    MG912604    MG912605    MG912606    MG912607    MG912608    MG912609    MH454272    MH371127    MH395139    MH432120    MG366483    MG757605    MH310910    MH310911    MH822886    MK462243    MK462245    MK462246    MK462247    MK462250    MK462252    MK462254    MK462255    MK462256    MK483839    MN120513    MN120514    MN365232    MN365233    ANF29170.1    ATG84698.1    ATG84720.1    ATG84764.1    ATG84819.1    ATG84830.1    ATG84852.1    ATG84896.1    ATG84907.1    ATG84918.1    ATG84929.1    ATY74389.1    ATY74400.1    ATY74411.1    ATY74422.1    AVK87326.1    AVK87337.1    AVK87348.1    AVK87359.1    AVK87370.1    AVK87381.1    AVK87392.1    AVK87403.1    AVK87414.1    AVK87425.1    AVK87436.1    AVK87447.1    AVK87458.1    AVK87469.1    AVK87477.1    AWU59329.1    AXG21651.1    AXG21662.1    AXG21673.1    AXN73367.1    AXN73533.1    AXN92246.1    AXN92257.1    AYM48039.1    QBF80463.1    QBF80485.1    QBF80496.1    QBF80507.1    QBF80540.1    QBF80562.1    QBF80584.1    QBF80595.1    QBF80606.1    QBF80619.1    QDP16203.1    QDP16214.1    QEJ82223.1    QEJ82234.1    MK462253    QBF80573.1    MG923468    AVN89321.1    MG923467    AVN89310.1    KJ156905    AHI48700.1    KT368858    KT368859    KT368860    KT368861    KT368862    KT368863    KT368864    KT368865    ALA49723.1    ALA49734.1    ALA49745.1    ALA49756.1    ALA49767.1    ALA49778.1    ALA49789.1    ALA49800.1    MK462244    QBF80474.1    KY688121    AQZ41351.1    MG923473    AVN89371.1    MF598679    ASU90865.1    MH310909    AXN92235.1    KF600632    KJ156872    KJ156939    KJ156909    AGV08488.1    AHI48660.1    AHI48719.1    AHI48811.1    MF598631    ASU90337.1    MH310912    AXN92268.1    MG011345    ATG84742.1    KX108941    ANI69875.1    KM015348    KM210277    KM210278    AID50426.1    AJD81448.1    AJD81459.1    MK462251    QBF80551.1    MK462248    MK462249    QBF80518.1    QBF80529.1    KT368834    ALA49459.1    KT368827    KT368829    KT368830    KT368831    KT368832    KT368845    KT368852    KT368856    KT368857    KT368887    KT368890    KT806055    ALA49382.1    ALA49404.1    ALA49415.1    ALA49426.1    ALA49437.1    ALA49580.1    ALA49657.1    ALA49701.1    ALA49712.1    ALA50042.1    ALA50075.1    ALW82761.1    KT751244    MF598596    MF598597    MF598598    MF598599    MF598600    MF598601    MF598605    MF598607    MF598609    MF598610    MF598613    MF598614    MF598616    MF598622    MF598623    MF598625    MF598626    MF598627    MF598629    MF598630    MF598634    MF598640    MF598650    MF598651    MF598653    MF598655    MF598659    MF598660    MF598668    MF598671    MF598683    MF598689    MF598690    MF598699    MF598700    MF598701    MF598702    MF598703    MF598704    MF598705    MF598706    MF598707    MF598708    MF598709    MF598710    MF598711    MF598713    MF598714    MF598715    MF598716    MF598717    MF598718    MF598719    MF598720    MF598721    MF598722    ALR69649.1    ASU89952.1    ASU89963.1    ASU89974.1    ASU89985.1    ASU89996.1    ASU90007.1    ASU90051.1    ASU90073.1    ASU90095.1    ASU90106.1    ASU90139.1    ASU90150.1    ASU90172.1    ASU90238.1    ASU90249.1    ASU90271.1    ASU90282.1    ASU90293.1    ASU90315.1    ASU90326.1    ASU90370.1    ASU90436.1    ASU90546.1    ASU90557.1    ASU90579.1    ASU90601.1    ASU90645.1    ASU90656.1    ASU90744.1    ASU90777.1    ASU90909.1    ASU90974.1    ASU90985.1    ASU91084.1    ASU91095.1    ASU91106.1    ASU91117.1    ASU91128.1    ASU91139.1    ASU91150.1    ASU91161.1    ASU91172.1    ASU91183.1    ASU91194.1    ASU91205.1    ASU91216.1    ASU91238.1    ASU91249.1    ASU91259.1    ASU91270.1    ASU91281.1    ASU91292.1    ASU91302.1    ASU91312.1    ASU91322.1    ASU91332.1    KF917527    KF958702    KJ156944    KJ156883    KJ556336    AHE78105.1    AHE78116.1    AHI48591.1    AHI48807.1    AHN10820.1    KT368878    KT806044    KT806045    KT806054    ALA49943.1    ALW82644.1    ALW82655.1    ALW82750.1    MG011354    MG011356    MG011357    ATG84841.1    ATG84863.1    ATG84874.1    KT368873    MG757601    ALA49888.1    AXN73489.1    KT368826    ALA49371.1    KJ650098    KJ713295    KJ713296    AHX71954.1    AHY22532.1    AHY22542.1    KU710264    KU710265    AMQ49001.1    AMQ49012.1    KT368828    KT368843    KT368844    ALA49393.1    ALA49558.1    ALA49569.1    KX108943    ANI69897.1    KT368866    KT368867    ALA49811.1    ALA49822.1    KT368875    ALA49910.1    KM027255    KM027256    KM027257    KM027258    KM027259    KM027260    KM027261    KT368849    KT368850    KT368851    KT368853    KT368854    KT368855    KT877350    KT877351    KT861628    KY581693    MK052676    MK039552    MK039553    MH259486    AIL23920.1    AIL23931.1    AIL23942.1    AIL23953.1    AIL23964.1    AIL23975.1    AIL23986.1    ALA49624.1    ALA49635.1    ALA49646.1    ALA49668.1    ALA49679.1    ALA49690.1    ALL26404.1    ALL26417.1    ALX27251.1    ASU45804.1    AYP10306.1    AYV64557.1    AYV64568.1    QCI31488.1    KC869678    AIG13104.1    MF593268    ATQ39398.1    LC469308    BBJ36016.1    KJ473821    AHY61345.1    MG596802    AUM60022.1    MG596803    AUM60032.1    MG021451    AVV62534.1    KX442564    ASL68950.1    KC545383    AGX27808.1    KC545386    AGX27819.1    KX442565    ASL68961.1    MG021452    AVV62545.1    MK679660    QCC20722.1   

Proteomes

UP000112279    UP000108469    UP000180345    UP000160415    UP000096281    UP000096442    + More
UP000096629    UP000096875    UP000097149    UP000098933    UP000101567    UP000101873    UP000102018    UP000102966    UP000103178    UP000104220    UP000104540    UP000105272    UP000105311    UP000105499    UP000106595    UP000108647    UP000109122    UP000109494    UP000109666    UP000110836    UP000112022    UP000112171    UP000112306    UP000113143    UP000113724    UP000115322    UP000115369    UP000115754    UP000117251    UP000118563    UP000119183    UP000119765    UP000120625    UP000120697    UP000121965    UP000122049    UP000123963    UP000125198    UP000125629    UP000126763    UP000127508    UP000127946    UP000128076    UP000128186    UP000128651    UP000128896    UP000129370    UP000129433    UP000130711    UP000131256    UP000131416    UP000134122    UP000136957    UP000138672    UP000139500    UP000140430    UP000140498    UP000140611    UP000142239    UP000143263    UP000144449    UP000144472    UP000144909    UP000145271    UP000146591    UP000146604    UP000147342    UP000148810    UP000149043    UP000149108    UP000149341    UP000151455    UP000151795    UP000151999    UP000152218    UP000152659    UP000154518    UP000158466    UP000158935    UP000159306    UP000159930    UP000160534    UP000161450    UP000162302    UP000163035    UP000163895    UP000165701    UP000167218    UP000167295    UP000169572    UP000170030    UP000170921    UP000172734    UP000173175    UP000174054    UP000174176    UP000174530    UP000174558    UP000108564    UP000113235    UP000114746    UP000122810    UP000143877    UP000149520    UP000155291    UP000156767    UP000171868    UP000114773    UP000157492    UP000171516    UP000168352    UP000112550    UP000117213    UP000124793    UP000126955    UP000129301    UP000139687    UP000142730    UP000155319    UP000159414    UP000159793    UP000161712    UP000172503    UP000135646    UP000120438    UP000135014    UP000145741    UP000148657    UP000144056    UP000147538    UP000171389    UP000171892    UP000119223    UP000173448    UP000104075    UP000153269    UP000161565    UP000098431    UP000128936    UP000151733    UP000134703    UP000157238    UP000140819    UP000100765    UP000104003    UP000112676    UP000113762    UP000116785    UP000124216    UP000136645    UP000137287    UP000144709    UP000153346    UP000156579    UP000159190    UP000175153    UP000145931    UP000124656    UP000101546    UP000095937   

ProteinModelPortal

K4L9K1   M4T791   A0A291I601   A0A140HF82   A0A2P1IT70   M1S904   + More
R9UNW8   A0A1W5LGP6   A0A411PBI5   A0A2P1IT59   A0A2P1IT57   W6A8Z4   A0A0U2GLJ8   A0A411PBF8   A0A2I2MQI0   A0A2P1ITB9   A0A2D0Y518   A0A385AJW8   T2B9U9   A0A2D0Y8J4   A0A385AJY3   A0A291I605   A0A1L2E0K4   A0A068EQ54   A0A411PBL4   A0A411PBJ8   A0A0U2GPC1   A0A0U2GMC7   A0A0S3IV87   W6A0C3   A0A0U2GM99   A0A291I6I5   A0A0U2GMT4   A0A0U2GKV1   A0A023W0Q3   A0A1B0V2R3   A0A0U2GL69   A0A1L2E0T6   A0A0U2GQ91   A0A0U2GLY8   A0A0A0QJF3   A0A075Q6H0   A0A2R2YRH9   A0A5H2WYZ6   A0A023YAC5   A0A2I6PIX0   A0A2I6PIX7   A0A2R4KP81   A0A2I4R8R2   U5LR23   U5LNP4   A0A2I4R8Z1   A0A2R4KP95   A0A4D6G1H4  

KEGG

vg:19910005    

From MSLVP

Single-Pass Membrane

Length:

112

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

1.54302

Exp number, first 60 AAs:

0.12986

Total prob of N-in:

0.06846

outside

1  -  112