Strain

USA_BAT_2006_NC_022103 (Region: USA: Boulder County, CO;  Strain: Bat coronavirus CDPHE15/USA/2006, complete genome.;  Date: 2006)

Gene

non-structural protein 3

Description

Annotated in NCBI,  non-structural protein 3

Location

NC_022103(+):24647-25324

GenBank Accession

YP_008439203.1

CDS

ATGTTTCTTGGACTTTTCCAGTATACAATTAACTCTGCCATCAAAGATAGTATCGCTAAGAGCAATTTGTCTCTCAGCGATGCTGTTGTTGTTGACCAGCAGCTAGAGCCAGTTAGGCAATTTTCTATTGCTTCTGGCTTTTTCTTTACCAGTGTGTTTGTGATTTACTTCACACTGTTTAAGGCGTCTACTTTTAGACGTAACCTACTACTACTACTTGCACGCTTTCTTGTAGTCGTGGTTTATTGTCCATTGTTATTTTACTTTGGATGTCATTTAGATGGTTCATTTATTTTGTTGACCATCTTTGCCAGACTTTTATATGTCTGTTACTATGCCTGGCGTTACAAGTCCATTCAATTTGTTGTGCTCAACACAACTACACTAGCTTTTGTCAACGGTAAGTGCACTTATTATGCTAATGAGCCATTCTTCACTTTTGAGGGTGGTGATCATTACATTAAATTGGGTGAGTATTATGTCCCATTTGTGGACAGGAACTCCCTTTATGTTGCACTTCGAGGAAAGTTTGAGGAGGATGTCTATCTGTCTCGTAGTATCGAGCTGTTTAATGGACACTTTCTCTATGTCTTTACTCGGCAGCAAGTTGTCGGCATTGTAAATTCTAATTTTACAGATGTTCAACTCGACGAACTTGAATATGCTTCAGCTAGTTGA

Protein

MFLGLFQYTINSAIKDSIAKSNLSLSDAVVVDQQLEPVRQFSIASGFFFTSVFVIYFTLFKASTFRRNLLLLLARFLVVVVYCPLLFYFGCHLDGSFILLTIFARLLYVCYYAWRYKSIQFVVLNTTTLAFVNGKCTYYANEPFFTFEGGDHYIKLGEYYVPFVDRNSLYVALRGKFEEDVYLSRSIELFNGHFLYVFTRQQVVGIVNSNFTDVQLDELEYASAS

Uniprot

S5ZIX9   A0A220YLL7   A0A0U3HQW7   A0A0U3HJ07   K7WB43   A0A286R3Q8   + More
A0A5J6VCX6   A0A0U1VEK2   A0A0U3RFS3   A0A1I9S195   S5MEE6   A0A411NPH9   A0A411NPC3   A0A411NPC0   A0A411NPD4   D3XNW4   A0A0U3T7Q1   A0A097I537   A0A0U3SB16   A0A5J6VDZ1   G9JWF4   A0A0U1YG34   A0A0B5INN1   L0CLX1   A0A0A0U8R3   A0A0C5AYN0   A0A1D8MIN9   A0A172PC16   A0A1Y0D9J8   A0A2U9AUR6   A0A411NPF9   A0A411NPF1   A0A0U3S4J6   E5LPB8   A0A0U1YIX8   A0A481XW37   X5CC42   B5A255   A0A190LBQ0   E5LPD2   E5LPB5   A0A172PC13   A0A0U1YH23   D3XNW8   L7Y6A8   A0A411NPH4   A0A411NPJ0   A0A411NPC1   A0A411NPK3   A0A411NPC8   A0A411NPJ1   A0A411NPK4   A0A411NPG1   A0A411NPI9   A0A411NPL8   A0A411NPB7   A0A411NPJ4   A0A411NPF5   A0A411NPH6   A0A411NPK5   A0A411NPM8   A0A411NPA8   A0A075M1B8   A7UG22   A0A411NPE0   A0A411NPC6   A0A411NPE9   A0A411NPF7   A0A411NPI6   A7LKV1   A0A097I545   I3QJZ9   A0A5K1KB86   L7Y4P9   E5LPC0   A0A481XUS1   A0A221ZTM6   A0A411NPJ9   A0A411NPE4   A0A068BFX9   I3QK01   A0A411NPE6   A0A411NPG9   A0A411NPH5   A0A411NPE5   A0A411NPD8   A0A411NPF3   A0A411NPK9   A0A411NPF2   A0A411NPF0   A0A411NPD9   A0A411NPJ5   A0A5J6VD88   A0A5K1KB37   A0A219TU70   A0A190LBM7   A0A411NPI2   A0A411NPJ7   A0A411NPI4   A0A411NPJ6  

Pubmed

28840816    23166239    23969052    20544234    22843324    25694517    + More
21210162    24818713    27178127    25125639    26112783    17932736    22532530    23151819   

EMBL

KF430219    AGT21334.1    KY799179    ASL24652.1    KT388424    ALV66176.1    + More
KT388422    KT388423    KT388426    KT388427    MK392335    ALV66174.1    ALV66175.1    ALV66178.1    ALV66179.1    QBM00062.1    JX647847    KT388428    KT388429    KT388432    KT388433    MH726387    AFW98999.1    ALV66180.1    ALV66181.1    ALV66184.1    ALV66185.1    QCQ19949.1    MF577027    ASV51732.1    MK656489    MK656490    QFG71752.1    QFG71753.1    KJ857447    AJD09570.1    KT388425    ALV66177.1    KU977493    AOZ60335.1    KF384500    AGR51643.1    MH744171    QBF53840.1    MH744170    QBF53839.1    MH744173    QBF53842.1    MH744172    QBF53841.1    GU372735    GU372741    MH006960    MH006962    MH006963    ADC67064.1    ADC67070.1    AVU05432.1    AVU05446.1    AVU05453.1    KT388434    ALV66186.1    KM048298    AIT56231.1    KT388430    ALV66182.1    MK656494    QFG71757.1    JN980697    JQ027024    JQ027025    JQ027029    JQ723733    KM609204    MH708895    AEW22947.1    AFD23296.1    AFD23297.1    AFD23301.1    AFJ54355.1    AJP67403.1    AYL64493.1    KJ857448    AJD09571.1    KM890281    AJF94315.1    JX880081    AGA16505.1    KM213252    AIW39677.1    KP455971    AJL35184.1    KU836638    AOV85635.1    KX010469    AND65686.1    KY928065    ART84251.1    MF522838    AWO81894.1    MH744202    QBF53871.1    MH744203    QBF53872.1    KT388431    ALV66183.1    HQ537440    ADQ27456.1    KJ857430    AJD09553.1    MH580585    QBK46452.1    KJ196348    KX580953    AHW40031.1    AQK38169.1    EU792474    ACF23008.1    KP281650    KP281651    AKA64557.1    AKA64558.1    HQ537454    ADQ27470.1    HQ537437    MF737355    ADQ27453.1    ASW30995.1    KX010467    AND65684.1    KJ857441    AJD09564.1    GU372739    ADC67068.1    KC120789    AGD93111.1    MH744218    QBF53887.1    MH744244    QBF53913.1    MH744162    QBF53831.1    MH744248    QBF53917.1    MH744184    QBF53853.1    MH744245    QBF53914.1    MH744246    QBF53915.1    MH744214    QBF53883.1    MH744181    QBF53850.1    MH744237    QBF53906.1    MH744163    QBF53832.1    MH744236    QBF53905.1    MH744205    QBF53874.1    MH744220    QBF53889.1    MH744219    QBF53888.1    MH744247    QBF53916.1    MH744158    QBF53827.1    KJ960178    KJ960179    KR610993    KR610994    AIF73530.1    AKH45339.1    EU054929    HQ537439    HQ537441    HQ537448    HQ537455    JN825712    JQ023161    JQ664298    KC294277    MK032691    ABS89138.1    ADQ27455.1    ADQ27457.1    ADQ27464.1    ADQ27471.1    AFC98508.1    AFE85963.1    AFK09781.1    AFZ85197.1    QBO24664.1    MH744186    QBF53855.1    MH744168    QBF53837.1    MH744167    QBF53836.1    MH744169    QBF53838.1    MH744230    QBF53899.1    EU031893    ABS72124.1    KM048308    AIT56241.1    JQ664302    KX852322    KX852331    KX852332    KX852333    KX852334    KX852335    AFK09785.1    ASK39728.1    ASK39737.1    ASK39738.1    ASK39739.1    ASK39740.1    ASK39741.1    MH726402    QCQ20039.1    KC120790    AGD93112.1    HQ537442    HQ537444    ADQ27458.1    ADQ27460.1    MH580569    MH580583    MH580584    MH580586    MK690502    QBK46436.1    QBK46450.1    QBK46451.1    QBK46453.1    QER78628.1    MF346935    ASO67378.1    MH744191    QBF53860.1    MH744190    QBF53859.1    KJ646563    AIC82370.1    JQ664304    AFK09787.1    MH744188    QBF53857.1    MH744212    QBF53881.1    MH744189    QBF53858.1    MH744195    QBF53864.1    MH744194    QBF53863.1    MH744200    QBF53869.1    MH744201    QBF53870.1    MH744192    QBF53861.1    MH744196    QBF53865.1    MH744193    QBF53862.1    MH744209    QBF53878.1    MK656484    MK656485    MK656486    QFG71747.1    QFG71748.1    QFG71749.1    MH726384    QCQ19931.1    KT346372    ANV78631.1    KP281646    AKA64553.1    MH744226    QBF53895.1    MH744242    QBF53911.1    MH744233    QBF53902.1    MH744240    QBF53909.1   

Proteomes

UP000174423    UP000128510    UP000150256    UP000157500    UP000129155    UP000102013    + More
UP000107040    UP000137179    UP000150912    UP000122353    UP000133157   

Pfam

PF03053   Corona_NS3b

Interpro

IPR004293   Coronavirus_Orf3b

ProteinModelPortal

S5ZIX9   A0A220YLL7   A0A0U3HQW7   A0A0U3HJ07   K7WB43   A0A286R3Q8   + More
A0A5J6VCX6   A0A0U1VEK2   A0A0U3RFS3   A0A1I9S195   S5MEE6   A0A411NPH9   A0A411NPC3   A0A411NPC0   A0A411NPD4   D3XNW4   A0A0U3T7Q1   A0A097I537   A0A0U3SB16   A0A5J6VDZ1   G9JWF4   A0A0U1YG34   A0A0B5INN1   L0CLX1   A0A0A0U8R3   A0A0C5AYN0   A0A1D8MIN9   A0A172PC16   A0A1Y0D9J8   A0A2U9AUR6   A0A411NPF9   A0A411NPF1   A0A0U3S4J6   E5LPB8   A0A0U1YIX8   A0A481XW37   X5CC42   B5A255   A0A190LBQ0   E5LPD2   E5LPB5   A0A172PC13   A0A0U1YH23   D3XNW8   L7Y6A8   A0A411NPH4   A0A411NPJ0   A0A411NPC1   A0A411NPK3   A0A411NPC8   A0A411NPJ1   A0A411NPK4   A0A411NPG1   A0A411NPI9   A0A411NPL8   A0A411NPB7   A0A411NPJ4   A0A411NPF5   A0A411NPH6   A0A411NPK5   A0A411NPM8   A0A411NPA8   A0A075M1B8   A7UG22   A0A411NPE0   A0A411NPC6   A0A411NPE9   A0A411NPF7   A0A411NPI6   A7LKV1   A0A097I545   I3QJZ9   A0A5K1KB86   L7Y4P9   E5LPC0   A0A481XUS1   A0A221ZTM6   A0A411NPJ9   A0A411NPE4   A0A068BFX9   I3QK01   A0A411NPE6   A0A411NPG9   A0A411NPH5   A0A411NPE5   A0A411NPD8   A0A411NPF3   A0A411NPK9   A0A411NPF2   A0A411NPF0   A0A411NPD9   A0A411NPJ5   A0A5J6VD88   A0A5K1KB37   A0A219TU70   A0A190LBM7   A0A411NPI2   A0A411NPJ7   A0A411NPI4   A0A411NPJ6  

PDB

1H43     E-value=0.452011,     Score=74