Strain

CHINA_BAT_2013_NC_028814 (Region: China;  Strain: BtRf-AlphaCoV/HuB2013, complete genome.;  Date: 2013)

Gene

hypothetical protein ORF3

Description

Annotated in NCBI,  hypothetical protein ORF3

Location

NC_028814(+):24338-25027

GenBank Accession

YP_009199791.1

Full name

Non-structural protein 3      

Alternative Name

Accessory protein 3a

CDS

ATGTTTCTTGGGCTTTTTGAAAGTTCAATGGAGGCAGCTATTGCTAATGGTTTCAATATACCACCTAACGAAGTTGAAGAAATACTGGATGTAATCAAACCAGCTAGACAAACAATTTCAATTGCTAGCTTTTTGCTCTCCAGTGTTTTTGTGACTTGGTTTGCATTGTACAAAGCCTCTTGTTTCAGAACAAATTGTGCACTTTTTGCCTTGCGCGTTTGCACTTTGCTGTTGTACACACCAATTTTGGTGTTTTTCAACTCTTACATTGACGCAGTTGTTGTAGCTTGTTCTCTAACTATACGTTTTGCTTATCTGGGCTATTACAGTTACAAGTACAAAAGCTTTTCTTTTCTGGTGTTAAACACCAGTAAAGTGGCTTTTGTGAATGGGAAATTTTGGTATTATGATGAGTCACCTTATGTTGTGCTTTGTGGTGGTGATCACCATGTGCAATTGGGTGAGTACATGATACCTTTTGCTGATTCAAATGAGTTGTACGTTGCTTTGCGTGGAACTACAGAAGATGATGTACCTTTGTCCCGTAAAGTTGAAATGATGAACGGTGCTTTCATCTACATATTTGCTCGTGAACCTTGTGTTGGCATTGTAAATATGTCATTTAAAGAAACTCAACTTGACGAGGACTTAACCTTTATTACACTTCACAATGTTGACATTAGTCAATGA

Protein

MFLGLFESSMEAAIANGFNIPPNEVEEILDVIKPARQTISIASFLLSSVFVTWFALYKASCFRTNCALFALRVCTLLLYTPILVFFNSYIDAVVVACSLTIRFAYLGYYSYKYKSFSFLVLNTSKVAFVNGKFWYYDESPYVVLCGGDHHVQLGEYMIPFADSNELYVALRGTTEDDVPLSRKVEMMNGAFIYIFAREPCVGIVNMSFKETQLDEDLTFITLHNVDISQ

Miscellaneous

Bat coronavirus 512/2005 is highly similar to porcine epidemic diarrhea virus (PEDV).

Keywords

Host membrane   Membrane   Reference proteome   Transmembrane   Transmembrane helix  

Feature

chain  Non-structural protein 3

Uniprot

A0A0U1WHE2   A0A0U1WHG6   F1DAX7   A0A482JZU4   A0A4Y5QL67   A0A482K3B3   + More
F1DB21   B1PHK3   A0A0U1WHD4   A0A0U1UZ22   A0A0U1WHC3   A0A0U1UZB9   A0A482JX61   K4JZ82   K4K2S1   K4K225   K4KCQ8   F1DB15   K4K1W1   A0A220YLL7   S5ZIX9   A0A3G3NGF5   A0A3G3NH43   A0A3G3NGZ1   A0A3G3NGT8   A0A3G3NGG5   A0A3G3NGE6   A0A3G3NHL5   A0A3G3NGI5   A0A3G3NGX3   A0A3G3NHB8   A0A1L2KGC7   A0A3G3NGJ8   A0A3G3NGZ8   A0A3G3NGW6   A0A219TU70   A0A3G3NHL9   A0A3G3NH25   A0A3G3NGB2   A0A3G3NHK5   A0A3G3NHP3   Q0Q465   A0A3G3NHE7   U3M6V4   A0A411NPD3   A0A160EDC3   U6A623   A0A1L2KGC6   Q06XP5   Q06XP2   Q06XP8   Q06XP3   Q06XP6   Q06XP4   Q06XP7   Q06XP9   Q06XP1   A0A5B9BGU4   U3RJK5   H9EJ24   Q6Q1S1   H9EJ59   E5LPC0   A0A0U1VEK2   A0A4D6NYX8   A0A1Y0EV10   H9EJ52   A0A482F7H2   A0A097I537   A0A097I545   H9EJ66   D3XNW4   A0A286R3Q8   D3XNW8   A0A411NPG6   U3M6Q9   U3M7U3   A0A0A0U8R3   A0A172PC13   A0A220T0U2   U3RGM6   H9EJA1   H9EJV6   A0A1V0PL03   S5MEE6   U3M698   A0A411NPJ9   A0A411NPE4   H6WQB7   A0A0K1RL86   A0A190LBQ0   A0A068BFX9   A0A1D8MIN9   L7Y6A8   A0A190LBJ8   A0A1P7ZRL6   A0A411NPH9   A0A411NPC3   A0A411NPC0   A0A411NPD4  

Pubmed

19239771    22561208    31067830    18420807    27125516    22933277    + More
28840816    16840328    17054987    24292967    22837419    22879617    27799635    29741740    15034574    21210162    31350613    20544234    23969052    22354946    27178127    28095455   

EMBL

KJ473807    AIA62253.1    KJ473810    AIA62272.1    HQ728480    ADX59452.1    + More
MG916902    MG916903    QBP43269.1    QBP43280.1    MK720945    MK720946    QCX35168.1    QCX35179.1    MG916901    QBP43257.1    HQ728486    ADX59496.1    EU420139    ACA52172.1    KJ473799    AIA62228.1    KJ473798    AIA62221.1    KJ473797    AIA62213.1    KJ473800    AIA62235.1    MG916904    QBP43291.1    JQ989266    JQ989267    JQ989269    AFU92071.1    AFU92079.1    AFU92096.1    JQ989270    AFU92105.1    JQ989272    JQ989273    AFU92123.1    AFU92132.1    JQ989271    AFU92114.1    HQ728485    ADX59489.1    JQ989268    AFU92087.1    KY799179    ASL24652.1    KF430219    AGT21334.1    MH687937    MH687961    MH687966    AYR18419.1    AYR18556.1    AYR18586.1    MH687943    MH687956    AYR18456.1    AYR18526.1    MH687938    MH687944    MH687955    MH687958    MH687960    MH687965    AYR18425.1    AYR18462.1    AYR18520.1    AYR18538.1    AYR18550.1    AYR18580.1    MH687957    AYR18532.1    MH687935    AYR18407.1    MH687939    AYR18431.1    MH687950    AYR18494.1    MH687942    AYR18449.1    MH687951    AYR18500.1    MH687936    MH687959    AYR18413.1    AYR18544.1    KY073745    APD51484.1    MH687940    AYR18437.1    MH687967    AYR18592.1    MH687962    AYR18562.1    KT346372    ANV78631.1    MH687949    AYR18488.1    MH687952    AYR18506.1    MH687934    AYR18401.1    MH687946    AYR18474.1    MH687945    MH687948    MH687954    MH687963    MH687964    AYR18468.1    AYR18482.1    AYR18514.1    AYR18568.1    AYR18574.1    DQ648858    MH687941    AYR18443.1    KF530113    AGT51388.1    MH744180    QBF53849.1    KU641649    ANB44384.1    KF495659    KF495663    AHA15401.1    AHA15405.1    KY073746    APD51492.1    DQ462776    ABE73433.1    DQ462779    ABE73436.1    DQ462773    ABE73430.1    DQ462778    ABE73435.1    DQ462775    ABE73432.1    DQ462777    ABE73434.1    DQ462774    ABE73431.1    DQ462772    ABE73429.1    DQ462780    ABE73437.1    MK334045    QED88027.1    KF476056    AGX01600.1    JQ765563    JQ765564    JQ765565    JQ765566    JQ765567    JQ765571    JQ765572    JQ765574    JX104161    JX524171    JX504050    KF530104    KF530106    KF530108    KF530109    KF530110    KF530112    KF530114    KT266906    KT381875    KU521535    KX179500    KY674915    KY674916    KY554967    KY554969    KY554971    KY829118    MG428699    MG428700    MG428701    MG428702    MG428703    MG428704    MG428705    MG428706    MG428707    MN026166    MK334044    MK334046    MK334047    AFD98751.1    AFD98758.1    AFD98765.1    AFD98772.1    AFD98779.1    AFD98807.1    AFD98814.1    AFD98828.1    AFO70498.1    AFQ55885.1    AFV53149.1    AGT51325.1    AGT51339.1    AGT51353.1    AGT51360.1    AGT51367.1    AGT51381.1    AGT51395.1    AKT07953.1    ALJ53432.1    ANU06085.1    APF29072.1    ARB07400.1    ARB07407.1    ARE29964.1    ARE29976.1    ARE29988.1    ARK08628.1    AWK59932.1    AWK59938.1    AWK59944.1    AWK59950.1    AWK59956.1    AWK59962.1    AWK59968.1    AWK59974.1    AWK59980.1    QDH43735.1    QED88020.1    QED88034.1    QED88041.1    AY567487    DQ445911    DQ445912    JQ765569    AFD98793.1    HQ537442    HQ537444    ADQ27458.1    ADQ27460.1    KJ857447    AJD09570.1    MH909803    QCE31481.1    KY983586    ARU07595.1    JQ765568    JQ765573    AFD98786.1    AFD98821.1    MK032689    MK482396    MK482397    QBO24652.1    QDZ36663.1    QDZ36669.1    KM048298    AIT56231.1    KM048308    AIT56241.1    JQ765570    AFD98800.1    GU372735    GU372741    MH006960    MH006962    MH006963    ADC67064.1    ADC67070.1    AVU05432.1    AVU05446.1    AVU05453.1    MF577027    ASV51732.1    GU372739    ADC67068.1    MH744179    QBF53848.1    KF530107    AGT51346.1    KF530111    AGT51374.1    KM213252    AIW39677.1    KX010467    AND65684.1    KX852323    ASK39729.1    KF476060    KF476061    AGX01604.1    AGX01605.1    JQ765575    AFD98835.1    JQ771056    AFD64752.1    KY554968    KY554970    ARE29970.1    ARE29982.1    KF384500    AGR51643.1    KF530105    MK334043    AGT51332.1    QED88013.1    MH744191    QBF53860.1    MH744190    QBF53859.1    JQ282909    JQ027020    JQ027021    JQ027022    JQ027028    AFB77235.1    AFD23292.1    AFD23293.1    AFD23294.1    AFD23300.1    KR809885    AKV62620.1    KP281650    KP281651    AKA64557.1    AKA64558.1    KJ646563    AIC82370.1    KU836638    AOV85635.1    KC120789    AGD93111.1    KP281615    KP281636    KP281637    KU977496    AKA64522.1    AKA64543.1    AKA64544.1    AOZ60338.1    KU363122    AMK69969.1    MH744171    QBF53840.1    MH744170    QBF53839.1    MH744173    QBF53842.1    MH744172    QBF53841.1   

Proteomes

UP000106394    UP000144177    UP000143524    UP000135768    UP000110898    UP000106776    + More
UP000126502    UP000119818    UP000126615    UP000132096    UP000155419    UP000112496    UP000126962    UP000162430    UP000123997    UP000174423    UP000277178    UP000113079    UP000106901    UP000098690    UP000103541    UP000105969    UP000108941    UP000125140    UP000129674    UP000134798    UP000136929    UP000140530    UP000141321    UP000141634    UP000143818    UP000144638    UP000145724    UP000146557    UP000151840    UP000158277    UP000162862    UP000167796    UP000173136    UP000008573    UP000115484    UP000138462    UP000130385    UP000100468    UP000168590    UP000151180    UP000174240    UP000153644    UP000110792    UP000150256    UP000171901    UP000123112    UP000117357   

Pfam

PF03053   Corona_NS3b

Interpro

IPR004293   Coronavirus_Orf3b

ProteinModelPortal

A0A0U1WHE2   A0A0U1WHG6   F1DAX7   A0A482JZU4   A0A4Y5QL67   A0A482K3B3   + More
F1DB21   B1PHK3   A0A0U1WHD4   A0A0U1UZ22   A0A0U1WHC3   A0A0U1UZB9   A0A482JX61   K4JZ82   K4K2S1   K4K225   K4KCQ8   F1DB15   K4K1W1   A0A220YLL7   S5ZIX9   A0A3G3NGF5   A0A3G3NH43   A0A3G3NGZ1   A0A3G3NGT8   A0A3G3NGG5   A0A3G3NGE6   A0A3G3NHL5   A0A3G3NGI5   A0A3G3NGX3   A0A3G3NHB8   A0A1L2KGC7   A0A3G3NGJ8   A0A3G3NGZ8   A0A3G3NGW6   A0A219TU70   A0A3G3NHL9   A0A3G3NH25   A0A3G3NGB2   A0A3G3NHK5   A0A3G3NHP3   Q0Q465   A0A3G3NHE7   U3M6V4   A0A411NPD3   A0A160EDC3   U6A623   A0A1L2KGC6   Q06XP5   Q06XP2   Q06XP8   Q06XP3   Q06XP6   Q06XP4   Q06XP7   Q06XP9   Q06XP1   A0A5B9BGU4   U3RJK5   H9EJ24   Q6Q1S1   H9EJ59   E5LPC0   A0A0U1VEK2   A0A4D6NYX8   A0A1Y0EV10   H9EJ52   A0A482F7H2   A0A097I537   A0A097I545   H9EJ66   D3XNW4   A0A286R3Q8   D3XNW8   A0A411NPG6   U3M6Q9   U3M7U3   A0A0A0U8R3   A0A172PC13   A0A220T0U2   U3RGM6   H9EJA1   H9EJV6   A0A1V0PL03   S5MEE6   U3M698   A0A411NPJ9   A0A411NPE4   H6WQB7   A0A0K1RL86   A0A190LBQ0   A0A068BFX9   A0A1D8MIN9   L7Y6A8   A0A190LBJ8   A0A1P7ZRL6   A0A411NPH9   A0A411NPC3   A0A411NPC0   A0A411NPD4  

PDB

2I4K     E-value=5.16415,     Score=65