Strain

CHINA_BAT_2012_NC_028824 (Region: China;  Strain: BtRf-AlphaCoV/YN2012, complete genome.;  Date: 2012)

Gene

hypothetical protein ORF3

Description

Annotated in NCBI,  hypothetical protein ORF3

Location

NC_028824(+):23679-24368

GenBank Accession

YP_009200736.1

Full name

Non-structural protein 3      

Alternative Name

Accessory protein 3a

CDS

ATGTTTGGTGGGCTGTTTCAGTTGACACTTGAAGGTGTCGTTAATTCTACAATCAGAGCTGCTAACTTGAATCCTAATGATGAAGCTATCATTAGGGAGCAAGTCCAACCTGCTATTAATGGCGCTAACATGCTTGGTTACATGCTTACTAGCATGTTTGTTTGGTACTTTGCTCTTTACAAGCCTTCTACGAAACGTGGCAGGATTGCTATGTTTGTTTCTAAATTGCTTGTCATCTTTGCTTATGTACCCATTATTATATATTGTGGTGGCATTGTTGATGGCTGCATTATTCTTACAGCAGTAGTTAGTCGGTTACTATATACCAGTTACTATGCTTTCTGTTATAGGAGCTTTGCTTTTGTCTTATTCAATGCCACTACATTATGTTATGTCAATGGTGTGGTTTGTCTTTATACGAGGATTACTAAAGTTGCCGACTATATAGCTTTATATGGTGGTCATCATTATGTTACTCTCGAGACTACACCAGTTGAATTTGCGCACAAAGATTCTCTCTATGTTGCTGTTAGAGGTAAAAAAGAACTTAATCTTTACCTCTCTAAGGCTATGGAGTTATCTGACGGCGCATATATTTATTTATTTACCAATACACCTTTTGTTGGTATCTATAACGCTAATTTTCAGCTACAAGAAACTCAACTAAACTATGTTTCTGAAGATTGTTGA

Protein

MFGGLFQLTLEGVVNSTIRAANLNPNDEAIIREQVQPAINGANMLGYMLTSMFVWYFALYKPSTKRGRIAMFVSKLLVIFAYVPIIIYCGGIVDGCIILTAVVSRLLYTSYYAFCYRSFAFVLFNATTLCYVNGVVCLYTRITKVADYIALYGGHHYVTLETTPVEFAHKDSLYVAVRGKKELNLYLSKAMELSDGAYIYLFTNTPFVGIYNANFQLQETQLNYVSEDC

Miscellaneous

Bat coronavirus 512/2005 is highly similar to porcine epidemic diarrhea virus (PEDV).

Keywords

Host membrane   Membrane   Transmembrane   Transmembrane helix   Reference proteome  

Feature

chain  Non-structural protein 3

Uniprot

A0A0U1WHE7   A0A2P1G6I3   A8JNZ3   A0A2P1G6I9   A0A346LQ16   A8JP01   + More
A0A5B9Y721   A0A3G1II23   A0A2P1G6P6   A0A2P1G6K2   A0A2S1WCF7   A0A2D1BJ51   A0A482JX72   A0A2P1G6J2   A0A1L2KGB1   U3M7U3   H9EJA1   Q06XP5   Q06XP2   Q06XP8   Q06XP3   Q06XP6   Q06XP4   Q06XP7   Q06XP9   Q06XP1   H9EJV6   H9EJ24   Q6Q1S1   A0A1Y0EV10   H9EJ52   H9EJ66   H9EJ59   U3M6Q9   H9EJW8   U3M6V4   U3M698   A0A1V0PL03   H9EJW2   H9EJV3   H9EJV9   H9EJW5   A0A2L0WQG0   F1DB15   A0A5B9BGU4   A0A5B9MVB9   Q6R1L6   B1PHK3   A0A0U1WHD4   A0A0U1UZ22   A0A0U1WHC3   A0A1L2KGC7   A0A0U1UZB9   A0A1L2KGC6   A0A0P0KWE8   A0A220YLL7   F1DB21   A0A3G3NGZ1   A0A5J6DDY7   A0A0P0K0Z4   A0A3G3NGF5   A0A4Y6A773   S5ZIX9   A0A3G3NGZ8   A0A219TU70   A0A3G3NGB2   A0A3G3NHE7   A0A3G3NH43   A0A3G3NHP3   Q0Q465   I3V636   A0A410JAL3   A0A3G3NHL5   A0A5J6VDZ1   A0A3G5BRX4   A0A172PC13   A0A3G3NGT8   A0A3G3NGI5   A0A5J6SUR5   A0A5B9MRB5   A0A3G3NGJ8   A0A1Y0D9J8   A0A1L2KGF2   A0A3G3NHB8   A0A3G3NGG5   A0A3G3NHK5   A0A5K1KB86   K4P7U2   A0A481XUS1   A0A3G3NGX3   A0A411NPI2   A0A411NPJ7   A0A411NPI4   A0A411NPJ6   A0A411NPI0   A0A411NPM5   A0A411NPK7   A0A411NPP2   A0A411NPJ2   A0A411NPK8  

Pubmed

29618817    17617433    31419711    28654418    30171801    31207129    + More
29704627    30103259    22837419    17054987    22879617    27799635    29741740    15034574    19239771    22561208    15073334    18420807    27125516    26378164    28840816    31503522    16840328   

EMBL

KJ473808    AIA62260.1    MF094685    AVM80476.1    EF203064    ABQ57209.1    + More
MF094688    AVM80501.1    MH615810    AXP98440.1    EF203065    EF203066    EF203067    ABQ57217.1    ABQ57225.1    ABQ57233.1    MK977618    QEH62670.1    MF167434    ASK51718.1    MG557844    MF094681    MF094682    MF094683    MF094684    MF769416    MF769417    MF769418    MF769419    MF769420    MF769421    MF769422    MF769423    MF769424    MF769425    MF769426    MF769427    MF769428    MF769429    MF769430    MF769431    MF769432    MF769433    MF769434    MF769435    MF769436    MF769437    MF769438    MF769439    MF769440    MF769441    MF769442    MF769443    MF769444    MG605090    MG605091    MK651076    AVM41571.1    AVM80440.1    AVM80449.1    AVM80458.1    AVM80467.1    AVM80525.1    AVM80534.1    AVM80543.1    AVM80552.1    AVM80561.1    AVM80570.1    AVM80579.1    AVM80588.1    AVM80597.1    AVM80606.1    AVM80615.1    AVM80624.1    AVM80633.1    AVM80642.1    AVM80651.1    AVM80660.1    AVM80669.1    AVM80678.1    AVM80687.1    AVM80696.1    AVM80705.1    AVM80714.1    AVM80723.1    AVM80732.1    AVM80741.1    AVM80750.1    AVM80759.1    AVM80768.1    AVM80777.1    AXY04084.1    AXY04093.1    QDE12098.1    MF094686    AVM80485.1    MG742313    AWJ64264.1    MF370205    ATN23890.1    MH697599    QBP43301.1    MF094687    AVM80493.1    KY073744    APD51476.1    KF530111    AGT51374.1    JQ765575    AFD98835.1    DQ462776    ABE73433.1    DQ462779    ABE73436.1    DQ462773    ABE73430.1    DQ462778    ABE73435.1    DQ462775    ABE73432.1    DQ462777    ABE73434.1    DQ462774    ABE73431.1    DQ462772    ABE73429.1    DQ462780    ABE73437.1    JQ771056    AFD64752.1    JQ765563    JQ765564    JQ765565    JQ765566    JQ765567    JQ765571    JQ765572    JQ765574    JX104161    JX524171    JX504050    KF530104    KF530106    KF530108    KF530109    KF530110    KF530112    KF530114    KT266906    KT381875    KU521535    KX179500    KY674915    KY674916    KY554967    KY554969    KY554971    KY829118    MG428699    MG428700    MG428701    MG428702    MG428703    MG428704    MG428705    MG428706    MG428707    MN026166    MK334044    MK334046    MK334047    AFD98751.1    AFD98758.1    AFD98765.1    AFD98772.1    AFD98779.1    AFD98807.1    AFD98814.1    AFD98828.1    AFO70498.1    AFQ55885.1    AFV53149.1    AGT51325.1    AGT51339.1    AGT51353.1    AGT51360.1    AGT51367.1    AGT51381.1    AGT51395.1    AKT07953.1    ALJ53432.1    ANU06085.1    APF29072.1    ARB07400.1    ARB07407.1    ARE29964.1    ARE29976.1    ARE29988.1    ARK08628.1    AWK59932.1    AWK59938.1    AWK59944.1    AWK59950.1    AWK59956.1    AWK59962.1    AWK59968.1    AWK59974.1    AWK59980.1    QDH43735.1    QED88020.1    QED88034.1    QED88041.1    AY567487    DQ445911    DQ445912    KY983586    ARU07595.1    JQ765568    JQ765573    AFD98786.1    AFD98821.1    JQ765570    AFD98800.1    JQ765569    AFD98793.1    KF530107    AGT51346.1    JQ771060    AFD64764.1    KF530113    AGT51388.1    KF530105    MK334043    AGT51332.1    QED88013.1    KY554968    KY554970    ARE29970.1    ARE29982.1    JQ771058    AFD64758.1    JQ771055    AFD64749.1    JQ771057    AFD64755.1    JQ771059    AFD64761.1    MG772808    AVA26874.1    HQ728485    ADX59489.1    MK334045    QED88027.1    MN306018    QEG03732.1    AY518894    AAS89768.1    EU420139    ACA52172.1    KJ473799    AIA62228.1    KJ473798    AIA62221.1    KJ473797    AIA62213.1    KY073745    APD51484.1    KJ473800    AIA62235.1    KY073746    APD51492.1    KT253271    ALK28788.1    KY799179    ASL24652.1    HQ728486    ADX59496.1    MH687938    MH687944    MH687955    MH687958    MH687960    MH687965    AYR18425.1    AYR18462.1    AYR18520.1    AYR18538.1    AYR18550.1    AYR18580.1    MN065811    QER90705.1    KT253272    ALK28794.1    MH687937    MH687961    MH687966    AYR18419.1    AYR18556.1    AYR18586.1    MG923574    QDE55566.1    KF430219    AGT21334.1    MH687967    AYR18592.1    KT346372    ANV78631.1    MH687934    AYR18401.1    MH687941    AYR18443.1    MH687943    MH687956    AYR18456.1    AYR18526.1    MH687945    MH687948    MH687954    MH687963    MH687964    AYR18468.1    AYR18482.1    AYR18514.1    AYR18568.1    AYR18574.1    DQ648858    JQ710434    AFK73389.1    MK288006    QAR17950.1    MH687950    AYR18494.1    MK656494    QFG71757.1    MG983755    AYW03310.1    KX010467    AND65684.1    MH687957    AYR18532.1    MH687942    AYR18449.1    MK644603    QFG01701.1    MN306040    QEG03749.1    MH687940    AYR18437.1    KY928065    ART84251.1    KY073748    APD51508.1    MH687936    MH687959    AYR18413.1    AYR18544.1    MH687935    AYR18407.1    MH687946    AYR18474.1    MH726402    QCQ20039.1    JX501330    AFV59252.1    MH580569    MH580583    MH580584    MH580586    MK690502    QBK46436.1    QBK46450.1    QBK46451.1    QBK46453.1    QER78628.1    MH687951    AYR18500.1    MH744226    QBF53895.1    MH744242    QBF53911.1    MH744233    QBF53902.1    MH744240    QBF53909.1    MH744234    QBF53903.1    MH744221    QBF53890.1    MH744227    QBF53896.1    MH744241    QBF53910.1    MH744243    QBF53912.1    MH744250    QBF53919.1   

Proteomes

UP000104963    UP000166619    UP000096660    UP000130662    UP000152921    UP000204102    + More
UP000153644    UP000110792    UP000098690    UP000103541    UP000105969    UP000108941    UP000125140    UP000129674    UP000134798    UP000136929    UP000140530    UP000141321    UP000141634    UP000143818    UP000144638    UP000145724    UP000146557    UP000151840    UP000158277    UP000162862    UP000167796    UP000173136    UP000008573    UP000115484    UP000138462    UP000100468    UP000168590    UP000151180    UP000130385    UP000174240    UP000106901    UP000171901    UP000161757    UP000143524    UP000135768    UP000110898    UP000106776    UP000277178    UP000126502    UP000096398    UP000130985    UP000174423    UP000113079   

Pfam

PF03053   Corona_NS3b

Interpro

IPR004293   Coronavirus_Orf3b

ProteinModelPortal

A0A0U1WHE7   A0A2P1G6I3   A8JNZ3   A0A2P1G6I9   A0A346LQ16   A8JP01   + More
A0A5B9Y721   A0A3G1II23   A0A2P1G6P6   A0A2P1G6K2   A0A2S1WCF7   A0A2D1BJ51   A0A482JX72   A0A2P1G6J2   A0A1L2KGB1   U3M7U3   H9EJA1   Q06XP5   Q06XP2   Q06XP8   Q06XP3   Q06XP6   Q06XP4   Q06XP7   Q06XP9   Q06XP1   H9EJV6   H9EJ24   Q6Q1S1   A0A1Y0EV10   H9EJ52   H9EJ66   H9EJ59   U3M6Q9   H9EJW8   U3M6V4   U3M698   A0A1V0PL03   H9EJW2   H9EJV3   H9EJV9   H9EJW5   A0A2L0WQG0   F1DB15   A0A5B9BGU4   A0A5B9MVB9   Q6R1L6   B1PHK3   A0A0U1WHD4   A0A0U1UZ22   A0A0U1WHC3   A0A1L2KGC7   A0A0U1UZB9   A0A1L2KGC6   A0A0P0KWE8   A0A220YLL7   F1DB21   A0A3G3NGZ1   A0A5J6DDY7   A0A0P0K0Z4   A0A3G3NGF5   A0A4Y6A773   S5ZIX9   A0A3G3NGZ8   A0A219TU70   A0A3G3NGB2   A0A3G3NHE7   A0A3G3NH43   A0A3G3NHP3   Q0Q465   I3V636   A0A410JAL3   A0A3G3NHL5   A0A5J6VDZ1   A0A3G5BRX4   A0A172PC13   A0A3G3NGT8   A0A3G3NGI5   A0A5J6SUR5   A0A5B9MRB5   A0A3G3NGJ8   A0A1Y0D9J8   A0A1L2KGF2   A0A3G3NHB8   A0A3G3NGG5   A0A3G3NHK5   A0A5K1KB86   K4P7U2   A0A481XUS1   A0A3G3NGX3   A0A411NPI2   A0A411NPJ7   A0A411NPI4   A0A411NPJ6   A0A411NPI0   A0A411NPM5   A0A411NPK7   A0A411NPP2   A0A411NPJ2   A0A411NPK8  

KEGG

vg:26628035     vg:5741385     vg:30522872     vg:2943500     vg:6020261     vg:16607890     vg:11266519    

GO

GO:0016021  C:integral component of membrane
GO:0033644  C:host cell membrane

From MSLVP

Multi-Pass Membrane

From Uniprot

Host membrane  

Length:

229

Number of predicted TMHs:

3

Exp number of AAs in TMHs:

77.09158

Exp number, first 60 AAs:

21.2409

Total prob of N-in:

0.03030

POSSIBLE N-term signal

sequence

outside

1  -  37

TMhelix

38  -  60

inside

61  -  80

TMhelix

81  -  103

outside

104  -  117

TMhelix

118  -  140

inside

141  -  229