Strain

CHINA_BAT_2014_NC_030886 (Region: China;  Strain: Rousettus bat coronavirus isolate GCCDC1 356, complete genome.;  Date: 2014)

Gene

putative p10 protein

Description

Annotated in NCBI,  putative p10 protein

Location

NC_030886(+):27994-28269

GenBank Accession

YP_009273010.1

CDS

ATGGGTGATTGTAACGGTATGTGGTCCATCTTTGGTAGCACCAATTGCAACTCTGCCAAAAATACGGCGGGCGGCAATTTGGAGGCTACTAATGTTTTGATTACATACGGCCCATATTTGGCAGCTATCGTTGGACTTCTGCTGCTGGTCTGTCTGTTTTACTGCTGTTATCTAAAGTTCAAGGCCTCCCAAGCGAAGAAGACCTACCGCAAGGAGCTTATTTCTTTGACCACGCGTCAGATTTATGCACCACCGCGGGAGATTTCGCATGTCTGA

Protein

MGDCNGMWSIFGSTNCNSAKNTAGGNLEATNVLITYGPYLAAIVGLLLLVCLFYCCYLKFKASQAKKTYRKELISLTTRQIYAPPREISHV

Uniprot

A0A1B3IZF7   A0A2P1M5K5   A0A2P1M5L2   A0A1B3IZH8   A0A2P1M5K8   A0A2P1M5L1   + More
A0A387JU87   D5J9N2   A0A0A1CEY2   A0A1Q2U730   Q9J1B2   B7SNH7   E5RMU0   A0A0N7KVK1   X5CC49   B6RMV3   G3CFX6   G4XG15   G4XG12   A0A0B6VIH8   A0A0F7J2J3   A0A0F7IZI8   A0A1J0M511   A0A0F7J2J6   A0A0F7IZJ1   A0A1J0M537   A7J360   A0A1J0M4U7   A0A1J0M4V7   Q992I4   A7J366   Q9J1B5   A0A0A0QMX9   Q77ND6   Q3HS53   O12285   A0A0F7IZ97   A0A0F7IZA8   A0A0F7J2I9   A0A0F7DGU0   Q3HW11   Q6T535   A0A0A0QNM2   R9RHV2   A0A0E4FGZ4   Q6T537   A3E8K7   A0A0A0QMW1   A3E8L0   A0A0K0MV57   A0A1J0M529   A0A193PPJ8   A3E8K8   A0A1J0M4Z1   A0A1J0M4Y4   A0A059ZXE3   A0A060A166   R9YSX7   A0A1J0M4X1   B1Q184   Q84142   A3E8K6   A0A060A5G5   A3E8J8   A0A060A0W5   A0A060A5Z0  

Pubmed

29500692    30232692    20495835    25497353    11752152    24667794    + More
26558341    24421111    18939639    21795475    22608100    27830770    11883183    26350773    11576636    14517086    16337282    17336355    23846280    17265142    25043587    26586882    23771766    19166062   

EMBL

KX652380    KX652381    KX652383    KX652384    KX652385    KX652386    + More
KX652387    KX652388    KX652389    KX652390    KX652391    KX652392    KX652393    KX652396    KX652397    KX652399    KX652400    KX652402    KU762337    KU762338    AOF47159.1    AOF47163.1    AOF47171.1    AOF47175.1    AOF47179.1    AOF47183.1    AOF47187.1    AOF47191.1    AOF47195.1    AOF47199.1    AOF47203.1    AOF47207.1    AOF47211.1    AOF47223.1    AOF47227.1    AOF47235.1    AOF47239.1    AOF47247.1    AOG30817.1    AOG30827.1    MG762675    MG762676    MG762677    MG762678    MG762679    MG762683    MG762686    MG762687    AVP25413.1    AVP25417.1    MG762680    AVP25418.1    KX652379    KX652382    KX652394    KX652395    KX652398    KX652401    AOF47155.1    AOF47167.1    AOF47215.1    AOF47219.1    AOF47231.1    AOF47243.1    MG762684    MG762685    AVP25422.1    MG762681    MG762682    AVP25419.1    LC389084    BBE49402.1    GU188274    ADE40974.1    KM279386    AIX94446.1    LC110268    BAW99777.1    AF218360    AAF45157.1    EU448334    ACC77635.1    AB521793    BAJ52806.1    AB908284    LC110198    LC110208    LC110218    LC110228    LC110238    LC110248    LC110258    LC110278    BAT21545.1    BAW99693.1    BAW99705.1    BAW99717.1    BAW99729.1    BAW99741.1    BAW99753.1    BAW99765.1    BAW99789.1    KF692095    AHW40452.1    EU252582    ABY78878.1    HM222974    AED99910.1    JF803295    AEP17497.1    JF803294    AEP17494.1    AB914766    BAQ19499.1    KP288867    AKH03111.1    KP288868    AKH03114.1    KX398298    APD15453.1    KP288869    AKH03117.1    KP288870    AKH03120.1    KX398328    APD15489.1    DQ868789    ABI97287.1    KX398248    APD15393.1    KX398258    APD15405.1    AF330703    AAK18186.1    DQ868791    KF741772    KJ476705    ABI97293.1    AIS22935.1    AJA90924.1    AF218359    AAF45154.1    KF741702    AIS22910.1    AF218358    AAF45151.1    DQ198854    ABA43652.1    AF004857    AY395797    AY436596    AY436598    AY436599    AY436600    AY436601    AY436603    AY436605    DQ643974    DQ643975    DQ868790    EF057397    EF057398    KF741732    KF741722    KF741712    KF741762    KY860636    AAB61605.1    AAQ92364.1    AAR10960.1    AAR10962.1    AAR10963.1    AAR10964.1    AAR10965.1    AAR10967.1    AAR10969.1    ABG43114.1    ABG43117.1    ABI97290.1    ABK51290.1    ABK51293.1    AIS22874.1    AIS22886.1    AIS22898.1    AIS22922.1    AWK97794.1    KP288833    AKH03069.1    KP288843    AKH03081.1    KP288863    AKH03105.1    KP288853    AKH03093.1    DQ191363    ABA33820.1    AY436597    AY436604    AAR10961.1    AAR10968.1    KF741742    AIS22862.1    KC183744    AGM48325.1    LC035389    BAQ95393.1    AY436602    AAR10966.1    DQ996607    DQ996609    ABN46971.1    ABN46973.1    KF741752    AIS22850.1    DQ996610    ABN46974.1    KR476804    AKH40955.1    KX398318    APD15477.1    LC164026    BAV18308.1    DQ996608    ABN46972.1    KX398238    KX398288    KX398308    APD15381.1    APD15441.1    APD15465.1    KX398278    APD15429.1    KF872239    KJ700479    KR997925    KR997915    KR997905    AIA57457.1    AID69236.1    ALG03368.1    ALG03380.1    ALG03392.1    KF872231    KF872232    KF872234    KF872238    KF872240    KF872241    KF872242    AIA57433.1    AIA57436.1    AIA57442.1    AIA57454.1    AIA57460.1    AIA57463.1    AIA57466.1    KC865792    AGO32037.1    KX398268    APD15417.1    EU526387    ACB11344.1    L38502    AAA57266.1    DQ996606    ABN46970.1    KF872233    AIA57439.1    DQ995806    ABL96273.1    KF872236    KF872237    AIA57448.1    AIA57451.1    KF872235    AIA57445.1   

Proteomes

UP000203393    UP000163768    UP000109464    UP000246180    UP000246749    UP000119418    + More
UP000100541    UP000109897    UP000110107    UP000119627    UP000121910    UP000125005    UP000131651    UP000133630    UP000172718    UP000246173    UP000111153    UP000122689    UP000102007    UP000125252    UP000104672    UP000246912    UP000173059    UP000128364    UP000115423    UP000246554    UP000246947    UP000104240    UP000120201    UP000136111    UP000140973   

Pfam

PF07204   Orthoreo_P10

Interpro

IPR009854   Orthoreo_P10

ProteinModelPortal

A0A1B3IZF7   A0A2P1M5K5   A0A2P1M5L2   A0A1B3IZH8   A0A2P1M5K8   A0A2P1M5L1   + More
A0A387JU87   D5J9N2   A0A0A1CEY2   A0A1Q2U730   Q9J1B2   B7SNH7   E5RMU0   A0A0N7KVK1   X5CC49   B6RMV3   G3CFX6   G4XG15   G4XG12   A0A0B6VIH8   A0A0F7J2J3   A0A0F7IZI8   A0A1J0M511   A0A0F7J2J6   A0A0F7IZJ1   A0A1J0M537   A7J360   A0A1J0M4U7   A0A1J0M4V7   Q992I4   A7J366   Q9J1B5   A0A0A0QMX9   Q77ND6   Q3HS53   O12285   A0A0F7IZ97   A0A0F7IZA8   A0A0F7J2I9   A0A0F7DGU0   Q3HW11   Q6T535   A0A0A0QNM2   R9RHV2   A0A0E4FGZ4   Q6T537   A3E8K7   A0A0A0QMW1   A3E8L0   A0A0K0MV57   A0A1J0M529   A0A193PPJ8   A3E8K8   A0A1J0M4Z1   A0A1J0M4Y4   A0A059ZXE3   A0A060A166   R9YSX7   A0A1J0M4X1   B1Q184   Q84142   A3E8K6   A0A060A5G5   A3E8J8   A0A060A0W5   A0A060A5Z0  

KEGG

vg:28721353    

GO

GO:0016021  C:integral component of membrane

From MSLVP

Multi-Pass Membrane

Length:

91

Number of predicted TMHs:

1

Exp number of AAs in TMHs:

22.56835

Exp number, first 60 AAs:

22.51061

Total prob of N-in:

0.00370

POSSIBLE N-term signal

sequence

outside

1  -  35

TMhelix

36  -  58

inside

59  -  91