CoVDB Coronavirus Database Go to the lastest version >>
Strain
UGANDA_BAT_2013_NC_034440 (Region: Uganda;  Strain: Bat coronavirus isolate PREDICT/PDF-2180, complete genome.;  Date: 2013)
Gene
ORF5 protein
Description
Annotated in NCBI,  ORF5 protein
GenBank Accession
Full name
Non-structural protein ORF5       + More
Non-structural protein 3d      
Alternative Name
Accessory protein 3d
 

Sequence

CDS
ATGGCTTTTTCTTTAGCCTTGTTCAAGCCTATTTCTTTAGTGCCTGCATTTCCTGAAGCGCATGGTGGTGAACCTGCTCAATTTGCTAATGTTTTCACATGCATTCCTACTGTAGGCTATATAGCCGCACTTACAGTGAATGTGTGCATTTTACCATTACTACTCCTCATTCCACAGGACACTTGCAGGCGTAGTATTTTCAAAACAAGCATCCTTTATGGTTTGTTTGTTTATAATTTTATATTAGCCATTACATTAATTAATGGTGTTTACACTCCCACTGGAGGCACATTAGTTGCCTTCCTGGTAGTGCTTATGATTACTTGGCTTGCTGACAGAGTTAGATTCTGTCTCTTGCTGCGTTCCTATATTCCACTTTTTGACATGAGATCTCATTTTATCCGTGTCAGTACAGTGTCATCATATGGCATGGTTCCAGTTAATCAAACCAAGCCATTATTTATTAGAAACTTTGACCAGCGTTGTCGCTGCTCACGTTGTTTTTATGTGCATTCTTCTCATTATCTAGAGTGCACTTATATTAGCCGTTTTACTAAAGTCAGTCTTGTAGCAGTTACAGACTTTTCTTTAAACGGCATCACTTCTACTGTATTCGTGCCTTCAACGCGCGATTCAGTTCCTCTTCACATAATCGCACCGAGCGTGCTTAGTGTATAA
Protein
MAFSLALFKPISLVPAFPEAHGGEPAQFANVFTCIPTVGYIAALTVNVCILPLLLLIPQDTCRRSIFKTSILYGLFVYNFILAITLINGVYTPTGGTLVAFLVVLMITWLADRVRFCLLLRSYIPLFDMRSHFIRVSTVSSYGMVPVNQTKPLFIRNFDQRCRCSRCFYVHSSHYLECTYISRFTKVSLVAVTDFSLNGITSTVFVPSTRDSVPLHIIAPSVLSV

Summary

Function
Seems to play a role in the inhibition of host innate immune repsonse.
Keywords
Host Golgi apparatus   Host membrane   Host-virus interaction   Inhibition of host innate immune response by virus   Membrane   Reference proteome   Transmembrane   Transmembrane helix   Viral immunoevasion  
Feature
chain  Non-structural protein ORF5
EMBL
KX574227    ARJ34230.1    KJ156876    AHI48676.1    KF600634    AGV08496.1    + More
KT368875    ALA49906.1    KC776174    KJ614529    AGH58722.1    AHY21473.1    MK357908    MK357909    QAT98901.1    QAT98912.1    KX108943    ANI69893.1    MH734114    MH734115    AXP07349.1    AXP07359.1    KY688118    AQZ41315.1    MK129253    AZK15904.1    KC667074    AGG22546.1    JX869059    AFS88940.2    KF186564    KF186566    KF186567    KF186565    KF192507    KF600612    KF600613    KF600620    KF600623    KF600627    KF600628    KF600630    KF600632    KF600636    KF600643    KF600644    KF600645    KF600647    KF600651    KF600652    KF961221    KF961222    KF917527    KF958702    KJ156866    KJ156869    KJ156934    KJ156944    KJ156949    KJ156952    KJ156916    KJ156942    KJ156872    KJ156873    KJ156905    KJ156911    KJ156939    KJ156865    KJ156907    KJ156915    KJ156923    KJ156927    KJ556336    KJ650098    KJ713295    KJ713296    KJ713297    KJ713298    KJ813439    KJ829365    KM015348    KM027255    KM027256    KM027257    KM027258    KM027259    KM027260    KM027261    KM027262    KP223131    KM210277    KM210278    KR011263    KR011264    KR011265    KR011266    KT006149    KT026453    KT026454    KT026455    KT026456    KT029139    KT036372    KT121572    KT121573    KT121574    KT121575    KT121576    KT121577    KT121578    KT121579    KT121580    KT275306    KT275307    KT275308    KT326819    KT368824    KT368825    KT368826    KT368827    KT368828    KT368829    KT368830    KT368831    KT368832    KT368833    KT368834    KT368835    KT368836    KT368837    KT368838    KT368839    KT368840    KT368841    KT368842    KT368843    KT368844    KT368845    KT368846    KT368847    KT368848    KT368849    KT368850    KT368851    KT368852    KT368853    KT368854    KT368855    KT368856    KT368857    KT368858    KT368859    KT368860    KT368861    KT368862    KT368863    KT368864    KT368865    KT368866    KT368867    KT368868    KT368869    KT368870    KT368871    KT368872    KT368873    KT368874    KT368876    KT368877    KT368878    KT368879    KT368880    KT368881    KT368882    KT368883    KT368884    KT368885    KT368886    KT368887    KT368888    KT368889    KT374050    KT374051    KT374052    KT374053    KT374056    KT374057    KT868865    KT868866    KT868867    KT868868    KT868869    KT868871    KT868872    KT868873    KT868874    KT868875    KT868876    KT868877    KT877350    KT877351    KT002193    KU233362    KU233363    KU233364    KT806044    KT806045    KT806046    KT806047    KT806048    KT806049    KT806051    KT806052    KT806054    KT806055    KT861627    KT861628    KU710264    KU710265    KU851860    KU851861    KU851862    KU851863    KU851864    KX034093    KX034094    KX034095    KX034096    KX034097    KX034098    KX034099    KX034100    KX154684    KX154685    KX154686    KX154687    KX154688    KX154689    KX154690    KX154691    KX154692    KX154693    KX154694    KX108944    KX108945    KX108946    KY688119    KY688120    KY688121    KY688122    KY688123    KY688124    KY706245    KY706246    KY706247    KY581693    MF598594    MF598595    MF598597    MF598602    MF598603    MF598606    MF598607    MF598608    MF598609    MF598611    MF598612    MF598613    MF598614    MF598615    MF598616    MF598617    MF598618    MF598620    MF598621    MF598622    MF598625    MF598627    MF598631    MF598632    MF598633    MF598638    MF598644    MF598645    MF598646    MF598648    MF598652    MF598654    MF598657    MF598658    MF598661    MF598662    MF598663    MF598664    MF598665    MF598666    MF598668    MF598669    MF598670    MF598674    MF598675    MF598676    MF598677    MF598678    MF598679    MF598680    MF598682    MF598684    MF598685    MF598686    MF598688    MF598691    MF598692    MF598693    MF598694    MF598697    MF598698    MF598712    MF741837    MF741825    MF741826    MF741828    MF741829    MF741830    MF741831    MF741833    MF741834    MF741835    MF741836    MG011340    MG011341    MG011343    MG011344    MG011345    MG011346    MG011347    MG011348    MG011349    MG011350    MG011351    MG011353    MG011354    MG011355    MG011356    MG011357    MG011358    MG011359    MG011360    MG011361    MG011362    MG366880    MG366881    MG366882    MG366883    MG912595    MG912596    MG912597    MG912598    MG912599    MG912600    MG912601    MG912602    MG912603    MG912604    MG912605    MG912606    MG912607    MG912608    MH013216    MH306207    MH454272    MH371127    MH395139    MG366483    MG520075    MG520076    MG757593    MG757594    MG757596    MG757597    MG757598    MG757600    MG757601    MG757602    MG757603    MG757604    MG757605    MH310910    MH310911    MH310912    MG546330    MG546331    MH822886    MH029552    MK052676    MK039552    MK039553    MK280984    MK462243    MK462244    MK462245    MK462246    MK462247    MK462248    MK462249    MK462250    MK462251    MK462252    MK462253    MK462254    MK462255    MK462256    MK483839    MH259485    MK796425    MN120513    MN120514    MN365232    MN365233    AGN70933.1    AGN70955.1    AGN70966.1    AGN70977.1    AGN72643.1    AGV08383.1    AGV08394.1    AGV08412.1    AGV08430.1    AGV08448.1    AGV08459.1    AGV08471.1    AGV08484.1    AGV08509.1    AGV08528.1    AGV08539.1    AGV08550.1    AGV08562.1    AGV08577.1    AGV08588.1    AHC74093.1    AHC74102.1    AHE78099.1    AHE78110.1    AHI48521.1    AHI48532.1    AHI48576.1    AHI48587.1    AHI48598.1    AHI48609.1    AHI48620.1    AHI48630.1    AHI48656.1    AHI48666.1    AHI48696.1    AHI48706.1    AHI48715.1    AHI48816.1    AHI48822.1    AHI48828.1    AHI48831.1    AHI48835.1    AHN10816.1    AHX71950.1    AHY22528.1    AHY22538.1    AHY22548.1    AHY22558.1    AHZ58505.1    AHZ64061.1    AID50422.1    AIL23916.1    AIL23927.1    AIL23938.1    AIL23949.1    AIL23960.1    AIL23971.1    AIL23982.1    AIL23993.1    AIZ48764.1    AJD81444.1    AJD81455.1    AKI29259.1    AKI29269.1    AKI29279.1    AKI29288.1    AKJ80141.1    AKK52586.1    AKK52596.1    AKK52606.1    AKK52616.1    AKL59405.1    AKL80597.1    AKN24753.1    AKN24762.1    AKN24771.1    AKN24780.1    AKN24789.1    AKN24798.1    AKN24807.1    AKN24816.1    AKN24825.1    AKQ21059.1    AKQ21068.1    AKQ21077.1    AKS48066.1    ALA49345.1    ALA49356.1    ALA49367.1    ALA49378.1    ALA49389.1    ALA49400.1    ALA49411.1    ALA49422.1    ALA49433.1    ALA49444.1    ALA49455.1    ALA49466.1    ALA49477.1    ALA49488.1    ALA49499.1    ALA49510.1    ALA49521.1    ALA49532.1    ALA49543.1    ALA49554.1    ALA49565.1    ALA49576.1    ALA49587.1    ALA49598.1    ALA49609.1    ALA49620.1    ALA49631.1    ALA49642.1    ALA49653.1    ALA49664.1    ALA49675.1    ALA49686.1    ALA49697.1    ALA49708.1    ALA49719.1    ALA49730.1    ALA49741.1    ALA49752.1    ALA49763.1    ALA49774.1    ALA49785.1    ALA49796.1    ALA49807.1    ALA49818.1    ALA49829.1    ALA49840.1    ALA49851.1    ALA49862.1    ALA49873.1    ALA49884.1    ALA49895.1    ALA49917.1    ALA49928.1    ALA49939.1    ALA49950.1    ALA49961.1    ALA49972.1    ALA49983.1    ALA49994.1    ALA50005.1    ALA50016.1    ALA50027.1    ALA50038.1    ALA50049.1    ALA50060.1    ALB08250.1    ALB08261.1    ALB08271.1    ALB08282.1    ALB08315.1    ALB08326.1    ALK80196.1    ALK80206.1    ALK80216.1    ALK80226.1    ALK80236.1    ALK80255.1    ALK80265.1    ALK80275.1    ALK80285.1    ALK80295.1    ALK80305.1    ALK80315.1    ALL26400.1    ALL26413.1    ALM88294.1    ALT66806.1    ALT66817.1    ALT66828.1    ALW82640.1    ALW82651.1    ALW82662.1    ALW82673.1    ALW82684.1    ALW82695.1    ALW82713.1    ALW82724.1    ALW82746.1    ALW82757.1    ALX27236.1    ALX27247.1    AMQ48997.1    AMQ49008.1    AMQ49030.1    AMQ49041.1    AMQ49052.1    AMQ49063.1    AMQ49074.1    ANC28638.1    ANC28649.1    ANC28660.1    ANC28671.1    ANC28682.1    ANC28693.1    ANC28704.1    ANC28715.1    ANF29166.1    ANF29177.1    ANF29188.1    ANF29199.1    ANF29210.1    ANF29221.1    ANF29232.1    ANF29243.1    ANF29254.1    ANF29265.1    ANF29276.1    ANI69904.1    ANI69915.1    ANI69926.1    AQZ41325.1    AQZ41336.1    AQZ41347.1    AQZ41358.1    AQZ41369.1    AQZ41380.1    ASJ26614.1    ASJ26622.1    ASJ26630.1    ASU45800.1    ASU89925.1    ASU89937.1    ASU89959.1    ASU90014.1    ASU90025.1    ASU90058.1    ASU90069.1    ASU90080.1    ASU90091.1    ASU90113.1    ASU90124.1    ASU90135.1    ASU90146.1    ASU90157.1    ASU90168.1    ASU90179.1    ASU90190.1    ASU90212.1    ASU90223.1    ASU90234.1    ASU90267.1    ASU90289.1    ASU90333.1    ASU90344.1    ASU90355.1    ASU90410.1    ASU90476.1    ASU90487.1    ASU90498.1    ASU90520.1    ASU90564.1    ASU90586.1    ASU90619.1    ASU90630.1    ASU90663.1    ASU90674.1    ASU90685.1    ASU90696.1    ASU90707.1    ASU90718.1    ASU90740.1    ASU90751.1    ASU90762.1    ASU90806.1    ASU90817.1    ASU90828.1    ASU90839.1    ASU90850.1    ASU90861.1    ASU90872.1    ASU90894.1    ASU90916.1    ASU90927.1    ASU90938.1    ASU90960.1    ASU90992.1    ASU91003.1    ASU91014.1    ASU91025.1    ASU91058.1    ASU91069.1    ASU91223.1    ASY99782.1    ASY99793.1    ASY99804.1    ASY99824.1    ASY99835.1    ASY99846.1    ASY99857.1    ASY99877.1    ASY99888.1    ASY99899.1    ASY99910.1    ATG84683.1    ATG84694.1    ATG84716.1    ATG84727.1    ATG84738.1    ATG84749.1    ATG84760.1    ATG84771.1    ATG84782.1    ATG84793.1    ATG84804.1    ATG84826.1    ATG84837.1    ATG84848.1    ATG84859.1    ATG84870.1    ATG84881.1    ATG84892.1    ATG84903.1    ATG84914.1    ATG84925.1    ATY74385.1    ATY74396.1    ATY74407.1    ATY74418.1    AVK87322.1    AVK87333.1    AVK87344.1    AVK87355.1    AVK87366.1    AVK87377.1    AVK87388.1    AVK87399.1    AVK87410.1    AVK87421.1    AVK87432.1    AVK87443.1    AVK87454.1    AVK87465.1    AVV61904.1    AWM99586.1    AWU59325.1    AXG21647.1    AXG21658.1    AXN73363.1    AXN73374.1    AXN73385.1    AXN73397.1    AXN73408.1    AXN73430.1    AXN73441.1    AXN73452.1    AXN73474.1    AXN73485.1    AXN73496.1    AXN73507.1    AXN73518.1    AXN73529.1    AXN92242.1    AXN92253.1    AXN92264.1    AYM48035.1    AYO86703.1    AYP10302.1    AYV64553.1    AYV64564.1    AZU90735.1    QBF80459.1    QBF80470.1    QBF80481.1    QBF80492.1    QBF80503.1    QBF80514.1    QBF80525.1    QBF80536.1    QBF80547.1    QBF80558.1    QBF80569.1    QBF80580.1    QBF80591.1    QBF80602.1    QBF80615.1    QCI31473.1    QCQ29079.1    QDP16199.1    QDP16210.1    QEJ82219.1    QEJ82230.1    KC164505    MG923478    MG923479    MG923480    AVN89422.1    AVN89433.1    AVN89444.1    MK564474    MK564475    QBM11740.1    QBM11752.1    KU740200    MG923465    MG923466    MG923467    MG923468    MG923469    MG923473    AMO03405.1    AVN89284.1    AVN89295.1    AVN89306.1    AVN89317.1    AVN89327.1    AVN89367.1    MH432120    AXG21669.1    MH259486    QCI31484.1    KT751244    MF598596    MF598598    MF598599    MF598600    MF598601    MF598605    MF598610    MF598623    MF598626    MF598628    MF598629    MF598630    MF598634    MF598640    MF598642    MF598643    MF598649    MF598650    MF598651    MF598653    MF598655    MF598656    MF598659    MF598660    MF598671    MF598673    MF598683    MF598687    MF598689    MF598690    MF598696    MF598702    MF598707    MF598708    MF598715    MF598717    MF598719    MF598720    MF598721    MF598722    ALR69645.1    ASU89948.1    ASU89970.1    ASU89981.1    ASU89992.1    ASU90003.1    ASU90047.1    ASU90102.1    ASU90245.1    ASU90278.1    ASU90299.1    ASU90311.1    ASU90322.1    ASU90366.1    ASU90432.1    ASU90454.1    ASU90465.1    ASU90531.1    ASU90542.1    ASU90553.1    ASU90575.1    ASU90597.1    ASU90608.1    ASU90641.1    ASU90652.1    ASU90773.1    ASU90795.1    ASU90905.1    ASU90949.1    ASU90970.1    ASU90981.1    ASU91047.1    ASU91113.1    ASU91168.1    ASU91179.1    ASU91255.1    ASU91277.1    ASU91298.1    ASU91308.1    ASU91318.1    ASU91328.1    MG923472    AVN89356.1    KT368890    ALA50071.1    KJ156881    AHI48554.1    MG757595    MG757599    AXN73419.1    AXN73463.1    KT806053    ALW82735.1    KT225476    MF598604    ALD51908.1    ASU90036.1    MF598699    MF598700    MF598701    MF598703    MF598704    MF598705    MF598706    MF598709    MF598710    MF598711    MF598713    MF598714    MF598716    MF598718    ASU91080.1    ASU91091.1    ASU91102.1    ASU91124.1    ASU91135.1    ASU91146.1    ASU91157.1    ASU91190.1    ASU91201.1    ASU91212.1    ASU91234.1    ASU91245.1    ASU91266.1    ASU91288.1    MG011352    ATG84815.1    KT121581    AKN24834.1    MG011342    ATG84705.1    KT374054    KT374055    KU308549    ALB08293.1    ALB08304.1    AML60274.1    KJ650295    KJ650296    KJ650297    KJ713299    KP209312    KJ361499    KJ361500    KJ361501    KJ361502    KP719927    KP719928    KP719929    KP719930    KP719931    KP719932    KP719933    KT156560    KU242423    KU242424    KX108937    KX108938    KX108939    KX108940    KX108942    KY581684    KY581685    KY581687    KY581694    KY581695    KY581698    KY581699    MF598619    MF598635    MF598641    AHX00715.1    AHX00725.1    AHX00735.1    AHY22568.1    AIY60582.1    AIZ74414.1    AIZ74429.1    AIZ74442.1    AJG44062.1    AJG44073.1    AJG44084.1    AJG44095.1    AJG44106.1    AJG44117.1    AJG44128.1    AKM76233.1    ALT66874.1    ALT66884.1    ANI69828.1    ANI69839.1    ANI69850.1    ANI69861.1    ANI69882.1    ASU45700.1    ASU45712.1    ASU45734.1    ASU45811.1    ASU45822.1    ASU45855.1    ASU45866.1    ASU90201.1    ASU90377.1    ASU90443.1    MG923470    MG923471    AVN89337.1    AVN89347.1    MG923474    MG923475    MG923476    MG923477    AVN89378.1    AVN89389.1    AVN89400.1    AVN89411.1    KJ156874    KJ156910    KJ156901    AHI48543.1    AHI48565.1    AHI48686.1    MG923481    AVN89455.1    KP209306    KP209307    KP209308    KP209309    KP209310    KP209311    KP209313    KY673148    KY673149    KY581686    KY581688    KY581689    KY581690    KY581691    KY581692    KY581696    KY581697    KY581700    MF598624    MF598636    MF598637    MF598639    MF598647    MF598667    MF598672    MF598681    MF598695    AIY60522.1    AIY60532.1    AIY60542.1    AIY60552.1    AIY60562.1    AIY60572.1    AIY60592.1    AQZ41289.1    AQZ41300.1    ASU45723.1    ASU45745.1    ASU45756.1    ASU45767.1    ASU45778.1    ASU45789.1    ASU45833.1    ASU45844.1    ASU45877.1    ASU90256.1    ASU90388.1    ASU90399.1    ASU90421.1    ASU90509.1    ASU90729.1    ASU90784.1    ASU90883.1    ASU91036.1    KF745068    AHB33330.1    KJ477102    AHL18095.1    KT156561    AKM76243.1    KC869678    AIG13100.1    KT868870    ALK80245.1    MF593268    ATQ39397.1    MG596802    AUM60018.1    LC469308    BBJ36012.1    MG596803    AUM60028.1    KJ473821    AHY61341.1    KF600622    AGV08424.1    MG021451    AVV62530.1    KX442564    ASL68946.1    KX442565    ASL68957.1    MG021452    AVV62541.1    KJ156933    AHI48843.1    KJ473820    AIA62347.1    EF065511    ABN10897.1    EF065510    ABN10888.1    EF065512    ABN10906.1    EF065509    KC545383    KC545386    AGX27804.1    AGX27815.1    MK679660    QCC20718.1    EF065507    ABN10861.1    EF065506    ABN10852.1    EF065505    DQ648794    EF065508    ABN10870.1    KJ473822    AIA62356.1    KU182965    ANA96043.1   
Proteomes
UP000202992    UP000096281    UP000140819    UP000108469    UP000180345    UP000160415    + More
UP000112279    UP000095864    UP000096442    UP000096875    UP000097149    UP000098431    UP000098933    UP000100765    UP000101567    UP000102098    UP000102966    UP000103178    UP000104003    UP000104075    UP000104220    UP000104540    UP000105311    UP000108030    UP000108564    UP000108647    UP000109122    UP000109494    UP000109666    UP000109767    UP000110604    UP000110836    UP000112022    UP000112306    UP000112550    UP000112676    UP000113143    UP000113235    UP000113724    UP000113762    UP000114620    UP000114746    UP000114773    UP000115322    UP000115754    UP000116785    UP000117213    UP000117251    UP000118244    UP000118772    UP000119223    UP000119765    UP000120083    UP000120438    UP000120697    UP000121965    UP000122049    UP000122810    UP000123963    UP000124216    UP000124793    UP000125198    UP000125629    UP000126763    UP000126955    UP000127508    UP000127946    UP000128184    UP000128186    UP000128651    UP000128896    UP000128936    UP000129370    UP000129433    UP000130711    UP000131256    UP000133615    UP000134122    UP000134703    UP000135014    UP000135429    UP000136645    UP000137287    UP000137346    UP000138672    UP000139500    UP000139687    UP000139800    UP000140430    UP000140498    UP000140611    UP000142239    UP000142730    UP000143263    UP000143877    UP000144056    UP000144449    UP000144472    UP000144709    UP000144909    UP000144938    UP000145271    UP000145741    UP000146144    UP000146591    UP000146604    UP000147538    UP000148100    UP000148657    UP000148810    UP000149043    UP000149108    UP000149341    UP000149520    UP000151455    UP000151733    UP000151795    UP000151999    UP000152659    UP000153269    UP000153346    UP000154518    UP000155291    UP000155319    UP000156579    UP000156767    UP000157238    UP000157492    UP000158466    UP000158935    UP000159190    UP000159306    UP000159414    UP000159793    UP000159930    UP000160534    UP000161565    UP000161712    UP000162302    UP000163035    UP000163895    UP000165587    UP000166310    UP000167218    UP000167575    UP000168352    UP000170921    UP000171389    UP000171516    UP000171868    UP000171892    UP000172503    UP000172734    UP000173175    UP000173448    UP000174054    UP000174558    UP000175153    UP000180346    UP000180347    UP000180348    UP000139997    UP000135646    UP000129301    UP000105272    UP000118563    UP000119183    UP000123861    UP000106595    UP000128076    UP000147342    UP000099376    UP000101873    UP000102018    UP000105499    UP000110818    UP000115369    UP000117128    UP000120625    UP000131416    UP000136957    UP000152218    UP000157628    UP000161450    UP000166654    UP000169572    UP000170030    UP000174176    UP000174530    UP000165701    UP000167295    UP000110817    UP000118636    UP000130850    UP000142709    UP000144516    UP000159028    UP000167954    UP000112171    UP000166519    UP000124558    UP000145931    UP000124656    UP000148908    UP000143769    UP000164987    UP000100668    UP000007451    UP000095937    UP000101546    UP000110642    UP000163538    UP000006574    UP000007449    UP000123539    UP000104899    UP000107989   

Ontologies

Subcellular Location

From MSLVP
Multi-Pass Membrane
From Uniprot
Host membrane  
Host Golgi apparatus  

Topology

Length:
225
Number of predicted TMHs:
3
Exp number of AAs in TMHs:
67.20096
Exp number, first 60 AAs:
22.56984
Total prob of N-in:
0.00474
POSSIBLE N-term signal
sequence
outside
1  -  34
TMhelix
35  -  57
inside
58  -  69
TMhelix
70  -  92
outside
93  -  96
TMhelix
97  -  119
inside
120  -  225
 
 

Population Genetic Test Statistics

Genomic alignment in the CDS region

 
 

Multiple alignment of Orthologues

 
 

Gene Tree

 
 

Orthologous in Strains

Strain Availability Status Gene
CHINA_HS_2019_MN908947    
CHINA_AVIAN_2008_NC_016995    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016991    
CHINA_MURINE_2015_NC_035191    
CANADA_AVIAN_2007_NC_010800    
USA_PIG_2000_NC_038861    
CHINA_AVIAN_2007_NC_011549    
ITALY_PIG_2009_NC_028806    
GERMANY_PIG_2012_LT545990    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016992    
CHINA_BAT_2005_NC_009657    
CANADA_HS_2003_NC_004718    
CHINA_BAT_2014_NC_030886    
CHINA_BAT_2005_NC_018871    
USA_MURINE_2009_NC_012936    
CHINA_RABBIT_2006_NC_017083    
UK_PIG_2000_NC_003436    
ROMANIA_PIG_2015_LT898435    
ROMANIA_PIG_2015_LT898436    
GERMANY_PIG_2015_LT898444    
GERMANY_PIG_2015_LT898414    
GERMANY_PIG_2015_LT898439    
GERMANY_PIG_2015_LT898413    
GERMANY_PIG_2015_LT898412    
GERMANY_PIG_2015_LT898411    
GERMANY_PIG_2015_LT898416    
GERMANY_PIG_2015_LT898443    
GERMANY_PIG_2015_LT898420    
GERMANY_PIG_2015_LT898408    
GERMANY_PIG_2015_LT898423    
GERMANY_PIG_2015_LT898432    
GERMANY_PIG_2015_LT898409    
GERMANY_PIG_2015_LT898425    
GERMANY_PIG_2015_LT898446    
GERMANY_PIG_2014_LT898438    
GERMANY_PIG_2014_LT898440    
GERMANY_PIG_2014_LT900501    
GERMANY_PIG_2014_LT898427    
GERMANY_PIG_2014_LT898415    
GERMANY_PIG_2014_LT898421    
GERMANY_PIG_2014_LT898431    
GERMANY_PIG_2014_LT898410    
GERMANY_PIG_2014_LT900498    
GERMANY_PIG_2014_LT898430    
GERMANY_PIG_1978_LT897799    
GERMANY_PIG_2014_LT898447    
GERMANY_PIG_2014_LT898426    
GERMANY_PIG_2014_LT898417    
GERMANY_PIG_2014_LT900500    
GERMANY_PIG_2014_LT898445    
AUSTRIA_PIG_2015_LT898418    
AUSTRIA_PIG_2015_LT898441    
AUSTRIA_PIG_2015_LT898433    
AUSTRIA_PIG_2015_LT900502    
GERMANY_PIG_2015_LT900499    
BELGIUM_PIG_1980_LT906620    
BELGIUM_PIG_1977_LT905450    
SWITZERLAND_PIG_2003_LT905451    
BELGIUM_PIG_1978_LT906581    
UK_PIG_1987_LT906582    
CHINA_PIG_2009_NC_016990    
CHINA_PIG_2010_NC_039208    
KENYA_BAT_2010_KY073745    
KENYA_BAT_2010_NC_032107    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016994    
EUROPE_MURINE_2004_AY700211    
CHINA_AVIAN_2007_NC_011550    
USA_MURINE_1997_NC_001846    
USA_MURINE_1998_NC_023760    
MID_EAST_HS_2012_NC_019843 Protein
YP_009047208.1
CHINA_AVIAN_2007_NC_016993    
CHINA_MURINE_2013_NC_032730    
USA_HS_2004_AY585228    
NETHERLAND_HS_2004_NC_005831    
CHINA_HS_2004_NC_006577    
EUROPE_HS_2000_NC_002645    
NETHERLAND_FERRET_2010_NC_030292    
JAPAN_FERRET_2013_LC119077    
USA_FELINE_2005_NC_002306    
CHINA_MURINE_2011_NC_034972    
CHINA_AVIAN_2007_NC_016996    
ARABIA_CAMEL_2015_NC_028752    
CHINA_AVIAN_2007_NC_011547    
CHINA_BAT_2012_NC_028824    
CHINA_BAT_2013_NC_028814    
CHINA_BAT_2013_NC_028833    
CHINA_BAT_2011_NC_028811    
USA_BOVIN_2001_NC_003045    
CHINA_MURINE_2012_NC_026011    
GERMANY_ERINACEINAE_2012_NC_022643    
GERMANY_ERINACEINAE_2012_NC_039207    
UK_HS_2012_NC_038294 Protein
YP_007188583.1
AMERICA_WHALE_2007_NC_010646    
CHINA_BAT_2013_NC_025217    
UGANDA_BAT_2013_NC_034440 Protein
YP_009361861.1
CHINA_BAT_2006_NC_009021    
CHINA_BAT_2008_NC_010438    
CHINA_BAT_2006_NC_009020    
CHINA_BAT_2006_NC_009019    
CHINA_BAT_2006_NC_009988    
USA_BAT_2006_NC_022103    
BULGARIA_BAT_2008_NC_014470    
CHINA_BAT_2008_NC_010437    
USA_AVIAN_2004_NC_001451    
Copyright@ 2018-2023    Any Comments and suggestions mail to:  zhuzl@cqu.edu.cn, mg@cau.edu.cn   渝ICP备19006517号

渝公网安备 50010602502065号

In processing...
Login to ASFVdb
Email
Password
Please go to Regist if without an account.
If you have forgotten your password, you can once again Regist an account with a registed or new email.
Change my password
Enter new password
Reenter new password
Regist an account of ASFVdb
It is required that you provide your institutional e-mail address (with edu or org in the domain) as confirmation of your affiliation.
Enter email
Reenter email
First Name
Last Name
Institution
You can directly go to if with an account.
Registraion Success
Your password has been sent to your email.
Please check it and login later.
Welcome to use ASFVdb.