Strain

JAPAN_FERRET_2013_LC119077 (Region: Japan;  Strain: Ferret coronavirus genomic RNA, complete genome, strain: FRCoV4370.;  Date: 2013)

Gene

non-structural protein 7b

Description

Annotated in NCBI,  non-structural protein 7b

Location

LC119077(+):27664-28278

GenBank Accession

BAV31355.1

Full name

Non-structural protein 7b      

Alternative Name

Accessory protein 7b

CDS

ATGTTAATTCTAAGTTTGGTAGTTCTGTCTCTGTTTTCAAATTCCTTAGGGTTAGAAGATGACAAGCATCAACATCCCACATATAACTGGGAAAGGTTAGATTATTTTGAAGGTTCCTACATCGAAGTTGATAAATCTGTGGTTTTATCATTACCACTTGACGCCAAATTACATTGTGGTTTGGTTGATGGTGTTTTGTGCAAATTCCCAGGTTTTGAAGCTGCATATGATGATCATGTAGACTATTATTTAGATGTAGACTCACCTTTCTACAAGTTTGTTGACACCTTCTACGTGTCTAAATTCGTAGATGGTAAGTTTGATAATCGTGCCACTCTGAAGTTTTTACCACGTAAGAGCAAAGATAAGATGCTTGTTATTGGTTGTAGTCTCACTGACCCTTTTCTAGACTTGCCTTTTGGTACCCAAATCTATAATGATGTGGACATGACTCTTAAAGTCGACCATGTGCCTTGCACTAACAGACGGTATTTTATTAAGTACTGTCCTGGTGGTCCCAATCATTTTTGCTTTAAAGATAAATTGGTGGTCAGAAGGTTTAGAGCTTTTTTCCCTGTGTCTAATAATAATAAAATTGAACATGTTGATTTATAA

Protein

MLILSLVVLSLFSNSLGLEDDKHQHPTYNWERLDYFEGSYIEVDKSVVLSLPLDAKLHCGLVDGVLCKFPGFEAAYDDHVDYYLDVDSPFYKFVDTFYVSKFVDGKFDNRATLKFLPRKSKDKMLVIGCSLTDPFLDLPFGTQIYNDVDMTLKVDHVPCTNRRYFIKYCPGGPNHFCFKDKLVVRRFRAFFPVSNNNKIEHVDL

Keywords

Signal  

Feature

chain  Non-structural protein 7b

Uniprot

A0A1B4X978   A0A222UC70   A0A224AW06   D3XGK0   Q20D19   A0A222UC74   + More
D3XGJ2   A0A172B8D1   C3RZS9   C3RZV7   C3RZK5   C3RZT4   C3RZT3   Q27HF6   Q27HR4   E7E043   Q14VC5   B7T079   Q14VC6   Q7T6S6   B7T4C5   E7E034   C3RZH4   Q14VA1   C3S004   Q14VA2   C3RZE5   C3RZE3   A0A0C5CJE3   S6BUM1   A0A0C5CJH8   Q14V91   Q14V96   C3RZI4   C3RZP2   C3RZI3   C3RZJ7   A0A077ERL0   A0A077EX95   D2WXM5   E3W5I7   Q152S8   G8J7H2   Q14VA7   D3KDL1   C3RZN4   S6BFK5   A0A386YIM7   E0AH05   D3KDM2   A0A1Z2WUB9   C3RZX8   C3RZP1   Q14V92   C3RZM8   Q0ZVW8   C3RZJ3   C3RZV2   C3RZJ4   C3RZD3   C3RZE7   C3RZJ6   Q14VC0   Q14V94   C3RZV9   C3RZB3   C3RZF8   C3RZH0   C3RZW6   C3RZD8   C3RZY3   C3RZP3   C3RZJ2   C3RZE4   C3RZG7   C3RZQ3   C3RZN1   C3RZD6   C3RZB4   C3RZB5   C3RZM7   C3RZE6   C3RZQ0   C3RZF9   C3RZD9   C3RZJ9   C3RZN0  

Pubmed

20079778    16499943    19788813    18306032    21481551    22002680    + More
19036814    15177889    25667330    25180686    25150756    22609354    16704791    17275120    22542271    25953186   

EMBL

LC119077    BAV31355.1    KX512809    ASR18943.1    LC215871    BBA21174.1    + More
GU338457    ADD49364.1    DQ340562    ABC70095.1    KX512810    ASR18951.1    GU338456    ADD49355.1    KM347965    AKG92646.1    EU663928    ACI13155.1    EU663958    ACI13183.1    EU663853    ACI13081.1    EU663933    ACI13160.1    EU663932    ACI13159.1    DQ403250    JQ404410    KY063616    KY063617    KY063618    ABD62167.1    AFG19747.1    ASB15746.1    ASB15756.1    ASB15764.1    DQ401031    ABD62165.1    HQ450377    JF682842    ADU17742.1    AEE69330.1    DQ675417    ABG25928.1    EU856362    ACJ63250.1    DQ675416    ABG25927.1    AY342160    EU924791    ACJ64192.1    HQ450376    ADU17733.1    EU663819    ACI13050.1    DQ675441    ABG25952.1    EU664008    ACI13230.1    DQ675440    ABG25951.1    EU663788    ACI13021.1    EU663786    ACI13019.1    KP143508    AJO26991.1    AB781789    BAN67917.1    KP143509    KP143510    KP143511    AJO27001.1    AJO27011.1    AJO27021.1    DQ675451    ABG25962.1    DQ675446    ABG25957.1    EU663829    ACI13060.1    EU663891    ACI13118.1    EU663828    ACI13059.1    EU663844    ACI13073.1    KJ665799    AIL54104.1    KJ665798    AIL54102.1    GQ477367    ADB28915.1    HQ392471    ADO39847.1    DQ648122    ABG25964.1    JN856008    AEQ61975.1    DQ675435    ABG25946.1    GU553361    ADC35469.1    EU663883    ACI13110.1    AB781790    BAN67926.1    MH817484    AYF53101.1    HQ012372    ADL71505.1    GU553362    ADC35480.1    KY292377    ASB16895.1    EU663980    ACI13204.1    EU663890    ACI13117.1    DQ675450    ABG25961.1    EU663877    ACI13104.1    DQ112226    GU146061    KP981644    AAZ91444.1    ADB10857.1    AKA65837.1    EU663840    ACI13069.1    EU663953    ACI13178.1    EU663841    ACI13070.1    EU663776    ACI13009.1    EU663790    ACI13023.1    EU663843    ACI13072.1    DQ675422    ABG25933.1    DQ675448    ABG25959.1    EU663960    ACI13185.1    EU663756    ACI12989.1    EU663802    ACI13034.1    EU663815    ACI13046.1    EU663967    ACI13192.1    EU663781    ACI13014.1    EU663986    ACI13209.1    EU663892    ACI13119.1    EU663839    ACI13068.1    EU663787    ACI13020.1    EU663812    ACI13043.1    EU663902    ACI13129.1    EU663880    ACI13107.1    EU663779    ACI13012.1    EU663757    ACI12990.1    EU663758    ACI12991.1    EU663876    ACI13103.1    EU663789    ACI13022.1    EU663899    ACI13126.1    EU663803    ACI13035.1    EU663782    ACI13015.1    EU663846    ACI13075.1    EU663879    ACI13106.1   

Proteomes

UP000272061    UP000150460    UP000106470    UP000149467    UP000100168    UP000105943    + More
UP000140032    UP000129066    UP000145457    UP000153699    UP000137357    UP000110620    UP000138585    UP000115330   

Pfam

PF03262   Corona_6B_7B

Interpro

IPR004945   Corona_6B_7B

ProteinModelPortal

A0A1B4X978   A0A222UC70   A0A224AW06   D3XGK0   Q20D19   A0A222UC74   + More
D3XGJ2   A0A172B8D1   C3RZS9   C3RZV7   C3RZK5   C3RZT4   C3RZT3   Q27HF6   Q27HR4   E7E043   Q14VC5   B7T079   Q14VC6   Q7T6S6   B7T4C5   E7E034   C3RZH4   Q14VA1   C3S004   Q14VA2   C3RZE5   C3RZE3   A0A0C5CJE3   S6BUM1   A0A0C5CJH8   Q14V91   Q14V96   C3RZI4   C3RZP2   C3RZI3   C3RZJ7   A0A077ERL0   A0A077EX95   D2WXM5   E3W5I7   Q152S8   G8J7H2   Q14VA7   D3KDL1   C3RZN4   S6BFK5   A0A386YIM7   E0AH05   D3KDM2   A0A1Z2WUB9   C3RZX8   C3RZP1   Q14V92   C3RZM8   Q0ZVW8   C3RZJ3   C3RZV2   C3RZJ4   C3RZD3   C3RZE7   C3RZJ6   Q14VC0   Q14V94   C3RZV9   C3RZB3   C3RZF8   C3RZH0   C3RZW6   C3RZD8   C3RZY3   C3RZP3   C3RZJ2   C3RZE4   C3RZG7   C3RZQ3   C3RZN1   C3RZD6   C3RZB4   C3RZB5   C3RZM7   C3RZE6   C3RZQ0   C3RZF9   C3RZD9   C3RZJ9   C3RZN0  

KEGG

vg:27963650    

From MSLVP

Host nucleus. Host cytoplasm.

Length:

204

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.01011

Exp number, first 60 AAs:

0.00502

Total prob of N-in:

0.00704

outside

1  -  204