Strain

NETHERLAND_FERRET_2010_NC_030292 (Region: Netherlands;  Strain: Ferret coronavirus isolate FRCoV-NL-2010, complete genome.;  Date: 2010)

Gene

nsp 7b protein

Description

Annotated in NCBI,  nsp 7b protein

Location

NC_030292(+):27561-28169

GenBank Accession

YP_009256203.1

Full name

Non-structural protein 7b      

Alternative Name

Accessory protein 7b

CDS

ATGTTAATTCTAACTTTAACAGTTCTGTCTCTGTTCTCAAATTCCTTAGGGCAAGAAGATGGCAAGCATCAACATCCCACATACAACTGGGAAAGATTAGAGTATTTTGAAGGTTCCTACATCGAAGTTGATAAATCTGTGGTTTTATCATTACCACTGGACGCCAAATTACATTGTGGTTTGGTTGATGGTGTTTTGTGCAAGTTCCCAGGTTTAGAAGCTGCATATGATGATCATGTAGACTATTATTTAGATGTAGACTCACCTTTCTACAAGTTTGTGGACACCTTCTACGTGGCTAAATTCACAGATGGCAAGTTCGATAATCGTGCCACGCTGAAATTTTTACCACGTAATAGCAAAAACAAGATGCTTGTTATAGGTTGTAGTCTTAATGACCCTTCTTTAGACTTGCCTTTTGGTACCAAAATCTATGATGATATGGATATGACTCTTGAAGTCGACCATGTGCCTTGCACTAACAGACGGTATTTCGTTAAGTACTGTCCTGGTGGTCCCAATCACTTTTGTTTTAAAGATAAATTGGTAGTCAGAAGGTTTAGAGCTTTCTTCCCTGTATCTAATAAAATTGAACATGATGATTTATAA

Protein

MLILTLTVLSLFSNSLGQEDGKHQHPTYNWERLEYFEGSYIEVDKSVVLSLPLDAKLHCGLVDGVLCKFPGLEAAYDDHVDYYLDVDSPFYKFVDTFYVAKFTDGKFDNRATLKFLPRNSKNKMLVIGCSLNDPSLDLPFGTKIYDDMDMTLEVDHVPCTNRRYFVKYCPGGPNHFCFKDKLVVRRFRAFFPVSNKIEHDDL

Keywords

Signal  

Feature

chain  Non-structural protein 7b

Uniprot

A0A172B8D1   A0A222UC70   A0A224AW06   D3XGK0   Q20D19   A0A222UC74   + More
A0A1B4X978   D3XGJ2   A0A0K2SF43   A0A2R4QL28   D9J210   D9J201   H9TEV9   K7XR00   Q04704   Q27HR4   Q27HF6   P36302   B7T4B6   E7E043   E7E034   Q66912   B7T079   A0A0C5CJE3   Q14VC0   A0A0C5CJH8   A0A0C5CJD1   B7T4C5   Q14VA1   Q14VC5   Q14VC6   Q14V95   Q14V93   E3W5I7   Q14VA2   Q14VA7   A0A1Z2WUB9   G8J7H2   A0A077ERJ0   Q0ZVW8   D2WXM5   Q14V91   Q14V92   Q152S8   A0A077EX79   Q14V94   Q14VA9   Q7T6S6   S6BFK5   A0A386YIM7   S6BUM1   Q14V96   A0A077EX95   Q14VB1   C6GHI6   Q66902   C6GHJ7   A0A2H5BX47   A0A125R5J0   Q5DQ86   A0A0K2BMD5   A0A077ERL0   Q14VB5   Q14VB2   Q66909   E0AGX3   D3KDL1   A0A077EX89   G1FEZ4   A0A077EQY2   Q66900   E0AH05   D3KDM2   A0A077ERH9   A0A2H4KI26   A0A077EX86   Q14VC7   Q14VC2   Q14VC1   E0AGW3   A0A077EV00   Q14VB9   C5IGF6   C6K2U3  

Pubmed

20079778    16499943    21346029    1329312    18306032    1431811    + More
19036814    21481551    22002680    7571432    25667330    22609354    25150756    16704791    17275120    22542271    25953186    15177889    25180686    26822958    26221765    20603153   

EMBL

KM347965    AKG92646.1    KX512809    ASR18943.1    LC215871    BBA21174.1    + More
GU338457    ADD49364.1    DQ340562    ABC70095.1    KX512810    ASR18951.1    LC119077    BAV31355.1    GU338456    ADD49355.1    LC029419    BAS25716.1    MF113046    AVY53342.1    HM245926    ADI80529.1    HM245925    ADI80520.1    JQ404409    AFG19727.1    KC175340    KC175341    AFX81105.1    AFX81115.1    X66717    DQ401031    ABD62165.1    DQ403250    JQ404410    KY063616    KY063617    KY063618    ABD62167.1    AFG19747.1    ASB15746.1    ASB15756.1    ASB15764.1    D13096    EU924790    ACJ64183.1    HQ450377    JF682842    ADU17742.1    AEE69330.1    HQ450376    ADU17733.1    X90571    CAA62193.1    EU856362    ACJ63250.1    KP143508    AJO26991.1    DQ675422    ABG25933.1    KP143509    KP143510    KP143511    AJO27001.1    AJO27011.1    AJO27021.1    KP143507    KP143512    AJO26981.1    AJO27031.1    EU924791    ACJ64192.1    DQ675441    ABG25952.1    DQ675417    ABG25928.1    DQ675416    ABG25927.1    DQ675447    ABG25958.1    DQ675449    ABG25960.1    HQ392471    ADO39847.1    DQ675440    ABG25951.1    DQ675435    ABG25946.1    KY292377    ASB16895.1    JN856008    AEQ61975.1    KJ665791    AIL54089.1    DQ112226    GU146061    KP981644    AAZ91444.1    ADB10857.1    AKA65837.1    GQ477367    ADB28915.1    DQ675451    ABG25962.1    DQ675450    ABG25961.1    DQ648122    ABG25964.1    KJ665785    AIL54077.1    DQ675448    ABG25959.1    DQ675433    ABG25944.1    AY342160    AB781790    BAN67926.1    MH817484    AYF53101.1    AB781789    BAN67917.1    DQ675446    ABG25957.1    KJ665798    AIL54102.1    DQ675431    ABG25942.1    FJ938060    ACT10956.1    KU215419    KU215420    KU215422    KU215423    KU215424    KU215425    KU215426    X90574    AMD11138.1    AMD11150.1    AMD11172.1    AMD11183.1    AMD11194.1    AMD11205.1    AMD11216.1    CAA62199.1    FJ938061    ACT10967.1    KY566209    KY566210    KY566211    AUG98127.1    AUG98138.1    AUG98149.1    KU215427    KU215428    AMD11227.1    AMD11238.1    AY548235    AAT45200.1    KP849472    AKZ66480.1    KJ665799    AIL54104.1    DQ675424    DQ675425    DQ675426    DQ675427    ABG25935.1    ABG25936.1    ABG25937.1    ABG25938.1    DQ675430    ABG25941.1    X90577    CAA62205.1    HQ012369    ADL71473.1    GU553361    ADC35469.1    KJ665793    AIL54092.1    JN183883    AEK25529.1    KJ665783    AIL54073.1    X90572    CAA62195.1    HQ012372    ADL71505.1    GU553362    ADC35480.1    KJ665786    AIL54079.1    KX722529    ASU62496.1    KJ665790    AIL54087.1    DQ675415    ABG25926.1    DQ675420    ABG25931.1    DQ675421    ABG25932.1    HQ012368    ADL71463.1    KJ665797    AIL54100.1    DQ675423    ABG25934.1    FJ917526    ACR10349.1    GQ152141    ACS44225.1   

Proteomes

UP000150460    UP000272061    UP000132946    UP000156811    UP000119169    UP000155481    + More
UP000165378    UP000106470    UP000149467    UP000100168    UP000105943    UP000140032    UP000115718    UP000170923    UP000145457    UP000153699    UP000115330    UP000129066    UP000118118    UP000113596    UP000117806    UP000135072    UP000135717    UP000143834    UP000158395    UP000161862    UP000147290    UP000102801    UP000126919    UP000174600    UP000161789    UP000137357    UP000173564    UP000110620    UP000138585    UP000141579    UP000164750   

Pfam

PF03262   Corona_6B_7B

Interpro

IPR004945   Corona_6B_7B

ProteinModelPortal

A0A172B8D1   A0A222UC70   A0A224AW06   D3XGK0   Q20D19   A0A222UC74   + More
A0A1B4X978   D3XGJ2   A0A0K2SF43   A0A2R4QL28   D9J210   D9J201   H9TEV9   K7XR00   Q04704   Q27HR4   Q27HF6   P36302   B7T4B6   E7E043   E7E034   Q66912   B7T079   A0A0C5CJE3   Q14VC0   A0A0C5CJH8   A0A0C5CJD1   B7T4C5   Q14VA1   Q14VC5   Q14VC6   Q14V95   Q14V93   E3W5I7   Q14VA2   Q14VA7   A0A1Z2WUB9   G8J7H2   A0A077ERJ0   Q0ZVW8   D2WXM5   Q14V91   Q14V92   Q152S8   A0A077EX79   Q14V94   Q14VA9   Q7T6S6   S6BFK5   A0A386YIM7   S6BUM1   Q14V96   A0A077EX95   Q14VB1   C6GHI6   Q66902   C6GHJ7   A0A2H5BX47   A0A125R5J0   Q5DQ86   A0A0K2BMD5   A0A077ERL0   Q14VB5   Q14VB2   Q66909   E0AGX3   D3KDL1   A0A077EX89   G1FEZ4   A0A077EQY2   Q66900   E0AH05   D3KDM2   A0A077ERH9   A0A2H4KI26   A0A077EX86   Q14VC7   Q14VC2   Q14VC1   E0AGW3   A0A077EV00   Q14VB9   C5IGF6   C6K2U3  

KEGG

vg:27963650     vg:18585636    

From MSLVP

Host nucleus. Host cytoplasm.

Length:

202

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.00052

Exp number, first 60 AAs:

0.00034

Total prob of N-in:

0.01380

outside

1  -  202