Strain

USA_FELINE_2005_NC_002306 (Region: USA;  Strain: Feline infectious peritonitis virus, complete genome.;  Date: 2005)

Gene

putative 3a protein

Description

Annotated in NCBI,  putative 3a protein

Location

NC_002306(+):24861-25076

GenBank Accession

YP_004070195.1

Full name

Non-structural protein 3a      

Alternative Name

Accessory protein 3a
X2a protein

CDS

ATGGACATTGTCAAATCTATTGACATATTCGTAGACGCTGTACTTGACGAACTTGACCGTGCATACTTTGCTGTAACTCTTAAAGTAGAATTTAAGACTGGTAAACTACTTGTGTGTATAGGTTTTGGTGACACACTTCTTGAGGCTAAGGACAAAGCGTATGCTAAGCTTGGTCTCTCCTTTATTGAAGAAGTCAATAGTCATACAGTTGTTTAG

Protein

MDIVKSIDIFVDAVLDELDRAYFAVTLKVEFKTGKLLVCIGFGDTLLEAKDKAYAKLGLSFIEEVNSHTVV

Keywords

Reference proteome  

Feature

chain  Non-structural protein 3a

Uniprot

K7XSF1   V9PIX8   O39432   V9PIX6   S6BPH6   O12295   + More
C6K2T7   D2WXL8   B7T062   B7T080   E7E027   Q0ZVX4   B7T4A9   B7T4B8   H9TEW6   G8J7G6   Q5VJU1   A0A0K2BMP1   K7YHT6   I0B0R1   Q65982   Q5VJU7   S6CE20   Q0PKZ4   Q7T6T2   Q8QRR4   Q0PL03   F1CNY8   P09046   A0A384VJY3   A0A384V9J3   Q0PL29   Q85083   Q88511   Q0PL20   A7UIZ7   Q89876   Q9QEV9   A1DS41   A0A384VK40   A0A384V9F8   Q2LJ82   C0LLQ2   A0A384VIA1   A0A088NBW0   G1FEY7   E3W5F8   E0AGY7   C6GHJ0   C6GHH9   A0A125R5F0   E3W5J1   C6GHA7   C5IJ42   A0A077EV64   A0A077ERC4   A0A077EXH0   D6RTP0   A0A088NCC5   Q3Y4F0   A0A2H5BX07   C3S0R7   C5IGG7   A0A1Z2WU97   C5IJ72   A0A077EXB2   A0A2H4KI54   A0A088ND01   E0AGZ8   D3KDL5   D3KDK4   E0AGW7   A0A077ERM9   C3S129   A0A088NRG2   C5IG87   A0A088NCY8   E3W5I0   A0A077EVA8   E3W5G9   A0A088NDD5   T1SS33   C3S140   G1FEX7   A0A088ND10   A0A088NCE0   C6GHC7   C3S0X9   C3S132   E0AGX7   A0A2H5BX04   A0A077EV79   C5IGE9   A0A077ERT7   E0AGV7   C5IGA5   C6GHE7   C6GH96  

Pubmed

23996606    9654687    25180686    20603153    21481551    22002680    + More
19036814    16704791    17275120    22542271    25953186    22609354    26221765    22438554    1431811    17023013    15177889    25890036    2825819    2548340    10805807    7707547    20229183    8546012    10948987    18306032    26822958    25150756    22718568    19788813   

EMBL

KC175339    AFX81092.1    KC461235    KC461237    AGZ84517.1    AGZ84537.1    + More
AF033000    AY994055    KC461236    AGZ84527.1    AB781790    BAN67919.1    AB781788    Y13921    BAN67901.1    CAA74227.1    GQ152141    JN634064    ACS44219.1    AFH58020.1    GQ477367    HQ450377    JF682842    JQ404410    KY063616    KY063617    ADB28908.1    ADU17735.1    AEE69323.1    AFG19739.1    ASB15739.1    ASB15749.1    EU856361    ACJ63232.1    EU856362    ACJ63243.1    HQ450376    ADU17726.1    DQ112226    GU146061    KP981644    AAZ91438.1    ADB10850.1    AKA65830.1    EU924790    ACJ64176.1    EU924791    ACJ64185.1    JQ404409    AFG19734.1    JN856008    AEQ61969.2    AY426984    AAR88619.1    KP849472    AKZ66472.1    KC175340    KC175341    AFX81099.1    AFX81109.1    JQ408980    AFH55112.1    D13096    AY426983    AAR88613.1    AB781789    BAN67910.1    DQ811789    ABG89331.1    AY342160    AF481368    AAL89749.1    DQ811788    ABG89322.1    HQ462571    KC962433    KP202848    KX499468    KX900394    ADY39741.1    AGM75127.1    AKA60055.1    AQT01350.1    ASV64287.1    X06371    X12800    AJ271965    DQ443743    KX900393    ASV64278.1    KX900402    ASV64359.1    DQ811785    ABG89296.1    U26210    FJ755618    KT696544    AAA67950.1    ACN71197.1    AMB66489.1    Z35758    CAA84807.1    DQ811786    ABG89302.1    EU074218    FJ718988    FJ718989    FJ718991    FJ718993    FJ718995    KX532151    KX532153    KX532154    KX532156    KX532157    ABU49660.1    ACN79544.1    ACN79548.1    ACN79555.1    ACN79562.1    ACN79570.1    ART29865.1    ART29868.1    ART29870.1    ART29873.1    ART29875.1    U26211    U26214    AAA67944.1    AF179886    AAF02711.1    EF056487    ABK79897.1    KX900403    ASV64368.1    KX900395    KX900397    KX900398    KX900399    KX900400    KX900401    KX900404    KX900405    KX900406    KX900407    KX900411    ASV64296.1    ASV64314.1    ASV64323.1    ASV64332.1    ASV64341.1    ASV64350.1    ASV64376.1    ASV64385.1    ASV64394.1    ASV64403.1    ASV64439.1    DQ201447    ABC72415.1    FJ718994    ACN79566.1    KX900408    KX900409    KX900410    ASV64412.1    ASV64421.1    ASV64430.1    KJ879336    KJ879339    KJ879428    KJ879430    AIN55758.1    AIN55768.1    AIN55986.1    AIN55991.1    JN183883    AEK25522.1    HQ392469    ADO39818.1    HQ012371    ADL71487.1    FJ938061    ACT10960.1    FJ938060    ACT10949.1    KU215419    KU215420    KU215421    KU215422    KU215423    KU215424    KU215425    KU215426    KU215427    KU215428    AMD11131.1    AMD11143.1    AMD11154.1    AMD11165.1    AMD11176.1    AMD11187.1    AMD11198.1    AMD11209.1    AMD11220.1    AMD11231.1    HQ392472    ADO39851.1    FJ938053    ACT10877.1    FJ943762    ACR46118.1    KJ665833    KJ665834    AIL54180.1    AIL54183.1    KJ665858    KJ665859    AIL54233.1    AIL54236.1    KJ665837    AIL54192.1    AB535528    BAJ08256.1    KJ879334    AIN55750.1    DQ160294    AAZ86078.1    KY566210    AUG98131.1    EU664275    EU664278    EU664302    EU664311    ACI13493.1    ACI13504.1    ACI13591.1    ACI13619.1    FJ917528    FJ917529    ACR10360.1    ACR10369.1    KY292377    ASB16888.1    FJ943771    ACR46148.1    KJ665817    AIL54132.1    KX722530    ASU62500.1    KJ879421    AIN55965.1    HQ012372    ADL71498.1    GU553362    ADC35473.1    GU553361    ADC35462.1    HQ012369    ADL71467.1    KJ665813    KJ665815    KJ665816    KJ665818    KJ665819    AIL54120.1    AIL54126.1    AIL54129.1    AIL54135.1    AIL54138.1    EU664307    ACI13605.1    KJ879335    AIN55754.1    FJ917519    FJ917520    FJ917523    FJ917524    FJ917530    FJ917531    FJ917532    FJ917533    FJ917534    FJ917535    FJ943761    FJ943764    FJ943767    ACR10280.1    ACR10289.1    ACR10316.1    ACR10325.1    ACR10378.1    ACR10387.1    ACR10396.1    ACR10405.1    ACR10414.1    ACR10423.1    ACR46110.1    ACR46129.1    KJ879414    AIN55945.1    HQ392471    ADO39840.1    KJ665835    KJ665836    KJ665843    KJ665844    AIL54186.1    AIL54189.1    AIL54203.1    AIL54205.1    HQ392470    ADO39829.1    KJ879423    AIN55971.1    KF530123    AGT52081.1    EU664310    ACI13616.1    JN183882    AEK25512.1    KJ879419    KJ879426    AIN55959.1    AIN55980.1    KJ879337    KJ879338    KJ879429    AIN55763.1    AIN55765.1    AIN55989.1    FJ938055    ACT10897.1    EU664291    EU664292    EU664295    EU664303    EU664309    KX722529    ACI13555.1    ACI13558.1    ACI13567.1    ACI13594.1    ACI13612.1    ASU62489.1    EU664308    ACI13608.1    HQ012370    ADL71477.1    KY566209    KY566211    AUG98120.1    AUG98142.1    KJ665840    AIL54200.1    FJ917526    ACR10342.1    KJ665845    KJ665846    AIL54207.1    AIL54209.1    HQ012368    ADL71456.1    FJ917521    FJ943765    ACR10298.1    ACR46136.1    FJ938057    ACT10917.1    FJ938052    ACT10866.1   

Proteomes

UP000119918    UP000156095    UP000169693    UP000000835    UP000131699    UP000164655    + More
UP000164750    UP000106470    UP000129066    UP000115330    UP000119169    UP000153699    UP000174600    UP000155481    UP000165378    UP000096172    UP000158285    UP000137024    UP000098772    UP000113525    UP000123026    UP000001440    UP000158504    UP000145148    UP000111647    UP000166023    UP000121388    UP000156732    UP000173564    UP000113038    UP000169984    UP000147290    UP000118118    UP000102801    UP000113596    UP000117806    UP000125896    UP000126919    UP000135072    UP000135717    UP000143834    UP000158395    UP000161862    UP000153548    UP000123646    UP000110620    UP000138585    UP000137357    UP000161789    UP000145457    UP000165438    UP000113324    UP000144443    UP000162682    UP000128709    UP000141579    UP000151137    UP000114363   

Pfam

PF04694   Corona_3

Interpro

IPR006784   Coronavirus_Orf3

ProteinModelPortal

K7XSF1   V9PIX8   O39432   V9PIX6   S6BPH6   O12295   + More
C6K2T7   D2WXL8   B7T062   B7T080   E7E027   Q0ZVX4   B7T4A9   B7T4B8   H9TEW6   G8J7G6   Q5VJU1   A0A0K2BMP1   K7YHT6   I0B0R1   Q65982   Q5VJU7   S6CE20   Q0PKZ4   Q7T6T2   Q8QRR4   Q0PL03   F1CNY8   P09046   A0A384VJY3   A0A384V9J3   Q0PL29   Q85083   Q88511   Q0PL20   A7UIZ7   Q89876   Q9QEV9   A1DS41   A0A384VK40   A0A384V9F8   Q2LJ82   C0LLQ2   A0A384VIA1   A0A088NBW0   G1FEY7   E3W5F8   E0AGY7   C6GHJ0   C6GHH9   A0A125R5F0   E3W5J1   C6GHA7   C5IJ42   A0A077EV64   A0A077ERC4   A0A077EXH0   D6RTP0   A0A088NCC5   Q3Y4F0   A0A2H5BX07   C3S0R7   C5IGG7   A0A1Z2WU97   C5IJ72   A0A077EXB2   A0A2H4KI54   A0A088ND01   E0AGZ8   D3KDL5   D3KDK4   E0AGW7   A0A077ERM9   C3S129   A0A088NRG2   C5IG87   A0A088NCY8   E3W5I0   A0A077EVA8   E3W5G9   A0A088NDD5   T1SS33   C3S140   G1FEX7   A0A088ND10   A0A088NCE0   C6GHC7   C3S0X9   C3S132   E0AGX7   A0A2H5BX04   A0A077EV79   C5IGE9   A0A077ERT7   E0AGV7   C5IGA5   C6GHE7   C6GH96  

PDB

5VEV     E-value=7.26572,     Score=60