Strain

USA_PIG_2000_NC_038861 (Region: USA:Indiana;  Strain: Transmissible gastroenteritis virus complete genome, genomic RNA.;  Date: 2000)

Gene

non-structural protein 3a

Description

Annotated in NCBI,  non-structural protein 3a

Location

NC_038861(+):24827-25042

GenBank Accession

NP_058425.1

Full name

Non-structural protein 3a      

Alternative Name

Accessory protein 3a
X2a protein

CDS

ATGGACATTGTCAAATCCATTTACACATCCGTAGATGCTGTACTTGACGAACTTGATTGTGCATACTTTGCTGTAACTCTTAAAGTAGAATTTAAGACTGGTAAATTACTTGTGTGTATAGGTTTTGGTGACACACTTCTTGCTGCTAAGGATAAAGCATATGCTAAGCTTGGTCTCTCCATTATTGAAGAAGTCAATAGTCATATAGTTGTTTAA

Protein

MDIVKSIYTSVDAVLDELDCAYFAVTLKVEFKTGKLLVCIGFGDTLLAAKDKAYAKLGLSIIEEVNSHIVV

Keywords

Reference proteome  

Feature

chain  Non-structural protein 3a

Uniprot

A0A384V9J3   Q0PL03   F1CNY8   P09046   A0A384VJY3   Q0PKZ4   + More
S6CE20   B7T4B8   Q8QRR4   Q0ZVX4   S6BPH6   O12295   Q65982   Q7T6T2   C6K2T7   D2WXL8   Q0PL29   Q85083   A7UIZ7   Q0PL20   B7T062   Q88511   Q5VJU1   A0A0K2BMP1   Q2LJ82   B7T080   E7E027   Q89876   I0B0R1   Q9QEV9   C0LLQ2   B7T4A9   Q5VJU7   H9TEW6   A0A384VK40   A0A384V9F8   K7YHT6   G8J7G6   K7XSF1   V9PIX8   O39432   V9PIX6   A0A384VIA1   A0A3Q8BAQ6   A1DS41   E0AGU7   E3W5F8   E0AGY7   E3W5J1   A0A088NCY8   C6GHA7  

Pubmed

17023013    25890036    2825819    2548340    10805807    25180686    + More
19036814    16704791    17275120    22542271    25953186    1431811    15177889    20603153    21481551    22002680    7707547    20229183    8546012    26221765    22438554    10948987    22609354    23996606    9654687    18306032   

EMBL

KX900402    ASV64359.1    DQ811788    ABG89322.1    HQ462571    KC962433    + More
KP202848    KX499468    KX900394    ADY39741.1    AGM75127.1    AKA60055.1    AQT01350.1    ASV64287.1    X06371    X12800    AJ271965    DQ443743    KX900393    ASV64278.1    DQ811789    ABG89331.1    AB781789    BAN67910.1    EU924791    ACJ64185.1    AF481368    AAL89749.1    DQ112226    GU146061    KP981644    AAZ91438.1    ADB10850.1    AKA65830.1    AB781790    BAN67919.1    AB781788    Y13921    BAN67901.1    CAA74227.1    D13096    AY342160    GQ152141    JN634064    ACS44219.1    AFH58020.1    GQ477367    HQ450377    JF682842    JQ404410    KY063616    KY063617    ADB28908.1    ADU17735.1    AEE69323.1    AFG19739.1    ASB15739.1    ASB15749.1    DQ811785    ABG89296.1    U26210    FJ755618    KT696544    AAA67950.1    ACN71197.1    AMB66489.1    EU074218    FJ718988    FJ718989    FJ718991    FJ718993    FJ718995    KX532151    KX532153    KX532154    KX532156    KX532157    ABU49660.1    ACN79544.1    ACN79548.1    ACN79555.1    ACN79562.1    ACN79570.1    ART29865.1    ART29868.1    ART29870.1    ART29873.1    ART29875.1    DQ811786    ABG89302.1    EU856361    ACJ63232.1    Z35758    CAA84807.1    AY426984    AAR88619.1    KP849472    AKZ66472.1    DQ201447    ABC72415.1    EU856362    ACJ63243.1    HQ450376    ADU17726.1    U26211    U26214    AAA67944.1    JQ408980    AFH55112.1    AF179886    AAF02711.1    FJ718994    ACN79566.1    EU924790    ACJ64176.1    AY426983    AAR88613.1    JQ404409    AFG19734.1    KX900403    ASV64368.1    KX900395    KX900397    KX900398    KX900399    KX900400    KX900401    KX900404    KX900405    KX900406    KX900407    KX900411    ASV64296.1    ASV64314.1    ASV64323.1    ASV64332.1    ASV64341.1    ASV64350.1    ASV64376.1    ASV64385.1    ASV64394.1    ASV64403.1    ASV64439.1    KC175340    KC175341    AFX81099.1    AFX81109.1    JN856008    AEQ61969.2    KC175339    AFX81092.1    KC461235    KC461237    AGZ84517.1    AGZ84537.1    AF033000    AY994055    KC461236    AGZ84527.1    KX900408    KX900409    KX900410    ASV64412.1    ASV64421.1    ASV64430.1    KY406735    ASV45149.1    EF056487    ABK79897.1    HQ012367    ADL71447.1    HQ392469    ADO39818.1    HQ012371    ADL71487.1    HQ392472    ADO39851.1    KJ879414    AIN55945.1    FJ938053    ACT10877.1   

Proteomes

UP000137024    UP000098772    UP000113525    UP000123026    UP000001440    UP000158504    + More
UP000158285    UP000115330    UP000164655    UP000164750    UP000106470    UP000129066    UP000145148    UP000111647    UP000166023    UP000121388    UP000174600    UP000156732    UP000096172    UP000119169    UP000155481    UP000165378    UP000153699    UP000119918    UP000156095    UP000169693    UP000000835    UP000131699    UP000171330    UP000113038    UP000169984    UP000153548    UP000123646   

Pfam

PF04694   Corona_3

Interpro

IPR006784   Coronavirus_Orf3

ProteinModelPortal

A0A384V9J3   Q0PL03   F1CNY8   P09046   A0A384VJY3   Q0PKZ4   + More
S6CE20   B7T4B8   Q8QRR4   Q0ZVX4   S6BPH6   O12295   Q65982   Q7T6T2   C6K2T7   D2WXL8   Q0PL29   Q85083   A7UIZ7   Q0PL20   B7T062   Q88511   Q5VJU1   A0A0K2BMP1   Q2LJ82   B7T080   E7E027   Q89876   I0B0R1   Q9QEV9   C0LLQ2   B7T4A9   Q5VJU7   H9TEW6   A0A384VK40   A0A384V9F8   K7YHT6   G8J7G6   K7XSF1   V9PIX8   O39432   V9PIX6   A0A384VIA1   A0A3Q8BAQ6   A1DS41   E0AGU7   E3W5F8   E0AGY7   E3W5J1   A0A088NCY8   C6GHA7  

PDB

5VEV     E-value=7.26572,     Score=60