Strain

CANADA_AVIAN_2007_NC_010800 (Region: Canada;  Strain: Turkey coronavirus, complete genome.;  Date: 2007)

Gene

5a protein

Description

Annotated in NCBI,  5a protein

Location

NC_010800(+):25669-25866

GenBank Accession

YP_001941172.1

Full name

Non-structural protein 5a      

Alternative Name

Accessory protein 5a

CDS

ATGAAATGGCTGACTAGTTTTGGAAGAGCAGTTGTTTCGTGTTATAAGGCCCTACTATTAACTCAATTAAGAGTGTTAGATAGGTTAATTTTAGATTACGGACCAAAGCGCACTTTAACGTGTGCTAGGCGAGTGCTTTTAGTTCAATTAGATTTAGTTTATAGGTTGGCATATACGCCCACCCAATCGCTGGTATGA

Protein

MKWLTSFGRAVVSCYKALLLTQLRVLDRLILDYGPKRTLTCARRVLLVQLDLVYRLAYTPTQSLV

Keywords

Reference proteome  

Feature

chain  Non-structural protein 5a

Uniprot

B3FHV1   A0A0S2ZXT6   A0A4Y5QAL8   F4MIR1   A0A140HEX0   A0A1L4BI89   + More
A0A516UWJ3   G3C775   A4ZCT3   A0A516UWG1   A0A172Q3V8   X2JF32   A0A516UWJ5   A0A516UWF6   Q9J4A5   A0A1W6AWK8   A0A346PYQ0   Q9J4B2   F6M7C0   A4ZCR7   A0A346T2V9   A0A1L5YNB8   I1YZI2   A0A0E3XI24   G3C7F1   Q5MBQ5   D0R6R8   J7I082   G4XMS2   A0A023PP46   A0A286LPM2   F4MIS1   A0A516UWB6   A4ZCQ9   Q80RZ8   A0A1X9Y2N7   A0A1X9Y2W5   B3TD55   D0R6R1   A0A023PN05   A0A1B2CWI7   A0A516UWF1   B3TD68   A0A221J5Q9   A0A2R4N523   E5D0C8   C9DSW5   J7I092   A0A516UWC4   C9DST2   Q805I0   C9DSU3   A0A0N9QGI9   A0A1L4A1P8   A4ZCN0   J7HKL2   Q0ZB49   A0A3G4BBT5   A4ZCS5   A4ZCN8   A0A291B662   A0A1P8SFM5   B7SXR9   E5D0A6   A4ZCJ3   A0A2K8GJ33   Q706B0   Q52H07   C9DSV4   A0A0E4G3T5   A0A1P8VEZ4   Q0ZB57   B2MWM4   B7SXQ3   A4ZCM2   O12398   A0A1W6AWJ8   A0A2P1BXS3   G3C7A1   B5A548   A0A1P8VF89   A0A0D4CG75   A0A1X9Y2S2   A0A2Z5D881   F1KCQ5   Q778S2   Q89613   Q998S0   A0A1P8SMS7   A0A1X9Y2P8   A0A1P8VFH9   A0A1X9Y2R2   A0A2H4I7K7   Q5MBQ9   U5QEL0   Q6DTU7   Q64FY9   A0A2K8GIT1   A0A0D4CFG9   A0A1P8FCL2  

Pubmed

18468711    26585962    31439703    21539870    28923510    21994806    + More
18045937    27938680    11087096    15019237    16990149    17629993    18295413    19100792    20181858    20652731    21909766    26482289    28495648    28646651    30126059    30197283    20574643    22421962    25843648    19625463    23202499    28116527    23178317    18514348    28705717    20022075    15183070    16927130    19102764    19219402    24613433    27108998    26262637    21049275    25721384    22903901    17364511    30714035    28917538    27793730    29337625    12425795    25712772    7710354    9168126    29141204    11711626    6092234    3027249    6331112    15661153    16137658    25843651    15722532    26616599   

EMBL

EU095850    ABW81433.1    KR822424    ALQ43522.1    MK878536    QCX19626.1    + More
FJ904714    ADA83483.1    KT886454    AMO03297.1    KY047602    MK581207    API80975.1    QDQ69193.1    MK581208    QDQ69206.1    GU393331    ADV71727.1    DQ490217    JN176213    KU556807    ABF61560.1    AFK30967.1    APP92762.1    MK581205    QDQ69167.1    KU253616    KU253617    KU253619    KU253620    KU253621    KU253622    KU253623    KU253624    AND76823.1    AND76831.1    AND76847.1    AND76855.1    AND76863.1    AND76871.1    AND76879.1    AND76887.1    KJ135013    AHN54759.1    MK581206    QDQ69180.1    MK581204    QDQ69154.1    AF203005    AF469016    AY641576    AY842860    AH014596    AY856346    EF602437    EF602439    EF602443    EF602457    EU714028    EU817497    EU822341    FJ807652    FJ888351    GQ229232    GQ504722    GU393335    JF330899    KJ425486    KJ425487    KJ425488    KJ425490    KJ425491    KJ425492    KJ425493    KJ425494    KJ425495    KJ425498    KJ425499    KJ425500    KJ425501    KJ425502    KJ425503    KJ425505    KJ425506    KJ425507    KJ425508    KJ425509    KJ425511    KJ425512    KJ435284    KJ435285    KT203557    KT736031    KX236001    KY588134    KY588135    KY805845    KY273667    MK937829    MK937831    MK937833    AAF69121.1    AAO33446.1    AAT70078.1    AAV88475.1    AAW56617.1    AAW83031.1    ABQ84747.1    ABQ84763.1    ABQ84795.1    ABQ84906.1    ACH72798.1    ACJ12839.1    ACJ50204.1    ACO37571.1    ACQ55235.1    ACT31318.1    ADP06476.1    ADV71778.1    ADY62557.1    AHX25907.1    AHX25916.1    AHX25925.1    AHX25943.1    AHX25952.1    AHX25961.1    AHX25970.1    AHX25979.1    AHX25988.1    AHX26015.1    AHX26024.1    AHX26033.1    AHX26042.1    AHX26051.1    AHX26060.1    AHX26078.1    AHX26087.1    AHX26096.1    AHX26105.1    AHX26114.1    AHX26133.1    AHX26141.1    AHX26159.1    AHX26168.1    ALE71336.1    AMK51943.1    APY26750.1    ARE67878.1    ARE67890.1    ARS23146.1    ASF20086.1    QDA76305.1    QDA76323.1    QDA76341.1    KY626045    MK071267    ARJ35796.1    QCS40645.1    MG021194    AXR85439.1    AF203000    FJ008695    GU393332    MF462334    MH779856    MH779857    MH779858    MH779859    MH779860    AAF69114.1    ACM45234.1    ADV71740.1    ASU92393.1    AYA44696.1    JF732918    AEF98435.1    DQ490215    ABF61544.1    MG233398    AXT92420.1    KU556806    APP92749.1    JQ088078    AFJ11181.1    KP662631    AKC34139.1    GU393336    GU393337    ADV71803.1    AY839139    DQ490206    EF602441    AAV88481.1    ABF61478.1    ABQ84779.1    FN430415    CAZ86713.1    JQ977697    KU900739    AFQ31005.1    ARS22415.1    JF828981    AEP84751.1    KJ425510    AHX26123.1    MF462335    ASU92401.1    FJ904715    ADA83494.1    MK581202    QDQ69128.1    DQ490214    ABF61536.1    AF469011    AAO33436.1    KU900740    ARS22425.1    KY805846    ARS23159.1    EU022525    ABW75131.1    FN430414    CAZ86704.1    KJ425489    AHX25934.1    KX258195    ANY59005.1    MK581203    QDQ69141.1    EU022526    ABW75145.1    MF421319    MF421320    ASM61967.1    ASM61980.1    MG763935    AVX27617.1    GQ504725    ADP06509.1    GQ427176    ACV87270.1    JQ977698    AFQ31015.1    MK581200    MK581201    QDQ69102.1    QDQ69115.1    GQ427173    ACV87241.1    AF469012    AF469013    AF470626    AY514485    AY761141    AY839142    EF602438    EF602440    EF602442    EF602451    EF602456    EU418975    EU418976    FJ904713    FJ904716    FJ904717    FJ904718    FJ904719    GU386375    GQ504720    GQ504721    GU393334    GU393338    JF775530    KC506155    KF411040    KF696629    KJ425485    KP868573    KU317090    KX252791    KR265092    KY776700    KY776701    AAO33438.1    AAO33440.1    AAS00085.1    AAV28727.1    AAV88485.1    ABQ84755.1    ABQ84771.1    ABQ84787.1    ABQ84858.1    ABQ84898.1    ACB59367.1    ACB59377.1    ADA83472.1    ADA83502.1    ADA83512.1    ADA83522.1    ADA83532.1    ADC79656.1    ADP06454.1    ADP06467.1    ADV71765.1    AEO79902.1    AGJ98442.1    AGZ89677.1    AHB79528.1    AHX25898.1    ALC78752.1    ANI87716.1    APY26732.1    ART35354.1    AVI69449.1    AVI69458.1    GQ427174    ACV87248.1    KR231009    ALH21118.1    KX077987    API61795.1    DQ490210    DQ490218    DQ490221    KF460437    ABF61507.1    ABF61568.1    ABF61584.1    AIG54290.1    JX143760    AFQ00048.1    DQ646405    ABG36792.1    MH878976    AYS76112.1    DQ490216    ABF61552.1    DQ490211    DQ490213    ABF61515.1    ABF61528.1    KY933089    KY933090    ATE90973.1    ATE90987.1    KX272465    APY20701.1    EU822340    ACJ50196.1    GQ504723    ADP06487.1    DQ490205    KU556805    ABF61470.1    APP92736.1    KU949746    ARI46297.1    AJ619604    CAF22050.1    DQ007017    AAY00020.1    GQ427175    ACV87259.1    LN610099    CEK09115.1    KX302861    KX302865    APZ73666.1    APZ73702.1    DQ646404    EU822337    EU822339    KX668222    MF673729    ABG36784.1    ACJ50172.1    ACJ50188.1    AOC59736.1    ASU92409.1    EU637854    ACC94331.1    EU822338    ACJ50180.1    DQ490209    ABF61499.1    U49858    U46037    AAC57078.1    KY626044    ARJ35786.1    KY799582    AVI69490.1    GU393333    ADV71753.1    EU812232    ACF77103.1    KX302868    KX372249    APZ73729.1    AQY03964.1    KP118886    KY620116    AJT47901.1    AQY61374.1    KU900744    ARS22465.1    MH021175    AXB38899.1    JF330898    MG448607    ADY62547.1    AVI69524.1    AJ311317    CAC39119.1    M95169    M25905    AY692454    DQ001338    DQ001339    AJ310641    CAC33184.1    KX252781    APY23565.1    KU900741    ARS22435.1    KX275393    APZ73839.1    KU900743    ARS22455.1    KR265088    ART35322.1    AY839136    EF602449    KX252772    AAV88479.1    ABQ84843.1    APY23484.1    KF377577    KJ425497    KP036502    KP036503    KP036504    KP118880    KP118881    KP118882    KP118883    KP118884    KP118885    KP118887    KP118888    KP118891    KP118892    KP118893    KX219794    KX236009    KX302862    KX259250    KX364299    MK032177    MK032179    MK032180    AGY56145.1    AHX26006.1    AJP16717.1    AJP16726.1    AJP16735.1    AJT47847.1    AJT47856.1    AJT47865.1    AJT47874.1    AJT47883.1    AJT47892.1    AJT47910.1    AJT47919.1    AJT47946.1    AJT47955.1    AJT47964.1    APV46127.1    APY26821.1    APZ73675.1    AQD20697.1    ARB66194.1    AZA07829.1    AZA07847.1    AZA07855.1    AY646283    AAT70777.1    AY702975    KJ425496    KT852992    AAU14253.1    AHX25997.1    AMD40268.1    KU949737    KU949738    KU949739    MG738154    ARI46225.1    ARI46233.1    ARI46241.1    QAA92382.1    KP118889    KP118890    AJT47928.1    AJT47937.1    KX219801    APV46189.1   

Proteomes

UP000106026    UP000138261    UP000133571    UP000133437    UP000138275    UP000138100    + More
UP000097868    UP000101527    UP000102121    UP000102163    UP000103149    UP000104400    UP000106511    UP000107224    UP000107830    UP000108224    UP000113245    UP000113896    UP000113939    UP000118008    UP000120286    UP000120642    UP000132365    UP000136241    UP000136440    UP000146865    UP000149404    UP000155572    UP000155946    UP000158124    UP000158949    UP000159206    UP000163887    UP000165788    UP000166253    UP000170189    UP000173109    UP000173215    UP000174151    UP000180343    UP000160499    UP000139891    UP000130326    UP000119508    UP000160333    UP000151903    UP000096390    UP000167410    UP000138146    UP000129334    UP000117980    UP000159366    UP000122234    UP000099410    UP000114242    UP000167574    UP000150527    UP000123786    UP000102335    UP000104663    UP000107038    UP000119721    UP000121579    UP000124016    UP000129978    UP000130162    UP000131863    UP000137477    UP000139706    UP000145806    UP000149006    UP000151624    UP000155805    UP000160278    UP000167075    UP000098674    UP000097758    UP000123393    UP000149405    UP000132955    UP000112634    UP000126934    UP000130254    UP000146844    UP000166017    UP000149090    UP000114388    UP000006717    UP000107149    UP000100522    UP000105210    UP000105510    UP000108163    UP000109170    UP000111271    UP000117109    UP000121165    UP000124537    UP000136129    UP000142905    UP000146859    UP000147307    UP000149934    UP000170218    UP000170844    UP000118234    UP000102195    UP000159001    UP000133678    UP000152683   

PRIDE

Q89613   

Pfam

PF06336   Corona_5a

Interpro

IPR009404   Corona_5a

ProteinModelPortal

B3FHV1   A0A0S2ZXT6   A0A4Y5QAL8   F4MIR1   A0A140HEX0   A0A1L4BI89   + More
A0A516UWJ3   G3C775   A4ZCT3   A0A516UWG1   A0A172Q3V8   X2JF32   A0A516UWJ5   A0A516UWF6   Q9J4A5   A0A1W6AWK8   A0A346PYQ0   Q9J4B2   F6M7C0   A4ZCR7   A0A346T2V9   A0A1L5YNB8   I1YZI2   A0A0E3XI24   G3C7F1   Q5MBQ5   D0R6R8   J7I082   G4XMS2   A0A023PP46   A0A286LPM2   F4MIS1   A0A516UWB6   A4ZCQ9   Q80RZ8   A0A1X9Y2N7   A0A1X9Y2W5   B3TD55   D0R6R1   A0A023PN05   A0A1B2CWI7   A0A516UWF1   B3TD68   A0A221J5Q9   A0A2R4N523   E5D0C8   C9DSW5   J7I092   A0A516UWC4   C9DST2   Q805I0   C9DSU3   A0A0N9QGI9   A0A1L4A1P8   A4ZCN0   J7HKL2   Q0ZB49   A0A3G4BBT5   A4ZCS5   A4ZCN8   A0A291B662   A0A1P8SFM5   B7SXR9   E5D0A6   A4ZCJ3   A0A2K8GJ33   Q706B0   Q52H07   C9DSV4   A0A0E4G3T5   A0A1P8VEZ4   Q0ZB57   B2MWM4   B7SXQ3   A4ZCM2   O12398   A0A1W6AWJ8   A0A2P1BXS3   G3C7A1   B5A548   A0A1P8VF89   A0A0D4CG75   A0A1X9Y2S2   A0A2Z5D881   F1KCQ5   Q778S2   Q89613   Q998S0   A0A1P8SMS7   A0A1X9Y2P8   A0A1P8VFH9   A0A1X9Y2R2   A0A2H4I7K7   Q5MBQ9   U5QEL0   Q6DTU7   Q64FY9   A0A2K8GIT1   A0A0D4CFG9   A0A1P8FCL2  

KEGG

vg:6353562    

GO

GO:0019013  C:viral nucleocapsid

From MSLVP

Single-Pass Membrane

Length:

65

Number of predicted TMHs:

0

Exp number of AAs in TMHs:

0.32859

Exp number, first 60 AAs:

0.32647

Total prob of N-in:

0.32171

outside

1  -  65