Strain

CHINA_AVIAN_2007_NC_016993 (Region: China: Hong Kong;  Strain: Magpie-robin coronavirus HKU18, complete genome.;  Date: 2007)

Gene

membrane protein

Description

Annotated in NCBI,  membrane protein

Location

NC_016993(+):23226-23882

GenBank Accession

YP_005352856.1

Full name

Membrane protein      

Alternative Name

E1 glycoprotein
Matrix glycoprotein
Membrane glycoprotein

CDS

ATGTCTGAAACCACGGAGTGGCAGATTATTGTTTTTATTATTCTTATATGGGCCCTTGGGGTTATCCTTCAGGGAGGGTATGCCACGCGGAACCGTATAATCTACATTATTAAACTTATCCTACTCTGGCTCCTGCAACCGTTTACTCTCGTCGTCACCATCTGGACAGCTGTTGACGCCAGAGCTACACCTAGCAGCGCCGTCTTTATCATTGCCATAGTGTTTGCCGTGCTCACCTTCCTATCATGGCTGCGCTACGTGTATGATTCAATCCGCCTAGTTATGAAGACGCACTCAGCCTGGAGCTTCTCCCCTGAGAGCAGAATTTTAGCAGGCGTCATGGATTCCATGGGCAATTGGAGGTGCATACCAATTGATCACATGGCTCCAATATTAACTCCAGTTCTCAAGCATGGCAAGCTAAAGCTCCATGGGCAACAGCTTGCAACTGGAATCGCTGTAACCTCGCCTCCAAAGTCTATGGTAGTTGTCACTCCCTCTGACACATTTCACTATAGCCTTAGGAAGACCATTGAATCTACTGATGACCGTGATTTAGCTGTCTTGATCTATCAGGGAGACCGCTCCTCAAATGCAGCTTTACACACAATCACAACCTCTAATTCTGGCAACGCCAGGATTTACAACTATTTATAA

Protein

MSETTEWQIIVFIILIWALGVILQGGYATRNRIIYIIKLILLWLLQPFTLVVTIWTAVDARATPSSAVFIIAIVFAVLTFLSWLRYVYDSIRLVMKTHSAWSFSPESRILAGVMDSMGNWRCIPIDHMAPILTPVLKHGKLKLHGQQLATGIAVTSPPKSMVVVTPSDTFHYSLRKTIESTDDRDLAVLIYQGDRSSNAALHTITTSNSGNARIYNYL

Function

Component of the viral envelope that plays a central role in virus morphogenesis and assembly via its interactions with other viral proteins.

Subunit

Homomultimer. Interacts with envelope E protein in the budding compartment of the host cell, which is located between endoplasmic reticulum and the Golgi complex. Forms a complex with HE and S proteins. Interacts with nucleocapsid N protein. This interaction probably participates in RNA packaging into the virus.

Similarity

Belongs to the gammacoronaviruses M protein family.

Keywords

Glycoprotein   Host Golgi apparatus   Host membrane   Membrane   Transmembrane   Transmembrane helix   Viral envelope protein   Viral matrix protein   Virion  

Feature

chain  Membrane protein

Uniprot

H9BR10   B6VDY9   A0A2Z5XXR4   H9BQZ4   A0A5B8JML2   A0A2Z5XXT2   + More
A0A2Z5XXS3   B6VDW2   B6VDX1   B6VDY0   A0A145YPB1   A0A140ES76   A0A1Z4F680   X2EZT4   A0A075X0D1   A6N254   A0A075E3D6   A0A075E3P1   A0A075E3D0   A0A097EU50   W8R479   A0A075E3L3   H9BQY0   A0A0E3U220   A0A1Z4F693   H9BQY7   A0A286NGL7   A0A1C9C4I5   A0A2H4NFS0   A0A140ESG7   A0A0U3BGC8   A0A514C923   A0A2Z4EVV0   A0A5J6NBG5   A0A2Z4EVY0   A0A2Z5XXU6   H9BR02   A0A2Z4EVU8   A0A2Z4G602   A0A2Z4G609   A0A2Z4G622   A0A4Y6ER58   A0A346IMW4   H9BR37   A0A2U9I694   H9BR27   H9BR19   A0A516UWD7   G4RJ85   A0A4Y5SY37   A0A4Y5SXV0   A0A0E3TI94   K7S5A6   G4RJ87   G4RJ86   A0A346PYP7   M4I8Z0   A0A1P8SFM3   M4I8Y6   A0A516UWC2   A0A0N9QUP2   G3FEJ2   B3VZS6   Q91SA1   I7B3F0   A0A1X9Y2Y2   Q91QS9   D0R6R0   Q7T9P7   A0A286LPM1   A0A1P8SMJ8   C6KCX6   A0A140DP47   B3TD52   A0A0D4CG32   Q91S98   Q7T9P6   A0A1P8SMV9   G4RJ84   A0A1X9Y2L9   A0A481NU89   B3VKF1   Q6DTU8   Q64FZ0   C1KF08   A0A4Y5SYV1   C6KCY2   A0A1P8SSN1   A0A1P8VF79   Q80RY9   B3GPG8   G4RJ89   Q7TEH1   C1KAC3   A0A1P8Z871   A0A1U9WSN4   E9LUF4   A0A5J6RDK2  

Pubmed

22278237    18971277    31239538    27231358    27718337    28634353    + More
24723718    25759498    17459938    24723704    24964136    25153521    24744332    26584185    26337879    26514769    26250097    25817405    26982324    28758347    29621617    29695146    29569144    27424024    29872066    29363281    30758768    29875375    25843648    30126059    23203570    27793730    26262637    21909766    28495648    11711626    19625463    18514348    23182435    28116527    15722532    26482289    26616599    19523910    15019237    23171741    31561498   

EMBL

JQ065046    AFD29219.1    FJ376622    ACJ12064.1    LC364342    BBC54824.1    + More
JQ065044    AFD29203.1    MK204388    QDY92323.1    LC364344    BBC54844.1    LC364343    BBC54834.1    FJ376619    ACJ12037.1    FJ376620    ACJ12046.1    FJ376621    ACJ12055.1    KU984334    KU870479    KU870480    KU870481    KU870482    AMW88199.1    APC23093.1    APC23094.1    APC23095.1    APC23096.1    KR265851    AML40806.1    LC216914    BAY00725.1    KJ567050    AHM88402.1    KJ769231    AIH06859.1    EF584908    ABQ39960.1    KJ601779    AIB07802.1    KJ601778    AIB07795.1    KJ601777    AIB07787.1    KM820765    AIT11902.1    KJ481931    AHL45009.1    KJ601780    AIB07809.1    JQ065042    KJ462462    KJ569769    KJ584355    KJ584356    KJ584357    KJ584358    KJ584359    KJ584360    KJ620016    KM012168    KT381613    AFD29189.1    AHN16222.1    AHN16229.1    AIA60975.1    AIA60982.1    AIA60989.1    AIA60996.1    AIA61003.1    AIA61009.1    AIA99520.1    AIP90488.1    ALJ32187.1    KP981395    KP757890    KP757891    KP757892    KT266822    KR131621    KT021234    KT336560    KT313675    KT313676    KT313677    KT313679    KT313681    KT313682    KT313683    KT313684    KT313685    KT313686    KR150443    KR265847    KR265848    KR265849    KR265850    KR265852    KR265853    KR265854    KR265855    KR265856    KR265857    KR265858    KR265859    KR265860    KR265861    KR265862    KR265863    KR265865    KU665558    KU051641    KU051642    KU051643    KU051644    KU051645    KU051646    KU051647    KU051648    KU051649    KU051650    KU051651    KU051652    KU051653    KU051654    KU051655    KU051656    KU517165    KU981059    KU981060    KU981061    KU981062    KX022602    KX022603    KX022604    KX022605    KU870483    KU870484    KY065120    KY129985    KX834351    KX834352    KX443143    KY354363    KY354364    KY364365    KY293677    KY293678    MF431742    MF431743    KY926512    MF948005    KY363868    KY513724    KY513725    MF041982    MF280390    MG242062    MG837130    MG837131    MG837132    MG837133    MH708123    MH708124    MH708125    MG832584    MH715491    LC260045    LC260038    LC260039    LC260040    LC260041    LC260042    LC260043    LC260044    MK005882    MK330605    AKA97940.1    AKC54430.1    AKC54437.1    AKC54444.1    AKQ63085.1    ALA13747.1    ALD83758.1    ALS54088.1    ALT00611.1    ALT00612.1    ALT00613.1    ALT00615.1    ALT00617.1    ALT00618.1    ALT00619.1    ALT00620.1    ALT00621.1    ALT00622.1    AML40606.1    AML40778.1    AML40785.1    AML40792.1    AML40799.1    AML40813.1    AML40820.1    AML40827.1    AML40834.1    AML40841.1    AML40848.1    AML40855.1    AML40862.1    AML40869.1    AML40876.1    AML40883.1    AML40890.1    AML40904.1    AML83918.1    AMN91623.1    AMN91629.1    AMN91635.1    AMN91641.1    AMN91647.1    AMN91653.1    AMN91659.1    AMN91665.1    AMN91672.1    AMN91678.1    AMN91684.1    AMN91690.1    AMN91696.1    AMN91702.1    AMN91708.1    AMN91714.1    ANA78298.1    ANA78445.1    ANI85827.1    ANI85834.1    ANI85841.1    ANI85848.1    APC23097.1    APC23098.1    APG38200.1    APW35736.1    APZ76692.1    APZ76700.1    AQS99155.1    AQT34132.1    AQT34138.1    ARJ31776.1    ASK86336.1    ASK86343.1    ASR75141.1    ASR75152.1    ASS83088.1    ATJ00131.1    ATV90800.1    AUG59158.1    AUG59166.1    AUH28252.1    AVR48521.1    AVZ61084.1    AWG96867.1    AWG96874.1    AWG96880.1    AWG96886.1    AXP32218.1    AXP32225.1    AXP32232.1    AYP31080.1    AYU65234.1    BAZ95611.1    BBA66307.1    BBA66314.1    BBA66321.1    BBA66328.1    BBA66335.1    BBA66342.1    BBA66349.1    QCO76965.1    QDP14520.1    LC216915    BAY00732.1    JQ065043    AFD29196.1    MF095123    KY398011    MK572803    MK330604    ASY98689.1    ATU88975.1    QDH76196.1    QDP14513.1    KX118627    AOM53029.1    KY363867    ATV90796.1    KR265864    AML40897.1    KT313678    KT313680    ALT00614.1    ALT00616.1    MK355396    QDH76190.1    MG812375    MG812376    AWV67109.1    AWV67118.1    MK673766    QEX51275.1    MG812377    AWV67127.1    LC364345    LC364346    BBC54854.1    BBC54863.1    JQ065045    AFD29211.1    MG812378    AWV67136.1    MF642322    AWV96561.1    MF642323    MF642324    AWV96568.1    AWV96575.1    MF642325    AWV96582.1    MK211169    QDF21513.1    MH532440    AXP20283.1    JQ065049    AFD29246.1    MH013338    AWR88317.1    JQ065048    AFD29236.1    JQ065047    AFD29228.1    MK581202    QDQ69125.1    FJ849810    ACZ67632.1    MK423877    QDA76268.1    MK423876    QDA76259.1    KP662631    AKC34136.1    JX565011    AFV92601.1    FJ849812    ACZ67634.1    FJ849811    ACZ67633.1    MG021194    AXR85436.1    JQ693042    JQ693044    AFZ88837.1    AFZ88839.1    KX272465    APY20698.1    JQ693039    AFZ88834.1    MK581203    QDQ69138.1    KR231009    ALH21115.1    JF705860    JF699749    AEO86772.1    AEO88932.1    EU826086    ACE95722.1    AF363600    GQ504722    AAK50027.1    ADP06477.1    JX014375    AFN88521.1    KY805846    ARS23156.1    AJ311362    FN430414    CAZ86703.1    AY325733    AAP86208.1    MF462335    ASU92400.1    KX252773    APY23492.1    GQ174479    ACS45211.1    KT736032    AMK51952.1    EU022525    ABW75128.1    KP118886    AJT47900.1    AF363605    AAK50032.1    AY325735    KC013541    KC119407    AAP86210.1    AFY11702.1    AFY11711.1    KX252785    APY23600.1    FJ849809    ACZ67631.1    KU900739    ARS22414.1    MH151328    QAV53736.1    EU753856    EU826083    ACE80212.1    ACE95719.1    AY646283    AAT70776.1    AY702975    KJ425496    KP343691    KT852992    KR608272    KU356856    KT002187    AAU14252.1    AHX25996.1    AKJ66257.1    AMD40267.1    AMH39309.1    ANI21153.1    AOG62366.1    FJ821773    ACO58564.1    MK937831    QDA76322.1    GQ174485    ACS45217.1    KX236004    APY26776.1    KX302867    APZ73719.1    AF470628    AAO33466.1    EU714034    GQ227602    KF377577    KP036503    KP036504    KP118880    KP118881    KP118882    KP118883    KP118884    KP118885    KP118887    KP118888    KP118891    KP118893    MK032177    MK032179    MK032180    ACD93207.1    ACT55271.1    AGY56144.1    AJP16725.1    AJP16734.1    AJT47846.1    AJT47855.1    AJT47864.1    AJT47873.1    AJT47882.1    AJT47891.1    AJT47909.1    AJT47918.1    AJT47945.1    AJT47963.1    AZA07828.1    AZA07846.1    AZA07854.1    FJ849814    ACZ67636.1    AY302747    AAP68695.1    FJ807653    GQ179645    JF893452    KF663560    ACO37578.1    ACS45205.1    AEJ80242.1    AHB74003.1    KX259251    AQD20705.1    KX434788    AQY55870.1    HQ141058    ADW77296.1    MK887092    QEY95697.1   

Proteomes

UP000162232    UP000103579    UP000135406    UP000161619    UP000116644    UP000011786    + More
UP000112854    UP000171091    UP000126862    UP000139576    UP000104403    UP000129252    UP000160089    UP000114014    UP000102644    UP000172095    UP000103266    UP000118543    UP000122701    UP000124223    UP000147537    UP000149778    UP000152486    UP000152859    UP000156755    UP000161942    UP000174689    UP000097413    UP000100106    UP000108307    UP000115701    UP000116882    UP000117737    UP000118503    UP000120336    UP000120804    UP000130144    UP000131750    UP000132517    UP000136494    UP000137853    UP000141273    UP000144892    UP000147360    UP000148151    UP000150502    UP000151351    UP000154045    UP000156468    UP000158884    UP000161041    UP000162784    UP000163421    UP000169372    UP000170248    UP000172024    UP000180351    UP000180352    UP000103330    UP000118624    UP000142997    UP000144236    UP000167590    UP000132721    UP000130326    UP000097758    UP000172963    UP000101527    UP000159366    UP000107304    UP000117980    UP000166017    UP000119449    UP000165290    UP000118234    UP000102195    UP000138732    UP000139325    UP000159001    UP000100522    UP000105510    UP000108163    UP000109170    UP000111271    UP000121165    UP000124537    UP000136129    UP000142905    UP000146859    UP000147307    UP000149934    UP000170218    UP000156427    UP000170434   

Pfam

PF01635   Corona_M

Interpro

IPR002574   Corona_M
IPR042550   GAMMA_CORONA_M

ProteinModelPortal

H9BR10   B6VDY9   A0A2Z5XXR4   H9BQZ4   A0A5B8JML2   A0A2Z5XXT2   + More
A0A2Z5XXS3   B6VDW2   B6VDX1   B6VDY0   A0A145YPB1   A0A140ES76   A0A1Z4F680   X2EZT4   A0A075X0D1   A6N254   A0A075E3D6   A0A075E3P1   A0A075E3D0   A0A097EU50   W8R479   A0A075E3L3   H9BQY0   A0A0E3U220   A0A1Z4F693   H9BQY7   A0A286NGL7   A0A1C9C4I5   A0A2H4NFS0   A0A140ESG7   A0A0U3BGC8   A0A514C923   A0A2Z4EVV0   A0A5J6NBG5   A0A2Z4EVY0   A0A2Z5XXU6   H9BR02   A0A2Z4EVU8   A0A2Z4G602   A0A2Z4G609   A0A2Z4G622   A0A4Y6ER58   A0A346IMW4   H9BR37   A0A2U9I694   H9BR27   H9BR19   A0A516UWD7   G4RJ85   A0A4Y5SY37   A0A4Y5SXV0   A0A0E3TI94   K7S5A6   G4RJ87   G4RJ86   A0A346PYP7   M4I8Z0   A0A1P8SFM3   M4I8Y6   A0A516UWC2   A0A0N9QUP2   G3FEJ2   B3VZS6   Q91SA1   I7B3F0   A0A1X9Y2Y2   Q91QS9   D0R6R0   Q7T9P7   A0A286LPM1   A0A1P8SMJ8   C6KCX6   A0A140DP47   B3TD52   A0A0D4CG32   Q91S98   Q7T9P6   A0A1P8SMV9   G4RJ84   A0A1X9Y2L9   A0A481NU89   B3VKF1   Q6DTU8   Q64FZ0   C1KF08   A0A4Y5SYV1   C6KCY2   A0A1P8SSN1   A0A1P8VF79   Q80RY9   B3GPG8   G4RJ89   Q7TEH1   C1KAC3   A0A1P8Z871   A0A1U9WSN4   E9LUF4   A0A5J6RDK2  

PDB

3VFC     E-value=5.42044,     Score=65