Strain

CHINA_PIG_2010_NC_039208 (Region: China: Hong Kong;  Strain: Porcine coronavirus HKU15 strain HKU15-155, complete genome.;  Date: 2010)

Gene

membrane protein

Description

Annotated in NCBI,  membrane protein

Location

NC_039208(+):23034-23687

GenBank Accession

YP_009513023.1

Full name

Membrane protein      

Alternative Name

E1 glycoprotein
Matrix glycoprotein
Membrane glycoprotein

CDS

ATGTCTGACGCAGAAGAGTGGCAAATTATTGTTTTCATTGCGATCATATGGGCGCTTGGCGTCATCCTCCAAGGAGGCTATGCCACGCGTAATCGTGTGATCTATGTTATTAAACTTATTCTGCTTTGGCTGCTCCAACCCTTCACCCTAGTGGTGACCATTTGGACCGCAGTTGACAGATCATCTAAGAAGGACGCAGTTTTCATTGTGTCCATAATTTTTGCCGTACTGACCTTCATATCCTGGCCCAAGTACTGGTATGACTCAATTCGTTTATTAATGAAAACCAGATCTGCATGGGCACTCTCACCTGAGAGTAGACTCCTTGCAGGGATTATGGATCCAATGGGTACATGGAGGTGCATTCCCATCGACCACATGGCTCCAATTCTCACACCAGTCGTTAAGCATGGCAAGCTCAAGCTACATGGGCAAGAGCTGGCCAATGGCATATCAGTTAGAAATCCGCCACAGGATATGGTGATAGTGTCACCAAGTGACACCTTTCACTACACTTTTAAGAAACCTGTGGAATCAAACAACGATCCAGAATTCGCTGTTCTGATATACCAGGGTGACCGCGCTTCAAACGCTGGACTTCACACCATAACCACTTCAAAGGCCGGTGACGCTCGCCTGTATAAGTATATGTAA

Protein

MSDAEEWQIIVFIAIIWALGVILQGGYATRNRVIYVIKLILLWLLQPFTLVVTIWTAVDRSSKKDAVFIVSIIFAVLTFISWPKYWYDSIRLLMKTRSAWALSPESRLLAGIMDPMGTWRCIPIDHMAPILTPVVKHGKLKLHGQELANGISVRNPPQDMVIVSPSDTFHYTFKKPVESNNDPEFAVLIYQGDRASNAGLHTITTSKAGDARLYKYM

Function

Component of the viral envelope that plays a central role in virus morphogenesis and assembly via its interactions with other viral proteins.

Subunit

Homomultimer. Interacts with envelope E protein in the budding compartment of the host cell, which is located between endoplasmic reticulum and the Golgi complex. Forms a complex with HE and S proteins. Interacts with nucleocapsid N protein. This interaction probably participates in RNA packaging into the virus.

Similarity

Belongs to the gammacoronaviruses M protein family.

Uniprot

H9BQY7   A0A1Z4F680   X2EZT4   A0A075X0D1   A6N254   A0A075E3D6   + More
A0A075E3P1   A0A075E3D0   A0A097EU50   W8R479   A0A075E3L3   H9BQY0   A0A0E3U220   A0A1Z4F693   A0A145YPB1   A0A2H4NFS0   A0A140ES76   A0A1C9C4I5   A0A140ESG7   A0A0U3BGC8   A0A286NGL7   A0A5J6NBG5   A0A514C923   A0A2Z4G602   A0A2Z4EVV0   A0A2Z4G622   A0A2Z4G609   A0A4Y6ER58   A0A2Z4EVY0   A0A2Z5XXU6   A0A2Z4EVU8   H9BR02   A0A346IMW4   A0A2Z5XXR4   A0A2Z5XXT2   H9BQZ4   A0A2Z5XXS3   B6VDX1   A0A5B8JML2   B6VDW2   B6VDY0   H9BR10   B6VDY9   H9BR37   H9BR27   A0A2U9I694   H9BR19   A0A516UWD7   A0A0N9QUP2   G4RJ85   G4RJ86   G4RJ87   A0A346PYP7   Q91SA2   A0A516UWC2   A0A1X9Y2Y2   M4I8Z0   B3VZS6   Q91S97   Q7T9P7   G4RJ84   J9WTV9   J9WMI2   A5Z118   I6ZUM5   A0A4Y5SXV0   I1YZI1   A0A4Y5SY37   K7S5A6   D7SCB1   J9WLT6   A0A1P8SSN1   D0R6R0   J9WMH8   A4ZCJ2   M4I8Y6   A0A1L5YN77   A4ZCS4   J7KDW5   G4RJ89   A0A1P8SMV9   A0A0D4CG32   F4MIR0   A0A140DP47   B3VKF1   J7K9N1   Q91S98   A5Z1A5   A0A1P8NTQ1   C5IUA1   A0A1P8Z871   Q7TEG9   C4PE57   C5IUA0   A0A1P8Z838   Q7T9P6   A0A1X9Y2R8   C6KCX4   A4ZCQ8   G4RJ96  

Pubmed

22278237    28634353    24723718    25759498    17459938    24723704    + More
24964136    25153521    24744332    26584185    26337879    26514769    26250097    25817405    26982324    27718337    28758347    29621617    29695146    29569144    27231358    27424024    29363281    29872066    30758768    18971277    31239538    29875375    26262637    30126059    28495648    23203570    18295413    22421962    19625463    18045937    27938680    21539870    23182435    22966194    28116527   

EMBL

JQ065043    AFD29196.1    LC216914    BAY00725.1    KJ567050    AHM88402.1    + More
KJ769231    AIH06859.1    EF584908    ABQ39960.1    KJ601779    AIB07802.1    KJ601778    AIB07795.1    KJ601777    AIB07787.1    KM820765    AIT11902.1    KJ481931    AHL45009.1    KJ601780    AIB07809.1    JQ065042    KJ462462    KJ569769    KJ584355    KJ584356    KJ584357    KJ584358    KJ584359    KJ584360    KJ620016    KM012168    KT381613    AFD29189.1    AHN16222.1    AHN16229.1    AIA60975.1    AIA60982.1    AIA60989.1    AIA60996.1    AIA61003.1    AIA61009.1    AIA99520.1    AIP90488.1    ALJ32187.1    KP981395    KP757890    KP757891    KP757892    KT266822    KR131621    KT021234    KT336560    KT313675    KT313676    KT313677    KT313679    KT313681    KT313682    KT313683    KT313684    KT313685    KT313686    KR150443    KR265847    KR265848    KR265849    KR265850    KR265852    KR265853    KR265854    KR265855    KR265856    KR265857    KR265858    KR265859    KR265860    KR265861    KR265862    KR265863    KR265865    KU665558    KU051641    KU051642    KU051643    KU051644    KU051645    KU051646    KU051647    KU051648    KU051649    KU051650    KU051651    KU051652    KU051653    KU051654    KU051655    KU051656    KU517165    KU981059    KU981060    KU981061    KU981062    KX022602    KX022603    KX022604    KX022605    KU870483    KU870484    KY065120    KY129985    KX834351    KX834352    KX443143    KY354363    KY354364    KY364365    KY293677    KY293678    MF431742    MF431743    KY926512    MF948005    KY363868    KY513724    KY513725    MF041982    MF280390    MG242062    MG837130    MG837131    MG837132    MG837133    MH708123    MH708124    MH708125    MG832584    MH715491    LC260045    LC260038    LC260039    LC260040    LC260041    LC260042    LC260043    LC260044    MK005882    MK330605    AKA97940.1    AKC54430.1    AKC54437.1    AKC54444.1    AKQ63085.1    ALA13747.1    ALD83758.1    ALS54088.1    ALT00611.1    ALT00612.1    ALT00613.1    ALT00615.1    ALT00617.1    ALT00618.1    ALT00619.1    ALT00620.1    ALT00621.1    ALT00622.1    AML40606.1    AML40778.1    AML40785.1    AML40792.1    AML40799.1    AML40813.1    AML40820.1    AML40827.1    AML40834.1    AML40841.1    AML40848.1    AML40855.1    AML40862.1    AML40869.1    AML40876.1    AML40883.1    AML40890.1    AML40904.1    AML83918.1    AMN91623.1    AMN91629.1    AMN91635.1    AMN91641.1    AMN91647.1    AMN91653.1    AMN91659.1    AMN91665.1    AMN91672.1    AMN91678.1    AMN91684.1    AMN91690.1    AMN91696.1    AMN91702.1    AMN91708.1    AMN91714.1    ANA78298.1    ANA78445.1    ANI85827.1    ANI85834.1    ANI85841.1    ANI85848.1    APC23097.1    APC23098.1    APG38200.1    APW35736.1    APZ76692.1    APZ76700.1    AQS99155.1    AQT34132.1    AQT34138.1    ARJ31776.1    ASK86336.1    ASK86343.1    ASR75141.1    ASR75152.1    ASS83088.1    ATJ00131.1    ATV90800.1    AUG59158.1    AUG59166.1    AUH28252.1    AVR48521.1    AVZ61084.1    AWG96867.1    AWG96874.1    AWG96880.1    AWG96886.1    AXP32218.1    AXP32225.1    AXP32232.1    AYP31080.1    AYU65234.1    BAZ95611.1    BBA66307.1    BBA66314.1    BBA66321.1    BBA66328.1    BBA66335.1    BBA66342.1    BBA66349.1    QCO76965.1    QDP14520.1    LC216915    BAY00732.1    KU984334    KU870479    KU870480    KU870481    KU870482    AMW88199.1    APC23093.1    APC23094.1    APC23095.1    APC23096.1    KY363867    ATV90796.1    KR265851    AML40806.1    KX118627    AOM53029.1    KR265864    AML40897.1    KT313678    KT313680    ALT00614.1    ALT00616.1    MF095123    KY398011    MK572803    MK330604    ASY98689.1    ATU88975.1    QDH76196.1    QDP14513.1    MK673766    QEX51275.1    MK355396    QDH76190.1    MF642322    AWV96561.1    MG812375    MG812376    AWV67109.1    AWV67118.1    MF642325    AWV96582.1    MF642323    MF642324    AWV96568.1    AWV96575.1    MK211169    QDF21513.1    MG812377    AWV67127.1    LC364345    LC364346    BBC54854.1    BBC54863.1    MG812378    AWV67136.1    JQ065045    AFD29211.1    MH532440    AXP20283.1    LC364342    BBC54824.1    LC364344    BBC54844.1    JQ065044    AFD29203.1    LC364343    BBC54834.1    FJ376620    ACJ12046.1    MK204388    QDY92323.1    FJ376619    ACJ12037.1    FJ376621    ACJ12055.1    JQ065046    AFD29219.1    FJ376622    ACJ12064.1    JQ065049    AFD29246.1    JQ065048    AFD29236.1    MH013338    AWR88317.1    JQ065047    AFD29228.1    MK581202    QDQ69125.1    KR231009    ALH21115.1    FJ849810    ACZ67632.1    FJ849811    ACZ67633.1    FJ849812    ACZ67634.1    MG021194    AXR85436.1    AF363599    AAK50026.1    MK581203    QDQ69138.1    KY805846    ARS23156.1    JQ693042    JQ693044    AFZ88837.1    AFZ88839.1    EU826086    ACE95722.1    AF363606    AAK50033.1    AY325733    AAP86208.1    FJ849809    ACZ67631.1    JX273188    AFS18108.1    JX273181    AFS18101.1    EF602447    FJ965344    JX014371    JX273177    JX273189    JX273190    JX273192    ABQ84826.1    ACR55673.1    AFN88517.1    AFS18097.1    AFS18109.1    AFS18110.1    AFS18112.1    JX014366    AFN88512.1    MK423876    QDA76259.1    JQ088078    AFJ11180.1    MK423877    QDA76268.1    JX565011    AFV92601.1    HM245924    ADI54959.1    JX273185    AFS18105.1    KX236004    APY26776.1    FN430414    CAZ86703.1    JX273176    AFS18096.1    DQ490205    ABF61469.1    JQ693039    AFZ88834.1    KU556805    APP92733.1    DQ490216    ABF61551.1    JX255512    AFQ98266.1    FJ849814    ACZ67636.1    KX252785    APY23600.1    KP118886    AJT47900.1    FJ904714    ADA83481.1    KT736032    AMK51952.1    EU753856    EU826083    ACE80212.1    ACE95719.1    JX195175    AFQ94217.1    AF363605    AAK50032.1    EF602458    KX219797    ABQ84913.1    APV46152.1    KX185058    APX44060.1    FJ965346    FJ965347    ACR55675.1    ACR55676.1    KX259251    AQD20705.1    AY302749    AAP68697.1    FJ919613    HQ848267    ACQ91087.1    AEB00710.1    FJ965345    ACR55674.1    KX259249    AQD20687.1    AY325735    KC013541    KC119407    AAP86210.1    AFY11702.1    AFY11711.1    KU900744    ARS22464.1    GQ174477    ACS45209.1    DQ490214    ABF61535.1    FJ849821    ACZ67643.1   

Proteomes

UP000103330    UP000126862    UP000139576    UP000104403    UP000129252    UP000160089    + More
UP000114014    UP000102644    UP000172095    UP000103266    UP000118543    UP000122701    UP000124223    UP000147537    UP000149778    UP000152486    UP000152859    UP000156755    UP000161942    UP000174689    UP000097413    UP000100106    UP000108307    UP000115701    UP000116882    UP000117737    UP000118503    UP000120336    UP000120804    UP000130144    UP000131750    UP000132517    UP000136494    UP000137853    UP000141273    UP000144892    UP000147360    UP000148151    UP000150502    UP000151351    UP000154045    UP000156468    UP000158884    UP000161041    UP000162784    UP000163421    UP000169372    UP000170248    UP000172024    UP000180351    UP000180352    UP000112854    UP000171091    UP000118624    UP000142997    UP000135406    UP000116644    UP000161619    UP000011786    UP000162232    UP000103579    UP000144236    UP000167590    UP000132721    UP000097758    UP000139891    UP000124698    UP000159366    UP000166017    UP000133571    UP000107304    UP000129345    UP000100089    UP000119449    UP000165290   

Pfam

PF01635   Corona_M

Interpro

IPR002574   Corona_M
IPR042550   GAMMA_CORONA_M

ProteinModelPortal

H9BQY7   A0A1Z4F680   X2EZT4   A0A075X0D1   A6N254   A0A075E3D6   + More
A0A075E3P1   A0A075E3D0   A0A097EU50   W8R479   A0A075E3L3   H9BQY0   A0A0E3U220   A0A1Z4F693   A0A145YPB1   A0A2H4NFS0   A0A140ES76   A0A1C9C4I5   A0A140ESG7   A0A0U3BGC8   A0A286NGL7   A0A5J6NBG5   A0A514C923   A0A2Z4G602   A0A2Z4EVV0   A0A2Z4G622   A0A2Z4G609   A0A4Y6ER58   A0A2Z4EVY0   A0A2Z5XXU6   A0A2Z4EVU8   H9BR02   A0A346IMW4   A0A2Z5XXR4   A0A2Z5XXT2   H9BQZ4   A0A2Z5XXS3   B6VDX1   A0A5B8JML2   B6VDW2   B6VDY0   H9BR10   B6VDY9   H9BR37   H9BR27   A0A2U9I694   H9BR19   A0A516UWD7   A0A0N9QUP2   G4RJ85   G4RJ86   G4RJ87   A0A346PYP7   Q91SA2   A0A516UWC2   A0A1X9Y2Y2   M4I8Z0   B3VZS6   Q91S97   Q7T9P7   G4RJ84   J9WTV9   J9WMI2   A5Z118   I6ZUM5   A0A4Y5SXV0   I1YZI1   A0A4Y5SY37   K7S5A6   D7SCB1   J9WLT6   A0A1P8SSN1   D0R6R0   J9WMH8   A4ZCJ2   M4I8Y6   A0A1L5YN77   A4ZCS4   J7KDW5   G4RJ89   A0A1P8SMV9   A0A0D4CG32   F4MIR0   A0A140DP47   B3VKF1   J7K9N1   Q91S98   A5Z1A5   A0A1P8NTQ1   C5IUA1   A0A1P8Z871   Q7TEG9   C4PE57   C5IUA0   A0A1P8Z838   Q7T9P6   A0A1X9Y2R8   C6KCX4   A4ZCQ8   G4RJ96  

PDB

3VFC     E-value=5.42044,     Score=65