Strain

NETHERLAND_FERRET_2010_NC_030292 (Region: Netherlands;  Strain: Ferret coronavirus isolate FRCoV-NL-2010, complete genome.;  Date: 2010)

Gene

non-structural protein 3c

Description

Annotated in NCBI,  non-structural protein 3c

Location

NC_030292(+):24473-25216

GenBank Accession

YP_009256198.1

Full name

Non-structural protein 3b       + More
Putative non-structural protein 3b      

Alternative Name

Accessory protein 3b
Protein X2
Non-structural protein 3-1
X2b protein

CDS

ATGATTGCTAATTTGTTTGTAGGCTTGTTTTTACAATCTATATCATTTCTTAAACAAGATGTTACAATTATCTCTACAGACATTGTTAACAGTTCTAAATCTGTTGTTGCTAGTGAGCAACACTTTGTTGTTAATAGCAAACATTATCGTGCTATTCCTGAGTTTAGCATTGCTGTTTTGTTTGTTCTCTTTTTGGCTATGTACCGTTGTACGAGCTTTAAGCAGAATGTAGCTATACTTATTTTCAAGATCGTGGCTATGTGTTTTATTGCACCATTACTTATAATGTTTGGTTGTTATATTGATGGTGTTATTACCATAGTTGTACTTTTAGCAAGGTTTTGTTATTTAAGCTACTTTTGGTTCAGGTTCAAGCGTTTTGAGTTTGTATTCTACAACGTTTCAACTCTGATGTTCGTACACGGTAGAGCTGCACCGTATTTAAGAAGTTCGCACAACACTCATTATGTTACCCTCTATGGAGGTCTTAACTACATGTGTGTTGACGATCTTGCGCTGCACTTTGTGAACCCTATGCTAGTCAAGCTAGCTATTAGAGGCTTAGTTCAATTAGATCTTAATGTTGTTAGATCCATAGAACTTCTTAACGGTGATTTTATTTACATATTCTCACCAGAGCCTGTTGTTGGGGTTTACAATGCTGCATTTGACCGTGAAATTGTAAACGAAATTGACTTAAAAGAAAGTATCTATGAAATTCCCGACTCTACTGACAGTGATTGA

Protein

MIANLFVGLFLQSISFLKQDVTIISTDIVNSSKSVVASEQHFVVNSKHYRAIPEFSIAVLFVLFLAMYRCTSFKQNVAILIFKIVAMCFIAPLLIMFGCYIDGVITIVVLLARFCYLSYFWFRFKRFEFVFYNVSTLMFVHGRAAPYLRSSHNTHYVTLYGGLNYMCVDDLALHFVNPMLVKLAIRGLVQLDLNVVRSIELLNGDFIYIFSPEPVVGVYNAAFDREIVNEIDLKESIYEIPDSTDSD

Similarity

Belongs to the coronaviruses NS3b protein family.

Keywords

Host membrane   Membrane   Transmembrane   Transmembrane helix   Reference proteome  

Feature

chain  Non-structural protein 3b

Uniprot

A0A172AZB2   A0A222UBX8   A0A1B4X970   D3XGJ5   A0A222UC37   D3YGU5   + More
A0A224ANW5   D3YGU6   A0A0K2SF38   D9J1Z5   H9TEX3   E7E029   B7T4B1   F6M1R2   B7T064   E7E038   Q0ZVX3   H9TEW4   Q9YRA6   Q5VJT9   A0A0K2BMQ8   G8J7G7   I0B0R3   D2WXM0   B7T4C0   A0A2H4KI32   Q7T6T1   A0A0U2U3A1   G3CI06   V9IMT5   Q88512   Q0PKZ3   Q0PL02   Q1W2P0   A0A1S6KDU9   P09047   A0A1Y0AXV1   A0A2Z6FAB4   Q85084   V9IMK5   A0A2Z6FAB3   A0A077ERS8   A0A077EV34   D1LT74   Q0PL28   C0LLN8   S6BUL5   A0A0Y0RUF8   A0A1X9Y2H9   A0A3S6J4L3   A0A2H4KI10   D1LT82   A0A077EV74   Q76WT3   P24414   D1LT57   C0LLN1   D1LT76   V9ILU1   A0A1D8ELQ9   Q5VJU5   A0A1Z2WU98   A0A2H5BX15   A0A088NG13   V9IMT0   T1STP8   A0A384VNQ2   D1LT68   A0A2U8Z975   A0A077ERN3   A7UIZ8   D1LT70   A0A1Y0AXT9   Q2LJ81   A0A2Z6FA98   A0A077EVA2   V9ILW1   A0A384V9K5   A0A384V9N4   A0A1Y0AXV4   V9ILU5   A0A2Z6FA41   Q9QEV8   P22656   A0A2Z6FAB6   D1LT59   A0A077ER27   C6GHA9   A0A088NDC7   A0A1Y0AXT2   A0A077ER66   D1LT50   A0A384V9I8   C5IJ47   A0A088NCG8   D1LT69   A0A384V9G6   A0A384V9M9   A0A077EVB0   E0AH00  

Pubmed

20079778    21346029    21481551    19036814    22002680    25953186    + More
16704791    17275120    10365166    26221765    22609354    22438554    15177889    23043168    25890036    8546012    17023013    2825819    2548340    2549745    10805807    29769478    7707547    25150756    19889934    20229183    25180686    1848593    2174956    27619563    10948987    2546515   

EMBL

KM347965    AKG92641.1    KX512809    ASR18939.1    LC119077    BAV31350.1    + More
GU338457    ADD49359.1    KX512810    ASR18947.1    GU459059    ADD26775.1    LC215871    BBA21169.1    GU459060    ADD26776.1    LC029419    BAS25711.1    HM245925    ADI80514.1    JQ404410    KY063616    AFG19741.1    ASB15741.1    HQ450376    ADU17728.1    EU924790    ACJ64178.1    JF682842    AEE69325.1    EU856361    KP981644    ACJ63234.1    AKA65832.1    HQ450377    ADU17737.1    DQ112226    AAZ91439.1    JQ404409    AFG19732.1    AF104420    AAC96005.1    AY426984    AAR88621.1    KP849472    AKZ66474.1    JN856008    AEQ61970.1    JQ408980    AFH55114.1    GQ477367    ADB28910.1    EU924791    ACJ64187.1    KX722530    ASU62502.1    AY342160    KR061459    ALR84921.1    HM776941    KC962433    KU729220    AEM55568.1    AGM75128.1    AML22778.1    JQ304285    AEY69251.1    Z35758    CAA84808.1    DQ811789    ABG89332.1    DQ811788    ABG89326.1    DQ443743    ABD97837.1    HQ462571    KP202848    KX499468    KX900393    KX900394    KX900402    ADY39742.1    AKA60056.1    AQT01351.1    ASV64279.1    ASV64288.1    ASV64360.1    X06371    X12800    AJ271965    KX532152    ART29867.1    LC316072    BBE15211.1    U26210    AAA67951.1    JQ304287    AEY69252.1    LC316074    BBE15213.1    KJ665837    AIL54194.1    KJ665819    AIL54140.1    GU053633    ACY69062.1    DQ811785    ABG89294.1    FJ755618    FJ718990    JX013850    ACN71198.1    ACN79552.1    AFN88474.1    AB781789    BAN67912.1    KT696544    AMB66490.1    KX527917    ARS22396.1    KY406735    ASV45150.1    KX722529    ASU62491.1    GU053644    ACY69070.1    KJ665816    KJ665818    AIL54131.1    AIL54137.1    D00658    BAA00549.1    Z24675    GU053616    ACY69045.1    FJ718988    ACN79545.1    GU053635    ACY69064.1    JQ304288    AEY69253.1    KX689261    AOT21921.1    AY426983    AAR88615.1    KY292377    ASB16890.1    KY566209    KY566210    KY566211    AUG98122.1    AUG98133.1    AUG98144.1    KJ879414    AIN55947.1    JQ304279    AEY69246.1    KF530123    AGT52083.1    KX900411    ASV64440.1    GU053627    ACY69056.1    MF457603    MF457604    MF457605    MF457606    AWN93273.1    AWN93275.1    AWN93277.1    AWN93279.1    KJ665817    AIL54134.1    EU074218    KX532151    KX532154    KX532156    ABU49661.1    ART29866.1    ART29871.1    ART29874.1    GU053629    GU053631    ACY69058.1    ACY69060.1    KX532155    ART29872.1    DQ201447    ABC72416.1    LC316054    LC316055    LC316056    LC316057    LC316058    BBE15195.1    BBE15196.1    BBE15197.1    BBE15198.1    BBE15199.1    KJ665831    AIL54176.1    JQ304278    AEY69245.1    KX900403    ASV64369.1    KX900404    KX900405    KX900406    KX900407    ASV64377.1    ASV64386.1    ASV64395.1    ASV64404.1    KX532158    ART29877.1    JQ304273    AEY69240.1    LC316051    LC316052    LC316059    LC316061    LC316062    BBE15192.1    BBE15193.1    BBE15200.1    BBE15202.1    BBE15203.1    AF179886    AAF02712.1    X14551    LC316044    BBE15185.1    GU053618    ACY69047.1    KJ665815    AIL54128.1    FJ938053    ACT10879.1    KJ879419    AIN55961.1    KX532153    ART29869.1    KJ665830    AIL54173.1    GU053609    ACY69038.1    KX900395    KX900399    KX900400    KX900401    ASV64297.1    ASV64333.1    ASV64342.1    ASV64351.1    FJ943763    ACR46123.1    KJ879423    AIN55973.1    GU053628    ACY69057.1    KX900398    ASV64324.1    KX900396    KX900397    ASV64306.1    ASV64315.1    KJ665836    AIL54191.1    HQ012372    ADL71500.1   

Proteomes

UP000150460    UP000272061    UP000156811    UP000106470    UP000115330    UP000119169    + More
UP000174600    UP000153699    UP000096172    UP000129066    UP000125818    UP000123026    UP000131894    UP000166047    UP000158285    UP000137024    UP000158504    UP000098772    UP000113525    UP000001440    UP000145148    UP000111647    UP000166023    UP000113324    UP000121388    UP000156732    UP000123646    UP000110620   

PRIDE

P09047   

Pfam

PF03053   Corona_NS3b

Interpro

IPR004293   Coronavirus_Orf3b

ProteinModelPortal

A0A172AZB2   A0A222UBX8   A0A1B4X970   D3XGJ5   A0A222UC37   D3YGU5   + More
A0A224ANW5   D3YGU6   A0A0K2SF38   D9J1Z5   H9TEX3   E7E029   B7T4B1   F6M1R2   B7T064   E7E038   Q0ZVX3   H9TEW4   Q9YRA6   Q5VJT9   A0A0K2BMQ8   G8J7G7   I0B0R3   D2WXM0   B7T4C0   A0A2H4KI32   Q7T6T1   A0A0U2U3A1   G3CI06   V9IMT5   Q88512   Q0PKZ3   Q0PL02   Q1W2P0   A0A1S6KDU9   P09047   A0A1Y0AXV1   A0A2Z6FAB4   Q85084   V9IMK5   A0A2Z6FAB3   A0A077ERS8   A0A077EV34   D1LT74   Q0PL28   C0LLN8   S6BUL5   A0A0Y0RUF8   A0A1X9Y2H9   A0A3S6J4L3   A0A2H4KI10   D1LT82   A0A077EV74   Q76WT3   P24414   D1LT57   C0LLN1   D1LT76   V9ILU1   A0A1D8ELQ9   Q5VJU5   A0A1Z2WU98   A0A2H5BX15   A0A088NG13   V9IMT0   T1STP8   A0A384VNQ2   D1LT68   A0A2U8Z975   A0A077ERN3   A7UIZ8   D1LT70   A0A1Y0AXT9   Q2LJ81   A0A2Z6FA98   A0A077EVA2   V9ILW1   A0A384V9K5   A0A384V9N4   A0A1Y0AXV4   V9ILU5   A0A2Z6FA41   Q9QEV8   P22656   A0A2Z6FAB6   D1LT59   A0A077ER27   C6GHA9   A0A088NDC7   A0A1Y0AXT2   A0A077ER66   D1LT50   A0A384V9I8   C5IJ47   A0A088NCG8   D1LT69   A0A384V9G6   A0A384V9M9   A0A077EVB0   E0AH00  

PDB

4R04     E-value=9.30641,     Score=64