Strain
Avian_JQ065047
(Region: China: Hong Kong; Strain: Night-heron coronavirus HKU19 strain HKU19-6918, complete genome.; Date: 2007)
Gene
replicase polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
replicase polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGGCTCTAAACAGGTAGACCACACCTGTCTAACCATACCACCAAACCCTTCTAAAACGCTGGCTCTCTTTATAACAACAGTGGCTGCGCAAGAAGGTAAAACCTTTAAGACAGTTGATGATGTCAAGACTATTTCTAAGTTCAACATCCGCCGTGGGAATGTAGTACCAGGCATACTTGCACTTGACAATCATACAACTCTTTCTGATTTTGAAAATCTGGTTGGTATTCAACCAGTCTTAAGAACTCTTCGAGAGCTTCTTAAGTCATCTGACTGGGCAGAGACTACTGAGTCTCTGTGGAGAAAGACCATGGATTTAACATGGTCTAAACAACTCTGCCGTGCAATCATGCTCTACGGCAGTGTTAAACTATCTTCGTTAGCATCCTTAGTTTATTACAACAAGGTGCTAGGAATTAAACAAGGTCCATTATCTGACGTGATGCGAGACATAGTGCTTACTGAGGCCGTTAATGGTACACTTGCCCAAAAGTTACTTCACTTCACAAAAGTAGAAGTAAAGCAAACTGATGACTATTTGACCTTAACTCAGAAAGGAGAGCTCTCTGATATGTTTAAGGCCAAATTGTTGCTCCTCTCTGAAAATCGCAATGGTTTCTACCAGTACAAAGACTACGTCTTCTGGCCAGCAGCCACTGCCTTAAAAACAGAGAATACAATGCAACTTTTGTACCAACAACCTTTACCTGTAGTAGAAGGTAATGCCATTGGTACAAAGAACATTAAATTAGCACCAACAAAAACCACTATAAAAACCCCTGTCACAGGAGATGTGGTTCGCATTGGTGATATCAATTACATCATACAACAAGACAACCCACCGTACTATTTACCTTTAGTAGATGGTGGTGTTGCACCCCAACCTCTGCGTGAAATTGGTACAGTCTTCAAGACTGTAAAAGTCACATTTCACGCACCTCCAAGTGACATACTTCACAACTTAATCACCCTCCAGGCGTCAGCACGTGGAGCAATCATAGACTTTGAAAAAGGTACTGATGTAGGTGAAAATGTGAAAGTTTATGTTGGACCTTCTCAACCAGGTGATGTGGTAGCGCGTGATGATGAAGATTACATCAAGTGCTTCCAAAAGGACCAGGTTAGGACTCTCTATAACACCATAAAGGATGGTACAATGTTGCAACTTTACACTCTTCAAGGTAGTGTTGTTGACAATGTTTTTCCACTCTTTCACAAACTTCTGTCATGGCTTAACAAGGTCTCAGACCTCTGTGGAGGTGCACTCTCTGCACTTGTGGCTAGCGTGACAGAACAACTTCTTAATATTAAAGTAAGCATTGTGATGCAGCTAACTAATCTTCAACTGGTAGCAAAGTCTACACTTGAGTTGGCTACTAACATCACACAGCTTAGCACTATCTTAAACCCTTTATTTACAGCAATAAAGGAGCATTCTAAGAAACTTTTCAACATGTTCACGTTGTCAATCACAAAAGATCAATTGATCTTCTTTGATGATGACGACGTGTTTGTTGCAAATGTAACATCTGACACACCAGTCCAAGGTACTGTTTACAATTTTTCAACAGATGTTGTCGTAAATTGTACTGGTGATGTTTACACTTCCACCTGTGATTATATTAAACCCACAGGTAAAAAGGAACCAATTAATGCTGTTTCAACAATCTATATCAAAAGTGGTAAGAATGTTGTTAAAATGGCCTATGATGGTGATTACTGCTATCCACAGGGTTCAGATAATTCCATCATATCACATGCTTTTAAGGTAGGTGGTCTCAAACCAATACTTATAAAGCAAACTAGTAACAAACCTAAAAAGGCTGTTACATTAAATGAAACTACAGTGGAACATGGAGAGGAGACTACTTATGGTAGTCTTAACGCAGACAAGTTTACAAATCCACAGGGACCTGTGCGTAAACTACCAGGATTGCGTTTGATCCTTGATTGTCAACTGTATGATGAAGACACTAACACAGCCATTAATGAAGAGATTCATGGTTGTGATGATAACTGGGAGCCACTCTATTATGAGAAAGACTCCACCATTGAAGACATTGAACAACTAGTTGAAGACACACTCTACACTGTTTTGACAGAACAACGTCCAGACTTAGGTGTAGACCCTGTAGACTTCATTCTATTTAATGCTGTGACTAATGACACAGCTACAATTACAGATATTAGTAGTGGCAATTTGACACTACAAATATTACCTCTAGAGGATGAAAATTGCTCTGATTCTGAAGACTACAGTAGTGGTTCTGAAGTAGAGTATGAAGAAGATGATCCTACTTATTTTGACAATGGTGATGATATAGGAGCTTATCCTATAGTACCATTGACTCCTGTTTTTACACAAAGCACAACTTCTTCAACATTGTCAGATCAGAAGTTACGCGACGCTGGTGACGCCCAGTCAGAATCTGAAGTGCTTGTCGATACAGTGGATTGTGTAGAAGAGGAGCCATTTACACCATTGAAGTCTTATGTCTCAATGGATAACTTACAATGTTCTACTGATGACGAGGAAACCATACCGATTGTTCCTGGTATGGAAAATGTCATAGTAGATGATGAAACACAGTACCCACAAGGAGACTGTGAAGATATAGTGTGTGAAACTGATGAAGAGTATTTTTCAGATTCAGAACAAACCTTAGTTGGTATAAACCAATATCTTTACAACTTACCTGTTGAAGCCATCATTGATGAACAGCCAACACAGGTAGAATTTCACATTGGAGATATTAGATCGCTGAAAGGCTTACGCAATGCAATCATTGTTAATGCAGCAAACGAGCGCCTTACCAATGGTGGAGGAATTGCGAAGGCAATAAGTGATCTAGCAGGTCCTGAATATCAAGCTTGTTGTGATAAAGCAGCACCTATATCTAAACCATTTTTAACCAATGCATATGACTTAGTTTTCTATGGCTATGCAGGAATTTTACATGTTGTACCACCACGTGGTAATGACCCAAATGTTAAGCAGAAGTTGTATGAAGCATACAAATCTGTTTTTACAAAACCATCTCATTATGTCATACCAGTACTAGGTGCTGGCATTTTTGGATGTAACCCTGTAGACTCTCTTCAAGCATTGAAGAAAGCTCTACCGCAAAACATTGGTAAAGTCACTATTATGTCCTTAGACAAGGAACATAAGAATATATGGGATGCAATAAATGCAACCATCGTGACTTATACCTATGATATGGACCAACTATACACAGGAGCTTTAAGTAAAGATCAGATAAGACAGTTGAACTTATTTGATGGTACTGATTATGTTTCTGAAGCTGTAGCTGGTGTTACTTATTTAGCAGTTAGTGACAAAGTAGCCACTAGTGCTAAAGAACTAGACTTAACAATGTCTCAATACTACAAGTATTTAGACTATTGTTCCTTACAATGGAAAGTTAAGAAAACTAACTTTACACATCTTGTAGTGGTTAGAAATAATTGTTTCATCACTGCAGTCTTAGACTTTTTGCAAAACACCCATGTAACATTTCGACAACCACTAGATGGCTTATATAAGCAGTATCTAAATGGTAATGTTGAACAACTTGTTGCATGGTGTTATGCTATAACCAACCAAACACCTGGTGACACAGGTGATGCAGTAGCTGTTTTATCAGCATTGCTAAAATACAATACTGATACCATCATTGCAACAACAGAGTGTTGCGGTTCTAAAGTTGACCTAGATGGTATGATATTTACAACTACTCTTTTAGATTTCAAACCTACAGTACACTGTGTAAAATGTGACACGTTTACTGGGTTGTCAGATCTACAAGTACCAGGTATTGTAGTAGCTTGTTCAAATGCTATAAAACCTGAAGAATACAAAACATCATTACCAACTATTAGTCACAATGCATCTGGAGTTGGTCACTGGTTCGCAGCATTAAATAAAGGATTAGATGGTTCAAACTTGAAAGGTGCAACCATTGATGTCATTTATTTTAAGAATCAAAAGCCTAAACCAGTTGAAGATGTCCTGTTGGATAATGTTGTGTTAACTAATAGGTATCAAGCACTAGCAGTTGAAGAGATAGTACAAGACACTAGTGAAGAACCTGTTAAACAAGAAGAAACTAAGGCTGACGTTGCTACAACTGATGTTAAAGTCTTAGATAATCCTGATAGTCTTGACATGTTAGCATTATGGATTGAAAAACCAGCATATGTTATGGTCAAGTCTTTTAAACTACTGGGTACTGTGCTCTTTGCCACAGGAAAAGTTGTACAGTACACCACAAAATTAATAACAGCCACTTATAATTTTCTGAAAAGAAGTGGTTTGTTAAGTAAAACTACTGACACTATCACCAACTTTTGCTTAAAAATTGTTAAGGATAATGTTAAATCTTTTACAACAAACATTAACTTTAAATTTTTAGCTACTGTTTGTTATACTTATATGTACAACATTTTGGCTGCAGTGCTACCATTTCTGATGTTAATACCAGTAGGTAGCATACTTAAGTCTGCTTTGTTGTTCTTTAACTATCTACGCTCATACACCTCAGTGTGTAGCATAGATATTATACCAAAATATGAAGAAGCAAAACCTTATAATTTAGAATCTTTTTGTTCTGACAAGCCATACTATTGTATGCCTTGTCTGCAGGGAAAGGATTCTATACATTTCTATAAACATTTAGTTGTACAATATACAACATCTATGGGCTATGACATAAATGTTACCTTATGGTCGCTTATAGTGGTGTTGTTATATTTTAAACCTCTTTTGTTTATTGTCACTACTAGTGTGGTTACATTTATCAATAGCATGGAGTTTTACATTCCATTCTATGGTACTTATAGCCTTACTTATACTAATACATATATAACAGTAATAATTATTAATTTGATGTATAAATCTTTTTGTTTTGTTAAACACCTTGTTTCTGGGTGCAGCAAAACAGGCTGTAGTATATGTGCTAAAAAGTCTGTGTATACTGTTCTTAATGTAGAAACAGT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Protein
MGSKQVDHTCLTIPPNPSKTLALFITTVAAQEGKTFKTVDDVKTISKFNIRRGNVVPGILALDNHTTLSDFENLVGIQPVLRTLRELLKSSDWAETTESLWRKTMDLTWSKQLCRAIMLYGSVKLSSLASLVYYNKVLGIKQGPLSDVMRDIVLTEAVNGTLAQKLLHFTKVEVKQTDDYLTLTQKGELSDMFKAKLLLLSENRNGFYQYKDYVFWPAATALKTENTMQLLYQQPLPVVEGNAIGTKNIKLAPTKTTIKTPVTGDVVRIGDINYIIQQDNPPYYLPLVDGGVAPQPLREIGTVFKTVKVTFHAPPSDILHNLITLQASARGAIIDFEKGTDVGENVKVYVGPSQPGDVVARDDEDYIKCFQKDQVRTLYNTIKDGTMLQLYTLQGSVVDNVFPLFHKLLSWLNKVSDLCGGALSALVASVTEQLLNIKVSIVMQLTNLQLVAKSTLELATNITQLSTILNPLFTAIKEHSKKLFNMFTLSITKDQLIFFDDDDVFVANVTSDTPVQGTVYNFSTDVVVNCTGDVYTSTCDYIKPTGKKEPINAVSTIYIKSGKNVVKMAYDGDYCYPQGSDNSIISHAFKVGGLKPILIKQTSNKPKKAVTLNETTVEHGEETTYGSLNADKFTNPQGPVRKLPGLRLILDCQLYDEDTNTAINEEIHGCDDNWEPLYYEKDSTIEDIEQLVEDTLYTVLTEQRPDLGVDPVDFILFNAVTNDTATITDISSGNLTLQILPLEDENCSDSEDYSSGSEVEYEEDDPTYFDNGDDIGAYPIVPLTPVFTQSTTSSTLSDQKLRDAGDAQSESEVLVDTVDCVEEEPFTPLKSYVSMDNLQCSTDDEETIPIVPGMENVIVDDETQYPQGDCEDIVCETDEEYFSDSEQTLVGINQYLYNLPVEAIIDEQPTQVEFHIGDIRSLKGLRNAIIVNAANERLTNGGGIAKAISDLAGPEYQACCDKAAPISKPFLTNAYDLVFYGYAGILHVVPPRGNDPNVKQKLYEAYKSVFTKPSHYVIPVLGAGIFGCNPVDSLQALKKALPQNIGKVTIMSLDKEHKNIWDAINATIVTYTYDMDQLYTGALSKDQIRQLNLFDGTDYVSEAVAGVTYLAVSDKVATSAKELDLTMSQYYKYLDYCSLQWKVKKTNFTHLVVVRNNCFITAVLDFLQNTHVTFRQPLDGLYKQYLNGNVEQLVAWCYAITNQTPGDTGDAVAVLSALLKYNTDTIIATTECCGSKVDLDGMIFTTTLLDFKPTVHCVKCDTFTGLSDLQVPGIVVACSNAIKPEEYKTSLPTISHNASGVGHWFAALNKGLDGSNLKGATIDVIYFKNQKPKPVEDVLLDNVVLTNRYQALAVEEIVQDTSEEPVKQEETKADVATTDVKVLDNPDSLDMLALWIEKPAYVMVKSFKLLGTVLFATGKVVQYTTKLITATYNFLKRSGLLSKTTDTITNFCLKIVKDNVKSFTTNINFKFLATVCYTYMYNILAAVLPFLMLIPVGSILKSALLFFNYLRSYTSVCSIDIIPKYEEAKPYNLESFCSDKPYYCMPCLQGKDSIHFYKHLVVQYTTSMGYDINVTLWSLIVVLLYFKPLLFIVTTSVVTFINSMEFYIPFYGTYSLTYTNTYITVIIINLMYKSFCFVKHLVSGCSKTGCSICAKKSVYTVLNVETVIQGRKFVSQVSTNGGTKFCEKHNFYCLNCDNPMDDGTFIPVEAVESLSKATNTHVKPTSVAYAMSRDITCNGDVFMANVTINGKNIVTCNKYTDVRTVDQLKKPDLLSNYPQDVVIACDFENVAAVNLPNQMAAPMSMVLRRFVLIIDQQHTKPVNSYEQVKNLLNEFFSFQDLTQTGDLIADVKNATNNQVSDTAICAAKFAVDNGLDLTMDNPNNTVPHYAFDFNSLPSEDKSTLMDFGIGSSVLKGTSYNIILPYNLLVKLSVKTIIKLKSAAMKNGVKLLVTPSTRVIRGTLSVIPFNIKTGGNKVYTTFLSLLKLFLLVSVVAFLASCFVTWLFTLTPPTTMSHVEASNFRVIRNGVIDSIRADDYCFSNKYVAFDSFISRPYINFPSCPVVIANVYVAGDSVPGIPGHLFHRDNIIMHAYDLHKYTLQHLFETPASTWNVPEVAGYTQYSAVQGSYKDSYALFTSKCTYLSYKGDRELYCYDNMTVQETLSFMGEVETVINKTVKLYSELKPHVRYMTDTVDGKIHDVIIPEQLWYVPYLVKFTTNLYCRIGECFKTNPGYCLSFTNKFVVNDGIQQPGVYCGDTLVQLLTNMFFGVVSATDIMKSSTALLLSTSLIIGIVFLVMLFQRIFKQYTSFVGVVVLNAFLNIIGLIILTICKPLAYGFFGLYFYVTLTLTPITRSIIYVFMVVTLLPHVSNLLLLAFFIVMLFYNIYKYVRVVKYTASGGFKTFLDASKATFVISNDKYVEMLNLAGSEYDTYLASYARYRYYSGTTDSAEYNKVCMAFLAKALDNFKTSGGSVLYTPPKLTVVQAGIKRLLSPSGSVEKCMVSVHYRGLTLNGIWLNNVIYCPRHILGKYQASFWQDAVKVADTRDFVINSQHSKIQFRPVGLRLNNAILQIVLPTEQNNPHTPDYEFVTAKPGSSMTIACTYDGIVSAIYHVIMQTNGLIYASFMNGACGSVGYTLKNGKLLLHYMHHLEFNNKTHGGTDLNGNFYGDYIDEEIAQSISKAATLTDNALAHIYAHLSTISTKPKWLSYQELSVEDFNDWAKNNDHTQFPSCDENYTYLDALAKSTGVSIKRVLSTLVTLHTNWGSASVLGMSTFDLDFTPEMVYNQAPITLQGTKKSTIFTWLASVAFNFIVYMTALMYVIPNNVLYIVVPATLMTAIVTQLFIKHTTVYMLAYCLPMVVLCVYNTFTIWVPNTMFRQIVYYAYTCFYEPSIAQYMVYLSVFLVSINAVKSLIVVRSNMQALYALYNFVRSALFGYTATMLLDSGLVNATYIVWFVASMSPTGSLLATLNWYLADYIASSFQFDLLCKMFIYHTLGFVVCMRFGLYWWINKFTGIPVGTYKFVVSSEQLKYMMATRMSPPKNFVEVLMTNMKLLGVGGKRDIAISTVQNKTLDIKATAVIIAQLLEKVGVTNKTEMCKKITQLHNKVLASKTAEEAEPHLYALLVYLLPHFSSDNLDKYFDSLLQHKPVLQVVADAFIHLDSYKIYKDAQQAYDEAVERGAEASEIKKALKAVNIAKAEYDRDVAAEKKLAKLADSALKSMYLAERSEDRKAKLTSGLTAMLYHMLRRVDSDKVKALFELAKSDVIPLHAITGSSTDGLKVIIGDQQTYEQYVTGNQVIFRGRTYVINTMYDLDNQILQEKPQSFPIVLECTKLNVLEKLHNMGWDTIDIKLQNNELYVRNVFCAQSTCTDANDNQSTGKTFYVSQSGNKILVAVTSTNDNLRTVTVTKDDGSKVVLNLEQPMRFAHMVNGKHLNTYLYFVANIKTIYRGMIIGHISSTVSLQSSGTSVEYQENNSLLTYLAFAVNPREAYLAHISNGGKPIQGAVRVIAPQGEGFAVTTKPQPNAMQHAYGGASICLYCRAHVTHPSMDGRCNYKGRFVHIDKDLEPTQFALTHEPCTACHRWVNHDCTCTNLQLGYSSNQNNSYLNRVKGSSDARLEPCTSDNRPDVVVRAFNIYNNATAGIFKSTKNNCTRFKSTRPGSIINKPVRTIETFFVTKQCTENVFRAEEQCYNMLPKSIVSTDDKFSCVAYHDFFKFDGVNNVVRRHLTKYTLLDLVYALRHLSTSQEIIQEILTTMCGTSEEWFVDGWYDPIENPTFYDEFHKLGSLINNCVVMANKFADTCKTVGLVGILTADNQDLGGQIYDFGDFVVTQPGNGCIEMDAYLSYIMPSMSMTHMLKCECLDDNGSYKDYSIYQYDFTDYKMELFNKYFRHWSQTYHPNCVDCVDDRCIVHCANFNILFAMCLPNTCFGNLCSQATVDGHPIVQTVGLHSKELGIVMNQDVNNHMSNINMPTLLRLVGDPTTMCSVADACLDLRTPCQTIASIASGATKQSVKPGHFNAHFYEHALESGILSEDSGIDIRHFYYMQDGEAAIKDYSYYRYNTPTMVDIKQFLFVMEVADKYLSFYDGGCIPAETVVVNNLDKSAGYPFNKLGKARNYYDLTYAEQNAMFEYTKRNVLPTVTQMNLKYAISAKDRARTVAGVSIISTMTNRQYHQKLLKSISVARNQTIVIGTTKFYGGWDNMLRNLMANINNPKLAGWDYPKCDRSMPNLLRITSSLLLARKHACCTHSQRFYRLANECAQVLSEIVVSGNVMYVKPGGTSSGDATTAYANSVFNILQVVSANIARFMSTSAATHHDVDVMHLHRQIYDDIYRGNSNDSVAIQSFYEHLQKYFGLMILSDDGVACIDQEAAKQGMVADLDDFRDVLFYQNNVYMSDSKCWIETDMSKGPHEFCSQHTVLAEYDGEPCYYPYPDVSRILGACIFVNETEKTDPVQNLERYISLAIDAYPLTKVDNKKGKVFYVLLDYIRKLANELQEGIMDAFQTSTDTSYINNFVTENFYSDMYAKAPVLQATGSCVVCGSPTILRCGECIRRPLLCCVCCYNHVTRTDHKRVIAINNYICSVENCNEDNVEELFISGTAIYCRAHKPVLCIPIVANGTVFGIYRHTARGSDDIDLFNQLATSDYTTIEPYQLANKAPVPLMLFAAETIKAKEEAIKRSYATATVKEVYDSKLIKLSWEHNKKVPPITKNHIFTGYHFNKNGKTQVGDYILVKCDGDSYSYKATSTYKLQVGDALVLMSHVVTPLSAPPMLAQTNYTKPQQYASPSEAAFYATHFKSYDSIAKQKITTVLGPPGTGKSTFAIGLAKYFPNARICYTASSHAAIDALCEKAYKTLPREQCSRIVPTRTTVECFSDFVVNNTTAKYVFSTINALPDIKCDIVVVDEISMLTNYELSSVNARLSYNHIVYVGDPYQLPSPRTMLTSGQLQPVDYNVVTSIMVQAGADVMLNICFRCPAEIVYTVSKLVYDNKLLSAKPA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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR042515
Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR014827 Viral_protease
IPR014829 NSP8
IPR036499 NSP9_sf
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR009466 NSP11
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR014822 NSP9
IPR037227 EndoU-like
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR036333 NSP10_sf
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score= 954 Identity=50.42%
Cov(Q)=15.06% Cov(P)=99.06%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
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GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0033644 C:host cell membrane
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6280
Number of predicted TMHs:
16
Exp number of AAs in TMHs:
362.668989999999
Exp number, first 60 AAs:
0.0118
Total prob of N-in:
0.06571
outside
1 - 1477
TMhelix
1478 - 1500
inside
1501 - 1575
TMhelix
1576 - 1598
outside
1599 - 1607
TMhelix
1608 - 1630
inside
1631 - 1983
TMhelix
1984 - 2006
outside
2007 - 2049
TMhelix
2050 - 2072
inside
2073 - 2281
TMhelix
2282 - 2304
outside
2305 - 2308
TMhelix
2309 - 2331
inside
2332 - 2337
TMhelix
2338 - 2360
outside
2361 - 2364
TMhelix
2365 - 2387
inside
2388 - 2800
TMhelix
2801 - 2823
outside
2824 - 2826
TMhelix
2827 - 2846
inside
2847 - 2850
TMhelix
2851 - 2873
outside
2874 - 2892
TMhelix
2893 - 2911
inside
2912 - 2923
TMhelix
2924 - 2943
outside
2944 - 2952
TMhelix
2953 - 2975
inside
2976 - 2987
TMhelix
2988 - 3010
outside
3011 - 6280
