Strain
Dolphin_KF793826
(Region: Germany; Strain: Bottlenose dolphin coronavirus HKU22 isolate CF090331, complete genome.; Date: 2008-2010)
Gene
replicase polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
replicase polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGTCTAAGTACCAAAAGTCAGTAGTTTCTACTAGAAATGCAAAGGTGGAGGTGGTTTACACCAGACCAGGCTTGCCGTTCCTGGATTACCTGCGCATCATGTATGGACCAACTAAGAAGTTGGATCAGATAAAGGACACCTCCATTGGAGAAGTTCATTGTGGGGATAAGGTCCTTAAATTTATCAACAACCCCGTAGTGGGTATTGTTTGTAATGAAGGTGATGTACCCTTTCCAGAACTTGAAGAAAAGTATGGAGGGAATGAGCTTACTAAGCTCTATCAGCACCTTGCTGCTACTCAGTCTATTTGGAGCAAAAGCTCTGCCGATTTGGTGGCAAAGGCTGAGTCTGTGGCGCATGTTGAAGGAATTGATAGATTGGTTGGGTGTTACAACCTTCGTATCAATATGTGTGCGACTCTTGCAGTGCTTAAGAACTTCCTTTGGAAGATTGAAGGTCTTGTTAAGAATGTAGCTGAGGGCTATATTGAACCTATGCAGGATAAGTTTAATACTTTGCTTGGTGATTACCTGGTAAGTGTTAAAATTACACCTACTGTTGTTAAGGAGTTGGCAAAATTGGCCAAGTCTATTCCTATGCTGAAAGTTGAGAACCATGTGCTGCGTTTGTTCGGAGCGGGTGGTGATTTTGTTGATTGTATCAACAAGTTCCTTTCAGATGTGTATTATAGACATCCTGGGCATGTGGAATATCATGGTGTGAAGGTTTCCGCCACGATTTTCTATCGCAACAACTGTGCAAAGATAAGCCGTGCGTATATCATGCCACCAAAAGTTGTTTGTAAGCCTGATGTGTATTTTGAAGCTACACCTGCTACTCAGTTTCAAACTGTGATTGTTGAAGGGAGTGGAGAGGAAGTGCATGAGCTCCGTCAAGTTATTGGTGAAGTACCAGAAGGACAGAAAGGCATTATTGTGCTTTCTGATGGTGCTGCCTATTTTAAGTACCTAGGTTCAGATGGAAAGGAATACCTTTCACTCTGGGTAGGTGTGGGATGCCTTAAATACCCTATTTATGTGCCAGAGCAACCTGCAGCAGTTAAATTTGCTGAGGCTGTGTCAGTGTTGGAATATGAACAAGAAGAAGAGCCGGACATTGCGATTAGATGCAAGTTCAGATGTTTTAATGGCAACCACATTGAAAAAGACCTTGATAAGGCAATTGATGAAATTGTATTTGAAGCAGAGTGTACCATTGAGGAAGTTCATGCAGTGTTTTATACCAGAATGTGTGAATATTTTGAAGAGCAAGGTAGCTCTGAAGAAATTCCACTTTTTGAAGAAACTGCCCTTGTGGATCCTGATTACCGTCTTTTGGATGGTCTCAGAAAGGTTGTTAGATTAGTCATGTTGGGTGAAGTCGCTGATGCGGAGGATGAAGACAACTATGATTGGAATGATGAAGATGCAGAGTCCCAGCCACCTGATGTTGAATTTGAAGAGCAGGTTCAAGATGAGGATGACTCTGTTGAAGTAGATGAAGGTGATTATGAAGAAGACACCTTTAACCTAGCTATGGGTGTACCTATGATCCATAGCGATGATGAGCTTGACCTTGTATGTGATGTTGATGATGATGAGCTGGTTGACGAGGGCGAAGAGCCTGATGTGCGGAGTTCATTAGAAGAGACTGACCTTGAGGTTAATGTTCAGTGTAATGATGATGCGGGTTGGTCTGAGGATCCTCTGGTGGTTGATGAGGACTCAGCAGACACCTCTGCTCAAGAAGAAGATGAAAACGAAAGTGCTAGTGCGCCTGAAACCTCTCAAGAGGATATGGCAACTACACCTGAGACATCTCATAATAAAAACGAAGTTGCTAGTGCAATGGAAACCACATATATTACCAATGACATGGCGGTGTGTAATCCAGAAGCCGTTGTTGATGGAGATATAGTGGAAATTGAAAATCAATTTTCTAGTGTTATTGAGGAGGGCGAGAAAAACGCTACCTCAGCTAGTGCAGATATTGTAAAATCTGCGGTAGGTCTCGTTGACCCGCGGAGCGATTCCTTGACTGACCAGCAGTCGGGTGTTGGTGACCTTGTGTGTAAACAGGTTGTTAGTAGTGTGGCTACGGTGCAGAGCGAAGTGGTAGGCGAAGGCAGTCCCGTACATACGCCTGATGCTGACGCGCTCATTGCAAGCTCCACTGCTAACCAAGGAGTAGCGACCAAAGGATTCGAGAGTGCTTCAAATGATGAAGAGTCTGTTAGTGGGGCTGAGAGTGTTTTACCCCTTACTGATTGTGATACTAGTTCATCTAGTAATTCTGCCAAACCTCTGCAACAGCGGCAAAAGAGGCTGAAAAAGAGAAAGGCTAAAAAATCTGGTGCTGATGCTGATACTGATCCCTCGAACTATTCTGGTATAAAGGGGGTTAGGGATGATTGTAGAGATGAATCAGCTCAGGCTTCGTGTAAGAGTGTATCCTCTGAGGAAGTGACAGATGTTGTTAAAGAAGATGAAGATTGGGGAAAAGCTGTTGATGCTCAGGAATGTAAAAACCTGGCAGGGCAGACTAAACCCTTCATCTTTTATGGAGATTTACAGGAGTTGCTGAAGCAACTTGGCGGGTTTGGTTCCATAATCATTAATGCCGCTAATGAAAGATTGCAGCATGGAGGTGGTTTTGCTAAAGCTGTAGCGAGTTTGGCAGGCCAACTGTTTATTAAGAAGTGTGAAGGTATAATTCGCACAAAGGGACCTGTGCCAATGGATACACGTATGGTTCAGACTGGTCCTTATAATTGTAGTATGTATGGAGTAAAGGCTATTAGAAATGCTGTTGCACCCAGAGGGAATGAACAGGATATTGAAGCTAAGCTCAATACAACTTATTACCATGCTATTCAGGATATTGTGAATAAGCCTGAGGTTATTATAACACCCTTGTTAGGGGCGGGGATATTTAATGTAGATCCTGAGTTGAGTCTTAAAGCACTCCTTAGGTATGCCACAAATAATGTGGTTATTATTACCAATGAGAAAAAGCAGTTTGAAATGCTTAAAGCTCATGGTTTAATTGAAGCCACTTTTTCAGGCGTGAAGACTTCTGCTCCAGGAACTTCGGTGAAGAGCGAAAAGGAGTTGGACTGGTCTGATAAAAGAACTGAAGAGGAAGAAGCTAATGTCTCAGGTACTTCGGTGAAAGACATAAGCACACCTAGAAGTGAGGCTCAAGTTGTTACTCCTGAGGAGAAAATTAATGAAGAACCTAAGCCTGAAAAAGCTGAGGAGGTTAAGAATTATTGGAAAAGCGAGTGTACTCGTGAATTGAACCTTGGTGCCGTCAGAGGATTAAATGGCATCTATAAATGTAAAAAGAGTGTTTTTCATGGTAGTTGTAATAATCCAGAACATAAGGGTTATTGTTGTGTATGTAATGGACATGTGTCGGAGGTAGTGTATTATTCTACCTTTGATGGTGTTAATTACAAAACCCATAAATTTAGTAATTTGGGTAAATTAGTGAAAGACGTCATAGGTGATAAAGTCTATGTTGATGGAGTTTGTGTAGATAACAAACCATTGTTTGAGATTCAACCAGGATCAACATTTTTGCGCTTATATCCAATTTCTGAGGCTGATAAGCAGCATATTAGAGATATTAATGAGCTAAGTCTAAAACAATATGGTGTGTTTGCTGCAGTTTATGCAAGAGAACACCCCATTATTGAGAGTGGTGGTTTGAGATATTTAAAACAGAAAAATAATAACTGTTTTGTGTCTACTGCCCTAGTTATGTTACAGCACTTGAAGCTTGAATTCAAGGGGATAGTTAAGGAATTATGGAGTAACTTTTTGGCTGGAGATGCTCGTGGAATTGTAGCTTATACCTATGCATTACTTTATCCTACTGTGAAGTATGGAGATATGGGTGATGCAGAAGAGGTAGTACTTAAGTACCTTAATAAGGCAAATTTATGTGCACAATTGACATTAAATATCAAGTGCAAATGTGGTGAAAGGAATCACACTTTTAATGGTGTAGATGCTGTTTACTGCATTGCTGATGTTTCTACTAGACATAAAGCATTAACGAGTCGCATAGTGTGTGCTTGTAATAATGTTAAATCTAGTATTGTGTATGCAGATCTTCCTTTTGTTTTTGTTCATCGTAATGTTACGACTAAGATAAAGTTAGAGGAAGACTTTGTTTGTGCAAACGTTTTTAAGCATGGTTCACATTATTGTGGTACTAATGCAATGTATAGTTATGATTCTATGAGTTCTAAAGCAGGAAAACCGATTTTAGAATCCAGTTTTTCTGCCATTGTATTTGAAGGATTTTTTAAGGCCAATACCGAAGTCTCAGAGGCGATAGATGAGGCCATTGAGAGCGGTGTGGATATTCACGGAAGTGAGGAAAACCAGGATGCTGATGCTGGAAAGCAACATGCAGGAAGTACCTTCACTCCCCCTCGAAAAGGCGACACCCGAGGTGCCACTGGGCGTACTGTGGTGGACGTCCCCAGTAAAGGTGATGTAGGGAGTGCGGTGAAAACTGTAGAGAGTGTGAGTAATGCTATTAGTGTTCGTCAGGACCCACATTTCCATGTGAATAATTTTGAAGTCCTTAGTGTGCAAAGTTTGCCCGCTGAGAGTGCTGATCCTGTTGTAAAGAAAGCTAGTGTAGTTACTATGAAGGGCGATTTTAAACCCTTTAAAGTAGGAAACACTACTGTTAAACCTGGTAAAGGACCTCAATTAGAGGAGTATTTAACGTTAGATGTGATTAAGCAAGCTTGGATAACTGGCGATTACAATGTTGTAATTCGCCGGACATCCACCCTAACAAAGATGTTGGGAGTTGTAGCAATGGATACAGGTAAAATAGTGTTTGATAGTATGCTTAAGGCAGCAAATGCTATTATTGATTATGCAAAGAGACATAACCTTCAGAAGAAGGCAATACAAGAAGCAAAGGAAGTTGCTACTATGTTGTCTCCTTATATGGATGTTAAAGTAGTAAAAGG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Protein
MSKYQKSVVSTRNAKVEVVYTRPGLPFLDYLRIMYGPTKKLDQIKDTSIGEVHCGDKVLKFINNPVVGIVCNEGDVPFPELEEKYGGNELTKLYQHLAATQSIWSKSSADLVAKAESVAHVEGIDRLVGCYNLRINMCATLAVLKNFLWKIEGLVKNVAEGYIEPMQDKFNTLLGDYLVSVKITPTVVKELAKLAKSIPMLKVENHVLRLFGAGGDFVDCINKFLSDVYYRHPGHVEYHGVKVSATIFYRNNCAKISRAYIMPPKVVCKPDVYFEATPATQFQTVIVEGSGEEVHELRQVIGEVPEGQKGIIVLSDGAAYFKYLGSDGKEYLSLWVGVGCLKYPIYVPEQPAAVKFAEAVSVLEYEQEEEPDIAIRCKFRCFNGNHIEKDLDKAIDEIVFEAECTIEEVHAVFYTRMCEYFEEQGSSEEIPLFEETALVDPDYRLLDGLRKVVRLVMLGEVADAEDEDNYDWNDEDAESQPPDVEFEEQVQDEDDSVEVDEGDYEEDTFNLAMGVPMIHSDDELDLVCDVDDDELVDEGEEPDVRSSLEETDLEVNVQCNDDAGWSEDPLVVDEDSADTSAQEEDENESASAPETSQEDMATTPETSHNKNEVASAMETTYITNDMAVCNPEAVVDGDIVEIENQFSSVIEEGEKNATSASADIVKSAVGLVDPRSDSLTDQQSGVGDLVCKQVVSSVATVQSEVVGEGSPVHTPDADALIASSTANQGVATKGFESASNDEESVSGAESVLPLTDCDTSSSSNSAKPLQQRQKRLKKRKAKKSGADADTDPSNYSGIKGVRDDCRDESAQASCKSVSSEEVTDVVKEDEDWGKAVDAQECKNLAGQTKPFIFYGDLQELLKQLGGFGSIIINAANERLQHGGGFAKAVASLAGQLFIKKCEGIIRTKGPVPMDTRMVQTGPYNCSMYGVKAIRNAVAPRGNEQDIEAKLNTTYYHAIQDIVNKPEVIITPLLGAGIFNVDPELSLKALLRYATNNVVIITNEKKQFEMLKAHGLIEATFSGVKTSAPGTSVKSEKELDWSDKRTEEEEANVSGTSVKDISTPRSEAQVVTPEEKINEEPKPEKAEEVKNYWKSECTRELNLGAVRGLNGIYKCKKSVFHGSCNNPEHKGYCCVCNGHVSEVVYYSTFDGVNYKTHKFSNLGKLVKDVIGDKVYVDGVCVDNKPLFEIQPGSTFLRLYPISEADKQHIRDINELSLKQYGVFAAVYAREHPIIESGGLRYLKQKNNNCFVSTALVMLQHLKLEFKGIVKELWSNFLAGDARGIVAYTYALLYPTVKYGDMGDAEEVVLKYLNKANLCAQLTLNIKCKCGERNHTFNGVDAVYCIADVSTRHKALTSRIVCACNNVKSSIVYADLPFVFVHRNVTTKIKLEEDFVCANVFKHGSHYCGTNAMYSYDSMSSKAGKPILESSFSAIVFEGFFKANTEVSEAIDEAIESGVDIHGSEENQDADAGKQHAGSTFTPPRKGDTRGATGRTVVDVPSKGDVGSAVKTVESVSNAISVRQDPHFHVNNFEVLSVQSLPAESADPVVKKASVVTMKGDFKPFKVGNTTVKPGKGPQLEEYLTLDVIKQAWITGDYNVVIRRTSTLTKMLGVVAMDTGKIVFDSMLKAANAIIDYAKRHNLQKKAIQEAKEVATMLSPYMDVKVVKGMLFNVWSYLLTVLPLLQKPTELYGECLKKSSKVVGGVKASTWAVMVLACMCWWRQRQIAAGAVRLANWFTLGYLCYDYNTYSDYHFNVFDYCNGTLCELCLSGVDSLHLYKHAKTTYQKVVTTDFVGYAPLYFILQAVFFKSAAMLSGLLFMIKFTINFGVFNTGIYIVDYVVSTIANTIDPIMISTIVCGMIKLYRMANHYFYGCKNPACDRCHAANVSERTELSCVVGSKRFPYYVYANSVAKMCSKHMWCCKNCDVFGEGNTFISTAIVGDLTDKIRRKVKATSEALAIATLVEEGDNYELHYKLNGAEGSRVYDKNQFWNCAIPVSDASKCGKFEPDNFITYNASSQSELSLAKQCAVYYAQVLSRPTIIVPLSQEEYTSGKVTRTQVTRLLDLCDDYYGISDAEVKMSVIKSNTGATLSAAVQQYVAKIVPSQVMNLDVDFLLFCDRYGLTPSQAAYNNAVPNSTCNLDAYEGEQFLRVKEQVKSAFVQFGVKYVDFKMALNDSKIAILQYDFLKSLPGNYLPSLLMRIRQAGVTLRVTTSQIMQQDTLGGVRVTMVEDRVSKTQKMPKKNGGNPPSWIQRFFNFMQESFKMSLIGVLLGALMISLIAPTFTPSVVELAASGYKVIDNGVIRPIVETDNCFANKYAGFNDWYYGFVGRYPYNSVDCPVVVALTTIMDANMKGAIVPGYAGNMAWLNGQIVHYRHEFSWFTGSSAEGIVGYTRDIVVYGEDFIKSLALISARCVKLMMVSERLYCYGGSNDAIDALPFTAIQPHVVYNDAVGVGKLVVPEQLLYKPYIVYTQAREYCRAGVCEQAKEGYCINFNGEWALFNQHYTSKDGVYCGETPMSVVMSIINAYIYQGTTTSFFNRFCVLSVMMLLALIALVYVVKFQAFFKTYAGLACAILLSWGFNAIMLLSYSVNPIVVMPLIVVYMYVALTVTTPTAMIMHVAFLVTIVPMLPYSLMAIYGAYVLLMYTXVACWFVKTKVSSGKLFEKGEFVADFDTAARSTFLINNSVYVKLVNEVGDKFQKYLSGYARLKYYSGSGGDQECLDACRATLANALENFKNTQVEVLYTPPRFGVNLVTRLQAGIKKMVAPSSAVEQCVVSVVHGNTQLNGLWLNDYVLCPRHILGKYTGEQWRDALINANNFDFHILYKGMELQVVGRELVGALLKLKVSMVNANTPKYKFAKARIGDNFSIACAYNGHVSGLYTVTLRENGTLKGSFMSGSCGSVGYNVTNEGVEFVYMHHLELPGCVHGGSDLHGMFYGGYVDEEVLQRIPPAPANSRNIVAWLYAAVYNNCDWFVKYGPKQVMSVEDFNEWASGYGFTKFEYHLAFDVFSAATGVSVEQMLAALKELADGWNYAPILGSFHLDDEYSPEMIMQQTSGIVLQSNVKKATKGFLSRLGYWLVMVILTVYASCNVVPLDMLPQLIMSVGVGFAIMFVTLKHQHFFMTTAIIPYVVTSILGMALEKPVFYNGWYFSFFHDFLKYVGIEATHQYAWMLLPFALYVAYNVAKGVGSTLINFNAGGISLWNSLVYGMRWGSTLRFLYTALMSDNVFETFGSSGEFYINMHMACVGLFSSDPASGYIIMWIVKQVNYVGYLAYFTELSYYTFVFYSCVLCYMFSCYFGLFWFTNKVLGTTFGKYPYKVSAGQFKYMMLNGMRGPRSTADVLITNMRLAGIGGERTITVSTVQSKLTDVKCATVVLMQLLTKLNVEANSRLHKHLVQTHNDILAESDPAICIEKLTGMLMTLLSIDSTLDVKALCDELLAKESVLQAVTDEFCALPSYVDYEKARASYEEIQKNSTNPQEIKAYKKAMNIAKSVLDRDIAVQKKLDAMAERAMSTMYKEAKSSEKKTRLVSSLHALLFSMIKRLDSDQVADVFEKARNGVVPLASVPITCSNKLTIVIPDMSLWEKVVVHDYVVYGNIVWDINEVVDMDGNQILPCRVSGEASWPLEVRLVRNGKLVGDLALLQNNELLPTGIKKSPCVAGANQERCAVPANAYYTSLKGQHFVAAITSEDPTLKYASFTGASGNLVVVELEPPCKFGVKTPDGAVKVMHLYFVKNVKNIVRGMVLGALTNVVALQHGVSTESVENCGILSLCSFALDAKECYLEYIKEGGTPLSNCVKMLTLHTGSGAAVTVKPAPTPEQDSFGGASVCLYCRAHISHPGVYGVCQFKGKFVQIPVEEKDPVGFCLRNKICIVCQMWIGFGCQCDSLRKDPLSIDPKPAAMPIRPKELLGVRAAGENSQDSAGFHHPGLDFTRVGANSESLELQSVPQNYLNRVRGLSEARLRPCASGLLPDVVKRAFDLYNSNTAGMYASLKHNCARFQELDENDDEIDSFFVVKQTTPHNFEHEEKCYLDLKADCVAVHDFFRFEGMYNICRQRLTKYTMMDLCYAFRHFDPNDCDVLKEILVVKGCCEWDYFDQPNWYDPVENPDWFSLISRLGPIFQRALIKVAEFCDLMVEKGYIGVVTLDNQDLNGNFYDFGDFKKVLPGCGVPVTTSYYSYMMPCLTACDALASERFFEFKATSGYKQYDLTKYDFTEEKLQLFMKYFKYWDRTYHPNCVECIDDRCLIHCANFNILFATLFPQTAFGCLCKRVYIDGVPFISTTGYHSKELGVLLNKDNSMSFSKMSIGELMRFAADPSLLVSASDAFVDLRTSCFSLSALSTGLTYQTVKPGHFNEDFYNFAEKKGFFKEGSSIPLKHFFYIQDGNAAIADFDYYRFNKPTMVDIQQFLFCFEVTDKYFEQYDGGCIPANQVVVTNLDKSAGYPFNKFGKARLYYESLSYAEQDQLFELTKRNILPTITQINMKYAISAKSRARTVAGVSILSTMTNRQFHQKCLKSIVNTRNATVVIGTTKFYGGWDNMLRNLMRGVEDPVLMGWDYPKCDRAMPSLLRLSASLILARRHKGCCDWNERIYRLANEAAQVLSEVALSNGGLYVKPGGTSSGDATTAYANSAFNLFQATAANVAQLLATPTSRIYVEEVRALQHELYTQVYRRDKPDMDFVYTFYAYLNKHFSLMILSDDGVVCYNSDYAEAGMVASIASFREVLFYQNNVFMADSKCWTEEDVKIGPHEFCSQHSMLVEIDGEMRYLPYPDPSRILGACVFVDDVEKTEPVVVMERYVALAIDAYPLIYHENEEYGKVFYLLLSYIQTLYQRLSNDMLMDYSFVMNIDTSSKFWEEDFYRQMYESSPTLQASGVCVVCNSQTVLRCGNCLRKPFLCCKCCYDHVMETEHKNVLSINPYVCSVAGCGESNVCKLFLGGMSYFCLDHKPRLAIPLVSGGTVFGIYRATCSGSPDVAVFNKLATTDWKSIDSYVLANNCSDSLRRFAAETVKATEELEKQQYASAEIKEIVGEKELVLSWEPGKTRPPLNRNYVFTGYHFTRNGKTQLGEFTFEKSDSQQSVYYKATSTSKLAVGDLFVLTSHNISPLTAPTICNQQIYTKFQNITPNLFLSEAFADNIPLYHIVGKQRRTTVQGPPGSGKSHFAIGLAAYFSNARIVYTACSHAAVDALCAKAFKFLKHDDCTRVVPMRVGVDCFSDFKVNDMTRKYIFSTINALPEVSCDILLVDEVSMLTNYELSYLNQKISYQYVVYVGDPAQLPAPRTLLNGCLEPAHYNLVTNIMVSTKPDIFLAKCYRCPKEIVDTVSELVYEGKFIANNPVSGQCFKCVVNTGNSDVKRELGSAYNQVQLDFVADFLKHNPLWRKACFISPYNSMNQRARRQLGLEVQTVDSSQGSEYDYVIFAVTADSPHAMNINRFNVAVTRAKVGILVLMRHNDSFYQGLKFVEIEGPRGKLQSQTTGLFKICSRNFKGLPPAYAPTYIALDEKYKVGDSVLATLLKVDTGSCVSYSHLVSLLGFKFDKGAGSSQIVSKYSPFITRDMAIRNVRGWVGFDVEASHAANEHIGTNLPLMVGFSIGTDYLVANEGLVMTEYNDEFRKIPARCPPGDQFAYLKPLLHKGKPWNVIRPQIVRMMADHLQDISDCVVLVTWSHSLELTTMRYFCKMGKEQKCKQCEGRGCAYNSAAETFHCWKHSFGCDFLYNPYLVDVQQWGYSGNLSSNHDRYCNMHGNAHVASADAKMTRCLAVYDCFVKNINWDVEYPIIANEEDVNRCCRHLQKLFVKSVCIGMNYDKVHDIGNPKGIKSANGISFNFYDKDPVADNVIRLDYDYDSMCERFKDGLALFWNCNVNCYPDNALVCRFDTRTLNALNLPGCNGGSLYVNKHAFHTEKYDRSAFRNLKSMPFFFFDDSPCDVKLVNDVAQDLVALSARDCITRCNIGGAVCWKHAKAYAEFVHAYNTCTLAGFTFWVSEKFDPYVLWKKFYKLQSLDQLVANVVKRDHFDDVKDDVPYVITGDKVFYRKGLQDVLIFENKTSMATSIAFEYYARRNIDVIPKSAILYGLGVDVTAGFTLWDRELSQPVFNGVVDTSKVIDIEPNEKLCVLYDDRVKGSRQRFLQTKNAVLISTTRVKVDGIELESVRIPASSCQIDSTPVSTVRDGNGQMFVYVRKDGKHVVPTSQLFTERRSFEDFFPLSVMERDFLNMEAPQFIAKYDCKGLGLEHVLYGDFSKKVIGGAHLTIGLARLYTQEKFDVHEISPSSFDVFKSYFVVTHAGAMKQVCTVLDVLLDDFINILKEIKVSHKGVVSEVLHYVVDYQTVDFMLWMGDNAINTFYPKLQADYWDSIKGKHPSVWSPGFNMPELYKVQNCQLEKCELANYGKTVLLPPGILMNVAKCTQLCQYLSKTTMCVPHNMRVMHFGAGSDKGVAPGTSVLRQWLPEGALLIDNDINRYVSDADACVISDCNVFKSQGKFDLIISDMYTSPKGVDIHEGIIKNNGISDCFGYLCHFIKNNLSLGGTFAVKITETSWLPELYELAQKCAYWTCFCTAVNTSSSEAFLVGVNYLGDVEKPIIDGSVMHANYLFWRNVTDLPLSARSLFDIAKFGLKVKATPVVNLKKENITELVINLLKNGKIVIRDSASVHYVDDSLII
Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR037204
NSP7_sf
IPR008740 Peptidase_C30
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR036333 NSP10_sf
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR014828 NSP7
IPR027352 CV_ZBD
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR037227 EndoU-like
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR009466 NSP11
IPR002589 Macro_dom
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR042515 Nsp15_N
IPR014827 Viral_protease
IPR014829 NSP8
IPR036499 NSP9_sf
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1167 Identity=60.69%
Cov(Q)=13.90% Cov(P)=96.96%
3D Structure
Ontologies
KEGG
GO
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
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GO:0033644 C:host cell membrane
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6663
Number of predicted TMHs:
12
Exp number of AAs in TMHs:
322.311719999996
Exp number, first 60 AAs:
0.01736
Total prob of N-in:
0.00187
outside
1 - 2265
TMhelix
2266 - 2288
inside
2289 - 2535
TMhelix
2536 - 2558
outside
2559 - 2567
TMhelix
2568 - 2590
inside
2591 - 2594
TMhelix
2595 - 2617
outside
2618 - 2631
TMhelix
2632 - 2654
inside
2655 - 3071
TMhelix
3072 - 3094
outside
3095 - 3097
TMhelix
3098 - 3117
inside
3118 - 3121
TMhelix
3122 - 3141
outside
3142 - 3160
TMhelix
3161 - 3183
inside
3184 - 3187
TMhelix
3188 - 3210
outside
3211 - 3254
TMhelix
3255 - 3277
inside
3278 - 3283
TMhelix
3284 - 3306
outside
3307 - 6663
