Strain
Human_OC43_KY967356
(Region: USA; Strain: Human coronavirus OC43 strain SC2924, complete genome.; Date: 2015)
Gene
replicase polyprotein 1ab
Description
Annotated in NCBI,
replicase polyprotein 1ab
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGTCGAAGATCAACAAATACGGTCTCGAACTACACTGGGCTCCAGAATTTCCATGGATGTTTGAGGACGCAGAGGAGAAGTTGGACAACCCTAGTAGTTCAGAGGTGGATATGATTTGCTCCACCACTGCGCAAAAGCTGGAAACAGACGGAATTTGTCCTGAAAATCATGTGATGGTGGATTGTCGCCGACTTCTTAAACAAGAGTGTTGTGTGCAGTCTAGCCTAATACGTGAAATTGTTATGAATGCAAGTCCATATTATTTGGAGGTGCTACTTCAAGATGCTTTGCAGTCCCGTGAAGCAGTTTTGGTTACAACCCCCTTAGGTATGTCCTTAGAGGCATGCTATGTGAGAGGTTGTAATCCTAAAGGATGGACCATGGGTTTGTTTCGGCGTAGAAGTGTGTGTAACACTGGTCGTTGCACTGTTAATAAGCATGTGGCCTATCAGTTATATATGATTGATCCTGCGGGTGTCTGTCTTGGTGCAGGTCAATTCGTGGGTTGGGTCATACCCTTAGCCTTTATGCCTGTGCAATCCCGGAAATTTATTGTTCCATGGGTTATGTACTTGCGTAAGCGTGGCGAAAAGGGTGCTTACAATAAAGATCATGGATGTGGCGGTTTTGGACATGTTTATGATTTTAAAGTTGAAGATGCTTATGACCAGGTGCATGAGGAGCCTAAGGGTAAGTTTTCTAAGAAGGCTTATGCTTTAATTAGAGGGTATCGTGGTGTTAAACCACTTCTCTATGTAGACCAGTATGGTTGTGATTATACTGGTAGTCTTGCAGATGGCTTAGAGGCTTATGCTGATAAGACATTGCAAGAAATGAAGGCATTATTTCCTACTTGGAGTCAGGAACTCCCTTTTGATGTAATTGTGGCATGGCATGTTGTGCGTGATCCACGTTATGTTATGAGATTGCAGAGTGCTGCTACTATATGTAGTGTTGCATATGTTGCTAATCCTACTGAAGACTTGTGTGATGGTTCTGTTGTTATAAAAGAACCTGTGCATGTTTATGCAGATGACTCTATTATTTTACGTCAATATAATTTATTTGACATTATGAGTCATTTTTATATGGAGGCAGATACAGTTGTAAATGCTTTTTATGGTGTTGCTTTGAAAGATTGTGGTTTTGTTATGCAGTTTGGTTACATTGATTGCGAACAAGACTCGTGTGATTTTAAAGGTTGGATTCCTGGTAACATGATAGATGGTTTTGCTTGCACCACTTGTGGTCATGTTTATGAAGTAGGTGATTTGATAGCACAATCTTCAGGTGTTTTGCCTGTTAACCCTGTATTGCATACTAAGAGTGCAGCAGGTTATGGTGGTTTTGGCTGTAAAGATTCTTTTACTCTGTATGGCCAAACTGTAGTTTATTTTGGAGGTTGTGTGTATTGGAGTCCAGCACGTAATATATGGATTCCTATATTAAAATCCTCTGTTAAGTCATATGACAGTTTGGTTTATACTGGAGTTTTAGGTTGCAAGGCTATTGTAAAGGAAACAAATCTCATTTGCAAAGCTCTGTACCTTGATTATGTTCAACACAAGTGTGGCAATTTACACCAACGGGAGTTGCTAGGTGTTTCAGATGTGTGGCATAAACAATTGCTAATAAATAGAGGTGTTTATAAACCTCTGTTAGAGAATATTGATTATTTTAATATGCGACGCGCTAAATTTAGTTTAGAAACTTTTACTGTTTGTGCAGATGGCTTTATGCCTTTTCTTTTAGATGATTTAGTTCCACGCGCATATTATTTGGCAGTAAGTGGTCAAGCATTTTGTGATTATGCAGATAAACTTTGCCATGCTGTTGTGTCTAAGAGTAAAGAGTTACTTGATGTGTCTCTGGATTCTTTAGGTGCAGCTATACATTATTTGAATTCTAAGATTGTTGATTTGGCTCAACATTTTAGTGATTTTGGAACAAGTTTTGTTTCTAAAATTGTTCATTTCTTTAAGACTTTTACTACTAGCACTGCTCTTGCATTTGCATGGGTTTTATTTCATGTTTTGCATGGTGCTTATATAGTAGTGGAGAGTGATATATATTTTGTTAAAAACATTCCTCGTTATGCTAGTGCTGTTGCACAAGCATTTCAGAGTGTTGCTAAAGTTGTACTGGACTCTTTAAGAGTTACTTTTATTGATGGCCTTTCTTGTTTTAAGATTGGACGTAGAAGAATTTGTCTTTCAGGCAGAAAAATTTATGAAGTTGCGCGTGGCTTGTTACATTCATCCCAATTGCCATTAGATGTTTATGATTTAACCATGCCTAGTCAAGTTCAGAAAGCCAAGCAAAAACCTATTTATTTAAAAGGTTCTGGTTCTGATTTTTCATTAGCGGATAGTGTAGTTGAAGTTGTTACAACTTCACTTACACCATGTGGCTATTCTGAACCACCTAAAGTTGCAGATAAAATTTGCATTGTGGATAATGTTTATATGGCCAAGGCTGGTGATAAATATTACCCTGTCGTGGTTGATGATCATGTTGGACTCTTGGATCAAGCATGGAGAGTTCCTTGTGCTGGACGGCGTGTTACATTTAAGGAACAGCCTACAGTAAAGGAGATTATAAGCATGCCTAAGATTATTAAGGTTTTTTATGAGCTAGACAATGATTTTAATACTATTTTAAATACTGCGTGTGGAGTGTTTGAAGTGGATGATACTGTCGATATGGAGGAATTTTATGCTGTGGTGATTGATGCCATAGAAGAGAAACTTTCTCCATGTAAGGAGCTTGAAGGTGTAGGTGCTAAAGTTAGTGCCTTTTTACAGAAATTAGAGGATAATCCCCTATTTTTATTTGATGAGGCTGGCGAAGAAGTTTTTGCTCCTAAATTGTATTGTGCCTTTACAGCTCCTGAAGATGATGACTTTCTTGAGGAAAGTGATGTTGAAGAAGATGATGTAGAAGGTGAGGAAACTGATTTAACTATCACAAGTGCTGGACAGCCTTGTGTTGCTAGTGAACAGGAGGAATCTTCTGAAGTCTTAGAGGACACTTTGGATGATGGTCCAAGTGTGGAGACATCTGATTCACAAGTTGAAGAAGATGTAGAAATGTCGGATTTTGTTGATCTTGAATCTGTGATTCAGGATTATGAAAATGTTTGTTTTGAGTTTTATACTACAGAGCCAGAATTTGTTAAAGTTTTGGGTCTGTATGTGCCTAAAGCAACTCGCAACAATTGCTGGTTGCGATCAGTTTTGGCAGTGATGCAGAAATTGCCCTGTCAATTTAAAGATAAAAATTTGCAGGATCTTTGGGTGTTATACAAGCAACAGTATAGTCAGTTGTTTGTTGATACCTTGGTTAATAAGATACCTGCTAATATTGTACTTCCACAAGGTGGTTATGTTGCTGATTTTGCATATTGGTTTTTAACCTTATGTGATTGGCAGTGTGTTGCATATTGGAAATGCATTAAATGTGATTTAGCTCTTAAGCTTAAAGGCTTGGATGCTATGTTCTTTTATGGTGATGTTGTCTCACATATATGCAAGTGTGGTGAGTCTATGGTACTTATTGATGTTGATGTGCCATTTACAGTCCACTTTGCTCTTAAAGATAAGTTGTTTTGTGCATTTATTACTAAGCGTATTGTGTATAAAGCAGCTTGTGTTGTGGATGTTAATGATAGTCATTCTATGGCTGTTGTTGATGGTAAACAAATTGATGATCATCGTATCACTAGTATTACTAGTGATAAGTTTGATTTTATTATTGGGCATGGTATGTCATTTTCAATGACTACTTTTGAAATTGCCCAATTGTATGGTTCTTGTATAACACCTAATGTGTGTTTTGTTAAAGGTGATATAATTAAAGTGTCTAAGCTTGTTAAAGCAGAAGTTGTTGTAAACCCTGCTAATGGCCATATGGTACATGGTGGTGGTGTTGCAAAAGCTATTGCAGTAGCAGCTGGACAGCAGTTTGTTAAAGAGACTACCAATATGGTTAAGTCTAAAGGAGTTTGTGCTACTGGAGATTGTTATGTCTCTACAGGGGGCAAATTATGTAAAACTGTGCTTAATGTTGTTGGACCTGATGCGAGAACACAGGGTAAACAAAGTTATGTATTGTTAGAGCGTGTTTATAAACATTTTAACAACTATGACTGTGTTGTTACAACTTTGATCTCATCTGGTATATTTAGTGTGCCTTCTGATGTGTCTTTAACATATCTACTTGGTACTGCTAAGAAACAAGTTGTTCTTGTTAGCAATAATCAAGAGGATTTTGATCTTATTTCTAAGTGTCAGATAACTGCTGTTGAGGGCACTAAGAAATTGGCAGCGCGTCTTTCCTTTAATGTTGGACGTTCCATTGTTTACGAAACAGATGCTAATAAGTTGATTTTAATCAATGATGTTGCATTTGTTTCGACATTTAATGTTTTACAGGATGTTTTATCCTTAAGACATGATATAGCACTTGATGATGATGCACGAACCTTCGTTCAGAGCAATGTTGATGTTCTACCTGAGGGTTGGCGTGTTGTTAATAAGTTTTATCAAATTAATGGTGTTAGAACCGTTAAGTATTTTGAGTGTACTGGAGGCATAGATATATGCAGCCAGGATAAAGTTTTTGGTTATGTACAGCAGGGTATTTTTAATAAGGCTACTGTTGCTCAAATTAAAGCCTTGTTTTTGGATAAAGTGGACATCTTGCTAACTGTTGATGGTGTTAATTTCACTAATAGGTTTGTGCCTGTTGGTGAAAGTTTTGGTAAGAGTCTAGGAAATGTGTTTTGTGATGGAGTTAATGTCACGAAGCATAAGTGTGATATAAATTATAAAGGTAAAGTCTTTTTCCAGTTTGATAATCTTTCTAGTGAAGATTTAAAGGCTGTAAGAAGTTCCTTTAATTTTGATCAGAAGGAATTGCTTGCCTATTACAACATGCTTGTTAATTGTTTTAAGTGGCAGGTTGTTGTTAATGGTAAGTATTTCACTTTTAAGCAAGC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Protein
MSKINKYGLELHWAPEFPWMFEDAEEKLDNPSSSEVDMICSTTAQKLETDGICPENHVMVDCRRLLKQECCVQSSLIREIVMNASPYYLEVLLQDALQSREAVLVTTPLGMSLEACYVRGCNPKGWTMGLFRRRSVCNTGRCTVNKHVAYQLYMIDPAGVCLGAGQFVGWVIPLAFMPVQSRKFIVPWVMYLRKRGEKGAYNKDHGCGGFGHVYDFKVEDAYDQVHEEPKGKFSKKAYALIRGYRGVKPLLYVDQYGCDYTGSLADGLEAYADKTLQEMKALFPTWSQELPFDVIVAWHVVRDPRYVMRLQSAATICSVAYVANPTEDLCDGSVVIKEPVHVYADDSIILRQYNLFDIMSHFYMEADTVVNAFYGVALKDCGFVMQFGYIDCEQDSCDFKGWIPGNMIDGFACTTCGHVYEVGDLIAQSSGVLPVNPVLHTKSAAGYGGFGCKDSFTLYGQTVVYFGGCVYWSPARNIWIPILKSSVKSYDSLVYTGVLGCKAIVKETNLICKALYLDYVQHKCGNLHQRELLGVSDVWHKQLLINRGVYKPLLENIDYFNMRRAKFSLETFTVCADGFMPFLLDDLVPRAYYLAVSGQAFCDYADKLCHAVVSKSKELLDVSLDSLGAAIHYLNSKIVDLAQHFSDFGTSFVSKIVHFFKTFTTSTALAFAWVLFHVLHGAYIVVESDIYFVKNIPRYASAVAQAFQSVAKVVLDSLRVTFIDGLSCFKIGRRRICLSGRKIYEVARGLLHSSQLPLDVYDLTMPSQVQKAKQKPIYLKGSGSDFSLADSVVEVVTTSLTPCGYSEPPKVADKICIVDNVYMAKAGDKYYPVVVDDHVGLLDQAWRVPCAGRRVTFKEQPTVKEIISMPKIIKVFYELDNDFNTILNTACGVFEVDDTVDMEEFYAVVIDAIEEKLSPCKELEGVGAKVSAFLQKLEDNPLFLFDEAGEEVFAPKLYCAFTAPEDDDFLEESDVEEDDVEGEETDLTITSAGQPCVASEQEESSEVLEDTLDDGPSVETSDSQVEEDVEMSDFVDLESVIQDYENVCFEFYTTEPEFVKVLGLYVPKATRNNCWLRSVLAVMQKLPCQFKDKNLQDLWVLYKQQYSQLFVDTLVNKIPANIVLPQGGYVADFAYWFLTLCDWQCVAYWKCIKCDLALKLKGLDAMFFYGDVVSHICKCGESMVLIDVDVPFTVHFALKDKLFCAFITKRIVYKAACVVDVNDSHSMAVVDGKQIDDHRITSITSDKFDFIIGHGMSFSMTTFEIAQLYGSCITPNVCFVKGDIIKVSKLVKAEVVVNPANGHMVHGGGVAKAIAVAAGQQFVKETTNMVKSKGVCATGDCYVSTGGKLCKTVLNVVGPDARTQGKQSYVLLERVYKHFNNYDCVVTTLISSGIFSVPSDVSLTYLLGTAKKQVVLVSNNQEDFDLISKCQITAVEGTKKLAARLSFNVGRSIVYETDANKLILINDVAFVSTFNVLQDVLSLRHDIALDDDARTFVQSNVDVLPEGWRVVNKFYQINGVRTVKYFECTGGIDICSQDKVFGYVQQGIFNKATVAQIKALFLDKVDILLTVDGVNFTNRFVPVGESFGKSLGNVFCDGVNVTKHKCDINYKGKVFFQFDNLSSEDLKAVRSSFNFDQKELLAYYNMLVNCFKWQVVVNGKYFTFKQANNNCFVNVSCLMLQSLHLTFKIVQWQEAWFEFRSGRPARFVALVLAKGGFKFGDPADSRDFLRVVFSQVDLTGAICDFEIACKCGVKQEQRTGLDAVMHFGTLSREDLEIGYTVDCSCGKKLIHCVRFDVPFLICSNTPASVKLPKGVGSANIFIGDNVGHYVHVKCEQSYQLYDASNVKKVTDVTGKLSDCLYLKNLKQTFKSVLTTYYLDDVKKIEYKPDLSQYYCDGGKYYTQRIIKAQFKTFEKVDGVYTNFKLIGHTVCDSLNSKLGFDSSKEFVEYKITEWPTATGDVVLANDDLYVKRYERGCITFGKPVIWLSHEKASLNSLTYFNRPLLVDDNKFDVLKVDDVDDSGDSSESGAKETKEINIIKLSGVKKPFKVEDSVIVNDDTSETKYVKSLSIVDVYDMWLTGCKYVVRTANALSRAVNVPTIRKFIKFGMTLVSIPIDLLNLREIKPAVNVVKAVRNKTSACFNFIKWLFVLLFGWIKISADNKVIYTTEIASKLTCKLVALAFKNAFLTFKWSMVARGACIIATIFLLWFNFIYANVIFSDFYLPKIGFLPTFVGKIAQWIKNTFSLVTICDLYSIQDVGFKNQYCNGSIACQFCLAGFDMLDNYKAIDVVQYEADRRAFVDYTGVLKIVIELIVSYALYTVWFYPLFALISIQILTTWLPELFMLSTLHWSFRLLVALANMLPAHVFMRFYIIIASFIKLFSLFKHVAYGCSKSGCLFCYKRNRSLRVKCSTIVGGMIRYYDVMANGGTGFCSKHQWNCIDCDSYKPGNTFITVEAALDLSKELKRPIQPTDVAYHTVTDVKQVGCSMRLFYDRDGQRIYDDVNASLFVDYSNLLHSKVKSVPNMHVVVVENDADKANFLNAAVFYAQSLFRPILMVDKNLITTANTGTSVTETMFDVYVDTFLSMFDVDKKSLNALIATAHSSIKQGTQIYKVLDTFLSCARKSCSIDSDVDTKCLADSVMSAVSAGLELTDESCNNLVPTYLKSDNIVAADLGVLIQNSAKHVQGNVAKIAGVSCIWSVDAFNQFSSDFQHKLKKACCKTGLKLKLTYNKQMANVSVLTTPFSLKGGAVFSYFVYVCFVLSLVCFIGLWCLMPTYTVHKSDFQLPVYASYKVLDNGVIRDVSVEDVCFANKFEQFDQWYESTFGLSYYSNSMACPIVVAVIDQDFGSTVFNVPTKVLRYGYHVLHFITHALSADGVQCYTPHSQISYSNFYASGCVLSSACTMFTMADGSPQPYCYTDGLMQNASLYSSLVPHVRYNLANAKGFIRFPEVLREGLVRVVRTRSMSYCRVGLCEEADEGICFNFNGSWVLNNDYYRSLPGTFCGRDVFDLIYQLFKGLAQPVDFLALTASSIAGAILAVIVVLVFYYLIKLKRAFGDYTSVVFVNVIVWCVNFMMLFVFQVYPTLSCVYAICYFYATLYFPSEISVIMHLQWLVMYGTIMPLWFCLLYIAVVVSNHAFWVFSYCRKLGTSVRSDGTFEEMALTTFMITXXXXXXXXXXXXXXXXXXYLSLYNKYRYYSGKMDTAAYREAACSQLAKAMDTFTNNNGSDVLYQPPTASVSTSFLQSGIVKMVNPTSKVEPCVVSVTYGNMTLNGLWLDDKVYCPRHVICSASDMTNPDYTNLLCRVTSSDFTVLFDRLSLTVMSYQMRGCMLVLTVTLQNSRTPKYTFGVVKPGETFTVLAAYNGKPQGAFHVTMRSSYTIKGSFLCGSCGSVGYVIMGDCVKFVYMHQLELSTGCHTGTDFNGDFYGPYKDAQVVQLPIQDYIQSVNFLAWLYAAILNNCNWFIQSDKCSVEDFNVWALSNGFSQVKSDLVIDALASMTGVSLETLLAAIKRLKNGFQGRQIMGSCSFEDELTPSDVYQQLAGIKLQSKRTRLFKGTVCWIMASTFLFSCIITAFVKWTMFMYVTTNMFSITFCALCVISLAMLLVKHKHLYLTMYITPVLCTLLYNNYLVVYKHTFRGYVYAWLSYYVPSVEYTYTDEVIYGMLLLVGMVFVTLRSINHDLFSFIMFVGRLISVFSLWYKGSNLEEEILLMLASLFGTYTWTTVLSMAVAKVIAKWVAVNVLYFTDIPQIKIVLLCYLFIGYIISCYWGLFSLMNSLFRMPLGVYNYKISVQELRYMNANGLRPPKNSFEALMLNFKLLGIGGVPIIEVSQFQSKLTDVKCANVVLLNCLQHLHVASNSKLWHYCSTLHNEILATSDLSVAFEKLAQLLIVLFANPAAVDSKCLTSIEEVCDDYAKDNTVLQALQSEFVNMASFVEYEVAKKNLDEARFSGSANQQQLKQLEKACNIAKSAYERDRAVAKKLERMADLALTNMYKEARINDKKSKVVSALQTMLFSMVRKLDNQALNSILDNAVRGCVPLNAIPSLAANTLNIIVPDKSVYDQIVDNIYVTYAGNVWQIQTIQDSDGTNKQLNEISDDCNWPLVIIANRYNEVSATVLQNNELMPAKLKIQVVNSGPDQTCNTPTQCYYNNSNNGKIVYAILSDVDGLKYTKILKDDGNFVVLELDPPCKFTVQDAKGLKIKYLYFVKGCNTLARGWVVGTISSTVRLQAGTATEYASNSSILSLCAFSVDPKKTYLDFIQQGGTPIANCVKMLCDHAGTGMAITVKPDATTSQDSYGGASVCIYCRARVEHPDVDGLCKLRGKFVQVPVGIKDPVSYVLTHDVCRVCGFWRDGSCSCVSTDTTVQSKDTNFLNRVRGASVDARLVPCASGLSTDVQLRAFDIYNASVAGIGLHLKVNCCRFQRVDENGDKLDQFFVVKRTDLTIYNREMKCYERVKDCKFVAEHDFFTFDVEGSRVPHIVRKDLTKYTMLDLCYALRHFDRNDCMLLCDILSIYAGCEQSYFTKKDWYDFVENPDIINVYKKLGPIFNRALVSATEFADKLVEVGLVGVLTLDNQDLNGKWYDFGDYVIAAPGCGVAIADSYYSYIMPMLTMCHALDCELYVNNAYRLFDLVQYDFTDYKLELFNKYFKHWSMPYHPNTVDCQDDRCIIHCANFNILFSMVLPNTCFGPLVRQIFVDGVPFVVSIGYHYKELGIVMNMDVDTHRYRLSLKDLLLYAADPALHVASASALYDLRTCCFSVAAITSGVKFQTVKPGNFNQDFYDFVLSKGLLKEGSSVDLKHFFFTQDGNAAITDYNYYKYNLPTMVDIKQLLFVLEVVYKYFEIYDGGCIPASQVIVNNYDKSAGYPFNKFGKARLYYEALSFEEQDEIYAYTKRNVLPTLTQMNLKYAISAKNRARTVAGVSILSTMTGRMFHQKCLKSIAATRGVPVVIGTTKFYGGWDDMLRRLIKDVDNPVLMGWDYPKCDRAMPNILRIVSS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Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR002705
Pept_C30/C16_B_coronavir
IPR009466 NSP11
IPR036499 NSP9_sf
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR014827 Viral_protease
IPR042515 Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR014829 NSP8
IPR036333 NSP10_sf
IPR032592 NAR_dom
IPR027352 CV_ZBD
IPR014828 NSP7
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR008740 Peptidase_C30
IPR037204 NSP7_sf
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR032505 Corona_NSP4_C
IPR038083 R1a/1ab
IPR041679 DNA2/NAM7-like_AAA
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR013016 Peptidase_C30/C16
IPR022570 B-CoV_NSP1
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR037230 NSP8_sf
IPR037227 EndoU-like
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
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SUPFAM
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score=1273 Identity=66.38%
Cov(Q)=13.08% Cov(P)=97.17%
3D Structure
Ontologies
GO
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0008242 F:omega peptidase activity
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
7095
Number of predicted TMHs:
18
Exp number of AAs in TMHs:
422.138939999994
Exp number, first 60 AAs:
0
Total prob of N-in:
0.33702
outside
1 - 2192
TMhelix
2193 - 2215
inside
2216 - 2221
TMhelix
2222 - 2241
outside
2242 - 2308
TMhelix
2309 - 2331
inside
2332 - 2351
TMhelix
2352 - 2374
outside
2375 - 2751
TMhelix
2752 - 2774
inside
2775 - 2887
TMhelix
2888 - 2910
outside
2911 - 3025
TMhelix
3026 - 3048
inside
3049 - 3060
TMhelix
3061 - 3083
outside
3084 - 3086
TMhelix
3087 - 3109
inside
3110 - 3113
TMhelix
3114 - 3136
outside
3137 - 3170
TMhelix
3171 - 3193
inside
3194 - 3559
TMhelix
3560 - 3582
outside
3583 - 3585
TMhelix
3586 - 3608
inside
3609 - 3612
TMhelix
3613 - 3635
outside
3636 - 3654
TMhelix
3655 - 3677
inside
3678 - 3683
TMhelix
3684 - 3701
outside
3702 - 3710
TMhelix
3711 - 3733
inside
3734 - 3752
TMhelix
3753 - 3775
outside
3776 - 7095
