Strain
Porcine_MF095123
(Region: China; Strain: Porcine deltacoronavirus isolate CHN-HG-2017, complete genome.; Date: 15-Feb-17)
Gene
replicase polyprotein
Description
Annotated in NCBI,
replicase polyprotein
Location
GenBank Accession
Sequence
CDS
ATGGCCAAGAACAAGTCCAAGCGCGACGCTATTGCGTTGCCTGAAAATGTACCACCACCTCTGCAACTTTTCATTCACGTTGCAGCTGCTGAAGAGGGTCACCCTAAGGTTACTACTTACCTTGGCAACTATAACCTCTATGCCACCAAGGCTCCGCCTGGCGTGCAGGTTCTTAGTGCTAAAACCTCTCTTACTGACTTTGAGAATGTCTTTGGAGCCCAACCCACCTTGCGATCTATTCGTAATCTGGTTTGTGAGGCTCGCTCGGCTGAATGGACAACTTCCAAGAATGCTTTTGCACTCAAAGCCACTCAACTTGACTACTCTGATGCCGTTTTGAGGGCAATGATTCGTTTCTGCCCTCCAAAGGTGTCCACACTCGCTGCCTTTGCTCTTTTTGGCCGATTGGTTAAAATTGAGGATAAGGAACTTGCTGAGTTAGCTCGTGATACTGCCCTTGAGTTGGCGTACACGGCTAAAATTGGTACATCTCTTGCTGACACGAGATCTGTCTCACTTATTCATAAGGACGCTTATCTAACTCTCAGTAATGAGGTTGTTGGCGTAACTTTTACTGCCGCACTTATGGCAAAGGCTACCACTGTTAATGGAGCAATGCAATACTCAAACTTTTACCTCTACCCTCGTGCCACTATTAAGGTGACCGATGGTAAGGCTGAAGCAATTGCAACTAAGCCTCTGCCTGCTGCCACTAAAGGCAAGCCAATCACAGAGGATGTCAACCTTCTCCCTGACTATCAGCAGCTGCTTGTTGATCAAGTGACTGGCACTGAGGTTAAGGTTGGAGCTCTAACCTATGTTAAGACCACTGATTCACCACCCCTTTACTTTCCCAAAGTCAAGGGTGGTGTTATTGGTATTGCACTTAAGCAGCAGGGCACTGCGGCTAAGAAGCTCAATGTAGTCTTCCATGCTCAACCTGATGATGTTCTGCTAGCCTTCATACAACTTCAGCAATTCTTGAACCGTACTTCGGATTCAAGTGTTGAAATTACTGACTGCCAGAGTTATGAAGTATCTCCAACTGTGACGGTCAAAATTGGCCCGTCTAAACCTGGGGATGTCATCGTGGCTACTGATGAGGAATACCTTAAATGCTTTGAAACCCCTGAGGTAGGTAGGCTTTATAAGGTTTTCCAAACTCAATCTTGGGCTATCATTGAGCGTGCCTTCTCCAGTATGAAGATCCGCGTGTCCAAAGCTTTATCAGCATTTATAAGTTTTCTGCAAAACCTTGCAGATAACTTTACTGCAATAAGTGGTGTTGTCACTGCACTCATTCGTGAACTCCGGGATCTTACCCTGGATGTGGCGACACGTATCACTAACATACAATTTGTTTACCGTGCCGGTAAGCTTATTGTCGACACGACAAGTGTCATAGCTAAACTTTTCCAGCCATTTTGTGATTTTATATCACCTTTCCTTCGGAAAGTTGCTGGTTTTGCAATTTACACTGTTGGTAATCGCATGCTTATGTTTACCAGCACTGGCACCTTTCTTCTCACAAAGGCAACTACTAAGATACTCAATAAGGCAAAGTACATCTTTGATGTGGAGCCTGAGTACCCAGTAGATGTAACAACATCCAAAGTTGTAGTACATGAAGCACTCCAGCAAATCGACACTAAGCCTACTAGAGCTCTAGAGGCTGTTGATGTCGTTGTTGGTAATACTGTACTGCAAATGGCTACTGATGGCACTGCGTTCTACCCATCGGATGGTACGCACGCCTCTCTTCCAGGATTCAAAGCAGGCTCGGATGAGCTTTTCATAAGCTTCAACTGTGACCTCTTTGATGATGAGACTAATGCTCAAATCAACGAAACACTCGCTGCATATGAGCTTAACCAACTAGTAGCTCCAGGTGATTCTACACCGCGTCAAATTGCGACGTTGGTTGTCGATACACTTGCAGATGCTATAACAGACCACTTTCCGGAGAAAACCATTGATCTACCTGAAGACTATCAAGTCTTTTCTGACCATGATGACCTCCCACTCGCACAATACCACATCCCTGATCACCTGAGCCTGTATATTCAGGCTATGGAAGGTGAAGATGATAGTGGTGATGAAATATGTATTGAGGACGATGATTACGACTGTCCTCAAGCCGACGAAGACACAGAAGGAGTAATTCCCCAACAGTGGGAACTTCCTGATGTTGATAAATTTTTACTCAAGATCCAGGAACGGAAGACCAGCAGCGACGAAGTACTTAGCGTTGACGTCTATCCTAAACCAGATGAGGTTGGGGTTGACGACAGCGCGTCGGAAAAGAAGCCAAATGGGGACCCAGTACCGGATCCTGAGGTTCATCCAACACTAGAGAGTGTGGATGTTGAACAACCAACTGAAACAGCAAACCAGGCTGTTGAAGACAAACCTTCTGATACCACCTTTGTGGTTGATGAGGAACAATTACAAGAATCAACACCAGAACATGAACTCCGCTCCTATGAAGGGGAGTTTGATTCTGATGATGAAATTATTATTCCTATAGTACCAGTAACACCTGCGGATTTAAAACCACAGACTATTACTATAAAGGAGTACTTTAAGTCTGAAAAACTTGAGACTATTAACGAAGGATCTACAGAGTCAGTTGCACAGTCTGACGATTCGTTCGACGAATCATTTGCTGATGCTGAGTCTGATGATCCACAAGACCCTGCTGTATATGATGATACAACAATTATAACAGACAGTACTGATGTAGGCGATGAGCCTGAGACAACTCTAGCTACCATCGTTAACACACCACTGACACTCGATAATAACTTGCCACCTGAAGCCATTAAACAACCCAGCCCGACTAAGGTTGAGTTAGTTGTTGGCGAATTGGCAAGTATTAAATTTGACAATTCTGTCTTAGTCAACCCTGCTAATACGCAATTAACAAATGGCGGTGGAGCTGCCCGTGCAATTGCAAAATTAGCTGGTCCAAAATACCAAGAGTACTGTAATAGTGTGGCTCCTATCTCAGGACCGCTTACCACGGACTCTTTTGATGCCAAGAAACTTGGTGTAGCCTGCATCTTGCATGTAGTGCCACCCAAAGGTTCTGACCCTAATGTACAAGAACTCCTGTATCAAGCTTACAAGAGTATCCTTACTGAACCAGCACACTATGTTATACCTATACTAGGTGCTGGTATTTTTGGATGCAACCCAGTCCACTCTCTGGATGCGTTCAGGAAAGCATGTCCAAGTGACATAGGTCGTGTCACCCTTGTCACTATGAACAAAAACCATTTGCAGGTGTGGGATGCTCTCAATAGGACCATTGTACGCACCACTACTGACTATGATCAAGTTACCACCAAGGCCCTTACACCCCAGGGAGTGTTAGAAGCCAATCTCTTTGATGGTGAGGACTTTGTTCAAGAACCTAAACCCGGTCAAATCTACCTTGAGGTTACTGAAGAAGTTCAGAACCAAGCCAAGGAACTTGACCTTAACCTTCAGCAATACTGCGTCTACCTGAAGACTTGCCACCATAAATGGGTTGTGAGTCGTACGAACGGGTTGATGCATCTAAAACAAAAAGATAACAATTGTTTTGTTAGTGCAGGTGTAAACCTGTTTCAAAACACTGCTTATCAACTTAGACCTGCTATTGATGCTCTCTATAGGGAGTATCTCAATGGTAATCCAAACAGATTTGTTGCTTGGATCTACGCATCCACTAACCGTCGTGTTGGTGAGATGGGTTGTCCACAGCAAGTTATTTCTTTGCTCGTTAGTAACTCTGACGCAGCATTTTCAGCAACTACAGCCTGTTGTAACACCTACTTTAACCACACAGGTGTTATTTCAGTAGCTCGTGAATATGACCCAATACAACCAAAGGTCTACTGCATGAAGTGTGATGTGTGGACTCCCTTTACACCCCAGAGTGGAAAAGGTGCAGTTGCAATTGGTACTTCTGCAGATGAACCTACAGGTCCTGCCATTAAATTTGCCGCAGCTCACTGCTGGTACACTAATGGCAAGAAAACAGTTAATGGCTATGACACTAAAGCTAATGTTGTAGCTACTTATCATAGGTTTGACGTGCCTAAGCCTCAACTTGTCGAGGACGTGGTTGCGCTGCCTACTAAAAATGACTTTGAAGTTCTCAATGTTGAAGAACTGCCACAGGATAGTGTGCTCCATTTGGACCCACCCCCTGTACAGGCCTTACAACCTAAGGCTAACCAACACATTGAGATTTTAGAAAACCCAGATTATCTGGACATTTTGGATCTTTGGATTCGTAAACCCAAATTCATCCTCGTAAAGTCGTGGAGTGTTTTGGGTAGAGCACTATGTAAGGCAGGTAAAGTTGTCTTTGTCAGTGCTTCGCTTTTGACCCGTTTCTACAATTACCTTGTAGAGATTGGTGCTCTTGACTCAACAATAAGGTTGTCAGTCGATCTTACCTGTAAATTTGTTAGAACGGTACTCCCATCGTCTAACACTGTACACAAAACTTGTCTTGGTCTGTATTATTCAGCCCAGACACTTTTTGTTTCTTTAGCACCATTCCTTATGTTACCAGCTGTAGTTAGTCTGCTTAATTCAGGCTATACAATTGGCACATATTTGTATGCAAAAACTGGCTGGCCTTGTAATTACAATGCCACGCAACACTTTGATTATAATTCTTACTGTGCAGGTGACTTGGTTTGTCAAGCCTGTTTTGACGGTCAAGACTCCCTACATTTGTATCCGCATTTACGTGTTAATCAGCAGCCCCTTCAGACCACTGACTACACTGTTTATGCGCTTTCACTAATATTACTATTAGCTAACATGACTCTTGTCATGGGCACGCTAATAGTTACTTTCTTTGTGAACTTCTATGGTGTGCAAATACCATTTTATGGTACACTTTTGATAGATTATCAGTCCGCGCTGATGATGACTTTCTCAGTGTACTACTTTTATAAGGTAATGAAGTTTTTCCGCCATCTCACACATGGATGTAAAAT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Protein
MAKNKSKRDAIALPENVPPPLQLFIHVAAAEEGHPKVTTYLGNYNLYATKAPPGVQVLSAKTSLTDFENVFGAQPTLRSIRNLVCEARSAEWTTSKNAFALKATQLDYSDAVLRAMIRFCPPKVSTLAAFALFGRLVKIEDKELAELARDTALELAYTAKIGTSLADTRSVSLIHKDAYLTLSNEVVGVTFTAALMAKATTVNGAMQYSNFYLYPRATIKVTDGKAEAIATKPLPAATKGKPITEDVNLLPDYQQLLVDQVTGTEVKVGALTYVKTTDSPPLYFPKVKGGVIGIALKQQGTAAKKLNVVFHAQPDDVLLAFIQLQQFLNRTSDSSVEITDCQSYEVSPTVTVKIGPSKPGDVIVATDEEYLKCFETPEVGRLYKVFQTQSWAIIERAFSSMKIRVSKALSAFISFLQNLADNFTAISGVVTALIRELRDLTLDVATRITNIQFVYRAGKLIVDTTSVIAKLFQPFCDFISPFLRKVAGFAIYTVGNRMLMFTSTGTFLLTKATTKILNKAKYIFDVEPEYPVDVTTSKVVVHEALQQIDTKPTRALEAVDVVVGNTVLQMATDGTAFYPSDGTHASLPGFKAGSDELFISFNCDLFDDETNAQINETLAAYELNQLVAPGDSTPRQIATLVVDTLADAITDHFPEKTIDLPEDYQVFSDHDDLPLAQYHIPDHLSLYIQAMEGEDDSGDEICIEDDDYDCPQADEDTEGVIPQQWELPDVDKFLLKIQERKTSSDEVLSVDVYPKPDEVGVDDSASEKKPNGDPVPDPEVHPTLESVDVEQPTETANQAVEDKPSDTTFVVDEEQLQESTPEHELRSYEGEFDSDDEIIIPIVPVTPADLKPQTITIKEYFKSEKLETINEGSTESVAQSDDSFDESFADAESDDPQDPAVYDDTTIITDSTDVGDEPETTLATIVNTPLTLDNNLPPEAIKQPSPTKVELVVGELASIKFDNSVLVNPANTQLTNGGGAARAIAKLAGPKYQEYCNSVAPISGPLTTDSFDAKKLGVACILHVVPPKGSDPNVQELLYQAYKSILTEPAHYVIPILGAGIFGCNPVHSLDAFRKACPSDIGRVTLVTMNKNHLQVWDALNRTIVRTTTDYDQVTTKALTPQGVLEANLFDGEDFVQEPKPGQIYLEVTEEVQNQAKELDLNLQQYCVYLKTCHHKWVVSRTNGLMHLKQKDNNCFVSAGVNLFQNTAYQLRPAIDALYREYLNGNPNRFVAWIYASTNRRVGEMGCPQQVISLLVSNSDAAFSATTACCNTYFNHTGVISVAREYDPIQPKVYCMKCDVWTPFTPQSGKGAVAIGTSADEPTGPAIKFAAAHCWYTNGKKTVNGYDTKANVVATYHRFDVPKPQLVEDVVALPTKNDFEVLNVEELPQDSVLHLDPPPVQALQPKANQHIEILENPDYLDILDLWIRKPKFILVKSWSVLGRALCKAGKVVFVSASLLTRFYNYLVEIGALDSTIRLSVDLTCKFVRTVLPSSNTVHKTCLGLYYSAQTLFVSLAPFLMLPAVVSLLNSGYTIGTYLYAKTGWPCNYNATQHFDYNSYCAGDLVCQACFDGQDSLHLYPHLRVNQQPLQTTDYTVYALSLILLLANMTLVMGTLIVTFFVNFYGVQIPFYGTLLIDYQSALMMTFSVYYFYKVMKFFRHLTHGCKIPTCMVCAKLRTPPTITVETVVQGRKYPSVIETNGGFTICKEHNFYCKDCSLQTPGTFIPTEAIESLSRATRLSVKPTAPAFLLARDVECQTDVVVARAMHNQNAHVCISKYSDIRTVDQLLKPTPLFSYTPDVIIAADFDNRGSLKTAKELAVVLSMDLKRTIIIIDQAYSRPIDNYQEVASRIEKYYPVSKITPTGDIFTDIKQATNGQASDSAINAAVLAVQRGLDFTIDNPNNILPHYAFDFSTLTAEDQSTILESGCAKGNLKGTNVGVVLSASLVTRLSQQAIRVIANAASRNGVTCAVTPSTLVMRGNIATQPLTRIKAGAPPMHQKILCVILALAIVYFAAMAFGFLASQITLNTVPTIKSDIRASTFYVVRDGVLDTVRSNDKCFANKFLAFDSFIQAPYTNSPDCPVVVGVVEVTTHSIPGIPAGVIHRDGLILNIYEQSLYETQQRQSMVRDALSLKTANLFNLGKRVVVGYTQHEVVVGTSYFNSPALFNAKCTFLQYQDTRQLYCYDTVPTEHKLYSDVLPHVEYKAIDINGDLVPFKIPEQIMFYPHIVRYTSNSYCRMGHCFNTNPGICISFTDEFPYSENVKPGVYCADTSLQLFSNLVLGTVSGIHIFTSTAALLGSTIVIILCVVAVLAVQRFFKEYTTFVMYTCGLALVNIVGIALMYKCLVFAIFYYAIYLYFVLTFPSFKRNVALFYFAVVIVPHVSNMQLLALIVCSIIYFLYTYVHTVAKTAGKFSSFLDAAKATFVIDNEKYVLLKDLAGAEFDQYLASYNKYKYFSGTASDKDYDKVCMAFLAKALSSFREGGGSQLYTPPKFAVVQSLKTKLQAGIKILLHPSGVVERCMVSVVYNGSALNGIWLKNVVYCPRHVIGKFRGDQWTHMVSIADCRDFIVKCPTQGIQLNVQSVKMVGALLQLTVHTNNTATPDYKFERLQPGSSMTIACAYDGIVRHVYHVVLQLNNLIYASFLNGACGSVGYTLKGKTLYLHYMHHIEFNNKTHSGTDLEGNFYGPYVDEEVIQQQTAFQYYTDNVVAQLYAHLLTVDARPKWLAQSQISIEDFNSWAANNSFANFPCEQTNMSYIMGLSQTARVPVERILNTIIQLTTNRDGACIMGSYDFECDWTPEMVYNQAPISLQSGVVKKTCTWFFHFLFMAITMLLAAMHVFPVHLYPIVLPCFTVVAFLLTLTIKHTVVFTTTYLLPSLLMMVVNANTFWIPNTFLRTCYETIFGSPIAQRLYGYTVALYMLIYAGLAINYTLKTLRYRATSFLSFCMQWFQYGYVAHIAYKLLNKPWTESLLFTAFTMLTSHPLLAALSWWLAGRVTLPIIMPDLAIRVLAYNVIGYVICVRFGLMWLANRFTTVPMGTYQYMVSVEQLKYMMAVKMSPPRNAFEVLIANIRLLGLGGNRNIAVSTVQNKILDAKATAVVVANLLEKAGVTNKHAICKKIVKLHNDTLKATTYEEVEVALVKLLSHIIEFLPTDQVDAYLADAANAQHVNTYFDNLLENKAVVQAVADININLDSYRIYKEADAIYKRSVEMNESPQEQKKKLKAVNIAKAEWEREAASQRKLEKLADAAMKSMYLAERAEDRRIKLTSGLTAMLYHMLRRLDSDRVKALFECAKAQILPIHAVVGISNDNLKVIFNDKESYSHYVEGNTLIHKGVRYTIVKKLSLDNAPIEGVPEEFPVVVETVREGVPQLQNNELCLRNVFTAQNTAQDFNGNESTVKSFYVTRTGKKILVAITSTKDNLKTVTCLTETGKTVLNLDPPMRFAHTVGGKQSVVYLYFIQNISSLNRGMVIGHISETTILQASGTQIEYQQNASLLTYLAFAVDPKTAYLKHLADGGSPIQGCIQMIATMGPGFAVTTKPQPNEHQYSYGGASICLYCRAHIPHPGVDGRCPYKGRFVHIDKDKEPVSFALTHEPCSSCQRWVNYDCTCGSSLQNSAYLNRVTGSSDARLEPLQPGTQPDAVKRAFHVHNDTTSGIFLSTKSNCARFKTTRSALPLPNKGEVELYFVTKQCAAKVFEIEEECYNALSTELYTTDDTFGILAKTEFFKFDKIPNVNRQYLTKYTLLDLAYALRHLSTSKDVIQEILITMCGTPEDWFGENWFDPIENPSFYKEFHKLGDILNRCVLNANKFASACIDAGLVGILTPDNQDLLGQIYDFGDFIITQPGNGCVDLASYYSYLMPIMSMTHMLKCECMDSDGNPLEYDGFQYDFTDFKLGLFEKYFKYWDRPYHPNTVECPDDRCVLHCANFNVLFAMCIPNTAFGNLCSRATVDGHLVVQTVGVHLKELGIVLNQDVTTHMANINLNTLLRLVGDPTTIASVSDKCVDLRTPCQTLATMSSGIAKQSVKPGHFNQHFYKHLLDSNLLDQLGIDIRHFYYMQDGEAAITDYSYYRYNTPTMVDIKMFLFCLEVADKYLEPYEGGCINAQSVVVSNLDKSAGYPFNKLGKARNYYDMTHAEQNQLFEYTKRNVLPTLTQMNLKYAISAKDRARTVAGVSIISTMTNRQYHQKMLKSISLARNQTIVIGTTKFYGGWDNMLRRLMCNINNPILVGWDYPKCDRSMPNMLRIAASCLLARKHTCCNQSQRFYRLANECCQVLSEVVVSGNNLYVKPGGTSSGDATTAYANSVFNILQVVSANVATFLSTSTTTHLNKDIADLHRSLYEDIYRGDSNDITVINRFYQHLQSYFGLMILSDDGVACIDSAVAKAGAVADLDGFRDILFYQNNVYMADSKCWTETDMNVGPHEFCSQHTVLAEHDGKPYYLPYPDVSRILGACIFVDDVNKADPVQNLERYISLAIDAYPLTKVDPIKGKVFYLLLDYIRVLAQELQDGILDAFQSLTDMSYVNNFMNEAFYAQMYEQSPTLQASGVCVVCNSPTILRCGDCIRRPLLCCVCAYQHVTQTTHKRIIAINNYICSVENCNEDNVEKLFISGTAIYCENHKPTLCIPIVANGSVFGIYRHTARGSDDIDLFNELATSNYDTIEPYQKANRAPLSLMLFAAETIKALEESIKKSYATATVKDVYDQRFIKLLWEQGKKPPPITKNHIFTGYHFNKNGKTQVGDYILAKTDGSDTYTYRGTSTYKLQTGDVLVLMAHVVTPLSAPPVLTQTTYVRKSLLPDSVGASYYVQHFKSYNEIAMQRVTTVLGPPGTGKSTFAIGLAKYFPSARICYTASSHAAIDALCEKAFKTIPVGQCSRIVPTRTTVECFQEFVVNNTTAQYIFSTINALPDIKCDIVVVDEVSMLTNYELSSVNARLVYNHIVYVGDPYQLPSPRTMLTSGQLSPADYNVVTDIMVHAGADVMLDMCYRCPREIVETVSKLVYDNKLKAAKPNSRQCYKTIVNFGPGDVAHEGQSAYNEAQLRFALAFRQQKRWDNVTFISPYNAMNVKASLAGFSTQTVDSSQGSEYDYVIFCVTTDSAHALNMARLNVALTRAKIGILVVFRQANELYNSLQFESIDSQLQSSAEKNLTPLFKRCGYEYNGVHPAHALTWHDCGAEYRCEEPLAKLVGVADGTLISYKTLVSTLGFLPSLKIDAYHNMFLTRDACRTYVQSWIGIDVEAAHAIKPNTGTNLPLQIGFSTGKNFSVTPEGIWVNEHGSCTEPVPAKIPPGEQFRHLKKDMRQARPWKVVRREIATHIAEVAPHTDYICFVTWAHQLELATMRYFVKLGMEEKCFCGRRACFTNGTEFACKAHHSLTIPQCDYVYNPFLIDVATWGFSGRLSTNHDAVCTYHANAHVASADAIMTVCLAIHELFSTVDWNLEFPVTAEQSQLNKACRLVQANYLNILLTTTKATVVHDIGNPKGIPIVRKPGVKYHFYDQAPIVKHVQKLKYKPEMEARFTDGLTMFWNCNVDTYPANALVCRYDTHRQKHLIGPNGSALYVNKHAFLTPEMHTYATHKLNLAPLIYYSTTDCSSEQPIVVTYRDCVTRCNTGKTLCPNHALEYQEFINAYNLMARHGFNVYIPRNVNVYNCWLTFTNLQNLENLAYNCYYKNCNAHVDGQLDVVINNNAVYAKVDNNLVKLFDNRTNLPVSVAFEHYTNRHTRSLPTTQLLSGLGVTATRNFTVWFDNDTIFQYTINVSTYTDIDPSTHVVLCDDRYGTDWSQFNQLPNAVFLTKTKVKKTEPFVCTALTLNGLAIDGEELYIYVRYNNQLTTFSTTCTQGRNVEQFIPKTPMERDFLEMSQQSFIQQYQLQELGVEHIIYGDDSSPVIGGTHTLISLVKNKFEHQLVNHVYNPVQNCVVTSPNASSKNVCTVLDVLLDDYIDIIRQAHASYTSKSKVFTVSIDNQQIRFMLWHDEQVKTCYPILQSLTNGYQMPSVYKTLVTDLQPADIPNYHSYTPRVPGVVKNVIKYRQLFNYIVKKDRLAVPHNMTVLHLGAASALGTAPGSSVIKQMFPEGTVLIDLDIREFTSDANQIIVTDYRTYIPPHHVDVIFSDLYCCDDIHFFDNLIRIVKERLALGGSIFVKITEHSFSPELYSLAGWFDDYQLFCTAVNASSSEAFLCCFNYLGLAKENINGFNLHASYIQWRNEIALTPTYSPLADNPATACKLKATPIISARELEKKPILRYLVASGRLLVRPPECRELY
Summary
Catalytic Activity
ATP + H2O = ADP + H(+) + phosphate
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
a ribonucleoside 5'-triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1)
Similarity
Belongs to the coronaviruses polyprotein 1ab family.
Uniprot
Pubmed
EMBL
Proteomes
Pfam
Interpro
IPR032505
Corona_NSP4_C
IPR009469 RNA_pol_N_coronovir
IPR008740 Peptidase_C30
IPR027352 CV_ZBD
IPR001205 RNA-dir_pol_C
IPR036333 NSP10_sf
IPR037227 EndoU-like
IPR014822 NSP9
IPR009003 Peptidase_S1_PA
IPR027417 P-loop_NTPase
IPR037230 NSP8_sf
IPR038123 NSP4_C_sf
IPR029063 SAM-dependent_MTases
IPR018995 RNA_synth_NSP10_coronavirus
IPR009466 NSP11
IPR014829 NSP8
IPR014827 Viral_protease
IPR042515 Nsp15_N
IPR009461 Coronavirus_NSP16
IPR002589 Macro_dom
IPR027351 (+)RNA_virus_helicase_core_dom
IPR007094 RNA-dir_pol_PSvirus
IPR036499 NSP9_sf
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SUPFAM
Gene 3D
ProteinModelPortal
PDB
6NUS
E-value=0.0 Score= 934 Identity=50.80%
Cov(Q)=14.99% Cov(P)=98.32%
3D Structure
Ontologies
GO
GO:0039694 P:viral RNA genome replication
GO:0033644 C:host cell membrane
GO:0044165 C:host cell endoplasmic reticulum
GO:0005524 F:ATP binding
GO:0019082 P:viral protein processing
GO:0008270 F:zinc ion binding
GO:0016896 F:exoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
GO:0016021 C:integral component of membrane
GO:0004197 F:cysteine-type endopeptidase activity
GO:0003724 F:RNA helicase activity
GO:0039520 P:induction by virus of host autophagy
GO:0008168 F:methyltransferase activity
GO:0003968 F:RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
GO:0032259 P:methylation
GO:0006351 P:transcription, DNA-templated
GO:0003723 F:RNA binding
GO:0044220 C:host cell perinuclear region of cytoplasm
GO:0008242 F:omega peptidase activity
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Subcellular Location
From MSLVP
Capsid
From Uniprot
Host cytoplasm
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Host perinuclear region
Host endoplasmic reticulum
Host membrane
Topology
Length:
6264
Number of predicted TMHs:
14
Exp number of AAs in TMHs:
326.409179999998
Exp number, first 60 AAs:
0.00504
Total prob of N-in:
0.07632
outside
1 - 1509
TMhelix
1510 - 1532
inside
1533 - 1597
TMhelix
1598 - 1620
outside
1621 - 1629
TMhelix
1630 - 1652
inside
1653 - 2000
TMhelix
2001 - 2023
outside
2024 - 2289
TMhelix
2290 - 2312
inside
2313 - 2332
TMhelix
2333 - 2355
outside
2356 - 2369
TMhelix
2370 - 2401
inside
2402 - 2821
TMhelix
2822 - 2841
outside
2842 - 2844
TMhelix
2845 - 2862
inside
2863 - 2868
TMhelix
2869 - 2891
outside
2892 - 2910
TMhelix
2911 - 2933
inside
2934 - 2939
TMhelix
2940 - 2957
outside
2958 - 2971
TMhelix
2972 - 2994
inside
2995 - 3005
TMhelix
3006 - 3028
outside
3029 - 6264
